3BP8A

Crystal structure of mlc/eiib complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
396
structure length
381
Chain Sequence
DQIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVREMLEAHLVQELEVGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDSPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
publication title Analyses of Mlc-IIBGlc interaction and a plausible molecular mechanism of Mlc inactivation by membrane sequestration
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative NAGC-like transcriptional regulator
total genus 103
structure length 381
sequence length 396
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3bp8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A03
2F5CA 1YS6A 5AQVA 1TNSA 1SD6A 3MZHA 3ZQ7A 4BHBA 2UXNA 4N0BA 1LDKB 2IIRA 2HYGD 2V52B 3Q9VA 3I4PA 3F23A 4BC2A 4YDUC 2WTEA 4HWIA 3MN7A 5AZJB 1W7PD 5AZIB 3GFLA 1CF7A 3FZFA 4R8HA 4FPAA 2H6CA 5AR0A 4G7OF 1UHMA 2BYVE 3VEZA 1C0FA 1TW2A 5BPDA 3HIFA 1NGCA 3JXUA 3ATVA 4BQZA 3HOTA 4UXNA 3V8KA 2LKPA 1IXRC 5LGNA 2JPCA 1PP7U 1T6CA 4BRGA 3HZ6A 2PG4A 4WF2A 4XSXF 3LFKA 3WTUC 3CUQC 2FF4A 3BJ6A 4MEYF 3FFKB 2VE8A 2EV0A 1P6RA 1HSTA 3RSEA 1T6DA 2RGVA 2Q2EA 2QQBA 3G25A 4BR9A 3ID8A 3FM3A 3B73A 1V4TA 1XQSC 2DBBA 2CG4A 2RDPA 3CJ1A 1ZREA 4B1ZA 3ZN0A 3GEZA 2Y0MA 3FM5A 1RUOA 3HSCA 3CETA 4WQ5A 1R36A 1KU3A 3R0AA 5E1ZB 2PAVA 4AWXB 2ASMA 4BRFA 4Y15A 3WTVC 2XROA 2MA3A 1W5TA 2UXXA 2WUSA 4PGGA 2P4WA 3HRMA 2QWQA 1UFMA 1IUYA 2YHWA 5ILVA 3ABTA 1HUXA 2VT3A 4OMYA 1FWZA 3QFUA 4A2UA 4FHTA 4HF2A 1S3XA 2K7LA 2P8TA 2ZMEA 3FXRA 5D4RA 1U2VA 3CJAA 4ON0A 5K5OA 1V3FA 1BWFO 4H0XB 1GLAG 2P9UA 4BVPA 3T1BA 1FYKA 3MEXA 5EXWA 2QWRA 1HKTA 2QBYB 2FNPA 3M9AA 1OPCA 2V1DA 2W24A 2A3SA 1XSVA 5AQQA 2UZKA 1O3TA 3U1DA 3I71A 3QBWA 4BC3A 5EVZA 3RKXA 3JSPA 2HF4A 3CO6C 1BA1A 2E1ZA 3FGUA 3D0SA 3FZVA 5DEQA 