3ISPA

Crystal structure of argp from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
292
structure length
290
Chain Sequence
QLDGPQLAALAAVVELGSFDAAAERLHVTPSAVSQRIKSLEQQVGQVLVVREKPCRATTAGIPLLRLAAQTALLESEALAEMGASLKRTRITIAVNADSMATWFSAVFDGLGDVLLDVRIEDQDHSARLLREGVAMGAVTTERNPVPGCRVHPLGEMRYLPVASRPFVQRHLSDGFTAAAAAKAPSLAWNRDDGLQDMLVRKAFRRAITRPTHFVPTTEGFTAAARAGLGWGMFPEKLAASPLADGSFVRVCDIHLDVPLYWQCWKLDSPIIARITDTVRAAASGLYRGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of ArgP from Mycobacterium tuberculosis Confirms Two Distinct Conformations of Full-length LysR Transcriptional Regulators and Reveals Its Function in DNA Binding and Transcriptional Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator Rv1985c/MT2039
molecule tags Transcription
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 74
structure length 290
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3ispA01
3.40.190.290 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ispA02
2KIFA 1GXQA 2XASA 2Q8KA 1KU2A 2YSRA 2E1NA 2QUFA 3EDPA 2W85A 2QBYB 1ZRCA 6PAXA 5E20A 4L0ZB 3I5UA 2YR2A 2MLKA 5E1XA 4I2OA 5CYVA 2EFWA 3GFJA 1Z05A 1QO0D 2ESHA 1ON1A 3ZN0A 3J80Z 2B0LA 4LB6B 1C0WA 3M8EA 2VT3A 1P4AA 1U6GA 4EM2A 3FWEA 4HW0A 2FMYA 2WTEA 3IC7A 4CYDA 4I0AA 2IPQX 5FO5A 4IRIA 3T0YA 1XGNA 1KU3A 2P5KA 3RPUA 3KEQA 3KP5A 4ESBA 4KA4A 3LA3A 2Y75A 4BYYA 2R3SA 2DPDA 1QZYA 4Q48A 3L2CA 4KNYA 2M1BA 1RIOH 1YQAA 2FF4A 3I71A 1S7OA 2PI0A 2DK8A 3VODA 4UVBA 1O3RA 2OBPA 2VC1A 4G6QA 4S05A 3ZMSA 4O3MA 4QWQA 1UHWA 3P9CA 3I58A 2IT0A 4WXCA 3KETA 1KGSA 1ZG5A 2P5LC 2FOKA 3GEZA 4EJOA 1MD0A 5LHGA 3I64A 3O3KA 2GA1A 1J2XA 1MKMA 3VOEA 4M72A 1WQ2A 2XVCA 1WRJA 4L0YB 2L02A 4M71A 2F5DA 1Q1HA 4OINF 5HDKA 2Z9OA 4QBAA 4HX4A 3REOA 2QLZA 3KZYA 2IW5A 3E6MA 1KQ0A 2VODA 3JAMK 4MNUA 2VOPA 1T6SA 1IN5A 2OQGA 3ZMVA 5DD8A 1RZ4A 2AXLA 2M87A 1P4WA 2P6TA 4N9HA 2LF7A 4HYEA 1Z6RA 4UUVA 5LBQA 1MZBA 4NHJA 1G3TA 5DV5A 1WI9A 2V1DA 3DQVC 3KE2A 1G3SA 4OOIA 1R5GA 3MQ0A 