2Z2SB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
193
structure length
182
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRDPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RpoE, ECF SigE
total genus 40
structure length 182
sequence length 193
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2z2sB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2z2sB02
3H8UA 1J3QA 2EAAA 4ORFA 1YFXA 1PMIA 2PAKA 5KHGA 3BPZA 1DGRA 3UKVA 2GZWA 2XHKA 1J59A 2QVSB 4R52A 3H3UA 4P9GA 5KHKA 2OZJA 1J3RA 3IDCB 4F8AA 3FJSA 4EROA 3H9AA 5JSOA 1Q5OA 4AQ6A 1X82A 5I8SA 4XF3A 1CAUB 1ZZ6A 4R8HA 3UKTA 3FHIB 5F1RA 1QWRA 1I5ZA 4QMAA 4YSFA 5E1RA 4XF1A 4QXKA 3RNSA 1XE7A 2CAVA 2GC1A 4YNIA 1OMIA 2BNMA 2IXKA 3MYXA 3E6DA 3RYKA 4ZU5A 2BGCA 3GYDA 5I0TA 1CGPA 3NW4A 1CAVB 4YARA 4NQWB 2Z69A 3PNAA 3D0JA 5KBFA 1EP0A 2VPVA 2WC2A 5C8WA 1YUDA 3H1WA 4AVAA 4JVAA 2P17A 5D1IA 3HIFA 3OTFA 1Q3EA 1O3QA 2E9QA 2PHDA 4QGMA 3WW4A 5BUVA 1CAWB 5JSRA 2D5HA 1OD5A 4BH9A 1O3RA 1ZVFA 1HW5A 3GBFA 4I0BA 3R6SA 1Y9QA 3OCPA 2UY9A 2IC1A 4MZUA 4WVZA 1CAXB 2QDRA 3ACLA 4AQ2A 4IEXA 2XLGA 1QXRA 3RDIA 2ETEA 5CADA 2HKXA 3RYPA 4META 3LAGA 5BV6A 3H1MA 1UD1A 4LUMA 4XFAA 2BNOA 3SCGA 4RD7A 4KU7A 1ZRDA 1NZCA 1LRHA 2B9UA 4I2OA 3FFQA 4XF0A 1X8MA 3CLPA 1DGWA 1YLLA 4Q0PA 2Q1ZB 5FCCA 3LOIA 2UYBA 4EV0A 1H1IA 3WW3A 1ZRRA 1NE6A 3MPBA 1LB2A 3CO2A 5FPXA 3DKWA 3DV8A 3QOPA 5I91A 2QJVA 4MX3A 4I3PA 2XL9A 2GU9A 3IDBB 4F7ZA 1O5LA 3RYRA 5JR7B 2N7GA 1Q43A 1VR3A 5E16A 3USSA 3D82A 1RUNA 1PM7A 4LEJA 4GULA 4MV2A 3M70A 2IXLA 4IEYA 5BY5A 1ZRCA 5KHIA 4E2QA 4XF9A 1FT9A 3KCCA 3NSTA 5FLJA 2CGPA 2MHFA 4IEZA 3E5UA 4XF4A 4HZFA 4BIFA 3ROUA 3OGJA 1IPKA 1CAWA 3HQXA 4OLLA 1L3JA 1NYWA 1O4TA 2BEOA 3H50A 4HSLA 3ES1A 2H6BA 1UPIA 2Q30A 1ZX5A 4BYYA 2FQPA 3U11A 4LTAA 4EWEA 2PYTA 4I09A 2XLAA 4PIXA 1SEFA 1CAXA 3LA7A 3NVCA 5I0SA 3U10A 2MPFA 2V09A 4CYDA 5JSPA 1V70A 2Z2SB 5J48A 1UIJA 3I54A 5KHHA 4E2SA 4O9EA 4Z82A 4X6RB 4OFGA 4IEQA 3SHRA 4HVQA 2XLFA 2UYAA 1Y3TA 5BPXA 4L2NA 4KWJA 2IXJA 4HMZA 3EJKA 4TLFA 1WLTA 1X8EA 1TQ5A 2O8QA 4YRDA 2XKOA 4I0AA 4EWAA 1X7NA 1SQ4A 1OI6A 3EBRA 1G6NA 4KWKA 1ZZ9A 3HT1A 