1TYQA 2P9IB 4BRNA 4HBLA 3VETA 5JR3A 2VWBA 5BOXA 4O8KA 1G3SA 3IKVA 2FBIA 3CQXA 2OA4A 1IF1A 2YPRA 3ZEUA 4G6QA 4P9UA 3K0LA 1XGNA 3H1QA 1WWXA 4A2AA 1OMIA 4HX8A 3CUQB 2EV5A 1R22A 2GA2A 1MKMA 2ZXJA 2RC4A 4BRPA 1MGTA 2PN6A 5AIPA 5DCMB 4BHCA 1HQCA 4MTEA 4NO7A 1O7FA 4HDUA 1JGSA 4RB1A 5B8HA 3E5UA 3TOBA 3OHRA 3W0LA 5E18F 3I59B 3IWZA 2MH2A 5EY4A 2QW9A 4B1UB 1R58A 5FO5A 1MWKA 1RNLA 2DT5A 1XUPO 1MZBA 1QO0D 4QWQA 3O6BB 4IHSA 3D2EB 3P9KA 3TO7A 2D0OA 3FX3A 3A0IX 4JK1X 1RZ4A 4EIAA 2GXGA 5CJ9A 1G3WA 3BPXA 5JHUA 4ISEA 2Z3YA 3VEVA 2QENA 3FZHA 3KLNA 2WC2A 3NEUA 4HQEA 2DQRA 5E8GA 5IT9K 4I6MA 1WSUA 1SD7A 4LFUA 1LNWA 3BOQA 4CDGA 2P5LC 1IJJA 3PFIA 2IVMA 2AXLA 4GO1A 3WG9A 4MTDA 3P4IA 3MWMA 2CSOA 2LF8A 2R7DA 1P4XA 4PZJA 1FSHA 3G73A 5ADXH 4R79A 3MFKA 1ZG3A 1ZG5A 2CH5A 2EWSA 2DLLA 2MC3A 1D8KA 1HBXG 2VBZA 1P4AA 1QBJA 1NGGA 4TV7A 2H09A 3VEWA 1BO5O 1J75A 3P9IA 1FBUA 5FD6A 1X3NA 1HSJA 1R1UA 3CLOA 2VONA 2K02A 2V7YA 2FOKA 5AQJA 3J80K 2OU2A 1D8JA 4HV5A 3SZTA 2A5XA 4BAYA 3I54A 3FHZA 4B9QA 1HKCA 4BQAA 1YUWA 3LDPA 4HLXA 3EQLF 4KYWA 2GWKA 3WXIA 4J8FA 1O7LA 4OIRF 3KE2A 2NZTA 3BJOA 2PEXA 1TQIA 2LSOA 4HF1A 1RGIA 4IWVA 3LQRA 3QMLA 2NYXA 2A3ZA 4K42A 4F7ZA 4L9NA 4DCHA 2IVOA 3KEQA 1BJAA 1J0RA 4P5OA 4G8XA 4EGZA 4L18B 2A42A 3I8BA 4LC9B 2FEZA 3TDUC 2AS5F 2FF6A 3JS6A 3L4IA 3LM2A 5EX5A 4M7YA 5EOYA 1FBQA 4WWCA 1O3RA 4BGAA 3A8YA 4ZZDA 4BRCA 1S7AA 1K78A 2ISZA 2IVNA 3WXKA 3VPZA 2ZGYA 4HF0A 2O61A 4H5RA 1GXPA 5LEJA 4CZLA 1SFXA 4QS9A 3IL2A 4B1YB 2D1KA 1WQ2A 2NRHA 3JAMZ 2D0PA 2V1XA 1ZBSA 3KEOA 3J81Z 3ZMUA 2STTA 3CJBA 1F4KA 1WRJA 5FPEA 3GYHX 1NHAA 1USTA 2OQGA 1ZXOA 4CHUA 3RKYA 4RGSA 3EZWA 5AQHA 5KQDA 2P9PA 1BN5A 1BI3A 4OMZA 2HQNA 4BGBA 1R7JA 4JQFA 1T38A 1V4SA 2P9SB 1ODDA 3JAMK 4FWOA 1F9NA 1I27A 1TUUA 3J81K 1MDMA 3MZYA 1XD7A 2KIUA 3ZPLA 3IDHA 3VF2A 1DKGD 1WKMA 2EFWA 1DDNA 1O3SA 1GLJO 4B09A 1KQ0A 1C0WA 