3BP8A

Crystal structure of mlc/eiib complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
396
structure length
381
Chain Sequence
DQIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVREMLEAHLVQELEVGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDSPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Analyses of Mlc-IIBGlc interaction and a plausible molecular mechanism of Mlc inactivation by membrane sequestration
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative NAGC-like transcriptional regulator
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
total genus 103
structure length 381
sequence length 396
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3bp8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A03
5D5XB 1QQOA 3IRQA 1MJBA 2A07F 2NS0A 4H5WA 1AWCA 1FX7A 3K2ZA 2HZTA 4UV9A 1BUPA 5D6EA 5JLHA 3HIFA 3KLNA 4BRMA 2MD5A 2LDUA 3BPVA 4HX4A 4U0WA 3WTXC 4WQ5A 3WTVC 4ZH4F 4FT8A 3ZX3A 5KPTA 5CVIA 3U9DA 2YHXA 1IJJA 3LL3A 3P7NA 4K41A 4BG8A 3F23A 1T6SA 3NEUA 4WCGA 1T0FA 1C0FA 3RIRA 4R8HA 1SFEA 4E70A 2F9TA 1EV7A 3WG9A 3VEYA 3M3ZA 1I27A 3BF3A 2KRFA 3IWFA 1PUEE 2BBYA 2YX4A 3WTYC 3AAFA 2E88A 3GFLA 3VEOA 5ADXH 1D5VA 2V9VA 2QW9A 2CWEA 4PGGA 2P9IB 1YW8A 3HSEA 2JRTA 5H6QA 2ZGZA 3I64A 3E97A 4HQMA 2RC4A 3FFKB 4Y15A 5CJ9A 2IJLA 2DPUA 1IN5A 5FPEA 4XRFA 3CJ7A 3QP6A 1B4AA 4EJVA 3GLXA 4M72A 1S29A 1JCGA 2Z99A 2P9UA 4H0XB 2L02A 5H6RA 3H3NO 3ECOA 4PDKA 1MDMA 4P96A 2FRHA 2A69F 3LDLA 4ON0A 1XSDA 3GFMA 5LBQA 1FSEA 1ZC6A 1HW5A 2KKOA 2V7YA 1W5TA 5JI6A 4BR7A 4IF4A 1P4AA 5FPDA 5KPZA 3QPTA 4HLYA 5ADXA 4BRLA 2HTSA 4ZYGA 3EN9A 4B1ZA 4ISFA 1GXPA 2VN2A 2D0PA 1IRFA 4HV6A 1EH6A 1W7PD 2RNJA 5HDNA 1U6ZA 1MJ9A 3F22A 2ZO4A 4H5NA 2DK5A 2ZF5O 3K0LA 2OZ6A 1KAYA 3A0IX 2FEZA 3VOVA 4DQ2A 2RGVA 3B8AX 2RKHA 2ZCWA 2R7DA 2GWKA 3WXIA 3DEUA 5E1ZB 2EK5A 3MCZA 1LVAA 2P9SB 