2Q1ZB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
193
structure length
185
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRQIADPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RpoE, ECF SigE
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 36
structure length 185
sequence length 193
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2q1zB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2q1zB02
2FQPA 4HZFA 4HN0A 3DL3A 4KL1A 5CU1A 3H1MA 3UKTA 4HVOA 4XFBA 1XE7A 3KGZA 2GU9A 4E2GA 4LA2A 3BU7A 4D7TA 4YSFA 1JUHA 4XF9A 2PA7A 2PHLA 2WFPA 4UBHA 4IEVA 1NYWA 4WBBA 1I5ZA 2D5HA 2XL7A 1IPKA 4Q0SA 3U11A 5LEJA 3KCCA 5J7MA 3RYPA 1Y9QA 3D0SA 2D5FA 1NZCA 5I8YA 3MDPA 1CAWA 1FXZA 4ZU7A 3PVBB 4R8HA 4I02A 3H3UA 1FT9A 5FCCA 1VJ2A 1VR3A 2UY8A 1ZZ7A 3NKTA 4AXOA 5FQ0B 4BH9A 5EFUA 3USSA 4ZU5A 5KHIA 3ACLA 3M3IA 3E97A 4MX3A 4ZU4A 2PAMA 3ETQA 3EO6A 5D1IA 2QCSB 2Q0AA 2BGCA 4KWJA 4IESA 1CX4A 3SCFA 1EPZA 1V70A 3WW2A 1OMIA 3H50A 4FAHA 3H8UA 1O3QA 4N9HA 2XLFA 5I0RA 1RUOA 1PM7A 3IIAA 4WVZA 3QOPA 2OYZA 2PQQA 3OF1A 1X82A 2C0ZA 1J3RA 3FFQA 1ZRCA 2IXIA 4KU7A 4XEZA 3LZZA 2PYTA 3H9AA 1U12A 2B8MA 5BUVA 4JV4A 5KHGA 2GH2A 2EA7A 3E6CC 2EAAA 3NL1A 2XGXA 2EVXA 4WZCA 4YNIA 1WLTA 4AVBA 2CAUA 5FQ0A 4OFGA 4META 2IXJA 4MGYE 5BXXA 1EYBA 1ZRRA 3KSCA 1ZVFA 4LTAA 2CV6A 4PJYA 4HSJA 4OLLA 2Y0OA 3JZVA 4RD7A 2MHFA 2GAUA 3OTFA 1WA4A 3O14A 3BALA 3EBRA 3BPZA 4J1WA 5JSRA 5I8TA 4JTNA 3E6BA 2CGPA 5KHHA 2ZKLA 5I0TA 5HI0A 2BYVE 4L11A 3OGJA 1O4TA 3KMHA 2XKPA 4QGMA 3PNAA 3H3ZA 3KGLA 1DZRA 1ZZBA 1X8MA 3S7EA 4XF1A 2PAKA 3LA7A 1LR5A 3M70A 3PLQA 3CL1A 4BYYA 5KBFA 1WGPA 3RYKA 1YFUA 2H6CA 4FAGA 4Z82A 1CAUA 2IXLA 4LEJA 3GYDA 4IETA 2OPKA 1H1MA 3WW4A 4HVQA 4Q0PA 1LB2A 3N4MA 2BNNA 1UCXA 2D93A 3HT2A 1RUNA 4KWLA 3EJKA 3LOIA 1O3SA 2BNOA 4IEQA 4LUMA 3U0ZA 1QY4A 3FE5A 1ZX5A 1XE8A 3IBMA 4I2OA 4KU8A 4X6QB 5FDBA 3FHIB 3HIFA 2QVSB 3IDCB 3E5UA 3ELNA 4IEPA 3C3VA 1YWKA 3SCGA 2MNGA 4O9GA 4EWEA 3EQEA 4QM9A 3RYRA 2IXHA 3CO2A 4I01A 4QGNA 4EROA 4HVRA 1RTVA 4JVAA 4MV2A 3E6DA 4BIFA 1CAXB 2XHKA 5LRSA 1CAVB 4LLOA 1YFYA 5I91A 3WW3A 5FLJA 5KHJA 5EZWA 3FZ3A 4XF3A 4FT8A 