3ISPA

Crystal structure of argp from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
292
structure length
290
Chain Sequence
QLDGPQLAALAAVVELGSFDAAAERLHVTPSAVSQRIKSLEQQVGQVLVVREKPCRATTAGIPLLRLAAQTALLESEALAEMGASLKRTRITIAVNADSMATWFSAVFDGLGDVLLDVRIEDQDHSARLLREGVAMGAVTTERNPVPGCRVHPLGEMRYLPVASRPFVQRHLSDGFTAAAAAKAPSLAWNRDDGLQDMLVRKAFRRAITRPTHFVPTTEGFTAAARAGLGWGMFPEKLAASPLADGSFVRVCDIHLDVPLYWQCWKLDSPIIARITDTVRAAASGLYRGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transcription
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Crystal Structure of ArgP from Mycobacterium tuberculosis Confirms Two Distinct Conformations of Full-length LysR Transcriptional Regulators and Reveals Its Function in DNA Binding and Transcriptional Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator Rv1985c/MT2039
total genus 74
structure length 290
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3ispA01
3.40.190.290 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ispA02
1KQ9A 5BQTA 2K4JA 1O7FA 1ONVA 3C3WA 2Q2EA 5DUKA 4ZH4F 3J80Z 1XGOA 1FYMA 1O3SA 3WTXC 4N9HA 1R1VA 4AIJA 3C7JA 2P7VB 3HSFA 5LRRA 1JE8A 1MDMA 1MDMB 2HKXA 1K78B 2HFHA 4EJWA 3DKWA 1B1BA 2D2WA 1XSXA 1IRFA 4KDPA 3E3VA 4HDUA 1ZYRF 4KN7X 3O6BB 1S29A 4KYWA 5CVIA 2XIGA 1S8NA 4FX4A 4CXFA 1E17A 2CQKA 1D3YA 1MGTA 1LQ1A 4GYIA 3GXOA 1U5TC 4OIOF 4HQEA 4I0AA 4HYEA 4M72A 2VODA 4NB5A 3J81Z 3CDHA 1IXSB 1FP1D 2RV8A 4KN4X 3H3ZA 1RNLA 5DUIA 1XSVA 2VN2A 1SFUA 4D0PA 2HS5A 3CUQA 3KEQA 4P55A 1I27A 4L5JA 4F7ZA 4IRGA 1DP7P 3J7AO 3FXRA 2V1XA 4UXNA 2EFOA 4BXUA 2XAHA 2FF4A 3WTZA 4IHSA 1OKRA 1P4WA 3DFGA 3VOEA 3G3ZA 5DCFA 5F6FA 1P92A 4BYYA 4CICA 3RDIA 1KU2A 3M8FA 4G94A 2MBFA 5DD4A 4M73A 4P9UA 3KE2A 4ASNA 2P5VA 3QP6A 4NHJA 5LGTA 2RGVA 2HEOA 3T8RA 3ABUA 4HOBA 3E6DA 5HS8A 2KRFA 2FU4A 2HOEA 3HIFA 2GWRA 2AS5F 2PBIA 3RYRA 2QQAA 3KP6A 1OPCA 4IRIA 3IWFA 5E8GA 1MKMA 2PLYA 4L9JA 4HX8A 1O3QA 3I64A 1EH6A 3F23A 2HYFA 1LDJA 3LFKA 5E8IA 3DEUA 1B4AA 5ILSA 