2Z2SB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
193
structure length
182
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRDPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RpoE, ECF SigE
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 40
structure length 182
sequence length 193
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2z2sB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2z2sB02
3DN7A 1QXJA 1ZZ8A 2HKXA 1CAUB 2FQPA 5FLJA 4R52A 4A2UA 1RUOA 4OLLA 1OI6A 1VR3A 2GU9A 1UPIA 1SQ4A 5KHJA 1YUDA 5I0UA 4JTNA 4MUVA 5C6CA 3ELNA 5J48A 1VP6A 1QXRA 1CAUA 5JAXA 4F7ZA 2Q1ZB 4Q0UA 2PTMA 2UYBA 2O8QA 4XFGA 5BUVA 5JSPA 4KU8A 1VJ2A 4IEZA 5LRRA 1CAWB 4MGIE 3RNSA 3I54A 3BB6A 3SHRA 3H9AA 5I0SA 1O3QA 4FAGA 1WA4A 5I0RA 5KBFA 4HBNA 2OA2A 4UBHA 2EAAA 4BH9A 1CX4A 2H0VA 2PYTA 2PHLA 5I93A 3LA2A 4JV4A 3VHRA 2C0ZA 3UKVA 2XL9A 3H50A 1PM7A 4QMAA 3LA7A 4BHPA 5JCTA 3LOIA 5KHHA 1L3JA 4I02A 4PIYA 1CAXA 1CAVA 4AVCA 4KWLA 4QM9A 4HN1A 1X82A 4Q0VA 2I45A 4X6QB 4IEXA 4MGYE 4I09A 3H1YA 5I8TA 4P9GA 2WC2A 3SMHA 4YARA 4MGKE 2UY8A 3WW1A 4WVZA 1ZZ6A 4J1WA 4ORFA 4IEPA 3WW3A 5T3NA 1RUNA 3H8UA 1LRHA 3EHKA 2Y0OA 4D7TA 4WZCA 4EWEA 3CEWA 4O9GA 2UYAA 1OD5A 5FQ0B 2IC1A 4XF0A 1XE8A 2PQQA 3PVBB 4N9HA 3D0JA 5LEJA 4MX3A 4IEQA 1SEFA 4NQWB 2Q30A 1HW5A 5I0TA 4HSLA 5FQ0A 1J58A 2D5FA 1J3QA 2XLGA 4Q29A 2QVSB 1H1MA 1YFYA 2BNOA 4AVBA 3KMHA 1Q43A 1J3PA 2ZKLA 2ZCWA 3KSCA 4IETA 2BEOA 1NYWA 2VPVA 4META 4GULA 4PIZA 1X8MA 2KXLA 4ZU4A 5JR7B 2XLFA 1ZNPA 4FT8A 2GC3A 3H1MA 3HIFA 4UXAA 3B02A 4I2OA 3RYKA 1EYBA 1ZZBA 2Z2SB 4KU7A 4XFAA 4CYDA 1Q3EA 4AVAA 4I0AA 2VECA 2MPFA 4AQ2A 5FLIA 5FCCA 2UY9A 3NSTA 4EV0A 3PNAA 4MZUA 3SCHA 1ZZ7A 1EP0A 1NXMA 3SCGA 4BYYA 3KGZA 1X8EA 5FPXA 4E2QA 3UKTA 3EJKA 5FLHA 2WFPA 1LKNA 3ACLA 2CAUA 4LEJA 1FXZA 4XF9A 5KHKA 2IXKA 2IXIA 2D93A 4Z82A 5AVPA 4QGMA 2PAKA 3S0MA 3H7YA 4KWKA 2BGCA 2N7GA 4XF3A 4E2SA 3USSA 1ZRRA 3I59A 4PJYA 3HT1A 1DZTA 3LZZA 1YHFA 2H6BA 1GQGA 1CAXB 4QX5A 1CAVB 1GQHA 2XGXA 2ET1A 