4IJAA

Structure of s. aureus methicillin resistance factor mecr2
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
377
structure length
363
Chain Sequence
PMNDNEKRVLREIYNHHNISRTQISKNLEINKATISSILNKLKYKSLVNEVGGGRKPILLKVNHLYGYFISLDLTYSSVEVMYNYFDGNVIKHESYDLPDEKVSSILSIIKKHIDIQEKLDTYNGLLGVSVSIHGVVDNEQHVTYGISIAKKIKEITNVPVVVENEANLSALYERNFNHNLSYNNLIALSIHKGIGAGLIINNQLYRGANGEAGEIGKTLVSKVSDNVEIFHKIEDIFSQEALLHNLSNQLNEKMTLSKLIQFYNEKNPVVVEEMEQFINKIAVLIHNLNTQFNPNAIYINCPLFNEMPEILEAIKNQFKQYSRNEIQIKLTSNVKFATLLGGTLAIIQKVLQINDIYLDIKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-Function Studies of the Staphylococcal Methicillin Resistance Antirepressor MecR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule keywords XylR protein
total genus 128
structure length 363
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
A PF01047 MarR MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 4ijaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA03
2PEXA 4A12A 2FEZA 3RSEA 4ISGA 4MEYF 4HW0A 4HLYA 3EETA 3O4WA 3LWFA 4BRDA 2CQKA 3I71A 2A5XA 1HW1A 3W6KB 3ZPLA 3K1MA 1PDNC 1FYMA 4IF4A 3MCZA 3WTXC 4LG0A 1G4DA 4K41A 3FM3A 2YPRA 3BJOA 1BJAA 4HBLA 4JBAA 5LGTA 1A04A 5KPRA 3FZFA 4FWQA 2GA2A 2E2QA 3ML6A 4AIJA 3LSTA 4ENKA 3TKYA 1U2VA 4BR5A 1Z1DA 4NQWA 3QP6A 4G94A 5BRHA 4IRGA 1KGSA 3F21A 2VCPA 1O3SA 3MFKA 1T6SA 2ZCWA 4ETSA 1FSEA 1B59A 3MN6A 4PL8A 4BHPA 1TQMA 4L9VA 1MDMB 4H5NA 1KYZA 4ENNA 4B1YB 2GXBA 2EV0A 5AZJA 4YDUA 2DO7A 4RGXA 2CGLA 3U4LA 4B8XA 3K1NA 3KZYA 2NNYA 1J2XA 1S8NA 4A0YA 4QS8A 4CBWA 3ZN1A 4PCQA 3JAMZ 2AXLA 4CD1A 2BYVE 4FX4A 3TGNA 2MBFA 4WK8F 3JW4A 1G99A 5AONA 2FBHA 3WE2A 1ZRFA 1ZC6A 2EA2A 4LLNA 3JTGA 2IVPA 2W41A 3N4MA 1ZGAA 1K6OA 5ILVA 3UKUA 2VC0A 2CH6A 2HTSA 4PZJA 3TPQA 1X3NA 2VXZA 5CYVA 2F5CA 2FXUA 2CG4A 4BVPA 3WTZA 2P9NB 4WXHA 4I0AA 3FR0A 2ADUA 1BM9A 1WWXA 5BOXA 4MO4A 1LNWA 3G25A 3KVGA 4BR9A 2L4MA 3J8AA 4M63C 2QQBA 4RB2C 4P5OA 1HBXG 4JD2A 4WXDA 2MH9A 4RB1A 3LDNA 3EDPA 5ADXH 2I7NA 3E6DA 3P9CA 2M87A 2P9PA 4R79A 3ZX0A 1ZG5A 2BUPA 1C0WA 4FOIA 3WUHA 3VEWA 1R22A 1ON2A 1YAGA 3ECOA 3WGGA 1NGAA 4IHSA 3LQQA 4B1ZA 1U6ZA 2FSNA 