3FXUA

Crystal structure of tsar in complex with its effector p-toluenesulfonate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA03
1FBSA 3ZMDA 4CZZA 4AVPA 4MLQA 3DP4A 1RNLA 2AYSA 2GIVA 4FE8A 5L3FA 3NEUA 2A6HF 2QZ8A 3OOPA 5I57B 3TDZC 3TODA 2K7LA 1STZA 3TO7A 2QYOA 1IN8A 1BJAA 2J5PA 1FCKA 1JHFA 5BUUA 1QKAA 3N6UA 2ZNTA 5CJ9A 3ECRA 2XX7A 1JGSA 3B6TA 1W5TA 4GF8A 2FF4A 4PETA 4RGXA 2UVHA 3QSLA 4R2FA 4U22A 5DCFA 5H8HB 1O3RA 3B6WA 2V6CA 1ON2A 3L7WA 1YYVA 4ZZLA 3IKTA 5HPQA 2EK5A 4KYDA 1XMKA 4ETSA 3G3ZA 4EM2A 3WAFA 2XGXA 3GUDA 3FHZA 2O1MA 1J7KA 3Q9SA 1P1OA 3C35A 2A5TB 2I3VA 1II5A 4ON0A 3TCHA 4ZDMA 3KOSA 2QWWA 3R0AA 3PPNA 1R9LA 5CVRA 2P5KA 3GWZA 4F29A 2HYGD 1YPNA 5AIQA 5D8KB 2NWJA 3T9XB 4LG0A 5ICTA 3UP9A 2X7QA 1HQCA 2A69F 1QBJA 4IRGA 2IA0A 1QVSA 4ZYHA 3OD7A 4EVIA 4GXOA 1BIYA 2OWSA 3PUXE 1HXDA 4I0BA 4DCXA 1QQIA 2ZJ2A 2G9WA 1F5TA 4RB1A 5AA4A 3H06B 4QSCA 1ZAOA 1XMAA 4A5NA 3CG1A 3WTUC 1QO0D 2FMLA 2DT5A 3QUFA 1XN7A 4WK8F 2F7BA 1US4A 3I4PA 1XD7A 5JR3A 4U4SA 3EYYA 1Z7NE 2R6GE 3FD3A 1R58A 3CG3A 1UTBA 1P6RA 1P4XA 3M3KA 1HW5A 3PPPA 3HOSA 5FTHA 1MDP1 2RQPA 3KZZA 4KYSA 3BFUA 3PUYE 2NNYA 4E70A 2BBYA 2TDXA 3ISPA 1SD5A 5AA2B 5I58A 3T8TA 4BDQA 1B3HA 2EV5A 3ZMUA 1A40A 3IORA 3QPTA 2LKPA 4OFJA 5CI5A 4UVAA 1CGPA 4AIKA 3KEOA 1A8EA 3TQNA 4MGRA 2KIMA 3MPKA 2A07F 5E8GA 3W9WA 3PPOA 4YKIA 2AS5F 4KYWA 3H6TA 3WG9A 4P0IA 4QSEA 3UN6A 4HQMA 5HDGA 3WTVC 4A0YA 1WWXA 1QZYA 2FU4A 2ZMEB 4BLAA 5CYVA 2AXLA 1SI1A 5DDGA 4U0VA 1G3TA 2P1SA 3V83A 4YG2F 3KCCA 3OO8A 1D3YA 3G73A 4EJTA 5TPAB 2FQ3A 1Z6RA 4QFLA 3DELB 1YCJA 1NFTA 3K6UA 1REPC 3W9VA 3ZMSA 1SD7A 2A68F 1PP8F 4QWQA 2Y0MA 1P1WA 5A5XA 4BAYA 2K4JA 1B4ZA 1B05A 1YQAA 3F8FA 2F78A 4LG0B 5LLQA 3TDJA 1FTLA 3LQRA 4I01A 2Z99A 5I84A 1DOTA 4LP2B 2I4CA 1BM9A 1T98A 4EJVA 2GA2A 4HLYA 4R1HA 2YPNA 4G9YA 2DP8A 3V5AA 2D45A 1YO5C 2HZTA 1MY0A 3RUMA 1B51A 2ABHA 2Y7IA 2OBGA 1R23A 2VT3A 2STTA 