3BPVA 1IN7A 1XN7A 1V3FA 2BV6A 3GO5A 2XAGA 4I01A 1TW2A 3K1NA 4RB3C 4R79A 3I59B 2QWWA 4N9IA 1O3TA 4U88A 4A2UA 1JHHA 4LGWA 4QBAA 1RUOA 2KJCA 3HHGA 5BPIA 1XGNA 2JSCA 4AIKA 1HKQA 3RTRA 3L09A 4LJZF 2W84A 2VT3A 4M6XA 3BJOA 2EFWA 5FO5A 4I2OA 5JHUA 1SFEA 4KIBA 1Z91A 4RB0A 2WWYA 1W7PB 4BHCA 3CLOA 3ZQ7A 1RI7A 4U7DA 2GXBA 1TQPA 3DQVC 1ODDA 4XLNF 3L2CA 3TDUC 2QYOA 1SD7A 2OU2A 2DI3A 4FHTA 2BYVE 4TV7A 5TJJA 3RJPA 2R7FA 4OIPF 3K1PA 1O57A 2R7DA 1ZREA 3L00A 3HFUA 1G4DA 2MH2A 2RVCA 2NRAC 3QPTA 3JSOA 2MLKA 1TBXA 1R36A 3KZZA 4MQ9F 4U0VA 2VONA 3IWZA 2QLZA 3WE3A 2ZO4A 2A5YB 3VFZA 4R8HA 3JTGA 2JTVA 2DQRA 1YS7A 3TOBA 1G6NA 2IA0A 2IJLA 3RKYA 1DPUA 3KLNA 2C6YA 1ON1A 5EEGA 5FLXK 2CWEA 1W7PD 3IKVA 2PJPA 2ZMEB 1IN8A 3I5UA 5K5RA 3LAPA 2HYGD 3MCZA 4YIIA 4GO1A 3FM5A 3FMQA 1H9GA 1FBSA 4G9YA 3JSPA 5DDGA 2K7LA 3BWGA 1HW2A 3P9CA 1L0OC 1ZGJA 3RI4A 2XV4S 1BI3A 4U0WA 2FBIA 3K0LA 5FD5A 4Q4ZF 4ZYHA 3HOSA 1E2XA 2STTA 4YIFA 5HVQC 3LA3A 1HW1A 1IN6A 1QGPA 1FY7A 2VBYA 3R60A 5FGMA 1U8RA 3CUOA 2E1CA 4M9SA 1FSEA 3MQ0A 2DLLA 3JAMZ 4CZZA 4L0YB 4XRFA 6PAXA 2BEOA 2E1NA 1XDSA 2DT5A 3M1EA 3E5XA 1O3RA 5IT9K 4KIGA 4U7BA 3JW4A 4KMFA 2OA4A 2LKPA 3T5XA 1D5VA 2DW4A 3F8BA 4OMYA 2A6EF 2FMYA 2XRNA 1U5TA 2ZKZA 1YFHA 1G3YA 1XMKA 2DTRA 1YG2A 2W85A 1R1TA 2JPCA 2Z5UA 4I02A 2OQRA 4P5OA 1FC3A 4AD9A 4NQWA 1FX7A 2YX7A 1V4RA 1W5SA 2BE5F 4OIQF 3E6BA 5EEHA 2ETHA 4CYDA 4ESFA 2P6TA 4HF0A 2OZ6A 3DP7A 5FFZA 3DF8A 5TRDA 2L3DA 2ESNA 1I1SA 3AAFA 4JVIA 2O61A 3QU6A 4L9NA 2RC4A 4UUVA 1YW7A 4OMZA 5K1YA 2H6BA 2FNAA 2M1BA 2HDCA 1FNNA 3F72A 2M45A 1FBUA 4HZFA 2L4AA 4EJTA 3RPQA 2STWA 4YG2F 2Z99A 3SZTA 3F22A 2K02A 4HV6A 1KGSA 1CF7A 2QQ9A 2F5DA 1K79A 2KIFA 4WX9A 1B9NA 2IVMA 2MD5A 2XASA 1FT9A 5D5UB 1Y0UA 4EV0A 2L02A 2ELHA 1BJAA 3FZVA 2VE8A 1WSUA 2LSOA 2IW5A 1ZG3A 3ZP5A 4IF4A 1BN5A 2EJRA 2LDUA 2XROA 2WTEA 3ML6A 2EFQA 2CGPA 4G6QA 2UZKA 5L3DA 2O03A 2GXGA 4HV5A 5KVRA 4ZYEA 2BBYA 2HQRA 4EM2A 4RGUA 3CO6C 3QPHA 1DPRA 4YFKF 1K6OA 4EQQA 2O8XA 3SHFA 4XSZF 3J80K 4UVCA 2WV0A 4EJOA 