3FXRA

Crystal structure of tsar in complex with sulfate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 86
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxrA03
1URDA 3R60A 2RCAA 2WTEA 1Z6TA 4ZZAA 5ICQA 2EK5A 5LEJA 4DXCA 2A61A 3FGSA 1VSOA 4XXUA 2JPBA 2XUBA 2RDPA 1PBPA 1MDQA 5DD8A 3FWEA 3PMXA 3OEMA 4G2ZA 3T5XA 4BYYA 3CO6C 2DTRA 3R0AA 3DP7A 5I2KA 2BJJX 3SESA 3DPLC 3E6DA 2YPNA 3PQJA 5H6QA 1FTJA 1FTOA 1MXVA 2HOEA 4NF5B 4KCDA 3UIFA 3KP7A 4RB3C 2PMUA 5JR3A 1JEVA 3MZHA 1ZN2A 4RJZA 1QULA 1ZHFA 3MPKA 2ZNYA 2COMA 4HF0A 1SMTA 3WGHA 1ZIUA 5I57B 3T9XB 2P2AA 1JE8A 3S2WA 1JW4A 5AA2B 1FC3A 3SEXA 3F72A 2O7UA 1B58A 4U0WA 1MRPA 4Q5TA 3O3KA 5AA2D 5BPIA 5DEQA 1K6OA 4OWDA 5ICEA 4BDMA 3EN3A 3IB0A 4UVAA 1XN7A 3KFMA 5DTBA 1IXIA 1MD0A 4LATA 1B2HA 3IC7A 1B3FA 1AMFA 4H0EA 1XGOA 4C1UA 2UZKA 4GWOA 1F9BA 3K02A 2R9JA 3E4RA 4UXNA 4MQVA 3EQLF 4POXA 2L02A 2I3WA 2V1DA 2J5OA 2LF8A 4DDDA 3E3VA 2QWWA 4YIFA 3CVGA 4ZYDA 3ZQ7A 3KCCA 3CUQA 3F3XA 1AOYA 3TGNA 2ZMBA 5CMBA 5ICFA 1KQ8A 3EQ1A 3COAC 1FP1D 2TDXA 2PFBA 1NNKA 1U2WA 3HHFA 4A0XA 1WRJA 1NHAA 2OA4A 3RN8A 5M2VA 1USTA 3CTAA 4PE5B 3VFJA 3JV9A 4Y13A 3WU1B 3F23A 1V3FA 5CVUA 1HQCA 3IOVA 1J2XA 4GYIA 4CXFA 1MH4A 4FEDA 3TQWA 4YB7A 4E0XA 1MZBA 5H20A 1SW4A 2G93A 2NAZA 2XHKA 4GCVA 2JSCA 2OK2A 4MH5A 2XXTA 1SAXA 3GXOA 4HOBA 2NUVA 5HVQC 3WAFA 5H8NB 4HQMA 5J6XA 3BY6A 5FB2A 3MVYA 1M5CA 1QPMA 2NVUB 4BDQA 1I27A 3Q28A 2OQRA 2UYFA 4JK1X 5ILVA 3FVOA 4DXUA 1WKMA 2KRFA 4KICA 1YTYA 2RQPA 3HOSA 3LAPA 4KPTA 2V25A 2H9BA 1IIWA 4M6XA 3IB2A 1MJ9A 1VTNC 1DMBA 1SW5A 4L5JA 1GR2A 1IZ1A 1DTGA 3U9GA 4XKRA 4GF8A 1KQ9A 4AB6A 5D4SA 1MQDA 5D5XB 2UXAA 2PYYA 2FQ3A 3P9CA 4RXLA 2DE4A 4KQPA 1S3JA 1BTJA 4HA8A 3M1EA 2QQAA 5EHSA 2OWSA 2YX7A 4L9JA 1PB9A 1KGSA 3RTRA 1P1UA 2HDCA 2DBBA 4GXAA 1U3EM 1TWYA 1JHFA 1B32A 1FQCA 1SQYA 5KVRA 3RJPA 4BLAA 3FMRA 1FWZA 1B4HA 5I56B 3K0VA 3V4GA 2M30A 3QUFA 3CFZA 2Y48A 4XTCQ 