4YIIA 2QM3A 1KQ8A 3I0TA 2OU2A 3D5LA 4OIOF 2K7LA 4OMZA 4MQ9F 4HBLA 3V8LA 4CDGA 1MJ9A 1I6XA 1FP1D 3DFGA 3NEUA 3RKYA 4RB0A 1TNTA 1R22A 3CUOA 5FLXZ 1K78A 1MJAA 4MEXF 2ZBKA 3J7AO 1D8JA 1B1BA 5K1YA 2IA1A 2X4HA 2PFBA 1O3TA 2EV0A 2P7VB 3BJOA 1BC7C 1Z91A 3HYIA 3F72A 2HQRA 3O2PE 4ESFA 2CQKA 1YS6A 1T38A 3K69A 1PDNC 2FQ3A 3V8JA 2ACJA 2K4JA 5IT9Z 4U0WA 4A0XA 3RPQA 1SAXA 1MDMB 1S8NA 1K7AA 1IUYA 2M8EA 5HS7A 2MH9A 5JR3A 2XAHA 3QPHA 3I59A 2KJCA 4BHCA 1ZG1A 3SZPA 3RIRA 2WWYA 1VTNC 4EGYA 1YS7A 3TOBA 5ICCA 1BBYA 1F5TA 1HBXG 4IXAA 1U5TC 3T1BA 3RI4A 2KKOA 3R60A 4LG0B 1BI2A 1EH6A 4O5VA 3MFKA 3J81Z 1FY7A 2ZCWA 4A12A 3JW4A 3CO6C 3BWGA 3K2ZA 4K2EA 4JQFA 4BHPA 3D0SA 1J9IA 3V4GA 3QU6A 4KFCA 2PMUA 4WCGA 1IXCA 1XMAA 1IXRC 1TQMA 3LAPA 2MC3A 3GVAA 2Q0OA 5D6EA 3EETA 1W5TA 1W7PB 3TO7A 1B59A 1BI3A 1SFEA 1TNSA 1GVJA 3F8MA 1TBXA 5K5QA 4RB1A 5HS8A 2IA2A 5TRDA 3ZMDA 2D1VA 3TDZC 3N97A 3LWFA 4LLNA 2BE5F 2FXAA 3LA2A 2NNNA 1ZGAA 2HTSA 3ZMTA 5L3GA 4GGGA 4YG2F 1T2KA 2XGXA 1USTA 1EV7A 1YLFA 2ZNYA 1YTYA 4IVNA 1LEBA 4LFUA 2HFHA 3CUQC 2FBKA 2V79A 4FHTA 4HAMA 4PGHA 4BQAA 1WKMA 5A2QZ 2OZ6A 3PFIA 5FLXK 2MH2A 2VBWA 2E1CA 4IPAA 3JTGA 2ADUA 5J6XA 4A5MA 3F3XA 4HA8A 1NHAA 4I01A 3WTZA 3ZPLA 3CO7C 4GO1A 3SHFA 1HQCA 5DYMA 2QQAA 1K6OA 2LSOA 2UWMA 3NQOA 2Z99A 2OAZA 3P9IA 1A04A 4P5OA 4HF1A 1B9MA 3FM5A 2COMA 1PUEE 3QPTA 2YX4A 4OIQF 1E17A 3ABTA 5FD6A 1XSXA 4DQ2A 3IKTA 3F8BA 2CO5A 3WTUC 2PN6A 2EV5A 2GIVA 5IT9K 1YO5C 5CVUA 3ML6A 4UNOA 5L3CA 1V4RA 1ZLJA 5ICFA 4UV8A 3GF2A 4IHSA 4ENNA 1W5SA 1TTYA 3MAJA 1G6NA 1R1UA 3DF8A 1S7AA 3HOSA 3ABUA 4HOBA 1BC8C 1LVAA 3WGIA 2O03A 3HRUA 2CYYA 5D5WB 1IAWA 4M6YA 1XB4A 4HDUA 3QAHA 3BJAA 3GXOA 3I54A 3BPXA 2RNJA 4XLPF 4YFXF 4L9VA 5DUKA 2UZKA 2L4MA 5CVJA 4RAYA 2RQPA 4HDVA 1H0MA 3QP6A 3FHZA 1BIAA 2HEOA 2VE8A 3NRVA 2L3DA 1SFUA 4UV9A 5E17F 5E8GA 2BBYA 2XIGA 3ULQB 5E8IA 4P9FA 1YW7A 2O61A 1I1GA 2LDUA 1KA8A 2DAOA 4MTEA 3HSRA 3L09A 1U3EM 1TQPA 1BOAA 4G6DA 4MTDA 1KQ9A 3SZTA 1O7FA 4L18B 2HYGD 5LLQA 4KMUX 1IN7A 1ZARA 