1Z6RA

Crystal structure of mlc from escherichia coli
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
395
structure length
382
Chain Sequence
QIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVHEMLEAHLVQELGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDLPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMSSMLHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of Mlc, a global regulator of sugar metabolism in Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
molecule keywords Mlc protein
total genus 106
structure length 382
sequence length 395
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1z6rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA03
1V4RA 2HYFA 3VF2A 4CZKA 1STZA 2D4WA 4PGGA 3MCPA 3L9FA 3WGGA 1K6OA 2VBWA 4JAXA 4CBWA 5AQKA 1SFEA 5HOOA 1GLCG 4I01A 5CVJA 2QWMA 2W85A 1DUXC 3M1FA 3KP7A 3J8AA 2GWKA 2DAOA 2G7HA 1TLHB 4JNEA 1ZXOA 1FYKA 5HLGA 1J2XA 4CICA 4GGGA 2A68F 4FPAA 2FXUA 2QW9A 3BDDA 3BOQA 1K8KB 2UXNA 3ZX0A 2WV0A 1J9IA 1S29A 4ENMA 4CZLA 3IDHA 3FMSA 2YU3A 1E4FT 4M74A 4ASNA 3B73A 2V51B 4HWIA 4CZEA 2D1HA 3E6CC 3Q9SA 4FWNA 2JPBA 1S7OA 1BC7C 2QBYA 2XAJA 3F8CA 4BRKA 5AQRA 1ZAOA 5AQYA 2QQBA 3MZHA 4KFCA 4DQ2A 3WTXC 5J8FA 4H0EA 3U8XA 4Q48A 3REOA 3WGIA 1PP8F 3RSEB 5F2RA 3CUQC 1S7AA 1YTYA 4IXCA 2ISYA 5AQJA 1SMTA 3WTSC 2BBYA 1MWMA 2FMLA 4M9ZA 1P92A 4N9IA 3LA2A 1T44A 4CBXA 1Z6RA 2GQQA 2CGLA 1FOKA 3K1PA 4HBLA 3L09A 2NLXA 3GG4A 4BGAA 4ON0A 1U5TC 4KMUX 3DXKB 3A8YA 3VERA 1K7AA 5BRDA 3C3WA 2RDPA 3OOPA 2BUPA 4OU0A 2O6GE 2K27A 2Q0OA 2Y75A 2M5WA 1JXSA 1TUUA 1ZG5A 1IN5A 2KJCA 1CZAN 1YFHA 2R7FA 1W5TA 2NRHA 2IVMA 2A6AA 5FO5A 4E70A 1S3XA 3I71A 4WX9A 4P5OA 4HX8A 1AWCA 1P4WA 2MH9A 2IA1A 1UCRA 4D0PA 1HXDA 5JLFA 2EV6A 4L9VA 4HDVA 3VOEA 1MDUB 4OMYA 4JHDB 2PBDA 3IL2A 4CZZA 2D45A 1UFMA 2IIRA 3EO3A 1F5TA 3CJ7A 2P9IB 5D4SA 3LL3A 4BC5A 3CDHA 1SAXA 2XV4S 3ID8A 2L3DA 3TO9A 4HYEA 2FMYA 1Z6TA 3TKYA 1D4XA 2P9SB 2ZGZA 3SZPA 2ZJ2A 3A0IX 4H5TA 1NGAA 2ADUA 4I98B 2A3ZA 5CJ9A 5AZIA 3JAMK 1Z7UA 1QPMA 1W4MA 3CLOA 4XSXF 4PDKA 1G3WA 2V52B 1I5ZA 