1Z6RA

Crystal structure of mlc from escherichia coli
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
395
structure length
382
Chain Sequence
QIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVHEMLEAHLVQELGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDLPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMSSMLHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of Mlc, a global regulator of sugar metabolism in Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
molecule keywords Mlc protein
total genus 106
structure length 382
sequence length 395
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1z6rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA03
2ZGYA 2HQRA 2H6BA 1DPUA 4MTDA 1IN7A 2RKHA 2OAZA 3WU0A 2LKPA 4HF2A 2ZXJA 4XSZF 1YXQA 4FHTA 4IHTA 4GYIA 2VN2A 3QU6A 2HTJA 4CXFA 1XC3A 1FBQA 1MD0A 5LGTA 3L2CA 3ZEUA 2PJPA 3M3ZA 2W24A 3RIRA 2QM3A 1G99A 1O7LA 4RGUA 3TQNA 4BRCA 2HKXA 4EJWA 3VEYA 4N9HA 4H5NA 3O6BB 1S6LA 2IIRA 3RJPA 1TLHB 3ZX2A 5L3BA 4ENNA 5FD6A 4KDPA 1H9GA 3ZMSA 2ELHA 2RN7A 2FBKA 1QNTA 2J5PA 5LRSA 1D8KA 6PAXA 1S3JA 4KIFA 4RB3C 2CGPA 3ABUA 2CWEA 3IKVA 2YHYA 2HTSA 3KLOA 3CUQB 1YIOA 3KEOA 2ESHA 2LF7A 2OD5A 1ZG5A 3CUQC 3WUHA 5H6RA 4ZZLA 4HQEA 4EM0B 1NWKA 1NGIA 1ZXOA 4PKHA 3ISPA 3JS6A 4OIOF 5F1RA 3VESA 5AQFA 2H94A 3QOPA 4A5NA 2EFOA 3ULEB 4CZIA 2ZF5O 3VF6A 3FZLA 1BWFO 4KMUX 4DHYA 4KNYA 3R9PA 1G3YA 2HFHA 2WC2A 5AQXA 1Y0UA 2OANA 4FWSA 3HOSA 5E26A 4FSVA 3E6CC 1LEAA 1T6DA 4RTFD 1WRJA 2STTA 1I27A 1GLAG 1D3YA 3W6KB 4CI6A 5E18F 2Q0OA 1Z91A 2XHKA 2ZJ2A 1BIBA 4RAYA 4ENKA 3GE1A 3VERA 1J9IA 3ZPLA 4L0ZB 2IVOA 1ESVA 2BE5F 1MJ9A 3I53A 4O3MA 1T38A 4A61A 4BRQA 4CZEA 3SXYA 2L54A 4BRDA 2NNNA 1H1VA 2QLZA 5AQRA 5J8CA 3GL1A 1D8JA 5D5XB 1ZHFA 3BP8A 4LK1F 3Q9VA 1OPCA 1MGTA 1FT9A 1DP7P 3WQUA 4HLYA 2A6AA 2QW9A 2DTRA 1SZ2A 3GG4A 