2Z2SB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
193
structure length
182
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRDPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RpoE, ECF SigE
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 40
structure length 182
sequence length 193
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2z2sB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2z2sB02
3NJZA 5E1RA 2CAUA 4KWKA 5FQ0A 4XF0A 2GH2A 2XKOA 4LULA 3I7DA 3B02A 3G7DA 1Y9QA 1YHFA 4IEUA 4AVCA 1DZTA 4QGNA 3QACA 4IESA 3OTFA 4J1XA 2H6CA 2XKPA 1I6XA 1ZZBA 3UKTA 3U10A 1NYWA 5LRRA 4Q0QA 4AXOA 5KHGA 2XLGA 1ZZ9A 3E5UA 4I01A 1EYBA 3MZHA 4D7TA 3H50A 4AVAA 4JVAA 3ES1A 4EV0A 3CEWA 1CAVB 4QX5A 5JR7B 3KMHA 3LAGA 4I2OA 1FXZA 1O5LA 2EA7A 4KU7A 1PMIA 4QM9A 1GQGA 2ATFA 2BEOA 1X7NA 2IXIA 2ZKLA 2OZ6A 1ZRCA 3OD0A 3WW4A 2Y0OA 2IXHA 4I3PA 3FHIB 2C0ZA 5E16A 2H0VA 4ONUA 1Q5OA 5LEJA 4QMAA 2PFWA 4XFBA 1V70A 3N4MA 2IXLA 5KHKA 3TNQA 4IEZA 1ZZ7A 4JTNA 4EWEA 4Q29A 4XF9A 3E97A 4UBHA 1XE8A 1SEFA 2IXJA 2PAMA 4PIYA 4N9IA 3MDPA 1I5ZA 1UPIA 4FAGA 3IIAA 2Q4SA 3H9AA 3OF1A 4Q0SA 4HN0A 4Z82A 4MGYE 2B9UA 4CYDA 2ET1A 1J3QA 3FWEA 2GU9A 2IXKA 2CV6A 3E5XA 5FPXA 1RUNA 3CLPA 3H1YA 1XRUA 2PA7A 1YFUA 3BPZA 1ZZ8A 5JSRA 3E5QA 4NVPA 2O8QA 4OFGA 4E2SA 1DGWA 3D82A 4IEWA 1SFNA 5I8SA 3D0SA 5KHHA 4E2QA 4ZU7A 1YWKA 3H8UA 1H1IA 4KU8A 1O5UA 2GC1A 5BY5A 3UKNA 3KSCA 4D7SA 4QM8A 2BNOA 2UY9A 3KGLA 2VECA 3QOPA 2CAVA 4ZU5A 3VHRA 4Q0UA 4R8HA 5KBFA 2B8MA 4RD7A 3SCGA 3FJSA 4JTOA 2ET7A 5J48A 5BUVA 3WW1A 4OLLA 1L3JA 4HVQA 5C8WA 4UBGA 1X8EA 1ZRFA 3LA2A 3EHKA 4I0AA 4IEVA 5I91A 5KHJA 4XFHA 2XLFA 4XFFA 5FLHA 1VP6A 5K8SA 2Q0AA 1ZZCA 1RGSA 3PVBB 2D40A 1ZRDA 3CL1A 2N7GA 2PYTA 3E6DA 1UIJA 3EBRA 2PAKA 2GC0A 2Q30A 4YRDA 1ZVFA 1YFWA 4XFGA 1ZZ6A 1HW5A 2WC2A 4IETA 4L11A 4EWDA 2K9ZA 3WW2A 1CAWA 1CAVA 4BHPA 4QGMA 3WW3A 5F1RA 3H1MA 2D5HA 4XF1A 5CU1A 3IDCB 