3BP8A

Crystal structure of mlc/eiib complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
396
structure length
381
Chain Sequence
DQIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVREMLEAHLVQELEVGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDSPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Analyses of Mlc-IIBGlc interaction and a plausible molecular mechanism of Mlc inactivation by membrane sequestration
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
molecule keywords Putative NAGC-like transcriptional regulator
total genus 103
structure length 381
sequence length 396
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3bp8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bp8A03
5FPMA 4HF1A 5AQKA 1MD0A 2CSOA 1LDJA 3HI0A 5AQGA 4DB3A 5LLQA 2NRHA 1RFQA 3WTVC 3DWLA 1NGIA 5BS6A 3FXQA 5ERIA 4L9JA 2JTVA 3GFJA 3HTVA 5EEHA 4KN4X 1YQAA 2A40A 2STWA 2J4RA 4IZ9A 3VB2A 1ZGJA 2H27A 1BA1A 4H5VA 1QO0D 4FWLA 5F0XA 3WUHA 1JE8A 3UB5A 5CVJA 1FX7A 2X4HA 3ZX0A 2HS5A 4K25A 3W6KB 2PN6A 3M7GA 4U0WA 3ZN0A 1J9IA 3IRRA 1BWFO 1QZ6A 4HWIA 4BROA 1USSA 2ZBKA 4P9FA 2Q2EA 4CZEA 3ENOA 3HTSB 1NGCA 3FM5A 3ERED 5IT9K 3WTSC 2EFWA 3MCPA 3CUOA 3T8TA 3LDPA 2I7NA 2E1NA 3IKVA 2IIRA 2YHYA 3K1MA 3JSOA 5F64A 4G94A 1QGPA 5AZIA 1CZAN 3KP4A 4H0PA 4EJVA 3GFMA 1OYIA 2D1HA 5E1XA 5E84A 5CJ9A 5LGNA 2HTJA 3H3UA 2GIVA 3DPLC 2QVOA 1S29A 3IUCA 1KYZA 2G7UA 1Z05A 5EVZA 1XB4A 2A61A 2EJRA 3F3XA 2KRFA 4BRKA 4FT8A 2P9NB 3GOIA 1Z91A 4I0BA 4BC5A 4A2UA 2YX7A 3R60A 2Z5UA 1ZARA 2L3DA 3MN9A 1UCRA 3GFIA 2QZ8A 2NAZA 3BJOA 3DV8A 3G25A 2MLGA 5ELZA 4ZZDA 2LF7A 1W7PD 5DCMA 2Q2RA 3ML6A 4XH5A 4UVBA 3C0BA 2P7VB 2D1KA 3J80K 3CERA 3RI4A 1YO5C 3U9DA 1SD5A 1XUPO 3WTTC 1G3WA 2BBYA 3DJCA 2OA4A 2GELA 1T38A 4RWTA 1BI1A 3U4LA 2FU4A 3CJNA 2A69F 4KDPA 1U8RA 2F9WA 1OYWA 4PKGA 3FZVA 3ZETA 1BJAA 1ZH5A 5LGUA 3CJCA 5L3FA 1T6DA 1NGDA 3WTWC 3CUQA 2BV6A 1R5GA 3RDIA 2V1UA 4A62A 3DKWA 2GA2A 3IC7A 2YPRA 3HZ6A 4CZMA 3EETA 4IRHA 3CO7C 5AQIA 4U0VA 2W41A 3LDNA 4Q47A 5JR3A 1IRFA 2Q8KA 1TBXA 3TDUC 4DCHA 3I59B 1MJAA 3F23A 2P9SA 1R7JA 