2Q1ZB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
193
structure length
185
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRQIADPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
molecule keywords RpoE, ECF SigE
total genus 36
structure length 185
sequence length 193
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2q1zB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2q1zB02
4RD7A 4ZU7A 1CAVA 1ZZ8A 3PNAA 4I02A 2OZJA 1J59A 1RGSA 3VHRA 4Q0QA 2ET1A 1XRUA 4IEVA 2GC3A 1YLLA 1CAXA 5I0TA 2GC2A 4IERA 4EWAA 2HJIA 3E6DA 4Q0PA 2CV6A 3N4MA 4PIZA 3CL1A 4XFIA 3BU7A 5CVRA 2QNKA 5I93A 4XFHA 3MYXA 4KWLA 1ZRRA 4IETA 4AQ2A 1ZZ6A 4AVCA 5FCCA 4DINB 3ES1A 3WW1A 1ZZCA 2MHFA 3NSTA 5I8SA 4MZUA 5KHGA 2BEOA 2CAVA 2IXIA 4KU7A 4P9GA 3NL1A 4WZCA 4ONUA 3RYKA 2ZCWA 2PTMA 5I0UA 4H7LA 4IEXA 3HT2A 3E6CC 3D0JA 1O5LA 1SQ4A 4BIFA 2FMYA 2UY9A 5J3UA 3D0SA 4Q0SA 1YFUA 1ZZBA 1ZREA 1RTVA 2QVSB 1OI6A 4IEQA 5CADA 1YWKA 3ELNA 3CLPA 2MPFA 3OCPA 1Y3TA 4J1XA 4BYYA 3L2HA 3LA2A 3LOIA 4LA2A 1X8EA 4LTAA 5EFUA 4L11A 4LA3A 2BNNA 3U0ZA 2EVXA 3HUGB 2GH2A 2OPKA 1ZZ9A 3WW3A 1CAWA 1EP0A 3TNQA 1HW5A 1YUDA 4NVPA 2UYAA 3EO6A 1WA4A 3M70A 2PFWA 4QMAA 4LULA 3I59B 5JSOA 2C0ZA 4QGNA 5I0RA 4Q29A 2Q0AA 3IDCB 4LUMA 5LEKA 2H6BA 3H1YA 2BNMA 4K8FA 4F8AA 4R52A 1SFNA 5JAXA 2MNGA 2Q4SA 5C8WA 2XLFA 5JSRA 4TLFA 1WGPA 2IC1A 1GQGA 3GYDA 1CAVB 4AXOA 3MZHA 1LR5A 4YRDA 1FT9A 3FJSA 3O14A 4J1WA 1J3PA 1DZTA 4XF0A 2D5FA 2PQQA 3KMHA 2GZWA 4HVRA 3FZ3A 1ZVFA 3H3UA 5LRRA 1CAXB 3SMHA 1X8MA 4B29A 4L2NA 4YSFA 1J3RA 5J7MA 5AVPA 5FLJA 3H3ZA 2ZKLA 5FQ0B 4HSJA 3OF1A 4ORFA 2H0VA 4IEYA 5BV6A 3OGJA 4UBHA 4QM9A 1IPJA 5FLIA 3EBRA 3TNPB 2UY8A 3G7DA 1RL3A 3RPQA 4PIXA 2D93A 4N9HA 3ROUA 3H9AA 2I45A 1EYBA 3LAGA 3ZDSA 3PLQA 2XHKA 4FBFA 3KGLA 1O3QA 1UPIA 1ZRFA 1O5UA 3U10A 1EPZA 2D5HA 3QACA 1YFWA 5HI0A 2PAKA 4XF3A 4HBNA 4XFFA 1J1LA 3DN7A 1ZNPA 1Q3EA 2HKXA 1WLTA 4HLTA 3IIAA 4YNIA 3BPZA 