3EL2A 5D8KB 1NGHA 4KIGA 5JLHA 1Z6RA 1LEAA 2RV8A 3H46O 3K1MA 1GLDG 3BEXA 3EETA 4PKHA 1R00A 2XAQA 5AFUA 2G9WA 1I5ZA 1S29A 4CBUA 2B0LA 5ICFA 2ZF5O 5LJWA 3QBXA 3CJ7A 2Q0RA 1W5SA 3DPTA 2VOPA 3CQYA 2MH9A 4HAMA 2I7PA 1IXSB 5ICCA 3D2FA 4ZH4F 2FBKA 4XBFA 3CJ9A 1NGEA 1KYZA 2YJEA 5AQLA 2M5WA 2VBXA 1NBWA 3O6WA 2NNNA 5H6RA 4CO8A 4RB0A 4CYDA 2IPQX 3O80A 2O0YA 2GIVA 5BMZA 5BPIA 3GFJA 3O2PE 1KXPA 4OIQF 3QPTA 4Y17A 1PP8F 1F1ZA 1EV7A 5FLXK 5BPLA 3GE1A 1MDUB 1ZGJA 4K41A 2CYYA 4IZ9A 4LLLA 1ZARA 5BRHA 1XGSA 4E70A 4BRKA 3HHHA 3B02A 2K4JA 3ZP5A 4BR5A 3ABUA 1NGBA 1J5YA 3K2ZA 1E17A 4RWTA 2CGJA 3H6EA 3ZN1A 4FOIA 2ACJA 5FD5A 3D7EO 1NLVA 5E1XA 3C7NB 4EAHD 1ATRA 2Z5UA 3GOIA 3ZMZA 1Z6TA 4CZIA 5E8IA 4G7ZF 2Q1NA 3V4GA 1IN7A 4FO0A 5HLGA 3OV8A 4KMUX 5BQTA 3ZMDA 1O3QA 2V6CA 4IO8A 2BGCA 1EQYA 2XVCA 1HW5A 5CLSA 3FZLA 2VODA 1FLIA 3S2WA 1T44A 5CE3A 3VB2A 4GYGA 1JHHA 3GVAA 2RQPA 1SD5A 3HSFA 3ZMSA 1JXSA 5FFZA 2IVPA 2TDXA 2DAOA 5E20A 4HDVA 4E1JA 1BA0A 1HKBA 3TO9A 1YTYA 4PKGA 3WT0A 2DPDA 3KLOA 4B8XA 4L9VA 2F5DA 3QAHA 5E84A 3WU0A 3HRUA 2A07F 3ECOA 5AONA 3M8FA 2OZ6A 3BJAA 3UKUB 4CXFA 1OKRA 1OYIA 2JPBA 3QPHA 2DU9A 3U8XA 1B9MA 2VYPA 1NGIA 4ZYEA 3MCZA 1GLLO 1XCVA 3IWFA 3ELKA 5BS6A 1Q18A 3RTRA 5AQYA 1NGDA 1USSA 3LAJA 3VENA 4UVAA 1CZAN 3FMQA 3NRVA 5LY3A 4XH4A 3LDOA 1RFQA 1LB2A 2VCPA 4FWMA 5BN8A 3W6KB 4BRMA 3RI4A 4EVIA 2G7UA 1STZA 3FXUA 2FXAA 5AQXA 3KP6A 2P9KB 4U0WA 2X4HA 3C3WA 5BRDA 2Z9OA 4FWNA 2OAZA 4YDUA 4Y0WA 1QZ5A 1Q1HA 4KBOA 4NQWA 3UB5A 3BWGA 2OD5A 4YFXF 2F5EA 3IRQA 1JCFA 1BM9A 1AOYA 3F6OA 5ICGA 2ZCWA 4BRLA 3F22A 3HSEA 5BPMA 3V7CA 1R1TA 3VEOA 4A5NA 1KA8A 4I0BA 5I9EB 5AQUA 3BZ6A 2HTJA 3BPVA 3ISPA 1YXQA 2Y75A 1NGFA 3E5XA 2VN2A 4PL7A 5KQ8A 4WXCA 5FPMA 1S22A 3H45C 3BY6A 3IFRA 3VF4A 2CQKA 2V9VA 4JHDB 4EQQA 1E2XA 4MQ9F 2L4AA 3QU3A 1FZPB 5ELZA 3QU6A 1K8KA 4JD2B 4BREA 4BC4A 3I59A 2W25A 1RUNA 