4AQ2A 2PAEA 1GQGA 1RC6A 4Q0UA 3D82A 3MYXA 2QNKA 1XRUA 1CGPA 1EY2A 4I09A 1YFWA 4XFIA 1YLLA 4JTOA 3IWZA 1O7FA 1SFNA 3BCWA 2K0GA 5I0UA 5BY5A 1Q5OA 2Q4SA 4XFAA 4YRDA 4F7ZA 4ORFA 4HLTA 1J3PA 5JSPA 4BHPA 4CYDA 2V09A 3E5QA 4IEXA 2GC2A 3LAGA 3RZZA 2BNMA 1G6NA 1YFXA 3LA2A 3FWEA 4XFHA 4D7SA 1UD1A 1DGRA 3VHRA 3TNPB 5T3NA 1ZRFA 3RDIA 4AVAA 2ZCWA 4NQWB 4TLFA 3BB6A 5CADA 1IPJA 3IDBB 3E5XA 5E16A 4QGLA 1DGWA 1J58A 4UXAA 3HUGB 1SEFA 3SCHA 3SXWA 1QXRA 1HW5A 1FI2A 5CVRA 3FX3A 4XF4A 3H7JA 1ZZ8A 3UKVA 2UY9A 1Q43A 5FPZA 3HT1A 2KXLA 2Q1ZB 4KWKA 2UYBA 4X6RB 3UKNA 3HQXA 3D0JA 4XFGA 5AVPA 1EP0A 2GC3A 2IXCA 2PHDA 3DV8A 3I59B 2PTMA 3L2HA 5JAXA 3S0MA 4GULA 3U10A 5FPXA 1DZTA 1CAWB 2P17A 1UPIA 1UIJA 3H1YA 3LWCA 1LRHA 4QMAA 4I0BA 4EV0A 4MGZE 2B9UA 2GC1A 3FJSA 1J59A 3OCPA 2B5HA 3ES4A 3MZHA 3ZDSA 1L3JA 4IEYA 3ROUA 4PIXA 2OA2A 3OD0A 4HBNA 5I0SA 1Q3EA 1ZNPA 2Q30A 1O3TA 1X7NA 5JR7B 1ZREA 3DN7A 4F8AA 4XFFA 4I0AA 1NE4A 3DKWA 4LUKA 2D40A 4IEUA 2OZ6A 5C6CA 3B02A 3CLPA 1ZZ9A 2Z2SB 1ZZ6A 4J1XA 4YARA 1RGSA 3I59A 5J3UA 5C8WA 4R52A 2I45A 4IERA 4XF0A 2HJIA 1J3QA 2N7GA 2UYAA 1ZRDA 2XKOA 5J48A 2DCTA 2VPVA 4B29A 4IEZA 3NSTA 2GC0A 3ES1A 1SQ4A 1H1IA 1UIKA 4EWDA 4ONUA 4I3PA 4QXKA 2E9QA 1O5LA 1NE6A 5K8SA 3ST7A 1O3RA 4N9IA 4QX5A 3GBFA 4K8FA 1O5UA 3SHRA 1QXJA 2ATFA 2VQAA 2ET1A 3QACA 4FBFA 3G7DA 2Z69A 1PMIA 2O1QA 4MGIE 3CF6E 2IC1A 4YYOA 4UBGA 4Z07A 3NW4A 4PIYA 1TQ5A 4QM8A 4E2SA 5LEKA 4PIZA 2WC2A 2BEOA 1QWRA 2CAVA 1OFNA 1VP6A 2GZWA 4HN1A 1OI6A 2OZJA 4MGKE 4NVPA 1YHFA 3CEWA 4XFCA 5KHKA 4MUVA 2VECA 1CAXA 2XLAA 2H0VA 4Q0VA 4HSLA 4Q0QA 1Y3TA 1CAVA 5FLHA 4XETA 5FLIA 1NXMA 5LRRA 3TNQA 4HMZA 4O9EA 4AVCA 1X8EA 1GQHA 4DINB 1RL3A 5BPXA 5BV6A 1OD5A 4IEWA 2HKXA 3EHKA 1CAUB 5I8SA 4E2QA 3MPBA 2XL9A 3RNSA 1J1LA 3CJXA 2MPFA 3R6SA 1YUDA 2F4PA 2QJVA 4A2UA 5E1RA 3SMHA 3RPQA 2XLGA 2ETEA 2O8QA 2FMYA 2K9ZA 1UW8A 3I7DA 4MZUA 4LULA 2ET7A 5JCTA 3S7IA 5I93A 2IXKA 2QDRA 3I54A 4LA3A 1LKNA 5F1RA 3NVCA 4Q29A 2PFWA 3LA3A 3WW1A 1ZZCA 1I6XA 4EWAA 2H6BA 4MH0E 5JSOA 4IEOA 3H1WA 3NJZA 3H7YA 4H7LA 4AQ6A 4L2NA 4P9GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FQPA 2ARAA 4BMEA 1MZEA 