1Z6RA

Crystal structure of mlc from escherichia coli
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
395
structure length
382
Chain Sequence
QIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVHEMLEAHLVQELGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDLPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMSSMLHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of Mlc, a global regulator of sugar metabolism in Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
molecule keywords Mlc protein
total genus 106
structure length 382
sequence length 395
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1z6rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA03
1Q18A 2KRFA 3EZWA 3UKUA 3U4LA 4BR7A 1C0GA 3N4MA 1R1UA 4MEYF 3DF8A 2W57A 4AM6A 4OIRF 5LHHA 4CZFA 1NGHA 2L01A 4BC2A 3BEXA 3BOQA 1IRFA 3CUQA 3IDHA 3SK3A 4FWNA 1OYIA 3JAMK 4G8XA 2GZWA 3FZMA 1MZBA 1XMAA 1XB4A 1HUXA 2HR3A 1JHHA 4S04A 1XQSC 3B73A 5L3FA 4GXOA 3FWEA 3LA7A 4P96A 3KE2A 5E20A 3REOA 1G4DA 1KQ9A 3VODA 2FMYA 5TRDA 2OZUA 4OIQF 2EFPA 2O0YA 1KQ8A 1KU9A 2XKOA 3F72A 5BOXA 1MDMB 5E84A 4HBLA 1C0WA 4H0VB 4AD9A 4M74A 1R5GA 3EYYA 3F8CA 1S8NA 3M6GA 2QBYA 4FL9A 3VESA 1QPMA 2WV0A 1X3UA 1FP1D 3VEYA 2VOPA 2IVPA 3P7NA 2QUFA 4BRCA 2P6SA 4CICA 2VCPA 3U9ZA 4PCQA 4ZH4F 1PUEE 2FU4A 3IRQA 3CUQB 4QS9A 3JAMZ 3I54A 2PQ8A 4RGSA 1XGOA 5AZJB 1IXSB 3DXMA 4FX4A 3EKUA 2ZNZA 3HSFA 1GLJO 2UYTA 1T39A 2ZGZA 2A3SA 3VGLA 4ENKA 4BR2A 3JTHA 1W7PD 4PKGA 1RNLA 2FNAA 3WEEA 2HDCA 2P9IA 4JNEA 2HZTA 2PBDA 5TKYA 4IWVA 3W0LA 1ZGJA 3R6MA 4L3QA 5EEGA 2E2OA 5AONA 4LB6B 5KPTA 5AQQA 4CZEA 5JLHA 1F1ZA 4H0YB 1YQAA 3MZYA 3CQYA 3DP7A 1O3RA 1NGBA 2CQKA 5HDGA 5F6FA 1NBWA 4PKHA 2P9SA 4B1XB 5BRDA 1LEBA 4RAYA 2IRFG 2VBYA 5D5XB 4ENMA 5AZIA 4K25A 2RV8A 2JPCA 1MA9B 3GXOA 2FSNA 4CD1A 4WXCA 3FGUA 3RPQA 1NHAA 4WYBA 2IA2A 