3ISPA

Crystal structure of argp from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
292
structure length
290
Chain Sequence
QLDGPQLAALAAVVELGSFDAAAERLHVTPSAVSQRIKSLEQQVGQVLVVREKPCRATTAGIPLLRLAAQTALLESEALAEMGASLKRTRITIAVNADSMATWFSAVFDGLGDVLLDVRIEDQDHSARLLREGVAMGAVTTERNPVPGCRVHPLGEMRYLPVASRPFVQRHLSDGFTAAAAAKAPSLAWNRDDGLQDMLVRKAFRRAITRPTHFVPTTEGFTAAARAGLGWGMFPEKLAASPLADGSFVRVCDIHLDVPLYWQCWKLDSPIIARITDTVRAAASGLYRGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of ArgP from Mycobacterium tuberculosis Confirms Two Distinct Conformations of Full-length LysR Transcriptional Regulators and Reveals Its Function in DNA Binding and Transcriptional Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator Rv1985c/MT2039
molecule tags Transcription
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 74
structure length 290
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3ispA01
3.40.190.290 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ispA02
1ONVA 4MNUA 2EFWA 4HYEA 2QQAA 2QWWA 4L0ZB 1D3YA 2R3SA 1ZHFA 4M72A 1Z91A 1IZ1A 3C1DA 4WK8F 3W6KB 3KLOA 3EUHA 1UB9A 1XDSA 4YG2F 3VODA 1PDNC 1FLIA 4S04A 1X3UA 2LDUA 3HOTA 2RVCA 2DLLA 5ED4A 1ZRCA 2ZNYA 3VOEA 1J0RA 1U5TC 4O6JA 2O0YA 4FHTA 2CWEA 4WXDA 2OD5A 3RPUA 5KK1A 1L3LA 2L02A 1BI1A 2HKOA 2OQRA 3ZMVA 4LMYA 3LAPA 3F23A 2FU4A 3SZTA 4Q47A 5DV5A 4JVIA 3DXJF 2L01A 3ROUA 1WRJA 1W7PA 5BQTA 1TLHB 5LEKA 1DPRA 2DQRA 3ZMUA 4ZH4F 4KYWA 2TDXA 2VBXA 1XSVA 2UWMA 3M8EA 4G7OF 3WGIA 4JK1X 3BDDA 1LEBA 5HDKA 2D2WA 4HOBA 4YFKF 1K78B 1XGMA 4P96A 3ZMSA 2Z9OA 3REOA 2FBHA 2DK5A 3F8FA 1LDDA 3U9GA 1XSXA 2ZKZA 1BIAA 5AIPA 4YIIA 4E70A 1BBYA 5JVTA 2MC3A 5ERIA 3FMRA 4K2EA 3V8LA 1FYLA 2P5LC 1RUNA 4KFCA 2RKHA 5JR3A 2W84A 4HZFA 1KQ0A 3GLXA 4MQVA 1HSTA 2FE3A 2P7VB 3GYHX 4IRIA 2D1VA 3RDIA 3M7GA 1MJAA 4HF0A 3ELKA 1TNTA 1IXCA 3R4KA 4QWQA 3QAHA 1Z7UA 4G8XA 1RIOH 3M9AA 3HHGA 1T39A 1TBXA 1P92A 3N4MA 4N0BA 1V4RA 4MTEA 1SFEA 4LK0F 5HDGA 1LDKB 2FRHA 3BJAA 3PFIA 