1P6RA 1HKTA 3F8MA 2CO5A 2CFXA 5D6EA 1ZH5A 1ZLKA 1T98A 1R1UA 2GZWA 2EK5A 2BGCA 4Y13A 3I58A 3U1DA 2M5WA 2EFNA 3QU3A 2XHKA 4L18B 2YR2A 2HZTA 4DNCA 2VOOA 1YTYA 1WQ2A 1KYZA 5E20A 2VT2A 2EFPA 3WGGA 3V7CA 5HOOA 4KT5C 1KQ8A 4S04A 4A12A 2ISZA 2EV6A 3Q9VA 2A3SA 2PN6A 3V7RA 3J81K 2JRTA 3D0SA 3O3KA 1K78A 2WC2A 2KIUA 1FYLA 3DXJF 3EETA 3ZMVA 1I1GA 1BI2A 1BC7C 1C0WA 2UXXA 1XB4A 3BJ6A 1T6SA 4KA4A 3NEUA 1QPMA 5CVVA 3BOQA 1TLHB 4FX0A 1HSTA 2RNJA 3SXYA 2EA4A 1DUXC 4HF1A 5LLQA 1WRJA 3HHHA 4IJAA 3H3UA 5FFXA 2D1VA 3KP2A 3FX3A 1MJAA 3TKYA 1HQCA 3BY6A 2OAZA 3HRSA 1NHAA 4LD5A 2OBPA 3C1DA 3C18A 2XVCA 3FXUA 3HOTA 3ABTA 1TQMA 1SFXA 2Q8KA 1OMIA 4Q47A 3EYYA 1TW3A 3K69A 1SD4A 1T2KA 5F1RA 4WK8F 2CYYA 5J8CA 3HTUA 2Y75A 2L4MA 3DPLC 1SD5A 3CJNA 2NNYA 1FLIA 3BROA 4MEYF 2HR3A 4ENJA 4M9XA 3E5UA 5LHGA 2MC3A 1J7KA 3PQJA 1FWZA 3FHZA 4BHPA 3R0AA 3WE2A 4UVAA 2TDXA 2DFIA 2K27A 3N4MA 1U2WA 1KU7A 5CJ9A 4ENMA 3WGIA 3KP4A 3QOPA 5D8LB 3LSTA 1ON2A 2LF7A 1YQAA 4E70A 3RKXA 2JPBA 4KNYA 2F5CA 3GZ6A 1YLFA 4G6DA 4A6EA 1EH7A 2QVOA 4P96A 4IXAA 3ZN0A 3F21A 1BIBA 5JI6A 1J9IA 3KCCA 2GA1A 1QQIA 4AWXB 4G7HF 1Z7UA 4K2EA 3GEZA 4LG0B 2XUBA 3IHUA 5K5QA 4HX7A 3I59A 4HLYA 4U0YA 4N0BA 1U78A 2ZFWA 2GIVA 3DPTA 4EJUA 3K2ZA 3TO9A 4G8XA 2MH9A 1G3SA 3ERED 5D6FA 3K9TA 2GAUA 4DQ2A 3E6MA 2FA5A 2RN7A 1X3UA 2JT1A 5H6QA 3KETA 1W7PA 3ZMSA 3P9KA 2PFBA 4PGHA 2CW0F 2NYXA 3OOPA 1IF1A 2DK8A 1CGPA 4EM1A 2XAQA 4KICA 4CO8A 5LHHA 2F2EA 4Y15A 5D5VB 4ESBA 3BZ6A 1Q1HA 3E97A 3T0YA 2VC1A 1R00A 1QBJA 3ZPLA 3LQRA 1I5ZA 3LWFA 4LK0F 4UHTA 3FM3A 2DK5A 5HDGA 2A07F 4ENKA 1YIOA 1P4AA 4I7HA 1ZGAA 2XKPA 1F1ZA 3Q5FA 5E1WA 3HTSB 3FMRA 3F6OA 4HDVA 2NAZA 1HKSA 2B0LA 2FEZA 2EV0A 2V9VA 3JAMK 3ZMDA 2HGCA 5JR3A 2O6GE 5ICEA 4EM0B 1YW8A 2VBWA 2ZMEA 3ISPA 2JZYA 1QZZA 2FNPA 2LF8A 1IXRC 1D8JA 4M71A 1Z6RA 2EV5A 3I4PA 3WGHA 3LAJA 5D5WB 3T1BA 2YU3A 1Z6TA 5LGUA 1DDNA 2A69F 2X4HA 2P4WA 3HRTA 3EDPA 2X0LA 3ECHA 5ED4A 3S2WA 1R22A 1IZ1A 1WWXA 4CHUA 5L3GA 1J59A 4LB5A 1IRGA 4EGZA 1W4MA 4JQFA 4BHBA 