3DQVC 5JR3A 3ULEB 4B1VA 5KQDA 2MD5A 2YX7A 4ESFA 3GX4X 5BN8A 4L18B 4IF4A 1GLEG 2P9IB 1XCBA 1MKMA 4HLYA 2DQRA 5AIQA 3FE1A 3ECOA 3DXKB 4YIIA 2F5CA 3WQTA 1IN5A 1XUPO 2CYYA 3ENHA 4XLNF 1U2WA 5HLGA 3HSEA 5J8CA 3BP8A 4ASNA 1RIOH 2H6BA 1WQ2A 2ESHA 4E70A 1ZRCA 2JRTA 3Q9SA 1B1BA 5HLIA 3NQOA 5BRFA 1A04A 2GTDA 4YFKF 1Z1DA 4LGWA 4Z94A 4EJOA 4BQZA 2W85A 3UKRA 4A2UA 3R0AA 2VE9A 1KYZA 2WTEA 3F9MA 3H6EA 1K8KB 3ZMDA 3WTVC 5AQMA 3QFPA 2ZNYA 3SJHA 2YPRA 4IXAA 2B0LA 5CLSA 3S2WA 3FZFA 1B6AA 5AR0A 3ABUA 1GLFO 5E1WA 2FF3B 2FF6A 4FT8A 4IO8A 5E1ZB 4I01A 3ERED 1LQ1A 1K6OA 2ZXJA 2Q0OA 3FM3A 2KHOA 4M73A 2I7NA 3ZX0A 2QZ8A 1OKJA 1TYQA 4MLEA 5HS8A 2EV5A 4CZLA 3QP6A 4YFNF 3V4GA 1JGSA 5AFUH 2NAZA 1BIBA 4AIHA 3O1WA 1STZA 3B8AX 1I6XA 3ATUA 2QWPA 1R22A 1ZG5A 5F1XA 2P9NA 3LDPA 1MD0A 1TTYA 3TGNA 1D8KA 4ZYHA 3WE3A 2ZMEA 4A0ZA 4XBFA 4RGXA 3LAPA 4ENNA 1YO5C 3I59B 1SMTA 3KEOA 2Q2RA 4HTLA 4OMZA 4BG9A 5FPDA 3CTAA 5DV5A 1ZBSA 5EX5A 3I58A 2VN2A 4H5VA 2FBIA 4LD5A 1G6NA 4AWXB 1JCEA 4A2BA 2F5EA 2FXAA 1YS7A 3CUQC 3GFLA 3FZKA 4GYGA 1XGNA 3U9DA 3E3VA 1T38A 2D1KA 4UVCA 2VBXA 3R9PA 1H1VA 1LJ9A 4CZGA 3FXUA 2XGXA 1Z6RA 2JTVA 1PP7U 2P9NB 5AQOA 3N97A 2A6AA 2OU2A 1J0RA 2ZMEB 3VF6A 2K4BA 2FBHA 4I6MA 4B1YB 4HV5A 4BRKA 3RDIA 4HAMA 3H3OB 3I53A 3BF1A 5DUKA 2V9VA 2DO7A 4O5FA 4BG8A 4CD3A 3L09A 2QWNA 5BREA 4HZFA 2W24A 3F8NA 1O7FA 3ZX3A 2RVCA 3DFGA 4R79A 1WKMA 4P55A 1YG2A 5FFXA 2NZTA 4FSVA 4MHGA 2CO5A 1FZPB 3QPHA 3J81K 1FYKA 1S7AA 2E2NA 2BGCA 1FWZA 1IZ1A 4FWPA 5L3CA 2GAUA 4FO0A 1LDKB 3VGKA 1IN7A 2KIFA 4CO8A 3KEQA 5L3GA 3LM2A 3D2EA 3QBWA 4XRFA 2QWQA 1USSA 3HSRA 4HX7A 4BR4A 5AQTA 5LJWA 3G25A 1U5TA 4I6MB 1YFHA 3O3KA 3VENA 3AARA 1J2XA 3E5QA 3ZMSA 1DPUA 2V1XA 2KIMA 2GELA 1TW2A 3BJ6A 1BOTO 3LA3A 3WUHA 5LEKA 4CYDA 3JXUA 1HSJA 3V7RA 4WX9A 2JSCA 2QLZA 4KN4X 3CJBA 2GXGA 2OA4A 1BWFO 4Y13A 5BMZA 3J81Z 3O6BB 3MFKA 