2Z2SB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
193
structure length
182
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRDPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RpoE, ECF SigE
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 40
structure length 182
sequence length 193
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2z2sB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2z2sB02
4HSJA 1XRUA 2PFWA 1Q43A 3QOPA 1ZRRA 1DGRA 2ET7A 3E97A 1LR5A 2Q30A 3L2HA 4MGIE 2WC2A 4QM8A 4JTNA 4HVOA 3ROUA 4Q29A 1ZVFA 4HMZA 1J58A 2QCSB 1ZNPA 3EBRA 4IERA 4LUKA 2OYZA 4D7TA 4YARA 4I0AA 5FQ0B 3LWCA 3ES4A 5FPXA 3RYKA 3H1YA 1YFUA 5F1RA 5JR7B 1LB2A 4XF3A 2GC0A 1ZZ8A 4YNIA 4A2UA 4BHPA 3B02A 1DZRA 3EHKA 1YUDA 3DN7A 4I2OA 1CAUA 4I09A 4AXOA 5T3NA 4EWDA 2B8MA 2XLFA 4MX3A 1EPZA 4LA2A 1RUOA 1ZREA 3I59B 3SMHA 4FBFA 1J3QA 1ZZCA 4I01A 1FXZA 2PAKA 3CF6E 5CVRA 5KBFA 1G6NA 4KU8A 1CAXA 4IEOA 2PA7A 4D7SA 5C8WA 3IIAA 2N7GA 4E2SA 4HLTA 4ONUA 3UKVA 4I0BA 3E6CC 3C3VA 4O9GA 5BXXA 3E5XA 3JZVA 5C6CA 3CLPA 2XKPA 1U12A 1RGSA 3SHRA 4NVPA 2UY8A 1UD1A 3RZZA 1WA4A 5E1RA 3H1WA 2EAAA 2OZ6A 4Q0UA 3OGJA 2F4PA 4XF9A 4YSFA 3WW4A 1Q5OA 3H9AA 4R52A 2QNKA 4ZU7A 4MGZE 4FAGA 5CADA 2IXJA 5JSOA 2GC2A 1CAWA 3PLQA 3U11A 1YFXA 2D40A 3FFQA 3FZ3A 3G7DA 1SEFA 3SCGA 4AVCA 4H7LA 4KU7A 2IXKA 4UBHA 3LA7A 5BY5A 2H6BA 1FI2A 1Y9QA 2IC1A 4FT8A 4META 1QXRA 4R8HA 4XFIA 4J1XA 4JTOA 3HT2A 4P9GA 3HUGB 5K8SA 4AQ2A 5FDBA 3EO6A 3H8UA 4MGYE 4PJYA 5FLIA 3IWZA 1ZX5A 2H0VA 3H50A 1X82A 3FWEA 1CX4A 4I02A 1O3SA 4XFHA 2Y0OA 3RPQA 1VP6A 4BH9A 1I5ZA 2BNMA 3OCPA 4MGKE 4F7ZA 3KGZA 3E5UA 4DINB 4XEZA 1VJ2A 3IDBB 3WW1A 4PIZA 4IEZA 1O3RA 4K8FA 4L11A 4BYYA 3CEWA 1I6XA 4O9EA 5LEKA 3MDPA 3NW4A 2BGCA 3LZZA 4MZUA 3HIFA 3EJKA 1OMIA 3U10A 2BEOA 4UBGA 1CAVA 3HQXA 2V09A 2QJVA 4Q0VA 5J48A 3D82A 5FLHA 1CGPA 4L2NA 5FPZA 4ZU4A 2ETEA 1YWKA 2Z69A 3NL1A 2BYVE 4B29A 2Q1ZB 