2FE3A 4O8KA 3LA7A 4A2UA 2XIGA 3ECOA 2IVNA 1NGBA 1KU9A 3CUOA 3CUQA 3MZYA 3HI0A 3HZ6A 1KQ8A 4B1WB 1JE8A 4A2BA 5KPTA 5F64A 2EFQA 4EGZA 5CVJA 1DDNA 3A0IX 2H6CA 4I02A 4Y15A 2CQKA 4M9ZA 1YAGA 1R1VA 1U6ZA 3WU1B 3GWZA 4MO5A 2ADUA 1FPQA 5HDNA 1QPMA 4RGXA 1EH7A 2I7NA 2VE9A 3EETA 2WTEA 3H3NO 2OQRA 1Z05A 3E97A 1QHAA 3V4GA 1T6CA 4IPAA 5E20A 5AFUH 3L4IA 1H9TA 4L9NA 2A07F 3SQNA 2LNBA 1MWMA 4PGGA 2M30A 3SFZA 1BI2A 1BDGA 5DCMB 1WUAA 1I5ZA 3FHZA 2Z9OA 2HF3A 5H20A 1USSA 4BR0A 4BREA 5F6FA 1IRFA 3GFIA 3HRSA 3MWMA 1GLFO 1CF7B 4HF1A 4ISFA 4YG2F 5ICFA 4IWVA 2GXBA 4BR5A 5BN9A 4HW0A 1QO0D 5K1YA 3H3UA 4IRGA 2EB7A 2YPRA 1KAYA 3UKRB 3RDIA 2M5WA 1ZN2A 3T8RA 1BM9A 1QQOA 3WTWC 2YU3A 1SQKA 2E1ZA 4WQ4C 5KQ8A 3IRRA 4WYBA 3CTAA 3HM8A 4BQAA 4AWXB 1S22A 4WXCA 5LHHA 4L18B 1H0MA 1U8RA 3I4PA 3CO6C 1J59A 3TO6A 2VYPA 1NGHA 4G8XA 1XB4A 1ZLKA 1MDUB 4M7XA 2PFBA 4P96A 2K4JA 2HS5A 2IVMA 3O80A 5BOXA 3R6MA 2L4AA 5AONA 4AM7A 2L4MA 3K9TA 4OINF 2EV5A 3R0AA 5ED4A 1Z1DA 2ZNZA 1NBWA 3VGMA 5TRDA 3M1FA 4Q5SF 4A6DA 1K79A 4FWNA 4EM2A 2P7CB 3C0BA 1R5GA 2FA5A 1FYMA 1STZA 4BHPA 1KYWA 5IT9Z 2KIFA 5ILVA 3QP5A 3CQYA 1DKGD 5BR9A 4LG0A 1RNLA 2CGJA 5CVUA 1IXRC 3F22A 3E6BA 4H0XB 3KP4A 3LQRA 3MEXA 5DCMA 5BREA 2A61A 2PQ8A 3FFKB 4I0BA 3FXUA 4EFHA 1ATRA 3GXOA 4MEXF 3WEEB 4YIFA 3QMLA 2DW4A 4H0TB 1ZYRF 3EYIA 4DQ2A 2GA2A 1CF7A 3FXRA 4JD2A 5L3CA 4Q4ZF 3MK6A 3ZN0A 1BI1A 3VEVA 4JN4A 3UKRA 4BAYA 4M6XA 2CSOA 1U78A 4CJ7A 5CE3A 4WQ4A 2MH2A 1ULYA 4G6QA 2FU4A 5AQGA 3DXMB 2FNAA 2D4WA 3F8NA 4Y17A 1NLVA 4H03B 2X4HA 1I1SA 4G94A 5EOYA 4XH4A 1LEBA 1AOYA 1LCUA 2QBYB 1ZBSA 2O03A 5BN8A 3RYPA 4UVBA 3DF8A 4RB1A 1RGIA 4F9OA 2KHOA 4L0YB 4KT5C 3A5OC 3LAJA 4EQQA 5HOOA 5BS6A 2D1HA 5AIQA 4FT8A 3ZX0A 1LNWA 1OYWA 5FO5A 5TKYA 1HKQA 1R7JA 4U0WA 1MA9B 1W5SA 4B09A 2HOEA 2Q0UA 3D0SA 2QENA 3K1PA 1GHCA 4G9YA 2D45A 4KFCA 4UNOA 1B1BA 2QQBA 3M1EA 