3BP8A

Crystal structure of mlc/eiib complex
Total Genus 103

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
396
structure length
381
Chain Sequence
DQIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVREMLEAHLVQELEVGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDSPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (13-28)AH3 (44-57)AH2 (33-40)TIV3 (63-77)S1 (60-62)TIV2 (58-61)S3 (85-92)EMPTYS2 (78-80)TIV10 (173-176)TIV4 (93-96)S4 (96-103)TI2 (103-106)S5 (108-115)S8 (163-166)TIV5 (117-120)TVIII1 (120-123)AH4 (124-139)S6 (145-153)TIV8 (168-171)TIV6 (140-143)S7 (156-158)TI4 (158-161)TI5 (159-162)TIV7 (167-170)S14 (373-375)TIV11 (177-180)TIV9 (170-173)AH5 (180-185)AH9 (309-333)S9 (190-194)AH6 (195-205)TIV12 (207-210)TVIII3 (212-215)S10 (215-220)S11 (224-230)TIV13 (220-223)TI6 (244-247)TIV16 (237-240)TIV17 (238-241)S12 (233-234)TIV18 (245-248)TVIII5 (249-252)TIV20 (257-260)AH7 (271-280)TIV24 (266-269)TIV27 (281-284)AH8 (297-306)S13 (337-341)AH10 (348-362)AH11 (365-369)TI1 (82-85)TI3 (139-142)TII1 (209-212)TIV19 (251-254)TIV26 (280-283)TI7 (342-345)TI8 (379-382)TIV1 (28-31)TIV21 (261-264)TVIII6 (335-338)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
publication title Analyses of Mlc-IIBGlc interaction and a plausible molecular mechanism of Mlc inactivation by membrane sequestration
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative NAGC-like transcriptional regulator
total genus 103
structure length 381
sequence length 396
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3bp8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A03
3JSPA 2QWPA 2MH2A 3TKYA 3ATVA 2QENA 3CETA 3H6EA 3E5QA 1BI2A 1EH8A 1KQ8A 3CJ9A 2QWNA 1I6XA 1K8KB 2ZGYA 2OQRA 2UXNA 4BRIA 4OINF 2CGKA 3MCPA 4CD1A 4YFXF 1MZBA 3GW2A 5TJJA 2PAVA 3ELKA 3L6QA 3VODA 5BPMA 1RUNA 2P9PA 1UB9A 2CH5A 2O61A 4UV9A 2EV0A 3QPHA 1YG2A 1YIOA 4U0VA 2V1XA 2IVOA 2ACJA 4L5JA 3LA7A 3WTVC 4CZGA 3ZN1A 3IKVA 1RZ4A 