4Z07A 3S0MA 3BB6A 4D7TA 4UBGA 4UBHA 4FAGA 5LRSA 2QNKA 3NJZA 4IEWA 1VP6A 4MGZE 4Q29A 4LA2A 5AVPA 3MDPA 1ZREA 4UXAA 4Q0SA 1YFYA 3RZZA 3O14A 4IEVA 1H1MA 4XFFA 1ZZ8A 1DZTA 2Y0OA 3M3IA 3SMHA 3BALA 4K8FA 3HT2A 3QACA 3PVBB 3I59B 4LLOA 1ZNPA 5KHJA 2VQAA 1UW8A 3FZ3A 1WA4A 4KU8A 4Q0VA 2VECA 1YWKA 1ZZCA 3E97A 4IEUA 5FLIA 5K8SA 3CJXA 3JZVA 5J3UA 3PLQA 2ZKLA 4HN0A 3E6BA 3E5QA 3ETQA 4PIYA 4ZU4A 2OZ6A 3KGLA 1UCXA 3IIAA 2H6CA 4XFGA 1RL3A 2IXCA 4E2GA 3D0SA 5HI0A 1GQHA 2D93A 2D40A 1WGPA 1LR5A 2K9ZA 4LUKA 4I02A 4QGLA 1O3TA 5LEKA 5I0UA 4XEZA 4BHPA 4IERA 3BU7A 1ZRFA 1O5UA 3ST7A 1EPZA 2OYZA 5FPZA 2XKPA 2GC0A 3SCFA 4FAHA 4WZCA 3EHKA 4IETA 5JAXA 4A2UA 3H3ZA 4KL1A 5FQ0B 3FE5A 3WW1A 4YYOA 1U12A 3CEWA 3H7JA 4HLTA 1VJ2A 3C3VA 4DINB 4EWDA 5EZWA 3OD0A 3FWEA 2ET7A 2ET1A 3LA3A 1ZZ7A 3MZHA 4MUVA 1J1LA 2HJIA 1QXJA 4MGKE 3LWCA 3E5XA 5I8TA 2BNNA 2C0ZA 2KXLA 1JUHA 3RPQA 2IXIA 1RGSA 3CL1A 4HVRA 3NL1A 5I0RA 4JV4A 3DL3A 2K0GA 5C6CA 1CX4A 2EA7A 2GC3A 1NE4A 3I59A 1UIKA 2OPKA 2PAMA 4HBNA 3SCHA 2XL7A 4HVOA 3NKTA 3EQEA 4KWLA 4QM9A 2Q0AA 1SFNA 4XFCA 4IEPA 3UKNA 3KSCA 3N4MA 2PA7A 3SXWA 3HUGB 4AVCA 2PAEA 1GQGA 4X6QB 4QGNA 5J7MA 1RC6A 5JCTA 2PHLA 4J1WA 4HSJA 3H1YA 4ONUA 4PJYA 4FBFA 2CAUA 1OFNA 2I45A 3KGZA 3S7EA 3S7IA 1RUOA 2BYVE 1ZZBA 2Q4SA 3BCWA 5CU1A 3I7DA 3H7YA 4MGYE 3ZDSA 2O1QA 5I93A 3U0ZA 4XFIA 3KMHA 3E6CC 2ATFA 2CV6A 2WFPA 4MGIE 4IEOA 1FI2A 2OA2A 2FMYA 3VHRA 3OF1A 1DZRA 4I01A 3IWZA 3IBMA 5FDBA 3TNPB 5FQ0A 2UY8A 3WW2A 2D5FA 2GH2A 3DN7A 1XRUA 4AXOA 3G7DA 4HN1A 5T3NA 4Q0UA 4ZU7A 4JTNA 3ELNA 2PTMA 4N9HA 4J1XA 5FLHA 4B29A 1RTVA 2DCTA 5LRRA 1YHFA 3LA2A 4QX5A 4H7LA 1IPJA 2F4PA 4XFHA 2PFWA 1QY4A 5EFUA 5I8YA 3TNQA 3FX3A 1CAUA 5LEJA 3EO6A 1I6XA 4O9GA 3ES4A 4FT8A 4XETA 2IXHA 2B8MA 4QM8A 2B5HA 2QCSB 4LULA 4AVBA 1YFWA 4D7SA 1J3PA 2ZCWA 2EVXA 2GC2A 4Q0QA 1FXZA 4N9IA 4JTOA 1XE8A 2XGXA 1EYBA 4L11A 3LZZA 4LA3A 1O7FA 4XFBA 2H0VA 1O3SA 1CAVA 1LKNA 5BXXA 2MNGA 2PQQA 3B02A 5CVRA 1NXMA 4NVPA 1J58A 1EY2A 3L2HA 4PIZA 4IESA 3CF6E 4MH0E 2GAUA 4WBBA 1YFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BQNA 4B4PA 3W5NA 2R063 1IRGA 2RMU3 2JG9C 5KHGA 