2O0YA 1IW7F 3ZN1A 5D8KB 4WQ5C 2XROA 1GLJO 3VODA 3T5XA 3OHRA 4A5MA 4LB5A 3H1VX 1EH6A 1O57A 2R7FA 3G73A 1R23A 3I71A 1HKSA 4OOIA 3WEEA 1R36A 4BRFA 1WI9A 1WSUA 2GZWA 2P9UB 3FZMA 1YLFA 4EJUA 2PLYA 2LDUA 1X9JA 4UXNA 4M72A 4MNUA 3BUZB 1WWXA 2XGXA 2MLGA 2E2QA 3HRTA 2GEMA 5TJJA 3RPUA 3PQKA 3K1NA 3A5MC 3WXIA 4BC3A 5AFUA 2VBYA 2YJFA 4U7BA 4OMZA 1TQIA 1IN8A 5H6QA 3CHWA 3CJ9A 3DXMA 3FM3A 4ASNA 2DPNA 4KYWA 1FLIA 3D5LA 3IWZA 4HX8A 5AQPA 1UHMA 3WODF 2V52B 2QBYA 1E17A 3R8EA 3BOQA 2PEXA 2NYXA 3KLNA 4I98B 1P4XA 2F5EA 4CZLA 2MLKA 4AIJA 4FX0A 3WGIA 1P4WA 1L0OC 2V6CA 3ATVA 1HKBA 1V3FA 3O1WA 3HTVA 2E20A 3FGUA 5E1XA 3O3KA 2PMUA 3H3ZA 3KP3A 4M7YA 4Q47A 2QVOA 2IJLA 1XN7A 3VETA 1WQ2A 1FY7A 3RYRA 1DGKN 4HTLA 3ULQB 4RAZA 3KP2A 4WXDA 4AIKA 1ZLJA 4BGAA 4WQ5A 2COMA 4BYYA 2FBIA 5DDGA 2DPDA 1IN4A 2YHXA 2Y48A 4PCQA 3QICA 3BJOA 1MJAA 4LFUA 2CGLA 3O5BA 3QP6A 1FYLA 1ATSA 2QQ9A 1JXSA 3O08A 4UV8A 1ZRDA 4GGGA 1E4FT 2V79A 2HMPA 3ABTA 1HXDA 3U9ZA 2P9UA 3EQLF 5AQMA 1RDWX 2IVPA 3KP6A 4FOIA 1X3NA 1RUOA 1ZGJA 1ZGAA 3DAWA 2W41A 3ROUA 4L3QA 3F21A 2AXLA 3ZX3A 3SLCA 1OKJA 1Y64A 3R6SA 2VOPA 1MJBA 1XD7A 2HDCA 2A69F 1BOTO 2ZGZA 2VONA 3KFWX 4I2OA 4M74A 1D5VA 3WT0A 2YSRA 4KN7X 3IL2A 1FBUA 1KU3A 4P5OA 3U9GA 3CJBA 5HDKA 4E70A 1U6GA 1S7OA 1G6NA 2L3DA 2PAVA 4XH1A 2VCPA 3CI5A 1IUYA 3LA3A 3COAC 3ENOA 2P9SA 1KQ9A 1HKTA 2P9IB 3JAMK 3VEPA 2O61A 4HV6A 5F1XA 5FFZA 1YW7A 2FF6A 3MN7A 3D2FB 3F23A 2EWNA 2QWNA 1AWCA 3N4MA 3BDDA 1IXCA 2RVCA 4MEYF 4BH9A 3QDKA 2GWRA 1VTNC 5J8FA 5A2QK 3GVAA 2FOKA 5FD5A 1LDKB 1Q18A 4WWCA 3PFIA 2L01A 5BRDA 1TYQB 2B0LA 3MAJA 4BRAA 1J2XA 5DYMA 5FB2A 1RFQA 3G25A 1JCGA 4EJTA 3V7CA 3F9MA 5LJVA 2QM1A 2JPCA 1V4RA 3I59B 2Z5UA 5DD4A 3CJNA 3FWEA 4QS8A 3VENA 5ERIA 3O1BA 3IKTA 2M1BA 1C0GA 4ISGA 4Y0WA 4B1UB 1TUUA 2P9PB 3DKWA 1P6RA 3VPZA 2DAOA 2YX4A 4A2AA 4IF4A 3U2RA 2RQPA 3GUDA 3LFKA 3F8MA 