1NZCA 4KWKA 1RC6A 2PHDA 3C3VA 3CEWA 1Q5OA 2Y0OA 2Z69A 5EZWA 4MGYE 4O9GA 3HT1A 4I2OA 4I3PA 1V70A 1OFNA 1OMIA 3USSA 2BGCA 2KXLA 1CAWB 4HVOA 4AQ6A 4PIYA 2CAUA 1H1MA 1VR3A 1QXJA 3FX3A 2XLAA 3OTFA 4XFCA 2CGPA 5JR7B 4OLLA 2UYBA 3E97A 4KU8A 5D1IA 1CAUA 4MGZE 3OD0A 3S0MA 5F1RA 5BPXA 4XETA 3EJKA 4HN0A 4MH0E 3RDIA 1DGWA 2N7GA 5CU1A 1SEFA 4MGKE 5E16A 4HVQA 2DCTA 3IWZA 3UKTA 2O8QA 3B02A 4QGLA 5JSPA 4XFBA 2IXHA 5BUVA 1VP6A 1NYWA 2IXJA 2PA7A 3SCFA 2Q1ZB 4IEUA 2D40A 4HMZA 4O9EA 3SXWA 5I0SA 3IBMA 3E5QA 3UKNA 3R6SA 3NJZA 3FE5A 4XFAA 3EHKA 4JV4A 3CJXA 3DV8A 4JVAA 4N9IA 4AVBA 2PAMA 1CGPA 1TQ5A 1YFYA 4MX3A 1O3RA 4MUVA 4A2UA 2B8MA 4QM8A 2K0GA 5KHKA 3LWCA 4FAGA 2VPVA 3WW2A 1CX4A 2BNOA 4D7SA 2FQPA 4MGIE 3S7IA 3E5XA 1U12A 1J3QA 4LUKA 3H50A 2K9ZA 3HIFA 2XGXA 2XKPA 1IPKA 2IXLA 1G6NA 3KSCA 2PYTA 5FPXA 4NQWB 2PAEA 4ZU4A 2ET7A 3GBFA 5BXXA 1OD5A 5C6CA 1O4TA 2EAAA 4EROA 1UCXA 2XL9A 4YARA 3EQEA 4HN1A 4LLOA 5LRSA 1O7FA 1X82A 4E2QA 4EWDA 2GU9A 4HZFA 1VJ2A 3RNSA 4ZU5A 1ZRDA 1FI2A 3D82A 4MV2A 5KHJA 1L3JA 5E1RA 3LA3A 3MPBA 2O1QA 3KCCA 3RYRA 1QWRA 4OFGA 2GC1A 1UIKA 2GC0A 2V09A 4GULA 4E2SA 2XL7A 1RUNA 2ATFA 4KWJA 1O3TA 2BYVE 5I91A 4KL1A 1UW8A 5BY5A 4EWEA 1PMIA 2WFPA 3NW4A 3BALA 3QOPA 4YYOA 3I54A 4Q0VA 1ZRCA 4UXAA 3KGZA 1XE7A 5KHHA 5JCTA 5K8SA 3FWEA 3M3IA 4I09A 1GQHA 4I0AA 3ES4A 3H7JA 5FQ0A 4Q0UA 2IXCA 3ST7A 1DZRA 1UD1A 3HQXA 2OA2A 1UIJA 2QCSB 2B5HA 3NVCA 5I8TA 4AVAA 3LA7A 4IESA 4IEOA 3BCWA 1J58A 1QXRA 3MDPA 3CF6E 4UBGA 2WC2A 4E2GA 1O3SA 2XKOA 4CYDA 3LZZA 4Z07A 3H7YA 3S7EA 4XEZA 4IEWA 1X7NA 3H8UA 4JTOA 4QX5A 3I7DA 3PVBB 2XLGA 5FPZA 2VECA 4XFGA 1I6XA 4D7TA 2ETEA 4LEJA 2Z2SB 2E9QA 4WBBA 3ETQA 4FAHA 2PHLA 3FFQA 2EA7A 5KBFA 4R8HA 2F4PA 3ACLA 3UKVA 5T3NA 3H1WA 4META 3RYPA 3SCGA 4EV0A 2QDRA 4BHPA 1Y9QA 1LKNA 4HSLA 4QXKA 3WW4A 2P17A 1I5ZA 4Z82A 4X6RB 3U11A 4IEPA 3SCHA 4FT8A 3BB6A 5I8YA 1QY4A 1XE8A 5FLHA 2OZ6A 4F7ZA 2GAUA 5J48A 1YHFA 2QJVA 4QGMA 