4XFCA 1ZVFA 3IDBB 3BU7A 3CLPA 2XLAA 4XETA 4Q0QA 4Z07A 3TNPB 1ZREA 4IEUA 4HLTA 2IXCA 1NZCA 2B9UA 3O14A 5BY5A 4HMZA 4HN0A 5FPZA 3NL1A 5LEKA 2F4PA 4XFIA 3M3IA 4OFGA 3DV8A 5CADA 2MNGA 4N9IA 5EZWA 2MHFA 4KWJA 4AQ6A 4EWAA 5I8YA 5JSOA 3MYXA 3CO2A 4Q0PA 2CGPA 2OZJA 3ETQA 1QWRA 1UIJA 3KCCA 5CU1A 1O4TA 3RZZA 2XHKA 1XRUA 1ZZ9A 2ET7A 3DKWA 1YWKA 3H1WA 4O9EA 5C8WA 1IPJA 3RPQA 4QGLA 2B8MA 2B5HA 1O7FA 3EO6A 2DCTA 3IDCB 1UD1A 2BNNA 1RTVA 1JUHA 1UW8A 5LRSA 2PFWA 2OYZA 4QM8A 3RYRA 3E5XA 2XL7A 1Y3TA 3L2HA 3D82A 1PMIA 1IPKA 2GZWA 3CL1A 3BALA 4ONUA 1WLTA 3ZDSA 3HT2A 1FI2A 4IEYA 4L2NA 4LTAA 2PAMA 4JTOA 3FFQA 4DINB 5F1RA 4EROA 2K9ZA 4J1XA 4IEOA 5JSRA 3MDPA 2OZ6A 4MV2A 1RGSA 3SXWA 4LA2A 3BCWA 4IESA 3NVCA 2O1QA 5BV6A 1X7NA 2VQAA 2ATFA 3HQXA 5BXXA 3IWZA 2PAEA 2Q0AA 4H7LA 4WBBA 2QDRA 1TQ5A 3MPBA 4LUKA 3WW2A 3FWEA 4EWDA 4X6RB 2FMYA 1YFUA 2HJIA 3S7IA 4I01A 4Q0SA 3LA3A 4HVQA 4ZU7A 3EBRA 3FX3A 4IEVA 2CAVA 4XEZA 1ZX5A 3I59B 4FAHA 1O3SA 4HVOA 1CGPA 4XF1A 1Y9QA 3LAGA 3NW4A 1V70A 2OPKA 3CJXA 3UKNA 1EY2A 3EQEA 4BIFA 1ZRCA 3PLQA 2GC0A 2CV6A 3E97A 5EFUA 3U0ZA 1Q5OA 2IXHA 4B29A 4FBFA 4QXKA 1LR5A 1J59A 1EPZA 3G7DA 4AXOA 4MGZE 5FDBA 3MZHA 3OTFA 2QJVA 1J3RA 1ZRDA 3E5UA 2XKOA 1NE4A 3SCFA 1CAWA 4HZFA 5E1RA 1RC6A 4LUMA 3FZ3A 3OGJA 3JZVA 3OF1A 1YFWA 1QY4A 3ROUA 4YSFA 1O3RA 3E6BA 4E2GA 5J7MA 3QOPA 4K8FA 3E5QA 2V09A 4F8AA 3FJSA 3GYDA 5BPXA 3RDIA 2D5HA 4XFBA 1SFNA 5I8SA 3I7DA 2D40A 1ZZCA 3D0SA 3H3UA 1YFXA 3FE5A 1OMIA 3ES4A 1UIKA 1WGPA 3OCPA 1H1IA 4R8HA 1YLLA 5I91A 2EA7A 1I5ZA 3KGLA 4LULA 4MH0E 1G6NA 3CF6E 3FHIB 4LLOA 5D1IA 2XKPA 2IXJA 1XE7A 2Q4SA 4XFFA 3IIAA 1LB2A 2K0GA 3ES1A 4KL1A 2GH2A 3M70A 1ZRFA 3QACA 3WW4A 4XFHA 1O5UA 5CVRA 2P17A 4I3PA 4QGNA 3TNQA 3RYPA 3GBFA 4RD7A 2GC1A 1J1LA 3U11A 2EVXA 3LWCA 4XF4A 4PIXA 3DL3A 1OFNA 4I0BA 1I6XA 4TLFA 4HSJA 5KHIA 4NVPA 5KHGA 2ETEA 5J3UA 5HI0A 5K8SA 4IEWA 2BYVE 2PHDA 3H7JA 3ST7A 3OD0A 3N4MA 3E6DA 1DZRA 3R6SA 2QNKA 2IXLA 1FT9A 5E16A 4ZU5A 1DGWA 4UBGA 2GC2A 4HVRA 3IBMA 4D7SA 4YNIA 