4BR0A 4PDKA 4LB5A 1U2WA 1ZGAA 2V79A 4H5NA 1JE8A 1WI9A 3O1WA 4CZKA 3D2EA 4MGRA 2V1UA 1KU7A 2F5FA 2J4RA 1YIOA 2RN7A 1OYWA 4P9FA 4IJNA 1U5TC 4UVCA 3C1DA 2A61A 1PDNC 4BG8A 2QWOA 1IG8A 2FQ3A 1Y0UA 5DCFA 2KJCA 3GBTA 5D5VB 4CZEA 4BRHA 3KP7A 2DO7A 3TDZC 3DXMB 5DYMA 4N9IA 5EEGA 2FSWA 2RVCA 5FB2A 3JTHA 4WQ4C 3WTXC 4ENJA 3MN5A 2DTRA 4BYYA 4MLHA 3RYRA 1U8RA 1YFHA 5ERIA 4BC5A 1BC7C 2LNBA 4PGHA 4I98B 1NWKA 3GFMA 4A0ZA 3R9PA 1J9IA 1EH7A 5TKYA 2FSKA 4LGWA 2ZJ2A 1HKSA 2EFPA 1W7PA 2H6BA 3EKSA 3VOVA 4CI6A 1D3YA 3M7GA 4GYIA 1QNTA 5F64A 2F2EA 2O6GE 3R6SA 4BXUA 2IA0A 5F2RA 2YX7A 3V7SA 4ZYGA 3Q5FA 3QOPA 1P4WA 4FL9A 2ESNA 5JFRA 3ZX2A 4LG0B 5AFUH 4XEIA 2EB7A 3CJNA 2E8AA 3BUZB 3WGGA 2NLXA 5A2QK 3E6BA 1RIOH 5AQZA 1R23A 4EM1A 1HPMA 2QWLA 1GXQA 4EM2A 1FYMA 2CGKA 4WQ5C 2MBFA 2A6HF 5K1YA 3GO5A 4C23A 5AQPA 3VGLA 3CERA 4FWSA 5AQRA 1LQ1A 2XRNA 4FT8A 3LAPA 1B1BA 1OKJA 2QWMA 3CIPA 4RGUA 4ZZLA 4MQVA 2AP1A 1QQOA 4RGRA 5D8LB 2HR3A 5FPDA 4P55A 2QZ8A 2VC0A 3RPQA 1HKGA 5AQMA 3V8LA 2NS0A 4M9ZA 3GXOA 1U5TB 2IA2A 3CI5A 3T5XA 1YLFA 3KP2A 5JLFA 1OYYA 1G3YA 3WXJA 4D0PA 5BN9A 3E3VA 2YX4A 3L2CA 3FE1A 5HLIA 5AQFA 4EJWA 1TNTA 1K79A 3WQTA 2P7VB 4OOIA 5IT9Z 2GTDA 4LD5A 3K1NA 4L5IA 1XCBA 4CZFA 2E2OA 3K1PA 1S6LA 3SXYA 1BI2A 2KRFA 4KNYA 3FMSA 5CVIA 3M8EA 4M6XA 2AA4A 2P9NA 2XKOA 3C0BA 1CF7B 4DNCA 4AD9A 3FR0A 4O6JA 3ZMTA 3DFGA 1FP1D 4HQMA 3WTWC 3FMRA 1ONVA 2IA1A 2HDCA 4LK0F 3ZX3A 4RTFD 1BU6O 3VOEA 1FYLA 2P9LA 4L0ZB 4EM0B 2EJRA 2R7FA 4H5WA 2PLYA 1YQAA 3F6VA 1BBYA 4UHTA 5AQOA 5HOOA 2BUPA 4HTLA 4DHYA 3CDHA 2GELA 4KN7X 1KAXA 1BIBA 4HV6A 4BHPA 3J80Z 3RSEB 2Z33A 2IRFG 4BRIA 1ZN2A 2PJPA 4A5MA 5BR9A 4BROA 2M1BA 4RAZA 3TQNA 4MO5A 2EK5A 1S8NA 2G7HA 1ULYA 1IZ1A 1U6GA 4G7HF 3TOAA 1TLHB 4L9TA 1WUAA 1QHAA 1R5HA 4LMYA 2YHXA 1T2KA 4EHUA 4M7XA 3E6CC 4IRGA 1LDJA 2BEOA 2D1VA 3D5LA 2QWWA 3RDIA 5ED4A 3UE5A 2FU4A 1T0FA 