3BP8A

Crystal structure of mlc/eiib complex
Total Genus 103

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
396
structure length
381
Chain Sequence
DQIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVREMLEAHLVQELEVGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDSPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (13-28)AH3 (44-57)AH2 (33-40)TIV3 (63-77)S1 (60-62)TIV2 (58-61)S3 (85-92)EMPTYS2 (78-80)TIV10 (173-176)TIV4 (93-96)S4 (96-103)TI2 (103-106)S5 (108-115)S8 (163-166)TIV5 (117-120)TVIII1 (120-123)AH4 (124-139)S6 (145-153)TIV8 (168-171)TIV6 (140-143)S7 (156-158)TI4 (158-161)TI5 (159-162)TIV7 (167-170)S14 (373-375)TIV11 (177-180)TIV9 (170-173)AH5 (180-185)AH9 (309-333)S9 (190-194)AH6 (195-205)TIV12 (207-210)TVIII3 (212-215)S10 (215-220)S11 (224-230)TIV13 (220-223)TI6 (244-247)TIV16 (237-240)TIV17 (238-241)S12 (233-234)TIV18 (245-248)TVIII5 (249-252)TIV20 (257-260)AH7 (271-280)TIV24 (266-269)TIV27 (281-284)AH8 (297-306)S13 (337-341)AH10 (348-362)AH11 (365-369)TI1 (82-85)TI3 (139-142)TII1 (209-212)TIV19 (251-254)TIV26 (280-283)TI7 (342-345)TI8 (379-382)TIV1 (28-31)TIV21 (261-264)TVIII6 (335-338)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
publication title Analyses of Mlc-IIBGlc interaction and a plausible molecular mechanism of Mlc inactivation by membrane sequestration
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative NAGC-like transcriptional regulator
total genus 103
structure length 381
sequence length 396
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3bp8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A03
