4IJAA

Structure of s. aureus methicillin resistance factor mecr2
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
377
structure length
363
Chain Sequence
PMNDNEKRVLREIYNHHNISRTQISKNLEINKATISSILNKLKYKSLVNEVGGGRKPILLKVNHLYGYFISLDLTYSSVEVMYNYFDGNVIKHESYDLPDEKVSSILSIIKKHIDIQEKLDTYNGLLGVSVSIHGVVDNEQHVTYGISIAKKIKEITNVPVVVENEANLSALYERNFNHNLSYNNLIALSIHKGIGAGLIINNQLYRGANGEAGEIGKTLVSKVSDNVEIFHKIEDIFSQEALLHNLSNQLNEKMTLSKLIQFYNEKNPVVVEEMEQFINKIAVLIHNLNTQFNPNAIYINCPLFNEMPEILEAIKNQFKQYSRNEIQIKLTSNVKFATLLGGTLAIIQKVLQINDIYLDIKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-Function Studies of the Staphylococcal Methicillin Resistance Antirepressor MecR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule keywords XylR protein
total genus 128
structure length 363
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
A PF01047 MarR MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 4ijaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA03
4RCHA 2GWRA 3IKTA 2F9WA 1J0RA 3UKUA 1ZRDA 2WV0A 2HTSA 4KFCA 1KU2A 5E1XA 2ZNYA 3OV8A 4LK0F 5AZIB 4Y13A 3D2EA 4JHDA 1P4WA 2VE8A 4L0ZB 1HKQA 5FLXK 3FXQA 6PAXA 3QRFF 4H5NA 3E5UA 4KBOA 3A0IX 2M1BA 4JD2A 4YDUA 3N97A 3CJNA 4AIKA 3O08A 1SMTA 2VXZA 2FF4A 5CVJA 4E70A 2FRHA 1BIBA 1WI9A 4EIAA 5BN9A 4BREA 1XDSA 4H5TA 3HZ6A 5AONA 3ZX0A 1KAXA 4HF1A 5AQWA 2D1HA 2GTDA 3H3UA 3MMVA 1XUPO 2IVPA 3I8BA 3W3DA 5KPZA 2HOEA 3A5NC 1SAXA 1CF7A 2Z99A 1BDGA 1TYQB 2XUBA 2HGCA 5DUIA 4B1ZA 3K2ZA 1BO5O 4QS9A 3JTGA 4XH4A 5A2QK 4Q4ZF 3WU1B 5LEKA 1Z9CA 4H0XB 1IN7A 2JPCA 1GHCA 4H0OA 1O3TA 2JTVA 3RTRA 4HF2A 2Q31A 1W7PB 2RNJA 1KA8A 3SJHA 3CERA 3ZMTA 5ICCA 2QW9A 2M5WA 3M6GA 1FT9A 2Z3YA 3I4PA 4J8FA 2EV6A 5E17F 2XAQA 1RZ4A 2LDUA 4FHTA 1XDUA 3CETA 4ESFA 2ZMEB 2HFHA 1IUYA 5BS6A 1ZH5A 3VFZA 3IWZA 1U8RA 1BWFO 1SFEA 2J5OA 2JZYA 2HEOA 3HSCA 3VEYA 4CJ7A 2V9VA 2Q0RA 4IZ9A 3IKVA 4PKGA 1R1UA 4I01A 4LK1F 1SD7A 3BEXA 3QPTA 