2Q1ZB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
193
structure length
185
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRQIADPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
molecule keywords RpoE, ECF SigE
total genus 36
structure length 185
sequence length 193
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2q1zB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2q1zB02
3BCWA 3H1MA 3TNPB 1H1MA 2E9QA 4EWEA 4XEZA 3HQXA 4F7ZA 1SEFA 3EHKA 5JSPA 4KL1A 2XLAA 5FPXA 2HKXA 3JZVA 2CV6A 1QXJA 3HUGB 2I45A 5FQ0B 3S7IA 3IBMA 1ZNPA 1O7FA 3PVBB 5EZWA 3KCCA 1UCXA 1NE6A 2Z2SB 3ES1A 3KMHA 3LA3A 1VJ2A 4JV4A 4HMZA 1CGPA 4D7TA 3H7YA 2D93A 3CEWA 1RC6A 1RUNA 3WW4A 2OA2A 1SQ4A 4AXOA 4JTOA 5JSRA 3CL1A 2MNGA 1ZREA 3CO2A 3RNSA 4XF0A 4FAGA 3CLPA 3E6DA 2BYVE 2UYAA 4QX5A 1GQGA 3OD0A 4IEVA 1J3QA 4YSFA 4FBFA 2WFPA 4D7SA 2P17A 2GAUA 1O3RA 3SCHA 2ET7A 3DV8A 4O9GA 4PIYA 1UPIA 2EVXA 3BALA 3D0JA 4I02A 2PAKA 1O3QA 3D0SA 3HT2A 4MGYE 4UBGA 5BPXA 3H9AA 4LTAA 3QACA 1DZTA 5I0TA 1PM7A 2BGCA 2H6CA 1LB2A 4XFFA 1YWKA 4ZU7A 4N9HA 3U10A 5J7MA 4ZU5A 3IDCB 4XFIA 5FPZA 3ROUA 3E97A 4IEYA 1IPJA 2D5HA 4QM9A 3ELNA 4MV2A 4EWAA 4K8FA 1SFNA 3E5XA 1FT9A 2IXJA 4HBNA 3IIAA 3EO6A 4IEPA 2XL9A 2OPKA 2XLFA 4XF9A 3H7JA 1ZZ8A 2B5HA 5LEKA 5I91A 4HVOA 1EY2A 1J3RA 1ZZ9A 2XL7A 3DN7A 4YNIA 4A2UA 2EAAA 3RYKA 4UBHA 5I0RA 3SXWA 2BNNA 1FXZA 3BB6A 4QM8A 2CAUA 1H1IA 3H3ZA 4EROA 2CGPA 3MPBA 1CAUB 4XFBA 3R6SA 4XFCA 3ES4A 3NJZA 3E5QA 4IEXA 3RYPA 3VHRA 4HN1A 2GC2A 1ZRFA 2D40A 2PAMA 5CU1A 4MUVA 5FLJA 4FAHA 4EV0A 2ET1A 4MGKE 5I0UA 3H1WA 5KHIA 1CAXA 3TNQA 1NE4A 4MZUA 4LUMA 2XGXA 4IERA 3UKTA 4LUKA 4AQ2A 3WW1A 4Q0SA 2IC1A 3L2HA 1QY4A 3ZDSA 4AQ6A 4Z07A 4WZCA 2PFWA 4N9IA 2PAEA 4IETA 3H8UA 2MPFA 5D1IA 4QGLA 1CAWA 2Q4SA 