2Z2SB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
193
structure length
182
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRDPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Rhodobacter sphaeroides
molecule keywords RpoE, ECF SigE
total genus 40
structure length 182
sequence length 193
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2z2sB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2z2sB02
4HZFA 4MGKE 5FCCA 1L3JA 4HN1A 2BGCA 5I8TA 5J3UA 1YFWA 2BNMA 1TQ5A 5CU1A 4R8HA 4NVPA 1WA4A 4MUVA 5KHHA 1UPIA 3E5UA 1IPJA 2GC0A 3I7DA 1ZZ7A 2XKOA 2XHKA 3S7IA 5FQ0B 1JUHA 1FI2A 1SEFA 2WC2A 3I54A 3OTFA 1X82A 4MGIE 1EP0A 4IESA 4BHPA 3D82A 1RC6A 1ZRDA 4META 5JSPA 4XFBA 4O9GA 1Q43A 1Q5OA 5I0TA 4ONUA 3NKTA 3D0JA 3N4MA 2XLFA 4MGYE 1Y9QA 4EWEA 2IXHA 4AVBA 3FZ3A 4IEPA 5T3NA 4D7TA 4F7ZA 3SCFA 4JTOA 3LAGA 1G6NA 4H7LA 2XGXA 3C3VA 4AVCA 4HLTA 3U10A 4FAHA 1UW8A 1VP6A 4OFGA 3LZZA 3DKWA 2FMYA 4XETA 3M70A 5EFUA 4Q0VA 1DGRA 1XE7A 4I0BA 3RPQA 3ST7A 3D0SA 4Z07A 3WW3A 5KHKA 1O3QA 1ZRRA 4WZCA 1RL3A 4EWAA 1DZTA 1QXRA 1ZZ8A 2BNNA 4EV0A 3CF6E 3ETQA 1EYBA 1Q3EA 3FHIB 1FT9A 4E2QA 3H1MA 3VHRA 5JSRA 4HVRA 1U12A 3NJZA 1FXZA 2QJVA 3RDIA 5E16A 4I0AA 1XRUA 1OMIA 4ZU7A 4X6QB 3U0ZA 3BCWA 1QXJA 4JTNA 1VR3A 2C0ZA 1QWRA 1YUDA 4BYYA 4LA2A 4LEJA 4LUKA 3GBFA 4HN0A 2PTMA 4YYOA 1RGSA 2VQAA 3IDCB 4XF4A 2VPVA 4XEZA 2QDRA 1NE4A 4XFAA 4F8AA 3ES4A 5BXXA 3BPZA 2XL7A 3PNAA 4JVAA 3SMHA 2PAKA 4Z82A 1CGPA 1ZRCA 2ETEA 1J1LA 5JCTA 4AVAA 4TLFA 4MX3A 4FBFA 5KHGA 1QY4A 3R6SA 2H6CA 3HQXA 4IEVA 2GAUA 1Y3TA 2IXKA 1YFYA 1CAUB 2K0GA 3ZDSA 4IEOA 1LB2A 5KHIA 2IXJA 2PHDA 1SQ4A 1UCXA 1ZZ9A 3EJKA 3IWZA 3KGZA 4Q0QA 4XF0A 2GU9A 4KWLA 5I0SA 4IEUA 3E6BA 3TNPB 2XKPA 2XLGA 2BEOA 3BB6A 2B8MA 4YNIA 3EBRA 2BYVE 4HVQA 2QVSB 4R52A 2BNOA 1NZCA 4XFIA 2H0VA 3UKVA 3G7DA 5EZWA 1UIKA 2Q1ZB 2B9UA 4LUMA 2ET7A 2Z69A 3E5QA 3RYKA 3NL1A 2CGPA 4N9HA 2PAEA 3H7JA 3KCCA 1CAVB 5I8YA 5FPZA 3RZZA 2GC2A 1ZREA 1DZRA 4KL1A 1WLTA 5KBFA 2PQQA 1EPZA 4N9IA 1DGWA 3DL3A 4AQ2A 4Q0UA 4Q0SA 4IEYA 4XFCA 3CJXA 5KHJA 3DN7A 2O8QA 1LRHA 2UY9A 2E9QA 4NQWB 1YFUA 5C8WA 2ATFA 2H6BA 2XL9A 3OF1A 4PJYA 