3C1DA 1SD4A 4BVPA 4ISEA 5E26A 4AIKA 4BRDA 1BI0A 4HQMA 2EWSA 2Z99A 4KMFA 3RIRA 3EO3A 1V4RA 3BZ6A 1IG8A 5DD4A 1NMDA 4EVIA 3O08A 3CI5A 5L3DA 4RCHA 3QP5A 1DUXC 2K4JA 2L4AA 3VF4A 3H1QA 1GLBG 1UB9A 1BC8C 2HKOA 1QBJA 4RWTA 3FMRA 1MJAA 1YLFA 5F1RA 2LF8A 2A5YB 3SZTA 1ZC6A 4XSXF 1O3TA 4L0YB 3M3ZA 2HYFA 3FMQA 1RI7A 5CYVA 1ZG1A 2CG4A 4ZZDA 3M1FA 3MN7A 3IHUA 3V7SA 3GFJA 4A0YA 4CZHA 1KA8A 1KU3A 2YHXA 3CERA 2V1DA 2X4HA 2KIUA 1Y0UA 3HZ6A 2WC2A 3BF3A 1TUUA 1H9TA 4ZYEA 2P4WA 5LY3A 5ILVA 1OMIA 3E6DA 1BC7C 4GO1A 4BR0A 3HTUA 2QQBA 3ABTA 3EYIA 3MAJA 5D4RA 2ZWHA 4BHBA 1P6RA 4BRIA 4DQ2A 2FMLA 2RN7A 3MCZA 4KN7X 4N9HA 1FP2A 3HI0A 4JD2B 2DK8A 1HXDA 4M9SA 4XH5A 2H09A 3P9IA 4B9QA 4F7ZA 2IVOA 4FX0A 1E17A 2W25A 1HKGA 1ZRDA 3SZPA 1LB2A 4J8FA 3QRFF 4BH9A 3WTSC 3BDDA 4LLLA 4I02A 1ZLJA 2KJCA 2YJFA 3LFKA 3LQQA 2EFOA 2ASMA 1H0MA 5F0XA 3M8EA 1R5HA 1WWXA 3K1PA 1I27A 2PFBA 3FXQA 1QO0D 4MLHA 4EIAA 3T0YA 3ULQB 2E1CA 3J8AA 1JHFA 3BROA 1BBYA 2XVCA 2D0OA 3QFUA 3ZQ7A 4CZMA 1XSXA 3LA2A 4UHTA 4WCGA 2VT2A 3RYRA 1YVNA 1J7KA 4A6DA 2H3GX 5AQRA 3ZMTA 5F64A 3VEVA 1Q1HA 1HKBA 3FZVA 2IVNA 2XROA 1G99A 2QQ9A 1LCUA 3QB0A 4PGHA 4ESJA 1BUPA 5IT3A 3G73A 4IZ9A 1XSDA 5LJVA 2NRAC 1UHWA 4FWKA 2K7LA 3IWFA 1W7PB 3E5XA 1JE8A 5FFZA 1VTNC 1D8JA 2ESNA 1ON2A 4KIBA 3LDLA 4FWOA 2NNYA 2K86A 3WU1B 1YW7A 1B9MA 1B4AA 2O03A 3IC7A 5D8KB 3VOVA 3UB5A 2VYPA 4DCHA 3G3ZA 4EGZA 2PAVA 4CJ7A 4BQLA 1IN8A 2Q97A 4FWLA 3MWMA 4UVBA 4TV7A 1T0FA 5AZJA 3J7AO 3O2PE 3RSEB 4H5WA 2L4MA 2AXLA 3HM8A 4BXUA 4BGBA 2M30A 5DEQA 3GE1A 3HHGA 2FBKA 1XGMA 5HLHA 3DWLA 3W6KB 5JMVA 1QNTA 3IUCA 5D4SA 5LHIA 1FSEA 3T8RA 1P4AA 4BRFA 2VODA 4BC5A 3GVAA 3I8BA 2AS5F 3HTSB 1XD7A 1XSVA 5FPEA 3E6CC 2P9UB 4HQEA 2AA4A 1HKSA 2Y48A 2FLOA 3U8XA 1U5TC 4H0PA 2A5XA 4C23A 5K5RA 1R1VA 2QQAA 5HS7A 2A61A 2R7DA 4MQ9F 4HF0A 2ZCWA 1FPQA 2R7FA 2D1HA 1NGGA 3ULEA 2EA2A 2HGCA 