4IJAA

Structure of s. aureus methicillin resistance factor mecr2
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
377
structure length
363
Chain Sequence
PMNDNEKRVLREIYNHHNISRTQISKNLEINKATISSILNKLKYKSLVNEVGGGRKPILLKVNHLYGYFISLDLTYSSVEVMYNYFDGNVIKHESYDLPDEKVSSILSIIKKHIDIQEKLDTYNGLLGVSVSIHGVVDNEQHVTYGISIAKKIKEITNVPVVVENEANLSALYERNFNHNLSYNNLIALSIHKGIGAGLIINNQLYRGANGEAGEIGKTLVSKVSDNVEIFHKIEDIFSQEALLHNLSNQLNEKMTLSKLIQFYNEKNPVVVEEMEQFINKIAVLIHNLNTQFNPNAIYINCPLFNEMPEILEAIKNQFKQYSRNEIQIKLTSNVKFATLLGGTLAIIQKVLQINDIYLDIKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-Function Studies of the Staphylococcal Methicillin Resistance Antirepressor MecR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule keywords XylR protein
total genus 128
structure length 363
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
A PF01047 MarR MarR family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 4ijaA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ijaA03
3JSPA 3PFIA 2F5CA 5LJVA 1D8KA 1TW2A 4A0XA 5EX5A 2NNYA 2E20A 3F22A 3NEUA 2FMYA 4I7HA 2P9SB 2AP1A 2L54A 3EYYA 3SXYA 3KLNA 3SHFA 3C1DA 4BHPA 1DUXC 1R58A 4LFUA 3ZMDA 1YIOA 1YW7A 1HPMA 2QQAA 3P4IA 2CGPA 4MO4A 3KLOA 4C23A 3T5XA 4AM7A 4FT8A 3CJ9A 5J6XA 2BEOA 3WU0A 3FZMA 1NGJA 3OHRA 5LHIA 1GLFO 3IKVA 2A5XA 4H5TA 5AQVA 3RI4A 3BJAA 1QQIA 5CVVA 5A2QZ 1OYYA 4LGWA 1TYQB 2GWJA 5DUKA 1Z9CA 3VOEA 5JHUA 4PGHA 3O4WA 2Z3YA 1DPRA 1S6LA 1UCRA 3IWFA 1R7JA 4KMUX 2ITMA 1JXSA 3MN6A 2CFXA 2V52B 2YI1A 4Y17A 4JAXA 3V7SA 1T2KA 3L6QA 3MK6A 1TNSA 4B1WB 3D0SA 5CVRA 2QWRA 1A04A 1SD7A 3EL2A 2FSKA 3QFPA 4BHBA 3UKRA 3QMLA 5ICCA 4KMFA 1X9JA 4FL9A 2I7PA 2BGCA 3DQVC 1B9MA 4KN7X 2M45A 3DXJF 1MJ9A 2P9KB 2F5EA 3R60A 4CHUA 3CJCA 2PN6A 5FLXK 2MH9A 1X3NA 4YFNF 1V3FA 4KIGA 2PEXA 4EMSA 2H94A 4P96A 3VEYA 1MD0A 1XGOA 1NGCA 3AAQA 2NLXA 2IP2A 2LKPA 1BOAA 2W85A 2FBKA 5KQ8A 1SZ2A 4I0BA 2VE9A 