1YFWA 3GBFA 3OD0A 2OPKA 3MPBA 3M70A 4JV4A 1DZTA 5BPXA 3RDIA 1TQ5A 2XLAA 3N4MA 3RNSA 4HVQA 2GZWA 2UYBA 3I59A 2K0GA 4PIXA 3H7JA 5I8TA 3OTFA 3EQEA 4Q0QA 3R6SA 1QWRA 1X8EA 2XL7A 1UPIA 2E9QA 4HSLA 5I0SA 2Z2SB 4FAHA 1EY2A 2ZCWA 3CJXA 2Q4SA 5KHKA 1J3RA 3RYPA 2BNOA 3BCWA 3MYXA 3QACA 3KGLA 5FLJA 3U0ZA 1XE7A 3KSCA 4EWAA 2GC1A 3BPZA 1SFNA 2HKXA 2GU9A 2H6CA 2IXLA 4IEPA 2BNNA 1CAUB 1ZZ9A 2CAUA 5D1IA 5JCTA 5J7MA 1VR3A 2GAUA 5J3UA 3CO2A 3PVBB 1UCXA 3FE5A 3MZHA 3ELNA 1O3TA 2VQAA 2PHLA 3H3UA 4RD7A 4IEXA 4IEQA 3RYRA 4YRDA 4N9IA 3H1MA 3S0MA 1RTVA 1PMIA 3KMHA 3LOIA 4MUVA 5I8SA 4Z07A 3WW2A 1EP0A 1Q3EA 1H1IA 4IEWA 4EV0A 4LTAA 3PNAA 1IPKA 4LA3A 2I45A 5HI0A 2PAEA 4IESA 3UKNA 1ZRDA 3DV8A 1JUHA 5KHGA 1J1LA 3ST7A 3WW3A 3FJSA 4QX5A 1YFYA 1PM7A 5I91A 5KHHA 3BU7A 4OLLA 4XETA 3KCCA 1OFNA 1NZCA 5LRRA 1DGWA 4KWJA 3LA3A 4ORFA 2DCTA 5EFUA 1OI6A 2PYTA 2EVXA 1WLTA 4HN0A 5JAXA 5KHJA 4WVZA 4KWLA 2UY9A 4I3PA 5I93A 2Q0AA 3E6BA 3DKWA 3SXWA 2O1QA 2VECA 2PHDA 4XF0A 5FQ0A 2UYAA 1RL3A 1LRHA 4N9HA 3IBMA 2K9ZA 3TNQA 4Q0PA 4XFBA 2IXIA 3LAGA 2KXLA 2O8QA 3H7YA 1NYWA 4JVAA 4PIYA 2XLGA 2HJIA 4LLOA 4QXKA 3OF1A 3NJZA 5LRSA 4QMAA 2QDRA 2D93A 4LULA 2C0ZA 2XKOA 4MH0E 3D0SA 1O5UA 4X6QB 3ACLA 4E2GA 3FHIB 4IEVA 3H3ZA 2QVSB 1ZZ6A 4F8AA 5I8YA 3BB6A 1NE4A 2MNGA 1QY4A 1CAVB 1YHFA 4GULA 3HT1A 4KWKA 3TNPB 2FMYA 1EYBA 2B5HA 4QGNA 1H1MA 4QGMA 2CV6A 1V70A 2P17A 4XF1A 3ETQA 4OFGA 4EWEA 4AVAA 3LA2A 2IXHA 3E5QA 4XFFA 4HVRA 3VHRA 2XHKA 1RC6A 4J1WA 4AQ6A 4Q0SA 2PTMA 1IPJA 4BIFA 3SCHA 1O3QA 3GYDA 4E2QA 1O5LA 5BUVA 1O7FA 2FQPA 1ZRFA 5AVPA 2CGPA 5BV6A 4IEYA 4LEJA 4XFGA 3S7IA 2WFPA 3FX3A 4UXAA 4TLFA 1NXMA 1ZZ7A 1CAXB 4XF4A 1GQGA 1XE8A 3O14A 4QGLA 4WZCA 2MPFA 4HN1A 4IEUA 3NKTA 1OD5A 4XFCA 4EROA 5CU1A 2D5FA 1J59A 2PQQA 3ZDSA 4YYOA 4Z82A 5I0TA 5FCCA 1SQ4A 3E6DA 3USSA 5JSPA 4QM9A 2XGXA 1UIJA 1FT9A 1X7NA 3ES1A 3SCFA 3IDCB 4AVBA 4HBNA 1NE6A 4KL1A 2EA7A 5LEJA 1LKNA 2B9UA 1O4TA 3UKTA 