The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
36
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sequence length |
177
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structure length |
177
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Chain Sequence |
SLGLDYEPSHLMFLVTVLDDRDGEVLGDAIQKLIEREEVLACHAVPCVTKKNRPGHVLVVLVDGGEDPDRVAEDVARDIMVLTGSTGVDRFDADGVYSVPSRFEDVRVVYGEREWRVSVKIAETEEGEVVTVKAEFDECREIGEETGIPPREVKAMVEAAARVGGWVDLKEREIKVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Crystal structure of protein MK0293 from Methanopyrus kandleri AV19.
rcsb |
molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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source organism |
Methanopyrus kandleri av19
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molecule keywords |
Uncharacterized protein MK0293
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total genus |
36
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structure length |
177
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sequence length |
177
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2008-01-22 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
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A | PF01969 | DUF111 | Protein of unknown function DUF111 |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | mk0293 like domain | ||
Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Transcriptional regulatory protein pf0864 domain like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3C19 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4K2X A; 3IVF A; 5GMD A; 1CMX B; 1IBK F; 2Y3A A; 3SEB A; 1WI0 A; 3PR4 A; 4DR2 J; 5L9X A; 1EU4 A; 1JLC A; 1WI6 A; 4LNK A; 8AT1 B; 3AD8 C; 1KLM B; 2XLI A; 1T05 A; 1FXT B; 2R7T A; 2DYM A; 3N1Z C; 1YQB A; 1GX5 A; 1TKX B; 5HMY A; 2ZDP A; 2ZEJ A; 4DXG A; 3TEG A; 4NPN A; 2BEF A; 3AE6 B; 4ES1 A; 3M30 A; 3B1L X; 4EMD A; 2D2Q A; 3RNE C; 5DLG A; 3K5L A; 2B51 A; 4OZL A; 2MRP A; 4DN9 A; 1CC8 A; 3WZ0 A; 3W5Y A; 2W4D A; 2NXN A; 3V62 A; 1JJ4 A; 1RTZ A; 3EVW A; 1HTO A; 3LP2 B; 4U95 A; 3K9P B; 2I5J A; 3NP5 A; 1T3N A; 4I6P A; 4RW4 