2HOEA

Crystal structure of n-acetylglucosamine kinase (tm1224) from thermotoga maritima at 2.46 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
359
structure length
354
Chain Sequence
ISRILKRIMKSPVSRVELAEELGLTKTTVGEIAKIFLEKGIVVEEKDSPRPTKSLKISPNCAYVLGIEVTRDEIAACLIDASMNILAHEAHPLPSQSDREETLNVMYRIIDRAKDMMEKLGSKLSALTVAAPGPIDTERGIIIDPRNFPLSQIPLANLLKEKYGIEVWVENDADMGAVGEKWYTKRDDSFAWILTGKGIGAGIIIDGELYRGENGYAGEIGYTRVFNGNEYVFLEDVCNENVVLKHVLSMGFSLAEARDSGDVRVKEYFDDIARYFSIGLLNLIHLFGISKIVIGGFFKELGENFLKKIKIEVETHLLYKHSVDMSFSKVQEPVIAFGAAVHALENYLERVTTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of N-acetylglucosamine kinase (EC 2.7.1.59) (TM1224) from Thermotoga maritima at 2.46 A resolution
rcsb
molecule keywords N-acetylglucosamine kinase
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
total genus 91
structure length 354
sequence length 359
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2hoeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hoeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hoeA03
4H5NA 3BUZB 4A0XA 3LQRA 1HUXA 5CVIA 1CF7B 2Q8KA 2ZBKA 3HSEA 5L3EA 1MZBA 1O3RA 1HKBA 3SQNA 4ON0A 2K4BA 3G25A 3FMRA 2XAHA 3TGNA 1LVAA 4CXFA 3CO6C 1GLCG 4ISGA 2HFHA 1NGEA 2HF3A 2E1YA 3RTRA 4P9UA 2QVOA 3ENOA 1O7FA 2PEXA 3ZPLA 4OU0A 2OAZA 3WXJA 4ENNA 3SLCA 5BMZA 2E7WA 1NGJA 4OIOF 4CBUA 2P7VB 2DQLA 5EOYA 3H45C 2HTJA 3V8JA 2ZF5O 3LAPA 3C0BA 3GOIA 1NLVA 4NHJA 4BR5A 3JW4A 4HF0A 3A5LC 3U9ZA 1J75A 4CGZA 2EFQA 3HUGA 1TQMA 4AM7A 1U2VA 4MGRA 1IN4A 4S04A 2BBYA 1NGGA 4CZIA 3I0TA 2IRFG 3DV8A 4K41A 4R8HA 3CO7C 1YW7A 3QFPA 3UKUB 2KIFA 1HX1A 3E6MA 3HTSB 2KIMA 2CO5A 2W57A 3ZX3A 3U9GA 2VBYA 1XC3A 4DNCA 2E88A 1IZ1A 2H3GX 3SMSA 3DQVC 4MEXF 5DDGA 5ADXH 4RB2C 1J59A 4IWVA 1TYQA 2HDCA 4GY2B 4QLCU 3O5BA 5LGNA 1K6OA 5FB2A 2OQRA 3MN7A 4NQWA 2EFPA 1ZBSA 3BPXA 3KP6A 3ZMSA 4K43A 2UWMA 4EGYA 5F6FA 5D8LB 1IG8A 5I9EB 1ZXOA 2HYGD 2HWVA 2K7LA 2NLXA 5LJWA 3KFWX 5ELZA 4B1XB 1IW7F 