2PHDA 3BPZA 1HW5A 1NZCA 1Q5OA 3GBFA 1NYWA 4L2NA 3M3IA 4I01A 3I59B 3RPQA 1FI2A 1I6XA 1Q43A 3B02A 4UXAA 4R52A 5FLIA 3WW3A 1L3JA 3KSCA 4Q0QA 1G6NA 3CF6E 4H7LA 1GQHA 1I5ZA 4YARA 1YHFA 1QXRA 2HJIA 1UW8A 5LRSA 4XF4A 3H50A 4YRDA 2ATFA 4HVQA 2DCTA 1ZZCA 2GC0A 2GU9A 2Q0AA 4IEUA 4E2SA 1X7NA 1CAVA 4Q0PA 5E16A 1EYBA 4IEZA 3KGLA 3NSTA 3OF1A 4OLLA 4PIXA 2XKPA 1U12A 3KGZA 1ZRCA 2VPVA 1O5LA 4YYOA 5HI0A 2K9ZA 3SHRA 3FJSA 4NQWB 3U11A 5JAXA 1RUOA 1EP0A 1RGSA 3MZHA 1IPKA 1X8EA 2C0ZA 3OGJA 5C8WA 1X82A 5EFUA 1J59A 3PLQA 3H1YA 4BHPA 2QCSB 2GZWA 2Q1ZB 2GH2A 4MGIE 4OFGA 5FQ0A 2VECA 4QMAA 2XLGA 2CAVA 3C3VA 4MH0E 3OCPA 4Z82A 3DL3A 1OD5A 1ZZBA 2BEOA 4XFGA 5FLHA 1XE7A 3LA7A 3FE5A 5KHHA 5J3UA 3DKWA 2K0GA 2WC2A 4XETA 3U0ZA 1PMIA 3FWEA 4Q0VA 3E6BA 1ZVFA 1RTVA 1LRHA 2Z69A 1Y9QA 1XRUA 2OYZA 2XKOA 3S0MA 2XHKA 4WBBA 2Q30A 3LAGA 3IWZA 3LWCA 4AVCA 4ORFA 2QVSB 5K8SA 4HSLA 3I54A 1YFWA 3MDPA 3NVCA 4J1XA 4LULA 1O3SA 1UIJA 2Y0OA 4FT8A 3N4MA 1O3TA 5T3NA 3OTFA 1J3PA 4ONUA 2H6BA 4NVPA 4IEWA 3ETQA 1YFXA 4IESA 4I09A 4P9GA 4AVBA 2GC1A 2IXIA 1OI6A 3NL1A 2KXLA 2IXKA 5C6CA 4TLFA 1YFYA 1QWRA 4R8HA 4XF3A 1JUHA 1O4TA 2B8MA 2O1QA 4GULA 3USSA 3BU7A 4CYDA 3SMHA 4LA2A 1VP6A 4KWKA 3FX3A 3LZZA 2PYTA 1V70A 3WW2A 2UY9A 4QXKA 4X6RB 4BH9A 5I93A 4O9EA 3O14A 3QOPA 4KWJA 3RDIA 3G7DA 1ZX5A 3FFQA 1DGRA 3MYXA 4PJYA 4IEQA 4XFAA 1O5UA 2IXLA 2ETEA 1LR5A 1WGPA 2BNOA 1NXMA 4AVAA 3HIFA 4LEJA 4META 4HVRA 4QGMA 3S7EA 1OMIA 1CAUA 1ZZ7A 4Q0UA 3SCFA 2OZ6A 3H3UA 3E5UA 5LEJA 2D5FA 2IXCA 2FMYA 4HSJA 3RZZA 4E2QA 1DZRA 4HLTA 4I0AA 4E2GA 5FDBA 4B29A 5BV6A 4I3PA 5KBFA 5KHJA 4KU7A 3FZ3A 1Q3EA 4HN0A 4KU8A 1RL3A 5BXXA 4L11A 3GYDA 1CAXB 2PTMA 2QNKA 1X8MA 5JSOA 2EA7A 4LLOA 1Y3TA 1UIKA 2B9UA 5FCCA 1YUDA 3UKVA 4PIZA 3E6CC 4I0BA 5J48A 5KHGA 1TQ5A 2PHLA 4F8AA 