4RGSA 5HLGA 1J5YA 1TNTA 4LFUA 2XKOA 1IUYA 4XBFA 3SFZA 1AWCA 3CTAA 3GLXA 2HXRA 4B09A 2MLGA 4KUMA 5CLSA 1JGSA 3L7WA 2ZNYA 3WTUC 2A61A 1L3LA 2NNNA 4A6DA 1TQIA 2D45A 3GW2A 3HYIA 1P4XA 2G7HA 4I98B 4KIFA 5JFRA 2H09A 3V7SA 3IKTA 3KLOA 3TOAA 1STZA 5ICFA 1IN4A 1S7OA 3SQNA 2A68F 2W24A 2HTSA 2M8EA 3GFJA 5HDKA 1XCBA 3GF2A 2QZ8A 4ZYDA 3WTSC 3I71A 4HQMA 4A5MA 1USTA 4OINF 2IA2A 2FBKA 3TO6A 2QBYB 5LHIA 1GXQA 2Z9OA 2DPUA 2KKOA 1U3EM 4G7ZF 1EV7A 3MWMA 4ON0A 1BI0A 3ZN1A 3JTHA 4WXCA 3MAJA 1USSA 3IC7A 3WTTC 1QZYA 3F6VA 4Q48A 3IRRA 4O5VA 1OYIA 4LMYA 2IRFG 4M9ZA 3TDZC 1KA8A 2O0YA 2ZXJA 1J2XA 1YS6A 2QQBA 3P7NA 4P9FA 3ZMUA 4O6JA 1F9NA 5AIPA 2FOKA 2RQPA 4FT8A 1R58A 3SZPA 3R61A 2LNBA 2Y0MA 1TTYA 3NRVA 1R23A 5DCMB 3EUHA 3F3XA 3FXQA 3R4KA 1S7AA 5J8FA 1YW9A 3QAHA 5FB2A 1ZHFA 2CG4A 2ZNZA 3RIRA 3MZYA 1TNSA 2ISYA 3COAC 2FRHA 5BMZA 1UFMA 2L54A 2VC0A 4HBLA 2EB7A 3ECOA 2FMLA 4WF2A 5LGNA 2RKHA 3WTVC 3HRMA 1MD0A 3BPXA 4RAZA 5D4RA 1ZRFA 1HW5A 2EA2A 3I54A 1XDUA 2QUFA 2FQ3A 1H0MA 2V6CA 5LBQA 3MFKA 5DV5A 4MEXF 1AOYA 2ZCWA 5DD8A 4GYGA 4RS8A 2PQ8A 3BDDA 1T38A 3B73A 3T8TA 3QRFF 4AVPA 5D4SA 4EJVA 5CVRA 5L3FA 3BP8A 2HKOA 3K1MA 1PP8F 4CGZA 1ZLJA 4UVBA 2J5PA 5J6XA 2Z3YA 3R6SA 4G7OF 5HS9A 1XD7A 1J75A 5A2QZ 4ZYGA 5CYVA 3RKWA 4WXHA 2Z33A 3DV8A 1SMTA 1W5TA 3ULQB 4RGRA 3IL2A 3VODA 1PP7U 2DAOA 4MTDA 4MNUA 1ZAOA 2G9WA 1FBQA 5FD6A 5H6RA 4H0EA 4HX4A 2O3FA 2V1DA 3WU1B 2VBZA 4GGGA 1XSDA 2ZJ2A 1BOAA 3CUQB 3WU0A 4I0BA 3ELKA 1MJ9A 4YFNF 1BC8C 1EH8A 1WI9A 1ZARA 3H92A 1B59A 4LK1F 3GZ5A 1HXDA 3GVAA 3QP5A 2ADUA 1YYVA 3Q9SA 5DEQA 5BPDA 5H20A 4LB6B 1H9TA 3LQQA 3I53A 2YPRA 5LRSA 2RDPA 1YO5C 5CVJA 2R3SA 3GYHX 2P5KA 5AIQA 1OYYA 4A0YA 4BH9A 1HBXG 4IPAA 5E18F 3KP3A 1GXPA 5LEKA 3O2PE 4IVNA 1O7LA 4WCGA 1LEBA 5JVTA 5L3EA 4LG0A 4PCQA 3P9IA 3KP5A 4M6YA 1ZG1A 2D1HA 4JK1X 5E17F 3HSEA 3N97A 3M9AA 1LB2A 1SD6A 3HSRA 2KIMA 1PUEE 1XGSA 2QENA 4ENNA 4RB2C 1LEAA 2P6SA 1IW7F 2ESHA 3U2RA 4ZZLA 2V79A 3KZYA 1S3JA 1UHMA 2UWMA 2M87A 3V4GA 4MGRA 2VXZA 4PZJA 3V8KA 