1W8OA 2JA7J 1LNWA 1Q56A 2X8KA 3Q8BA 5FRNA 2ZMEC 2WKKA 5JVTA 5DM7F 4ZYDA 1X19A 2F2EA 2L9VA 4B8XA 4HF2A 1IOAA 5LEJA 5J7MA 4H0EA 2JB4A 2R5ZA 2L02A 2VQ0A 1U2WA 3UR3C 1YW8A 3OY8A 5E3OA 1RUJ1 4XILA 3WF0A 1FV3A 4HKLA 4XONA 1MR5A 3AX4A 1X3UA 4FE7A 3M3IA 2J5OA 5IVVA 2M8EA 2ZC2A 2ISZA 2OX0A 2FOWA 4BISA 1SAUA 3WTUC 4QKNA 1QJX3 1LFPA 3J7AY 3SEPA 1G8WA 5C3PA 2XJRA 4NO4A 4NHXA 2KDZA 2W9XA 5LA1A 3FF5A 1KQRA 4E7KA 2OPWA 4BJTA 4WM7C 6PAXA 3WE2A 3NQHA 3HQUA 5LCWL 2K9LA 2JG9A 2PMWB 1UG0A 1R1ZA 1EKEA 2XGXA 2EVXA 4H2AA 4A0YA 2CAUA 4K3UA 2IXJA 3FLTA 4M0NA 1LOBA 4K7JA 1US2A 4OCTA 3GZ6A 2R92J 1IKPA 2GAUA 2JDKA 2VPRA 1LU2A 4YFXF 1WA4A 2W48A 4EZ4A 3AFKA 1HXS2 4LOCA 5I0TA 4ITVA 4NIIA 4FCYA 1YQ6A 1NTCA 3DECA 4JAAA 5DUXA 1R1A1 3N7LA 1ZZBA 1A8MA 2R1BA 5DAWA 1MKMA 1H6XA 5FZBA 3ABUA 4BYYA 2R1DA 3CL1A 5L7OA 2EFPA 2H6CA 2Y75A 4EQQA 1HLVA 4L5JA 3CCMI 5JHUA 3HOUJ 1LOGA 4HDUA 3CCYA 1K45A 4LUMA 1PGL2 1MS4A 2IFRA 1MBHA 2FNAA 1UZZA 2CSOA 2E71A 5DS9A 4MXVA 5FDBA 3EB7A 4UV8A 2HYXA 1NLSA 4HPKB 3GJBA 4QX8A 3K1NA 3IB3A 5A7SA 1ZG3A 2JRTA 5L9VA 4LO6B 1NHAA 1RUG2 1SCRA 2XF6A 3TAYA 2FDIA 3P9KA 1C0WA 1NCRC 5B2GB 5TJJA 3DEMA 1YJLA 4Q4Y3 1EV7A 1Q1VA 3RI8A 3AP9A 1JYIA 4QB6A 4D7YA 1RUH3 1QJX2 1UZWA 1A35A 4I09A 2VBBA 1JZ2A 4DW6A 3WHCA 1NKGA 2D45A 1ZYRF 3TEYA 5CFDA 3BTAA 4DZGA 4A44A 4Z1VA 1TWAJ 3SFZA 1UZ0A 2JENA 4ESBA 1OVPA 3N7JA 5JXGA 4WM8A 4Y26A 2HVSA 1AR71 1BBT3 1AUYA 3PTYA 3U1XA 3CZUA 2CGNA 2HWE3 5JVVA 3TNPB 2XGEA 4AR2A 4B1LA 1AR61 4D0PA 1SCSA 1RJ8A 5CFCA 3D6EA 1P4AA 1QNYA 2VZVA 4P1WA 5IK8A 2EZHA 1LENA 2PMUA 2RR13 1QRYA 4L0YB 4GJZA 1NY72 3MKLA 1RIRA 1HB3A 2K85A 4ZYAA 1CZVA 3D0JA 5HV4A 5D8AB 1P92A 2BY2A 1F2NA 1XSRA 3UK9A 2XUBA 1ZRIA 4GULA 4FSJA 3PDQA 1S0FA 2AACA 4I0BA 1CESA 5EEHA 4LBJA 1FBUA 4BL0B 2GC1A 4E8CA 2Z79A 3MZHA 3OD0A 1YI7A 2Q30A 5H6QA 3V0BA 1WFXA 1IO2A 1JGSA 2BJSA 1SAXA 3QYFA 3T2QA 5IAXA 4LOTA 4ENNA 3KF3A 5EIYB 4PLNA 3MFKA 4IV3C 2G9WA 4PSXA 5FPBA 2UXNA 3RIRA 3MAJA 4J1XA 1AR82 2CRGA 1LCLA 1DFQA 2DUPA 5FLXK 5C8WA 5FYHA 1U0AA 2E5ZA 3MICA 2ZXIA 1LE8B 5ICGA 4ZONA 3M7AA 4CP1A 4E4DX 2XSDC 2CUZA 2O3FA 2D3PA 1GV9A 1W3XA 3VBRB 1SLBA 5C4WB 4EM0B 4MSVA 