1IXSB 4IRHA 3MCZA 1G3SA 1EH8A 2Z5UA 3W6JB 3WE3A 5FFZA 4EM0B 4GYIA 1TTYA 2H6BA 4A0ZA 4PCQA 1W5SA 4G6DA 1MGTA 3TKYA 5LGNA 3IKTA 4XSXF 4BHCA 5FD6A 1G6NA 2WV0A 2KKOA 1WWXA 4ESFA 1U3EM 5E1WA 4IVNA 4U7BA 1LB2A 3MFKA 3LQQA 3P9IA 1OYIA 4RAZA 2JPCA 4HQEA 5F64A 1J59A 5HVQC 2BE5F 4CHUA 4EQQA 6PAXA 1OMIA 2FNAA 2FXAA 3BWGA 3HHHA 4RB0A 5FO5A 1YW9A 1I1GA 1Y0UA 2M8EA 4RGUA 2GXGA 1G3WA 1S7AA 2QVOA 2PMHA 2K86A 4CO8A 4M9ZA 4G9YA 2FF4A 1H9TA 3IHUA 1WQ2A 2J5PA 3WODF 5LLQA 3EYYA 2NNNA 4OMYA 2ZCWA 1GVJA 1QNTA 3DQVC 4M74A 1W4MA 5D5XB 3E3VA 4RGXA 3KZZA 4BH9A 1F5TA 3BJOA 3MAJA 4Y13A 1QQIA 3RKWA 1USSA 3MZHA 1R1VA 4CZZA 4YIFA 3GW2A 1S3JA 4A0YA 4L9VA 2IA0A 3FHZA 2KJBA 5LRSA 2HFHA 1JE8A 3CUQA 3F21A 1UFMA 2XKPA 3L00A 4HBLA 1SMYF 3H3UA 5L3EA 1MJBA 5HOOA 1FZPB 2GXBA 4R8HA 3SQNA 4HX4A 2ZNZA 4EJUA 1SMTA 3ISPA 3GEZA 4RS8A 2A69F 1ON2A 3F8MA 2AS5F 1ZN2A 3ZP5A 5ICFA 1DUXC 2BBYA 4UV9A 3V7RA 5K5QA 3RPQA 3K1PA 3QP5A 2A6EF 2KIUA 3KP2A 5E17F 5ILVA 3R0AA 4LLNA 3ZN0A 4CGZA 3IRRA 3HOSA 1Z6TA 3KCCA 2UXNA 3F8BA 3ERED 4A12A 2L3DA 5CVRA 2MA3A 2E7WA 4LJZF 1JHHA 3KP5A 5HS9A 3TQNA 3IRQA 3O2PE 2JT1A 1R58A 2FOKA 4RB1A 5ICEA 4BAYA 5DYMA 4HQMA 1ZG5A 4U0WA 4KUMA 1S29A 2ZBKA 3KP3A 1VTNC 2CW0F 1PUEE 2QENA 1QZYA 4FT8A 4L18B 2HYFA 2IPQX 2HOEA 2VOPA 1SD6A 4B09A 5CVUA 3P7NA 2AXLA 4HV5A 1QZZA 5HS8A 2KIMA 1DDNA 4PGGA 4L9TA 4KNYA 5LGTA 1FYKA 3KEQA 2HS5A 4KIFA 2E1NA 3LA3A 4EM2A 4P9UA 3WTTC 3HTSB 1J75A 4CICA 1Z9CA 2IJLA 3ULQB 5DUIA 4ETSA 2Q2EA 2JZYA 1WI9A 4XSZF 2G7UA 1KQ8A 2DTRA 1OYWA 4O3MA 5LHGA 4A0XA 4L9NA 3L7WA 2XV4S 4U0VA 4MQ9F 3L9FA 3RYRA 1ZLJA 1S7OA 1LNWA 1Z6RA 3DPTA 3HYIA 3GFLA 2PBIA 4L5IA 4RAYA 2A5YB 2V79A 2K02A 1BN5A 4RB2C 1FP1D 2RV8A 1BM9A 3IL2A 1UHWA 3F22A 2HKXA 1K6OA 4JQFA 1W5TA 5LBQA 5LEJA 3GFMA 1IW7F 4OIRF 5D4SA 4G7HF 1T0FA 1ZGJA 3V4GA 1O3RA 1BI3A 3MQ0A 3P9CA 3DF8A 5DEQA 3I54A 2Z3YA 4YFNF 4EJTA 1MDMA 3QOPA 3SZPA 3BY6A 4A5NA 4FX4A 2DPUA 3C3WA 5LGUA 2MBFA 2F5DA 3BZ6A 4UNOA 1E2XA 1ZG1A 2GA1A 2YPRA 4CXFA 2UXXA 1IRGA 2VONA 1QGPA 