3QP5A 3H3OB 3HBTA 2P9KB 1IN7A 5ADXH 5CVRA 3J80Z 3GZ5A 3M7GA 2O3FA 5E18F 5CYVA 1WWXA 3QDKA 1TQPA 1X9JA 5FPMA 2W41A 1DPUA 4H03B 5FLXZ 3AAQA 1Q1HA 5AQTA 4EAHD 4GNIA 3F23A 5ICFA 2DPDA 4A2BA 1I1GA 1CGPA 2EFQA 5BOXA 2AS5F 3LWFA 5AZJB 2JT1A 5AQQA 2VODA 5BPLA 2Z5UA 4B9QA 1GLDG 2XRNA 5IT9K 1TYQA 2QXLA 2X4HA 1IAWA 3VOVA 3HOSA 2HZTA 4MEXF 2HMPA 1YW9A 3CHWA 4KA4A 1YIOA 2VT3A 3E6MA 2X0LA 1IZ1A 3I33A 2GUPA 4FWPA 2P5KA 3PQKA 3O5BA 4BR5A 3MWMA 4ZYEA 1FSEA 3HTVA 2P9UA 2K86A 1MDMA 1LDKB 2W24A 1GLFO 3A5NC 2JTVA 2P7VB 1XCVA 1YAGA 5AQUA 4KIGA 2H3GX 4M6XA 3TOAA 1XSVA 4HV6A 4L9JA 2P8TA 1TNSA 5ADXA 1TQMA 2A6HF 4I02A 3WEEB 5FB2A 1ZLJA 1O57A 4BRAA 1LOTB 4L3QA 3N4MA 3KZBA 1QQIA 3VPZA 4DHYA 3DKWA 2DU9A 4ENKA 1WKMA 3HSCA 3RYPA 3ZETA 3WTZA 1YYVA 1QQOA 4B1WB 4RB3C 1CF7A 1YUWA 5DCMA 1Z91A 5L3CA 1DP7P 2I7NA 3GFMA 4CD1A 3O4WA 1HW5A 4P9UA 3FZMA 4IJNA 2VWBA 1OR7A 3R8EA 4K41A 2XAQA 2AA4A 4M63C 4BG9A 1UHMA 2F5EA 3LAJA 1OYWA 3E5UA 3QP6A 2RN7A 4EJUA 5KPRA 1R1TA 4HW0A 1SD6A 3FMQA 4HX4A 3ECHA 1FSHA 3SFZA 4BYYA 4JD2A 4LJZF 2QWLA 3MEXA 2YHYA 1KU7A 5EX5A 4BXUA 1KAXA 3DPTA 4B1YB 2ZNYA 2ZXJA 5AR0A 1L0OC 3FWEA 3LA7A 4CZHA 2Z9OA 2LDUA 3HRTA 1FX7A 4KDPA 2HQRA 1BDGA 3QFUA 5E1WA 1HW1A 1U3EM 2ASMA 2DK8A 1IXSB 3EDPA 3RTRA 1I1SA 1GLBG 4OIRF 1C0FA 3HTUA 1HQCA 4ESBA 3ML6A 4GXOA 1QZ6A 2OU2A 5BQTA 2CQKA 3RI4A 2PQ8A 3J81K 4YIIA 3U9GA 1USTA 2H94A 3RKYA 3H1QA 4UXNA 2K02A 4HQEA 1XGSA 3ZX3A 2DI3A 4BRDA 4O5VA 2K7LA 3R6MA 3FZVA 2VN2A 4BRQA 4YFNF 5HDKA 3FZLA 1DEJA 1WOQA 2J4RA 3RKXA 3HOTA 3AARA 4ZYDA 3FE1A 1H9TA 4PKHA 1BU6O 1S3JA 4CGZA 3HIFA 1NGCA 4HV5A 3FHZA 1BM9A 3I64A 1FP1D 1FBUA 2A5YB 2DQLA 5HVQC 1DKGD 3CJCA 2E2NA 4I2OA 4A62A 2H6CA 1Y0UA 1B1BA 1HLUA 1D3YA 1T0FA 1XUPO 5JHUA 5E17F 3WTVC 4HA8A 3ZX2A 2ZKZA 3ZMTA 4B09A 3G73A 3GBTA 1OYIA 4AWXB 3M3ZA 1IG8A 2HGCA 4CZGA 2ZCWA 1ZBSA 4G9YA 2O0YA 3LA3A 1SAZA 5D5XB 1BO5O 1TTYA 3WU0A 3CO6C 2RQPA 1NWKA 3W0LA 3ZPLA 2PAVA 5F0XA 4M71A 3HHHA 2Z99A 4BHBA 1O3QA 3H3UA 4EJOA 4NQWA 4L9TA 3V8KA 1PP7U 4H5NA 2E7XA 3VGKA 1HKBA 2Q0RA 1KQ9A 3UKUA 3WE3A 2RV8A 1A04A 2W57A 1I6XA 1BI3A 