3BOQA 5D4RA 1ONVA 1SMYF 2Q31A 1HKTA 2D1KA 2V7ZA 3ATUA 2FE3A 3FMQA 3RTRA 2W84A 3N4MA 1SD7A 5AQXA 1MWMA 1X9JA 1HX1A 5JR3A 2CWEA 2E7WA 1YS6A 5ICGA 3ERED 4PL8A 1Z7UA 3VESA 5AQIA 2HMPA 1FP1D 1IJJA 4FOIA 4OIQF 3K69A 5AQWA 3MWMA 1X3UA 3L09A 3GZ6A 5CVUA 3I58A 3E5UA 2LKPA 5FFZA 1I27A 4O5VA 1WRJA 2XAHA 3ABTA 1JCEA 4PGGA 3E97A 4BHCA 2XKOA 1ATSA 1DEJA 1J0RA 3EYIA 2MH9A 4K41A 1XSVA 1IRFA 3HTSB 4AWXB 4BAYA 3VEZA 3QU6A 1NGJA 4HOBA 4BR4A 5E8GA 3DPLC 5AFUH 5AZIA 2D2WA 3LFKA 4ON0A 4JBAA 1KA8A 2XROA 4HAMA 3KP4A 4HX8A 3L00A 5JLFA 1B9NA 3F3XA 4AM6A 5EEHA 5BPIA 4MEXF 3KLNA 4QLCU 2PJPA 4CBXA 4A5MA 3WEEB 1OKRA 2HQNA 1Z1DA 2DPUA 4EQQA 3L2CA 3R4KA 4G9YA 3CJCA 2M1BA 3DQVC 3UE5A 4L5IA 3WTWC 2FA5A 5F6FA 3KCCA 3L7WA 4N9IA 1RUOA 3DJCA 4E1JA 1TLHB 2Z9OA 1IXRC 4I6MB 2RKHA 4RB0A 1OYIA 1U3EM 4S04A 3PFIA 2FXUA 3C18A 4BYYA 5KQDA 3FZFA 4HWIA 4KICA 4EGZA 3FHZA 5AQJA 2XASA 3FF5A 1H0MA 3I33A 3WXIA 3TDUC 2ASOA 4YDUC 3I54A 3HSCA 3F23A 5BS6A 4R79A 4YIFA 5JVTA 1T6DA 4WQ5A 4E70A 4KIBA 4M9ZA 2IVNA 2E2PA 3BUZB 3SQNA 1HW5A 1HSJA 2VE8A 4UHTA 3ID8A 1NGBA 4MLEA 2P9SA 2PLYA 4ZZDA 5K5OA 4K43A 2E1NA 4M73A 3RI4A 4L3QA 1GHCA 4NO7A 2HYFA 3UB5A 3HRSA 1GLCG 3MN6A 2HKXA 3H1VX 1R5GA 5BRFA 2H09A 4JD2B 1Q1HA 2QXLA 3VEOA 4EJVA 5FPDA 1W5SA 2V1DA 2H27A 1T0FA 4EVIA 5ICCA 3AAQA 1F9NA 3RSEB 2FQ3A 1TUYA 1R23A 4HQEA 2XUBA 2Z5UA 5E1ZB 1YW7A 1F5TA 3CI5A 4CJ7A 3P9IA 2F2EA 2J5PA 2NLXA 1HW2A 4BGBA 3F8NA 2OZUA 1T6SA 3IWFA 4RS8A 3FLCO 2EWNA 2IPQX 4Y13A 4IHSA 3D2FA 1TQPA 3FM5A 1K79A 5AR0A 4MLHA 3AAFA 2Q1NA 1NGEA 2CFXA 3KVGA 1ZG5A 2DU9A 1LDKB 1IW7F 1WUAA 4CZZA 2KIMA 4BRKA 1NGCA 4B8XA 3ECHA 4BRHA 2K7LA 1SQKA 3LDNA 4ENJA 5AQKA 1ZG3A 2BYVE 3H46O 5E1XA 2W57A 4NB5A 1MDMB 2EJRA 4IF4A 1Z05A 2A68F 2PEXA 1QQMA 2QYOA 3WXJA 5DD4A 2P9UB 4WQ4C 2VC1A 3M1EA 3MZYA 1SD4A 2ZKZA 1XGOA 5HS8A 4KA4A 2VOPA 3GFIA 3GOIA 5AQYA 3RKWA 4A0YA 1SZ2A 1CF7A 4K25A 4FX0A 3BWGA 4U7DA 2Q2RA 1RFQA 3TO9A 3O1WA 3H92A 4RB3C 3V7SA 2IP2A 5KK1A 5I9EB 1H9GA 3WE2A 4LLLA 4H5WA 4Y17A 3FGUA 1DKGD 2E20A 1IZ1A 3LDQA 