4BRKA 2D2WA 4M7XA 3DAWA 4OMZA 3BWGA 2DPDA 3GFJA 2CFXA 4AIKA 3VEPA 2YSRA 4AIHA 4BGBA 3I54A 1FPQA 4LMYA 2XAQA 5E18F 5J6XA 1U6GA 5LBQA 1WOQA 3DJCA 2QM3A 3WTYC 2FF4A 2L4AA 4M6YA 2NRAC 1QZ6A 5FFZA 3GF2A 1BN5A 1BG3A 3KP5A 1XUPO 1IN8A 1DPRA 4L0ZB 4U0VA 3E97A 3GFIA 3U2RA 2YR2A 3V7SA 3KVGA 2WWYA 1WSUA 2GZWA 3HTVA 4LJZF 2XAFA 4G7ZF 2PLYA 1RDWX 1BUPA 3ABUA 1DDNA 3NQOA 2GWKA 3Q9VA 4RB1A 3IFRA 4XSXF 5AQIA 4WQ5A 2OQGA 3V4GA 1W5TA 1DP7P 2VOPA 3LDOA 5J8FA 1HKCA 3GL1A 3VOVA 2BE5F 1OPCA 1G3YA 1ZGJA 3T1BA 4A6DA 3ID8A 4BR7A 4WXDA 1HSTA 4I7HA 3KEOA 1BU6O 2PFBA 2YPRA 2ZGZA 3KZYA 3WU1B 3L2CA 1FSEA 2V7YA 2ESNA 1TQPA 3RSEB 2HR3A 1WKMA 2FNPA 1OYIA 3VFZA 4WQ4C 4KNYA 3I53A 2VC1A 5JHUA 1Q1HA 5FPDA 2RVCA 5H20A 1YS6A 4LFUA 1ZC6A 3LAJA 1HLUA 3VF2A 3BEXA 4BC4A 3ZMDA 1H0MA 4KMFA 1BWFO 1SZ2A 1XSXA 4BRIA 3HRUA 5AQQA 4LGWA 4NB4A 1YVNA 3D0SA 3VEOA 4IZ9A 2I7PA 2Z3YA 4EIAA 4O5VA 1KU9A 2ZNYA 1YO5C 1HW5A 4EJOA 4CZKA 3E6DA 4RAZA 4I6MA 1DUXC 1MWKA 3LDNA 2CWEA 4CZZA 3L4IA 1YW8A 4BYYA 1D4XA 3TO6A 1B6AA 2QQBA 3CJBA 3KP7A 2NRHA 2VC0A 3BDDA 2Y75A 1G99A 2ELHA 2CG4A 4A2AA 1F4KA 5E1WA 3IWFA 3E5QA 3M1FA 4HV5A 3FM3A 2V1UA 2IIRA 4A2UA 2A3ZA 2A68F 2L54A 3WEEB 4BRMA 3A5OC 3QICA 4FWPA 4UUVA 5E26A 2UXNA 5AIPA 3MFKA 4A5MA 2MH9A 5AQUA 4A62A 4G7HF 3GYHX 4I6MB 3RKWA 3CQYA 4Q5SF 3ML6A 2ISZA 2ZJ2A 5JFRA 4NB5A 2W40A 3I33A 5JMVA 2GQQA 1ZN2A 1X3NA 2M5WA 3V7CA 2GUPA 3DXKB 2A61A 4RGRA 3KEQA 2DTRA 3KHYA 3Q5FA 3IKVA 2V51B 1XDUA 3FE1A 2E8AA 4BHCA 3COAC 2JPCA 3ZX0A 3M9AA 5LJVA 2DPNA 3A8YA 2PJPA 1SMTA 2VN2A 4XH5A 4LD5A 3SZPA 3SMPA 2K86A 1QQMA 2QQ9A 4HX7A 1BIBA 4HWIA 5EEHA 2AS5F 5FFXA 2XROA 4I98B 2UYTA 1XGOA 4I02A 1YS7A 3T5XA 4WX9A 2CQKA 3WODF 1RIOH 1U8RA 1Z1DA 1REPC 2FF6A 1Z9CA 4RWTA 2G9WA 1PUEE 1O3QA 3UKRB 1W7PD 4CYDA 2TDXA 2FMLA 1JHFA 2GIVA 2Q97A 2LNBA 1KQ0A 2MLGA 2E1CA 2ASPA 3F22A 4KT5C 2KJBA 3WGHA 2LDUA 1BI3A 4M7YA 4YIIA 4IJNA 4CBXA 4KA4A 4QWQA 5ICEA 1SFEA 2KRFA 3TDZC 1S3XA 2ESHA 3LSTA 1Y64A 3FGUA 2XAJA 3VENA 1ZRFA 