2KIFA 2DI3A 1LOTB 3HTUA 4YIFA 1ZAOA 3H3ZA 1IN5A 1ON2A 4MHGA 1XMAA 3F72A 2JSCA 2MD5A 1WOQA 4AM7A 2ZMEB 5KPRA 2A68F 3BP8A 5F0XA 2XIGA 4CZGA 3L09A 4EFHA 2P9UB 4CZHA 5IT3A 3WTTC 1XMKA 3CJCA 2EFNA 2K86A 1V4RA 1D5VA 2QLZA 5AQWA 2J5OA 4ESBA 1SZ2A 3N4MA 1G4DA 1B59A 3JSOA 4H0VB 5AQSA 1FY7A 4JAXA 3EYYA 1J7KA 3TKYA 1TYQB 4Q47A 3RIRA 3NQOA 2F9TA 2DFIA 3LDQA 1G3TA 4CZZA 2WV0A 1KGSA 2A5YB 5D4SA 2L02A 3ZMVA 2IW5A 2OQRA 1HW1A 3R0JA 4M9XA 4H5VA 5LEKA 3ZEUB 5CVRA 1TQMA 1U3EM 3VFZA 3C18A 1SAZA 2Q0UA 1B6AA 1D4XA 4XLNF 4BG9A 4U0YA 2BV6A 2GQQA 2JTVA 1KAZA 4PCQA 3JTGA 5JI6A 5KPZA 2QVOA 2GEMA 2BE5F 3KFWX 2FSJA 4YG2F 3Q9SA 1VTNC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2F5C A;  1YS6 A;  5AQV A;  1TNS A;  1SD6 A;  3MZH A;  3ZQ7 A;  4BHB A;  2UXN A;  4N0B A;  1LDK B;  2IIR A;  2HYG D;  2V52 B;  3Q9V A;  3I4P A;  3F23 A;  4BC2 A;  4YDU C;  2WTE A;  4HWI A;  3MN7 A;  5AZJ B;  1W7P D;  5AZI B;  3GFL A;  1CF7 A;  3FZF A;  4R8H A;  4FPA A;  2H6C A;  5AR0 A;  4G7O F;  1UHM A;  2BYV E;  3VEZ A;  1C0F A;  1TW2 A;  5BPD A;  3HIF A;  1NGC A;  3JXU A;  3ATV A;  4BQZ A;  3HOT A;  4UXN A;  3V8K A;  2LKP A;  1IXR C;  5LGN A;  2JPC A;  1PP7 U;  1T6C A;  4BRG A;  3HZ6 A;  2PG4 A;  4WF2 A;  4XSX F;  3LFK A;  3WTU C;  3CUQ C;  2FF4 A;  3BJ6 A;  4MEY F;  3FFK B;  2VE8 A;  2EV0 A;  1P6R A;  1HST A;  3RSE A;  1T6D A;  2RGV A;  2Q2E A;  2QQB A;  3G25 A;  4BR9 A;  3ID8 A;  3FM3 A;  3B73 A;  1V4T A;  1XQS C;  2DBB A;  2CG4 A;  2RDP A;  3CJ1 A;  1ZRE A;  4B1Z A;  3ZN0 A;  3GEZ A;  2Y0M A;  3FM5 A;  1RUO A;  3HSC A;  3CET A;  4WQ5 A;  1R36 A;  1KU3 A;  3R0A A;  5E1Z B;  2PAV A;  4AWX B;  2ASM A;  4BRF A;  4Y15 A;  3WTV C;  2XRO A;  2MA3 A;  1W5T A;  2UXX A;  2WUS A;  4PGG A;  2P4W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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