B; 4DV3 F; 5AUI A; 4WYW A; 3KVF B; 3G96 A; 4IOB A; 4YTP B; 3NAH A; 3V6E B; 4J6I A; 4LUB A; 2BJ7 A; 2PGC A; 3DDK A; 4WP3 A; 5DCN A; 3M95 A; 4N8N A; 3T3N A; 2H4Y B; 4EU0 A; 1VHI A; 2ZC4 A; 3AE1 B; 2W3S A; 2PMH A; 2FID A; 5DRK A; 4LDT B; 2I38 A; 3FZB A; 3U4E G; 3MM8 B; 3H25 A; 2RIL A; 3MCO A; 1FWP A; 1JLA A; 3ZZR A; 3W5U B; 4FN2 A; 1X0F A; 5JXS A; 2C22 A; 1QTM A; 4H2A A; 1QOF A; 3M8Q A; 3KG4 A; 4O3N A; 5JH5 C; 3W62 A; 1FKA F; 4FPI A; 3TUJ C; 2B4P A; 4ZLN A; 4BCA A; 2DAF A; 3QC8 B; 3MJ5 A; 2SAK A; 4X4N A; 2DXF A; 1N62 A; 1BT0 A; 3N6N A; 3BBB A; 2V4R A; 2ZVS A; 4ICL B; 2YEP B; 1WUU A; 4CNZ A; 4OYB A; 1RLF A; 2V8G A; 3UN3 A; 3SQO P; 1U4B A; 5ETR A; 1E10 A; 2GNK A; 4U7U K; 2LMC A; 2GZO A; 3DWM A; 3CJT A; 3SSS A; 3G86 A; 1GC7 A; 1KVI A; 5JXV A; 2TSS A; 2M4M A; 4F50 A; 2RDJ A; 1TT5 B; 2MTL A; 2KMC A; 1DFD A; 3HHL B; 4ZVR B; 2YQ0 A; 2J9E A; 1YQ3 B; 3CD7 A; 4IOI E; 1IBX B; 2IZV B; 4DV6 F; 5CYJ A; 2DAJ A; 4WIP A; 3NEK A; 2CJQ A; 2C3O A; 2V67 A; 4M02 A; 2K6Q A; 2PEH A; 1N6Q B; 3KJN B; 2QLJ B; 2JSX A; 2XMT A; 1JLB A; 3HVW A; 2YLM A; 2R7R A; 3R7B B; 2WS3 B; 2C1E B; 4IM2 A; 2GIQ A; 4M1K A; 3TRG A; 2QMW A; 1WWT A; 4GXB A; 3CCV S; 2LU1 A; 3KK3 B; 2LFV A; 3SD5 A; 2HTH A; 5BMI A; 1HBN A; 5A8W A; 3Q3F A; 2H88 B; 2D3B A; 1N88 A; 3OLM D; 2YX1 A; 2J0X A; 4M63 A; 3N9U C; 3VGV A; 2OMO A; 4YY3 J; 1X4H A; 1RHK B; 2Y5P A; 2BX6 A; 2Q66 A; 5J2P A; 3GIR A; 2P6S A; 4YT0 B; 4WAA A; 3OXL A; 3BQ2 A; 1WE6 A; 3NNA A; 3EZU A; 3A4T A; 4ZVP B; 2WXR A; 4IR1 A; 4DL6 A; 2JQR B; 1HFE L; 3IBW A; 4H4O B; 4A8M P; 3FJ2 A; 4ICU A; 4AUQ C; 1IR1 A; 3MEC A; 2N1V A; 5B7W A; 2MBB B; 5D0H A; 1KSP A; 4I2Q A; 3F41 A; 2BKR B; 4OHV A; 3U1L A; 3LPY A; 2OPQ B; 3DYA B; 3IT6 B; 2JRS A; 1YRU A; 3MR3 A; 1YBA A; 2J7K A; 2AP6 A; 1JQG A; 4JI1 J; 3M2V B; 1TL4 A; 1SUQ A; 1XLN A; 4LF9 J; 2CPD A; 3WAN A; 1R0A A; 3AEC B; 3MEG A; 3I3T B; 2NQP A; 2Y8W A; 1OFF A; 1XK8 A; 2RIJ A; 1QSL A; 4B9S A; 4NZ7 A; 2WGS A; 3N28 A; 2VZK B; 4YB7 A; 1ZET A; 4DR5 F; 4JWS C; 2OHD A; 3GSI A; 1ZAV A; 4WU2 A; 1JNZ B; 2NCN A; 1PKU A; 2K2P A; 3DRS A; 5K9F A; 3NKY A; 3HI9 A; 3PW2 A; 3GII A; 3KLG A; 1MN7 A; 4DUY J; 4HKZ E; 3BN4 A; 1U6F A; 2BKF A; 3VQS A; 2M56 B; 4CYE