2KKOA 2VYPA 3R0AA 3CO6C 1VTNC 1YTYA 2JPCA 4JHDA 3LDOA 5LJVA 1F4KA 4RTFD 4EGYA 1ZH5A 3C7NB 4XLNF 2CGKA 3L0QA 4KICA 3HOSA 3DXMB 4HX8A 4ISEA 3HYIA 2A61A 4GXOA 3KP6A 1XQSC 3H3UA 2E1CA 2FE3A 2FSWA 3BY6A 4LFUA 5HDGA 1XCVA 3GZ6A 4M7YA 4RS8A 2QBYB 2NNNA 3V7SA 4BRLA 4Q4ZF 2FA5A 1JCFA 1IUYA 4GY2B 1FOKA 1BIBA 3MQ0A 4LJZF 3LAJA 1HKTA 4G7OF 2HQNA 5AQLA 5BRDA 1FZPB 2NLXA 5FPNA 3DJCA 1TQIA 5LY3A 2QYOA 5L3FA 3FZKA 3GEZA 4HWIA 2XAJA 2XKPA 2R7FA 1P92A 2QLZA 3FZVA 3ZMTA 3FXUA 2OZUA 6PAXA 3ZEUB 1HSTA 1B9MA 3WU0A 1GVJA 1LB2A 3ZMZA 1MWMA 1G3YA 5D4SA 1YXQA 5KQ8A 2QWRA 1XDSA 4Z2YA 2K27A 2P9UB 3JXUA 3VOEA 2ISZA 2VN2A 1W5SA 2M30A 5DEQA 3HM8A 1I6XA 3FZMA 1ZREA 3WEEA 1S29A 2X4HA 4FWOA 3VESA 4ZYEA 2P9IB 5AQUA 1D8KA 2OZ6A 3SJHA 1IN7A 4H5TA 5AQTA 2IA0A 5AZIA 1G3WA 2V6CA 4DNCA 3LAPA 2EJRA 3R6SA 5KK1A 1KU3A 2Q2RA 1YIOA 1TTYA 1UHMA 5BPLA 3R9PA 1FP1D 3AY9A 4ZZLA 3B02A 4CZJA 3H1VX 4F7ZA 3QFUA 4I6MB 3F22A 5L3EA 3BUZB 1ZXOA 3E97A 1BOTO 2D2WA 1LQ1A 2E7XA 3SLCA 2HGCA 4KFCA 1FYKA 2PN6A 5BMZA 2E8AA 1ODDA 4GO1A 3I58A 2JRTA 1YW9A 3GFIA 3CI5A 3WXJA 1R1UA 4L5JA 2YJFA 5AQMA 3ZMVA 4Y15A 1HKCA 1IW7F 2M1BA 4FHTA 1B1BA 5LHGA 1KU7A 3HRTA 1O3QA 4J8FA 2V1UA 5F1RA 2G9WA 1NGDA 4Y17A 1SAZA 3ZMUA 4O6JA 1QBJA 4Q48A 3WXIA 4MQVA 1QGPA 1U8RA 4U88A 1EH6A 2XASA 1WKMA 4RAYA 3BEXA 2ZWHA 1NGGA 4I09A 2VC1A 5F6FA 3D2EB 5E17F 2OQGA 3HHHA 1OYIA 1XGOA 4A5NA 2ELHA 4BAYA 1MJAA 1QQNA 1IJJA 3MWMA 4BXUA 1O7LA 2HTJA 3WT0A 3MZHA 3ISPA 2V79A 2VBXA 3VB2A 4LK1F 4HZFA 2EA4A 1RDWX 3IFRA 4P9FA 4HX7A 4BC4A 2GWRA 3D5LA 2EFNA 3BWGA 4EHUA 4A6DA 3ATVA 4AWXB 3FF5A 3KZZA 4OINF 2HF4A 4H03B 4Y13A 4WF2A 2YR2A 2FF4A 3D7EO 2A6EF 3SFZA 3U1DA 4MQ9F 3A5OC 5FPDA 4FL9A 5AQOA 3EYIA 1RZ4A 1IN8A 1JHHA 4XH4A 4BRAA 1QNTA 2W57A 1I27A 2Q97A 2ASOA 2P9SA 5DD8A 5ILUA 3RSEB 2H27A 1ATSA 3O8MA 5DCFA 4EIAA 3GDQA 1WI9A 2LDUA 2DT5A 3JSOA 2ZO4A 5EY4A 4CZKA 1BA0A 1BA1A 2Q1NA 3R6MA 2KIUA 5F1XA 1JGSA 4B1UB 1T98A 5JICA 2QM3A 3DP7A 5EEHA 4ZYGA 2HF3A 1BC7C 3RDIA 3IKTA 4ESFA 4JN4A 5ICCA 2CW0F 4LC9B 4H0TB 3DXKA 4KYWA 5DD4A 3IRRA 3ZX3A 1HQCA 2M8EA 4H0VB 3TQNA 4LG0B 2A68F 1QQMA 2E2OA 2M5WA 4FWPA 3FLCO 2DLLA 5LRSA 1V4SA 1P4AA 2A07F 