2VBYA 2XAJA 2EJRA 1KYZA 2STTA 4ASNA 1SAXA 4XBFA 2VE9A 5L3BA 2P8TA 3M1EA 2V9VA 1XMAA 2VC0A 2XROA 2KIFA 4HDUA 4P55A 3JAMZ 1F9NA 3PQJA 5K5OA 2A6HF 2PLYA 2WWYA 3JAMK 2JSCA 3WTUC 3TOBA 4M71A 3COAC 2FA5A 4WF2A 2R7FA 2VXZA 5L3DA 3GO5A 1B59A 1BIBA 1BI2A 3LWFA 1W7PB 4EJVA 2A68F 5AONA 5L3GA 3K2ZA 3RKYA 4BQAA 2BGCA 4A6EA 3K0LA 1XGNA 2P7CB 3HRUA 4GCVA 2O8XA 4IHTA 1U6GA 1IAWA 3DP7A 3G73A 3E97A 2VBZA 5J8CA 3JTGA 2HGCA 2EK5A 2FEZA 3WGGA 2ZXJA 3RIRA 2QQ9A 1S8NA 4Z2YA 5HLHA 3QU3A 5JI6A 3GVAA 3LFKA 1R00A 3V8JA 1TQMA 2EA4A 2M87A 3G3ZA 5D8KB 4UHTA 4XRFA 1UHMA 1T98A 1FBQA 4LK1F 2Q8KA 3B02A 3N97A 5F1RA 2PEXA 4HF1A 2JRTA 2FBKA 3KE2A 4MEYF 4UVCA 1EH6A 2NNYA 2CFXA 2EFQA 1YFHA 3HRMA 3SHFA 3FM5A 3T8TA 3S2WA 1P4WA 1R1UA 3ML6A 5FGMA 2MLKA 3DPLC 2HR3A 4AIHA 1R22A 2P5KA 4IJAA 3SFZA 3TGNA 4UUVA 1D8JA 2MH2A 3WGHA 1FPQA 2H27A 3R0JA 1HBXG 4ZYEA 5LRRA 3U1DA 3T1BA 2F5CA 5AIQA 3RJPA 1U8RA 1ZLKA 3GFJA 4EV0A 3R61A 4I02A 2XVCA 1QBJA 2YX4A 3WG9A 2D1HA 1LJ9A 1P4AA 5ICGA 3I59A 2IRFG 2ISZA 3I59B 2WC2A 3ZMDA 2IP2A 4DNCA 1T2KA 2P6TA 3HRSA 1V3FA 2HTJA 2OU2A 2BEOA 2HQRA 3KP4A 2G7HA 3WTXC 1BC8C 4AD9A 1IUYA 4WXHA 2GZWA 3TO7A 5K5RA 1P2FA 1QPMA 1REPC 1LEAA 4FX0A 2EA2A 4IPAA 2XUBA 1YS6A 4ON0A 2ZJ2A 1A04A 5CVJA 2IA1A 4ZYGA 2O61A 1H9GA 3QPTA 5BPDA 4I01A 2BV6A 3GF2A 5EEGA 4WCGA 5DCMA 2KJCA 2ZMEA 2W85A 2QBYA 3FM3A 2ZMEB 3CJNA 1XB4A 2QBYB 1O3TA 3EETA 1KQ9A 2E7XA 1U5TA 1U5TB 1H0MA 1R36A 2XAHA 1F1ZA 3KP6A 3K69A 1PP8F 2EWNA 2XKOA 4LD5A 2CYYA 4G94A 4NB5A 3GX4X 1RI7A 3F6OA 2LF8A 2OZUA 3M8FA 2YX7A 1I27A 5CVIA 3MZYA 4MTDA 2O3FA 2UZKA 3BOQA 2KRFA 1ZRFA 1HW1A 1TQPA 1XGOA 4KMUX 1YLFA 5HDNA 1BJAA 3CUQB 3JW4A 1I1SA 5D5UB 1FC3A 2NAZA 1IN7A 3QPHA 1ZAOA 4GXOA 4OIOF 3U2RA 1BOAA 1ZREA 4HLYA 3HUGA 2JTVA 2E1CA 3TDUC 1T38A 4O5VA 2A61A 3D5LA 1IN4A 1O7LA 4IXAA 4ESJA 3NQOA 4KIGA 5CVVA 5D4RA 2PQ8A 2K7LA 2EV5A 3OOPA 1T6SA 4KDPA 3Q9SA 5CJ9A 2MH9A 5KVRA 2RC4A 2W57A 1LVAA 4ZZDA 2GIVA 3J81Z 4OIQF 2V1XA 3NEUA 3WTZA 2GA2A 2C6YA 3BP8A 3J81K 1IN8A 3HSRA 2Y48A 