3U1DA 5F2RA 4CZHA 3P9KA 2GTDA 2GWJA 4BG9A 2V1UA 2B0LA 1PUEE 4IRGA 1K79A 2CGLA 4BR5A 1IXCA 1HSJA 2HTJA 1RIOH 2HWVA 2H27A 4AM7A 5BPNA 3QAHA 3I59A 1SZ2A 3SLCA 2BBYA 2J5OA 2GWRA 3SFZA 4NB4A 2VT2A 4G9YA 1XGNA 4A5MA 2P9KB 1FY7A 2FSJA 1XC3A 4PDKA 2CW0F 5F64A 2PAVA 4XEIA 1BA0A 4WQ5A 2FXUA 5AFUA 3V7RA 4A2UA 3RYPA 3LA3A 1IN8A 2PMUA 1R23A 2FSWA 2DO7A 1KQ8A 3FGUA 3U9ZA 4MGRA 2DK5A 4JD2B 2W25A 4Z94A 5ICGA 1HW1A 1QQMA 4Z2YA 3MN7A 3I53A 1JXSA 2R7FA 4CD1A 5CVIA 5DYMA 2QWMA 3R4KA 5HVQC 4I0BA 5KPRA 2E7WA 4H0YB 1SAZA 4B9QA 1PDNC 2D1KA 1NGEA 4YFXF 5EEGA 3UKRB 3RKWA 4YFKF 2PN6A 2QM3A 5E18F 4BROA 4ZZDA 3H3UA 4BC2A 2RVCA 2W57A 4WQ4A 1MJAA 5LBQA 2HTSA 1ZG5A 3JXUA 2Z5UA 3FZKA 1GLLO 3L09A 3N4MA 3CQXA 3PQJA 4A12A 4EJUA 4CZLA 2LF7A 5F1XA 3V7SA 5FB2A 4EVIA 5LJVA 2Z99A 2Q1NA 2MH2A 3O08A 5AIPA 1WRJA 5HS7A 2FU4A 2RDPA 1IN5A 3C7JA 3GYHX 2H6BA 4LD5A 2W84A 2QENA 3UE5A 2W85A 3WGIA 2ZJ2A 4UVAA 2A40A 2Z9OA 4BRGA 1ZRFA 3CO6C 2WUSA 3GZ5A 1BUPA 2XAHA 1MWKA 2JSCA 3JAMK 3KFWX 3R6MA 1R58A 1GLJO 4BQAA 3VGKA 2ZXJA 5F6FA 4NQWA 1XB4A 2QZ8A 2ZMEB 2W40A 5ED4A 3MZHA 1ZRCA 2UXNA 4BG8A 4FPBA 5EY4A 1RUNA 4CZJA 2BYVE 4BAYA 4H0EA 4RB3C 2HDCA 3ABUA 4U7BA 4ASNA 1TW2A 4GY2B 4RB0A 2NRAC 5EX5A 3FZMA 1JHHA 2J5PA 3E3VA 1QQOA 1ATRA 4H0VB 2DI3A 2FQ3A 4H03B 1SD7A 4ENKA 5E20A 4GGGA 4I09A 3KZYA 4BH9A 4Y13A 3VEYA 4CZIA 1GLCG 2YHWA 3HTVA 2WWYA 2RQPA 2PMHA 1YLFA 2QWWA 2FF3B 1YFHA 4GNIA 3J8AA 2EA4A 3HIFA 3JTGA 4PL7A 4LC9B 4BRFA 2I7PA 3TOBA 3KP3A 1NGJA 1NGBA 2XKOA 5TRDA 4I7HA 3VPZA 3V4GA 3FR0A 4IJNA 4CZEA 2CWEA 3HZ6A 5AQWA 1XDSA 4AD9A 4BRLA 4KIBA 1MZBA 1FLIA 3R8EA 3I54A 4U88A 1FBUA 1W4MA 1G6NA 4MTDA 4B1WB 5IT9K 2Q97A 1HKGA 1TBXA 1ONVA 4YFNF 1HBXG 2VBYA 3DWLA 2A5YB 4CD3A 5IT3A 4JHDB 5BS6A 2Q0OA 1IW7F 1QZYA 2ITMA 4OIQF 3V8JA 2K02A 3OOPA 4BRNA 3BJ6A 1DGKN 2A3SA 5AQNA 3BY6A 3R60A 1XCBA 3MAJA 4Q4ZF 4EJWA 3RJPA 1C0GA 2KHOA 1T6CA 5LGNA 1ON2A 2UWMA 4ZYHA 5LHHA 3GXOA 1GXPA 1BWFO 4EV0A 3IFRA 4KN7X 1E4FT 2L02A 4N9IA 3ZN1A 3IL2A 2OANA 4OU0A 5D5XB 