1IF1A 2A3ZA 1OR7A 2K7LA 2NLXA 3ENHA 4H5RA 3BZ6A 5CVRA 2CGJA 2XAFA 3LA3A 2FBKA 2XAJA 2QWQA 4TV7A 4MO4A 2E7XA 2MH9A 3IKTA 2EFQA 2QENA 3F8FA 5L3BA 1T6CA 1USSA 1WRJA 2COMA 1TW2A 1YAGA 3WE3A 5I9EB 1G3SA 4P9FA 1P6RA 1I5ZA 2IT0A 2EA2A 1ESVA 4Z94A 1QBJA 5E8IA 1HSJA 3UKUB 1FBUA 1LB2A 5ICFA 1SQKA 2XAGA 4G9YA 3KZZA 4BR9A 4ZYHA 1GVJA 5E17F 1IZ1A 2P9KB 1HKQA 2GEMA 4ESFA 3V8LA 2EFOA 1K6OA 4EIAA 4KA4A 3BROA 4GYGA 2P5VA 4RAZA 1R1VA 5DDGA 3L09A 2Y0MA 3WT0A 5K5QA 4PGHA 3D2FB 3WGHA 2Q2RA 3CJNA 4BRGA 3L2CA 3WE2A 3P9KA 2ZJ2A 1MDUB 4CI6A 4MTDA 5F2RA 3KEQA 2VONA 4IRIA 3U2RA 3FE1A 2HEOA 4FWOA 3RI4A 3HHGA 3WTTC 3H3OB 3MN9A 2YSRA 4ZZLA 2HF3A 3BPXA 1F9NA 1Q1HA 1QZ6A 1GLDG 2EV5A 4RCHA 2WWYA 3K1MA 2QM1A 4WXHA 3UKRB 3JW4A 2K4BA 4BHBA 4NQWA 3WXLA 1LDKB 4NB5A 2GQQA 2YU3A 5F0XA 1YTYA 2P9IA 1FY7A 3IC7A 3RKYA 3CO7C 2YHWA 3UE5A 4PKHA 1BOAA 3F8CA 3I5UA 1HW2A 1J0RA 3LQRA 2JPBA 4B1VA 2F5EA 4HX8A 4OIOF 5D5VB 4IJNA 5DD8A 3C1DA 4IHTA 4IHSA 3TKYA 3KHYA 2FNAA 1FYLA 2P9LB 3VGKA 3DPTA 1HKGA 5FPNA 5AR0A 3GWZA 3RPQA 4BRAA 1IG8A 4ZZDA 1H9TA 4KMUX 4U0YA 2DPDA 3ZMDA 3L7WA 5JR3A 3RYPA 4FHTA 1D8KA 2A68F 2KJBA 2XKPA 4BRFA 5J6XA 4XSZF 2QVOA 4AD9A 4M74A 4EFHA 4ENJA 3D5LA 5F64A 4HWIA 2YCHA 4CZFA 1BI2A 3M9AA 3CQYA 3VEXA 5HS7A 1B9NA 3LWFA 2HWVA 3GZ6A 3L00A 3HRSA 3QICA 2DO7A 1BJAA 2W41A 1X9JA 1B9MA 4L0ZB 2P9SA 3I71A 5AIQA 4A6DA 1BBYA 1DDNA 2E1NA 2ISZA 4M63C 2MA3A 3WTWC 4G6QA 2V52B 2NAZA 5LJVA 4A0XA 5IT3A 3MEXA 3HTUA 2QWMA 1O7LA 2D45A 3RPUA 3WU1B 3KP6A 1W5SA 2A6EF 3F3XA 1S3XA 5BREA 4WXCA 4B09A 2VXZA 5LRSA 4HX7A 3FXUA 4WQ4C 4B1WB 1JHFA 3LAJA 3C7NB 2H6BA 2VBYA 1IN4A 4BRDA 3GF2A 1XQSC 3GFJA 4S04A 1JXSA 2E1CA 1Z91A 3O4WA 2HKXA 4B1XB 3FZHA 3UKUA 4BRIA 4CZIA 4R1HA 1I1GA 3ULEB 4CZMA 1H0MA 1QQMA 3MZYA 2XROA 4K42A 1ZBSA 2JSCA 2ZNYA 4YIIA 1DUXC 1YO5C 1IW7F 3R61A 4JK1X 4O5VA 4UV8A 5HLHA 1U5TC 5BS6A 5AZJA 3BJ6A 2V1UA 