3HHGA

Structure of crga, a lysr-type transcriptional regulator from neisseria meningitidis.
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
KTNSEELTVFVQVVESGSFSRAAEQLAMANSAVSRIVKRLEEKLGVNLLNRTTRQLSLTEEGAQYFRRAQRILQEMAAAETEMLAVHEIPQGVLSVDSAMPMVLHLLAPLAAKFNERYPHIRLSLVSSEGYINLIERKVDIALRAGELDDSGLRARHLFDSRFRVIASPEYLAKHGTPQSTEELAGHQCLGFTEPGSLNTWAVLDAQGNPYKISPHFTASSGEILRSLCLSGCGIVCLSDFLVDNDIAEGKLIPLLAEQTSDKTHPFNAVYYSDKAVNLRLRVFLDFLVEELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of CrgA from Neisseria meningitidis reveals a new octameric assembly state for LysR transcriptional regulators
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Neisseria meningitidis serogroup b
molecule keywords Transcriptional regulator, LysR family
total genus 69
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3hhgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA02
2QENA 1MY1A 2O61A 1H76A 2KJBA 3LA2A 3OELA 2IRFG 1EH3A 3G3JA 4FE8A 1KU3A 4RK2A 4QLCU 3S2VA 4P9FA 4FX4A 3FJMA 2K02A 3M8EA 3G3GA 3CFXA 1N7XA 1W5SA 1MY2A 1HSLA 2ZNUA 3OENA 5L8DA 3R6UA 4OTEA 3G3KA 4YIIA 4YKKA 4NF5B 2H27A 3K0VA 4ZZDA 4F3GA 5B7DA 1Z7ME 4O3MA 1GR2A 5DEXB 1B5IA 3V83A 3R60A 2QQAA 4H8JA 4PETA 2B3FA 3PUZE 5LRRA 1O64A 2WV0A 3GLBA 4IXAA 1TWYA 4G8MA 2P6SA 1UIVA 1R5HA 3LQRA 2PT1A 1FTJA 5I57A 5ICTA 4F2QA 3QP6A 1WSUA 4OIQF 1H0MA 4WK8F 1QULA 2M5WA 1SD5A 2ZNSA 4H8IA 5H8NB 3P7NA 4S05A 1ATGA 1FP2A 3U1DA 1BIAA 2VHAA 3K0LA 4HCYA 2DWHA 5ICCA 2DXYA 2FBKA 2XXYA 5IT9Z 2VT3A 2XGXA 4PGHA 3C36A 3R0JA 1MQDA 3K9TA 4R79A 3J81K 3MWMA 3DP8A 3FV2A 4HLXA 2DS9A 1B5HA 1Y4CA 4NF8A 1MXYA 4H0EA 2AYSA 3GBAA 2FOKA 1P6RA 1IXSB 3ABUA 1ONVA 5H8HB 2Z9OA 4ZYEA 3Q28A 1FW0A 3WTTC 4EMSA 2VP1A 5HDNA 3VXCA 1P92A 1QUJA 2Q9TA 5ITPA 1IXCA 1NNKA 3UIFA 1JE8A 3IWZA 2O6AA 1JNFA 2V93A 2XX8A 5HS9A 1B0HA 2L02A 1H9GA 3EYIA 2R7DA 2Z5UA 2HXWA 1TNTA 2XAFA 4JXIA 4H5GA 1FWZA 4Q8RA 3FXQA 4U2RA 1FQDA 1O3RA 2CGPA 3FJ7A 3LC8A 4R2FA 1QKAA 5L9OA 3O97A 5BUUA 2PJPA 1ZLKA 1AOVA 1MXUA 3FZVA 3H06B 3RTWB 1KYWA 1X3UA 2DOJA 4IO4A 2ESHA 1B3HA 4OU0A 1VE4A 2W85A 