2P10A

Crystal structure of a putative phosphonopyruvate hydrolase (mll9387) from mesorhizobium loti maff303099 at 2.15 a resolution
Total Genus 92

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
277
structure length
268
Chain Sequence
KRPTRSELVDRFQKKIRAGEPIIGGGAGTGLSAKSEEAGDIDLIVIYNSGRYRMAGRGSLAGLLAYGNANQIVVDMAREVLPVVRHTPVLAGVNGTDPFMVMSTFLRELKEIGFAGVQNFPTVGLIDGLFRQNLEETGMSYAQEVEMIAEAHKLDLLTTPYVFSPEDAVAMAKAGADILVCHMGLTGKSMDDCVSLINECIEAARTIRDDIIILSHGGPIANPEDARFILDSCQGCHGFYGASSMERLPAEEAIRSQTLAFKAIRRQP

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
S1 (29-34)TII'1 (233-236)AH2 (37-46)AH4 (76-82)S2 (50-53)AH3 (55-60)3H1 (66-70)TIV3 (91-94)AH5 (110-119)TI1 (84-87)EMPTYS3 (96-100)3H3 (130-132)S4 (123-126)AH6 (135-143)AH7 (148-161)S5 (164-165)S6 (168-169)S7 (185-188)TI3 (224-227)AH9 (207-223)S8 (228-231)AH10 (239-248)TI4 (249-252)S9 (254-257)TIV1 (60-64)O1 (71-73)3H2 (88-90)TIV4 (126-129)AH8 (172-176)3H4 (177-181)TVIII1 (183-186)AH1 (12-25)TI2 (101-104)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Mesorhizobium loti
publication title Crystal structure of hypothetical protein (NP_085906.1) from Mesorhizobium loti at 2.15 A resolution
rcsb
molecule keywords Mll9387 protein
total genus 92
structure length 268
sequence length 277
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF09370 PEP_hydrolase Phosphoenolpyruvate hydrolase-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.5.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces Single helix bin 2p10A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2p10A01