2EVXA 1OFNA 2F4PA 4I0BA 2QCSB 2UYBA 5JSPA 3HIFA 3NW4A 5EFUA 3H7YA 1J3PA 4AQ6A 4YYOA 4EWAA 5D1IA 4HBNA 4XETA 2GC3A 3I59B 1NXMA 1UIKA 2XL9A 4IEPA 3RYRA 2BNMA 2VQAA 4F7ZA 1Y3TA 3GYDA 1YLLA 3ST7A 2OA2A 5FQ0B 2GC2A 3SCFA 3BCWA 5I0RA 1XE7A 4B29A 2KXLA 5FPZA 1ZX5A 2UYAA 3FFQA 2BNNA 1EPZA 3DV8A 1OD5A 2GAUA 1O3TA 4KWLA 5I0TA 1CAUA 2MHFA 4MZUA 2HJIA 1TQ5A 4O9GA 4XEZA 4FT8A 3RNSA 3ROUA 4LA3A 5I93A 3MPBA 4BYYA 1Q43A 3CO2A 3NSTA 2WFPA 1J3RA 2QDRA 4WBBA 4HVRA 1CX4A 3BALA 2P17A 5I0SA 3CF6E 3GBFA 1O3SA 1O3RA 4O9EA 2ZCWA 1CAXB 1WGPA 4K8FA 3KCCA 2QJVA 5EZWA 1UD1A 4PIZA 3S7EA 3DN7A 4MGIE 3HT2A 1CGPA 2UY8A 2QVSB 1UCXA 3O14A 4XF4A 1QY4A 1QXJA 5HI0A 1O4TA 5JSOA 3UKVA 4Z07A 4LUMA 4J1WA 4LUKA 4YARA 1LRHA 3H1WA 3LA7A 4LA2A 2CGPA 5I8TA 3FZ3A 4MGZE 4PJYA 5JAXA 5BPXA 1OMIA 2QNKA 3RDIA 4HVOA 4H7LA 3LZZA 4LEJA 3RYKA 1VR3A 2GZWA 4JV4A 2VPVA 3SCHA 5FDBA 3NL1A 4E2GA 4XFCA 2PHDA 2HKXA 4EROA 3KGZA 1O7FA 5BV6A 4X6RB 3MYXA 3NKTA 2MNGA 3LWCA 5FLJA 4MGKE 2PHLA 3ELNA 5I0UA 2OZJA 2Z69A 4IEQA 1YFYA 3HUGB 4AQ2A 1X82A 1RTVA 4Q0PA 1RL3A 2DCTA 3CJXA 2K0GA 4HSLA 5J7MA 4N9HA 1O3QA 1J1LA 4AVBA 3PNAA 1GQHA 3C3VA 2FQPA 3BB6A 3FE5A 1YFXA 4MV2A 3TNPB 3OCPA 5KHIA 3D0JA 4MX3A 4R52A 4BIFA 2E9QA 4HSJA 1J59A 4X6QB 1NE6A 3ACLA 4WZCA 2OPKA 4ZU4A 5CVRA 3SXWA 3H7JA 4BH9A 4YSFA 4MH0E 1WLTA 4META 3OGJA 4IEYA 4XFAA 3R6SA 3M70A 3ETQA 1FT9A 1ZNPA 4KWJA 4XF3A 3DL3A 1WA4A 3I54A 4F8AA 1CAWB 5T3NA 4IEXA 2Q1ZB 2PAEA 3U0ZA 3E6BA 4I02A 4A2UA 3E6CC 3IBMA 1OI6A 4TLFA 4WVZA 3S7IA 3H3ZA 1X8MA 2IXCA 4DINB 2FMYA 1JUHA 3IWZA 3LA3A 4QXKA 3RYPA 3SMHA 4Q0VA 3S0MA 2IC1A 2D5FA 1CAXA 2BYVE 3BU7A 5LRSA 1RC6A 1EY2A 1QXRA 2XLAA 3H3UA 4GULA 4PIXA 3NVCA 1DGRA 2XHKA 4IEOA 2H6BA 1LKNA 1J58A 3HQXA 3EJKA 1NE4A 3RPQA 1Q3EA 1CAUB 1LR5A 4MUVA 5I8YA 2O1QA 2XL7A 1IPKA 1UW8A 2OYZA 4QGLA 2D93A 1SQ4A 2I45A 3L2HA 4LLOA 4L2NA 4FBFA 4UXAA 1RUOA 5AVPA 3JZVA 2ETEA 3M3IA 4HMZA 4P9GA 1ZRRA 3ZDSA 4HN1A 4YNIA 