2GH2A 1CAWB 2ATFA 3NVCA 1X8MA 5KHIA 3CL1A 1ZZBA 2OZJA 2PAMA 3I54A 2ZKLA 1WGPA 5I0UA 5JSRA 4LUMA 4MV2A 1YLLA 4X6RB 2OA2A 5I0RA 1Y3TA 1GQHA 3S7EA 4ZU5A 3I7DA 2VPVA 1HW5A 1QXJA 4XFAA 2ET1A 5E16A 5EZWA 1UIKA 2XL9A 2GC3A 2CAVA 2D5HA 1UW8A 4HZFA 3D0JA 1L3JA 2IXCA 3NSTA 1RUNA 1J3PA 3M3IA 4IETA 3DL3A 2MHFA 3BALA 4CYDA 1ZRCA 4WBBA 4NQWB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IAIA 3QOPA 1K12A 2HYJA 3I2GA 3LSJA 4RGUA 3L2HA 5HDGA 1OD3A 1LOEA 2Y64A 1U5ZA 2NS8A 2J1TA 5EHDA 2OYZA 4XUNA 4YZ3A 4I0AA 1JYNA 2R5ZB 1U9OA 4XILA 3MIFA 5C71A 1OHFA 2R16A 3B02A 1VALA 2WNUB 4M01A 2E1MC 2G9ZA 4EJWA 3GJBA 3FDYA 2HZTA 3W6JB 1ETQA 3N9QA 1Q56A 5IK8A 4LA2A 1LHNA 3WSOA 3JAMK 4S2GA 2QUOA 1J09A 5GAGJ 3SH3A 4I01A 1FXZA 3S30A 5CVRA 2UURA 1ZG3A 5FRAA 4QHBA 2VNGA 4IEOA 5JI7A 3ZYHA 2IVMA 4CU8A 5BNGA 1PGW2 3JCIA 2KPMA 1GFF2 3CMYA 1JOPA 1XSRA 1V0AA 5HOOA 5BXXA 1MDMB 3JZVA 3T08A 2CY6A 1E0EA 2EIMH 2W57A 3E1SA 4UFKA 2QZ8A 2VOWA 5FPUA 2F6BA 2YSRA 3VZKA 2XIGA 2KT0A 1USTA 4IRIA 4BQYA 2B46X 1JZ6A 2X8KA 4QPIA 3H8XA 4L5JA 3FUOA 2OAZA 3AFGA 3T1MA 4FFIA 2ZXHA 1H9PA 3GBGA 1W7PD 4ESJA 5TSWA 4ZU7A 2Y38A 3IAPA 4JGYC 4MEXF 1AR63 2ZSHB 4ZDPA 2QM3A 4K21A 1DP3A 3SCGA 4COUA 2WZR3 2OBPA 1AYN1 4AAPA 2DTWA 2JG9C 1OPCA 1SVLA 4FPHA 1WWYA 1I3HA 4P9GA 3BTJA 1ZBA1 3HUGB 3MV11 3D6EA 4D69A 4RGKA 1B72B 3KS7A 3GX4X 2HOSA 4B09A 4DINB 1WLCA 3U9GA 3O12A 2BFUS 2QZ3A 2ISYA 2PFBA 4XHXA 1VIWB 3CIHA 3EJKA 1HW1A 1RXFA 3HRUA 3Q0UA 3HPHA 2JE8A 3ZN6A 4Q0VA 4Q4V3 2ERFA 4AE2A 3ZMTA 3VBSC 2Z69A 2HU9A 4UT5A 3V42A 2YC0A 1VBC3 1HJGA 3VB2A 2XONA 1C3HA 1S7OA 1DZTA 1WBLA 1D4M1 1QJFA 1AWCA 4ET7A 4HVQA 2R32A 4LLNA 1RUC3 1H2MA 3T4VA 5C33A 4RS8A 3PFIA 1QJY3 1UAAA 4OHXA 2X5IA 1BEV3 4F93B 2D1VA 3RKYA 1ENXA 3I2OA 3V64A 4MGQA 3CP8A 2F4LA 5A32A 3QACA 3KGLA 1ZTRA 4ZYGA 4FP2A 1UMIA 2ZABA 1SFNA 1K4TA 2HKXA 4PJNA 2IXLA 4WF2A 3CQOA 2XMLA 2CAUA 3P1IA 1MS3A 1R1VA 1V4RA 1AR71 3K48A 1RITA 1H88C 