1Z7ME 1N7WA 3VLVA 3KZGA 3N97A 1N04A 2MH9A 4R1HA 1IEJA 2OQGA 2RGVA 3L2CA 4NF6B 3UGWA 1J0RA 4RS8A 3DP8A 1O3RA 1B0HA 2CYYA 3LR1A 1FBUA 4OXVA 3IO6A 3QP5A 2QS4A 3BPXA 3K6UA 3QPHA 2Z8DA 1DSNA 2ZNUA 3FV2A 1I1GA 1FTKA 4WCGA 4QSEA 1P99A 3NQOA 4HTGA 3M9AA 4U7DA 4H5GA 2WKYA 3TOAA 4TOZA 4AB5A 1KYWA 1FBSA 2DW4A 3KP3A 2CG4A 1MY1A 1TFDA 2IA0A 5FD6A 3RI4A 2LKPA 1A7LA 2FNCA 3DFGA 4LB6B 1DP7P 1A99A 2X4HA 4LQ5A 4P55A 5L3EA 5AA3A 3E5XA 2VBYA 2V6CA 2STTA 4L17A 2EFQA 4H0WA 3MEXA 1FPQA 4RAYA 2Q8JA 3I6VA 5FLXK 3FV1A 1CF7B 5TP9A 1BJAA 1MQHA 2BYVE 2M8CA 3M8UA 2GA2A 4PFUA 3SKPA 3HRSA 3RLFE 2IA2A 1KA8A 1YIOA 2V9VA 2HYFA 3M8FA 3TTRA 5HOOA 3J7AO 2HEUA 4HQEA 2Y84A 3FVKA 5JTYA 1U8RA 4QRZA 5HLHA 4RNSA 2AIXA 1ONVA 3CJNA 3L9FA 1TQPA 3KLOA 2WWYA 4UHTA 3HRUA 4R72A 2QS1A 5A5XA 2C6YA 4RYAA 2OBPA 1Y3QA 1NFTA 3H6TA 5K1YA 2O61A 3C31A 4MTDA 5KDTA 5ELVA 3GFIA 3IOTA 2KIMA 1GGGA 2OWTA 4JWXA 1UHWA 1B1HA 2DWIA 1WQ2A 1Z1DA 4G6DA 3K6XA 1TW2A 3HSTA 2THIA 1OR7A 1JVXA 3WODF 4FORA 3TTLA 1HKQA 2XXRA 4HW0A 1HKTA 4I7HA 2E0SA 1J1NA 2VD2A 2OJTA 1IN8A 3IWZA 3KJTA 1GVJA 2MD5A 1A40A 5L9SA 4MLVA 2OAZA 2PVUA 4KA4A 2BEOA 3O66A 2F5CA 4G94A 4ONYA 1ZREA 1OLCA 3SDFA 2H25A 4UVCA 4GL0A 5ILUA 3MZ9A 3TCFA 4H1XA 4EXKA 4IO4A 5L3GA 1UTBB 1NKXA 2HZKA 4Q30B 1RUOA 1XVXA 1L0OC 2ANJA 2GRVA 2ISYA 3BP8A 1BI3A 3GUDA 1STZA 2VT3A 1M5FA 5ILSA 2WC2A 2XGXA 4Y15A 3H92A 1KQ0A 2DOJA 1LJ9A 3H6VA 2M8EA 3DV8A 4LVQA 3L09A 5JEIA 4U4XA 4LLGF 2B0LA 2VT2A 1EH7A 1B5IA 2QJEA 3U1DA 4HZFA 4B09A 5HLIA 3TTKA 4PP0A 3SQNA 4ESJA 3MQ0A 4F29A 1FX7A 2DT5A 3WE2A 3C9HA 1TBXA 4EJUA 1HKSA 1SD3A 2ZCWA 3G3KA 3WTZA 4F1UA 2EV0A 3I0TA 3MBPA 2GFEA 1UIVA 3U92A 3PQKA 2F5XA 4PZJA 3F11A 3A09A 5H8HA 5L3FA 5BPDA 5IAIA 1XMAA 1IXHA 1P92A 1Q1HA 2DK8A 2IA1A 3U72A 2DSFA 1N7XA 3GEZA 1R23A 4ZEBA 3EYIA 4R6KA 4NB5A 4X9TA 5B7DA 3BDDA 2F5EA 3VV5A 3P9IA 4HV6A 4OMZA 5HDGA 3TO6A 3SEYA 4MLQA 3I59B 4KYDA 3FMQA 1M5BA 2FMLA 