2ESNA 1NM1A 4FWKA 5EY4A 1ATNA 2DQRA 2KIMA 3MK6A 3FXQA 3QOPA 1MJ9A 2GTDA 2TDXA 5LRSA 1S22A 1XQSC 3ENOA 3FMRA 3LQQA 2CGPA 1PDNC 1HJOA 4BROA 3CJ9A 3MN6A 1GLLO 1IXCA 3ERED 3VETA 2HF4A 1LVAA 4G6QA 2COMA 3MDQA 3O08A 3G25A 3UKRB 4EJTA 2P9PA 5AZIB 1UB9A 4Z2YA 2F5CA 3W6JB 3P9IA 3J7AO 4M6YA 5L3DA 4O3MA 4UVBA 2YHWA 1MKMA 1T6SA 3F3XA 3R0AA 2G7UA 1O7FA 2GA2A 5LGTA 1ON1A 4WK8F 1WRJA 4YDUC 1BJAA 4CYDA 2XIGA 3KLOA 3CJNA 1RZ4A 2W84A 2FSJA 3IWFA 5AQWA 2OQRA 3WXIA 2NNNA 1O3SA 1AOYA 3IC7A 1GVJA 2A40A 4EJVA 5AONA 1RFQA 3H46O 5FGMA 1UHWA 1SMYF 4I0AA 5D8KB 5TKYA 4CZIA 4RGSA 4PCQA 2FF3B 2I7PA 5BRFA 1R23A 3HUGA 1FBQA 3WQTA 2HKXA 2IRFG 2VONA 1WI9A 2GXBA 2Q97A 1NGIA 4RTFD 2FBIA 3C7NA 1BA1A 2IVOA 4A12A 5E20A 1J7KA 2HOEA 1TYQB 1B9NA 5BMZA 3IRRA 1DDNA 4N9HA 1ATRA 2FBKA 2QWNA 4LK0F 1EH8A 1YW8A 3GWZA 5LGNA 1BI1A 1G6NA 4U7BA 3P7NA 2IJLA 4PKIA 3EUHA 3LDQA 4LG0A 2CYYA 2P9UB 4AIJA 1MDMB 4BRGA 2PMHA 1ON2A 3P4IA 4AIKA 3T5XA 5ICCA 1OYYA 4GCVA 3F8FA 1B6AA 3TO7A 5ICGA 5JR3A 2WUSA 5FPEA 2W25A 3EETA 2A07F 1F1ZA 3WXKA 3KEQA 3IMXA 4ENNA 5FD6A 1VTNC 5ELZA 3T1BA 3VODA 3VEPA 2FRHA 3I4PA 3GXOA 4IJAA 3SZTA 4MNUA 2OZUA 3GFJA 1I27A 1X3NA 2ZMEA 4RAZA 3WUHA 1CF7B 3U2RA 2F9TA 2E88A 5DCMB 2LSOA 5ICEA 2FBHA 2HTJA 2L02A 1QHAA 1B4AA 1Y64A 3CJAA 5I9EB 1IN8A 1H9GA 1KGSA 4Y15A 1ESVA 2P9LB 4BQLA 4ISEA 1XGOA 3GZ6A 2FSNA 4R79A 3H3ZA 4DNCA 1W7PD 2V1DA 1R1UA 4JD2B 3VENA 2ZNZA 2HQNA 2KHOA 3UB5A 2NS0A 5L3FA 3EL2A 2ESHA 1ZLKA 3B02A 2XUBA 2H27A 3FM5A 3W6KB 4ESFA 1IW7F 4OOIA 5D5VB 3BPVA 5HS7A 2OZ6A 4IF4A 4FSVA 2XROA 2F2EA 3ULEA 4K43A 1SD7A 1KU9A 3KP6A 3ZN1A 1FBSA 3F6OA 2CGJA 5CVIA 2FU4A 4WXDA 4JBAA 2OAZA 1XB4A 4BH9A 3DXJF 1QZZA 4ZYGA 4UUVA 3EN9A 3LQRA 1XSDA 2B0LA 2RNJA 5DD4A 4DCHA 1R00A 2NAZA 3TDZC 3IWZA 3I53A 3VFZA 3JTGA 5BPIA 3WTUC 2P4WA 3ZMZA 3E5XA 4BNCA 1XC3A 4O8KA 3WQUA 4QLCU 4BVOA 3GFIA 2EA4A 3FXUA 2HR3A 1NGJA 3SHFA 1GXPA 3DV8A 4EHUA 2UWMA 5BR9A 5DYMA 4EGYA 3FZKA 4JK1X 1LDDA 3V7RA 1ZGAA 3W3DA 2DO7A 5LEKA 4GYIA 3LDPA 2MH2A 3RDIA 3BROA 3ABUA 5BN9A 2MLKA 3EKUA 5LEJA 3ULQB 1R1VA 3SLCA 1R22A 3ENHA 2YX4A 1NGFA 