4FF7A 3M5ZA 4JDYA 3GXNA 1FCQA 5LKYA 3N14A 3FS2A 2V5LA 2X1TA 2E09A 4JDBA 1M7PA 4DO5A 1WXJA 2TYSA 1V7YA 1AK5A 3LHZA 1A50A 3BW3A 2XN0A 4BF9A 3DH7A 2E6AA 1FDJA 4X2RA 3W84A 5AFDA 4IMEA 3S1UA 1L6SA 3BLEA 2ZZ7A 5MHBA 4NXSA 5BMXA 4Z1BA 3UZ5A 1F5ZA 4O50A 4Z1AA 1TRIA 3DXIA 2GOUA 1ME9A 5DXYA 4A29A 1SO6A 4UR8A 3O15A 1OJXA 1WYIA 1X8FA 3QMSA 5EL1A 4JD4A 1J4EA 3PUOA 1W5NA 2GUUA 2RFGA 4KFPA 1OMIA 1TIMA 2NXHA 3OIXA 4L4MA 3PBVA 2CZ5A 1ME7A 4DEFA 1GWJA 2FQIA 4E0CA 3CM4A 1GG0A 3KFTA 1HFBA 4LVAA 1MO0A 2H3BA 1TJPA 3S9YA 4O18A 1F76A 2W79A 2FB2A 1G67A 4JTEA 4PA8A 1AW1A 5KZDA 4YCPA 5AYZA 3MJYA 2GJLA 5HJLA 2A6LA 3L0KA 3W1AA 3O6DA 2E5DA 3W7RA 5C2XA 2NX3A 3LRLA 3AJXA 3S1XA 1VLIA 1ZAJA 3SY5A 3TNOA 3T7VA 1QPNA 2QAPA 4OWGA 5D2TA 4EOUA 4LOCA 1QO5A 3G3MA 2QDHA 1W5OA 4DELA 2P10A 1KTNA 2WSYA 1KLYA 1F7BA 1TPFA 2Y7DA 2CLMA 1K7EA 2CW6A 1TCDA 2YFOA 3GDTA 4UTTC 3DFOA 4G1KA 3TU9A 1KV8A 4UTTA 1SW0A 2F7FA 3QPZA 4JTKA 2E5BA 3N19B 2Z1BA 3TIMA 1K8YA 1KBJA 4WXZA 5DBUA 3NXFA 2VFIA 5D2VA 2B7QA 5AYYA 1K02A 4NX0A 1VS1A 2ZYFA 1G69A 3LBMA 2OZ0A 4AF0B 3NQCA 1RZMA 3W88A 1KM6A 2QEZA 3DFPA 4FX7A 3G1AA 1TTPA 1D3HA 1UUMA 3M47A 4ZQOA 4HNVA 2QCLA 1RQBA 3EX1A 2ZTKA 3ELFA 5AHMA 5AHLA 4TIMA 4JTFA 1N7KA 1GTHA 1D9EA 1LOSA 4N4PA 3WJSA 5SWUA 2ZZ6A 2ABAA 3BGJA 3S5YA 5K7JA 3NL3A 1KM5A 3EWKA 4UC5A 3UWUA 4OQVA 2QCDB 4UFIA 5K9DA 1W5MA 3QC3A 3MP3A 2WNQA 4QQ3A 1UCWA 2QDGA 4JTJA 3P8IA 1VCVA 2JBMA 3HIJA 4I7UA 4N2YA 1M5WA 1H1YA 4DPPA 4O1DA 2CLHA 4LWWA 3A22A 1XKYA 4K39A 4JS3A 2G8YA 1GG1A 2JKAA 2EF9A 2EPHA 4FNPA 4S1FA 3W73A 1I45A 1OFAA 1C9DA 1KFEA 1ICPA 1F2JA 3QMRA 1R47A 4JXCA 4WQ6A 1NFBA 1AJYA 5I3FA 5DBTA 1PL9A 3HGOA 5I3KA 3LTSA 3M9YA 4AHOA 2GVJA 1LBMA 2JGQA 4N6EA 3GAYA 4WY0B 4LVFA 3P74A 3NQ2A 2A7PA 5LNSA 1H60A 2J88A 1P0KA 4FHAA 4I7VA 2I1OA 1M6JA 4RCXA 1FWRA 4M7TA 3UYCA 1OFRA 2DZVA 1TYGA 4UMBA 4LRTA 2W0UA 3S5OA 3BW2A 3TK7A 1XXXA 5KZMA 4JTUA 3S0CA 4S2BA 1L9WA 4NNBA 3RF9A 5FF7A 3WK1A 5H91A 5E1QA 5H2ZA 2Y7FA 1MZHA 5T26A 2ZRVA 2CLOA 4CCDA 3GDRA 