1CZAN 4ENMA 3L09A 4O5FA 4QS7A 3W3DA 4DQ8A 4CZJA 1KQ0A 1HKGA 4G94A 2K27A 1IN7A 5FPMA 1T44A 3VF6A 1JE8A 1QZZA 1QO0D 3FHZA 2EA2A 5ADXH 1ZG3A 3F8BA 3RDIA 1RFQA 2W24A 2VODA 1E2XA 1NGFA 1J6ZA 2HGCA 2HTSA 5LBQA 3OOPA 3TPQA 2BTFA 3VEXA 4P5OA 3L7WA 2ZWHA 1IAWA 1T98A 1ZREA 2XVCA 4KNYA 1S3JA 1MKMA 2XAQA 3B73A 3HSFA 3QB0A 4A12A 4RWTA 2GZWA 3CJAA 3VGKA 5JLFA 3LAJA 3ML6A 3ULEB 4BGAA 3JAMZ 5AQGA 3RSEA 4CJ7A 2GXBA 1EH6A 1H9GA 3GEZA 5KK1A 4BXUA 5E20A 1SFXA 1USSA 4ISGA 3T8RA 3L2CA 5DUIA 3O1BA 3R0AA 4CZIA 1AOYA 3GWZA 3J8AA 2P6TA 2D2WA 4IRGA 5LHGA 2A3ZA 1TQIA 3BJOA 3HRMA 3F8CA 3FWEA 5BPNA 4M73A 4M9XA 5AIQA 2CWEA 3E6DA 2DQLA 1ATRA 4XH1A 3CHWA 4A2AA 1MWKA 4KN4X 1D4XA 4GY2B 2IRFG 2IA2A 1FBUA 2ZJ2A 1R5GA 1KAYA 1ZG1A 3ABTA 2E7WA 2A41A 4WX9A 3KP2A 2H6BA 4B1UB 5D5VB 1ESVA 4Z2YA 3D7EO 1SFUA 2CH6A 5CYVA 4FPAA 3D5LA 1U3EM 2KJCA 2Z99A 1IN6A 1KYZA 1PP7U 3KEQA 2JSCA 2QWWA 4GYIA 1S22A 2MC3A 1USTA 2E8AA 1ATSA 3U4LA 5HDGA 5AQJA 3SMSA 2Q1NA 2P9UA 4BC5A 5E17F 3GFLA 3EN9A 2L3DA 3JS6A 2MA3A 1J2XA 4EJUA 1HKBA 4XEIA 5ILSA 5AIPA 5E26A 4Z94A 2VE8A 3A8YA 4A0YA 2VT2A 2QUFA 4EGYA 2HQRA 5BREA 4M6XA 4GGGA 3GZ6A 3G3ZA 5J8CA 1HLUA 3KZZA 3TDUC 3IUCA 1MZBA 3KFWX 1HSJA 5D8LB 3MFKA 4PL7A 1MGTA 3WE2A 5ICGA 3RSEB 3VEZA 5FPDA 4OMYA 4O8KA 4CZLA 2ZMEA 2BUPA 2GAUA 1R00A 4EHUA 3SMPA 1BA0A 1UB9A 4BC4A 3H3NO 2W41A 3VF2A 3GG4A 5JFRA 2KKOA 4BNCA 3W6JB 2KJBA 1W5TA 5LEKA 5DCMA 4BG8A 1XSXA 3ZMTA 4RGUA 4U0YA 4EGZA 4I6MA 3GL1A 3C3WA 5AQTA 3WTSC 3ZEUA 3DPLC 2XKPA 1P4AA 1NGIA 5KPZA 2A42A 4J8FA 3HOSA 3I54A 4Q5SF 4S05A 2C6YA 4FWLA 3VF4A 3O6BB 4LB6B 4HLXA 1KYWA 1XMAA 3HRUA 1RDWX 1QQNA 4GO1A 2FRHA 3CO7C 1BU6O 4YFXF 2GA2A 3MN5A 1OYIA 2VONA 4FWOA 5AQNA 2V1UA 4U0VA 2P9NB 2KIMA 1BDGA 2QW9A 3UB5A 4XSZF 4IPAA 2YHXA 4XSXF 5AQPA 1B9NA 1R1TA 1XC3A 2R7FA 3VFZA 2IVMA 1ZYRF 2G9WA 3HTVA 2BBYA 4OIRF 1K78B 5LGNA 1FSHA 2W57A 3M8EA 3GYHX 4ISEA 5BR9A 4QS8A 5TRDA 3HTSB 3RTRA 3V7CA 