4G94A 4WXDA 2IRFG 1IRFA 1B6AA 3IHUA 3TO6A 4LLLA 2EFQA 2PJPA 1BM9A 1Z6TA 1FX7A 3KP4A 2PMHA 4EQQA 2XROA 1Y0UA 2E7XA 5H6RA 4EM1A 1JHHA 1ODDA 5A2QK 2PG4A 2ISYA 2EA2A 3ZN1A 1XSDA 1S29A 2VONA 1FYLA 2G7HA 1F1ZA 4L9NA 1B9NA 1FP2A 3WODF 2V6CA 3KP3A 1XGMA 4WF2A 1FPQA 5FFXA 3V7SA 4L9TA 5EEGA 1P2FA 3LSTA 2DQRA 3F8NA 1G4DA 3GFLA 4ZYGA 4MGRA 3RJPA 5ICEA 1LDDA 3M8FA 2A6HF 1USSA 2XAQA 1DDNA 2NAZA 1YFHA 3RYRA 4U0VA 2DPUA 3KCCA 3IL2A 3ROUA 3KZZA 1Z9CA 4CZZA 1HW2A 3ZMUA 2LKPA 2HZTA 1HXDA 1OPCA 5J8FA 2KJBA 3C18A 4JVCA 2UXNA 5D5XB 3WGGA 2D45A 4LMYA 1ULYA 5ILVA 2QBYA 1W4MA 1FWZA 2OQRA 4A5NA 3K1PA 4XRFA 2RKHA 4JVDA 4N9IA 4R1HA 1OYWA 3GZ5A 1F9NA 4A0ZA 1HKTA 4XBFA 2V1XA 1O3QA 3GLXA 5DEQA 4I09A 2VN2A 1FT9A 5ILUA 3Q9VA 5AIPA 2L54A 4RGSA 2VBYA 1PP8F 3BDDA 2BYVE 2W25A 3LQRA 3L9FA 2L01A 3LQQA 1XDUA 3JSPA 4YIFA 5LEJA 1F4KA 5LEKA 4G7OF 5ED4A 5LGNA 3IRRA 5CVVA 4EVIA 2JTVA 3GFMA 2HKXA 2GXBA 4A6EA 2FE3A 5DUIA 1SD4A 2EJRA 2WV0A 4RB2C 1YIOA 3M1EA 1EH7A 1IW7F 2A6EF 4EV0A 5KK1A 4KDPA 4BXUA 3H3ZA 5HDNA 1TQIA 3R61A 2ZXJA 3TGNA 4RGXA 4JVIA 3K1MA 4IHTA 4KMFA 2VT2A 2C6YA 2O0YA 2P7CB 3HRSA 4JK1X 1SFXA 2Q2EA 2AS5F 3CDHA 3VFZA 3N4MA 2FBHA 4M6XA 2M30A 3OOPA 3K1NA 2H09A 4GXOA 3BPVA 2HTJA 3FZVA 1YW9A 3WGHA 5CJ9A 2J5PA 2A07F 2F5FA 4B09A 4GYGA 4I0BA 2DI3A 1XDSA 5LHIA 3PQJA 4RAZA 5HLHA 4RB3C 3RTRA 2RDPA 1H9GA 4FX0A 3HHGA 3FMQA 2HGCA 4AIHA 3BP8A 4U0YA 2NNYA 2IJLA 4EJUA 2XKOA 2RC4A 2FSWA 2RN7A 4CHUA 2J5OA 5TJJA 4MEYF 1GXPA 3ISPA 2XHKA 5K5RA 4CXFA 3CTAA 5BQTA 4L5IA 3WTXC 1IN8A 2D1HA 1KYZA 1OMIA 2CGPA 2HXRA 2FNPA 1YYVA 2EA4A 4NB5A 4N0BA 2DK5A 4PCQA 4OU0A 3F21A 2H6BA 4R79A 2QYOA 1BN5A 5JI6A 1CF7B 1ZLKA 2MBFA 3VB2A 1GHCA 4WX9A 3R4KA 4ENMA 3OV8A 1OYYA 2FNAA 4EJTA 2Z3YA 2O6GE 2JPCA 5DCMB 1MDMA 1U5TB 1OKRA 5D4RA 3DP7A 3CJNA 5CVRA 1ZGJA 1FZPB 1O7LA 1HKSA 3HRMA 3IWFA 4RGRA 1G3WA 4Q4ZF 2G7UA 5FGMA 2QQ9A 1UHMA 4G9YA 2A69F 3F23A 1R00A 3B73A 4RS8A 1IF1A 4LG0A 5DCFA 1H9TA 2STWA 2L4AA 3HUGA 2EFOA 3KP6A 5JFRA 4HLXA 3WU1B 5BPIA 1ZRFA 4I7HA 