3AYCA 3VZLA 4N90A 2JSCA 3H3UA 1JGGA 3AZVA 4M9XA 3KYLA 3FUQA 3PU3A 2X10A 3SFZA 4MOAA 3LGRA 1NA1B 4L5EA 3I2HA 3S1MJ 4WV8A 1GKBA 4Q26A 3VKOA 4HF0A 4LHKA 2QQNA 1RJ8A 4QT6A 3BT9A 2WAFA 1ULGA 3MW3A 4M3BA 5J09A 3HNYM 2OQGA 4GH4C 2VQ0A 2ZGSA 1IUYA 4GWIA 3AB0A 2KP6A 2QKDA 2ZNZA 1IAWA 1DGWA 2PLV2 3I8TA 3CMAI 2YC4A 4P08A 2DFEA 2VOXA 2Y6KA 2VKHA 2UYAA 4UXNA 5JPMB 2E2IJ 1VAMA 1A78A 4FTSA 3P3NA 1WW5A 3PFYA 1W0OA 3DLAA 4G7ZF 4QPGA 1EH6A 3ZIWA 5IP9J 2YX7A 2YB7A 4OZOA 1G9BA 1ONAA 5HBAA 1DG6A 5A1LA 5LRSA 2JKBA 4AUXA 2Z9OA 4N7UA 4QXHA 1OLTA 3HTSB 3PIOF 4OMCA 2A05A 2C0ZA 1FOWA 1W8NA 1Y4WA 3BR0A 2O9LA 4AOCA 2M7BA 3L9FA 2IPQX 2L5QA 4PCQA 1XN7A 1QF3A 2FZ2A 2M30A 3K10A 5FYUA 1Z6RA 3NAPC 1IS6A 2P5LC 1UXXX 1MDMA 4MSVA 4XMYA 1ETOA 2VBYA 1CQTA 1DQ6A 4WVVA 4XUOA 2OQ6A 4X6AJ 2ZGRA 2HEVF 1VBA3 2K9SA 2HGCA 2WO2A 1O7FA 4PT6A 3EUKL 2IVIB 2PI0A 2BVLA 3VEPA 2E7WA 2R7WA 2V72A 5JR2A 3LL7A 1HX6A 1SDDB 1DF0A 1OLMA 5JZGB 5FYCA 5B5EC 1W8TA 3HWJA 2WO1A 1FNYA 3EYIA 2FNAA 2FRHA 4BJTA 1CZVA 2FDGA 1GBGA 2COBA 3MPPG 4YYOA 4OMZA 4UV8A 1BI1A 1UOBA 4LLLA 2KIQA 3WZ1A 3KVAA 4M3CB 3SCFA 4W1UA 4A4AA 3LSKA 1B72A 2QQVA 1PGL2 5D8AC 1FBUA 2GBYA 2GOXB 4G3YC 2RAEA 1S5LC 5HLIA 1UJ8A 1LDKB 1HKTA 1E3OC 1HRI3 1PVC1 2WQ4A 3CL1A 2LROA 3ZMZA 4EATA 5GTIC 2VMGA 2G9FA 4FPLA 4LJZF 1SMVA 5LY2A 4A3BJ 1SVOA 5ACA1 3K75B 4URTA 1HW5A 5CQEA 2EV5A 2GC3A 2A73B 1P92A 2UUZA 3ZIXA 4YFZA 2Y0SA 4U36A 2XGDA 3BIEA 5E18F 4BCUA 4A3KJ 4NQWB 1LULA 5K0UC 3R0JA 2GDFA 2WC2A 2CNAA 1WLWA 1C5HA 2BVBA 4IERA 4D7TA 5KC6A 4HRIA 1O4YA 1REFA 4U87A 3RYKA 2E7XA 4Y13A 4COWA 4ZONA 4I0WB 1BC7C 1B4AA 2R7OA 4Y26A 3FXJA 1MH4A 3DN7A 2QE3A 5D21A 2NMNA 3VYUB 4YWAA 4A7YA 4Y7NJ 3VOEA 3FLRA 4G7HF 1BKZA 2PAKA 1Y0NA 5B4NA 3G1LA 5FO5A 4FX0A 3ZGKA 1XCVA 1CAXA 4DFSA 1QVTA 2N7GA 1HKSA 4LNVA 3MLKA 3E6CC 1IV6A 1PYVA 4ZYHA 3ERED 5FKOA 2JG8B 3CLPA 4LK1F 5CA6A 2CH0A 3RZZA 4NBQA 4RB0A 1NG0A 1QPMA 1T0FC 2W3JA 1FMVA 1W9FA 