4XTCQ 3RI4A 5HDNA 1LVAA 3V8KA 2XXHA 4OERA 5ICGA 1RYOA 3H6VA 4A12A 1M5BA 3SZTA 1SD6A 4B09A 4L0ZB 2F35A 2UXAA 3P7IA 1FNNA 5LGTA 2A6EF 3FX3A 5K2YA 3TCFA 2ELHA 3TAJA 3I6VA 1N7WA 5I58B 3KP4A 1V3FA 1ZTYA 5IKBA 1B9NA 4AQ4A 2P6TA 3BKIB 2IPQX 4E0XA 4LLGF 2XHDA 3G3KA 1B1HA 3WGIA 3IOTA 4FX4A 2H98A 2NOOA 5D5WB 1C0WA 4ELPA 1ZLJA 4IRIA 3DLNA 1JETA 2X26A 1FPQA 2WKYA 2CQKA 2R71A 4DXCA 3QIMA 3ZKLA 3MVZA 3VOEA 5E1XA 5CMCA 2P5LC 1O3TA 1P2FA 5LEKA 4CICA 2HOEA 1U8RA 4OZ9A 3DFGA 2AL4A 3I58A 1HW2A 1B5IA 3CI8A 4LLNA 5DTBA 3IKVA 1MDQA 1U5TB 3MVWA 3K1MA 1FTOA 1AMFA 1WVJA 3GXAA 2I3WA 4R6HA 1JQFA 3MCZA 4RB0A 2CGPA 3VXCA 1SFXA 1USTA 2GWRA 2QS4A 1OVBA 4ZZDA 3I64A 3BBRA 3F8NA 3IL1B 3PMVA 3IL2A 1NL5A 1ZHFA 2ZYKA 3S9MC 4RNSA 2PG4A 1KA8A 2FBKA 4JWYA 4N9HA 3M3FA 5HLGA 4GIZA 4LA9A 2PI0A 1L3LA 4K3FA 2XHKA 2XV4S 2XXIA 3WODF 1ODDA 1J1NA 2V3QA 4OIRF 3RGYA 3IB1A 3N26A 1LLSA 2O7IA 4I9DA 5L3DA 2NXOA 2CMOA 4HBLA 3FJMA 1ZG1A 4L9JA 3JSPA 1SI0A 2GQQA 4ZYEA 1MM7A 1GXQA 4MTDA 4ENNA 1P1NA 2Z8EA 1SD4A 1XVYA 1GVJA 5L9SA 2EWNA 2GH9A 1URSA 1NH7A 2VOPA 1QW0A 4R74A 3FATA 1UCRA 3ABTA 3K9TA 4YKKA 2RC4A 3IB2A 5E1WA 5AIPA 5KCJA 2GXBA 2W57A 4NEDA 1FY7A 1XOCA 2F5EA 3GZGA 1QKBA 2ALUA 2DOJA 1FSEA 4WXHA 3LAJA 3TYHA 2ZXJA 5DD4A 5ICEA 1OQHA 2VBWA 1MS7A 3IR1A 5CRYA 1Y4TA 2Z33A 4AIJA 2VN2A 1YTVA 4LMYA 3HTSB 2H6CA 3DPLC 3EUHA 4B8XA 2LSOA 3C4MA 1R9QA 2Q2CA 4U0YA 1F1ZA 2EV0A 1Q35A 5J8FA 4BHCA 3CUQB 5L3EA 4OENA 4OVJA 3SKPA 2MBFA 3WE3A 2KJBA 5DYMA 4OEVA 1GV8A 3T9VA 2CFXA 2Z22A 5DVIA 2O3FA 1B32A 3T0YA 4JBZA 2E1CA 1KQ0A 4HDUA 1N04A 3FVOA 1Z05A 5KK1A 2XAFA 4BYYA 2Y84A 4MBPA 1IEJA 4H6DA 4YFKF 2M45A 3SEUA 4BDOA 4KICA 4HS7A 4ELOA 3UORA 2Y75A 3E13X 4KFQA 2ZYMA 3A3CA 3TO6A 4LUBA 1WDNA 1XVXA 2PT2A 2FEZA 4ZEDA 4G77A 3IAZA 4Z0IA 5F1RA 1DTZA 3T1BA 3QP6A 3WTYC 1BC7C 3E6MA 3G3IA 2GAUA 4ZYDA 1OKRA 3DP8A 4Q8RA 1HSJA 3ZP5A 2D2WA 2VE8A 5ED4A 2O0YA 2FSWA 4M72A 