2Z2SB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
193
structure length
182
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRDPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RpoE, ECF SigE
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 40
structure length 182
sequence length 193
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2z2sB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2z2sB02
4I09A 4KWJA 5CVRA 2DCTA 1CAVA 3JZVA 2Q0AA 3CLPA 4PIZA 3DL3A 1RTVA 4EWAA 2UY9A 2OZ6A 3CEWA 3OTFA 5I8TA 1RC6A 4EWEA 1ZZCA 3KCCA 4PIXA 4L11A 4XF0A 4LEJA 1NZCA 4AQ6A 1CAXB 3SHRA 4QMAA 4KWLA 2MPFA 4XFAA 1V70A 1CAXA 5I0SA 3LA2A 2HKXA 2O8QA 1TQ5A 2ET7A 3CO2A 2D40A 4D7TA 3ST7A 3CL1A 5E1RA 4HVQA 3UKVA 3NKTA 2K0GA 2XLFA 3MZHA 2WFPA 3FHIB 5D1IA 1QXJA 1O5UA 4EV0A 4N9IA 3NVCA 3NJZA 2B8MA 1OMIA 4BHPA 5F1RA 1IPJA 4JTOA 1ZX5A 4BH9A 2Z2SB 2PFWA 4XF9A 1X7NA 3H3ZA 4WBBA 5FPZA 2PQQA 2UYAA 3ES1A 4HZFA 1ZZ6A 4Z82A 5EFUA 1NE4A 4MV2A 1ZZBA 4XFGA 1SFNA 2IXLA 1ZRFA 2EVXA 4IETA 1WA4A 2XKOA 5KHGA 4D7SA 2PHDA 5T3NA 1GQGA 2QVSB 4KU8A 3SCGA 1NE6A 3DKWA 3H1YA 1U12A 1IPKA 4IEVA 3RYPA 3WW3A 4XF1A 2IXKA 4E2GA 4JVAA 4XFFA 4I0AA 4LA3A 5FLIA 3FX3A 1QY4A 3ACLA 2PTMA 3R6SA 1OD5A 5J48A 1O5LA 5JR7B 3GBFA 4O9GA 2F4PA 4XFCA 1J1LA 1LRHA 4XF3A 3H7YA 3NL1A 5CU1A 4H7LA 3HUGB 4Q0SA 4HLTA 3U10A 1I5ZA 3ROUA 3M70A 3I7DA 4HN0A 5BPXA 4JV4A 1DGRA 1J59A 4MZUA 2KXLA 3ES4A 3E6BA 2QCSB 4XFIA 2FQPA 2OYZA 5JSOA 4EWDA 2N7GA 1SQ4A 2UY8A 5FLHA 1Y3TA 3KGLA 4MH0E 3RYRA 3EQEA 1NXMA 5K8SA 3BPZA 2ZKLA 1J3PA 1ZREA 4QGMA 3CF6E 4JTNA 4IESA 3BALA 1CX4A 2Z69A 4KWKA 5FCCA 1UIKA 2B9UA 4Q0VA 5KHKA 1YFYA 5E16A 2D5FA 2XL7A 2XLGA 2H0VA 3HIFA 3LA3A 4UXAA 2IC1A 3ELNA 1YLLA 2OPKA 3FE5A 3RDIA 3UKNA 1VR3A 3E5UA 2H6BA 2EA7A 1YHFA 2WC2A 5LRRA 4LUMA 4X6RB 1RUOA 4P9GA 1UIJA 5LEJA 2O1QA 3EBRA 3RZZA 1EPZA 4E2SA 4J1XA 1YFWA 5LEKA 4FT8A 2PA7A 3IBMA 4IEZA 5JCTA 2Y0OA 4HN1A 2UYBA 1RUNA 4B29A 3L2HA 4MGIE 4KU7A 4YYOA 5J3UA 3B02A 4LTAA 1YFXA 3ETQA 3MPBA 3UKTA 2MHFA 3EO6A 3S7EA 3FZ3A 2GH2A 4ORFA 3OGJA 3KGZA 2GC2A 2D93A 3MYXA 4F8AA 1OFNA 4XF4A 3VHRA 5I91A 4QM9A 3OCPA 3I54A 2C0ZA 