4UT5A 2CU5A 1H4HA 4B3NA 5DG1A 2GZWA 2JDMA 3AG2H 1YO8A 4LG0A 1SVMA 2KIFA 3ZFGA 1S9HA 1SLTA 1D3YA 2NOGA 4NC7A 1FPN2 4XAEA 3EUHA 1UN1A 5FREA 3HZJA 5IVCA 4OIQF 3P1IA 4QMAA 2EIGA 3JBG3 2CAVA 2E6VA 1RJ8A 1Z6RA 3WE3A 4FFHA 1JBCA 1S72I 1MBFA 2E7WA 3RJRA 5HPOA 1X1DA 2R32A 1TNRA 3Q8CA 5GAEJ 5C8WA 3BR6A 3OGGA 1QHGA 1X1CA 1HC8A 1W7PA 5FOJB 3C2GA 4DYQA 3IUOA 3I49A 2IS1A 4G6DA 2IGKA 2VKDA 3LSPA 3O12A 5EIYB 5JSRA 5F08A 5FO9B 3GZNB 3ZSEA 3ACFA 1MH4A 3VZKA 4CUBA 3U78A 4AHYA 1S0DA 1ZBA3 4YIIA 3SDBA 4JX4A 2QSHX 4IO9F 2K86A 2ETEA 1AWCA 1BJZA 1JYVA 3HTSB 3M3CA 2CV2A 1S0IA 1YI2I 3HNBM 2ARAA 4FPKA 3ILFA 5CZKA 3JD71 4DNYA 3N9LA 3MPBA 5C4XJ 2HWF1 5FPXA 4GCVA 2O5RA 1TQIA 3UR3C 4KA4A 3KT4A 4MFEA 1MGTA 3JW4A 4NQWA 2QTWB 5CFDC 3LE0A 1RUC3 5IK5A 4CP1A 1ND3C 3OG2A 1B35A 3TEYA 4Z2YA 1TTYA 3G71I 1K61A 1C8M1 1RB8G 1XNKA 1JYTA 1PM4A 1DQ4A 4BB3A 2JE7A 1S6LA 2IAIA 3POSA 4A3BJ 4XF4A 3VBSC 5JI7A 4HX4A 2MEV2 3DUIA 2DUQA 2JVHA 2YFUA 4BYYA 2EA2A 1XNBA 4JDOA 3ABLH 3DU6A 3ACIA 4V1PA 4A6DA 4JQRA 2WA3A 4Q5OA 5FB2A 3VDXA 3LKJA 4UF0A 4AYUA 3PUFA 3GFJA 3JRGA 4QPGB 5F5QA 2DF7A 5M5XJ 3KLOA 4CZZA 3I3LA 3GUDA 4OUEA 5JXIA 3Q8EA 3PUAA 4RR3B 5BMZA 2M8EA 1OD3A 1XNTA 3EYIA 4EWAA 1X7NA 2VN2A 3D4KA 4ENMA 1IPSA 1PVC1 1I6HJ 4Y20B 1RR7A 5ABJC 5T54A 3S2WA 1TLHB 2R7XA 3BY6A 1G3SA 4GYGA 5J09A 4UFKA 1HRI1 1G9AA 1GDTA 1DPRA 4BJ5C 1KU2A 4DOZA 5JHFA 4QAWA 1W6QB 3V8LA 4A7ZA 5FLVA 4KI5M 5LHIA 2XPVA 1JT0A 4BU2A 2ZSHB 1UW8A 3QH6A 2MW8A 3OYNA 3DF8A 2ZX1A 2P2KA 3G1OA 3V64A 1W3VA 3KLSA 1T33A 5BNOC 2ZPXA 4BHCA 4IRHA 3WDVA 5FY0A 4OHVA 3S8PA 3AKZA 3MPPG 5C4WB 1U5ZA 3OWTA 2ELHA 5EEGA 1US2A 2H8RA 3DWLE 1ZQ3P 3ZMZA 2RMU2 1BI2A 1OPMA 4XBNA 5LA2A 2L4AA 4J00A 2Q1MA 1HXS1 5A7WB 3L2CA 2W7NA 3CO6C 2G7HA 3IM0A 5FV3A 3MN2A 1J2XA 1R64A 2V1UA 3IZOA 5C8CB 4JBAA 4RQPB 3WU1B 2Y8KA 1PGL1 1IKPA 4A0XA 5T5PA 2XF7A 3GBWA 3L2VA 3JBG2 1OCTC 2KZVA 1S5LC 2WO7A 2P5BA 4K3UA 4F93B 4YM3A 5HLGA 2KQRA 1HF0A 3U37A 5G05L 1QXJA 3F95A 4A44A 3M4OJ 1RVF3 1AR63 2E26A 1T0FC 5D2AA 4QDRA 5GZFA 2KRCA 1MNDA 5C6CA 2JB4A 1ASJ3 4RM2A 3I71A 3I59A 1WPKA 2W1QA 1OF4A 1ZR4A 4MYEA 3KP3A 2MBFA 3GHMA 2HXOA 3KD4A 2PA7A 