3SFZA 4JQFA 1J9IA 1ZYRF 4BR4A 2DK8A 5BPLA 5FGMA 2PMHA 2V1DA 4PKGA 4LD5A 2M45A 3QOPA 5DEQA 4BH9A 1J75A 3VERA 3H46O 2BGCA 4GCVA 4KBOA 3HSFA 5ERIA 4NO7A 4XLPF 2FBIA 4EM1A 4CZHA 2PI0A 1XGOA 3HHHA 4ENNA 3FMQA 1BIAA 4KFCA 2BUPA 2W40A 3P4IA 2VOPA 3UKRA 4A2BA 2HDCA 2D1VA 3E6CC 1IXRC 2ZMEB 1FSHA 5HS9A 4HF1A 1QQNA 3E5XA 3WU0A 3EL2A 3E5UA 3B73A 3KFWX 3HRTA 3ZMSA 1SFXA 1BA0A 1ATSA 4HAMA 1IUYA 1E4GT 2I7PA 2P5KA 2RDPA 1U2WA 4I09A 3VODA 2XUBA 3IDHA 3MK6A 2JT1A 2RQPA 3IHUA 4BQZA 2XKOA 3A5MC 3T1BA 5EVZA 2GXGA 1FBQA 3VGMA 3FZMA 3FM3A 3V8KA 3SK3A 4GNIA 3JTHA 1TNTA 5DYMA 2P9LA 4KT5C 3VENA 3TO7A 2OD5A 1U3EM 3O8MA 2BEOA 4U0VA 2OU2A 4RGSA 4NHJA 1T44A 2F5DA 3DFGA 4L18B 4FX0A 4M6YA 5AQZA 1J7KA 4MHGA 2FF6A 3B02A 4BR0A 1F1ZA 1R5GA 4MTEA 4OMYA 1YFHA 1JGSA 3V7CA 1XCVA 5FFXA 4RB1A 1SZ2A 3J8AA 4IRHA 2Q1NA 3ISPA 2XV4S 1O3RA 5BRHA 5AQLA 4OIPF 3FLCO 1HKCA 3I54A 3T8RA 3DQVC 4EQQA 3GE1A 4KN4X 3I4PA 3FGUA 6PAXA 1NGIA 2VT3A 4JN4A 1Z9CA 4RGRA 3AAQA 3ZN1A 3W3DA 2X4HA 4Q5SF 2CO5A 5D4SA 3COAC 2UZKA 3ZPLA 4KIFA 1U2VB 1EQYA 4UVBA 1R1TA 3U9GA 4BNCA 4FSVA 2OQRA 2G7UA 1ZXOA 4H0EA 3C7NA 1FZPB 4H0TB 1RI7A 1S7AA 4R79A 3TU5A 3I59B 3J7AO 3LM2A 5E1WA 1K78B 3F9MA 4AIHA 1TUYA 1R00A 2XAQA 3HBTA 2G9WA 3FWEA 4CJ7A 1VTNC 4A12A 5DD4A 4ISGA 3ULEA 2L4MA 5F1XA 4XH4A 4KIBA 1NGFA 2W25A 4CBXA 5AQSA 3RDIA 5BRDA 1Z6RA 5AQUA 4A62A 2FSKA 1R59O 1Z1DA 1ON2A 4DHYA 1MD0A 4A2UA 3WGIA 2Q0OA 2I7NA 4BVOA 1O3SA 5LRRA 3TQNA 4WF2A 4XSXF 2NZTA 5AQMA 2XGXA 2VBXA 5BOXA 3HZ6A 3HOTA 3ERED 5DCMB 2DTRA 4LC9B 2ESNA 3BP8A 2CW0F 3CIPA 1D4XA 1FT9A 2P6SA 1TQIA 4YDUA 5HS8A 1HW1A 4A0YA 3R60A 4RTFD 2K02A 4GY2B 3WEEB 2QWWA 4MQ9F 3VEPA 2DLLA 3EETA 2JZYA 1EH7A 2ZMEA 3FZLA 2ZKZA 1ZG1A 3FZKA 2IA2A 5FD5A 2DI3A 5ILUA 4RB3C 1SAZA 3U8XA 2EJRA 4L9VA 4HQEA 2PMUA 1DPUA 1S22A 2P9PA 2ZXJA 1NGBA 4JBAA 4CZGA 3BWGA 5D5UB 1FWZA 2QQAA 2A5XA 3ZEUA 2Z9OA 1MWMA 