1IF2A 2OCZA 2DZTA 1W8SA 3SSJA 3W72A 4IGHA 4UFKA 3L0GA 3E12A 5DY3A 2G95A 4GWEA 3VKJA 1ZCOA 1FDOA 2DP3A 3KHJA 1DOSA 1KFKA 3LXAA 4NNCA 3PUEA 1R2SA 3L9CA 1TV7A 3PSVA 4O0ZA 3G24A 4ZQNA 1H61A 1JQVA 4UFLA 2NX9A 5ABTA 3DKJA 3W83A 4JX5A 3MI2A 4LT9A 4XQ6A 3CEUA 3OBKA 1WBJA 2OJPA 5KZEA 1TTJA 4AWUA 3H53A 1DJNA 3W85A 4JX4A 3W74A 1FUYA 1XBVA 5DXXA 1T99A 4OGZA 2ZRXA 3PWAA 4Y96A 3ZWTA 4P2VA 1Y0EA 3WK2A 3N9SA 1R2TA 5FF2A 1B4EA 1AW5A 3FOKA 4JYEA 3SZ8A 2V0TA 2GQAA 3OVQA 2RDWA 4E2BA 4RJEA 5CPLA 1RD5A 4ZQPA 2PCQA 4POCA 4AEOA 5D30A 3KOFA 5HULA 4YL2A 5FI8A 3MI6A 1W37A 3FYPA 1SZFA 1VCGA 4NZJA 3HG4A 3NQVA 1TPUA 2EGZA 1KV5A 5CKSA 1TSIA 2P1FA 4GBUA 5HNRA 3T4CA 4RR4A 2J6XA 2ZA3A 3CLMA 2B7OA 3G1SA 3MYPA 1VRDA 3UY7A 3O6CA 1EX5A 2DZXA 3GR8A 3TDFA 3LTPA 4HKPA 2YW4A 3P67A 2Z2UA 4HNUA 1FCVA 3V75A 3HF3A 3GDKA 2DU2A 3TX9A 3QSTA 2CLEA 2Y61A 3HG3A 2H6RA 4A22A 1JRCA 2C13A 1UB3A 3TKFA 1A5CA 5LNVA 3KX6A 2XFWA 2BX7A 3NG3A 2CZFA 1BKSA 4BI7A 3NYZA 3I7RA 3G1FA 2VEPA 4GFSA 3TAOA 1S5TA 3G0XA 4AXKA 1SZNA 3IVUA 3IIVA 1TPEA 3NA8A 1TV5A 4IQLA 4ORIA 1KM1A 3HJZA 5HUPA 1ADOA 1VQTA 3C6CA 4JIQA 3BVJA 3O06A 2X2GA 3PVFA 3GKAA 4HNTA 2YYTA 1E51A 2I9EA 2VFFA 3QEZA 5AHIA 2X1SA 3NO5A 4A3UA 1OYBA 3MHFA 1LLZA 1GVQA 3I68A 2H8XA 3MYOA 1ZHAA 3O8AA 3PB0A 3NEVA 1QCWA 4ZQCA 5EMUA 4DBDA 3QYQA 2Q8ZA 1PCWA 3KVKA 3RLUA 1Q6QA 3G1VA 2E6YA 3EB2A 5FF3A 1Z48A 5AB3A 3W2UA 2VOMA 1W54A 4O10A 4Z1CA 1VC4A 5FF4A 2VC6A 5DY2A 5AHFA 3W2KA 2WV8A 1L6WA 1G7VA 4TO8A 4AHPA 2B7NA 4XWUA 3UPBA 1TPH1 1X6UA 1GYLA 4FNUA 4QM1A 3W2NA 5F2MA 1W1ZA 3A23A 3NGJA 4QITA 1F73A 4PFMA 5G2IA 1VLWA 4WUIA 4BK9A 1FCBA 3B06A 2HS6A 3KVJA 1OFQA 5G5IA 4Y6GA 3LRMA 3C8FA 1OABA 1YDOA 1OX4A 1XBXA 3QF0A 3LX9A 1G4PA 3BLFA 3W1XA 1QOPA 1B9BA 2CWNA 5DCBA 3IVSA 3M16A 2QKFA 1H7NA 3AO0A 1FY6A 1EEPA 2TSYA 5C55A 2W6RA 1GT8A 1GJPA 