2OYZA 4I0BA 1JUHA 1FXZA 3JZVA 4I01A 4XF4A 3H1MA 2H6CA 4IEZA 5LEJA 4XF1A 1NE6A 1NE4A 1NXMA 1RUOA 1Q43A 4XF9A 4BH9A 2VQAA 1PM7A 3E6BA 1CAUB 3DL3A 3NKTA 1LRHA 4X6QB 1H1IA 4WVZA 3I59A 3DKWA 3IDBB 1ZX5A 2B9UA 2Q30A 3RZZA 1DGRA 4PJYA 3E5UA 1LB2A 1EY2A 3CO2A 1ZZ7A 4JTNA 3SHRA 5KHIA 2IXKA 5FDBA 3FHIB 1YFXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1R5ID 1GP5A 2HWC2 1MZ5A 2B45X 3ILNA 3IH4A 3SFZA 2E1CA 1YYNA 2OZJA 3L00A 3VZOA 5FY5A 1W6QB 1JTZX 3C7HA 3TDZC 3M3CA 4HXCA 2RNJA 2XAQA 1J9IA 2LW8A 4Q0PA 3UGHA 2CL2A 2XJSA 1AOYA 4PIZA 3RZKA 2VB6A 4NC6A 4XFHA 3T4HB 3BR2A 2IGOA 2PN5A 1S2BA 5JMCA 3QWLA 4A5MA 1OLTA 2XF7A 4Q4ZF 3MV11 2BEOA 3U75A 1QZYA 3O8GA 3D5OA 4P9GA 5JZGC 5ABJB 4HQMA 4KG0A 1YEWA 5FYSA 2FMYA 4Z1VA 1FP1D 4D5CA 2XAUA 1YQ5A 2LY1A 4LK0F 2DTWA 1IS3A 2WA4A 2GMPA 4COYA 1W0PA 2AH2A 1G9AA 3TWIA 1QZEA 2Y6FA 2CHHA 4DXZA 2D6PA 1H8VA 2VXDA 4ZS3A 2DPUA 2QSGX 3EO6A 3MMYB 2DUQA 3T09A 3BTLA 4Q26A 3OYHA 2OS2A 2Q0AA 3WVJA 1R081 3ZN6A 2V4JC 3F6VA 4CE8A 3HVDA 1OKOA 5ILUA 2RNGA 4XICA 5EYXA 2ZGRA 3SISA 4QX2A 3W2AA 4ESJA 5J1YA 2WWYA 4BE1A 2PQQA 2QLZA 4TWTA 5C4WA 3GTOJ 1UMHA 3SMHA 5A3MA 3GTPJ 3S32A 1CR7A 5J7MA 5TISC 4JGYC 1Q8VA 2VBWA 2H94A 4D6RA 1CF7A 1OYWA 1WUVA 3BTJA 1C57A 2XHNA 3G7DA 4Y5SA 2NYXA 2R7XA 5FRAA 4PJJA 1XB4A 2JVGA 3L2UA 1VBD3 3ABKH 4WZFA 4A5NA 2I5UA 4QB2A 4KISA 4XF3A 4YWAA 2XH6A 1F4HA 1W6NA 2NN8A 3BR6A 3H0DA 2JJ7A 1C8NA 4BXFA 1NZCA 2OTLI 3F8FA 5FFOC 5JOYA 4I2OA 2W57A 4EN8B 2WIIB 1UYZA 4GB31 1UX7A 4KNCA 1DQ1A 3JUUA 3TN92 2DURA 2R061 3JRGA 1PNFA 5CBLA 1N75A 2HDDA 4M74A 4XBQA 5IHRA 2VG9A 4YGCA 2MGQA 1L7RA 1R4NB 2EA2A 3C7GA 3IWZA 1QJX1 4RB1A 4TYSA 1AR92 1NYWA 1D5VA 4C2TA 2OW4A 1NG0A 5F2WA 2DO7A 4HMZA 2A5YB 1G3YA 5AFBA 5CFCC 3ZFEA 1UG2A 1PMHX 1B6AA 1ZRIA 5K9YA 1RUI1 2C24A 3CJXA 1ENHA 4N9IA 3DYOA 1YS6A 5C5TA 4AGGA 2WLQA 4MUVA 3A22A 1AA7A 9ANTA 3DCQA 5C3QA 4G9SB 2HVRA 5ISLA 1TME1 3AZYA 4GAZA 1D1AA 4JHTA 2P5BA 2Z5UA 