4XH1A 3WXIA 1P6RA 2ZNZA 3HSRA 1CGPA 3GL1A 5CVJA 1XMAA 3DFGA 4K25A 1C0FA 4BRCA 1ATSA 4WCGA 3E6CC 2PBDA 3GW2A 2OU2A 4EIAA 3LSTA 4RB1A 4KN4X 1GVJA 1BI2A 4WQ5C 3U9DA 2DPDA 4O5VA 1IN4A 3L0QA 4AWXB 5JI6A 2BV6A 4U0VA 4D0PA 4QWQA 3E5UA 3FZHA 2CYYA 3Q9SA 2ASMA 4DCHA 3MWMA 4FOEA 3CJAA 2K4BA 5LEKA 1R00A 4QLCU 2EV5A 1YS7A 3GLXA 5L3BA 4KMFA 3K69A 2EWNA 3G25A 1KU9A 3WUHA 5D5WB 1KQ9A 5HS8A 1H9TA 2IVOA 4HF1A 3I8BA 5J6XA 2STWA 2BE5F 3CJ9A 4WQ4C 5DV5A 3I71A 5AQGA 5JHUA 2ZF5O 5AQMA 4BR2A 3FLCO 5AZJB 1J7KA 1GLFO 4DB3A 2NAZA 3J7AO 2P9IB 2D1VA 3GFLA 5DUKA 2E2QA 2EV0A 3ZX0A 2PEXA 5CVVA 4R1HA 2IVPA 2O3FA 2RNJA 4L9JA 4ISEA 1OYYA 3P9IA 2IPQX 3V7CA 4A0YA 4G6DA 3DXKB 1TQIA 3T8RA 2KIMA 2DPNA 2FE3A 3PQKA 2Z33A 2QM1A 2RN7A 3ZP5A 2UXXA 5DEQA 3SQNA 3H1QA 1QZ5A 1WOQA 2DBBA 1BI3A 4OIOF 4CDGA 5L3CA 4LK0F 2EFNA 4BRMA 2CFXA 3CERA 5E26A 3A5OC 1FYLA 3HRSA 4KIFA 3VEXA 3GF2A 1MGTA 4A6EA 2WV0A 2ZNYA 1GXQA 2D4WA 3TO6A 1R1UA 2K27A 2I7NA 3DPTA 3D2FA 4JAXA 2ZGZA 3WU1B 1JE8A 3WEEA 4IVNA 5E17F 5BOXA 1IN6A 3SZTA 2D2WA 3ATVA 2MLGA 5LEJA 1QZZA 4M71A 5AQUA 2XAJA 3I4PA 1HKCA 5A2QZ 2P9NA 3E6BA 2CQKA 5BPDA 5FD5A 1DPRA 2L54A 1NBWA 4DHYA 1S3XA 3CJBA 1B9MA 5L3DA 1KU3A 4FHTA 1SMTA 2FMYA 3LQQA 1MDMB 4BQZA 3L00A 1J59A 1HX1A 3D7EO 4AM6A 5CE3A 1XDUA 3SMPA 1YW7A 4QS9A 3TGNA 4MO5A 3E97A 4LMYA 4IHTA 3ML6A 1YW8A 4BR9A 4GYIA 3V8KA 1FWZA 3R0AA 3IRRA 4K41A 2PI0A 3F3XA 1Z9CA 4BC5A 1ON1A 1RFQA 5KK1A 2V52B 1BA1A 1FC3A 2H6CA 2QWOA 3DF8A 1T98A 4ESBA 1PP7U 2Y0MA 4LGWA 3BEXA 2ESNA 1ZC6A 5E8IA 1ZXOA 5F0XA 4HWIA 1S6LA 4G7HF 4B1ZA 3MDQA 3SXYA 2IA2A 5D5UB 3VGMA 1ZYRF 4BGBA 2M5WA 2NZTA 4PL8A 3MZYA 4H0PA 4MLHA 1DPUA 1DKGD 4JN4A 3QU6A 3J80Z 2MC3A 3WT0A 3QDKA 3RIRA 3LDNA 5EXWA 2VWBA 4FWMA 1QQIA 3BUZB 4HTLA 5KPTA 5CLSA 2V7YA 5D8LB 1BIAA 4JBAA 2COMA 3GE1A 3VB2A 2HOEA 4LK1F 3UKUA 3G3ZA 3WU0A 2RV8A 4I6MA 