3BROA 2JZYA 1IN6A 2DPUA 2E2NA 1T6SA 4FWOA 1XD7A 4KMUX 1RZ4A 4ETSA 3L0QA 2M1BA 5BQTA 3AY9A 3C7JA 1BO5O 5AQKA 1XDSA 1CGPA 2MH2A 2DK5A 2XHKA 3F3XA 5L3FA 5HS8A 3M8FA 4HAMA 3T8TA 5AQFA 2DW4A 3VEYA 2QWWA 2XIGA 4EV0A 3FX3A 3D7EO 3MN5A 2ZXJA 1EV7A 4DQ2A 4O3MA 3O1BA 2BGCA 3E6BA 4I09A 3HZ6A 4FSVA 2W25A 4B1UB 2P9UA 1OYYA 2DK8A 2K27A 3HRSA 4ASNA 2PI0A 4FL9A 4OIQF 3BP8A 1R1VA 3EL2A 4WF2A 1SD6A 5B8HA 5BPNA 1NGHA 2V52B 3VEZA 1LCUA 2FOKA 3QPTA 4P96A 4BNCA 3I64A 2QWQA 3LDQA 2FE3A 4ZYHA 2K02A 1LJ9A 3BZ6A 5LRSA 1MGTA 4IF4A 4AWXB 1MJAA 3K1NA 1KAZA 1IF1A 5F1XA 3B73A 4LK1F 3HSFA 2PN6A 1XN7A 2VWBA 2ETHA 4UVAA 1TUUA 3GWZA 1SFUA 2YJFA 3BJ6A 4KN7X 2O8XA 1YIOA 3WG9A 3K1MA 3MQ0A 2BUPA 1SMYF 3VOEA 1PDNC 1LOTB 2P9IB 4PCQA 3FXRA 4GCVA 3KE2A 5D4SA 3ZMUA 5JI6A 2PQ8A 2P9PA 3GUDA 4H5VA 4HDVA 4P9FA 2A07F 1T39A 4N9HA 3EZWA 1ZREA 4CD3A 3IC7A 5AQLA 4U0YA 3IRQA 3K0LA 4L0YB 2VOOA 3KZBA 2OZUA 2CGLA 1LNWA 5CYVA 4EHUA 3ZEUA 4HTLA 2OANA 2FXAA 5DD8A 5TJJA 1FYMA 1ZRDA 4GYIA 3W3DA 1U5TA 1SAZA 2QW9A 2L4MA 3DPTA 3S41A 2GXGA 4LLGF 1XMKA 2STTA 3D2EB 1KGSA 4FO0A 2RDPA 2BYVE 3ZX2A 5AZJB 3KLOA 2VBXA 2HKOA 4PKGA 3HHHA 4U0WA 3OV8A 1BI0A 5JVTA 2VBZA 4ZYGA 1TNSA 2AP1A 4E70A 1IXCA 1GVJA 2ZCWA 4FWQA 4Y0WA 4WWCA 1LDJA 3QP5A 1S7OA 1U5TB 1J9IA 2QBYB 4JHDA 4H0OA 3HOTA 3V7RA 2F5EA 1FYLA 4Z2YA 2BV6A 2FA5A 1ESVA 1TLHB 2Q0OA 2NZTA 4O8KA 4UHTA 1BBYA 4OOIA 1ZYRF 3F8CA 2EA2A 4BQAA 2EV6A 5K5QA 2ASOA 2F9TA 1V4RA 2YCHA 4Q4ZF 3EYYA 1G3TA 5LGUA 3GEZA 2VXZA 6PAXA 1ZLKA 5E84A 2D0PA 2DU9A 2IA0A 4OIRF 1QPMA 4Y13A 1H9TA 3ULEA 3LWFA 2XVCA 3R6SA 4JBAA 3TO7A 5HDGA 1KAXA 2WV0A 4H5WA 4G6QA 1OMIA 1HSJA 1QO0D 4M6XA 1BM9A 1OR7A 3HBTA 2H09A 4F7ZA 5KPTA 5E1XA 1FNNA 3JXUA 3H3UA 3RIRA 4BC5A 2F5DA 3CTAA 1D5VA 5ED4A 3GZ6A 3CHWA 3F21A 3C3WA 2YX7A 3H92A 3OOPA 4KBOA 5CE3A 4B1VA 2IW5A 3LQQA 1XSVA 1T98A 1C0WA 3ULEB 3I58A 1IN7A 2P9SA 3RKXA 2EV5A 3Q9SA 5LHHA 3SHFA 2FLOA 3FMQA 4XSZF 1JXSA 3RI4A 4BREA 4MO4A 3ZP5A 2STWA 1XGMA 3TDUC 5F0XA 4YIFA 5LY3A 4EJUA 