2G93A 3HO7A 5KVRA 3TMGA 4KHZE 3SZPA 3ML6A 3J7AO 1Y4TA 1ON2A 1SMYF 3BP8A 3V8XB 2I4CA 3EYYA 1DUXC 1HQCA 2ONRA 3VVFA 1YW8A 2QBYA 4TLMB 1T0KA 3RTFB 4WKMA 1XHYA 4HLYA 4I8CA 1S9TA 1D3KA 4QRZA 2ZNTA 2VD2A 2VBZA 3I71A 5AIQA 1KU2A 3T66A 1PBPA 3HRSA 4HYEA 4WCGA 3F3XA 5D8KB 3CVGA 5EHMA 2RQPA 1B9MA 3RKWA 2A5SA 1HSTA 2HFBA 1K79A 1MPCA 2OJTA 2PQ8A 4OINF 2XXIA 2HAVA 1QPMA 3RYRA 3REOA 3V8JA 1YTVA 4UVBA 1ZAOA 3C18A 1YW7A 2F5CA 1DPPA 4BHPA 1U5TC 2EK5A 1JQFA 1A04A 4KCCA 1IZ1A 1JETA 4EJWA 4R75A 1WKMA 1WVJA 5LOMA 2EJRA 3SETA 4MHGA 2NS0A 5E20A 2E1CA 3B73A 3H3UA 3WTSC 4KYWA 2A68F 3EUHA 3VXBA 2QVOA 2VOZA 2IT0A 5CVRA 3KEIA 4RYAA 3FXUA 4UXNA 2KIFA 3J80Z 5AIPA 1VFEA 1S50A 5AA2D 2W7YA 4ZZEA 4I0BA 3FJGA 3T0YA 3QPHA 4M73A 1MZBA 3TQWA 4ZE8A 1YO5C 4MTDA 1URDA 3RKYA 3RY3A 4AB6A 1IITA 1SQYA 3OO6A 1ZN2A 4OMBA 3LAPA 2CWEA 3C7JA 4XSZF 1D4NA 4OWDA 1MJ9A 1RYOA 4GGGA 1V3FA 2JRTA 4CDGA 5TP9A 2L54A 4LJZF 5FO5A 3WTZA 2DLLA 4KN7X 1IUYA 1LAHE 1XDSA 4JDFA 1S8NA 1PDAA 1RZ4A 2UWMA 3H6VA 2Q8JA 1TXFA 3JTGA 3O6HA 3PGFA 1XSDA 1ZARA 3KP4A 3CFZA 1BKAA 5FLXK 2P4WA 1IN6A 1S7AA 1QUKA 1L5TA 2BYVE 3SEWA 3DP4A 4N6PA 4OQOA 2R7FA 1R1VA 5CBSA 1RUNA 3VB2A 1OLAA 4A6DA 1MY3A 4YG2F 1F9NA 2GAUA 2OAZA 5E8GA 3FASA 4ZYDA 3E4RA 3TCGA 2FE3A 4GRKA 5CM6A 1Q1HA 4S04A 4P0GA 4IF4A 5CBRA 1ZG3A 3KSJA 2THIA 4OEUA 2JSCA 1BJAA 2R3SA 1II5A 2BV6A 1XDUA 1NNPA 1WDNA 3PUXE 1FSEA 1BIBA 5LGUA 4H5FA 1RYXA 2YR2A 4CHUA 3CR9A 5ILUA 5L3BA 4N0BA 3ZMZA 1HW1A 2W25A 3ABTA 5H8SA 4KYDA 1LEAA 4LD5A 3M8FA 1XGOA 4JSDA 4KPTA 5TU0A 3TYHA 2OWTA 3PUYE 1OYYA 1F4KA 4EQ9A 3K6XA 3RYPA 1T38A 1U3EM 5K2XA 3SZTA 5CMBA 2HKXA 1LCFA 4OERA 3P9IA 1AIVA 1BBYA 3TTMA 1FX7A 3DPLC 1FBUA 2YPNA 2XX7A 2DW4A 1IAWA 5L3CA 5D6FA 1O7LA 3TOAA 4FEDA 4WXHA 4GL8A 2ZNZA 5FFZA 3VEPA 5EYFA 1B7UA 4K2EA 2EB7A 1S29A 3TCHA 4ZEBA 1JW5A 1BOAA 2Q8KA 1P4WA 3DF8A 4R9FA 2I3VA 3LQQA 1POTA 4ETSA 4KR5A 4KYSA 1FY7A 1XGNA 4HV5A 2DE4A 3TEPA 4RA1A 3TO7A 1GTKA 4NF5A 5E17F 5DYHA 3F8BA 2CG4A 3LSTA 2ISYA 4U88A 3HOSA 1N3XA 3TPAA 4YMAA 3KFWX 2V3UA 3CFLA 3K02A 4C1TA 1Y20A 5CLSA 4HCWA 1BN5A 4MLQA 4R74A 4ISUA 3CTAA 1UHMA 