1J3QA 2BGCA 2GU9A 4R8HA 5KHHA 1H1MA 1O3QA 1ZNPA 3OF1A 5EZWA 1UW8A 2VECA 4HVOA 5C6CA 2I45A 5KBFA 4PIYA 1DGWA 5I0RA 5HI0A 4XETA 4N9HA 1ZRDA 5FPXA 3E6DA 2B5HA 1Q43A 2FMYA 2V09A 3GYDA 2XGXA 3ZDSA 4WVZA 3BU7A 2XLAA 1YUDA 3DN7A 5AVPA 1FT9A 4MGZE 1X82A 1DZTA 3IDCB 2BNOA 4FBFA 1L3JA 4ZU7A 2GC1A 4HSLA 2ZCWA 3E5QA 2GC0A 1Q5OA 2GC3A 3C3VA 1XRUA 1H1IA 3E97A 2IXCA 5JSPA 4UBHA 2PHLA 3NW4A 2OZJA 4HVRA 4NVPA 1CGPA 2IXHA 2XL9A 3RNSA 1PM7A 3LA7A 4HSJA 3D82A 2ETEA 4I0BA 4AVCA 1LB2A 5C8WA 2CGPA 4ZU4A 4Q0QA 2IXJA 1LKNA 2Q4SA 2EAAA 3BCWA 4I2OA 2BNNA 4QGLA 3D0SA 4TLFA 1CAWB 4Q0UA 4ZU5A 2GAUA 4QM8A 4IEXA 1O7FA 5FQ0B 3LZZA 4QGNA 2P17A 2BEOA 3WW1A 1CAWA 1O3TA 3H3UA 4MGKE 5BUVA 5FQ0A 4Q0PA 3H8UA 4HMZA 3H1MA 4BYYA 4IEQA 4Z07A 1YWKA 3DV8A 3IIAA 1UPIA 4OFGA 3LAGA 4K8FA 3KMHA 3U11A 3FJSA 2PYTA 4I02A 3MDPA 3H50A 1YFUA 4LULA 3G7DA 4AXOA 5FLJA 3S7IA 1QXRA 4E2QA 1SEFA 2VPVA 5CADA 1VJ2A 1RL3A 2HJIA 4LLOA 4LUKA 4XFHA 2QJVA 3U0ZA 4IEUA 1J3RA 1UCXA 2XKPA 3OD0A 1I6XA 3S0MA 4ONUA 3FFQA 4PJYA 1PMIA 2QDRA 3SCFA 1O4TA 1ZVFA 4OLLA 2Q30A 5I0UA 4CYDA 4AVAA 4RD7A 5KHIA 1Q3EA 4HBNA 2QNKA 4YRDA 4I3PA 1XE7A 2Q1ZB 3I59B 1ZRRA 1ZZ9A 5BXXA 3IDBB 3SMHA 5J7MA 1O3SA 3HQXA 4J1WA 4R52A 4EROA 1EP0A 3I59A 3TNQA 3N4MA 2E9QA 2K9ZA 1FI2A 2CV6A 4F7ZA 4FAHA 3H9AA 5FDBA 4IEOA 1FXZA 1QWRA 1OI6A 4MUVA 1RGSA 2BNMA 3E5XA 4O9EA 3IWZA 4AQ2A 4YARA 1LR5A 2MNGA 4A2UA 2CAVA 2VQAA 1JUHA 1WGPA 2PAMA 3KSCA 4Q29A 5BY5A 4QXKA 3CJXA 4FAGA 1G6NA 5LRSA 3E6CC 5I93A 1WLTA 3HT2A 3SXWA 3LOIA 3TNPB 3EHKA 4LA2A 3PLQA 4YSFA 2ET1A 2XHKA 2BYVE 3RYKA 3LWCA 4UBGA 3PNAA 2PAKA 3SCHA 4QX5A 2H6CA 3USSA 1O3RA 3EJKA 4YNIA 4WZCA 3M3IA 2D5HA 1X8EA 1NYWA 4GULA 4L2NA 1ZZ7A 1XE8A 2GZWA 4XEZA 2IXIA 1CAUB 1GQHA 3HT1A 1ZZ8A 3WW4A 1VP6A 5BV6A 5JSRA 5I0TA 3PVBB 2PAEA 4IEWA 5I8YA 3H1WA 1UD1A 1CAUA 1HW5A 4AVBA 4META 5I8SA 1J58A 3D0JA 4XFBA 3O14A 3QOPA 5JAXA 4NQWB 1EYBA 3FWEA 4KL1A 4DINB 2OA2A 4BIFA 4MGYE 5KHJA 2CAUA 3BB6A 4IERA 1Y9QA 3NSTA 4I01A 4IEPA 1EY2A 4IEYA 4MX3A 2ATFA 3WW2A 1X8MA 1CAVB 1DZRA 4X6QB 3QACA 3RPQA 1ZRCA 3H7JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CLQA 4CEWA 2R5YB 4OI2A 3E6MA 