1EH7A 4AD9A 2D1KA 2B0LA 5JI6A 2DPDA 3QFUA 5AR0A 2V7YA 2Y48A 1HBXG 3M9AA 1W7PD 5BQTA 4B1XB 4GXOA 3J80Z 2HFHA 4RB2C 1ZGJA 4IRHA 2P6SA 2QVOA 3JW4A 5HLIA 3FXUA 5E1XA 4YG2F 5F1XA 1D5VA 3CI5A 1MWMA 3IL2A 2Z5UA 4PCQA 2L4AA 1I6XA 1TBXA 3I59A 3F6OA 3IWZA 2ESHA 3FGUA 4LMYA 2DTRA 4WWCA 1S7OA 1DKGD 2FNPA 1WWXA 2ZO4A 4H03B 3A5LC 3SFZA 4EM1A 2IIRA 1R1UA 5DCMB 3O8MA 2CO5A 3VEWA 2HTJA 4AIJA 4UVBA 1U5TA 5AQUA 3QP5A 5FPNA 1HKCA 3R6MA 1JCGA 5LHHA 4DNCA 5EEHA 3T8TA 1FX7A 2A6AA 2CQKA 4BRDA 4RB1A 2QBYA 1KAZA 3BUZB 3KP3A 3I5UA 3JSOA 2O61A 1I1GA 1SD4A 5BN9A 4OIOF 3LSTA 1XGNA 5BN8A 4UXNA 4BRFA 1J5YA 1KU3A 1FY7A 4ESFA 1C0WA 2PMHA 1ZARA 4BRAA 5HS7A 3IFRA 4HAMA 2XV4S 4B1YB 4GNIA 1ON1A 2EFNA 4MHGA 4HOBA 4LLNA 4O3MA 2EB7A 5H20A 4M6YA 1C0GA 1FBQA 5HVQC 5K5RA 3I4PA 3DXMA 2QXLA 4OOIA 3GW2A 2V6CA 2XAGA 2PMUA 3W0LA 3HSCA 2FU4A 4B09A 3LQRA 4HX8A 1C0FA 4JN4A 3WTUC 2ZNYA 1G4DA 3LDOA 2ZFWA 3SK3A 5ELZA 2NRAC 3COAC 4IHTA 1GHCA 2XAHA 3I71A 2P4WA 1HW1A 2EFWA 3ZMSA 3LM9A 2QM1A 3HI0A 1YXQA 3HSEA 4AIKA 3C7JA 4IF4A 4HV5A 2V51B 1BOTO 4A0ZA 3DV8A 1MDMA 3MZHA 3UE5A 2X4HA 2ASOA 3H3OB 3N4MA 2STTA 4P9FA 1IRGA 2E2OA 4L5IA 4CO8A 1IN8A 4CZKA 4IVNA 1BO5O 5I9EB 4AIHA 1NGGA 3HOTA 1XSDA 4RB0A 4IJNA 1FOKA 3CUOA 1XGSA 2PAVA 1F4KA 2QWMA 1TQMA 1ODDA 3I8BA 3WQTA 3P7NA 2A07F 2FBIA 3E6CC 1FYMA 3O80A 2KIUA 2WTEA 1LOTB 2HKXA 1WSUA 1U2VA 1J7KA 2QBYB 1KQ9A 2HWVA 4FWNA 2ZGZA 3JXUA 5LEJA 4N9HA 3U9DA 5JVTA 2A61A 4IRIA 3A5NC 3FR0A 1K6OA 2P7VB 2HYGD 4YIFA 4K43A 5FD5A 4K41A 2DFIA 4LK0F 4H0YB 1W7PA 2DI3A 4OINF 5D5XB 4FX0A 3ATUA 1QZ5A 3LM2A 3WXLA 3F8MA 3HM8A 1EH8A 4IXCA 1FLIA 3EYIA 3T1BA 4BRMA 4IZ9A 4OIQF 4BRGA 1REPC 4F7ZA 3KEOA 3VB2A 4JHDA 4M72A 4H0EA 1BA1A 4PGGA 1LB2A 1Q18A 1U2WA 3MN7A 2GA1A 2E1CA 4NB4A 1GLDG 4UHTA 5HLHA 3RKYA 2J5OA 4L18B 2D0PA 5LGTA 4K25A 1LEAA 2AA4A 3FXQA 3H46O 5LJWA 4N0BA 1LNWA 3GX4X 1GXQA 1NBWA 2Y0MA 1QGPA 2A6HF 5FFZA 5E1WA 3ZX3A 1LCUA 4WQ5C 4I2OA 