4Y15A 2PI0A 3WODF 5DV5A 1WSUA 3CUQA 5KPRA 3GX4X 3E5XA 3LDQA 2W85A 5JHUA 4EV0A 3DEUA 4BXUA 5K5QA 4WK8F 1B9MA 2W25A 3VEZA 1LCUA 3WQUA 1RGIA 2BV6A 3LDPA 4ETSA 2LKPA 3CI5A 3QBXA 3ID8A 5K1YA 5BPLA 1HSTA 3RKYA 1YO5C 2Q36A 2NS0A 3M7GA 3K0LA 1FYKA 1BI0A 4NO7A 3ZX2A 3GXOA 1NGEA 1OPCA 5AIQA 4L0YB 2UWMA 4BR9A 2D2WA 1YXQA 1S7AA 3S41A 3WGGA 3DF8A 1JE8A 2XAFA 4GY2B 3HTSB 2BTFA 3O80A 3MZYA 4CBXA 3MN5A 3TQNA 1IN5A 2CWEA 4M9SA 4KIGA 3VETA 3ROUA 2GA1A 2HMPA 3U1DA 1FLIA 2UXNA 1W5SA 2QBYA 2QWLA 1H9GA 4GXOA 2E1ZA 1BN5A 2OBPA 4HTLA 5LHIA 5JLHA 1Q1HA 3TO6A 4YFNF 4QLCU 4AIHA 3GZ6A 1XD7A 2RC4A 4CBUA 2EFQA 2BYVE 1ON1A 1ZHFA 4IO8A 2P9KB 3HRSA 2GIVA 5LRSA 1BJAA 3ERED 1OKRA 4F7ZA 3KVGA 4OIPF 5H20A 3WTZA 5F6FA 2KHOA 2WC2A 3EQLF 3CTAA 1J7KA 2W57A 1RUOA 2DW4A 4OIRF 3I71A 1I27A 4IF4A 1LB2A 2X0LA 3FZVA 4HWIA 3VPZA 1E2XA 2LSOA 2P7CB 2VONA 3KP2A 2EV0A 1GLAG 1IAWA 1QPMA 1ZAOA 2FXAA 2ZBKA 2GELA 3ELKA 2YCHA 1USSA 3H3NO 1ULYA 1FBUA 2P9PB 1R23A 1U2VB 4M6YA 4ZH4F 4ENKA 5D5UB 2VT3A 3EN9A 3R6SA 3CJ1A 3RPQA 4JN4A 3EZWA 2V52B 2PBIA 4B1YB 1TQIA 2AS5F 5FPNA 3T8TA 4S05A 1T6DA 1PP8F 5HOOA 5ED4A 1R1VA 3F22A 3VODA 4BRCA 4CXFA 3E5QA 2P6SA 1LJ9A 3BJOA 4BR2A 4CYDA 4FOIA 5CLSA 2PBDA 1K6OA 1ODDA 2P9UB 4H0TB 4EMSA 3HIFA 4K2EA 4I0BA 2FOKA 3I5UA 2GXGA 4EQQA 1ATRA 3KEQA 3DPLC 5ERIA 3L7WA 4DQ8A 4CZJA 4DCHA 2DPNA 2QWRA 1BIAA 2MD5A 3FZMA 2A68F 3VGMA 3FMSA 2D1KA 2P9IB 4RB1A 3LA7A 3V8KA 2DQLA 1F4KA 3A5OC 3KP4A 3ZEUA 1E4GT 2ETHA 2ELHA 2EFOA 3F8CA 2VC0A 1X3NA 2CQKA 3FWEA 4CDGA 2P5KA 1R58A 2CGJA 5L3EA 4LG0B 2KIFA 1KQ0A 5BOXA 3VEPA 3RYRA 4FOEA 1YLFA 2ZO4A 1WWXA 1FX7A 4A2UA 4MLEA 4EM1A 5ILVA 3ULEA 1P8ZA 3VGKA 4HX7A 3LDLA 4A0YA 4YIIA 2HKOA 1SD5A 3NQOA 2HQNA 4EJOA 4ESJA 4BQAA 1OYIA 4IHSA 1NMDA 1TQPA 1GLBG 1MA9B 2OANA 1SFXA 4H0VB 3O6WA 3HSFA 4UXNA 1IRFA 3WTSC 1ZG1A 4JNEA 4OU0A 2HYFA 3HUGA 2VOOA 4M7XA 2Q1NA 1MJ9A 3G25A 4JBAA 2IJLA 2X4HA 3FMRA 1RIOH 4L9NA 2G7UA 3KEOA 2P9SA 2QWNA 1W4MA 