2JT1A 2XVCA 2F5XA 2GZWA 4WCGA 2F5CA 2OA4A 3LSFB 5FGMA 3BY6A 3FMSA 1SD3A 1Y3PA 1FQDA 3GEZA 2P5VA 1AWCA 4I8CA 1K78A 2D1HA 1QPMA 2L3DA 2PEXA 1TLHB 2QJEA 1PBPA 3REOA 4FHTA 1MPCA 5LOMA 2Q88A 2W7YA 4GFRA 5H6QA 3MUQA 4IO4A 4NF8B 4BQAA 1OIBA 1Q1KA 4NMYA 2QMWA 1TWYA 1P92A 4ZH4F 3BDDA 3TELA 3J81K 1I6QA 4I62A 3ZS6A 4QFOA 1EH3A 4EXKA 2OQGA 3RT8A 3ILTB 3QP5A 1BP5A 2DS9A 4R75A 4Z2YA 4EGZA 3PPRA 4ZE9A 4PP0A 4F31B 3EHSA 2E7XA 4JK1X 2IEEA 3MEXA 4LGWA 2FNPA 5E1ZB 2DBBA 2RKHA 3D4CA 3O6IA 4NF5A 2XAQA 4NF4B 5ICFA 1Y1ZA 1HKTA 4UA8A 3GF2A 1XSXA 5I2NA 4ZYGA 2VC1A 4FORA 5HLIA 4Q5SF 2H25A 2RGVA 2DLLA 1UIVA 3T9UA 1H76A 1I5ZA 1JW1A 3KETA 1XSDA 4ZEFA 1FQCA 2V93A 2DTRA 5B70A 3R6UA 3RPUA 1ZRCA 1LFIA 3GFLA 5LEJA 1NKXA 2F34A 2V9VA 1B46A 5K5QA 2O84X 1FBUA 1S7YA 4OFLA 1KYZA 1DMBA 2DQLA 3KSJA 2QLZA 1SDXA 2Q89A 1Y1MA 3KJTA 4O3MA 3PUZE 3KN7A 3GFJA 2VHAA 3BPVA 4F18A 3W6JB 1Y20A 2Z23A 1NHAA 2JPBA 4ESWA 1E17A 3MP6A 3U1OA 4HF0A 4MQVA 4P9FA 2NUVA 1H3DA 5AE4A 4N6PA 4TOZA 2BYVE 5H8FB 3JV9A 3DV8A 5EYFA 4XSXF 2QUFA 5D8LB 3O6HA 4HF2A 3ZMZA 5E17F 2M5WA 3DPTA 2Q8JA 3HHGA 4KCDA 1OVTA 2ISZA 3RLFE 1YW8A 3IOUA 1HW1A 1NNPA 2F7CA 1IN6A 4IXAA 4RPNA 2UVIA 3E9XA 3K6VA 1NNTA 3KLNA 2FOKA 2ZNSA 3F6VA 2OU2A 5F6FA 2CO5A 5AONA 1MDMB 1U3EM 4HW0A 2RV8A 3IJOB 1B0LA 3TTLA 1N3WA 2XXPA 1MD0A 4KHZE 1SMYF 2OZ6A 3I59B 1SFEA 2HR3A 2JRTA 4P96A 4RS8A 4OFOA 3OO9A 2VOOA 4I2OA 1FQFA 1HSLA 3PQJA 4IJAA 3VEPA 3K00A 3MP8A 4HW8A 5F1QA 2V3UA 3K01A 1KWHA 3TOBA 1VFEA 3M9AA 3RPWA 1R1UA 3QYTA 5J6XA 1UHMA 2Z8DA 3SEXA 3HSFA 2RN7A 2XIGA 3JW4A 1K6OA 1I1GA 2ZNZA 1B9JA 3E3KA 5J1DA 5CMKA 4OINF 1ATGA 3LR1A 3PPQA 5IT9K 3LAPA 2OQRA 1H45A 3FXQA 2OZZA 1IF1A 1R1VA 1IRFA 5FLXZ 3FMRA 4G6DA 4YFNF 4ONYA 5ISUA 3LQQA 2DW4A 2DU9A 4RK9A 2OD5A 4RJZA 5DVJA 1TT1A 3R6SA 3QK6A 4UUVA 2QENA 1SQYA 2F6GA 1PC3A 1UTHB 3LUYA 1OR7A 2QS1A 3CR9A 1QUKA 1O7FA 3TKYA 2O68A 1WODA 2CWEA 2VODA 2V3TA 1G3YA 