2ZNZA 3E6MA 4FWKA 1BA1A 4AVPA 3QBWA 5K5RA 3GBTA 4Q47A 3CUQA 3GL1A 1R58A 3WODF 4HBLA 3LDOA 1TQMA 4P9UA 4BR5A 2LF8A 2JPCA 1SD4A 1FYMA 2L01A 2MH2A 1KAXA 4P5OA 4ISEA 3SJHA 2AA4A 1YS6A 2F9WA 1RNLA 1ZLJA 5EOYA 1X3UA 3VEVA 3D2EA 4OINF 4LLNA 2E2QA 3HM8A 2E1YA 3GUDA 2HYGD 3TO9A 3R6SA 1OPCA 3JTGA 3FR0A 3DJCA 2J4RA 3BJAA 2F2EA 1ZGAA 1LDJA 4FL9A 3L0QA 2M5WA 4UUVA 3DWLA 3GFIA 4Z2YA 4XLNF 4O3MA 3ZETB 2VWBA 2D2WA 3HYIA 1OKJA 3Q9VA 4BRNA 1NBWA 3FHZA 2UYTA 4KMFA 5L3DA 5FO5A 3TPQA 4CZKA 3S2WA 4LK1F 2CGLA 3F8BA 3WGGA 1I1SA 1R23A 3F8NA 3FZFA 2AXLA 4PL8A 1IXCA 3CQXA 2EWSA 3HSCA 4P55A 3I59A 3REOA 4OIRF 3MCPA 4DQ8A 5ICGA 1ZRFA 4LG0B 1K78A 3H1QA 3H3ZA 4GO1A 1KQ8A 3CJCA 4KUMA 5BMZA 4CBUA 1J59A 2OA4A 1GLAG 2WC2A 1B1BA 2FSWA 1R1UA 2GA2A 1Y64A 3ECHA 2UWMA 1HX1A 3W0LA 3R4KA 2CH5A 1BI0A 2F5FA 1H9GA 3KP4A 1HKTA 3A5NC 4AM6A 1CGPA 3DP7A 4G6DA 2O03A 1REPC 1ON1A 3LM9A 1FBSA 2YR2A 3CJBA 1FP2A 1QZZA 3TOAA 4BROA 3HOSA 3IWZA 4EHUA 2CQKA 2E2PA 2KIFA 3DXJF 1X3MA 2O0YA 2FLOA 5AQOA 5KVRA 5DCMA 3CERA 1TNSA 4BQAA 2Q36A 1BO5O 1NGGA 3E5QA 2DQRA 1ZARA 4HA8A 4BGBA 1ZGJA 4B1YB 1G6NA 1NHAA 1KXPA 2E7WA 1BI1A 2ESHA 3WEEA 3GDQA 2P7CB 4WX9A 5JMVA 4EJWA 4LLGF 2PLYA 3BDDA 3I33A 1BOTO 2IVPA 2FU4A 4IWVA 2EWNA 3ZN0A 3DKWA 1MA9B 1XSXA 4CDGA 1TLHB 2VC1A 1HKSA 5E20A 4FPAA 1HKBA 3VGLA 3F21A 2MC3A 1IN6A 1OYYA 3F8MA 5JHUA 3R6MA 1E2XA 3SHFA 2FE3A 4XEIA 3IKVA 4ASNA 3F6OA 2HF4A 2H3GX 5L3GA 4MEYF 5E1XA 4OMZA 2G7HA 3V4GA 5BN8A 1T39A 3HTVA 2CGPA 4CBWA 5BPIA 3R8EA 2VODA 1SMTA 3LDNA 1QQIA 2J5OA 4I0BA 3LAPA 4HZFA 4PZJA 1FPQA 2IP2A 4L5IA 4I7HA 2KJCA 5E84A 3WQTA 1JCEA 3Q5FA 1OKRA 5IT9K 3QBXA 3O6WA 2E2NA 2ZFWA 3ZMTA 1MJAA 1UHWA 4FWMA 3L4IA 3MWMA 3FXQA 2W24A 1SD7A 1XSVA 2O8XA 1U78A 5BPDA 2FQ3A 3G25A 4A5MA 3ZETA 1LEAA 3H92A 3LFKA 3BOQA 4E1JA 2VE8A 1WWXA 1S7OA 2PN6A 1K7AA 2EFNA 3GEZA 5AQFA 1GLBG 2H27A 2VE9A 1BI3A 2A3SA 3O2PE 