2JZYA 1QQIA 1QZZA 5TKYA 3A8YA 2YX4A 1S6LA 2KIFA 2PBIA 1U2VB 1OKRA 3T8RA 4I7HA 2RC4A 2PAVA 4CYDA 1F1ZA 1IXCA 4XRFA 2NRAC 2Q31A 3DWLA 5HDNA 3AARA 3BOQA 3VFZA 2F5DA 1O3RA 1DPRA 4BRMA 1XUPO 1UHWA 4WXCA 2IVNA 4BG8A 1J6ZA 5B8HA 4ESBA 4LK0F 5E18F 5CVVA 5IT9K 3MDQA 3WODF 2F5EA 2KRFA 1K8KA 3HHGA 2O03A 3WQTA 2Q8KA 4AIKA 2NS0A 1UFMA 1V4RA 3P7NA 3FGUA 2O0YA 3CJAA 1BI0A 4O8KA 4M9ZA 1BN5A 4KIGA 1QZ5A 3RKWA 2PBDA 5BPNA 5CVJA 3FWEA 2DI3A 5A2QZ 2Q0OA 1Q1HA 3I5UA 1UB9A 3H1QA 2W84A 2JT1A 4GYGA 4PL7A 2GAUA 3K0LA 3CQXA 3EO3A 3WTVC 1MWKA 3CJBA 4FWKA 4L3QA 5CVRA 5K5QA 3REOA 4L18B 3L7WA 3Q5FA 3UKUB 4BRFA 1I5ZA 2E2NA 3CO7C 4ZYHA 3F6OA 3JSPA 1ATNA 3GZ5A 4M7XA 3W0LA 4UNOA 4PKGA 3RYRA 3QU3A 1W5TA 3M8EA 4WX9A 1JCEA 4EJWA 2L3DA 1GLFO 1EH8A 2HOEA 4S05A 4YFNF 1R5GA 4JD2B 4CICA 2QW9A 2DTRA 2IA1A 3TO6A 3MN7A 5L3DA 2QWLA 5ICEA 4H5WA 5E1WA 3HTVA 5BS6A 2D45A 3O5BA 2P9PB 1LOTB 4KIFA 2H09A 1GLLO 4CZMA 1ZLJA 4CD3A 3T5XA 1L3LA 4A61A 3SQNA 4CGZA 1KAZA 4HV6A 4UHTA 4HQEA 4BREA 2QZ8A 2CFXA 2PG4A 4KUMA 5JVTA 1KQ9A 4MTDA 4HAMA 5AQFA 4AD9A 3I33A 2JTVA 3CQYA 5BR9A 2E1NA 5EVZA 3H45C 1OKJA 1XB4A 3U2RA 3IDHA 4LLGF 2VE9A 4BHCA 3M1EA 1Q18A 4H0PA 1STZA 3EQLF 1MZBA 2BBYA 4N9IA 1BG3A 4B09A 4P9UA 2O61A 2QWMA 2IVOA 1J5YA 3LDPA 4UVAA 4KMUX 5J8CA 3C7JA 4XH1A 1YS6A 4ESJA 1XSDA 2V7YA 4NHJA 1X9JA 3PQKA 1QZ6A 3DXJF 4MLEA 2VWBA 3IC7A 4KT5C 3RJPA 2PJPA 1R5HA 5FB2A 1KA8A 3LA7A 3DPTA 3VF6A 4U0VA 1ATRA 1S7OA 3QAHA 2Z33A 1AOYA 3G73A 3KE2A 4CZZA 4ZZDA 4EGZA 1IZ1A 3T1BA 1TYQA 3RI4A 3ZP5A 3KHYA 1P6RA 4XLPF 2HWVA 2ZMEA 3DAWA 4A0XA 3O80A 5JI6A 2A42A 1YS7A 4BQLA 5FD5A 1YQAA 2OD5A 2BGCA 3COAC 2ZGYA 1BUPA 5E26A 2NZTA 2FF3B 3WEEB 2A3ZA 4B1WB 1U3EM 3S2WA 1FBQA 2AS5F 5AZIB 4B9QA 1D4XA 4CZIA 1T44A 3L2CA 3SZPA 3H6EA 5FLXZ 4HF2A 2CGJA 5ERIA 3CUQC 5LGUA 3FM5A 2E2PA 1QHAA 2ZXJA 4K43A 1TNTA 4RB0A 2UWMA 4A2AA 3UKRA 5F64A 5H6QA 3FFKB 1CGPA 4CHUA 1R1TA 1U2WA 1K7AA 1HKGA 3RTRA 3ELKA 3KP5A 1NGEA 2J4RA 2WTEA 4CJ7A 5EOYA 1T38A 4L9TA 3V7RA 2PQ8A 3BJAA 1MJ9A 4RAZA 2NYXA 1SAXA 5BPMA 2XAFA 1NGHA 2MD5A 4U0WA 1HW5A 3QU6A 4LMYA 4UV9A 4PKIA 4WQ4C 4BHBA 4KIBA 3WG9A 3F9MA 1R00A 3VF2A 2IVMA 3BPXA 3ZN0A 4HF1A 1LCUA 