2XIGA 2XV4S 2DPUA 5H6QA 2IA0A 5TJJA 4BC3A 2E2QA 4H0PA 3WEEB 4B9QA 2VBZA 1NLVA 4A2BA 2KIUA 3PFIA 4FO0A 3KZYA 3LDOA 2CG4A 2Q97A 3GFJA 3WE2A 1KXPA 4FWKA 3FM3A 4U0WA 2W41A 3GW2A 1KQ9A 2HF4A 4WQ5A 4BHBA 4IXCA 2A07F 1I6XA 3T5XA 2O3FA 1XCBA 4B1UB 3BROA 5FB2A 4KMFA 4OMZA 2GUPA 5KQDA 4EGYA 5AZJB 3UKRA 2E2OA 4MEXF 2ADUA 2F5EA 4ISEA 4BQLA 2TDXA 5AQPA 2DU9A 1ON2A 1KGSA 4WF2A 1FYLA 4H03B 5JLFA 2BGCA 2P9LB 2P9NA 3ZN0A 1I1GA 3C7NB 3WT0A 4B1XB 2VE9A 3CO6C 1Z6RA 3QICA 2EWSA 4H5WA 5K5OA 2EK5A 3QU6A 5HS8A 5J8FA 4WCGA 3ATUA 1ZRCA 4A2AA 4ENMA 3WTTC 2QVOA 4UV8A 4ESBA 2H09A 4RB3C 2EB7A 3VF2A 3DPTA 2Q2EA 5FGMA 3SQNA 2COMA 4G8XA 2HKXA 4BHPA 3EKSA 1MD0A 3CO7C 1GLFO 4B1VA 1XSVA 3ZETA 4MTDA 3KETA 5CYVA 1LDKB 1O7LA 3RPUA 3ABTA 4F9OA 2E88A 3BF1A 1ESVA 3QFUA 2ISZA 2BEOA 4HW0A 3DWLA 3R4KA 4AIJA 4BQZA 1Y64A 3T1BA 3SHFA 2J5PA 3FGUA 1IF1A 1QQOA 3V8JA 3HTUA 3GG4A 4R79A 3G73A 3RYPA 3BOQA 4CZIA 3DV8A 2G7HA 1AOYA 5AQSA 2RDPA 3VOEA 1MDMB 2ZGYA 3P7NA 4EGZA 3JTHA 1C0WA 2QQAA 3RSEA 2BE5F 3M9AA 1SZ2A 2FU4A 1JCGA 1X3MA 3ECHA 2P7VB 1V4TA 1HW5A 2O0YA 3F8FA 4BR0A 2E8AA 5AQNA 2HS5A 3KLOA 5LY3A 3SMSA 2FNPA 2GWKA 1YS7A 3ZPLA 3K9TA 3WG9A 2E1YA 1REPC 3SFZA 1LQ1A 1HUXA 4ISFA 1IN6A 2FXUA 4L9JA 4CZFA 4BRNA 1MWKA 3LM2A 3HOTA 3O6BB 4E1JA 1FPQA 5CVVA 3L0QA 4G6DA 4Q47A 1R59O 3ATVA 3MWMA 4H5VA 1YG2A 2V7YA 4ZZDA 1T39A 4FSVA 4IPAA 1FNNA 3W6KB 2PAVA 4M9ZA 2K02A 3FR0A 2EJRA 2OQGA 4A6DA 4WWCA 5J8CA 2FSJA 4HV5A 3HBTA 3F6OA 2VN2A 1GLLO 3EETA 1O7FA 2EFWA 1YW9A 3ZMVA 1G4DA 4BC2A 2A6EF 4EAHD 2MH2A 1RNLA 1U5TA 1IN8A 3WTVC 2EV5A 2IIRA 4YIFA 5ADXA 1D8KA 3D2FA 4G6QA 4KDPA 3CUOA 3GFIA 1A04A 1JXSA 4MLHA 3UB5A 4CZKA 2XAHA 3IMXA 1K8KA 1FWZA 1F1ZA 1TBXA 3I33A 1USTA 3P4IA 1X9JA 4GYGA 4BVPA 1P2FA 1NWKA 3LFKA 3E6CC 5BRHA 1RDWX 3C0BA 2OA4A 4RB2C 5JICA 2E20A 3F3XA 4CZLA 1K79A 4HDVA 2P4WA 2P8TA 4FPBA 5LEJA 3QBWA 2PQ8A 3M8EA 1JCEA 1BC8C 3OHRA 3K1NA 1MKMA 4OMYA 1MGTA 3LAPA 4B8XA 5E1WA 4P96A 3TO9A 