2XHKA 5CJ9A 4UUVA 3I33A 2XAFA 1HKTA 2L3DA 3CIPA 1JCFA 3HUGA 4LC9B 1P92A 2Q2EA 3K0LA 2HWVA 3CETA 4HLXA 5ILUA 2UXXA 3DXKA 3JTGA 3TO9A 3HRUA 4L5JA 2MC3A 3A5NC 3IMXA 1KQ0A 2DT5A 4PGGA 4KICA 5JFRA 2Y0MA 3H3UA 1DDNA 1QZZA 2W40A 2OD5A 3WGIA 3L6QA 1ATRA 4BROA 1IN4A 1D4XA 3V7CA 1GXQA 2HKXA 3KZZA 2UZKA 2MLGA 1K8KA 2BTFA 2EFNA 5FD6A 3DJCA 1MWKA 1QQMA 1G3SA 1Z6TA 2IVMA 4LLNA 2P9LA 2HEOA 3Q9VA 2WUSA 2E88A 1FLIA 5AQNA 4CBXA 1HW1A 3IKVA 3D0SA 4XEIA 4AIJA 4BR5A 5AQVA 4CZIA 1SFUA 3GUDA 2FRHA 4RB0A 3IWZA 3WTXC 3O6WA 3LAJA 4EFHA 3GO5A 3O4WA 4EJVA 4JAXA 3KP7A 1X3MA 2E20A 1O7LA 5TJJA 1SFXA 4G9YA 4ETSA 4RB3C 4FOIA 5FLXK 1HBXG 3I0TA 4NHJA 1S3JA 2QVOA 2HF3A 2DFIA 2RNJA 2XUBA 1U2VA 3S41A 1K79A 1XDSA 4FWQA 5EEHA 2EFQA 2H6CA 3NRVA 3ENOA 3I59A 2OQRA 3I5UA 5CVJA 4G7OF 1BJAA 2Q0UA 3AY9A 5ELZA 5AQGA 4I98B 4A62A 1R36A 2P9LB 3VGMA 1T44A 1W4MA 3WXJA 4RGRA 1I5ZA 2G7UA 1H9GA 4IHTA 4HV6A 1P8ZA 4HX4A 3QICA 4O3MA 1G3YA 2W41A 2CH6A 2MH9A 4L9NA 5JICA 1J75A 1EH7A 4K42A 5ICCA 5CE3A 5KVRA 1IUYA 1O3QA 3F3XA 4M7XA 4IXCA 2YSRA 3PFIA 2GEMA 3FFKB 3E5UA 3KETA 3JW4A 1RFQA 2X0LA 5FLXZ 4HOBA 5LRRA 1R7JA 2DBBA 2D2WA 4QLCU 3C3WA 4JQFA 4LLGF 4MO5A 3M7GA 2Q8KA 1U2VB 1HKCA 4HYEA 5DYMA 5FD5A 1S7OA 5ICGA 4BRNA 1HSTA 2F2EA 2P9KB 4WQ5A 4UVAA 4OINF 4I7HA 4U0WA 3KLOA 4RTFD 1SQKA 4GNIA 3F8MA 1UCRA 5BQTA 3MQ0A 3IRRA 2OBPA 4KUMA 4BRLA 2VT3A 3LQRA 4BRHA 5B8HA 3VOEA 2QXLA 3K2ZA 2D45A 4BREA 2L02A 2BUPA 2EK5A 4CXFA 5F2RA 1IW7F 5ADXA 1D5VA 3CJ9A 1EV7A 5BRHA 1BI3A 4B1UB 2FSJA 4BC3A 1ZHFA 1E2XA 5D8LB 1LOTB 2E2QA 3K1NA 1J6ZA 2VWBA 3SHFA 5BPDA 1R58A 1FT9A 2V1UA 3ML6A 2E8AA 3GWZA 2P5VA 3ZETB 5BS6A 5ILSA 1BG3A 3FZHA 4BHPA 5FB2A 1ZARA 1J9IA 4CBWA 4H0EA 1SZ2A 5DDGA 1ODDA 4BNCA 4N9IA 6PAXA 2HQRA 1BA0A 3I4PA 2F5DA 5K5QA 1FC3A 4NO7A 3HRTA 3AAFA 2G7HA 2ISZA 2VE8A 4M71A 2V52B 2CGJA 3ZX2A 4BRGA 2Z5UA 1YUWA 3I64A 4BQAA 