2F4MB 1QNYA 1KJRA 3IKVA 3KD4A 4GYGA 1REPC 3LF7A 3I97A 1I50J 1G6NA 1KFUL 3KSCA 4NROA 2F4LA 2ZMEA 5JXGA 1O4TA 2P7CB 1MZ6A 4O7XA 1UCXA 2K9NA 2NRAC 4BISA 3WTWC 2WB1N 2Y2ZA 2FNPA 4B4PA 1KFXL 1QPIA 2VXJA 3I49A 1IQDC 2WO2A 1XE0A 1KQ9A 5FTTC 1KDMA 1N3QA 3T4VA 1TTYA 2BYVE 4EYUA 2HXIA 3GVAA 1XDSA 2DT6A 3JRAA 1WBFA 2RVCA 5BY5A 4URTA 1N3PA 3DFGA 1MZEA 2ILMA 1IDYA 4YRVA 1KDKA 1MZFA 1JYTA 1TW3A 4AVVA 4AFMA 1YYVA 5KHHA 1MPXA 4AE2A 5JLVA 5ICCA 2GP3A 1X1BA 4M3CE 1NA1A 1DQ5A 1BOBA 2NLRA 1O8PA 4Q0UA 3TN93 2IXCA 1T33A 3NVCA 2VUDA 5ACA2 1RC9A 2VU9A 4RHV2 2DYSH 3CJTB 2O0OA 3F9KA 2M5WA 4YW4A 5FZIA 3HD8B 5HLGA 4A3IJ 2W9XA 4CYDA 4CRQA 1P4WA 2DUPA 1AR93 3HGYA 3WF2A 4XLCA 3S5QA 1WW7A 1STMA 5AIPA 3GHMA 3QQAA 3DXUA 5CIRA 3ZSEA 1WFXA 3T0YA 1TW2A 5D6FA 2ELHA 4PFOA 3KM5A 3S15J 2JVHA 1Y6IA 3JW4A 3TO6A 2RM21 1N78A 1UWWA 2DT5A 2R0FA 3QODA 5C4WC 2ZX3A 1ONVA 4QKBA 1LKNA 2GDFA 2LLKA 1FBQA 3K3OA 2WV0A 2R49A 4OIOF 1XE8A 3KP6A 1FMD1 1FOYA 1O6UA 5J48A 1H89C 1ACCA 2PHUA 4DJAA 2VNVA 2AR6A 3GCMA 2WJSA 5DM6F 2ZEYA 2L3DA 3P3PA 3WG9A 2M2EA 4X6QB 4PK4A 4LBNA 1SFUA 3BIWE 2LDUA 3ILFA 4LHNA 1E3HA 1NQJA 2AYHA 5DN2A 3N9QA 4P1WA 3ZXAC 2Q8DA 2JDMA 2V72A 3FHIB 4YM2A 4I98B 1GP4A 1C1FA 4FQ4A 3PNAA 2E51A 3PM1A 3LSJA 3L2VA 3VHRA 2P6HA 5EP9A 3MAJA 4CEWB 4IHSA 1QBJA 5C3SA 2OT7A 2HJIA 3NV3A 5GKAC 2YS9A 3WNLA 2VMCA 4OCTA 3CL1A 5BNQA 2WNUB 4L9NA 4DOZA 4IETA 3LGRA 3PHMA 3KP2A 5I8SA 4Y1ZA 5HODA 1WMEA 3LPFA 3CCSI 2B39A 2IXIA 5FY8A 2XWBB 3ZLIA 4ENJA 1GOHA 2Y6JA 3E6CC 3D3AA 3OOXA 2HQ5A 5ACA3 3ZFEC 2JWTA 3VDDA 5BNPA 3FIWA 4IEQA 5JLXA 1AX1A 1AUYA 3GGLA 4XZPA 1UQXA 2JUCA 4ZDLA 1MBHA 3GTQJ 3S30A 1XCVA 3O1UA 3ZMVA 3NWKA 3DWLE 1FZPB 2NYYA 1Q8OA 2VE8A 1JN2P 3NRVA 3LL7A 1VRH2 3N9MA 2D7FA 2JA8J 2K4JA 4W6XA 4HV6A 2QQPA 2WYSA 2ZMEC 5A1LA 4LUMA 2EB7A 4QPIB 1SFNA 3W6VA 2V6EA 1YJLA 1IS6A 1VAVA 1QJU2 3GYDA 4AXOA 5EV7A 4C0HA 4IV1B 2ZHNA 3I2HA 5FKCA 2WL1A 3CO6C 5BPIA 1YOVB 2MC3A 3F22A 