2E1CA 4FPAA 3K1MA 4M74A 3R61A 1LNWA 3ABUA 2QWQA 3H1VX 3U2RA 4BRHA 3FX3A 5AQFA 1J75A 3CDHA 4PGGA 4K42A 3TDUC 4KIBA 3ML6A 5K5RA 1Z6TA 3REOA 2KJBA 4NHJA 2XRNA 2J4RA 2H94A 1NGJA 4BGAA 3DAWA 3I59B 3WE3A 5ICGA 3L6QA 5DEQA 4HV6A 2CSOA 1TTYA 2YJFA 2YHYA 3GEZA 2IW5A 4GCVA 4WXCA 3VEWA 3HSRA 3Q9VA 4UVCA 3O1BA 1D4XA 2A61A 1HW1A 3I58A 4MGRA 2A3ZA 1J59A 2Z9OA 3WQTA 3D7EO 5AQTA 2E7XA 1R22A 3V7RA 3U9ZA 4LB5A 2P5VA 2PJPA 2ASMA 3R60A 3WXIA 5AQIA 1WQ2A 4JAXA 3COAC 4IHTA 4WQ4C 3FE1A 3ZN1A 3W0LA 5AQQA 3F72A 5FD6A 2VBYA 2M45A 5LJWA 2GA2A 2QWPA 2QENA 4H5RA 5ADXH 4K25A 3DKWA 3ZMSA 2NNNA 3HRMA 1GXQA 1KU9A 3HRUA 3FZLA 2O03A 2ITMA 2YJEA 4HAMA 4GYIA 2K86A 2DAOA 3MN6A 3VEVA 5KVRA 3U9GA 2QQBA 4BRLA 1K78B 3LM9A 5DCMA 3O3KA 5IT9Z 1QQMA 3MDQA 3H46O 2PMUA 2XHKA 3MZHA 1YS6A 2VBXA 4CHUA 4K41A 5FFZA 2KRFA 3B73A 3KP7A 1FBQA 4IJAA 3FHZA 5FPDA 2A69F 2YU3A 5LHGA 4BC5A 1U3EM 3E6BA 1B4AA 3J8AA 3M3ZA 2YSRA 3ZP5A 4L9TA 3LSTA 4OINF 5L3BA 1NHAA 1BOTO 3HOSA 3SLCA 1RUNA 3EDPA 3H3OB 4HLYA 5HS7A 3VEOA 3KE2A 5DCFA 4BVOA 2Q2RA 2MBFA 4ZYHA 3H6EA 3SK3A 1CZAN 2R7FA 3AAQA 5F64A 2C6YA 4HLXA 3VGLA 4L5JA 4PKIA 5L3FA 4I6MB 4H0YB 5LJVA 3I0TA 3ZMZA 5D6EA 3WTUC 5EEHA 3AAPA 1ZXOA 1NGAA 3GYHX 2IT0A 3Q5FA 4A0ZA 1IZ1A 3RDIA 3WTYC 5HLIA 5E1ZB 3NRVA 4PDKA 4KT5C 3K69A 1YIOA 5BPDA 5BPIA 5D4RA 1XSDA 4MO5A 3SMPA 1AWCA 3E6MA 1ZREA 3CJ7A 3BPXA 3BP8A 3HI0A 3LQRA 3FF5A 3RJPA 1XGOA 3C3WA 4NB5A 4R1HA 1NGDA 3KCCA 1NGFA 4YFXF 4LGWA 2E1NA 2CGKA 4A0XA 1R1TA 2MLKA 3A8YA 2F2EA 3GE1A 4H0EA 2RQPA 4PCQA 2W40A 2GQQA 4A12A 1ZBSA 3GF2A 2EA2A 4BAYA 5LLQA 4EFHA 1ZGAA 4CO8A 1ZGJA 4G7HF 4KIFA 1B6AA 1V4SA 2QZ8A 1KU7A 1NGBA 3WTXC 1LDJA 2L4AA 2DI3A 3IC7A 1GLJO 5AZIA 2XAGA 3TOAA 4G94A 5BQTA 2RKHA 2IRFG 3CJCA 1EV7A 3IDHA 1G3WA 2IVMA 5BR9A 1KU3A 3DFGA 2QWWA 2O61A 4BR7A 4DHYA 4UV9A 1FZPB 3VB2A 2WWYA 2AXLA 3MAJA 4KYWA 3CUQC 1U78A 5IT3A 3JAMK 1DKGD 4N9HA 5AIPA 4KN7X 5D5XB 4P9UA 5LGTA 3DXKB 3R6MA 4FWRA 4M63C 