2PFWA 3KSCA 1YHFA 1ZNPA 5J48A 3KMHA 4IEWA 3MPBA 2GH2A 3O14A 3MZHA 3IIAA 2EAAA 3LA7A 4LA3A 4LLOA 5K8SA 1V70A 2UYBA 1O7FA 4FT8A 5D1IA 4QGMA 1ZRFA 4DINB 1RTVA 2EA7A 1UIJA 2N7GA 2ZKLA 4B29A 1H1IA 1IPKA 3WW4A 1SFNA 3WW1A 1NYWA 3E5XA 4QX5A 4XFFA 3CO2A 3HIFA 5FQ0A 1X8MA 1ZZ6A 1HW5A 1UD1A 2IXLA 3FE5A 1CAWB 3QACA 2P17A 3NVCA 4FAGA 4UXAA 4HBNA 5BUVA 3S0MA 1RUOA 4XFHA 2GC3A 4QMAA 1OD5A 2IXIA 3SHRA 1PMIA 1CAVA 1J3PA 2PYTA 3OD0A 2Q0AA 3I59B 3GYDA 4KWKA 5I93A 2D93A 3U11A 4XFGA 3FFQA 5JAXA 4YRDA 2OA2A 4LULA 3MYXA 5CVRA 5JR7B 2F4PA 2OZJA 3ELNA 4L11A 4Q0PA 4E2SA 2Y0OA 4CYDA 3EQEA 1EY2A 5C6CA 3CEWA 4IERA 3H1WA 4ZU4A 2OYZA 3IBMA 3KGLA 1X7NA 4J1WA 1CAXB 3PVBB 2PA7A 3BU7A 5FLJA 4QGLA 5FLHA 4HMZA 3LA2A 2D5HA 4QM9A 4MZUA 2CAUA 2V09A 4AXOA 2CAVA 2I45A 4IEZA 1O3SA 4E2GA 4KU8A 4WVZA 1RUNA 2IXCA 4ORFA 1XE8A 4XF1A 5AVPA 5BV6A 2B5HA 3HUGB 1VJ2A 4P9GA 2D5FA 4BH9A 4PIYA 2CV6A 1NE6A 2HJIA 5I91A 3S7EA 4Q29A 4XF3A 3H3ZA 3NW4A 4KU7A 1O3RA 1O3TA 2MNGA 1WGPA 4UBGA 3CL1A 2XLAA 1ZZCA 1CAWA 4YSFA 5I8SA 5BY5A 4IETA 3UKNA 4EROA 1OFNA 5LRSA 3I59A 4MV2A 2QNKA 3ACLA 1I6XA 5HI0A 2GZWA 3HT1A 2OPKA 2EVXA 2HKXA 3UKTA 1LKNA 2MPFA 4J1XA 4QXKA 1ZX5A 5LRRA 4HSLA 1CAXA 3RYPA 4A2UA 3H9AA 3LA3A 1CAUA 5J7MA 3NSTA 2QCSB 1ZZBA 3HT2A 4KWJA 3OCPA 3EHKA 4D7SA 2IC1A 4LTAA 4IEXA 2MHFA 5LEJA 3TNQA 3ROUA 4YARA 4I09A 2D40A 3E6CC 3MDPA 5E1RA 5LEKA 3IDBB 3USSA 4GULA 4OLLA 5F1RA 5FPXA 2ZCWA 1J59A 5I0UA 4I3PA 4EWDA 3DV8A 4IEQA 2KXLA 2K9ZA 1YFXA 4PIZA 1O5UA 1NXMA 3BALA 2PAMA 4MGZE 4UBHA 3RYRA 4MH0E 4K8FA 3H1YA 1OI6A 4HSJA 4L2NA 3SXWA 2DCTA 4ZU5A 1J3QA 1H1MA 2O1QA 3H3UA 2WFPA 3E6DA 2Q30A 4QGNA 1PM7A 1YWKA 4I01A 4PIXA 2Z2SB 2OZ6A 5BPXA 4I2OA 3H8UA 3RNSA 3JZVA 4I02A 3FJSA 3SCGA 4X6RB 1J3RA 4O9EA 3OGJA 3PLQA 1I5ZA 3SCHA 3H7YA 3E97A 3LWCA 2VECA 3H50A 3QOPA 5CADA 3WW2A 1CX4A 3M3IA 1ZVFA 3CLPA 3FX3A 1YLLA 3B02A 5FLIA 3ES1A 1J58A 1X8EA 1GQGA 2Q4SA 2ET1A 1O4TA 2FQPA 3FWEA 2PHLA 4BIFA 5JSOA 3LOIA 2UYAA 3L2HA 1LR5A 4QM8A 5I0RA 3EO6A 4WBBA 2GC1A 1GQHA 4HVOA 2UY8A 4JV4A 1O5LA 4RD7A 4AQ6A 4XF9A 5FDBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HZFA 2O14A 3PNYA 2W94A 5DZFA 