2FOKA 2GWKA 3S41A 3MN9A 5L3EA 4HLYA 1FC3A 1ZLJA 2Q97A 3SLCA 2A3SA 1QBJA 3LDNA 4H5VA 4ZZDA 1P6RA 3DP7A 4DB3A 4A5NA 1ZRCA 2VT3A 4U88A 3RPUA 1TUYA 1EQYA 1S3XA 1HKTA 4H0PA 1FWZA 3FMQA 3IHUA 3ZMVA 3EO3A 1CGPA 2HMPA 1Z6RA 5HS8A 2ZBKA 4KA4A 2KHOA 4CXFA 3R4KA 4F9OA 4WF2A 1U2VB 6PAXA 1YYVA 3KP4A 4WK8F 3QU6A 1SAXA 5HOOA 2DPNA 4BRCA 4RAZA 5DV5A 2F5FA 3NQOA 2K4JA 4BR0A 1W7PB 5D6FA 4OU0A 5E18F 2F2EA 3HZ6A 2HKOA 4B9QA 1H9TA 2CGJA 2DLLA 4A62A 3O6WA 3ZPLA 4HA8A 4EJWA 4HW0A 2NS0A 1O7LA 4Y13A 2OANA 2OQRA 5IT3A 2LSOA 4JK1X 2P5LC 1JCEA 1IZ1A 3VETA 3LFKA 4OIPF 3E3VA 3FXRA 1IF1A 2QWNA 3BF1A 2RQPA 4BH9A 3ZETA 2A6EF 2VN2A 5AQXA 3C7NA 5B8HA 1ZH5A 3D2FA 3B02A 3DPTA 3UKUA 5AQFA 3EDPA 2J5PA 1T0FA 3U8XA 4B1VA 3LA2A 5IT9Z 3ECHA 2ZXJA 1X3MA 3ULQB 1TNTA 1QZYA 2P9LA 4ESJA 3WGIA 3J80K 4ESBA 2H27A 1IG8A 4FWQA 4JD2A 4FOIA 3TO6A 5ICEA 2ETHA 3FMRA 3K2ZA 5K5QA 1FP2A 4XLPF 5AZIA 2ELHA 4HQMA 2W40A 3WE3A 3FZKA 3MCZA 2V1DA 4RAYA 2MH2A 2FF6A 3ENOA 4IXAA 1Z6TA 5AQYA 3HTUA 4I02A 2XKOA 3BDDA 1XDSA 4UVCA 2Q0RA 3UKRB 1W4MA 2OBPA 2VOPA 1RUOA 3M1FA 3GLXA 4KIBA 2FLOA 2GWRA 3VGMA 4HBLA 3AAFA 3WTTC 3ZX2A 4R8HA 3LDPA 4KDPA 2V7ZA 3Q9VA 3WT0A 2ISZA 2EFOA 3L00A 5ERIA 1NWKA 2Q31A 3F3XA 1KGSA 5DD4A 5D4RA 2Q2RA 1HKSA 1O7FA 3J81Z 3A0IX 5AZJA 4H0TB 4EHTA 1B6AA 2MD5A 5CVUA 3HHHA 5BMZA 4RCHA 3MAJA 1UHWA 1O3QA 2HQNA 3WGHA 3WUHA 4M9SA 5LRSA 3ELKA 2AS5F 2KIFA 4FWPA 2HF3A 2YU3A 1E4GT 3NRVA 3U2RA 5CJ9A 1I1SA 1PP8F 1HQCA 2VWBA 4ENKA 3TO7A 1SAZA 5BS6A 4BQLA 1U8RA 1HW5A 2Q36A 1KQ8A 3WGGA 5ADXA 1ZGAA 3C7NB 2UZKA 2VYPA 2RN7A 3D2FB 3C18A 1U78A 3KETA 3KVGA 5AFUH 1ON2A 3FF5A 4BR4A 3QDKA 2R7DA 1T6DA 2LF8A 1OMIA 3PQKA 3CQXA 5F2RA 3E5XA 4U0WA 2E1NA 1JGSA 3DFGA 3V7RA 4JD2B 1HJOA 3BF3A 3GBTA 1YFHA 1ZG5A 2I7NA 2NZTA 5AQRA 2O03A 3V4GA 5JR3A 2ACJA 3CUQA 4IWVA 3TGNA 4BC2A 1KU2A 2IVOA 2IVPA 2QM3A 4L3QA 1RUNA 2FXAA 4DQ2A 4HZFA 1IJJA 1HW2A 5AQOA 3FM3A 2O0YA 4UV9A 2P7CB 1H1VA 