2IXHA 1YFUA 5CVRA 3FHIB 2ZCWA 1LKNA 5CADA 1CAWB 1DGWA 3I59A 1UD1A 4XF1A 2QDRA 1ZRRA 3D82A 3IDBB 5I8YA 4JTNA 4DINB 1OFNA 3ACLA 3LOIA 1J1LA 3PNAA 2BNMA 2QJVA 1ZZ6A 3CJXA 4QGNA 5JR7B 4HZFA 1XE8A 1WA4A 5KHKA 5F1RA 2MHFA 4WVZA 2OZJA 4LA3A 2ZKLA 4BIFA 5JCTA 1VR3A 1EPZA 1CX4A 4J1WA 3RYRA 4ZU4A 4JVAA 4BYYA 5E1RA 2FQPA 5BY5A 4X6QB 4KWLA 2VQAA 5I8TA 3NKTA 5BUVA 5I8SA 3HT1A 2GC3A 4XFHA 4EWDA 2PA7A 3I7DA 1CAVB 3EQEA 3NW4A 5LRRA 1J58A 2N7GA 3ST7A 2H0VA 2UY8A 4I2OA 1WLTA 1ZRDA 2V09A 3UKNA 4RD7A 2UYBA 3LA2A 3SCGA 2PQQA 5I0SA 4MX3A 4IEOA 4MGZE 3EBRA 3EJKA 2O8QA 1YLLA 2F4PA 4Q29A 3M70A 5AVPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CJIC 2CWSA 2LYCA 2BPA2 4MXWA 1SEFA 4IHVA 5I0DA 4WM7C 1P4AA 2HWF3 3J7AO 3OYJA 2YPDA 4XLPF 1PUEE 4P5YA 2E2JJ 3AP4A 3MKYB 1LODA 3WF1A 3ES1A 4XVHA 3F95A 2VMGA 3S1NJ 4BJ0A 4JV4A 3ME2A 2WFF1 1E5HA 4O61A 1PX4A 2RNJA 2RKHA 1BQPA 1A35A 2EH3A 4ZY9A 1MQTA 5JXHA 1YIFA 4IL7A 4LK6A 1ZELA 1EF4A 4IEVA 5LA0A 4R9AA 5FMCA 3WF2A 1DGRM 4FBFA 3WTVC 1Z7UA 2ZMLA 5EWSA 5CB7A 3DV8A 5BNOC 3MD2A 1YO8A 4GQ7A 5ACA2 4LB5A 4UFJA 1SFUA 1LB2A 1TE1B 2X85A 3OL3A 1TWFJ 4C8DA 3DQVC 3ZMUA 4DYQA 3VBHB 3HJEA 3UGGA 3WLUA 1TMF2 4N7IA 4BE1A 2W24A 3LSJA 3V0AB 4YVSC 3NV4A 1GT0C 2OPKA 3ZVXA 5FMBA 3OPZA 1EY2A 1ZZ9A 2RDSA 4QPQA 2XONA 1IAWA 4UBHA 5J47A 3WR0A 1YXWA 3ZR6A 3H3ZA 1M06G 2MFZA 4CP2A 1QGLA 3OYCA 5F5CA 3PUHA 5FLJA 3ZSKA 4EJRA 2M4KA 2WZR1 3IB3A 5EZGA 3AFGA 3L2VA 2XGXA 4IERA 3ZN6B 4P9LA 1DF0A 1QY4A 3G4SI 4XQWA 2PAEA 2WQ4A 2W95A 3HEFA 3K4AA 1S7EA 3OY8A 3EMRA 3LQQA 1B35C 2WT0A 1YO5C 2OVUA 1OQYA 1AXKA 3HOBA 4HSTA 2WS91 1Y43B 1I6XA 3FBIB 1ZA7A 3BQYA 2FJ1A 5FRAA 2XQRA 5FPAA 2XDVA 3H92A 4LKEA 3ZQLA 1R7JA 2DCTA 1SD4A 2E1CA 2R6QA 2KIFA 1U6GA 1JE8A 5JXIA 3WGHA 4MADA 1GP6A 4YG3A 3MLJA 5L19A 