2Q2EB 3KCYA 1APNA 5F04A 4NWVA 3AM2A 5GLUA 1OURA 3ZPYA 4QQ2A 1K45A 4OMDA 3EUKL 3BG7A 4GJYA 2ZX2A 2RR13 5B4NA 3HSEA 3RZDJ 3WE3A 2XHKA 4R9CA 4U0WA 4YG6A 2E26A 1P4WA 2J1TA 1PVEA 4MQ9F 5CISA 3WU0A 1RC6A 4AK3A 3BTXA 1ZM1A 3LD8A 3D0JA 3N4MA 4I0WB 1PVXA 4QIWN 1FTTA 3SCFA 4JTOA 1SCSA 5BS6A 3JRDA 4LK1F 1NZIA 1MSFC 5CIRA 4Z92B 1JI8A 3SDGA 3WHBA 4P9UA 1SVLA 3DPUA 1CVNA 2MLKA 1UZVA 2QEXI 3UJOA 4BQ1A 1UY0A 3JQWA 3ST7A 1FOXA 5L3GA 3NJYA 4XDPA 5E18F 5LBQA 1QXRA 1DYKA 5EG0A 4D9JA 3LOCA 2P5BA 4COZA 2P34A 2D1HA 2EXHA 2XJQA 4BQ4A 1U12A 4HETA 2ZJCA 4YW6A 2VUJA 3ZX7A 1ZYBA 1F43A 3VDAA 4ZU7A 3VYUB 4HPKB 2M7AA 5IPAA 1W0UA 2DMTA 1QXJA 1I3AA 2FQ3A 5EDNA 5DAQA 1MIJA 2CWSA 4AEKA 3OWTA 5TGTA 1TEIA 3NAUA 3HKZN 1QJY3 3SMHA 5GTHC 4ZZLA 5J09A 1Y1VJ 1J1LA 3R0RA 2WZ8A 1U5TA 3H3LA 2RJLA 2WNEA 1OCTC 4A3DJ 3U14A 2IXKA 1Q8SA 1F36A 3N9QA 1UMQA 4XTPA 4A3FJ 1OPMA 5C71A 4L9BA 2CGOA 1WJDA 5A2QK 4YM1A 4M3CE 5H20A 3IWZA 2ZX0A 1TMF3 5C5UA 4BXXJ 3J8F1 4LG3A 1C57A 4S2GA 2DTRA 3ZXEA 5DABA 4HVQA 1KD7A 2RE9A 4NN0A 5HLGA 5LCWL 5LGUA 2WNOA 3ERMA 1UO9A 3RZHA 3R0AA 1NCRA 2ZXQA 4LHNA 1LOFC 4DO0A 4EN7B 1B09A 2PX9A 1OH3A 4LKFA 3TGNA 5IVYA 3NL1A 4PSXA 3KCCA 1D1CA 1H30A 4BISA 1ONAA 1RHI3 3DYOA 4BLJA 2RR11 1O57A 3POFA 3ZMZA 4ZY9A 4CYCB 5FUIA 1HV0A 1XC5A 2Y75A 1XSXA 3ZXJA 2DQLA 2IVJA 3L2YA 1MJ9A 3LOBA 4BWOA 4U36A 4V2WA 2VMHA 4FTHA 3PL8A 1W8NA 4C8DA 2LVSA 2OQ7A 2QKMB 1HQCA 1P8JA 4KBBA 1X19A 3M07A 4HLYA 5D6FA 1WLWA 5DM6F 1TG7A 4CDUA 1ULYA 2HKOA 1JU4A 4YEJA 3K2OA 3AAFA 5E79C 3R61A 4A5MA 1CQTA 2ARXA 3FE5A 1CAWB 1L7RA 4L9JA 4LLLA 3NVCA 4IXLA 1RUOA 4HBNA 4D7MA 4WVMA 5FFXA 3SHRA 5KVRA 2Y6FA 3MYXA 5GZCA 4JDNA 3IPVA 2MA3A 4CDQA 2CUFA 1JJ8C 4AZZA 3K1NA 2OS2A 1WA6X 2QQLA 3CEWA 4CP9B 3GW2A 2CGNA 3ZFFA 1V6JA 3F8FA 2QZ8A 3LSTA 5FZOB 3T0BA 1A34A 5FBZA 3VBSA 5FLHA 5IOZA 2YHJA 2RQPA 4MVTA 3OGRA 4C1XA 1WZ2A 4CPBD 3TOAA 1QJY1 4MHRA 2JTVA 5AVPA 3HUGB 1VJ2A 2WNUC 3Q9SA 3EETA 1S72I 4DGWB 2HJIA 3PQJA 3IH2A 3M4FA 3CL1A 4JQRA 1JXNA 1TMF1 2ZHLA 3HJEA 2WNUB 1ENHA 1UZCA 3VKLA 1X9PA 3LEKA 2C24A 1ND3C 4IGQA 3VDCA 3UETA 1COV3 3RS6A 2FMLA 2H94A 1R4NB 3BIEA 1FTZA 2Q8OA 3DPRC 3OOUA 3C7JA 