3W1TA 5L9FA 1LRNA 3FKRA 3DFNA 5CSSA 4NX5A 2VEKA 2GPTA 3CEPA 1O5KA 4FNTA 3A5FA 1KFJA 4HSOA 3ATYA 3MMTA 5BOOA 2IQTA 4OU1A 3UWQA 3HPXA 3MHGA 1SUXA 4TU1A 2YSWA 2ZA2A 3NM3A 3EKLA 1ICSA 3SW6A 1Q45A 3B0UX 5TQLA 1OX5A 5D2YA 1GVSA 1CI1A 4HPJA 3M5YA 1TV8A 1ZY9A 3TFCA 3M7WA 1TTQA 2G5WA 3QRHA 1J5TA 3M0ZA 3NPVA 2QJGA 2AGKA 5K3VA 2J9YA 3PUDA 3LLDA 3W7PA 3C2FA 3PM6A 1OFBA 2C18A 5CPOA 5G4WA 2Y85A 1G4EA 2CLFA 3CWNA 3C61A 4JEQA 4KFNA 1NEYA 3L0NA 2QCGA 1FWWA 2BSLA 3F1QA 2WO5A 5D32A 2VFGA 2CZDA 3NZ1A 1OVDA 4ZMGA 3H25A 2ZRWA 1SSDA 3Q58A 3S6DA 4E38A 1QFEA 4IMGA 3DU0A 3EKZA 4BI5A 1S5WA 3NQMA 3GNNA 3UXAA 1ZENA 1K7XA 2A5HA 3R12A 3TW6A 1SFJA 3H55A 3PS7A 3NQDA 1DL3A 1OYAA 4NJGA 3S42A 4LUIA 3W75A 4WJEA 1MEHA 1XUZA 1W3TA 3BG9A 5KMYA 3W7HA 4O54A 3STEA 1QPQA 5G4EA 4BWLA 3CU2A 4FXRA 3IIPA 1XFBA 4EWND 1P4CA 1I4NA 3W7CA 3IV3A 1D3GA 4RX0A 2FPVA 1QDSA 3G1DA 4DXVA 5FEPA 1H7PA 3LERA 4IJBA 1LLWA 2QF7A 5BNKA 3R2GA 1X1ZA 3LXBA 2DJXA 1W0MA 1TPWA 1TTIA 1O5XA 3N2XA 5EYWA 1OFPA 1JCNA 4MOZA 1PE1A 3C0JA 4N9EA 5KSWA 5D2WA 2NX1A 4LC8A 3BK0A 1VYSX 3PG9A 1V5XA 1YYAA 3F4NA 3IGXA 4CLMA 1I2PA 3QSRA 5G1YA 1QO2A 3USBA 3W7IA 1RV8A 4JTGA 3R8RA 5FEWA 3WJWA 3UWZA 3SJ3A 5HR6A 3BARA 1KFCA 2WJZA 5J5DA 4N9BA 5F1VA 2VENA 3B0PA 2X16A 1DHPA 3DHDA 3LBCA 5AHNA 3DFSA 4UFMA 1MEIA 5F4XA 3M5XA 2EHHA 5LNRA 2ZDRA 1GVOA 5DELA 3Q2DA 3PR2A 1LOQA 1R30A 4JR5A 4XUGA 4AAJA 3TR2A 2V2HA 3NQFA 5HUOA 3TH6A 1Q6LA 3EXSA 7TIMA 3UZJA 3C2EA 3TMQA 4NQ1A 1HTIA 1SW7A 3G8EA 4PEKA 3CPRA 5D03A 1FWSA 1HO1A 3NQ7A 2V2DA 2ATMA 4M6VA 3LCIA 3W7KA 2NUWA 3G0UA 4MY1A 3W23A 3THAA 2QR6A 5GVJA 1J2WA 3UXDA 1VHNA 1WX0A 1X1OA 1OK4A 4Z1DA 3ABSA 3C2VA 4M5PA 4UTLA 1YTDA 1JVNA 1S3HA 5J5RA 1PS9A 3LXCA 4MJZA 4LTSA 3W1LA 1ZNNA 2ZZ3A 1JR1A 3C52A 3QW4B 4NXKA 2FIQA 1RQEA 4UXDA 1SSGA 4O19A 3O6YX 4DF1A 2YPIA 1H7RA 