1ZQ3P 1JU3A 4KT5C 2CW0F 3I2HA 4KQ7A 2BFUS 1RUD3 5A3UA 3OGJA 3VD7A 1USTA 3M4FA 4MHUA 5D8KB 4KJZA 1RMU1 1IKQA 3ZLIA 5H9QA 4HX7A 3OPTA 2CAVA 2GQQA 2ZMNA 1FMWA 1ZLJA 3Q8BA 1OISA 4JHTA 4ZHNA 1DG6A 3GEZA 4DY3A 4XSXF 2OW4A 1FOYA 2VUMJ 3VD5A 3FWEA 4S2HA 1YG2A 4J25A 1ON2A 1ZARA 1Z7S2 1W99A 1V6IA 2DK5A 4AIJA 1HIXA 5C3QA 1ERDA 4AF9A 3BJAA 1F9NA 4JQRA 4CU8A 5A6YA 1IN7A 1K5MC 3DYPA 1OCTC 4GKXA 3VV1A 3PFIA 1SANA 3MMYB 4PHZA 5FPVA 2RVAA 3W5NA 3TL4X 3HVDA 5H20A 3KM5A 1UWWA 2EWNA 1QWRA 1HN0A 1JUHA 2B8MA 3VKNA 2FUG2 1HQWA 3ZXEA 1NAEA 2ZS6B 4GD4A 4HX4A 2YU9J 2CU5A 1GZTA 4X6RB 3ASNH 1A04A 4FPLA 2FEZA 5GZGA 3BZ6A 3KF5A 1K83J 5JWPA 4AIKA 3K3OA 3OY9A 4PQQA 4XJUA 1R6RA 4Z2WA 3IV5A 2JMWA 2LS6A 4OZXA 2JDZA 4XZUG 1KGYA 3AXEA 3DECA 3BTXA 1NG6A 3ZRGA 4ARXA 1WRJA 2IS1A 4QPIA 4HSJA 2Y2ZA 3TGNA 2EFQA 4Q8LA 5JUVA 3POYA 4I3PA 1U5TB 5KHJA 2BBVA 3I4IA 4BBRJ 3DKXA 3GHMA 2VMDA 1SPPB 4QQPA 3DU5A 3BG6A 2B9UA 2VOXA 1K61A 2KISA 3GBGA 4V2VA 3BTZA 3HNMA 4XLAA 3E6CC 5D5WB 1N3OA 1X3ZB 4LLLA 2QQIA 3CZUA 1VBA1 2BFUL 3I2KA 1FMD3 2QDRA 4DYCA 2HOSA 2GNBA 4D0PA 3RZOJ 1LEDA 3KETA 3ACIA 2MEV2 2KP6A 3TEYA 4MXVA 4LA3A 2W68A 1MJAA 3A2KA 5J4YA 2VUDA 3OBTA 2K9MA 5BY5A 2W92A 4QQLA 5I8TA 1YIPA 3HT1A 1TLHB 3RSNA 3W21A 3EQEA 3LOCA 3U07A 3WV6A 4RA2A 3N9NA 2JD9A 5HS9A 3ST7A 2UY8A 1ZRDA 3UKNA 2F4MB 3HZJA 5IK5A 4KN7X 2A6WA 1HB3A 1XOYA 4FQGA 4QWNA 4M3BA 2BRTA 4Q29A 4FP3A 3TNPB 4N90A 1UXZA 3ZO0B 4RBOA 3ENRA 3EHKA 2EZLA 3VYTB 2IGMA 3MKWB 1IRXA 4BPZA 5LLQA 3C7HA 2AS5F 1H9TA 3S7IA 1MR5A 2OAZA 3AMHA 1SCRA 1ZG3A 1C1FA 2ZFWA 3TMOA 3SDBA 4O7XA 2ZX0A 4LO5B 1IG3A 5LGNA 2R16A 4OHZA 1QNWA 1ODDA 5C4JJ 5ABJC 1CQ9A 2ZPXA 1PNFA 5IK8A 1PO23 4XF0A 4IUGA 1COV3 2BYVE 3CMEI 1RUJ1 1YW9A 1W6MB 3UJOA 1VF9A 2EFOA 2RS13 2ZXIA 2Z1DA 3K7AJ 4L5JA 1MGTA 