4AVPA 3I0TA 1G3SA 4H5TA 4CZHA 3FZVA 4ZH4F 2OZ6A 2JPBA 4JK1X 4XLNF 3Q9SA 3DEUA 1XGOA 3WE2A 1QBJA 5EVZA 1TW2A 1T98A 1ZG3A 1F5TA 3FM5A 1P8ZA 3CJ7A 4I0AA 2D1KA 2P9IA 5F0XA 4KICA 1CZAN 2NS0A 1NM1A 2FF4A 2QUFA 2Q36A 3FZHA 1TNSA 3P9CA 3R4KA 1SAZA 2O3FA 1KXPA 3D2FA 4BNCA 3REOA 5CVRA 1HSTA 1O3RA 2STWA 1J6ZA 2UXXA 3SHFA 2WV0A 2K7LA 3VGKA 1HQCA 4LD5A 4EGYA 1BU6O 5FPNA 4BRNA 4O6JA 5B8HA 1RI7A 5FPMA 3T1BA 4BQLA 3P9IA 5CYVA 2ZO4A 3BF3A 3U8XA 2LF8A 3U9DA 1BI3A 5EEHA 3DXKB 5AQQA 2DPUA 3A5LC 2NLXA 1BC8C 2Q8KA 3I59A 1FYKA 2IW5A 3M7GA 4FPAA 2E1YA 2YHWA 4XSXF 1Z9CA 1O3SA 2P9PA 1R1UA 1ONVA 5ILUA 5D5WB 4CBUA 1NGJA 5E17F 3GBTA 5AQVA 1DEJA 2FNPA 5BPDA 2CO5A 3GX4X 2ZWHA 1HJOA 3MN9A 2FMYA 4NHJA 5ILSA 2NRHA 1SFUA 3E5UA 2Z33A 4MQ9F 1R59O 3ULEA 1QQNA 1F9NA 3RI4A 3TOAA 1YVNA 2AA4A 2ASMA 3O8MA 5BMZA 1YFHA 2ZMEB 1LDDA 3R0JA 4GNIA 1KGSA 1YQAA 2IPQX 3MZHA 4HX7A 4IXAA 3MN5A 4R8HA 2CG4A 3CJ1A 2ZKZA 2FBHA 5CVVA 3J7AO 2BV6A 3TGNA 3FF5A 4FWQA 3L0QA 1CGPA 4BGBA 1MWKA 4YDUC 3WQTA 2FMLA 3ZETB 3M9AA 5HLIA 3BPXA 2JTVA 4CZMA 1FOKA 3A5NC 2A6EF 2ETHA 2G7UA 1ZAOA 2Q2EA 4BG9A 3DV8A 1XSXA 4S05A 3BEXA 3P7NA 3M6GA 1FX7A 4ZYHA 5ADXH 3WTYC 4U0VA 3F8FA 2G9WA 2VOOA 3DXKA 1OYYA 1C0WA 5K5QA 1J5YA 1SAXA 3DP7A 1MKMA 1S8NA 3GFJA 4A12A 4BRPA 3VEWA 3HSFA 1HW2A 4EVIA 4PL8A 5HVQC 5AQNA 4YIIA 3MDQA 3W6JB 5FPEA 3QPTA 4H5VA 4BR2A 3VB2A 3F6OA 4N9IA 1GLCG 3J80K 5AZIB 1FZPB 3GLXA 3LAPA 4UUVA 3KP7A 4HDVA 2IP2A 4AIHA 1SMTA 5FGMA 2ZMEA 1GLEG 2L02A 2RNJA 4PGHA 5LHIA 5L3FA 4IJNA 3IRQA 2JRTA 2P5LC 1MDMB 3KETA 4GO1A 3ID8A 5JMVA 1SMYF 4LK0F 2ASOA 1XGSA 3G3ZA 4YDUA 2XAQA 2CFXA 2VC1A 3HHGA 1EV7A 1T0FA 3O2PE 3ZETA 2VXZA 2XVCA 3FLCO 4XRFA 3P9KA 3WXLA 2OZUA 5EY4A 1OR7A 5AQUA 2GQQA 1A04A 4YFNF 3J8AA 3HYIA 2A3ZA 2I7PA 4NB5A 3FZKA 4CD1A 2E2OA 3OV8A 2DQLA 2P5VA 2NAZA 3LM9A 3P4IA 3GFLA 4ENJA 4OIPF 2VBXA 2QQAA 1BN5A 2CH6A 