2V1UA 1S6LA 1XMAA 3E5QA 2YX4A 1FSHA 5HS7A 1IAWA 1FYKA 3W6JB 1KYWA 4XLPF 2OQGA 3B02A 2PMUA 4EGYA 2UXNA 3VEPA 2F5EA 3VB2A 3IRQA 3D5LA 1REPC 4EMSA 2FBHA 1KQ0A 2IPQX 1LDDA 2DPDA 5ILUA 2FE3A 2J5OA 4YFXF 3BJAA 2XAFA 3HRUA 4A5NA 1RIOH 1BBYA 3KFWX 4A0ZA 4AIHA 3CO7C 2P7CB 3L9FA 4OOIA 2L01A 3F8NA 1G3TA 5LEJA 2K4BA 2PG4A 4XSXF 3LA2A 5L3CA 4HW0A 4L0ZB 2VOPA 1VTNC 1RUNA 2A6HF 2Q0OA 3GFIA 1ZG5A 3E6CC 2G7UA 2DU9A 3WODF 3MZHA 2HTJA 2YSRA 5BS6A 4LLGF 3KP7A 4HLXA 1R5GA 3FWEA 4WXDA 1QNTA 5ICGA 2HQNA 5D5XB 4KMUX 3EQLF 5E1ZB 4Z2YA 1G3WA 4IRHA 4IHTA 1T0FA 1GHCA 4BQAA 3WG9A 1LJ9A 2MA3A 1IXCA 5K5OA 1IN5A 4S05A 2W57A 2ZBKA 3PQKA 3KEOA 1BIAA 2GA2A 2OD5A 4JVCA 3RPUA 5HLIA 4ETSA 3ZMZA 4MQVA 3CUQC 3F8FA 4JVDA 4UNOA 2E7XA 2NS0A 4RAYA 1ZN2A 4EVIA 1FP2A 2DQLA 1JHFA 5FLXZ 2PI0A 2P8TA 4UV9A 5HLHA 2Y48A 1SMYF 3GWZA 3NQOA 1Z05A 2PEXA 4L9VA 1B9MA 2M30A 4OIRF 3G73A 3TO7A 3PFIA 1R5HA 4MHGA 1LVAA 4LLNA 4M74A 2VBXA 2XGXA 1J0RA 1U5TB 2CSOA 5L3BA 1I6XA 4BAYA 3ROUA 2HWVA 1RZ4A 3LA7A 1KU3A 1U6GA 4MTEA 1XCVA 4BNCA 4B8XA 1A04A 3HUGA 1R7JA 4A0XA 2W25A 4JBAA 3WTWC 2COMA 1QO0D 4O3MA 2FXAA 3OV8A 1F4KA 3GX4X 1GVJA 5IT9Z 4LLLA 2QBYA 5ILVA 2IT0A 4I09A 1UCRA 2ACJA 3GFMA 4HA8A 3U9GA 4L9TA 2EWNA 1ZRCA 1F5TA 4PGGA 1ZRDA 1MJBA 4Y17A 4CDGA 5CVUA 3WTYC 4Q5SF 1UB9A 2H27A 1SAXA 1XGMA 3FF5A 4ESJA 5D8KB 1K7AA 4RGXA 4KFCA 4GXOA 5ICCA 3M7GA 2F5FA 1CF7B 1UHWA 1JXSA 1ULYA 2XAJA 2K86A 1BI1A 1T39A 1FZPB 3GUDA 1Z9CA 2H6CA 2OZUA 5DYMA 3EYIA 3V8LA 3TGNA 1B6AA 2FSWA 3M8EA 3MEXA 4QWQA 5KK1A 2P5LC 4RB1A 3F8CA 2E7WA 2DBBA 5ERIA 5DCMA 5AONA 4QLCU 4R1HA 3ZMTA 4GCVA 2H94A 3RYPA 1P2FA 2AXLA 3R0JA 4OU0A 1OR7A 4HAMA 1KU9A 1WKMA 5E1XA 4PDKA 3TQNA 2PMHA 4HF2A 1LNWA 1Z1DA 1PDNC 2VE9A 4UV8A 3V8JA 1OYWA 5BOXA 3I0TA 2IP2A 4L5IA 1FOKA 1LDKB 3W6KB 1BM9A 5HDNA 3GFLA 3REOA 2DO7A 1D8KA 2KJBA 1HSJA 2GQQA 2IA1A 4ZZDA 4WWCA 1MZBA 5A2QK 2QM3A 1FPQA 3FMSA 5F64A 5IT3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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