2COMA 2VBYA 1G3TA 4OMZA 3MQ0A 2QWQA 2JPBA 4BROA 1YW8A 1SMTA 4I98B 3HBTA 3KCCA 4LB5A 1FT9A 3M3ZA 4MO5A 4WCGA 4ISFA 2JZYA 4EJTA 1CF7A 2PBDA 5J8FA 4M63C 3WTYC 3IRQA 4FWSA 2JTVA 1OR7A 1YO5C 2Y75A 4A6EA 5BPIA 4ZYHA 3RIRA 4XH5A 3QU3A 2ASPA 2P9IA 2P5KA 4I01A 2JPCA 5AZJB 3FLCO 4HX4A 1O3SA 5FLXZ 3H45C 1S8NA 1YLFA 3EKSA 3ABUA 1RIOH 1G3WA 1XN7A 1XB4A 1WI9A 2P9UB 3BY6A 2YHWA 4BHCA 3MCPA 5AONA 2HZTA 4FWRA 1W5SA 5KPRA 1K8KA 5BOXA 1LDJA 3FMSA 1E4FT 2CGKA 3GZ5A 4KIFA 5CE3A 4YDUA 4EJVA 3MZYA 4KICA 5AQIA 4G7HF 1QPMA 1V4SA 4CZHA 3ZQ7A 3JTHA 4L0ZB 4HTLA 1NHAA 5EOYA 3F21A 2R3SA 5FGMA 5ILUA 3HUGA 5A2QK 1KU7A 1FYLA 3EZWA 2LDUA 3IKTA 1NLVA 1BC7C 2ZMEB 1F5TA 3B8AX 1FP1D 4AVPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3JSP A;  3PFI A;  2F5C A;  5LJV A;  1D8K A;  1TW2 A;  4A0X A;  5EX5 A;  2NNY A;  2E20 A;  3F22 A;  3NEU A;  2FMY A;  4I7H A;  2P9S B;  2AP1 A;  2L54 A;  3EYY A;  3SXY A;  3KLN A;  3SHF A;  3C1D A;  4BHP A;  1DUX C;  1R58 A;  4LFU A;  3ZMD A;  1YIO A;  1YW7 A;  1HPM A;  2QQA A;  3P4I A;  2CGP A;  4MO4 A;  3KLO A;  4C23 A;  3T5X A;  4AM7 A;  4FT8 A;  3CJ9 A;  5J6X A;  2BEO A;  3WU0 A;  3FZM A;  1NGJ A;  3OHR A;  5LHI A;  1GLF O;  3IKV A;  2A5X A;  4H5T A;  5AQV A;  3RI4 A;  3BJA A;  1QQI A;  5CVV A;  5A2Q Z;  1OYY A;  4LGW A;  1TYQ B;  2GWJ A;  5DUK A;  1Z9C A;  3VOE A;  5JHU A;  4PGH A;  3O4W A;  2Z3Y A;  1DPR A;  1S6L A;  1UCR A;  3IWF A;  1R7J A;  4KMU X;  2ITM A;  1JXS A;  3MN6 A;  2CFX A;  2V52 B;  2YI1 A;  4Y17 A;  4JAX A;  3V7S A;  1T2K A;  3L6Q A;  3MK6 A;  1TNS A;  4B1W B;  3D0S A;  5CVR A;  2QWR A;  1A04 A;  1SD7 A;  3EL2 A;  2FSK A;  3QFP A;  4BHB A;  3UKR A;  3QML A;  5ICC A;  4KMF A;  1X9J A;  4FL9 A;  2I7P A;  2BGC A;  3DQV C;  1B9M A;  4KN7 X;  2M45 A;  3DXJ F;  1MJ9 A;  2P9K B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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