4BREA 2CGJA 5CYVA 3U2RA 3ROUA 5BRFA 2D1HA 1FNNA 2F5DA 3K2ZA 3MEXA 3IMXA 1FX7A 1P4AA 5KQDA 1NGAA 1ZH5A 2GUPA 5LGTA 3WTUC 2EFOA 1JCGA 5DUIA 2HR3A 4RGUA 2F9WA 1HKSA 2ZO4A 4TV7A 1D4XA 4HF0A 2CG4A 3TDUC 1DP7P 1DDNA 4MO4A 2GEMA 4RGRA 4AIHA 2STTA 5HLHA 2ASPA 5EEHA 3QMLA 3B8AX 4A2BA 4E1JA 1QPMA 5BN9A 1HKBA 4Y0WA 2OZ6A 1AWCA 3ISPA 3ZQ7A 2ACJA 2F2EA 4UNOA 3GX4X 3BZ6A 1FYMA 2HKOA 3ZMVA 4LJZF 1LCUA 1JHFA 1QNTA 2MBFA 3EKSA 1NWKA 4KICA 1TTYA 2RGVA 3DV8A 1EV7A 1HW5A 4BR4A 1RGIA 1YW9A 3VODA 3O8MA 5TKYA 3ECOA 4HX8A 1R5HA 3RKYA 2QQ9A 4B1VA 4MHGA 2NNNA 3VEPA 2AP1A 1VTNC 4BRIA 1BI1A 4ISFA 5AIQA 5AQRA 3O80A 4UXNA 4EMSA 1SQKA 1KAZA 2DPUA 3T0YA 5HLGA 5FO5A 1BM9A 4P9FA 4RWTA 2ZGYA 2QWRA 3DXJF 3VEWA 3H3NO 4BR7A 3CHWA 2E88A 4PZJA 4RB2C 3O2PE 2NLXA 4MLEA 3FWEA 5ICFA 5JR3A 3W6KB 3IWZA 2OQRA 4U7DA 1WI9A 1EH8A 3A0IX 1ZAOA 4PKIA 1OKRA 4HQEA 2NYXA 1HW2A 1OYIA 2M1BA 1U5TA 4CZMA 3FE1A 5AQQA 4A2AA 2KJBA 3ENOA 3CIPA 2FBKA 1G99A 4N0BA 2IVNA 3KLOA 5DCFA 1W5TA 1GLEG 2IJLA 4CICA 2O03A 4U0WA 5DCMA 4M6YA 4OMZA 3IKVA 3T1BA 3L2CA 2DQRA 4Q48A 3ZPLA 4YDUA 3OHRA 2FSNA 2K4JA 3CJ7A 4JQFA 1YTYA 3WTXC 2P9SA 3ULEA 1SD4A 2ZKZA 1CZAN 2XRNA 3F8NA 1I1GA 3VERA 4BRQA 2ASOA 1FT9A 2E1CA 3F6VA 4DNCA 3FZLA 2HF4A 3O6WA 4HX4A 1HQCA 2NS0A 4A0ZA 4ZYEA 2A6AA 1J2XA 2GWKA 4C23A 2G7UA 2FNAA 3AY9A 3I5UA 2FA5A 2E2NA 3DXMA 4EAHD 4HZFA 1S29A 1O3SA 2HZTA 2P6SA 5ERIA 4MEYF 2F9TA 3VETA 1B1BA 2E20A 3F8FA 5FPMA 4BRHA 2PQ8A 3QBWA 4E70A 2GA2A 3S2WA 2KIFA 4HV6A 5AQYA 4L0YB 4R8HA 4EM2A 1GLDG 3ZMDA 4Y15A 4CYDA 1REPC 4ESFA 5ADXH 1KU7A 1FP2A 3D0SA 4RCHA 3HM8A 5JICA 5AQVA 3HTUA 2L4MA 2CO5A 1IUYA 4FOIA 3P4IA 1FP1D 1MWMA 2BTFA 3TO7A 2OBPA 3ID8A 5AQZA 2H09A 2H3GX 3WXJA 4B1UB 4ENNA 3KHYA 3VF2A 1SFEA 3E5QA 2Q0UA 4OINF 3LAPA 3KP2A 1EH6A 4L0ZB 1S7AA 3L9FA 3ZETA 2ZWHA 5E1ZB 1OMIA 2ZBKA 4MTEA 3MMVA 3JAMZ 