3SXWA 3CC2I 3HSEA 1N78A 4J1WA 1I5PA 5EP9A 1X58A 2VIXA 2VNGA 1DBNA 3B01A 2ADEA 1O57A 3I64A 3RZOJ 4Y1YA 4EM0B 4XJAA 2HEWF 2DT7B 5CU1A 1JZ6A 3F6VA 4E7KA 2QQ8A 4WX9A 1FAYA 1FP1D 3I4MJ 4B1LA 1JUPA 4Q48A 2XRNA 1LHWA 3RZLA 1JT6A 3M3YJ 3AYAA 2XQRA 1K83J 1U8BA 1S29A 1UF2C 2TNFA 5FKLA 1A3KA 1UZVA 3WW2A 4UFHA 3WF3A 5BNGA 2IS6A 4V2WA 4M3DA 4CO8A 2BXYA 2ZFWA 2C1FA 4RGAA 3V4GA 2O61A 1OCRH 3KPHA 1TZOA 5EEHA 2I10A 3AZWA 2CUFA 3A01B 5F27A 1BI0A 4YFKF 4U0YA 4BHBA 4LMFA 4O9GA 4ZZDA 2Z16A 3OYDA 4XIOA 2MG4A 1BK1A 2QCSB 1WD4A 3QPHA 1RKWA 2QA4I 2VNRA 1X2MA 2M5WA 2X6YA 1DLLA 4LLLA 1TME2 1ULEA 3OY8B 2XGXA 4CDWC 1YIFA 2VW0A 1O7FA 4M3EA 4DNCA 2YB7A 1SFPA 1DDLA 3A21A 3E7LA 4A6OA 3B3QE 2GWRA 3O8HA 4GWIA 1N77A 1JOJA 2YR2A 4A3GJ 3BJOA 3MF9A 2HDCA 1RMU3 3OR1C 1NCRC 4HKWA 3TEXA 3UKVA 5A1FA 3PIPF 4C8DA 1J59A 1IUFA 4CDGA 2BZTA 2XPUA 4H3WA 4OMYA 4P9GA 1J3RA 3IDCB 2KFDA 4F8AA 3LCPA 5E1XA 2P5VA 4IEJA 1MIJA 4MADA 3UKTA 4IGOA 1XGSA 5BYNA 1T08B 1W28A 1UZYA 3H42B 2BW3A 3QH7A 1D7PM 1I3AA 4QXKA 5FIXA 3RZHA 3VD3A 3BIWE 4FETA 3M8FA 2IXKA 4A5MA 2DPUA 4KN4X 1U9NA 2BZDA 4ZU5A 2D6LX 4PCRA 3MLKA 1XMKA 2YC4A 3WTZA 5AC93 4LR4A 4II3A 1TVGA 2ZABA 3A2KA 2V5YA 3OS1A 4FSJA 1YE9A 3DBLB 1VMJA 1ZTRA 2LBFB 4V2VA 2LLKA 3N97A 3MV11 2CDPA 1VBC1 2JSPA 1RYYA 1AF9A 1W9TA 3NKGA 4WCGA 5A3TA 3I3BA 2VKEA 4BH9A 3U14A 1ETYA 3GBFA 3ECQA 4R9AA 2Y6GA 1X50A 3KP7A 4HPKB 3JRHA 4MHGA 1H9TA 3ZRGA 1SDDB 3GZEA 2AQFA 2L0KA 1BBYA 2BVLA 4XJWA 4L9VA 1W2TA 3EXUA 3H1MA 3ZYRA 4XUQA 3WDYA 4IL7A 3HVDA 4D6QA 3OSFA 1VALA 2Q1ZB 1SLIA 3W20A 4RS5A 3HOXJ 3T8TA 5D8AC 3WF0A 2IA0A 2FQ3A 3TO6A 5LGNA 3AG3H 5JPNB 2GU9A 3S1RJ 3TEDA 4AWXB 1GOFA 5DM7F 1KRIA 4W65A 3FXKA 1FV3A 1RVF2 2XUEA 3KF5A 2DQLA 5BY5A 2BBAA 1P4XA 3RZGA 3FXMA 2GXAA 3WHTA 4YPJA 4YW7A 2MHFA 3ZPLA 1ASJ2 2IPQX 1LEMA 2VCAA 4K21A 3GLLA 3DEUA 3OYIA 1UPIA 4O3MA 2RVAA 1IN6A 1ULCA 2Q8KA 4N4OB 3IKTA 1CAXA 5IYBJ 4KDPA 4RGUA 3R4SA 1UIJA 3BTCA 4X8NA 3GTKJ 4O9EA 1JZ5A 4QX0A 5DM6F 1KS4A 3O0VA 3THDA 1WVRA 2IXJA 2KZGA 1AHDP 2DUPA 2BERA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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