5CADA 1EP0A 2BGCA 5JCTA 3U11A 4LTAA 1YUDA 3HT1A 3PLQA 1H1MA 3DKWA 3SHRA 2PTMA 5J3UA 4HZFA 1PM7A 2MPFA 1U12A 5C6CA 1IPJA 2B5HA 2V09A 3IDBB 4NQWB 1NZCA 1ZREA 4IERA 5BXXA 2EAAA 4HLTA 1FI2A 5FCCA 5LEKA 3EQEA 3LOIA 2PQQA 4FAHA 3ES4A 3USSA 3EO6A 1LB2A 2XGXA 1VJ2A 3RZZA 1DZRA 5FLIA 4KL1A 3FX3A 1G6NA 2Z2SB 4XFIA 1QWRA 4ORFA 4I09A 3I59A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F64A 4L9NA 1J09A 1LFPA 2K9MA 4ISRA 4IHSA 4KWKA 3FMRA 3I7DA 4WVMA 3D5LA 5K9YA 3BTAA 2VE8A 3RJ2X 4XUTA 2DF7A 4EVIA 1DU0A 1X3UA 4Y20B 2VMCA 3SEPA 3JTGA 1UWWA 5FZIA 4HSTA 1JT6A 2XUMA 1X2MA 1FXZA 2QUFA 3OGRA 4Y52J 1AR61 3PUFA 2AR6A 1MZ5A 4G6DA 3S30A 2IXIA 3IHUA 3FN9A 2I07B 1W2TA 1WI3A 1GMMA 1UHMA 2J1RA 3ZXEA 4BDYA 5EWSA 1BJZA 5GAEJ 4Q2FA 3M7AA 1NHAA 2VQHA 3ABMH 3AKZA 3E97A 1OPCA 2DV9A 1F2NA 4AEKA 2W94A 4N43B 4G7HF 2OUJA 3OF1A 4Q0SA 4KWUA 3F6VA 2OC6A 2P3YA 2WSVA 2BPA2 5EEAA 3CZJA 3AB0A 5C4WB 2A6HF 2R93J 5FPXA 2I8DA 4LBKA 1OXCA 4CRQA 2DODA 4NVPA 2F4MB 3DEMA 4IEWA 1TW2A 4YM1A 4V19K 1MACA 3OWTA 3EYIA 3ILFA 4E2QA 5HLGA 5FYSA 4F91B 4QM8A 3F8FA 2UY9A 1LHWA 4LHNA 4NB5A 5KBFA 2WAFA 3DBHB 4HDUA 4BKXA 2VZUA 3S1MJ 1JI8A 2XAFA 2VBZA 4Q4X2 1IN8A 2OS2A 1YJKA 2LF7A 1P4AA 1Z1DA 1D1BA 3PVBB 1ZRDA 3IT8A 5HDGA 3KV5A 4E7KA 3G1OA 3HHHA 4HNTA 5GTHC 2HPIA 1ST8A 1YFWA 3JAMK 3HOXJ 5J40A 1NQDA 5CFDA 2WL1A 5B1AH 5CYYA 3RMYA 1W5TA 1UYXA 2D5VA 3RIRA 3DBRB 5HXMA 3SEEA 3VKFC 3SJMA 5LY2A 4H14A 2OAZA 4BACA 1SACA 3SQOA 3A23A 2MD0A 4UXNA 4AHYA 4EWAA 2LTNA 3K77A 4RQPA 1SFEA 1IN4A 3OPZA 3UV9A 3FFQA 1USTA 5GZDA 4DZJA 5J47A 1MSFC 3N05A 2VN2A 4UF0B 2OXBA 2K46A 3A0HC 4N53A 1R1TA 3WF2A 4HKWA 2Q8OA 5FY1A 1SFUA 5APAA 1FOD1 2RS12 2CV0A 2IGNA 2JRMA 4BQNA 4AFBA 2X6WA 4JKKA 5ICFA 2G1MA 4AZZA 3W6VA 5KAFC 1ASJ2 5FXXA 2BVVA 1BA5A 2P34A 3BPXA 1RNLA 1WLDA 3MWMA 3AG4H 2I5UA 2L9RA 1K12A 3M3CA 3HEIA 1BZWA 3JCIA 4XF4A 2NZ9A 4EGZA 5HI0A 2VCCA 4MO7A 3ZMUA 4LUKA 1A6IA 1LRHA 5EJ1B 3LA7A 