2ZWHA 2V6CA 3ZP5A 4M73A 4UXNA 4IO8A 1S8NA 5D6FA 3RSEB 2K86A 1DKGD 1XMKA 1JE8A 3DXKB 1GHCA 2IRFG 1UFMA 5HDGA 3DXMB 3LDPA 2PJPA 3AARA 1T6DA 3KVGA 5BN9A 3I58A 2OBPA 2QQBA 3SQNA 1RZ4A 1NMDA 3QB0A 5CE3A 1IAWA 4ZYEA 1T2KA 3EQLF 1KU3A 2Y48A 3QAHA 1PP7U 3KEOA 4CHUA 3J81K 4YIFA 2YPRA 3CETA 3O80A 3H3UA 2D4WA 2Y75A 1GLCG 2BTFA 5KK1A 4H5TA 4N0BA 2XIGA 3V8JA 2D0OA 3EYYA 2VCPA 4FWLA 1D3YA 3GO5A 2FSNA 5K1YA 2QWPA 4BRKA 2QBYB 2UXXA 5BPNA 1E4FT 4WWCA 1OYIA 2P5LC 1XMAA 2P9KA 3TDZC 3FMRA 4EV0A 1GLLO 5CLSA 4A0ZA 3U4LA 4EAHD 2ZGYA 4YFNF 3EUHA 5EEHA 5CVUA 2A41A 3VF6A 2QYOA 1KU2A 2EV0A 3D2FA 4RGXA 4H0VB 4FWSA 5ICEA 4KYWA 2ZBKA 5ELZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5D5X B;  1QQO A;  3IRQ A;  1MJB A;  2A07 F;  2NS0 A;  4H5W A;  1AWC A;  1FX7 A;  3K2Z A;  2HZT A;  4UV9 A;  1BUP A;  5D6E A;  5JLH A;  3HIF A;  3KLN A;  4BRM A;  2MD5 A;  2LDU A;  3BPV A;  4HX4 A;  4U0W A;  3WTX C;  4WQ5 A;  3WTV C;  4ZH4 F;  4FT8 A;  3ZX3 A;  5KPT A;  5CVI A;  3U9D A;  2YHX A;  1IJJ A;  3LL3 A;  3P7N A;  4K41 A;  4BG8 A;  3F23 A;  1T6S A;  3NEU A;  4WCG A;  1T0F A;  1C0F A;  3RIR A;  4R8H A;  1SFE A;  4E70 A;  2F9T A;  1EV7 A;  3WG9 A;  3VEY A;  3M3Z A;  1I27 A;  3BF3 A;  2KRF A;  3IWF A;  1PUE E;  2BBY A;  2YX4 A;  3WTY C;  3AAF A;  2E88 A;  3GFL A;  3VEO A;  5ADX H;  1D5V A;  2V9V A;  2QW9 A;  2CWE A;  4PGG A;  2P9I B;  1YW8 A;  3HSE A;  2JRT A;  5H6Q A;  2ZGZ A;  3I64 A;  3E97 A;  4HQM A;  2RC4 A;  3FFK B;  4Y15 A;  5CJ9 A;  2IJL A;  2DPU A;  1IN5 A;  5FPE A;  4XRF A;  3CJ7 A;  3QP6 A;  1B4A A;  4EJV A;  3GLX A;  4M72 A;  1S29 A;  1JCG A;  2Z99 A;  2P9U A;  4H0X B;  2L02 A;  5H6R A;  3H3N O;  3ECO A;  4PDK A;  1MDM A;  4P96 A;  2FRH A;  2A69 F;  3LDL A;  4ON0 A;  1XSD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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