2XAJA 3JTHA 5FFZA 2A68F 3HOTA 4KUMA 1LQ1A 2DO7A 2Y0MA 2GA2A 2HQNA 1R1TA 3SXYA 2KRFA 3TQNA 1O57A 1W7PD 4AVPA 2VC0A 4Q47A 5L3FA 2K27A 1W7PA 2F5CA 3RYPA 2YU3A 1RI7A 1AOYA 1JE8A 2ZFWA 3W6KB 2E7WA 3KLNA 3F8FA 3CUQB 3G3ZA 1QBJA 4M74A 1FC3A 3U9GA 2XAGA 4MHGA 4JBAA 3QRFF 3V7CA 4IRGA 1J0RA 5AIQA 1G3YA 3K9TA 5CLSA 2ELHA 4L5JA 1LB2A 2EV6A 3WE3A 1U78A 4EMSA 1XGSA 3QP5A 3GYHX 2JT1A 1XMKA 2RGVA 3FMSA 2P6SA 1RNLA 1TLHB 5HOOA 2CSOA 3E3VA 4AD9A 2OD5A 1REPC 4NQWA 2FA5A 4HZFA 3W6JB 4Y17A 4GYIA 2W84A 3P7NA 2DFIA 2ZMEB 1J7KA 2PBIA 2A61A 1D8KA 2HDCA 2HR3A 1QZZA 3GUDA 4F7ZA 1IXSB 4ESJA 5CVIA 2QVOA 3MZYA 4FT8A 5L3EA 3WTSC 2BGCA 4O6JA 2VOOA 2MA3A 3P9KA 3ELKA 4ZYEA 5K5OA 3BOQA 3ECHA 1I1SA 1LDKB 3MEXA 4OMYA 3EYYA 3FXUA 1ON2A 4L9JA 3MWMA 3U1DA 5LGTA 1QQIA 3CLOA 1SD6A 4UVCA 1AWCA 1UB9A 3BJ6A 3DV8A 3HTSB 2XRNA 3I4PA 1UCRA 2NRAC 1JXSA 2VE9A 3BROA 4HV5A 1XCBA 4Y15A 2QENA 5H6QA 4Z2YA 2EFPA 1SD7A 2HS5A 1K79A 4LK0F 1HSJA 3FM3A 4BNCA 1I5ZA 4EJVA 3FXRA 3IRQA 2JRTA 2FRHA 3LFKA 2VXZA 2GZWA 4FX4A 2ZMEA 2BEOA 3FXQA 4M9ZA 4LK1F 3E97A 4LB5A 4ZH4F 1QPMA 2YX7A 4H0EA 1IN4A 1DPUA 5HLGA 2EK5A 5D4SA 1P6RA 4IJAA 5FD5A 2K4BA 5LGUA 5DD4A 2XV4S 1DP7P 3C3WA 3EUHA 2O3FA 3F6OA 5LRRA 2Z33A 4DNCA 2NS0A 4HF0A 1R5HA 1FBQA 2KIUA 2EB7A 4ZYDA 4WWCA 2HOEA 2GAUA 2FU4A 3C7JA 4CICA 1SMTA 3WU0A 3EQLF 4CGZA 3WE2A 5HS9A 4UXNA 2EFNA 1X3UA 1DUXC 2DU9A 4XSZF 1S3JA 2D2WA 4ETSA 1T98A 4YFKF 4ZZLA 2JSCA 1KYWA 1XSVA 2X0LA 1FSHA 4I98B 3EYIA 3DPLC 3T5XA 1P4XA 1Z7UA 3Q5FA 5HVQC 1FOKA 2DT5A 1XN7A 4U7BA 2QWWA 2JZYA 3F6VA 4KIGA 3ZQ7A 3Q9SA 2O8XA 1FSEA 1FBUA 3SFZA 1UFMA 2QZ8A 2JPBA 3PQKA 5FB2A 1SD5A 2GXGA 4TV7A 1O3SA 2FEZA 2F2EA 4KYWA 2GQQA 4WK8F 2YPRA 2OZUA 3V8KA 3MZHA 1K78B 5L3BA 1STZA 4HX7A 4PGGA 2IA0A 3COAC 4AIKA 4QLCU 1LDJA 3HTUA 1R7JA 2VBXA 3E5UA 4M9SA 4Y13A 1MJBA 1OYIA 4BAYA 3L00A 2P5VA 1YG2A 5E1WA 3R6SA 1JGSA 5ICGA 1P92A 5J8CA 2CFXA 2H27A 2M45A 3F8CA 3BZ6A 1R1VA 4G7ZF 1ZHFA 2ZO4A 1FLIA 1KU9A 3C1DA 5DDGA 1HW1A 4UHTA 1OR7A 3KFWX 1XGOA 2DLLA 5E1ZB 