5ICGA 4L18B 3D2FB 3R6SA 1X9JA 3CI5A 2VC1A 1FYKA 3DAWA 4WXDA 1K6OA 2CGLA 4BAYA 4M7XA 3CJ7A 4I0AA 2P9IA 2GWKA 4CO8A 1WKMA 3GE1A 4ON0A 3O6WA 2V6CA 2E1ZA 3L2CA 1HUXA 2V79A 1LEAA 4MTDA 2WTEA 3VGMA 2XAQA 1X3UA 2HYFA 5AQRA 1Z6TA 1OKRA 2E1CA 2A41A 3HSFA 4AIJA 3FZLA 1YW8A 1BIBA 1KU7A 1FBQA 3QPHA 3WG9A 3SHFA 2FEZA 4UVCA 4RGXA 1IN6A 1D8JA 2ZCWA 5D5WB 4FOEA 5HOOA 1SQKA 5LEJA 1Y64A 4N9HA 2PBDA 3P4IA 2P5LC 3FX3A 2AS5F 3BPXA 1NBWA 4OMZA 3MN7A 4AM7A 1BA0A 3ABTA 2KIMA 2PAVA 2G9WA 3W0LA 3HRSA 2DPUA 4RGRA 3O2PE 4RS8A 3ZMTA 5EX5A 2QWOA 4MHGA 2CWEA 5F6FA 1U2VB 4ENNA 3UE5A 3IFRA 1WI9A 3QP6A 1NGFA 4QS9A 2FNAA 2LF8A 5L3CA 1TNSA 3ZEUA 1C0FA 5AQHA 1U5TC 2Q0RA 2XV4S 1IN4A 1NGHA 1VTNC 1B59A 1Z7UA 1G4DA 3HTUA 1EH7A 2XKOA 1MWMA 2NRAC 1U5TB 3L4IA 2XASA 1YXQA 3QDKA 1O7FA 3R0JA 1ZRDA 2IVPA 2WC2A 3RSEA 2DLLA 3GFLA 4BYYA 1O57A 3HYIA 4FWQA 1SFXA 4YIIA 3CTAA 3H45C 5LHHA 1O3SA 1Q18A 4J8FA 1OMIA 4IJAA 1HLUA 5K5OA 1S3JA 1ATNA 4FX0A 1V4RA 2B0LA 4Q5SF 1NMDA 4LG0A 3ATVA 3E97A 5EEGA 2VBYA 4LB6B 1QQMA 3RKXA 2FRHA 5ICFA 2COMA 5AQSA 1Z9CA 4RB1A 3E5QA 4ISFA 2VBZA 3BF3A 2W84A 3WE3A 1SMTA 3CETA 2E20A 2ZWHA 3BZ6A 3F8NA 3VPZA 3CJAA 3JS6A 2P9LB 1B1BA 4HOBA 4RAZA 4JBAA 1PDNC 3A5MC 4ISEA 2DK5A 5CVUA 3WU1B 4HF2A 2FSNA 4D0PA 4ESBA 4UVAA 3E6CC 4BR2A 1X3MA 4XH1A 2O8XA 1UB9A 4IPAA 5DD4A 1FZPB 3VEYA 1ZN2A 1SAXA 4DQ8A 1XCVA 4CXFA 1K7AA 3M1EA 2OZ6A 4WXCA 4CHUA 3MCZA 2E88A 5D5XB 4E70A 2HKXA 4HLYA 2YHWA 1T39A 2QBYA 2M45A 3DXJF 3WODF 4GNIA 4QS8A 4MEXF 2YSRA 3LA2A 2V51B 4WQ4C 4B1VA 4NB4A 1XGMA 4OINF 4HDUA 5H6QA 4L5IA 2Q0OA 2ZF5O 5DYMA 3WXKA 1TYQA 4BRHA 1KYWA 2P9PB 3QBXA 4I6MA 1ULYA 3I33A 4BRMA 5KQDA 1EV7A 1REPC 1W7PA 1ZC6A 5AONA 1MKMA 3HRTA 1XMKA 2QLZA 2QWWA 5HS8A 3ECOA 3FXUA 3ULQB 4M9ZA 1ATRA 3MQ0A 4WCGA 3UKUA 3C3WA 2F5DA 1IG8A 3FWEA 2YCHA 2VYPA 1USTA 5KK1A 1EH6A 5L3EA 1P4WA 5KQ8A 4RCHA 1E4GT 1KU3A 2F5EA 2P6SA 5L3DA 1KAYA 3LFKA 1B4AA 2UZKA 1XD7A 2A5YB 5AQJA 3T5XA 1J5YA 1I6XA 2OD5A 2L54A 2D2WA 4KYWA 3GWZA 4P55A 3CQXA 3U2RA 4UV8A 4K41A 4LMYA 1DPUA 1S22A 3HHHA 1W5SA 4R79A 4EVIA 4RB2C 2FMYA 3E5XA 3K1NA 4IJNA 4RAYA 3H6EA 3DXKB 