1M4WA 4UHTA 3LSTA 2BP6A 4Y3OA 5IP6A 2WSVA 4EJOA 4WK8F 4LKFA 4ES8A 4G9YA 2Q8DA 1OR7C 2XR4A 5BY5A 5JPNB 3I56I 2E2HJ 5IAVA 1YHQI 2WN3A 2JX9A 3ZMDA 4PCRA 3I0TA 4E9KA 3PNYA 5J6XA 1R092 4I6ZA 1G86A 1WH7A 2VZ3A 4IRHA 3OYIA 4HQEA 1PK6B 3RPQA 4DEQA 3ZXFA 1C28A 2DO7A 2RNGA 3F3XA 3PSIA 4HNVA 1VQNI 1TME2 4A44A 2D3SA 3S6PA 5L7OB 1ZGJA 5F0HA 5CG9A 2CW0F 4FTHA 5FLHA 1W9TA 3CDIA 2ETEA 3HTUA 2ID3A 2BYVE 5LGUA 5E79C 2P6HA 1VQLI 3L2UA 1NTCA 1OQYA 1TQ5A 4P14A 5DABA 3WDXA 3PSFA 1H9WA 3M3QA 2UYBA 3ZQ7A 4XBFA 3LSPA 4LB6B 3HOVJ 3EQEA 5FZMA 2R0HA 3MN2A 3WF2A 2VT2A 1WMXA 2ENRA 4H4KC 1LVKA 2P6SA 2B42B 3MVPA 4A42A 4RMNA 1WW6A 2A3YA 3CJIB 5FZBA 1BBT1 2ZA9A 1R1A3 1O7LA 1FIAA 3P9IA 4A3DJ 2CYFA 2VC9A 3GDBA 2X4HA 3CO2A 3WP6A 4K9SA 1OF3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2B7Y A;  3QOP A;  2GH8 A;  1ZRR A;  1DGR A;  3D4K A;  3CJR B;  3L2H A;  5BNQ A;  1X1C A;  1LOE A;  1U5Z A;  4LIT A;  2WFF 1;  1B09 A;  1AJK A;  1R09 3;  2QCS B;  1ZNP A;  4LBO A;  4AVT A;  5JI9 A;  4C30 A;  3PVN A;  1DQU A;  2OYZ A;  1UMZ A;  3ZXK A;  3K70 D;  4YZ3 A;  4YVW A;  1TME 1;  4I0A A;  3SNM A;  2BFU L;  2ZPX A;  1S0F A;  5GKA C;  1PO2 3;  3CNA A;  1BBT 2;  3USU B;  4AQS A;  2R7X A;  4CEY B;  4F3J A;  4XIL A;  3ENR A;  2GC0 A;  3MIF A;  2DVF A;  4A2U A;  1OHF A;  2R16 A;  4CP0 A;  3B02 A;  1VAL A;  4LG3 A;  4TSV A;  1RUH 3;  2WNU B;  3EHK A;  4M01 A;  2YXS A;  2E1M C;  3OIQ A;  1QJX 1;  3OY8 B;  2QZ2 A;  4NHK A;  1APN A;  4AXO A;  1F5J A;  3FDY A;  4FXK B;  4SBV A;  4EWD A;  3WCR A;  3BCA A;  2LM3 A;  3ILR A;  4BGD A;  2HWE 3;  1ULE A;  1JYI A;  1Q56 A;  3JBG 2;  4AHZ A;  5IK8 A;  3PNT A;  4LA2 A;  1LHN A;  1R1A 1;  1SLC A;  2QUO A;  1J09 A;  4S2G A;  2OUH A;  3SH3 A;  4I01 A;  1FXZ A;  3M8J A;  3S30 A;  5CVR A;  2UUR A;  5FRA A;  4QHB A;  5JZG A;  2VNG A;  1MVQ A;  4IEO A;  3J4U H; 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