1ZRCA 4N0BA 1G3TA 2HS5A 1TLHB 2HYGD 3QB0A 3J80Z 2VBZA 1KU9A 3CJNA 5AFUA 4IWVA 2LF8A 3M7GA 3J81Z 2HEOA 3GBTA 5DCMA 2W24A 3WXLA 5ICFA 2KHOA 4BC5A 2RV8A 1FSHA 1Z6RA 3I53A 1J9IA 1NGFA 2YHYA 5JR3A 1FBUA 5CLSA 3VGKA 1FPQA 3Q9VA 3TO9A 4HX4A 2J5OA 4EJUA 5L3GA 1OYWA 2FBKA 2GWJA 2HKOA 3AAQA 4FPBA 1BU6O 4WQ4A 2A6HF 3WQUA 5LEJA 4YFXF 4CXFA 3L6QA 2NRHA 2KJBA 2W40A 2DK8A 2Z99A 1R36A 3M9AA 2FBIA 3T8TA 1DDNA 1ZGJA 4NB4A 4ENMA 5E8IA 1NMDA 1CF7B 2IT0A 4CBXA 1FY7A 3P4IA 2IRFG 2E1YA 2H6BA 4IXCA 4A0ZA 3TDUC 2RQPA 2OA4A 2A5YB 2ZBKA 4YIIA 2EWSA 4EM2A 2IIRA 3IUCA 1FC3A 2P7VB 3I59B 1J7KA 3RYPA 4XH5A 2HFHA 2EFQA 5BN9A 5JFRA 3C3WA 1JE8A 4BGAA 4BRNA 1HKBA 2P9KA 1FBSA 2V7ZA 2BV6A 4ZH4F 1NLVA 3VEVA 3BDDA 2STWA 2QWWA 4WCGA 1FP2A 4BNCA 3KEOA 4FPAA 4E1JA 4IJAA 2ZF5O 2GIVA 3R0JA 4K42A 4FWRA 1REPC 2HDCA 3KEQA 2RVCA 2L4AA 2D0OA 4MTEA 3MK6A 3HOTA 3QPHA 2MA3A 3I8BA 4BR0A 4HDVA 5K5OA 2L02A 5AQIA 3ZX2A 2EWNA 5HDKA 3RKYA 3GO5A 2Q36A 4O3MA 1IN5A 4JK1X 4UUVA 2A69F 3DXKB 2YJEA 1K78B 1ON1A 4MNUA 4MLHA 3ABTA 5AQNA 3D2FA 2DW4A 1XSXA 2XUBA 3SMSA 2A3SA 2XGXA 4EHTA 1BO5O 1EH7A 2P9NA 4A2BA 4DCHA 2MLGA 4FT8A 5JLFA 4HDUA 5LLQA 1KAYA 2YCHA 5E1XA 3B73A 3BP8A 1SQKA 4ENJA 2XVCA 3W6JB 3GYHX 3L4IA 3ATUA 5KVRA 2KIMA 2RKHA 3CIPA 3EN9A 2GQQA 3J7AO 4KNYA 1P4XA 4KA4A 1T6DA 1QQOA 1GXPA 4ON0A 3FMQA 2ZGZA 2Z5UA 4F9OA 1MKMA 1R7JA 3HBTA 3VEOA 3OOPA 1K8KB 4Y0WA 4ISFA 3V8JA 3QICA 2XV4S 3E6MA 2Q2EA 3KP2A 4EQQA 4CDGA 1MA9B 4RCHA 4M74A 2ZNYA 4EVIA 2ESHA 1NM1A 1ZYRF 2QXLA 3HTSB 3QBWA 4FX0A 2IP2A 5AQXA 4EAHD 1RNLA 2E20A 1OMIA 3M8FA 3GFMA 1RFQA 2DPDA 4BVOA 4UVCA 5AQZA 3IKVA 3I0TA 4P96A 4OIPF 3CDHA 4CZHA 4A6EA 3UB5A 3SZTA 1X3UA 1YUWA 2VBYA 3H3OB 4DQ8A 2M45A 2DFIA 3LM9A 5KPZA 5FD6A 4HTLA 1WUAA 2PMUA 1NWKA 3GF2A 2IJLA 2ZKZA 3GLXA 3CERA 4BRKA 4MGRA 1WRJA 3PQJA 2K86A 2CGPA 1HKQA 3A5MC 3R8EA 2RDPA 4M71A 1W7PA 5DDGA 1IG8A 3WTUC 1X3MA 2EK5A 2P9LB 4QLCU 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2PEX A;  4A12 A;  2FEZ A;  3RSE A;  4ISG A;  4MEY F;  4HW0 A;  4HLY A;  3EET A;  3O4W A;  3LWF A;  4BRD A;  2CQK A;  3I71 A;  2A5X A;  1HW1 A;  3W6K B;  3ZPL A;  3K1M A;  1PDN C;  1FYM A;  4IF4 A;  3MCZ A;  3WTX C;  4LG0 A;  1G4D A;  4K41 A;  3FM3 A;  2YPR A;  3BJO A;  1BJA A;  4HBL A;  4JBA A;  5LGT A;  1A04 A;  5KPR A;  3FZF A;  4FWQ A;  2GA2 A;  2E2Q A;  3ML6 A;  4AIJ A;  3LST A;  4ENK A;  3TKY A;  1U2V A;  4BR5 A;  1Z1D A;  4NQW A;  3QP6 A;  4G94 A;  5BRH A;  4IRG A;  1KGS A;  3F21 A;  2VCP A;  1O3S A;  3MFK A;  1T6S A;  2ZCW A;  4ETS A;  1FSE A;  1B59 A;  3MN6 A;  4PL8 A;  4BHP A;  1TQM A;  4L9V A;  1MDM B;  4H5N A;  1KYZ A;  4ENN A;  4B1Y B;  2GXB A;  2EV0 A;  5AZJ A;  4YDU A;  2DO7 A;  4RGX A;  2CGL A;  3U4L A;  4B8X A;  3K1N A;  3KZY A;  2NNY A;  1J2X A;  1S8N A;  4A0Y A;  4QS8 A;  4CBW A;  3ZN1 A;  4PCQ A;  3JAM Z;  2AXL A;  4CD1 A;  2BYV E;  4FX4 A;  3TGN A;  2MBF A;  4WK8 F;  3JW4 A;  1G99 A;  5AON A;  2FBH A;  3WE2 A;  1ZRF A;  1ZC6 A;  2EA2 A;  4LLN A;  3JTG A;  2IVP A;  2W41 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3H36 A;  4KHU A;  2HHV A;  4XSZ F;  1MW7 A;  1DU0 A;  4IHY A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 2PEX A;  4A12 A;  2FEZ A;  3RSE A;  4ISG A;  4MEY F;  4HW0 A;  4PHT X;  3CCS N;  4HLY A;  3EET A;  3O4W A;  3LWF A;  4UY8 O;  4BRD A;  2CQK A;  3VTH A;  3I71 A;  2A5X A;  1HW1 A;  3W6K B;  3ZPL A;  3K1M A;  3KWI A;  1PDN C;  1FYM A;  4FVU A;  2QTD A;  4IF4 A;  3MCZ A;  3WTX C;  4LG0 A;  1G4D A;  4K41 A;  3FM3 A;  2YPR A;  3BJO A;  1BJA A;  4HBL A;  4JBA A;  5LGT A;  1A04 A;  4GV9 A;  5KPR A;  3FZF A;  4FWQ A;  2GA2 A;  2E2Q A;  3ML6 A;  3MWP A;  1VQ8 N;  4AIJ A;  3LST A;  4ENK A;  3TKY A;  1U2V A;  4BR5 A;  5TKW A;  1Z1D A;  2OTL N;  4NQW A;  3QP6 A;  4G94 A;  5BRH A;  4IRG A;  1KGS A;  3F21 A;  2VCP A;  1O3S A;  3MFK A;  1T6S A;  2ZCW A;  4ETS A;  1FSE A;  3CC2 N;  1B59 A;  3MN6 A;  3P38 A;  4PL8 A;  4BHP A;  1TQM A;  4L9V A;  1MDM B;  5DM7 L;  4H5N A;  1KYZ A;  4ENN A;  4B1Y B;  2GXB A;  2EV0 A;  5AZJ A;  4YDU A;  2DO7 A;  4RGX A;  2CGL A;  3U4L A;  4B8X A;  3K1N A;  3KZY A;  2NNY A;  1J2X A;  1S8N A;  4A0Y A;  4QS8 A;  4CBW A;  3ZN1 A;  4PCQ A;  3JAM Z;  2AXL A;  5CR4 A;  4CD1 A;  3CCQ N; 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