1CONA 2XBO1 3O1OA 4NIGA 4PHZA 2D45A 4PF5A 3LDRA 4Q4Y1 1Z0HA 5H20A 4P08A 3JQXA 3VLBB 4C8DA 1SMTA 2VTXA 1IF1A 2VOOA 4IDZA 3GTQJ 4P9UA 1OA2A 4FQGA 1W2AX 4HOOA 1JYWA 4Y15A 2WLQA 4I3GA 4RSUA 1SANA 4HV6A 2KRFA 2YC2A 3B7MA 3FBIB 5FBZA 2VW1A 5D4RA 2BXZA 3NKTA 4MTDA 3RS6A 5IYBJ 4A3EJ 3Q9SA 4D0QA 1W1WE 4AHXA 1HXS2 2VTFA 3CJTB 2WKKA 4QWQA 4XLCA 4CUCA 2ACJA 2JWPA 2LKXA 4Q0PA 2X6YA 1DYKA 3BG6A 4ZTJA 1PDNC 2FQPA 1OCTC 1G3YA 2RREA 1K83J 2JSCA 1JT0A 3HKZA 2IFRA 3P9IA 2DYRH 1HBXG 4P9FA 3AZWA 1Y9MA 5EDNA 1GNYA 2M8GX 1OYWA 1RIOH 5T3NA 3LNQA 5LY1A 1B6AA 2Q1ZB 3TYJA 1PX4A 3VV1A 1DU6A 4NROA 2W95A 4IUGA 3IWZA 4HF2A 1W6QA 5IJRA 5A2QZ 2OVUA 1RUI3 4M0HA 2VJJA 4AEMA 2QSFX 1EUTA 3RRDA 1EY2A 3TL4X 2FE3A 2CWSA 1E3HA 5A32B 1NCRA 5FTTC 4HLXA 2W2IA 3N3HA 3THTA 2FQ4A 3QH7A 5FFOC 3E1F1 2M7AA 5K0UA 2ZGPA 5KXCA 4AIJA 1QJY2 4LQRA 4Q27A 2D3SA 3CCEI 5F3CA 2ZGKA 2ID3A 5FZOB 3MIBA 3WTTC 5CADA 5E1ZB 2EIDA 4CZCA 3K51A 5L3GA 3U9GA 3T8TA 4XJAA 4Z92B 4UFLA 1NX9A 1VBB1 5HS8A 5IOZA 2E1MB 3HNBM 4LG0B 1QHDA 4SLIA 3MGUA 4Y1ZA 1RVF1 5LBCA 1HQCA 1DQ0A 4WK8F 2K3FA 2ZXWH 4NQWB 1NZCA 4QPQA 4RR3B 4XJ8A 5FZ8A 2GA2A 3R60A 2EAAA 2JVGA 1DGLA 5CISA 2W84A 1VF9A 3I2DA 4IW3A 1Q8OA 4AUXA 1QH6A 1P4WA 2WUHA 3B5LB 3I53A 2WAEA 3HYIA 1OLRA 1RUC2 3G2BA 2XDVA 3H3LA 2FEZA 2VY0A 4IRGA 1Y4WA 1DGRM 2ZEYA 2EF6A 5F32A 2WNVB 2QM3A 2F48A 4XF0A 3L09A 3B02A 4LT5A 2WT2A 4LXLA 3S1QJ 1G9FA 1XQNA 2YC4A 5J1UA 1Z91A 3OTFA 4B44A 1LGNA 2PHFA 5LRRA 2DBNA 3PL8A 2DA1A 2M5WA 2ICWG 2WZEA 1APNA 4M4RA 1BMV1 4Q4V1 4RBOA 5JR7B 2A6EF 3GM8A 1WMDA 4XHXA 4JRAA 1JI6A 1S0CA 3O3KA 3ZMTA 1E5HA 3IUOA 2PJRB 1NY71 4NPLA 2H0VA 5IVCA 1R1VA 2VBDA 1TMF1 4GQ7A 2BP6A 4EWEA 1GWLA 3A4CA 5SV8A 4D9JA 1S29A 3MW3A 1PP7U 1IKPA 2UWCA 4CDQA 2ADEA 1BI3A 3MDPA 2R5ZB 2DO7A 2X5IB 1N77A 1W9FA 4Q4W2 1G2HA 1BM9A 2WS91 1TT0A 5DZEA 1XE0A 1TVGA 1QZZA 3OYMA 2VVFA 1JE8A 4P5OA 4JKLA 3E5XA 3ZN1A 2P5BA 2Y0IA 5ERIA 5GZCA 1P9QC 2NOJB 