2D21A 2ISZA 1GXQA 1W7PD 3PD8A 1RNLA 1NNFA 4DXUA 3FVNA 2E0SA 3WAEA 3KBRA 3KN8A 5AA4A 3KP6A 1LAFE 3G7WA 4GXSB 3U72A 4Q48A 3GZGA 4F18A 3IAZA 2DQLA 4EM0B 2E1NA 2EV0A 3HSEA 3ZN1A 2F7CA 2F8DA 3KN7A 4QHQA 1F9BA 4HS7A 2BE5F 3I4PA 2QUFA 5IKBA 4PGGA 5F7VA 4UVAA 1B6HA 2K27A 3R26A 1WQ2A 5TRDA 2YLNA 1A8EA 4UUVA 1BI1A 4GYGA 2RCAA 3GEZA 3OV8A 5CVJA 5ITOA 2Y7IA 4HBLA 3HIFA 5LHHA 2HAUA 3E3KA 3UA8A 1P1QA 1O63A 4NF8B 2K4JA 1LB8A 3HOTA 3OOPA 3O6BB 3CG1A 1LFHA 3E5UA 3GF2A 1XS5A 3PUWE 4KD5A 5DTBA 1GHCA 2REGA 3HHGA 4MGRA 5FHMA 1G4DA 4I02A 3L00A 2ACJA 2ZBKA 2OBGA 3KJ7A 4HDUA 3O6GA 2XIGA 1R9QA 2DK8A 2P7CB 3ODBA 4XKQA 3VLUA 5FFXA 3R0AA 3JZJA 4OENA 5CMCA 1BI2A 4A5NA 2GH9A 2B65A 4M71A 4AWXB 4RGSA 3P7IA 2X26A 2J5PA 2JT1A 2ZMBA 5ICEA 3TO9A 2QQBA 4F2OA 2OQRA 1BIYA 2DK5A 2M87A 3KSXA 4LG0A 1JHFA 1B46A 5DCFA 3LSXA 1PB9A 2DAOA 3WGIA 2X0LA 2QS4A 1FTOA 2XXTA 3SHFA 3N6UA 1RIOH 3W6KB 4MNUA 1UTHB 4HDVA 2VE8A 4XIGQ 1G3WA 4YFNF 3ILUB 2P1SA 5B70A 2QBYB 4F3PA 3KP2A 2O03A 3BPVA 3KEQA 5F1QA 3CRBA 3CJNA 3BPXA 3GFLA 1IEJA 1HKQA 1N04A 4U22A 1M5EA 2GA1A 4DCYA 5ILVA 4FIMA 1QW0A 2M8CA 2Z33A 2V1DA 3CSGA 1B1XA 1V4RA 1WWXA 4LLLA 3KP7A 1STZA 5IAIA 3BFUA 3C3WA 3KZZA 2ZFWA 2HZLA 1FTMA 1TW2A 3BKIB 1G6NA 4GYIA 2HS5A 4IO6A 1A55A 1B05A 3CUQA 5KZTA 4HX7A 1CF7A 2WTEA 4ASNA 2GA2A 3FVGA 5H8QA 1I1GA 1Y1MA 3MBPA 1J2XA 2XXHA 1YAEA 4JBAA 1FTKA 2A69F 3CG3A 4GWOA 2RC9A 5ERIA 1DMBA 1GVJA 2DWJA 1P4XA 1N3WA 3L6HA 1D9YA 3G3IA 4OFOA 1OMIA 3N26A 1SBPA 4F39A 3I64A 2CO5A 4HQMA 1R5GA 2XHKA 3A3CA 4PZJA 4LQ5A 2RN7A 4L17A 3C4MA 4DE8A 4JQFA 3IX1A 3OO9A 2O8XA 4LVQA 3F6VA 2LSOA 3GLXA 4OETA 3B6WA 3D5LA 3K69A 1ZBMA 4LK0F 1BC8C 4GL0A 2L3DA 5BQTA 1DSNA 5TP9B 2REJA 1MDP1 3TKDA 1FBQA 4POXA 4YFKF 3KFMA 4EQQA 1OPCA 4KUMA 3ELKA 2EA4A 1GXPA 2XV4S 1UCRA 1CGPA 1WRJA 2DWAA 1TQPA 2KIUA 4F7ZA 4R6KA 3DELB 2IA2A 4LK1F 2FA7A 2I48A 4LZ7A 4PQJA 1SFXA 3FM5A 5JHUA 2FYIA 2GHBA 1RUOA 3COAC 3D4CA 1M5BA 2DXRA 1Z1DA 4M4GA 3U1OA 3IL2A 1P1NA 3IKVA 1QGPA 4IO7A 3THIA 1FSHA 2GZWA 1LLSA 2QM3A 1T39A 3Q25A 4IY5A 3WAFA 3BBRA 3AAFA 3IL1B 1LNWA 4BAYA 4M72A 4IPAA 3T5XA 3K1MA 