A; 1TKY A; 1JK9 B; 3PXG a; 4U6P A; 1RI7 A; 3N0V A; 2DZK A; 3H20 A; 4OJH A; 2LFI A; 2WU5 B; 2QIE B; 3UIP B; 4I6Y A; 5J18 A; 2GO9 A; 2DNQ A; 1UJ5 A; 3GV8 B; 2ZEQ A; 3BKU A; 1KLG D; 2UXC F; 3IS9 A; 5HAO A; 1EX8 A; 1R27 B; 3BK2 A; 2LA6 A; 3IRX B; 1YJJ A; 2WOM A; 2IDY A; 1RWO B; 3AXM A; 4PYD A; 2BYE A; 1A9N B; 2ZVI A; 2IA6 A; 5DPT A; 2YX4 A; 3TR5 A; 1U2C A; 3A8E A; 1RA7 A; 2ZM6 J; 3SDE A; 1T5X D; 3ET6 A; 3IR5 B; 1OQ6 A; 4ID5 B; 4ANE A; 2FJV A; 2ALY B; 4X4P A; 3EUN A; 2XY7 A; 3LAK A; 4HT5 A; 5I42 A; 1S76 D; 3PY8 A; 3UE2 A; 1SC3 B; 2KDB A; 4C8K A; 5KHO A; 4V19 X; 5T14 A; 1LV5 A; 3M6W A; 4JQW C; 2WHI A; 4F4Y A; 3BRE A; 4LRD A; 2RQM A; 2EFN A; 3OXG A; 2IRU A; 3LGM A; 4LSL B; 3OTD A; 1I5O B; 1FRJ A; 2J7Q B; 2YY3 A; 2YNF A; 2D7S A; 2V34 A; 3VGU A; 5EWE A; 1TS2 A; 2QC8 A; 4ED6 A; 5HVH A; 1IP9 A; 1UET A; 4A9A A; 3HRD D; 1RAI B; 4FNI A; 4ZN3 A; 2Y9H A; 1U2F A; 2I1J A; 8RUC A; 1JLC B; 1J5E J; 2LQ9 A; 5D4P A; 3WDO A; 2HNZ A; 1XO3 A; 1M1G A; 3G8T A; 1UJ6 A; 2JZZ A; 1WG5 A; 2GIR A; 2LAS A; 1UA0 A; 1C1B A; 3LH2 S; 2I6W A; 4FKX A; 1XIQ A; 4WJQ A; 5KFY A; 1VQ4 S; 5CZX A; 3NMA A; 1VJQ A; 1L4Z B; 1SE2 A; 1T3Q A; 2X8X X; 2GI9 A; 1S99 A; 3KLS X; 1OGW A; 2L8J A; 2CNN B; 3F44 A; 4WQO B; 3W61 A; 1HD0 A; 3T19 A; 4C3L A; 2QMT A; 4QW9 A; 4AJW A; 4IO9 Q; 4MH0 E; 2YPZ A; 2VA3 A; 1YHQ S; 3P45 B; 1WX7 A; 4CO7 A; 3QJZ A; 1V5O A; 5DPR A; 1O51 A; 3MR2 A; 4ZPT R; 1S3S G; 3AED B; 1RTD A; 4R3D A; 1T02 A; 4UY8 5; 5IWA F; 5DDQ C; 1ESF A; 3EGN A; 4ZPV R; 2I5J B; 4DPO A; 4LR8 A; 4MGY E; 1NDP A; 1U7L A; 1J5O A; 2G0C A; 2FLO A; 1RGV A; 3MMJ A; 4J3O D; 3QJP A; 1NUE A; 2V2Q A; 4HVZ A; 2AIR B; 1UBQ A; 1EO6 A; 4J9S A; 4HRS A; 3RUI B; 5K14 B; 2VIH A; 4QR2 A; 3L4P A; 3GP7 A; 3MP9 A; 3ZTO A; 1S9E B; 3CD5 A; 4LT6 A; 3CO0 P; 4CH7 A; 2W01 A; 1I1G A; 2RRA A; 1OQ3 A; 5I3P A; 4URK A; 2PO4 A; 4ZN1 A; 3M8Q B; 4U8V A; 4JUZ A; 5KFU A; 3THV A; 1K73 T; 1L5P A; 3Q22 A; 4PWU A; 3IBC B; 3RZA A; 2FE8 A; 2HHV A; 2M0A A; 4LF1 A; 2E5L J; 1I6J A; 3QCA A; 1V86 A; 1IPG A; 1TZ0 A; 4U8Y A; 2I1R A; 1SC6 A; 4L1B A; 1J2V A; 4ZYN A; 5LJ5 Y; 3DLJ A; 2CPE A; 1WG1 A; 3TWZ A; 5CXT A; 5E6N A; 4QOT A; 5K8N A; 2XZW A; 3SQG A; 2DGV A; 2KTR B; 3ILL A; 1PIE A; 