3DXJF 3SK3A 4P55A 2K02A 1QGPA 1D5VA 4ISEA 3U9DA 4B09A 3SZPA 1EV7A 1H9TA 2A5YB 4UXNA 4JK1X 1BU6O 3C0BA 1KU2A 3V8JA 3FZHA 2H6BA 2VODA 3P4IA 1LDJA 2D0PA 2RV8A 3BP8A 5BPLA 2NNNA 2F5EA 4KT5C 1K78A 4RWTA 3QFPA 3ROUA 3M1FA 4WX9A 2XIGA 3I5UA 4CICA 4O6JA 5JLHA 2KIFA 1WI9A 5K5RA 2QWWA 3KHYA 1HW1A 1R58A 4XEIA 4M6YA 4AIHA 3ZEUA 3CTAA 1X3NA 1ZLJA 4A61A 2FLOA 3RKYA 1AOYA 5AQHA 3QP5A 3I0TA 1GLFO 1ODDA 5AQQA 5JI6A 1ESVA 1TYQB 4FHTA 2ISYA 3IFRA 2HR3A 4WXCA 1ZG1A 3HZ6A 1BG3A 2H3GX 1J2XA 3FM3A 1P8ZA 2PN6A 2QWRA 1Z91A 3QP6A 4OIPF 2QBYB 1Z6TA 3ULEB 3RPQA 1I5ZA 4LFUA 4H0VB 5BREA 3MEXA 3EO3A 1H1VA 3LDLA 3EKUA 4CGZA 2A6EF 1Y0UA 5L3GA 5L3BA 2HZTA 2DT5A 1FWZA 3WEEA 4B1VA 3I71A 2FBHA 2ZXJA 1DUXC 1U5TC 3BEXA 1TQMA 2G7HA 2X4HA 3FWEA 4R8HA 4I09A 1YXQA 1CZAN 1UHWA 1EQYA 2L54A 1G99A 3U4LA 5ADXH 4I6MA 2Q0UA 1O3SA 3C7NB 5HLHA 1P6RA 1JCFA 2PFBA 2OZ6A 1IAWA 1J9IA 1J5YA 1NMDA 2HF4A 1FYMA 4FX4A 2CG4A 4EIAA 1R7JA 3HRTA 2E1ZA 3WGHA 5CJ9A 5D4SA 3K1NA 2E7XA 2GWJA 3TPQA 4H0YB 1DP7P 2CH6A 1NHAA 6PAXA 4BVOA 3WTXC 2L4MA 1SAXA 2BUPA 3MK6A 3F8MA 1FNNA 3JW4A 3ZN0A 4YG2F 2I7NA 2RVCA 3E6BA 2NZTA 3GF2A 4LG0B 3LDOA 4RCHA 1YLFA 4CZJA 1YAGA 1RI7A 3AAPA 2D4WA 4HTLA 4HBLA 2QZ8A 2A5XA 3T8RA 1AWCA 1BIAA 2ZNYA 3U9GA 3IRQA 1GLDG 3DKWA 1YUWA 1R1UA 3C3WA 3H45C 2QW9A 2DBBA 2ZNZA 4MGRA 1W7PD 5KQ8A 1UFMA 1NGHA 2HS5A 2PBIA 2R7DA 1OYWA 4ENMA 5KPTA 3COAC 4MNUA 4RB2C 3GO5A 2JPBA 3BPVA 3G73A 3CQXA 5IT9K 3BJAA 4RGRA 2UXXA 1B59A 3VENA 5HVQC 5D5XB 4ZH4F 4CXFA 1YVNA 3EKSA 4BR5A 1ATRA 5LEJA 4KN7X 4LGWA 2QQ9A 1DPRA 5AQTA 2A6HF 4PZJA 3ZMSA 3RDIA 4FWQA 3UKRA 3FMSA 2W40A 3CUQB 3KP2A 3B8AX 1QO0D 4UVBA 2ETHA 3A0IX 2EV5A 1HKGA 3SMPA 3GVAA 2OANA 1ZYRF 4ZYEA 2FSWA 3K1PA 2NNYA 2PI0A 2QWOA 3VERA 1D4XA 2M8EA 4EMSA 5DUIA 3D7EO 1ZARA 3F8BA 1QQOA 3WUHA 5FPNA 4N9HA 2GIVA 4CHUA 5F2RA 4FPBA 4CZLA 4JHDB 3C7JA 4HX7A 1HPMA 3LSTA 3R6MA 1FSHA 1KAXA 1QZYA 1FBUA 4G6DA 2C6YA 3A5NC 3LA3A 5F1XA 3VEYA 1B9MA 2G9WA 1FYKA 3FE1A 2OD5A 3VEPA 3F21A 3ZETB 4A2UA 1G3SA 1LDDA 3KETA 3F8CA 5AQLA 4GYGA 