1NGDA 3VEOA 1SFUA 1NGBA 5LY3A 4WQ4A 2VBXA 3EKSA 4RB0A 5F6FA 3SXYA 4BRFA 2PFBA 1BI0A 4PGHA 5D8LB 3CETA 1E4GT 5EXWA 2QUFA 4NB4A 4P55A 1FYMA 2WC2A 4LLGF 3RKWA 4KMFA 2IPQX 1TUYA 2PEXA 4FWSA 4UNOA 1BI2A 3HRMA 5L3BA 1HKSA 2P5VA 3DAWA 5LJWA 2Q31A 3K0LA 5KQDA 5EEGA 4XEIA 4EM0B 1RNLA 2XAGA 3WGHA 2V7YA 1LEBA 4L5IA 3T8TA 4CHUA 1HKGA 3QU6A 5J6XA 2MA3A 3CUQA 1YW7A 3QICA 1U6GA 3JXUA 5AQSA 3GEZA 1K78A 4GYGA 2LNBA 3DF8A 1U2VA 4WWCA 5ERIA 4F9OA 2FNPA 2AP1A 4H0OA 2QQ9A 3BJOA 1IF1A 1R5HA 4YIFA 1P6RA 1RUOA 3KP3A 1IUYA 2P9NA 1U5TA 4LGWA 1ODDA 4XH1A 4P9FA 1G3TA 1D8JA 4WQ5C 2IW5A 2BGCA 4KYWA 2DLLA 4H0VB 3HRSA 3TPQA 2P9PB 4M9XA 1ZRCA 4FT8A 3HSRA 3U1DA 1TW3A 2O8XA 3ECOA 4H0TB 1J59A 1KAZA 4XRFA 1Q18A 4U0YA 3SQNA 4MQVA 5EEHA 4LC9B 5KPZA 5TRDA 3FXRA 3O2PE 4HQMA 2ASPA 2KIUA 4RB1A 2IVNA 3O6BB 3QPTA 4FWQA 3HSEA 2Y0MA 4CJ7A 3H6EA 3QFPA 4OIPF 1T6DA 1G3SA 1BOAA 2CSOA 1HKCA 4LK1F 2PMUA 5AQGA 1O3TA 2GA1A 3HRUA 1J6ZA 2FSKA 1BIBA 4HX7A 5DEQA 1LQ1A 2F5DA 3ABTA 2L01A 1EQYA 2L4AA 1C0GA 1ZH5A 4BRLA 4UV8A 4BGBA 4CZFA 3VGMA 1TBXA 1S6LA 5BPMA 2EFWA 5LHGA 1USSA 2Z33A 3C7NB 2GWJA 3JTHA 3HTSB 1Z1DA 3V8LA 4BAYA 2JRTA 4R1HA 4XLNF 3K9TA 4M9SA 2MBFA 3Q5FA 4XH5A 2R7DA 2PJPA 4BRCA 1YG2A 2D1KA 2Q1NA 2H09A 3DJCA 3DXMA 5AQIA 4ETSA 2VOOA 1EV7A 2V6CA 3MMVA 4LG0B 2E1NA 5CVVA 2E1YA 3LFKA 2CH5A 1MJAA 3VF6A 4HAMA 4EMSA 2KRFA 4TV7A 2XHKA 5CVUA 1TQIA 5FFZA 4AD9A 2STWA 4NB5A 3N97A 2CGKA 4EVIA 3BF3A 4A2UA 2PLYA 1P4XA 2PBIA 3D0SA 2A61A 5LHIA 3KLNA 5LBQA 2IT0A 2ZF5O 2QBYB 4L0YB 1YQAA 2RVCA 1JHFA 4RWTA 5CE3A 2ZMEB 1Z9CA 1BIAA 3D7EO 1RUNA 3FLCO 3S2WA 2E7WA 2P6TA 1NMDA 2EFOA 1RI7A 5K5RA 3E6BA 4FWOA 3BJAA 2OA4A 3R60A 4EHTA 1KQ8A 2IA0A 1KU3A 3QB0A 3RPUA 4Y0WA 1P8ZA 1P2FA 2Y48A 2ZWHA 5LLQA 1ONVA 3JS6A 3J80K 4S05A 3MFKA 1G99A 1NGEA 2FA5A 3AY9A 2QQAA 3NEUA 4DQ8A 1KQ0A 3GDQA 2E2PA 3TOBA 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5DUKA 1FNNA 4IVNA 3ZQ7A 3AAFA 5E1XA 2QM3A 2CFXA 3WTWC 2FNAA 3COAC 5D5WB 1WSUA 3CERA 1ZG1A 3F8NA 3L7WA 3ZMVA 1EH7A 1IRFA 3CUQB 1Z05A 4HOBA 1K78B 1MA9B 5E8GA 5HLIA 3KP2A 1U2VB 2J5PA 