3WF1A 4BZ4A 2ME6A 4P9YA 3H3ZA 4BPZA 1IHMA 1NT0A 4AHWA 3EUAA 2ZGOA 2HQRA 3W6JB 1JYVA 2K3PA 5IW0A 2W46A 2JRMA 5E3OA 2E53A 4LG0B 3VL8A 4YFWA 4GGGA 5B4XA 1K61A 2XHKA 4Q4W3 1MMGA 2VOOA 3ZXDA 1BK0A 3H3LA 1NA1C 2R6QA 4XFFA 3W9AA 1YG2A 3SEEA 4CXWA 2HKXA 1PVC3 2IP2A 2P3JA 3ZYGA 1RKWA 4LD5A 4NHMA 5HPOA 2YUEA 3C3VA 4MNUA 3C8XA 5F8PA 2E2JJ 4CP1A 3KZZA 3BOPA 4I3PA 1WPKA 5L3CA 2MG4A 1RUE1 3MW3A 1ND2B 5IP6A 3OEBA 4MO3M 3A0KA 4HVOA 4XUPA 2IWGB 2VMGA 1XX5A 3AL5A 4QQHA 2G9FA 4AIHA 3OTFA 3TBDA 1IW7F 3A0HC 1CVNA 1OVSA 3OPTA 4Q4V3 3UL2A 2Y69H 1JU4A 1Y56A 4CU9A 4XM3A 4YW3A 1G7YA 4HVQA 2Z99A 1RB8G 3Q8FA 3V0AB 1W0NA 2BW3A 3ZFGB 2XVCA 1HDDC 4HW0A 2XF5A 1GSLA 5HDNA 3H42B 4FPJA 3H9GA 2WT0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RD7 A;  4ZU7 A;  1CAV A;  1ZZ8 A;  3PNA A;  4I02 A;  2OZJ A;  1J59 A;  1RGS A;  3VHR A;  4Q0Q A;  2ET1 A;  1XRU A;  4IEV A;  2GC3 A;  1YLL A;  1CAX A;  5I0T A;  2GC2 A;  4IER A;  4EWA A;  2HJI A;  3E6D A;  4Q0P A;  2CV6 A;  3N4M A;  4PIZ A;  3CL1 A;  4XFI A;  3BU7 A;  5CVR A;  2QNK A;  5I93 A;  4XFH A;  3MYX A;  4KWL A;  1ZRR A;  4IET A;  4AQ2 A;  1ZZ6 A;  4AVC A;  5FCC A;  4DIN B;  3ES1 A;  3WW1 A;  1ZZC A;  2MHF A;  3NST A;  5I8S A;  4MZU A;  5KHG A;  2BEO A;  2CAV A;  2IXI A;  4KU7 A;  4P9G A;  3NL1 A;  4WZC A;  4ONU A;  3RYK A;  2ZCW A;  2PTM A;  5I0U A;  4H7L A;  4IEX A;  3HT2 A;  3E6C C;  3D0J A;  1O5L A;  1SQ4 A;  4BIF A;  2FMY A;  2UY9 A;  5J3U A;  3D0S A;  4Q0S A;  1YFU A;  1ZZB A;  1ZRE A;  1RTV A;  2QVS B;  1OI6 A;  4IEQ A;  5CAD A;  1YWK A;  3ELN A;  3CLP A;  2MPF A;  3OCP A;  1Y3T A;  4J1X A;  4BYY A;  3L2H A;  3LA2 A;  3LOI A;  4LA2 A;  1X8E A;  4LTA A;  5EFU A;  4L11 A;  4LA3 A;  2BNN A;  3U0Z A;  2EVX A;  3HUG B;  2GH2 A;  2OPK A;  1ZZ9 A;  3WW3 A;  1CAW A;  1EP0 A;  3TNQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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