4M5L A; 2BKN A; 5A0Y B; 1APS A; 2DH7 A; 5IOL A; 1YQH A; 2W54 A; 1E6V B; 2E5G A; 2KXF A; 4CLW A; 5AUK A; 2E5J A; 2XCP A; 4ILR A; 4DBQ A; 2PKO A; 4HJG E; 2GMJ A; 2VON A; 1EAY C; 3EZO A; 4UOC A; 1N61 A; 1ZM9 A; 1LK7 A; 4H4K C; 8ATC B; 4IH5 A; 1JLB B; 2CHX A; 4Y6I A; 4HI1 A; 2HPU A; 4AYB D; 3ZRC A; 3T5L A; 3HLU A; 3HVT A; 3T1A A; 1P9Y A; 2W9C B; 2PD1 A; 4DR6 J; 4KKJ A; 4F8C B; 1LW0 A; 1ZA1 B; 3FKB A; 1FXL A; 1LO5 D; 2B9Y A; 3R5B A; 2C2E A; 5A8W B; 1BWE A; 4NE9 C; 3H5S A; 1TKZ B; 1DQ9 A; 4P73 A; 4WXW A; 3BSN A; 3PIP Q; 5ETM A; 4MMO A; 1S1W A; 3LOU A; 1TVR B; 4C80 A; 3L13 A; 5KG0 A; 5CAA A; 4HHH A; 3QIP B; 1QOA A; 1V1P B; 1XD3 B; 3Q2T C; 2XMA A; 2F3J A; 5C7P A; 1WRI A; 2E1R A; 3WBZ A; 1L5U A; 2LA4 A; 3IR7 B; 3MEC B; 2MBQ A; 1GB1 A; 3R2T A; 2XY5 A; 4I2Q B; 2IBI B; 4G50 A; 3B82 A; 1WDD A; 2P5V A; 4HXD A; 4OZN A; 3C46 A; 2OOB B; 5D77 A; 4A8X A; 1RT2 A; 4ZMM A; 3CCM S; 5B0D A; 3HT0 A; 4B0M A; 1FCC C; 2EKY A; 2ASJ A; 2Y1L B; 1NBF C; 1SJ3 P; 2V8V A; 1R0A B; 3ABV B; 3MEG B; 1IVZ A; 2C3M A; 1X31 C; 1R4M B; 2NPF A; 2CNL B; 3KG0 A; 4ZPC A; 1WOP A; 2V94 A; 1P98 A; 1N0V C; 3JXO A; 1IBC B; 3HD2 A; 4EOY A; 1RK8 A; 4XE0 A; 1HPZ A; 1YIW A; 3D6F B; 1F0X A; 2MKJ A; 1RU1 A; 3KLG B; 3M8Y A; 1BE4 A; 2MKI A; 1ZE3 D; 4MYU A; 4TN2 A; 1RAX A; 3UGB B; 2CQ1 A; 2QIL A; 2DT9 A; 3LGN A; 2A10 A; 1OSC A; 1VS3 A; 2VL1 A; 4N9F 4; 4OW0 A; 4J9U E; 1RAD B; 4DX7 A; 1F9E B; 3TP2 A; 4LSZ B; 2NTT A; 1MVK A; 2MLB A; 3O44 A; 4R5P B; 2D1C A; 1F3F A; 1CUL B; 1QE1 B; 1NHK L; 1XWL A; 1H2V Z; 3ZO5 B; 2O5D A; 3BSA A; 4B3O A; 3ILJ A; 4USI A; 1HBM A; 4DV4 F; 1MHX A; 3D6H B; 3CUN A; 1L0X B; 1NDD A; 4NQL B; 2E5L F; 2JXX A; 2AV5 A; 1RJJ A; 3CED A; 4ECY A; 4RF1 A; 3PJ9 A; 1WYG A; 3NZS A; 3ZC4 A; 2BOA A; 1N48 A; 2PI5 A; 1ZBT A; 2BAC A; 3SDE B; 2DEI A; 3ET6 B; 2FIU A; 2WZ1 A; 2AYB A; 2J0W A; 2PW9 A; 3N5F A; 4YUD A; 2V1Y A; 3N1X C; 1FMA D; 3W3S A; 2FHO B; 2Y1J A; 2PLP A; 2O2V A; 5C2G A; 4AL6 A; 3GCX P; 4OLP A; 3TZX A; 3NXZ A; 4NL5 A; 1LQB A; 1ZA2 B; 5E41 A; 1G4C A; 2OD4 A; 1TL1 A; 2N3O A; 3NGS A; 2EFO A; 4A8W A; 3I9V 9; 3D6M B; 4ZPB A; 2D3O 1; 4HR2 A; 1BQN A; 1T0T V; 4NLS A; 2DWQ A; 5CZV A; 5IAA C; 2FHK A; 3ONQ A; 1ZKH A; 3FDS A; 2FAZ A; 3GE3 C; 2HJ1 A; 5ETQ A; 5DM6 Q; 3IWN C; 2KFJ A; 2HHX A; 1KLV A; 2PII A; 1I4X A; 3ZKJ C; 4YSY B; 2M8H A; 1OQY A; 2LEA A; 5G4D A; 2CWK A; 3JSM A; 3GON A; 1HWU A; 5L46 A; 2LVQ A; 3MMC A; 3BKT A; 3DMJ B; 3UIN B; 4N76 A; 4R8U B; 1KDN A; 4A55 A; 2XYG B; 3FGV A; 3J7Y U; 1I94 F; 1EZZ B; 1S1Q B; 2HNZ B; 2GGP A; 5H1S V; 4XGA B; 1K8A T; 3LAM A; 1JRU A; 2IO2 B; 2DVI A; 1C1B B; 3P49 B; 5K20 B; 4UTG A; 2QV6 A; 2UUT A; 2B3A A; 1SVD A; 4RNM A; 3C6T A; 4PUO A; 3OSN A; 1L4D B; 3ZFV A; 3DDI A; 3OJS A; 4DX6 A; 4DV5 F; 4LQ9 A; 2BMB A; 2IO0 B; 2DIT A; 3W63 A; 3I0R B; 3ILO A; 4RW9 A; 4UQG A; 4ILM A; 1X4G A; 2L08 A; 4PYA A; 4NLR A; 4AL7 A; 2Z2L A; 5GMV A; 2AJQ A; 4IWQ A; 1WJ9 A; 2AJ0 A; 4MGZ E; 4UOF A; 3PX4 A; 2FUG 1; 4QBU A; 1RTD B; 5LOQ A; 2VPY B; 1SJ4 P; 4YFU A; 2GBR A; 3KKF A; 1WM3 A; 4KHP J; 4RW6 A; 1ICE B; 2KOX A; 3ZZ0 A; 1FNV A; 2M3D A; 1FFW B; 3EGV A; 4DXA B; 4YR2 A; 2OSQ A; 3L4B C; 1T9W A; 2AX0 A; 2KFY A; 1HQU B; 2WYQ A; 4F4X A; 1QLN A; 3PYD A; 4J9L A; 2JWN A; 1JWU D; 1RU2 A; 1S6P A; 1REG X; 1RWP B; 2V9W A; 3EX7 B; 2SXL A; 2K0P A; 3B2G A; 4ED0 A; 2WDV B; 4OX9 J; 4ZVO B; 4DR4 F; 4TQR A; 3EIC A; 2ZUG A; 4C00 A; 2LGY A; 1OYE A; 5J1E A; 4P2F A; 3QLH A; 4DG1 B; 1BUX A; 1FKP A; 3D67 A; 2DR9 A; 4JWU C; 3GS2 A; 3MC0 B; 5IC4 B; 5L1I A; 3VR1 A; 2CJ9 A; 3OTO J; 3RI7 C; 1O5J A; 4W9H A; 2DY1 A; 3CTR A; 2G2O A; 3P8B B; 3MF5 A; 3OJU A; 3UDL A; 1U0S A; 3RZW C; 4ID8 A; 3LGH A; 4LFB J; 3OR1 B; 4IFV A; 4OX8 A; 2MKK A; 3RTV A; 1WM2 A; 3JYU A; 2J0M A; 2HQF A; 2P6T A; 3SQG B; 1TL3 B; 2DNM A; 1R6V A; 2BV3 A; 4ICV A; 2V5H G; 4DHZ B; 3Q69 A; 3P6Y C; 1OJ4 A; 1WHY A; 4Y3C A; 1J7C A; 3Q3O C; 2RPQ A; 4KGR A; 4CH1 A; 1HXY D; 4OVZ A; 4NA1 A; 5IN7 A; 2ZWO A; 1YJW S; 4OX6 A; 3GJR B; 2FGO A; 4B6W A; 3OHA A; 3CD0 A; 3QGG A; 1NB7 A; 3POT A; 1KOT A; 4D3G A; 1UWA A; 3NCP A; 3HVT B; 1F9H A; 2HS4 A; 1LW0 B; 3N6L A; 2ZPN A; 1NK7 A; 3I4P A; 3PVL A; 1V8C A; 2OFG X; 3TEH B; 2DGW A; 4C8O A; 4XZ4 A; 1P6T A; 2QL9 B; 4X4T A; 4P52 A; 3JAM Y; 4XDC A; 1M0S A; 2MMY A; 1PQS A; 4O44 A; 3DOK A; 2Y0B B; 3EDR B; 1S6Q A; 4G1I A; 4I7F B; 4B17 A; 1RTH A; 1RHR B; 2X1A A; 4F36 A; 2M88 A; 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