5HBCA 4EF2A 3RI4A 4F1VA 5DCMA 1N7WA 4M6XA 2HWVA 3NQOA 3RPQA 1MRPA 2FF4A 4ZYHA 1LDDA 3WE3A 2VXZA 1H3DA 3E6CC 2FA5A 1HW2A 3TQLA 1P2FA 3IHUA 1A99A 2HQNA 4EUOA 2ALUA 2P2AA 5J8FA 2HZKA 3WTUC 2K7LA 1A40A 5DV5A 2D1VA 1TT1A 1Z6TA 2O6GE 3K1NA 1EU8A 2I3WA 4XLNF 3GVAA 4MTEA 1XMKA 2NWJA 3O6IA 5J6XA 1TQIA 4JK1X 4HOBA 4MF3A 3J81Z 4RB3C 4HW0A 4A0YA 2VGQA 2QQ9A 3OEKA 2MH2A 3D4GA 1US4A 4UNOA 3V7CA 4YMBA 3K2ZA 1URSA 2QMWA 3U2RA 1R1TA 4KYEA 4FJPA 1B3GA 1P1UA 1I27A 3ISPA 1ZU0A 3F72A 1J1NA 3CO7C 1MY0A 3F8CA 2YJPA 4IRHA 4GCVA 4RK9A 2QYOA 1MQHA 1P1WA 4Q4ZF 1U6GA 4M74A 4LZ5A 3Q27A 2CZLA 2ZKZA 1SYHA 3VVDA 2F2EA 3E5QA 4G7HF 3I5OA 5KCJB 3KEOA 4Z0IA 1HSEA 3L2CA 2F34A 1LFIA 2RKHA 5A5XA 3DLNA 2PYYA 4Z7EA 3QAXA 1AWCA 3HTUA 3QOPA 3CO6C 1EH7A 4A5MA 5AA4B 2DP8A 4L5JA 3TCFA 2OZZA 4BLAA 2MA3A 4GIZA 3K6VA 4RPNA 5F1RA 1ANFA 4QFPA 2Y7RA 4HQEA 1T2KA 3E3VA 5D6EA 2QS1A 5D5WB 4ELOA 3LR1A 5BPDA 3BJOA 3ECRA 6PAXA 5LRSA 4IY6A 3WTWC 1MGTA 2YSRA 3TUSA 3GX4X 2ETHA 1QBJA 4L0ZB 4U1OA 3LSLA 4ENMA 3EDPA 5DVFA 4LQ2A 2HZTA 1D3YA 4ENKA 3BZ6A 3BOQA 3GZ6A 2XX9A 2QWWA 2QMXA 4EJVA 3KN3A 2V3QA 4EXLA 2Z23A 3L7WA 5ILSA 1ZLQA 1IRGA 4F31B 3K4UA 3CI8A 1ZJLA 4E70A 2LDUA 4HF2A 4GVOA 2IP2A 5LEKA 3RPUA 4DCXA 3D0SA 5H20A 4JSOA 3LA3A 2ZXTA 3H7MA 5KDTB 2CMOA 2OBPA 4RPOA 3HPIA 2ZO4A 4XKPA 2F7AA 4KMUX 3G3FA 2IEEA 4LLGF 3MCZA 2P0SA 1MXXA 3MPLA 5FHNA 3ZMDA 3PD9A 3H92A 1UTHA 3GWZA 2BEOA 4KT5C 3BROA 4LG0B 4UHTA 2P8TA 1OYWA 3ZMUA 4QFOA 1R00A 4OIRF 3SEVA 2DWIA 4K3FA 4R9GA 3TTRA 3QU3A 4ONYA 2NNYA 3FGSA 3MZ9A 5E1ZB 1TFDA 1LFGA 3I6VA 3PPNA 3DP6A 4KQPA 3ZS6A 3F11A 4LA9A 1OYIA 1R22A 4BYYA 4FECA 4KN4X 3N5LA 4KFCA 4ND9A 2Q2AA 2XHDA 2UVHA 1IXIA 3H6UA 3W9WA 1KQ8A 4ZZAA 5FLXZ 5JTYA 3FM3A 1XC1A 3IOVA 5H8FB 5I56A 2XKPA 3BJ6A 2FQ3A 4LUBA 2VT2A 3OO8A 4NMYA 2MH9A 1OLCA 2RVCA 1QUIA 4I01A 4RAYA 2L4MA 5TJJA 1B59A 1LGBC 2XXRA 1FLIA 3KGCA 1SFUA 3MC2A 1FQEA 4UV9A 1ZRCA 2XAHA 3KG2A 3C33A 4IJAA 3HHFA 3U9GA 4KICA 1FYKA 3T8RA 3CUQB 1CF7B 3PQKA 1L3LA 4P9UA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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