3UA8A 1FQAA 2XAGA 2Y7WA 3KE2A 4EM1A 4KMFA 4NQWA 3QRFF 3E13X 3T9UA 2PQ8A 2XX9A 1K78B 5IT3A 5E1WA 2PI0A 1P6RA 3MAJA 1I6QA 3K69A 1UTHA 4LLLA 4U1OA 2Z33A 2QVOA 2HGCA 2MBFA 1KYZA 4H67A 2JTVA 3H3UA 1R1TA 4G8HA 3KP4A 5CLSA 1UQWA 3PGFA 1M5DA 4F3SA 2FE3A 1H45A 2QSXA 2X0LA 1G4DA 2Z22A 1DTZA 2H6CA 1QKAA 2RKHA 1FBQA 1F9NA 2FU4A 1DOTA 1FYMA 4IO2A 4PQJA 2P5VA 4G4PA 4LGWA 2DXYA 1H0MA 2QL3A 1SD7A 3M3FA 3GFMA 4WEPA 4QLCU 1XS5A 4GVOA 4XSZF 5FLXZ 3ABTA 3ECOA 3PD8A 2RN7A 4IXAA 4HV5A 2VC1A 4WWCA 3LA3A 1B3EA 3EHUA 1B7UA 4ISUA 4FX0A 1BIYA 2DWJA 3HHGA 1D4NA 5DVIA 3FASA 4EMSA 2BE5F 4MEYF 3WGIA 2A5YB 3JTHA 4RAZA 4LG0B 3IWFA 5DDGA 3HYIA 1G3YA 1ZRFA 4H8JA 2NNNA 1TW3A 1P2FA 1IITA 1D8JA 3C32A 3TQLA 3UP9A 3I58A 2NNYA 1R00A 4UV9A 5I58A 2OZ6A 4BQAA 4U21A 1PP7U 1MDMA 1L5TA 1MM7A 4MFIA 1LDKB 2Y75A 1BC8C 3MZBA 3IRQA 3MZYA 1Z7NE 2VBZA 2W57A 1YS6A 1ANFA 4GRKA 2A07F 4KFCA 3C3WA 4JB7A 4HX8A 1E17A 1O3SA 3ULQB 3H4ZA 5D4RA 2H5YA 3OOPA 2PBWA 4YB5A 2D21A 4U0YA 1FLIA 4OTEA 1EZPA 2DE3A 3GBBA 1U6GA 1W5SA 5DCMB 4ZS9A 4OHNA 5ISUA 2FXAA 2KJCA 4KN4X 3LA7A 3KN8A 3LFKA 5E8IA 2QLZA 2W7YA 3IJXB 5FFXA 2EA4A 4CICA 1PDNC 1MQIA 4IY5A 1H44A 1QUIA 1U5TA 3UK4A 1R5GA 2YSRA 1R36A 2LDUA 3L00A 1H76A 2IRFG 2ISZA 3GWZA 2Z23A 4QFLA 2QS3A 4LLNA 3FX3A 4HBLA 2O7IA 1LBBA 1AH5A 1II5A 3RTFB 1XSXA 3F8MA 2O6GE 3QP6A 1QGPA 1B4AA 4LP2B 3USDA 1TNTA 3PU5A 2HTSA 3GLXA 3VXBA 3KEIA 5DEXB 2EFWA 3E5UA 3K4UA 2XKPA 4GD5A 3HSRA 3GF2A 4I02A 1MH3A 1XT8A 3HPIA 4M72A 3ZS6A 3O97A 1EV7A 3LWFA 2KLFA 2ZKZA 4NWDA 2MH2A 2VE8A 4N9HA 1KU3A 3FJMA 4EXLA 4NF8A 3ZKKA 1T0FA 1DUXC 1ZMGA 1YLFA 3N6TA 4BHPA 1F5TA 1R9LA 2A5TA 1N0TA 3DKWA 2FF4A 4EDPA 4I62A 3O2AA 1XSVA 1W4MA 2I58A 3FATA 5AE4A 3BROA 3G3GA 3BFTA 2RV8A 2CFXA 3QU3A 1HXDA 3F8FA 4I01A 3K01A 2F36A 2XASA 2UXXA 4OQOA 4H65A 3LSLA 4G7OF 1VFEA 4LD5A 3LQQA 2P5LC 1T2KA 3PPRA 1MXYA 2A6EF 3SEVA 2XHDA 3EHSA 5FD5A 2E1NA 3A3UA 2DPDA 2Q9TA 4IHSA 