3J7LA 1SVMA 3UKTA 3OS2A 4ZJZA 3CCUI 4QX2A 4RL7A 3S32A 2W4SA 2H1LA 4YIIA 4ENJA 5FKKA 1ND3B 1GZCA 3CC7I 1CAXA 2P81A 3FDYA 2IVIB 2ERFA 1OHFA 1YI2I 3H9AA 3J8F2 3DPRB 2V4JC 3MIEA 5A3TA 3AG4H 1RHI1 2KIUA 1N1YA 2D98A 3BR2A 2BY2A 2D40A 2FDHA 2LP0A 3MV11 3IDBB 4BK4A 3POSA 3S5QA 3G1OA 1HB2A 1BK0A 2VU9A 2L9VA 1Q8QA 4M6YA 2B39A 2OXBA 3NAPC 1VQ8I 3HTSB 4MO7A 4LO7A 3I3BA 2HGCA 4XKBA 4J25A 5A6XA 2WY8Q 1KGYA 2HI3A 2RR12 2IPQX 1J3QA 4ZU5A 3CDIA 4LIUA 1R36A 4XM3A 1H2KA 4OUMA 3HDDA 1GNHA 4I2OA 4GFBA 1DHKB 4BPZA 1JZ2A 4XCAA 2CSOA 4OHWA 4F3JA 1A3KA 1UXXX 3OBRA 4RR3C 4ET7A 4JP0A 4MADA 3OPZA 4E9KA 5FWEA 3WF2A 1MJBA 3C7EA 5EYYA 4UUTA 1OF4A 2F5CA 4BU2A 2ZABA 2IGOA 2V9VA 4RR3B 1GQGA 1P7JA 1CESA 4FE4A 4XZUG 4RD7A 2O8OA 2RS33 1IKQA 2DF7A 1GZWB 2EH3A 1F31A 5GLTA 2HVSA 5JXHA 1UCRA 2DA1A 4XBLA 1VAVA 1OA4A 1VALA 3G3ZA 3BROA 4LXLA 4V1PA 4PQQA 5DV5A 1XN7A 1WW5A 1WCDJ 2QWWA 3V0AA 1QJY2 3PDQA 1FATA 4XFBA 1C5IA 3NV3A 4NO4A 3OV8A 3TL4X 2FBEA 2XLFA 1UJ8A 1COV1 4L97A 4E4ZA 2Y6LA 4YW2A 3WNKA 2CWEA 4XHXA 3AKQA 3TEWA 3C3VA 1GVJA 3DKWA 1Z0XA 2LYCA 1TMF2 3VBHA 2NRAC 1XNKA 2M5WA 1ODMA 4B4CA 4XKCA 3O1TA 1JODA 1WLDA 3K4BA 1G8WA 1XSQA 5C8CC 2L3DA 2XF6A 1IV6A 4EV0A 2YSRA 1R71A 1YLFA 5BNNA 4E2QA 1CZTA 3CJRB 4RS5A 3MN2A 1XBFA 1OMIA 1SD6A 5C8CB 5FXVA 4KNYA 2VI6A 3CC2I 2YR2A 2C0ZA 4BYYA 1RHI2 1DCSA 2GIZA 3MI8A 1C8M3 1BEV2 3RJRA 4LEJA 2FBKA 3AP7A 2FDGA 1UL9A 3BCBA 4E4SA 4BDVB 2VKHA 1W99A 1BBT3 4OWRB 2PAKA 4QB1A 3WODF 3FBYA 3V7SA 4IPAA 1SFEA 1US2A 1MS1A 5LZ6A 5CKMA 5E88A 3K0LA 4ZDPA 3ZOIA 3H1CA 4XJAA 5D4SA 1XSDA 4CCDA 4YG0A 1MR5A 3VWBA 1IRFA 4XF0A 2GU9A 5K5OA 4XPVA 4GKXA 3WZ1A 3RI9A 2JRMA 5F5QA 3MKYB 2K4JA 4HOOA 3BJ6A 2RS31 5SV5A 2ZKNA 3BY6A 4IHTA 3GZEA 2E51A 2E1OA 2JE9A 1LFUP 5T5JA 2RKHA 4WXDA 1DZRA 3N36A 4QWNA 3PSFA 4HL0A 2AR6A 3ZVXA 3ZOBA 5JR2A 1W5SA 4EGYA 3WTTC 1VFCA 4LMFA 2YPRA 4JGZC 2D45A 1ASJ3 1XNDA 2BV4A 1MNMC 2ES3A 5HDNA 3W6VA 1ZNPA 3ESWB 4B3AA 3MZHA 1LOBA 1KXGA 4JGZB 5BNGA 3OEBA 4D6RA 2A75A 3ZKUA 4UUSB 5L36A 3HM5A 1LHUA 3ZXDA 4XAEA 3G6EI 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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