3T5XA 1FX7A 4M73A 2RDPA 4M9XA 4QLCU 4G6QA 4LFUA 1MJ9A 4U0YA 4OMZA 4U7DA 2Z99A 2VT2A 2VBWA 2M1BA 3E5UA 2NRAC 1WSUA 5E20A 3ABUA 1P6RA 1E17A 1FOKA 1ODDA 4YFXF 3FXQA 1JXSA 3JTHA 2F5FA 2A07F 3V7CA 5JHUA 2H6CA 3ZQ7A 4IF4A 2XGXA 4L0YB 2R7DA 3WTWC 2IVMA 3L2CA 4UVBA 2OZ6A 4PDKA 4HW0A 1HQCA 2W24A 3L09A 3IKVA 2EV6A 4GGGA 3TO9A 3E5QA 1LDJA 3V7SA 5HLIA 4NHJA 3DV8A 5IT9Z 1J7KA 1TW2A 2QM3A 2DPDA 4AVPA 4GO1A 1FWZA 5IT9K 5DDGA 2CSOA 5F6FA 1AOYA 3GUDA 2COMA 5H6QA 5TRDA 2DBBA 4HX7A 3TDZC 4N9IA 2V1UA 1GXQA 2XHKA 1STZA 1U78A 3Q9VA 4UXNA 1JHFA 1D5VA 2EFOA 1TQIA 4I0BA 4Q4ZF 3E6CC 2PI0A 2FQ3A 1J9IA 3WTSC 1R1TA 1W7PD 3KP7A 4KMFA 4WXCA 3J80Z 1MZBA 4ZYHA 4S05A 3F3XA 5D8LB 1FSEA 1O3SA 4LB5A 3C18A 1MDMB 3J80K 2HZTA 2Y75A 1D8KA 2CG4A 3LQRA 1Z1DA 2XASA 4BHBA 5FFXA 4JVDA 1P4XA 5HS7A 1HKSA 2FBIA 2Z33A 4AIJA 2OQGA 2XIGA 5ILSA 1DP7P 4HF2A 3P9KA 1O3QA 3PQKA 2HQNA 3ECHA 3HIFA 2ISYA 2YU3A 1SD5A 1XCBA 2GAUA 1B1BA 2V1DA 2OA4A 3DKWA 5LHHA 3I58A 1KU9A 1YIOA 1DPUA 4I7HA 1UCRA 1L0OC 4A6DA 2RN7A 2W25A 4ZYDA 4EVIA 4EGZA 3FXRA 3E6MA 3VB2A 4MHGA 3J7AO 2HWVA 4Y15A 2ZO4A 1OPCA 2YSRA 2XAFA 3F6VA 1B9NA 1SD4A 4RB3C 1RUOA 3IC7A 3QRFF 4KICA 3WTVC 1ZARA 2ZFWA 4D0PA 1FBSA 3F8CA 2DO7A 4M6YA 4Y17A 1HXDA 3QU6A 4QBAA 3HTUA 4Q5SF 1NHAA 2EFPA 5E18F 4HLXA 1G3YA 2RQPA 4JBAA 2FNPA 2ESNA 1CGPA 4KN4X 1F4KA 2X0LA 3K1NA 5H20A 1HKTA 2NS0A 3I53A 3NRVA 2DK8A 2Q0OA 1PP7U 1MKMA 4R1HA 3WU0A 3GXOA 1XGSA 1KU7A 1XDUA 3FMSA 1SFXA 3CUQC 3T0YA 4OOIA 4HV6A 2STWA 2GWRA 3WU1B 1BC7C 3I5UA 2PG4A 4R79A 1K78A 1XSDA 1XD7A 1FSHA 4IHSA 3GWZA 2VOOA 3GFIA 2FSWA 4XLNF 3CUOA 1ZH5A 3KZYA 4A5MA 4TV7A 3K1MA 2PFBA 3H92A 5D5VB 4NQWA 1RZ4A 1YW7A 2ELHA 2QQBA 3ABTA 4KA4A 4P5OA 1GXPA 3HSEA 4HX8A 3ZN1A 4I09A 1IRFA 1HSJA 4EJWA 2MD5A 2BYVE 2P4WA 1SD7A 2LF7A 2ACJA 5IT3A 4EM1A 4ENJA 2RNJA 1AWCA 5DD4A 1KU3A 4N9HA 2G9WA 4LB6B 4PZJA 5A2QZ 1ZRDA 2ADUA 2K27A 1OR7A 1KA8A 3I64A 4HAMA 5A2QK 1K7AA 3R6SA 3E5XA 1G4DA 1J2XA 5J8FA 4AIKA 2HDCA 2QZ8A 1FNNA 5DD8A 4M6XA 1K79A 4UV8A 2V6CA 1Q1HA 