3HUGB 4IERA 3BPZA 3NJZA 1O3TA 1RL3A 4LA3A 4YYOA 3S7EA 1DGRA 3E6CC 2E9QA 2GAUA 4YRDA 1U12A 4JVAA 2Z69A 1UCXA 3C3VA 1NE6A 3U10A 2H6CA 2BNMA 3H3ZA 3NKTA 2QCSB 2PA7A 1O5LA 4L11A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W05A 1QXJA 4M3DA 5A7WA 3AP4A 5DUXA 2ORXA 1FPN1 4BXSV 1KYZA 3ZXEA 4Y1UA 2ZGUA 1A8MA 3OS1A 1R9TJ 2KKOA 2YV8A 1FTTA 1TWFJ 5I0UA 1VP6A 3IDAA 3GTJJ 5FRNA 4L5JA 3FXKA 2CV1A 1N3QA 1SFEA 4U7DA 5GZDA 2VMIA 3JD72 4HK9A 3ZYBA 2P81A 2VQGA 5BS6A 3ZDVA 5CFDA 1R1A3 1OQDA 1H2NA 2PHUA 3LPGA 4E8CA 2R0FA 3ZSMA 1BVP1 4QX2A 2ME6A 3VZJA 4IRIA 4DO0A 5JOZA 5HNFA 4KITB 2RS11 3DU6A 3B9CA 3THTA 4AWDA 1V5FA 4PSXA 2W47A 2JDAA 1NG7A 1MVEA 1TLHB 3VYUB 2DDAA 4XXAA 2K9QA 4C2MJ 3IIIA 3EHKA 1OD5A 5HLIA 3GO5A 1XE8A 3F22A 1EAH3 1F5JA 5B1BH 1B8IB 2DUOA 4OIPF 1IS6A 2BWCA 4G7OF 1J3QA 2W46A 2W1WA 4Q29A 1GQPA 1X1DA 4AI8A 4Y3OA 3MIBA 3PIJA 1ZLJA 1DP3A 3SQNA 2DJIA 1PHMA 4PBPA 3FHZA 1NYWA 1KS4A 4PIZA 4ZYDA 5GZGA 1QQP1 3ORJA 3LFKA 3SKJE 1LCLA 4I2OA 2P5VA 2R93J 3I3DA 4FE4A 2X10A 1E3HA 4BE1A 2JD4A 1IDYA 2P4EA 2DA7A 1OLQA 5LWBA 1VRH2 4HPKB 1NT0A 3SKVA 2VECA 2EZLA 2Y0MA 4EV0A 4QIWN 4XDOA 3VGIA 3JTGA 1RUG3 3OYWB 4UHTA 2HWE2 3K10A 4UUSB 3FM3A 5FY9A 4PLOA 4FFHA 3VWBA 5M5XJ 2K85A 5BMZA 3MLJA 2VOTA 1SLAA 2BGCA 3JRCA 4Y20A 4AVPA 5IT3A 4B43A 4OHWA 2XF6A 1OCCH 2ME0A 4UW5A 2V9PA 1S1AA 1POV1 5B4NA 5ICGA 4ZYEA 4BU2A 3BU7A 3OYFA 3ASOH 5C33A 3OPWA 2HBTA 2QQJA 1DBNA 1IRZA 2DMPA 2J1RA 2CWMA 2X05A 1BI1A 4UW4A 5M3MJ 3S3MA 2Y0SN 5B2GB 1R4MB 1ZREA 3VBHA 4M3BA 2RQQA 4HMZA 3WF4A 5B66C 3NL1A 4RMNA 1K78B 4OINF 4J25A 4O61A 2D6NA 1L7LA 4Q0PA 4UVAA 2NVTJ 2BY3A 2E5ZA 4BIOA 5CU1A 3K70C 2W4SA 3WCRA 1BMV1 3ZFEB 1YIJI 3DKWA 1DU0A 2IT0A 5CJ9A 2XC7A 1VALA 2VXZA 1W6QB 4OZOA 1VRH3 1U5YA 4OUSA 2OV7A 4KBZA 1UF2C 4JQFA 3B69A 5IVCA 2BJSA 2EFWA 5GLVA 4BCUA 2HWE3 2W0XA 5DUKA 1WCMJ 3Q5FA 4F55A 4PFPA 3W6KB 5E8IA 1SFOJ 1U5XA 3KZYA 3TYJA 1Y1WJ 2L0KA 4INDA 3REOA 3F6VA 4XILA 1OCZH 2LRPA 4B3NA 4BQ3A 5BXXA 1UCRA 2HBUA 1LVKA 4PCQA 1JJ8C 4YVSB 1EV11 4LUKA 