1R1VA 3D5LA 4XH5A 2D1VA 3QOPA 3E6MA 4IPAA 4UVCA 5K1YA 3BY6A 1TTYA 2ISZA 2FMLA 3VF6A 4YDUA 3ENHA 5CVIA 1L0OC 1K6OA 1YS7A 4BHPA 3S2WA 2E1CA 1NGAA 1NBWA 3BF1A 3GUDA 3R8EA 4B1ZA 2EFPA 4CO8A 4NB4A 3W0LA 3GDQA 1R1TA 5DD8A 2P9KB 3O1BA 1MJ9A 2Q2EA 4P9UA 2IVMA 1F1ZA 1HUXA 2BV6A 1C0FA 1V4SA 5J8CA 2GQQA 1FBSA 2JPCA 5E8IA 1E2XA 1G6NA 2GZWA 5AQRA 3ZMTA 1E4FT 4BRGA 5BN9A 2MC3A 4LLGF 4KIFA 5L3EA 1HKBA 3HRUA 1ZBSA 5EX5A 4M63C 2L4AA 2XHKA 5HDGA 5AONA 2O0YA 1ZC6A 3FZMA 5AQZA 4QWQA 1O3QA 1E4GT 1NGDA 2A07F 2P7CB 4B1YB 2COMA 5ILVA 3MFKA 2ELHA 5BRHA 2VBWA 3C1DA 4ZYHA 2H6CA 3J7AO 5AQUA 4FO0A 1TW3A 4PDKA 4FSVA 2W24A 4M74A 4RGXA 1KYWA 4G6QA 2EFOA 1B6AA 2P7VB 3HOSA 4OOIA 3BZ6A 2FBIA 4KFCA 2Y48A 2AS5F 1BUPA 2QWQA 3HTUA 5CE3A 1FX7A 1QNTA 2P9IB 4A0XA 3BROA 4HV5A 5B8HA 5CVRA 3V4GA 3WG9A 1PP8F 2DFIA 2FF3B 1BBYA 4KDPA 1LOTB 1BOAA 1HQCA 3V7CA 1U2WA 2P9NA 2P5VA 4Q5SF 4WQ4A 2FEZA 1USSA 3ML6A 3I8BA 4FWPA 3GXOA 2V79A 4BGAA 3HIFA 3O8MA 3CJAA 1KU3A 3DWLA 4MQ9F 3FZKA 2RNJA 1YYVA 5E18F 2R7FA 4LLNA 5LLQA 1P4AA 1IN4A 2P6TA 3T8TA 5F0XA 4EM1A 5HDNA 4FT8A 1HJOA 2V52B 3GZ5A 2KJBA 3WGIA 1U2VB 1D3YA 1NGIA 1RDWX 2YX7A 5H6RA 4H0XB 4U7BA 1S3XA 1O3RA 5BQTA 2GEMA 3H3UA 2FBKA 3DAWA 3EN9A 3ULQB 2ZMEA 3D2EB 3B73A 4KUMA 5CLSA 2FNPA 1FBQA 5DCMB 1KXPA 4MO4A 4EV0A 4BQZA 3V8KA 1GLEG 4Q48A 3ZX2A 3ISPA 2DPDA 1XDSA 3A8YA 1LVAA 1BDGA 1T44A 2YR2A 3FXQA 1J7KA 3R61A 2IJLA 2E1YA 1ZXOA 1TUUA 3DXMA 2NAZA 1C0GA 3CO6C 2P4WA 1XSXA 3BJ6A 3V7RA 3WTUC 3REOA 1O3TA 1JCGA 5L3CA 2JZYA 2MA3A 1MJBA 2O8XA 5LY3A 3VF2A 1GLLO 4BRLA 3H3ZA 5LEKA 2XAQA 1S3JA 2XV4S 4RGUA 1BC7C 1XN7A 1XB4A 3P9KA 1OMIA 2ZO4A 2BE5F 5HOOA 4ENKA 3QBXA 2WTEA 2KIUA 1HKCA 5CYVA 4OIRF 2Z3YA 4B1UB 1O57A 4A62A 2ZFWA 1LJ9A 3TOBA 2ASMA 3DXKB 4K42A 3UKUA 4RGSA 1KU9A 4GCVA 5AQNA 3HSRA 3ZX3A 3F22A 1NGFA 3I59A 2YJEA 4PKHA 2PMUA 1YW9A 5ICFA 1U5TA 2R3SA 4CZMA 2HYGD 4BXUA 3A5OC 4H5NA 4H0TB 2P5LC 5LJVA 1ZGAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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