4CD1A 4I0AA 2IA1A 3FM5A 2O3FA 4ISFA 2A5XA 1OYWA 3GXOA 4L5IA 3QBXA 3CJ9A 4WXHA 1ULYA 5ICCA 1ON2A 5JLHA 1X3UA 5CLSA 1ZG1A 4N9IA 3CLOA 5L3BA 3M3ZA 2ADUA 1U2VB 5AFUA 4R79A 1ATNA 3HM8A 3W6KB 1QGPA 3F8NA 2CGKA 1BJAA 1MKMA 1XCBA 3AAPA 3K9TA 3RPUA 5J8CA 3QAHA 2IT0A 4HF2A 2V7ZA 3L7WA 3W0LA 2Y0MA 3ULQB 1QZ5A 4GGGA 3LA3A 3MZHA 3QP6A 2MD5A 1R59O 4EJWA 4S05A 4L9JA 1BOAA 2IVOA 5A2QK 4BGAA 3PQJA 5AZIA 1TYQB 4IO8A 3LM2A 3BY6A 5CVUA 5E20A 1UFMA 3BOQA 4MQVA 4IXAA 3HRMA 1FZPB 3VERA 1Z05A 1KQ8A 1F5TA 5DD4A 4CZJA 1GLEG 4H5RA 1LQ1A 4G9YA 1EH7A 1YAGA 2FF3B 5FPMA 5A2QZ 2O6GE 5ICFA 1GLDG 4M73A 1USSA 4BRDA 1NGCA 2QM1A 2OU2A 3CERA 1ZLJA 5L3GA 1V4TA 1IRFA 3MN9A 3CDHA 4H0XB 1XQSC 2GEMA 4UV8A 1BIAA 4XH4A 5TKYA 4LLLA 1I1GA 2NNNA 4PGHA 2Q2EA 1VTNC 2IJLA 2JT1A 5KVRA 4OMYA 2HF4A 3WUHA 4EGZA 4CICA 1FC3A 1MDMA 4EAHD 3EUHA 5CVJA 4IRGA 4BG9A 4ENMA 2OZ6A 3OHRA 2IVMA 5D5VB 5ADXA 2E20A 3IUCA 2P7CB 5BPLA 3MZYA 5L3DA 2MA3A 4BRNA 2Z9OA 3TO9A 4Q48A 2HTSA 4UVCA 4XEIA 4BRHA 3DFGA 1KXPA 3I59A 1K8KA 4JAXA 3J8AA 2OBPA 1MDMB 1B9NA 3SZTA 2M87A 3R4KA 4HDUA 3RKYA 4KN4X 3ZMTA 5HOOA 2LF7A 3P4IA 5EVZA 1MJBA 1RUNA 1HKTA 4H0EA 2W85A 1QHAA 1X3MA 2RNJA 3CJ7A 4PZJA 1GHCA 3U8XA 1S7AA 3FR0A 4M72A 4BXUA 2JPBA 1EH8A 2M45A 3ABTA 1BI1A 3QOPA 1IUYA 3M7GA 2GWRA 3BJAA 3D5LA 4BRAA 2V9VA 4XBFA 3I59B 1K8KB 4BRFA 1S6LA 1TBXA 3KP2A 3N97A 2RC4A 2DI3A 3C18A 2P9NA 2Y48A 4WQ4A 4CBWA 4B1ZA 1J0RA 3AARA 1BI2A 3DKWA 1KU3A 1S8NA 2D1KA 1L3LA 4CDGA 4BRLA 1ZHFA 4HX4A 4FPBA 3M1EA 1TNTA 4PKIA 5BN9A 5D5WB 4ZYDA 4I0BA 4A6EA 2I7NA 1FWZA 5IT9K 2OD5A 3QDKA 1USTA 3N4MA 5BPMA 4K2EA 4L3QA 1IJJA 3WTZA 1LDKB 3HI0A 5K5RA 4RS8A 1HBXG 3VGMA 2PBIA 5BRDA 3FFKB 5E1ZB 1RFQA 5CVRA 2P6TA 2EFOA 2DQRA 3LL3A 1BA1A 3BF3A 3DWLA 3I8BA 2QYOA 3VF4A 2K4JA 1TW2A 2W24A 5IT9Z 4BRQA 3H3ZA 3R0JA 1ATRA 1H9GA 2P4WA 2XUBA 1NGDA 1KA8A 5FGMA 2EFNA 2WC2A 3FZMA 5AQYA 1UHWA 2ZO4A 5AQMA 3VGLA 1HW1A 4MNUA 2FSKA 4GO1A 3DP7A 4CZLA 1P2FA 2DT5A 4M9SA 3GVAA 1TW3A 2V79A 4HQMA 1NGBA 