3LD8A 2M87A 5EPAA 4D1QA 3UT0A 2VZRA 3E1SA 5EG0B 3LSKA 2A6TA 3QPLA 4Y5Z0 5BY5A 3BVCA 2PMZN 1OA4A 2I10A 4G7OF 1UY4A 4R8HA 1DFQA 4WM7A 1AR71 4C0HA 1TWFJ 1Z7LA 5BUVA 3R0RA 2PHUA 2PQSA 4CCJA 4IEVA 4S2GA 1R9TJ 5FGMA 1RGSA 3CL1A 5ABJA 1B8IA 4UHTA 1YRNB 3H36A 3AMMA 5A33B 4YZ2A 4QPGC 1FOXA 1WJBA 3S17J 3ZMVA 2QFEA 4A3XA 2K9ZA 4BHPA 1XMXA 3GTOJ 2XF6A 2YU9J 2K9NA 4AW7A 5HCHA 1SFPA 3KVAA 4XPVA 4KG8A 1T6BX 1BW6A 4YIFA 1B72A 2DUQA 2YPRA 3CDLA 1T6SA 4GWNA 1ZLKA 2ZHNA 4CP9A 3PNVA 3L9JT 2ZSIB 1MR5A 4N0BA 1XE7A 2VVDA 4OUSA 3GEZA 3CF5F 1W90A 2XUEA 1ZX5A 4GALA 3LFUA 1JXSA 5E3MA 4XL9A 2CL2A 3UGHA 3ZQGA 3CC2I 5C8CC 1S3JA 4Y13A 1IXRC 4CDXB 5JZGB 4QPIB 1YI7A 3CQZJ 3VBRC 4MVTA 2XVLA 2W4SA 2W1OA 4OWRB 3RI4A 3K1NA 1JJ6C 3AJYA 5BPDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 3AYD A;  4FPG A;  4P9X A;  5E1R A;  1J09 A;  1LFP A;  2K9M A;  2RHP A;  3J26 N;  2F4I A;  2CAU A;  4ISR A;  4KWK A;  4Q4Y 2;  5BNQ A;  5FQ0 A;  2O0O A;  1OKQ A;  1S0F A;  3WDY A;  1M06 G;  1AR8 1;  3I7D A;  1FMD 1;  2A6X A;  4KGQ A;  4WVM A;  1IOA A;  2NLR A;  4JGZ B;  4PJM A;  5BNP A;  1DZT A;  3PVE A;  4RQP C;  4L9B A;  5ABJ B;  3D5L A;  4J1X A;  5K9Y A;  2XKP A;  3BTA A;  3IDE A;  4EN6 B;  3RJ2 X;  5JWP A;  4EN8 B;  2DF7 A;  2NN8 A;  5KHG A;  2XLG A;  1H4G A;  4IV3 A;  3E5U A;  4Y20 B;  4JVA A;  1XU1 A;  4EV0 A;  1VBA 1;  3CEW A;  3KB5 A;  1I1E A;  1CAV B;  3GZT B;  4M3C F;  4QX5 A;  4HST A;  1BXH A;  3KMH A;  4RHV 2;  2XUM A;  2BQP A;  2ZGO A;  4X0G A;  4AVS A;  1FXZ A;  1PGL 2;  2FBE A;  4N53 C;  4LBQ A;  4C0B A;  1AR6 1;  3ALQ A;  2AR6 A;  1CN1 A;  4LLF A;  1MZ5 A;  4YVW C;  2ZXI A;  4XTP A;  4N4O B;  2V6E A;  1FAY A;  1JOJ A;  1X7N A;  2IXI A;  2DFC A;  2HEV F;  2JEN A;  2JG8 B;  2YMZ A;  4YGC A;  2I07 B;  4COW A;  1U0J A;  2R07 2;  1VBC 1;  1E0E A;  2PN5 A;  4FPK A;  5FMO S;  5LEJ A; 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