2AA4A 5K5QA 3F72A 1IXRC 5E8GA 2RC4A 1SFUA 1R5HA 2FOKA 2GUPA 2M5WA 3J80Z 4FWSA 2VE8A 1E17A 4G7HF 3FZMA 3VEVA 2HYGD 3COAC 5AQNA 4A0XA 2H09A 2G7HA 1NGAA 4M6XA 2H94A 3E5UA 4ZYDA 4I09A 5CE3A 5JLFA 2PI0A 4AWXB 1F5TA 1D4XA 3BWGA 1NGBA 1Y0UA 1UHWA 4HX8A 4HV6A 1HXDA 1W5TA 1FP2A 3DQVC 5BOXA 3N97A 1EQYA 5DUIA 1YS7A 1FYMA 4HBLA 3L0QA 4HTLA 3SK3A 3CQYA 3M1FA 3SZPA 2NNNA 1S6LA 3M8EA 1P8ZA 1J7KA 3REOA 4H0EA 1IF1A 2Q0UA 4A0YA 3NRVA 2Z3YA 5LRRA 3I71A 4JNEA 5AZIB 2CH6A 2DI3A 1P92A 1P2FA 4N0BA 1SD6A 3FLCO 3B73A 5A2QZ 4BNCA 2XAJA 3MWMA 1OPCA 4WQ5A 4JD2A 3C7NA 3ATUA 2E7XA 3MDQA 1HPMA 1HW2A 4FL9A 4B1XB 1T6CA 2OQGA 2HF4A 2ZFWA 5E17F 4BR5A 1BI3A 3C7JA 4I7HA 4M6YA 3VEOA 1MJ9A 5HLIA 1RUOA 1GHCA 2Z99A 4PGGA 4QWQA 4BQLA 4BHCA 2ZMEB 2QUFA 5AQXA 3FE1A 2E2PA 3MN5A 4CBWA 1LDDA 2L01A 1H9TA 4BRLA 5BQTA 5TJJA 4PZJA 4FPAA 3BDDA 4EJTA 1GLDG 4XLPF 3ZP5A 3DPTA 4O3MA 1TW2A 4EHTA 2HKOA 3SMSA 1SMYF 2EWNA 2O3FA 4OIRF 2IVOA 4XRFA 5H6RA 4H0XB 2ESNA 5BPMA 1QQIA 2FSWA 3KVGA 1YIOA 3K69A 3LQQA 3KCCA 1K78A 3RKWA 3IRQA 4GGGA 2UXXA 5D8LB 5AQOA 5FO5A 3Q5FA 2CG4A 1ZRFA 2MLKA 5KPTA 4K43A 3FF5A 1BG3A 3TQNA 3CO6C 5AFUH 3F21A 4CZGA 3VFZA 5ILVA 1JCGA 4YDUC 3WQUA 2ZNYA 2OZUA 1O3RA 3V7SA 4L9VA 4KFCA 4PCQA 5BRDA 2IJLA 4O5VA 4A5MA 2BTFA 3VEWA 3ZETB 1T98A 3I58A 1QZYA 4JQFA 3T1BA 4F7ZA 3CUQB 3VODA 1U78A 1C0WA 1E4FT 4IXCA 3FZKA 2DU9A 1QZZA 2DAOA 4KUMA 4ISGA 5FPEA 4BQZA 4PGHA 5AIQA 3LM9A 3QAHA 4BC4A 5BPNA 3BPVA 2RDPA 2YX4A 1P4XA 3MZHA 3W6JB 3ECHA 2UXNA 2HQRA 5ICEA 5KVRA 3IMXA 3FGUA 2QWPA 5HDKA 4M9SA 1T0FA 2P9SB 4E1JA 3WGHA 1T2KA 5D5VB 3VOVA 4U7BA 3T8RA 2P9IB 1SAZA 2PFBA 3ABUA 2P9KA 4CZZA 1GLJO 2QQ9A 1NHAA 3LQRA 2EWSA 4ENMA 3ROUA 1PUEE 1HQCA 4MLHA 4HYEA 4GY2B 1SD4A 2FXAA 3P9IA 1DP7P 5LEKA 3FR0A 1TUUA 3BJAA 2A3SA 1TNTA 2QWNA 4PKIA 1BBYA 1JCFA 5E1WA 3RKYA 3VGLA 3HRUA 3FFKB 2XVCA 2QM3A 4ZYGA 2Q31A 1U6GA 1LVAA 2F2EA 1BC8C 4EQQA 2FSKA 2ASOA 5F2RA 4G8XA 4L0YB 2ZNZA 2PJPA 4JAXA 4WYBA 2FBIA 4AIKA 1MWKA 3TOBA 3FZFA 1QQOA 4RB3C 3D2EA 4NB5A 2O03A 4YFNF 1XGSA 1IXCA 1SD7A 1G3YA 1Z1DA 3BROA 5JHUA 3KP6A 4CZKA 4BRFA 1A04A 1ZRCA 5E8IA 3ULEA 3ZEUB 