4O8KA 1OYWA 3G3ZA 4XH5A 2MA3A 3A5LC 1OMIA 3QDKA 3BJ6A 3T8RA 5D8LB 1W7PD 5D4SA 2HWVA 4BHCA 4AVPA 2FQ3A 1L0OC 4LMYA 3J7AO 2IP2A 4MEYF 1TYQA 3WXLA 4HBLA 1SQKA 3H3ZA 4YFKF 5E84A 2HZTA 1TNTA 3H45C 3CQYA 2I7NA 2V1XA 5AQKA 2F5CA 1Z05A 1MWMA 3TDZC 4I09A 2FSNA 3DXMB 4RS8A 5E20A 4LD5A 1W7PA 3J80Z 2G9WA 4IVNA 5JI6A 3ZMUA 1T6SA 5DDGA 2KIMA 4S04A 2Q0UA 3WGIA 4ZYEA 4CZEA 5CVRA 3J81Z 3ZMDA 1HPMA 4EJTA 2PN6A 3L2CA 2M8EA 5CE3A 2ZMEA 1MJAA 2H6CA 4WX9A 1S3JA 3UKUB 1IRGA 3TKYA 4EJUA 1BA0A 1QZ5A 3D2EB 4JHDB 2E7WA 5BRFA 4UVBA 4RB0A 4Y17A 5KK1A 4U0YA 4HYEA 2O8XA 4LJZF 5FLXZ 2R3SA 4JD2B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RCH A;  2GWR A;  3IKT A;  2F9W A;  1J0R A;  3UKU A;  1ZRD A;  2WV0 A;  2HTS A;  4KFC A;  1KU2 A;  5E1X A;  2ZNY A;  3OV8 A;  4LK0 F;  5AZI B;  4Y13 A;  3D2E A;  4JHD A;  1P4W A;  2VE8 A;  4L0Z B;  1HKQ A;  5FLX K;  3FXQ A;  6PAX A;  3QRF F;  4H5N A;  3E5U A;  4KBO A;  3A0I X;  2M1B A;  4JD2 A;  4YDU A;  3N97 A;  3CJN A;  4AIK A;  3O08 A;  1SMT A;  2VXZ A;  2FF4 A;  5CVJ A;  4E70 A;  2FRH A;  1BIB A;  1WI9 A;  4EIA A;  5BN9 A;  4BRE A;  1XDS A;  4H5T A;  3HZ6 A;  5AON A;  3ZX0 A;  1KAX A;  4HF1 A;  5AQW A;  2D1H A;  2GTD A;  3H3U A;  3MMV A;  1XUP O;  2IVP A;  3I8B A;  3W3D A;  5KPZ A;  2HOE A;  3A5N C;  1SAX A;  1CF7 A;  2Z99 A;  1BDG A;  1TYQ B;  2XUB A;  2HGC A;  5DUI A;  4B1Z A;  3K2Z A;  1BO5 O;  4QS9 A;  3JTG A;  4XH4 A;  5A2Q K;  4Q4Z F;  3WU1 B;  5LEK A;  1Z9C A;  4H0X B;  1IN7 A;  2JPC A;  1GHC A;  4H0O A;  1O3T A;  2JTV A;  3RTR A;  4HF2 A;  2Q31 A;  1W7P B;  2RNJ A;  1KA8 A;  3SJH A;  3CER A;  3ZMT A;  5ICC A;  2QW9 A;  2M5W A;  3M6G A;  1FT9 A;  2Z3Y A;  3I4P A;  4J8F A;  2EV6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4Z2Y A;  3H0G J;  1HKT A;  4M72 A;  4DTU A;  4ELT A;  5T7B A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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