1TRDA 4QSHA 5HWNA 3W7LA 2G96A 3LRKA 1WOAA 1O60A 1OHLA 1U83A 5EKYA 3NM1A 2AAMA 4ZQMA 3P62A 1TPB1 2X1UA 4R33A 5LGXA 3ABRA 3C4UA 5FEXA 2A4AA 1JUBA 3DI0A 1YXCA 2Z0IA 2QCNA 5E0KA 3RK8A 3P7YA 5HINA 5K2ZA 3BPWA 1MSSA 1G4SA 1SZEA 3B4UA 3TAKA 3W6YA 3UWYA 4FO4A 1TJRA 3GR7A 2R91A 4JTSA 4UR7A 4GE8A 4RLIA 1VR6A 3TMLA 1WMKA 1DV7A 4UNKA 3H54A 3OEXA 3QZEA 3P5ZA 5LGZA 1OYCA 1W5QA 1WBHA 3C2OA 3RMJA 1DBTA 3PBUA 2VEMA 2RH9A 4YMZA 2ALDA 4GRSA 2X1RA 2NUXA 3P81A 5EPDA 1DQWA 4O0KA 3I65A 2R94A 4LY8A 1K03A 2NV2A 4IMFA 3BV4A 3EWBX 4H4IA 3K30A 4M6QA 1H7XA 3QH2A 5D33A 4HIBA 4RZ5A 2NZLA 3TV8A 1KBIA 5HWMA 3ZS4A 5G2HA 1JCMP 3EWYA 2HSAA 1IXOA 4QNEA 5CG7A 5TIMA 4LS2A 4WY0A 3W7NA 3G18A 5HWJA 1BTMA 4RK8A 4PC8A 1ZMEC 5DCEA 1LCOA 1W31A 3W7DA 1KFLA 3CT7A 5LNWA 2WNZA 1LDCA 1LTDA 4GXMA 5D04C 5CZSA 2NXGA 4XKYB 4QISA 3TXVA 5KTLA 1EP1A 2WSQA 4TX9A 4OHQA 4JN6A 3KVMA 3FLUA 4HN4A 1LP6A 4MUZA 3CIWA 2G97A 2YXGA 1IGSA 2Z6IA 4K7YA 2RDTA 1RVGA 1R46A 3IIZA 3RNDA 1KA9F 1F74A 1H50A 3FJLA 3MO7A 2J24A 4O28A 5EBUA 4AWSA 3DKLA 3D0CA 4ONVA 3O6QA 3GX9A 2B7PA 3GDMA 3STFA 3BLIA 5BMWA 4UTJA 1P5BA 3ZWSA 2RDUA 3TCEA 4MYAA 4R7JA 1XC4A 3PB2A 3FKKA 1O94A 2FPTA 3W7OA 3CB8A 3DI1A 1H62A 1F6KA 4MZYA 4C1LA 1XDMA 1B3OA 5AYXA 5D37A 3PSWA 2V9DA 4M19A 3LCXA 1ZFJA 1Q6RA 2JGYA 2GVLA 1HG3A 3NPWA 3QM3A 1DKWA 3NDOA 4O11A 5C54A 3DFTA 1SO4A 3BG3A 4LNYA 3EX3A 3T40A 4WD0A 3PULA 1VGAA 4Q32A 4TMBA 1TPC1 3W1PA 4NNAA 1N8FA 5FF0A 3HGJA 1YLVA 3MI3A 1SU5A 4OT7A 2PC4A 4Z0SA 4FIRA 3SGZA 3OVRA 3A21A 4DBEA 3OG3A 2V30A 4DO6A 1O95A 1VH7A 2V81A 4N02A 1L2UA 1FXPA 2ZRYA 1XCFA 2C3ZA 3WK3A 1PHWA 3MP5A 4O12A 3PBWA 3GYEA 3O63A 4XBKA 4MLJA 3S8HA 4LVGA 5F2LA 3P61A 1FDIA 3KVLA 5F4WA 4UNLA 1JQXA 5D38A 2RHGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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