2BGCA 3RTRA 2DQRA 1KGSA 3VETA 2CW0F 3WTZA 3LAPA 6PAXA 2DW4A 1D3YA 2Q97A 4LLGF 4EJOA 2A68F 5H20A 4HQMA 2E2OA 5ICCA 3DXMA 2C6YA 4F9OA 4S04A 3IWFA 4YFKF 3VGKA 3D0SA 2H3GX 3R6MA 3RSEB 4KA4A 1J6ZA 1P6RA 4MLEA 4A6DA 4EM1A 3MZYA 5LHIA 2P9UB 3VF6A 2IT0A 3PQKA 2HFHA 4KIGA 5A2QK 2YI1A 5TKYA 3M8FA 1NWKA 4HF0A 4MEYF 3P9CA 2W40A 3RIRA 2W25A 4G9YA 4Z94A 4LG0B 4H0YB 3K2ZA 3FMSA 1J75A 1BC7C 2ASPA 5AQQA 1F4KA 1JHFA 2HDCA 4CICA 2FNPA 2A6EF 4EAHD 3P7NA 1GLEG 5HDGA 5AQLA 2O61A 4L5JA 1RZ4A 4IXAA 5HDNA 2LSOA 4WWCA 2IPQX 4BRQA 4EM2A 4BHPA 2A42A 3IKTA 5LRSA 1K8KA 3VENA 5JVTA 2XGXA 1TQIA 5AQWA 3BUZB 4KMFA 2RQPA 1L0OC 2HF3A 3JTGA 1YUWA 4LK0F 4IHSA 3BF1A 1TQPA 4EJUA 1KAZA 3VEXA 5DV5A 3H1VX 1IZ1A 2QBYB 1RUNA 4I98B 2FBHA 2DPDA 3C18A 2NLXA 3EL2A 1G3TA 3L7WA 1L3LA 1CF7B 2CH5A 5BN8A 4M74A 4FWMA 3QBWA 4ETSA 2EA2A 3H46O 2CGKA 1KAXA 1TYQB 4CYDA 1NM1A 2M87A 4RGSA 1MDMA 3KZBA 5JLHA 3OV8A 5EY4A 5DUKA 1O3TA 1SFEA 3CJ1A 3O6BB 5DD8A 4A6EA 2KJCA 4H5WA 1F1ZA 4YIFA 3FMRA 5AZJA 4LC9B 3LA7A 2QYOA 3I64A 4WXHA 3IHUA 2I7PA 1ZAOA 4JHDB 3UKUB 5KPZA 2QM1A 1G6NA 2VC0A 4KNYA 4GXOA 2YU3A 1AOYA 1PP7U 3R8EA 3NQOA 1LJ9A 2EV5A 5BPDA 2VODA 2ZGYA 3AY9A 4H5TA 4OIPF 4XH4A 2FMLA 1WQ2A 5E18F 4BVPA 3GZ5A 1WOQA 3HSRA 1DPRA 2QENA 3GLXA 2NZTA 1BI0A 3MAJA 3R0AA 3CIPA 3H3OB 2H6CA 2FLOA 2PEXA 2P8TA 2QWMA 2VOPA 3GYHX 2DT5A 1S7AA 3TO7A 4CD1A 2R3SA 2E2NA 1BOAA 3LM2A 1RNLA 5CLSA 1C0GA 2EFPA 1KU2A 2JT1A 3HIFA 2O0YA 4EJWA 1ZGAA 3ZPLA 1BU6O 3WXLA 4ZH4F 1LEBA 3LAJA 1GLAG 2J5OA 3GVAA 5LY3A 2R7DA 1ZREA 3F6OA 5FFZA 2DQLA 1ZYRF 5LJVA 5ED4A 1HBXG 1FOKA 4Y13A 4B09A 3O5BA 2EFNA 4CZLA 4DQ2A 2OU2A 1TLHB 2STTA 4Z2YA 1IW7F 2QQBA 2EV0A 3F6VA 1FBSA 1ZBSA 3U9ZA 4CBUA 4BHBA 1JCEA 3WXJA 1HSJA 1U2VA 1B9NA 4JD2B 1Q1HA 1ONVA 4R8HA 1KXPA 1H9GA 5KPRA 1XGOA 3TO6A 2MC3A 2K4JA 3HUGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5FPM A;  4HF1 A;  5AQK A;  1MD0 A;  2CSO A;  1LDJ A;  3HI0 A;  5AQG A;  4DB3 A;  5LLQ A;  2NRH A;  1RFQ A;  3WTV C;  3DWL A;  1NGI A;  5BS6 A;  3FXQ A;  5ERI A;  4L9J A;  2JTV A;  3GFJ A;  3HTV A;  5EEH A;  4KN4 X;  1YQA A;  2A40 