1W5TA 4PF1A 3R60A 2LUWA 1WZXA 1GBGA 5FO7B 4MG2A 2ZMEB 4LBLA 1NCRB 4IX7A 2ZBJA 2FDKA 3WTSC 3ECQA 3J81K 4XEZA 4AIJA 5JIAA 1TWAJ 4DRRA 3C2BA 1FYKA 1Y9QA 2ELHA 3LE0A 3NV4A 2Y33A 4H55A 4BIFA 4CEWA 3SLIA 3FXMA 1Q5OA 3HN1A 3L2VA 4RA0A 3TP3A 1MR5A 4XQDA 2VIXA 5JXGA 2V73A 2VNOA 5BNNA 3SC7X 2QCOA 1VBB2 2VVEA 1CAWA 1JU3A 4ISRA 3FZ3A 3ROUA 3K4BA 1N77A 4DXSA 1XMXA 2DFCA 1ZG1A 1RMU3 4XURA 1VAVA 1ZBE1 5F8PA 4BXFA 1RR7A 1T38A 2D40A 3OBRA 3G1MA 4KG0A 2P1BA 3L2CA 2F4MB 3WP4A 2R6QA 3OWTA 1H1AA 3H5RA 4I30A 4UF0B 4AI2A 1YI9A 1JUSA 4BDYA 2O61A 4XFFA 2LF7A 4OIRF 4CCKA 3BUCA 1HXS3 2FQ4A 2JN6A 1Z7S2 5CVRA 2P17A 3NV3A 2PELA 3O7OA 1APNA 3AB0A 2G9FA 4ARYA 3ZSEA 1PO22 4B4PA 1UELB 3NEUA 2RM23 4IEJA 4B8EA 1ZA4A 2A07F 1H8TB 4FX4A 1NK3P 1Y39A 3AL0C 1U8BA 2QYOA 3PDQA 4I6ZA 2Y6JA 3JSOA 1IV8A 2WAAA 4D7SA 4BQ5A 3BY6A 1LOCA 4COWA 1OFSA 5B3SH 2Z42A 3E6CC 4BQ1A 4YRDA 4K7JA 4Y26A 4LIUA 1YJLA 4IL7A 5LA1A 2J7MA 1W0UA 1IPSA 4ITVA 5HOOA 1C0WA 5TISC 3PFIA 2FQPA 5BNOB 2GMEA 1KU2A 1N3OA 3O0XA 4GH4A 1MBJA 3U4XA 4L18B 2BXZA 1SLBA 4CUAA 2UUZA 5BUVA 1G9CA 1E2XA 2WQ8A 3C7GA 5TRDA 3TN91 4HKLA 2ZXWH 3F6OA 1FNNA 3P9CA 3RNSA 2P5KA 4DBRA 5CA6A 2ACJA 4LITA 4QQPA 4M3CF 4AIHA 2VODA 4BZ4A 1W8ZA 1WA4A 4FXGB 5B4XA 4W8JA 2EAAA 3DCFA 2GXBA 1WLCA 2V9KA 1CN1A 3R4KA 3VHRA 3VV1A 2MC4A 1BBT2 1N75A 3ABUA 1RB8G 4F93B 1W9TA 1Y6IA 2VO5A 1OUSA 2QQOA 1WA6X 1H2MA 3VN4A 3I2GA 4XLCA 2NOJB 2MGQA 2DUQA 3WT3A 5IVVA 2OUMA 5HPOA 4GWIA 4TXWA 3KYLA 4IEPA 5AFEA 5D6FA 4D6SA 2R0QC 4BDVB 1DYPA 5KR7A 3IKWA 4O9GA 5C8CB 4A3GJ 1QZZA 3VKFC 4AI3A 4XQ4A 4XF0A 3ITQA 5CZKA 1F15A 3B00A 1S8NA 3HPGA 1H89C 2ZSHB 1GOGA 1W1WE 1OOPC 2FCTA 2PLV1 4QT6A 3BPVA 1D4VB 4CCDA 2WLPA 4F83A 1TWCJ 3WNPA 1IQDC 5EJCA 4UWDA 4E4HA 4EYUA 1ASJ1 2ZKLA 4Y13A 5GZCA 4META 2VJXA 3SNMA 2VZPA 3E7LA 2XR4A 4UFJA 3PL8A 5DM7F 5JR7B 2WNUC 1XNBA 1O4YA 4FT8A 5CKMA 5DTDA 4YZ5A 1W6PB 3B02A 3QH7A 1K42A 5C3EJ 5A7QA 1V9U1 2MPFA 2I5UA 1BXHA 1JE8A 5FCCA 5DEQA 5K7PA 1ZZ7A 2IA0A 2QA4I 3ZYIB 3DKQA 1NG6A 2ECCA 1WWYA 