2LY2A 3K4MA 5K5QA 1XSQA 2A6VA 1QJY3 3OIQA 1JYTA 4GQ7A 4IEJA 1PGW1 2R7EB 1FATA 4XK4A 1CPNA 4KGQA 1UG2A 1C8M3 5KAFC 2XBO3 1U3EM 2X51A 5KCMA 2PLYA 3FHIB 3V8KA 4LPLA 4EV0A 3VBFC 4XCAA 1VI0A 3UESA 3BR0A 5FZMA 4LK7A 2AH2A 4HT1T 1G9CA 1SFXA 1YW9A 3ZN0A 4J00A 4M01A 3WV6A 1ZZ6A 3PQJA 2ZBJA 5CVIA 3ECOA 2P6TA 4MV2A 5CFCC 1ND2C 4XLHA 5E89A 4LBQB 3J7HA 3ZYFA 3CJNA 4KU8A 3H1YA 4Q4Y1 3L2CA 4RAYA 3CJIB 1DP3A 3MKZA 2FNPA 2DUOA 3DKQA 5FGMA 1JMUB 5FY0A 5DABA 1H0MA 1A36A 4LK1F 4FPKA 3VOEA 5DCFA 2G1MA 3WHUA 1NQJA 3DYPA 2QGUA 3NEUA 3CZ6A 2PHRA 2WAOA 2HYFA 3N7LA 4OI1A 1DU6A 1LOEA 1BIAA 2EIMH 5A2QZ 4KISA 3TEXA 4GH4A 1VQ9I 2R7VA 4U0WA 4Z92B 1YEWA 2GQQA 2KDOA 1UXXX 2QCSB 2YGMA 3JRCA 3KPHA 2W24A 4RB0A 3RJRA 4XKWA 4XICA 1NK3P 2YR2A 2JQ7A 1MQTC 2P6HA 2FBEA 3MZYA 1C1LA 1PNGA 5LLQA 2FF4A 2DDBA 3T09A 4Q0VA 1MBJA 1EUTA 1QNWA 3TN93 4A0XA 3MO4A 2WC2A 1RUOA 1EH7A 3LIGA 1UIJA 1XNBA 3ZYRA 1FPN2 3UV9A 1WLCA 2QSGX 4CZZA 1RUNA 2WR9A 3BPXA 1TLHB 2NNNA 3LSMA 3GCWA 1AR73 3J7NA 2MHFA 1I5PA 3HOUJ 4A44A 3OSGA 3UKGA 3A03A 3MAJA 2ADUA 4AEJA 2R5ZB 4F8AA 4NRPA 4QM9A 3DFGA 1V6NA 1WSUA 3TL4X 4KMUX 3MFKA 3U2RA 5BNNA 4FHTA 2WRAA 4HVOA 3D5SC 1UY2A 4GDFA 2ZNYA 5LGUA 3CMEI 4DNYA 2QF7A 4Y26A 5FV3A 3U1KA 1TMF1 3WU0A 2XAGA 1W5CC 2VXRA 4D8MA 1LHUA 2DW4A 5CYYA 2JDYA 2PLV1 4YW5A 4C8DA 1LOAA 3A1YA 4RS8A 1GHCA 3OV8A 3QH6A 5A7WA 5FMBA 1N1TA 2P3KA 3WNMA 2TBVA 2ZGRA 3K77A 3FUQA 3O1RA 2IXHA 1WW7A 3RNSA 4RR3A 4YZ5A 5HV0A 4MXWA 5T54A 3GHMA 1IN8A 5C8WA 4CDWC 4M9SA 4M6YA 3BTXA 2E31A 4I2OA 2GNBA 3OYAA 2WABA 3S5QA 3V42A 4QDSA 2V1XA 1EH8A 4QM8A 3T5XA 1GFF2 2J7MA 5FKKA 5F2SA 3H8UA 4OIPF 1NCRB 5B4XA 1XNCA 2VJJA 1YWKA 2WYFA 5GLUA 1RI7A 3KMHA 1EA3A 1PZ7A 1WD3A 3K4JA 5K7PA 4BJTA 1VJ2A 3FHNA 4JAAA 3ZX7A 4HF2A 1D2QA 4LFUA 2P4EA 2FBHA 3GGLA 4CCNA 2HFHA 3M3QA 5F3IA 1DG6A 2ARCA 3S1MJ 1FY7A 2HOSA 4XSZF 1JUIA 2VGDA 3HQXA 1ENXA 4XTMA 4EROA 2VOKA 4JOMA 3OYLA 5HXMA 2DMTA 3N9QA 5J8FA 4F7ZA 1C8NA 2LTPA 1FBQA 4E7JA 1DDNA 2VI6A 4A6EA 1MBHA 4MHRA 3X29B 1LKXA 1VRH2 1B4AA 3HQRA 2NOJB 4RA0A 4QB6A 1UYPA 3QH7A 2D3SA 5F0CA 4HBLA 1BMV1 1O8SA 3S17J 4BL0B 3JSOA 4B3XA 4PCRA 4LGWA 3N36A 3C7JA 2GXBA 