2ZCWA 5DEQA 5AQWA 4RGRA 2FSWA 2HR3A 1B9NA 4CICA 4U7DA 1ZRCA 2V1DA 2R3SA 2DFIA 3K2ZA 3J81Z 3RSEB 5FLXK 2P5KA 1UHWA 4BRMA 2M45A 3F8BA 2F5DA 4C23A 1NGAA 1S3XA 4MHGA 2CW0F 2DO7A 5AIPA 1BG3A 3WTSC 3A8YA 5AZIA 4IVNA 4QLCU 1S29A 4FX4A 4CHUA 1KQ0A 1LJ9A 3HRUA 3WTVC 4DNCA 4FPBA 1HBXG 4H0YB 3B73A 4BQZA 2MA3A 2YI1A 1ZC6A 3FE1A 4BRGA 3H45C 3D7EO 3SMSA 3KVGA 3I64A 2F5CA 4BRLA 4BRHA 4R1HA 4MQVA 3L9FA 1R00A 3R61A 3WXKA 1MDMA 5D6FA 1ATNA 1R5HA 2UYTA 2F9TA 2KKOA 5L3GA 4HX4A 1IG8A 5JLFA 1IN6A 4FWLA 4ESFA 4JNEA 4EJOA 4B1VA 1RZ4A 4IZ9A 1LOTB 2HWVA 3E5QA 3GW2A 4CBWA 2TDXA 2XAGA 5EXWA 2H27A 4YFXF 3LSTA 4BROA 5AQZA 4FOEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZGY A;  2HQR A;  2H6B A;  1DPU A;  4MTD A;  1IN7 A;  2RKH A;  2OAZ A;  3WU0 A;  2LKP A;  4HF2 A;  2ZXJ A;  4XSZ F;  1YXQ A;  4FHT A;  4IHT A;  4GYI A;  2VN2 A;  3QU6 A;  2HTJ A;  4CXF A;  1XC3 A;  1FBQ A;  1MD0 A;  5LGT A;  3L2C A;  3ZEU A;  2PJP A;  3M3Z A;  2W24 A;  3RIR A;  2QM3 A;  1G99 A;  1O7L A;  4RGU A;  3TQN A;  4BRC A;  2HKX A;  4EJW A;  3VEY A;  4N9H A;  4H5N A;  3O6B B;  1S6L A;  2IIR A;  3RJP A;  1TLH B;  3ZX2 A;  5L3B A;  4ENN A;  5FD6 A;  4KDP A;  1H9G A;  3ZMS A;  2ELH A;  2RN7 A;  2FBK A;  1QNT A;  2J5P A;  5LRS A;  1D8K A;  6PAX A;  1S3J A;  4KIF A;  4RB3 C;  2CGP A;  3ABU A;  2CWE A;  3IKV A;  2YHY A;  2HTS A;  3KLO A;  3CUQ B;  1YIO A;  3KEO A;  2ESH A;  2LF7 A;  2OD5 A;  1ZG5 A;  3CUQ C;  3WUH A;  5H6R A;  4ZZL A;  4HQE A;  4EM0 B;  1NWK A;  1NGI A;  1ZXO A;  4PKH A;  3ISP A;  3JS6 A;  4OIO F;  5F1R A;  3VES A;  5AQF A;  2H94 A;  3QOP A;  4A5N A;  2EFO A;  3ULE B;  4CZI A;  2ZF5 O;  3VF6 A;  3FZL A;  1BWF O;  4KMU X;  4DHY A;  4KNY A;  3R9P A;  1G3Y A;  2HFH A;  2WC2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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