A;  2STW A;  2J4R A;  4IZ9 A;  3VB2 A;  1ZGJ A;  2H27 A;  1BA1 A;  4H5V A;  1QO0 D;  4FWL A;  5F0X A;  3WUH A;  1JE8 A;  3UB5 A;  5CVJ A;  1FX7 A;  2X4H A;  3ZX0 A;  2HS5 A;  4K25 A;  3W6K B;  2PN6 A;  3M7G A;  4U0W A;  3ZN0 A;  1J9I A;  3IRR A;  1BWF O;  1QZ6 A;  4HWI A;  4BRO A;  1USS A;  2ZBK A;  4P9F A;  2Q2E A;  4CZE A;  3ENO A;  3HTS B;  1NGC A;  3FM5 A;  3ERE D;  5IT9 K;  3WTS C;  2EFW A;  3MCP A;  3CUO A;  3T8T A;  3LDP A;  2I7N A;  2E1N A;  3IKV A;  2IIR A;  2YHY A;  3K1M A;  3JSO A;  5F64 A;  4G94 A;  1QGP A;  5AZI A;  1CZA N;  3KP4 A;  4H0P A;  4EJV A;  3GFM A;  1OYI A;  2D1H A;  5E1X A;  5E84 A;  5CJ9 A;  5LGN A;  2HTJ A;  3H3U A;  2GIV A;  3DPL C;  2QVO A;  1S29 A;  3IUC A;  1KYZ A;  2G7U A;  1Z05 A;  5EVZ A;  1XB4 A;  2A61 A;  2EJR A;  3F3X A;  2KRF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3ELK A;  3B6C A;  3FHZ A;  5AQP A;  1IDZ A;  5B8H A;  2V7Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 5FPM A;  4HF1 A;  5AQK A;  1MD0 A;  2CSO A;  1LDJ A;  3HI0 A;  5AQG A;  4DB3 A;  5LLQ A;  3WXM B;  2NRH A;  1RFQ A;  3WTV C;  3DWL A;  1NGI A;  5BS6 A;  2NRX A;  3FXQ A;  5ERI A;  4L9J A;  2JTV A;  3GFJ A;  3HTV A;  5EEH A;  4KN4 X;  1YQA A;  2A40 A;  2STW A;  4IEE A;  2J4R A;  4IZ9 A;  3VB2 A;  1ZGJ A;  2H27 A;  1BA1 A;  4H5V A;  1QO0 D;  4FWL A;  5F0X A;  3WUH A;  1JE8 A;  3UB5 A;  5CVJ A;  1FX7 A;  2X4H A;  3ZX0 A;  2HS5 A;  4K25 A;  1S72 N;  3W6K B;  2PN6 A;  3M7G A;  4U0W A;  3ZN0 A;  1J9I A;  3IRR A;  1BWF O;  1QZ6 A;  4HWI A;  4BRO A;  1USS A;  2ZBK A;  4P9F A;  2Q2E A;  4CZE A;  3ENO A;  3HTS B;  1NGC A;  3AGK A;  3FM5 A;  3ERE D;  5IT9 K;  3WTS C;  2EFW A;  3MCP A;  3CUO A;  3T8T A;  1W97 L;  2I7N A;  2E1N A;  3LDP A;  3IKV A;  4A57 A;  2IIR A;  2YHY A;  3K1M A;  3JSO A;  3CD6 N;  5F64 A;  4G94 A;  1QGP A;  5AZI A;  3N4Q A;  1CZA N;  3KP4 A;  4H0P A;  4EJV A;  3GFM A;  1OYI A;  1YJN N;  2D1H A;  5E1X A;  5E84 A;  5CJ9 A;  5LGN A;  2HTJ A;  3H3U A;  2GIV A;  3DPL C;  2QVO A;  1S29 A; 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