1U78A 4J8FA 4NO7A 3U4LA 2EV0A 2VT2A 5HDGA 2BTFA 2QVOA 5JFRA 2F9WA 1R59O 4G8XA 4LB5A 4QS8A 2CO5A 1JGSA 2VBYA 2P9NB 4MGRA 1U5TB 4BREA 1FYLA 2HFHA 2E2OA 2M45A 3KCCA 2V79A 3FFKB 5IT9Z 1JCGA 3QU3A 4ISGA 4QS9A 3GOIA 1XGNA 4BR9A 2XVCA 3IHUA 3AAPA 2YI1A 3OV8A 3RIRA 2FF6A 5AFUH 4F7ZA 2ASOA 5D5UB 3HSFA 4HF0A 1IJJA 3KHYA 4WQ4C 4P96A 5CLSA 1KXPA 1MWKA 4C23A 3PFIA 2EWNA 2VCPA 3CIPA 4WF2A 5TJJA 3ZETB 4RGRA 3EYYA 2UYTA 4ZYHA 4MTDA 2ZFWA 3BP8A 3O3KA 5FFXA 3WTYC 4CXFA 2DK5A 2A42A 3P9KA 4B1ZA 5DD8A 2H6BA 4U0WA 1ZGJA 5KVRA 5AQVA 3V4GA 4JN4A 3ZEUA 1G4DA 3CO7C 3Q9VA 2A41A 1PUEE 2E1ZA 2GAUA 1R36A 4WXCA 4Q5SF 2V9VA 4Q47A 3SMPA 2FEZA 4CBUA 3KE2A 3A5OC 3M8EA 3FM3A 2HWVA 2FF4A 3MCZA 4IRHA 4FO0A 3FR0A 4WXHA 2QWPA 2YCHA 3K1MA 3E97A 3DQVC 2M30A 3F72A 4RS8A 3DXMB 4H0YB 3HI0A 2E1CA 1BOTO 4U88A 3L6QA 1HSJA 3IFRA 1FPQA 2DTRA 3F9MA 1U8RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1V4R A;  2HYF A;  3VF2 A;  4CZK A;  1STZ A;  2D4W A;  4PGG A;  3MCP A;  3L9F A;  3WGG A;  1K6O A;  2VBW A;  4JAX A;  4CBW A;  5AQK A;  1SFE A;  5HOO A;  1GLC G;  4I01 A;  5CVJ A;  2QWM A;  2W85 A;  1DUX C;  3M1F A;  3KP7 A;  3J8A A;  2GWK A;  2DAO A;  2G7H A;  1TLH B;  4JNE A;  1ZXO A;  1FYK A;  5HLG A;  1J2X A;  4CIC A;  4GGG A;  2A68 F;  4FPA A;  2FXU A;  2QW9 A;  3BDD A;  3BOQ A;  1K8K B;  2UXN A;  3ZX0 A;  2WV0 A;  1J9I A;  1S29 A;  4ENM A;  4CZL A;  3IDH A;  3FMS A;  2YU3 A;  1E4F T;  4M74 A;  4ASN A;  3B73 A;  2V51 B;  4HWI A;  4CZE A;  2D1H A;  3E6C C;  3Q9S A;  4FWN A;  2JPB A;  1S7O A;  1BC7 C;  2QBY A;  2XAJ A;  3F8C A;  4BRK A;  5AQR A;  1ZAO A;  5AQY A;  2QQB A;  3MZH A;  4KFC A;  4DQ2 A;  3WTX C;  5J8F A;  4H0E A;  3U8X A;  4Q48 A;  3REO A;  3WGI A;  1PP8 F;  3RSE B;  5F2R A;  3CUQ C;  1S7A A;  1YTY A;  4IXC A;  2ISY A;  5AQJ A;  1SMT A;  3WTS C;  2BBY A;  1MWM A;  2FML A;  4M9Z A;  1P92 A;  4N9I A;  3LA2 A;  1T44 A;  4CBX A;  1Z6R A;  2GQQ A;  2CGL A;  1FOK A;  3K1P A;  4HBL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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