2R3SA 5AFUA 2GWKA 2V79A 5HDNA 2PG4A 2RQPA 3O80A 3F22A 2PLYA 1NGIA 1HQCA 3TU5A 3SFZA 3ZMVA 1TQIA 5EVZA 4ISGA 1FNNA 1BI1A 5D5UB 3AAPA 5A2QK 4PZJA 2V6CA 2ZFWA 4XH1A 1REPC 2XV4S 2CFXA 2DW4A 3EQLF 3QBXA 1BM9A 1EH6A 4PL7A 1K78B 1SD7A 1YIOA 2CH5A 3TOAA 2Q0RA 4IRGA 3ZPLA 2CWEA 4BHCA 5AQJA 2XASA 1ZLKA 4YDUA 4CBUA 3CDHA 2EV0A 1G3TA 2IT0A 2I7PA 2STWA 4PL8A 2NYXA 2YR2A 4HWIA 1YW9A 3JS6A 3LL3A 2IJLA 1IXRC 1YYVA 3K69A 4I0BA 5JHUA 1FBSA 1U6GA 1TUYA 4KYWA 3ZEUA 1HKQA 1Z9CA 3GLXA 3CHWA 3IFRA 3A8YA 2P5KA 2IW5A 5AQSA 5J6XA 1UHMA 3M9AA 4B1WB 1SD6A 5A2QZ 3ELKA 3GZ6A 3GEZA 3GL1A 5AQKA 4RAZA 4EHUA 3GFMA 4L0ZB 4NQWA 2QWMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1Q18 A;  2KRF A;  3EZW A;  3UKU A;  3U4L A;  4BR7 A;  1C0G A;  3N4M A;  1R1U A;  4MEY F;  3DF8 A;  2W57 A;  4AM6 A;  4OIR F;  5LHH A;  4CZF A;  1NGH A;  2L01 A;  4BC2 A;  3BEX A;  3BOQ A;  1IRF A;  3CUQ A;  3IDH A;  3SK3 A;  4FWN A;  1OYI A;  3JAM K;  4G8X A;  2GZW A;  3FZM A;  1MZB A;  1XMA A;  1XB4 A;  1HUX A;  2HR3 A;  1JHH A;  4S04 A;  1XQS C;  3B73 A;  5L3F A;  4GXO A;  3FWE A;  3LA7 A;  4P96 A;  3KE2 A;  5E20 A;  3REO A;  1G4D A;  1KQ9 A;  3VOD A;  2FMY A;  5TRD A;  2OZU A;  4OIQ F;  2EFP A;  2O0Y A;  1KQ8 A;  1KU9 A;  2XKO A;  3F72 A;  5BOX A;  1MDM B;  5E84 A;  4HBL A;  1C0W A;  4H0V B;  4AD9 A;  4M74 A;  1R5G A;  3EYY A;  3F8C A;  1S8N A;  3M6G A;  2QBY A;  4FL9 A;  3VES A;  1QPM A;  2WV0 A;  1X3U A;  1FP1 D;  3VEY A;  2VOP A;  2IVP A;  3P7N A;  2QUF A;  4BRC A;  2P6S A;  4CIC A;  2VCP A;  3U9Z A;  4PCQ A;  4ZH4 F;  1PUE E;  2FU4 A;  3IRQ A;  3CUQ B;  4QS9 A;  3JAM Z;  3I54 A;  2PQ8 A;  4RGS A;  1XGO A;  5AZJ B;  1IXS B;  3DXM A;  4FX4 A;  3EKU A;  2ZNZ A;  3HSF A;  1GLJ O;  2UYT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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