3VDAA 2VTXA 2KIQA 1AF9A 4DOUA 4IHSA 2XROA 1KS5A 2VQAA 4B1MA 4MGIE 2LBFB 1G9AA 3HNMA 3DF8A 3JBG1 4UBGA 1VQLI 4K40A 5L19A 3GCXA 1PNFA 1WVRA 2ZAAA 3MF6A 4XOTA 2JJ6A 4S2HA 1K6OA 1YS6A 5LY2A 4XFCA 2EZLA 1OKQA 4WM7A 1VLNA 1TWCJ 4UB8C 2HWE2 5HDGA 1FY7A 1F9KA 1Z7UA 1JYVA 2GNTA 4RR3C 2DK8A 2RM21 2KJCA 1D2QA 4EATA 3W20A 5F6KA 3ZN6B 3EHKA 2Q1MA 4HG6B 1J1LA 3G1MA 4BQ4A 2F4PA 4W50A 4OAZA 2XXZA 4M3CE 1VRH3 2BGOA 1BC8C 4PGGA 2FMYA 2ET7A 4AD9A 1LDJA 4QKBA 3OL4A 2OXBA 4ASKA 3T2PA 4DUXA 1DU0A 5GALA 2DPUA 5A3LA 4JX6A 3HRTA 1QPMA 1HCRA 2VONA 4RAZA 2KMUA 1AYM3 4MXWB 3C3WA 4AQ6A 4BGDA 3KZ4C 3O8HA 2QQJA 2W52A 3BG7A 3BGAA 2E32A 4GH4A 1SBEA 3K70D 4IGPA 5LA9A 4CUAA 5A33B 3S5QA 5FY8A 4EN8B 3N3HA 2KRCA 2PA7A 4FX4A 3FDYA 4E7JA 2AUYA 2OQ7A 5FREA 1V4RA 3U11A 2R7TA 2P6CA 5FGMA 1UPSA 1V9U1 3M8JA 1ZA7A 3OOPA 1FXZA 3BUCA 1YI9A 2VB6A 2V79A 1W0TA 1T38A 5GPAA 4CDXC 2VUMJ 2EK5A 4PDWC 3AKZA 2DJNA 5DQ0A 3KP2A 2W0XA 2XWJB 4XJUA 3K4DA 4CP9A 1H2MA 3V8LA 4KGQA 3ECQA 5DCMB 5FZDA 2AYHA 3M3OA 3BDDA 5CIRA 1DGWY 3AL6A 2A6HF 2IWGB 1UCRA 2E7TA 1NG6A 1YQCA 3H50A 4GB33 3U21A 1U9NA 4MADA 1FZPB 1UYYA 1WCUA 1FYLA 1S0JA 2DOFA 4RHV1 3ZMNA 2CV1A 1H8TA 4J6GA 4K8RB 2VBDA 1ZRCA 4DXSA 2QQUA 4PQQA 4DXRA 4FOYA 3GTKJ 3OGVA 2BY0A 4GXOA 4MHRA 3VHPA 2E51A 2HTSA 5GM0A 2WAOA 1XSDA 4CP0A 1CQ9A 5IP9J 3W2AA 3UGHA 1VRH2 3I2JA 4IQJA 2O03A 4DFSA 1QGLA 4ASLA 3WNMA 4C1WA 2L7KA 3FK7A 1LHWA 2JECA 3ZSMA 1AYM2 5FP3A 2W47A 2CWSA 2FMDA 3WF4A 3LA7A 2D5VA 3PLQA 3HNYM 2Y33A 2NOJB 3KE2A 3B6AA 1R093 3WG2A 3WEZA 4CGZA 2EV5A 2TCTA 1ZBE3 3RQ4A 2OPKA 2G9FA 1V3FA 2QQVA 3F23A 4EGZA 2HWF3 3B00A 1W5CC 1UCXA 5BNQA 1JZ4A 3NV4A 3VDXA 1MMNA 1TMF1 2VZ3A 1O3SA 5JI7A 2OA4A 4RFT0 2VGDA 3T08A 1V6LA 3HRSA 3IBMA 4ESFA 1ACIA 2R49A 3IV5A 5FAXA 1H9GA 3ERED 2ZGUA 4UF0A 3RS6A 2M9HA 2R7UA 1Z3XA 2R7WA 3RYRA 4UUSA 4HVRA 5T5LA 1KEXA 4JGYC 3IUOA 2VC1A 3HOBA 4L9JA 4M3CF 1FAYA 2CG4A 4HNVA 2EB7A 2ZSIB 4A5NA 1JT6A 1JI6A 1S4CA 1SFOJ 1SMYF 5IPAA 4BDYA 4ON0A 1G3WA 3UV9A 3HWJA 3M3YJ 2MLGA 1POGA 5FZ9A 2P37A 4D7SA 1UD1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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