4NWVA 3SCGA 3ZMZA 1MDMA 4E2QA 2F6BA 1SEUA 2OIIA 2VUDA 4I3GA 1S72I 1C4RA 1WLWA 4B3XA 4OAZA 1W3XA 1IW7F 1ACIA 4QGMA 1DZQA 3LSGA 2HQNA 1K83J 3DF8A 5D5XB 1CZVA 4YW3A 3RRDA 1GWLA 3IAQA 1QHGA 1YOVB 2XGXA 1BI2A 2LF8A 3V56A 3VBUB 4KT5C 2HS5A 4F3JA 5C5UA 1AYN1 3I49A 1BR4A 1ZGWA 4RLFA 1AYM1 1Z1DA 3KIOA 1M1EB 2EV0A 3L2WA 2BZDA 3I4PA 3GTLJ 4CCOA 2VZVA 2WB1N 4NB5A 1DPUA 1ZELA 1APLC 5CADA 2MNGA 4CDUB 1MACA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3DN7 A;  1QXJ A;  1ZZ8 A;  2HKX A;  1CAU B;  2FQP A;  5FLJ A;  4R52 A;  4A2U A;  1RUO A;  4OLL A;  1OI6 A;  1VR3 A;  2GU9 A;  1UPI A;  1SQ4 A;  5KHJ A;  1YUD A;  5I0U A;  4JTN A;  4MUV A;  5C6C A;  3ELN A;  5J48 A;  1VP6 A;  1QXR A;  1CAU A;  5JAX A;  4F7Z A;  2Q1Z B;  4Q0U A;  2PTM A;  2UYB A;  2O8Q A;  4XFG A;  5BUV A;  5JSP A;  4KU8 A;  1VJ2 A;  4IEZ A;  5LRR A;  1CAW B;  4MGI E;  3RNS A;  3I54 A;  3BB6 A;  3SHR A;  3H9A A;  5I0S A;  1O3Q A;  4FAG A;  1WA4 A;  5I0R A;  5KBF A;  4HBN A;  2OA2 A;  4UBH A;  2EAA A;  4BH9 A;  1CX4 A;  2H0V A;  2PYT A;  2PHL A;  5I93 A;  3LA2 A;  4JV4 A;  3VHR A;  2C0Z A;  3UKV A;  2XL9 A;  3H50 A;  1PM7 A;  4QMA A;  3LA7 A;  4BHP A;  5JCT A;  3LOI A;  5KHH A;  1L3J A;  4I02 A;  4PIY A;  1CAX A;  1CAV A;  4AVC A;  4KWL A;  4QM9 A;  4HN1 A;  1X82 A;  4Q0V A;  2I45 A;  4X6Q B;  4IEX A;  4MGY E;  4I09 A;  3H1Y A;  5I8T A;  4P9G A;  2WC2 A;  3SMH A;  4YAR A;  4MGK E;  2UY8 A;  3WW1 A;  4WVZ A;  1ZZ6 A;  4J1W A;  4ORF A;  4IEP A;  3WW3 A;  5T3N A;  1RUN A;  3H8U A; 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 4HVR A;  3IBM A;  4D7S A;  4YNI A;  3HUG B;  4IER A;  3BPZ A;  3NJZ A;  1O3T A;  1RL3 A;  4LA3 A;  4YYO A;  3S7E A;  1DGR A;  3E6C C;  2E9Q A;  2GAU A;  4YRD A;  1U12 A;  4JVA A;  2Z69 A;  1UCX A;  3C3V A;  1NE6 A;  3U10 A;  2H6C A;  2BNM A;  3H3Z A;  3NKT A;  2QCS B;  2PA7 A;  1O5L A;  4L11 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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