2VT2A 1L5TA 3DP7A 3HN0A 3PFIA 3ECHA 1MY3A 1USSA 1USYE 3CO6C 1OLAA 2DWHA 3R26A 3K69A 2PX1A 3O66A 3MZBA 4A2UA 5JFRA 2XXUA 3CFLA 2DE2A 1S3JA 2EV6A 3F72A 1ZREA 3KLOA 4EM0B 3R61A 1BIBA 4YIIA 1PB7A 3FXRA 5CBRA 2P4WA 3E6BA 4DZ1A 3K2ZA 1NMUA 1LFGA 3CFXA 4F2OA 1LDDA 1XHYA 2D21A 2WC2A 4OMZA 5CVVA 3GX4X 1FSHA 4G8MA 3RT6B 4RGRA 3M8UA 1MH3A 1MH4A 3F8BA 2H94A 3CO7C 3TOAA 1B9MA 3D0SA 2QBYA 2VBZA 1R36A 1VFDA 3TFLA 4GD5A 3IC7A 2YSRA 3JAMK 4L18B 1FLIA 2DK5A 1IN5A 2HEOA 4XIGQ 3R0JA 1LB2A 5A2QK 4U0WA 4IY6A 3N6TA 3H3GA 3RKWA 3COAC 1Q1HA 1LBCA 3M3LA 3KP3A 1LAHE 1XC1A 3TTMA 2DQRA 5DUKA 3U92A 2A5YB 3KEIA 2MD5A 1FQBA 3I3VA 4GL8A 3VE1B 3V8XB 2PVUA 3VVDA 3GFIA 4P55A 1WRJA 5L3CA 5FTIA 3MVXA 4QF9A 1IZ1A 4EF2A 2Y7WA 3PD9A 2MH2A 3IWZA 3TDUC 2CW0F 5L9OA 1FX7A 1N76A 4YKPA 2W85A 2Q0OA 2NS0A 5KDTA 2H9BA 3TEPA 1P1QA 4F7ZA 1N84A 4R2BA 2ESNA 3MAJA 4LZ8A 1S7AA 2XRNA 3EYIA 4H0EA 2ZFWA 2CYYA 2V79A 1QNTA 3P7NA 1B3LA 2O1LA 1SYIA 4XRFA 4P11A 4HX7A 3F3XA 3IWFA 4FJPA 2BE5F 4WEDA 1YFHA 4DIGA 3SQNA 3ZQ7A 3C31A 2L54A 4TQUQ 2IA4A 4U7DA 5J8CA 5CBSA 2ZO4A 4XLPF 5D4SA 1LB8A 4EJWA 1BOAA 3G3FA 4HX8A 2ONSA 1TFDA 4U23A 1LFHA 2DE3A 2I0CA 3LSTA 4DCYA 2PQ8A 4DXUA 1KQ9A 1OMPA 4O3AA 5ILSA 1XB4A 1IRGA 5I2KA 4XKPA 4HYEA 4HX4A 3U1DA 5JK4A 2YLNA 2Y7RA 3C36A 1P1UA 4KD5A 5HDKA 1Y3QA 5ICCA 1H9GA 4KN7X 5D5XB 1F9NA 2MA3A 3H3UA 4G7HF 3EETA 4QFNA 1MXXA 1URGA 2PBIA 5ICQA 4NQWA 4OIOF 1KYWA 3IHUA 1A8FA 4YU0A 2QVOA 3HSTA 4WXJA 4PGHA 2QS3A 2VD2A 3FXUA 2WTEA 1W7PA 4WEPA 4F1VA 3K6XA 2XD3A 5AA3A 2DXRA 4P5OA 2XXXA 3KJ7A 3KOTA 5EHSA 4BHPA 3G3JA 3MVYA 2KKOA 4R72A 5EEGA 4YICA 3ZPLA 1PP7U 2AL5A 3T66A 4F19A 3OEMA 4KN4X 2EFPA 2UXXA 1RZ4A 4LVQA 5D6EA 1DDNA 4NWDA 3LSLA 1O63A 3IRQA 1TBXA 1Y0UA 2ZCWA 2FNAA 5AA4B 1G6NA 1V4RA 2QQ9A 2DI3A 4Q30B 1R5HA 4G68C 4RB3C 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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