2ZGSA 4BEHB 1W8ZA 1LEMA 2LUWA 3Q9OA 2BGPA 1NX9A 1OQ1A 5C9AC 5BPIA 4MTDA 4D5CA 3ASOH 4Z2YA 4JGZB 1C0WA 1UYXA 4ET7A 3CUOA 1EV12 2R042 3ZSJA 1X1CA 1QJX2 1UY0A 3F72A 4N7UA 4NHXA 2P4WA 1NHAA 2H6CA 5E1XA 4A0XA 2LFBA 2FDKA 1V5GA 3ZSEA 4B7KA 2EIJH 1TME1 3FXQA 1XJAA 1UZ0A 3VZJA 3ELNA 3K4ZA 3IN9A 2JXAA 2IXJA 2QVOA 5CFDB 3QPHA 2ADEA 2XL9A 2JJ7A 3G73A 1QVUA 1G9CA 4HVOA 3M3CA 1J3RA 5FYSA 3GDBA 2LP0A 3ZSLA 3IPVA 3ULQB 4YW7A 4ZH4F 1G59A 1AL21 1DGWX 1QEXA 4PDWC 4DNYA 3ONQA 1R58A 4Q4V3 4U7BA 3A4UA 1DGRN 3NV1A 4WX9A 3MW3A 4B1LA 1GWMA 5C70A 2Y30A 1PO12 3HN3A 4M9XA 5BYNA 4UFHA 4RR3B 1QPMA 3N9PA 4IHSA 2JDAA 4HNVA 1KITA 3UKTA 3OR1C 4ITVA 1GP4A 1BVP1 1ZG5A 3ZDSA 4A93J 4A7KA 3DPLC 4QAWA 1BEV2 1O59A 1O4XA 3JB8A 5FY9A 2Q4SA 4HBLA 3WUDA 3M3IA 2ZEXA 1Z77A 3I59B 1S0JA 2PJRB 4RHV3 1HDPA 2BV4A 3AYDA 3W3CA 2VC0A 1W36C 1E3HA 3CF6E 2HYJA 3JRDA 2XAJA 1ZM1A 4XF4A 4UFIA 4A3XA 3VSKA 4NAOA 2PELA 4JHZA 2DDBA 4CDUA 2ESNA 4KMUX 4QB6A 1XG1A 2BY2A 1OPCA 4YYOA 1G9DA 2DPUA 2DK8A 3SQOA 2UWMA 2L4AA 1GNHA 4P9UA 2AR6A 1RUOA 2E35A 1OYYA 2C0ZA 2HWB2 1MEC3 4G6TB 1A5JA 2JA7J 2JK3A 4A7YA 2DBIA 1PK6B 2ZTNA 2OX0A 3VHPA 2Y9YA 3AZZA 3OYEA 1DYKA 2DA3A 4OHVA 2XOMA 4BXSV 2GNMA 3LWFA 1U3EM 2J1SA 4XBLA 3A01A 3WQ1A 1JN2P 1FIPA 2ZO4A 4QDRA 2RGVA 3THCA 3CIHA 5DV5A 2M0CA 3OGSA 4JRAA 3MIFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2PA7 A;  3I7D A;  1CAV B;  3EQE A;  3NW4 A;  5LRR A;  1J58 A;  2N7G A;  3ST7 A;  2H0V A;  2UY8 A;  4I2O A;  1WLT A;  1ZRD A;  2V09 A;  3UKN A;  4RD7 A;  2UYB A;  3LA2 A;  3SCG A;  2PQQ A;  5I0S A;  4MX3 A;  4IEO A;  4MGZ E;  3EBR A;  3EJK A;  2O8Q A;  1YLL A;  2F4P A;  4Q29 A;  3M70 A;  5AVP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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