3FZVA 1WQ2A 2P9KA 1FPQA 2EA2A 1CF7A 5JVTA 3NEUA 1O57A 2L4AA 3JTHA 2XROA 2XAQA 1XCVA 4LB6B 4FO0A 3HBTA 1BC7C 1QBJA 3M1EA 1TW3A 4ZZLA 4CI6A 3TOAA 2QUFA 3TU5A 1WSUA 5AZIB 2H94A 2FBIA 2XAFA 1D5VA 1R22A 1NHAA 1BOTO 1STZA 3D2EB 1W7PB 4M72A 1YG2A 2XV4S 3ZX3A 4PGHA 2DLLA 1ZN2A 4HLXA 4UHTA 3SZPA 5JFRA 3TPQA 3L6QA 2NRHA 4P96A 4MQ9F 3HHGA 3ZEUB 1T2KA 5KQ8A 2V51B 1OR7A 2LKPA 2A69F 1P4XA 2X4HA 1NLVA 3DPLC 3BPXA 3I33A 2ETHA 3GDQA 3BJAA 2E1NA 3RSEA 5DDGA 4M9ZA 5ICEA 1UFMA 1KA8A 3EUHA 2HF3A 2EV6A 3RI4A 4BNCA 3U9GA 2CH6A 5FFZA 2BGCA 1RI7A 1IXSB 4EFHA 4N9HA 3EKUA 3FXUA 3D2FB 5LY3A 4IF4A 1X3UA 1XSVA 4OIRF 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4BYYA 5FGMA 2Z3YA 1X3NA 1IN7A 3SJHA 3QU3A 4G94A 3O5BA 3QP6A 2LDUA 3GFJA 3P9CA 2OA4A 2D0OA 2FBHA 1D8KA 1OKJA 4YIIA 4UVBA 3CDHA 4M9XA 3FMQA 4EGYA 1L3LA 3BJOA 3F8BA 2XGXA 3WTTC 4I98B 3CLOA 2IA1A 4WXCA 2E1ZA 1WKMA 1NGDA 1T44A 2YX7A 4ESJA 1J5YA 1H1VA 4H5TA 2Q31A 3K1NA 4RGSA 4XLPF 3I59B 4G6QA 1YUWA 3HRTA 1O3RA 1XN7A 2KRFA 1UHMA 3A5NC 4M63C 2RC4A 4RAZA 4UV8A 4M73A 4HLYA 3BROA 3DKWA 3QP5A 3W0LA 1ZLKA 4KIGA 3WTWC 4LFUA 2IT0A 1S7OA 3DAWA 2XIGA 4P55A 2K86A 1YIOA 4K42A 3WGGA 1MJ9A 3C18A 1R36A 5AQXA 2FF4A 3FXQA 3FZFA 1K7AA 2VBXA 4UVCA 3TDZC 3T8TA 2MH9A 4GO1A 3F23A 2JTVA 3G73A 3ATUA 4QS7A 3EDPA 4M74A 4A6DA 1TLHB 1F9NA 3E6DA 3CETA 3JSPA 1U5TB 1I5ZA 3KEOA 2FSKA 4P5OA 1LEBA 2FOKA 5K5RA 3CTAA 1ODDA 2EFPA 3NRVA 4BGAA 4OIPF 3KCCA 1IXRC 3QBXA 3AAQA 2ELHA 1R59O 2VBWA 3VFZA 5H6QA 4Y17A 2QWQA 5DCMB 1DEJA 4F9OA 4HQMA 1LOTB 1RDWX 1B59A 3R9PA 3ZMSA 2E8AA 4BVOA 1R5GA 2V9VA 1T0FA 2VN2A 2DAOA 4ENJA 2F5FA 3ULEB 2HYFA 2E1YA 1TYQA 4HX7A 3EQLF 1BC8C 4JNEA 3WXKA 3ERED 3LA2A 2CGPA 3WE2A 2VODA 4WXHA 2IP2A 5AQKA 5AQOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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