2ETHA 1I27A 5D5VB 3I59B 1SMYF 1WSUA 1ZAOA 2F5EA 2LF8A 5KVRA 5F1RA 2Z5UA 1U2WA 4KICA 2W57A 4PDKA 1R23A 2IP2A 3JSOA 5JHUA 3F22A 3K0LA 2ISZA 1FBSA 4LJZF 2EWNA 1DPRA 1L0OC 4EJWA 3B02A 4E70A 3GO5A 3M9AA 3J80K 3LAJA 5BPDA 3DXJF 3WTTC 1TW3A 4AIJA 1XD7A 2XKPA 1T39A 4IRHA 4G7HF 2XUBA 4EM0B 2PEXA 5HDGA 1D5VA 3KP2A 3V7RA 4LGWA 3L7WA 4KIBA 3LA7A 1ZH5A 5BS6A 1FYKA 4LLGF 5E18F 3WG9A 3H92A 1LNWA 1IZ1A 1QNTA 2NYXA 2MLGA 1FNNA 2HKOA 2PQ8A 3E6CC 2LNBA 2KIMA 2RV8A 3RKXA 4ZYHA 5L3DA 2CG4A 3GW2A 5BOXA 3ERED 3T8RA 3TDUC 3WTVC 4ENKA 4EGZA 2FBIA 4BHBA 4HX8A 4G8XA 3ZP5A 5LRSA 4Q5SF 1RUOA 2R7FA 1B4AA 1ZG3A 3IWZA 3RKWA 3T8TA 1D3YA 4BH9A 2DW4A 3HHHA 1ONVA 3SQNA 5IT3A 3FF5A 2K02A 4HQMA 3GWZA 4LD5A 4U88A 1HKQA 4OIPF 4D0PA 3FX3A 1ZYRF 3KEOA 3WTWC 1E2XA 1ZREA 3I53A 5AONA 3BY6A 4HV6A 2DBBA 5D8LB 3GZ6A 2CWEA 3MCZA 5ILSA 2ZKZA 2GWRA 4KN7X 2M5WA 2V1UA 4OIRF 2P8TA 3DKWA 2R7DA 5ERIA 2FMLA 5D6FA 3DEUA 3R0AA 3U2RA 3HRTA 4KN4X 3IKVA 1J59A 2W24A 1JHFA 2PLYA 3FMRA 5EEHA 2H6CA 4M9XA 2ZNZA 4MQVA 3R0JA 1EH8A 3HFUA 1TW2A 1CF7A 2A3SA 1J75A 2STTA 4A0YA 1J5YA 4M73A 5F6FA 4WXHA 5D8KB 2XAFA 3KP7A 1HSTA 3TO9A 1U8RA 3QOPA 3AAFA 3H3UA 5DCMA 1U5TA 2P4WA 1LJ9A 1PP7U 1ZN2A 1IRGA 4GCVA 4IF4A 3TOAA 4PZJA 1FYMA 4HF2A 4P96A 5H20A 4ZZDA 1YW8A 2ZJ2A 2VBZA 3QU3A 3E5XA 3RDIA 1R36A 1IN6A 1BIBA 2IVMA 2HWVA 3TKYA 1BI1A 4AWXB 3S2WA 3HSEA 1ZRDA 3ZMZA 4A6DA 3GFIA 1Z1DA 2A5YB 3E6BA 1LEAA 4R8HA 2V9VA 4XLNF 2H94A 1L3LA 2BV6A 5JVTA 1QGPA 4UVAA 5F64A 4CO8A 4P9UA 4KIFA 4ENJA 1T0FA 1CGPA 4P55A 3KLOA 4XSXF 1S6LA 4B8XA 3J81K 3ECOA 1V3FA 5D5UB 1WWXA 2TDXA 1RUNA 5HLIA 3JAMZ 4ON0A 5LHHA 2OA4A 3CUQA 3G73A 4ASNA 3VEPA 2UXXA 2Y48A 2CW0F 3O6BB 2ESNA 1XCVA 2K86A 4U7DA 1BI0A 3HIFA 3HSFA 1HW5A 4S04A 2MD5A 4HQEA 3E6DA 3E5QA 1KU7A 2RVCA 3M7GA 1BJAA 4YFNF 4A2UA 2G9WA 2WC2A 2DTRA 4I02A 4RGUA 1R58A 3WTYC 2HYFA 5BMZA 4KT5C 3GX4X 4HLYA 1MGTA 3DPTA 2DQLA 2QQBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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