5EYFA 3W9VA 1MY0A 1RI7A 2OBGA 1XGSA 2X7PA 4F7ZA 2I4CA 4M1VA 4B8XA 3HV1A 4ZE9A 4AIHA 4JWYA 3D0SA 4M9XA 2Q2EA 5DVJA 4NF4A 2OD5A 1P1WA 2E1SA 3CO7C 3HHHA 2G29A 2M45A 5CVJA 2VOPA 3FM3A 3RKWA 1YPNA 2R7DA 3VLUA 3MAMA 5ITOA 5F64A 2HXWA 5AA4A 4FATA 3IORA 3FJGA 1OVBA 3V8XB 3VE1B 3E3KA 3T93B 3KFWX 2O1MA 2MLGA 5IKBA 2XRNA 1LAFE 4PFTA 1ZYRF 1IQ7A 1FSHA 4H8IA 1ZAOA 4M9ZA 3T8TA 3CIJA 3HCQA 3VB2A 3T9HB 4UA8A 2DK5A 3EF7A 1IN4A 1B4ZA 4EJVA 4U1ZA 4BAYA 5HDNA 2OLBA 3WE3A 2XXYA 2Y0MA 1IUDA 3MCZA 1ZLQA 3B6QA 4Q8RA 1O7TA 3MVZA 4YMAA 5HS9A 3E6CC 4ZEIA 1LLSA 3SZPA 1D5VA 5HDKA 1H9TA 1EZ9A 3GZ5A 4LUBA 3PPNA 4KHZE 5I59B 1N76A 4M74A 4AQ4A 1GHCA 2NRAC 2O51A 3K00A 1IAWA 3BJAA 4EQBA 4O3BA 5CBSA 4N13A 3MP6A 4IRHA 3MJNA 2IW5A 1GVCA 3CUQB 3O2PE 3VEPA 1MY4A 4HW8A 2IVMA 4ZEFA 4N0BA 4BDOA 4OZ9A 1LB8A 1JGSA 1RZ4A 3HTSB 2NOOA 3WTUC 4O6JA 1RIOH 2B65A 2NYXA 3AAFA 2DI3A 1IF1A 3G3IA 1NNTA 1Y3PA 2XKOA 5I57A 1Y9UA 1IRGA 3K9TA 3TODA 5F1RA 5JFRA 5CM6A 5ITPA 5AA2A 1XSDA 4ECFA 3N4MA 3TDZC 5D8KB 2F8DA 4OENA 2FBHA 4ZEDA 2Q89A 1J9IA 2VODA 3CI8A 3Q27A 1Y4CA 3HSFA 2ZBKA 3ERED 1Y1MA 2REGA 1MGTA 1UIUA 3B02A 4A6EA 4ZZDA 1I1SA 3EHTA 4L9VA 4FJPA 2UWMA 5FO5A 4OVJA 2XX8A 1A8EA 3OO8A 5KK1A 3P7NA 3PPQA 1SDXA 3MP1A 3WTYC 2VC0A 4K2EA 3W6JB 3L6HA 1SFEA 2E7XA 4LZ5A 3TTNA 3J80K 3TTMA 4TLMB 1ZTYA 4NE4A 4KD5A 1HW2A 2EFOA 2F35A 2UVIA 3PD9A 1ZARA 3F8NA 1HSEA 2IP2A 2OZZA 1TQMA 1W7PA 3ZN0A 4BHBA 4MGRA 4A5MA 4ESBA 3TMGA 3LSFB 2LF7A 3S9NC 1ZBMA 2EJRA 4P0GA 5E17F 4JQFA 1SBPA 1VR5A 4ZZLA 2FNPA 4I0BA 1GXPA 2I6EA 3CUQC 5E18F 1FOKA 2QYOA 1NH8A 5DUKA 2XIGA 2YX4A 3GVAA 4OIQF 2GHBA 3TZAA 4UVBA 3D4GA 5AONA 1SD6A 1H3DA 4KYEA 2W85A 4UUVA 5H8NA 1BC7C 4LB5A 5JK4A 2P7CB 3VLWA 2GH9A 3P7IA 3DP6A 4RGUA 3CLOA 3DELB 2FMYA 4RPNA 4F1VA 2HQRA 3KEOA 1L3LA 4DIGA 2Q88A 3IOWA 3CG3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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