5D6EA 3SXYA 3LSTA 2ESHA 2X4HA 4JVCA 3LAJA 4KIBA 3AAFA 1ON1A 3ZPLA 1YYVA 2LKPA 2LNBA 4OIPF 1CF7A 1CF7B 3CTAA 5E8IA 1XMKA 3CO7C 1R23A 2CO5A 5BPIA 3ECOA 3HRTA 3GZ5A 5BOXA 2VN2A 2H94A 5J6XA 4U88A 1I5ZA 3DEUA 1YO5C 1GHCA 4EMSA 1EH7A 3FZVA 1YW8A 4I2OA 3KFWX 2HTSA 3CO6C 3O3KA 2XAQA 3IWZA 3QP6A 4MGRA 1B4AA 2P5VA 2DQLA 5DCMB 3B73A 2A3SA 2M5WA 5TJJA 3WE2A 2EFNA 1FT9A 5EEHA 2PMUA 1B9MA 3F8NA 2HEOA 5D6FA 2DFIA 4I98B 2MLGA 3JSOA 3FMQA 4OINF 3FX3A 2HYGD 4L5JA 4KN7X 3HSFA 1S6LA 1R5HA 2H09A 3WTYC 2VE8A 4EGYA 2M30A 2LSOA 1IXRC 3TO6A 3E6BA 1USTA 2YR2A 3F72A 2O03A 1KU2A 1JGSA 3IWFA 5ICCA 3KLNA 2RGVA 1HW5A 5K1YA 4GYGA 3EQLF 2IA2A 2QLZA 5LHIA 2IW5A 2GQQA 5FLXZ 1HW2A 2DU9A 4Q48A 5FLXK 5E1XA 5ILUA 4WWCA 4LLGF 1YS7A 3R60A 2DAOA 2L4MA 1XCVA 2OBPA 3RTRA 2IT0A 3O6BB 4L9JA 4P9FA 5D5WB 4ESBA 1FP2A 3JSPA 5CYVA 3V8KA 2B0LA 2K4BA 3LA2A 3CLOA 4CDGA 1O57A 3FWEA 1I6XA 1QO0D 5BS6A 3GZ6A 1G3TA 2HXRA 4G7ZF 1KGSA 1XN7A 2ETHA 1IN5A 4PGHA 2P6SA 1ZYRF 2CGPA 1OKRA 2VT3A 3LA7A 3EYIA 3BJ6A 2EV0A 1TW3A 1J5YA 2XAGA 3MWMA 4BXUA 2QUFA 3E6DA 4H0EA 2M45A 1FY7A 4AWXB 1O7FA 4MEXF 2L54A 2L4AA 2D45A 2O6GE 1MD0A 1SFUA 1TNSA 2FMYA 3D0SA 3EDPA 3ZMZA 3KEOA 4XLPF 1YQAA 1R7JA 1ZGAA 5DCFA 5FD5A 4ZZLA 2PJPA 2K4JA 2OAZA 2DI3A 3BPVA 2JPBA 2EB7A 1IF1A 5HLGA 2DW4A 4ENMA 4CYDA 4EJOA 4BNCA 2F5EA 4A2UA 3FXUA 5DUKA 3MEXA 3DFGA 1OYYA 3Q5FA 4I0AA 2CQKA 4B8XA 1HKQA 1B6AA 3BPXA 1BI0A 4ENNA 5E1ZB 1WKMA 1EV7A 3I71A 3I0TA 4HA8A 4LGWA 4ENKA 4BYYA 4F7ZA 3BROA 2VODA 4UVAA 3RYPA 3FF5A 4RGRA 5E8GA 4KT5C 5BMZA 1YTYA 2FMLA 5CLSA 2VC1A 2WTEA 1C0WA 2J5OA 2F2EA 1R5GA 3OV8A 3ZMTA 4LG0A 3VFZA 4LG0B 2XRNA 4WX9A 5JFRA 1U2WA 1YG2A 1ULYA 4IRGA 3TOAA 5H6RA 2QYOA 4HDVA 3KETA 3K9TA 3C7JA 1FBUA 3RI4A 1KYWA 4DQ2A 3H3ZA 1ZG3A 4BHPA 2Y0MA 2PN6A 4LLLA 5FB2A 1RNLA 3CDHA 3RKXA 1FYMA 4OU0A 3VEPA 5L3CA 2NYXA 3I4PA 5L3FA 3T8RA 3HFUA 4RGSA 1IN6A 1LQ1A 4M9SA 2DT5A 1Z05A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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