3POJA 4HKOA 4Y1UA 3AXEA 1WRJA 2IEKA 2R6QA 4Q2FA 3LNQA 4FCYA 4ENJA 3TDZC 1BI2A 4LO8A 1H9PA 2BFUS 1JHNA 1RUG2 4K40A 1ZR4A 2VJ5A 3CCJI 1AX0A 1W9YA 2OPTA 1BOBA 4DY3A 1BR4A 4NRMA 4H14A 1VAKA 1B1BA 4DNCA 1PZ8A 1Q1VA 3A02A 1U8BA 3M4FA 5EJ3A 1RUJ3 2KM2A 4E7HA 3POFA 2M5WA 3WF4A 2OTJI 4M4PA 1FMWA 5DUVA 2MBFA 4WXDA 3SDBA 1S0DA 4BBSJ 4QXHA 1HN1A 4PJNA 1JOPA 5FZDA 2K9MA 1ODNA 4OZOA 5KK1A 2QQVA 5T52A 2MGQA 5T5PA 2IA1A 1REEA 3QACA 4F3QA 3TOAA 2NQYA 1ULGA 2Y30A 3DL3A 1J9IA 5BPIA 2NNYA 4IF4A 4XF0A 2LYCA 3LSRA 5DUUA 4CDXB 2ZS6B 2WA4A 2W08A 2P0WA 1YE9A 5ACA3 1KU3A 2J1EA 1Q8SA 4LMFA 3EUKL 4BQXA 4NHYA 1FOXA 3BOQA 2M4GA 1UPSA 2QYOA 2QENA 1Q8QA 2VMCA 5FXZA 2QBXA 3SZTA 2WLQA 3K7AJ 3BTJA 1GKBA 5J3LA 3IC7A 1B35B 3AG3H 4BA6A 2HYGD 1I39A 5JXJA 2HVQA 2QSHX 3WHBA 2Q8EA 2ZGMA 5GZDA 1QPMA 3S93A 5IVYA 4A45A 4G7OF 5IT9Z 1ZZBA 2OBPA 6PAXA 5J40A 3D6EA 1COV1 1KFUL 3MUY1 5DDJ2 1KU7A 3MLJA 2DFBA 2IA2A 3IH2A 3SCGA 2GALA 4GAZA 3DEEA 4ZYEA 2XDVA 1EPWA 3ZXKA 1BK1A 1L7QA 4HSTA 1QY4A 4Q4Y3 1R36A 1ST8A 2ETHA 1A6QA 4PJLA 3JB4C 3M1EA 2HI3A 3BKZA 1OCTC 4MQ9F 3OS2A 2RR12 3GFJA 2RDQA 1VBA1 4QPIB 2CQXA 4BS9A 1W2UA 3T0AA 5BPXA 4NHXA 3PIOF 5CAZA 3FHQA 5CKTA 2DA3A 4ZXKA 5HCFA 1MS8A 1PUFB 3E7LA 2YC0A 2CW0F 2KZGA 4RLFA 3WCRA 3NAPB 3T3YA 4D0QA 3WG7H 1OQYA 5C4XJ 5FZ9A 5LBEA 3PO3J 4AFBA 2KIUA 2W4SA 3HSEA 1J3PA 4R9CA 4OAYA 4LMYA 1PO21 2D45A 5DXDA 1DU3D 2JA7J 2DJNA 1MZBA 5F64A 1I3QJ 3LCPA 3VBOB 5K5RA 2XF6A 3VDBA 2O14A 3N9NA 5FZGA 1G86A 3JRGA 1IDYA 5HPOA 2EA4A 2JK3A 3BG9A 1RUH1 4LR4A 3TGNA 2QTWB 5BS6A 3S2HJ 3JD73 2VZUA 3MLLA 1MACA 3UL2A 2QZ2A 4MEXF 2GH2A 1HXS2 2VXDA 1H0BA 2VMDA 4J19A 2HPIA 4XRSG 3VYUB 4P5YA 2VW2A 2B63J 3CO6C 4V2VA 3KD4A 2YV8A 4B1LA 1W8HA 4OUMA 1W4MA 4ZZ8A 5F5AA 1S1AA 3H9GA 1TG7A 2E2JJ 4ASKA 2FMYA 3C2GA 1EKEA 4UFJA 3IAM2 1QHHD 1JYVA 5BNGA 1XGMA 1IRFA 4ZC3A 1SBEA 3KEQA 3GTOJ 1TMF3 2M87A 1CJDA 1W8TA 5H9RA 3ZMDA 4ZU7A 4PLNA 3HHGA 1PGW2 3HBLA 2HOTA 4YIRX 2PLV3 4HG6B 1UOFA 2P3YA 1AXKA 2UZKA 3S14J 1TE1B 2VBWA 5ISLA 5FZBA 5JSPA 2BPA2 2LKXA 3AYEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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