3D2FA 1ZARA 1S3JA 2D4WA 2FQ3A 2ZKZA 4IXCA 4BR4A 2ZNZA 2H94A 2R7FA 1WI9A 1HKSA 1D3YA 1EH6A 3WT0A 4G94A 3DEUA 4FWMA 4YDUA 4IHTA 2AA4A 1T0FA 4LB5A 1R5HA 3WU0A 5HLGA 4ENKA 1WQ2A 3VGKA 2COMA 1NMDA 3MCPA 5DCFA 1RUOA 1D8KA 4A0ZA 4B8XA 4FWNA 4CZMA 3JS6A 3L6QA 1ZG3A 1MWMA 2FBIA 3QFUA 1HW2A 2HEOA 2EFWA 4L9VA 3ZN0A 2A69F 2VCPA 4Y15A 4MTEA 4BQZA 4O6JA 5HLIA 4HLXA 1QBJA 1DGKN 4XH1A 2QWNA 5LEJA 1QNTA 3KCCA 1IN5A 2QZ8A 2Q0RA 2PBDA 3LDPA 3HHGA 3F8FA 3VODA 1MA9B 1BC8C 2YU3A 2FSWA 1IXRC 3SXYA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4H5N A;  3BUZ B;  4A0X A;  3LQR A;  1HUX A;  5CVI A;  1CF7 B;  2Q8K A;  2ZBK A;  3HSE A;  5L3E A;  1MZB A;  1O3R A;  1HKB A;  3SQN A;  4ON0 A;  2K4B A;  3G25 A;  3FMR A;  2XAH A;  3TGN A;  1LVA A;  4CXF A;  3CO6 C;  1GLC G;  4ISG A;  2HFH A;  1NGE A;  2HF3 A;  2E1Y A;  3RTR A;  4P9U A;  2QVO A;  3ENO A;  1O7F A;  2PEX A;  3ZPL A;  4OU0 A;  2OAZ A;  3WXJ A;  4ENN A;  3SLC A;  5BMZ A;  2E7W A;  1NGJ A;  4OIO F;  4CBU A;  2P7V B;  2DQL A;  5EOY A;  3H45 C;  2HTJ A;  3V8J A;  2ZF5 O;  3LAP A;  3C0B A;  3GOI A;  1NLV A;  4NHJ A;  4BR5 A;  3JW4 A;  4HF0 A;  3A5L C;  3U9Z A;  1J75 A;  4CGZ A;  2EFQ A;  3HUG A;  1TQM A;  4AM7 A;  1U2V A;  4MGR A;  1IN4 A;  4S04 A;  2BBY A;  1NGG A;  4CZI A;  3I0T A;  2IRF G;  3DV8 A;  4K41 A;  4R8H A;  3CO7 C;  1YW7 A;  3QFP A;  3UKU B;  2KIF A;  1HX1 A;  3E6M A;  3HTS B;  2KIM A;  2CO5 A;  2W57 A;  3ZX3 A;  3U9G A;  2VBY A;  1XC3 A;  4DNC A;  2E88 A;  1IZ1 A;  2H3G X;  3SMS A;  3DQV C;  4MEX F;  5DDG A;  5ADX H;  4RB2 C;  1J59 A;  4IWV A;  1TYQ A;  2HDC A;  4GY2 B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3DTE A;  2R7T A;  2BH1 A;  1W5S A;  4IRI A;  2E2O A;  3CUQ C; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 4H5N A;  3BUZ B;  4A0X A;  1VQK N;  3LQR A;  1HUX A;  5CVI A;  1CF7 B;  2Q8K A;  2ZBK A;  3HSE A;  5L3E A;  1MZB A;  1O3R A;  1HKB A;  3SQN A;  4ON0 A;  2K4B A;  3G25 A;  4C1N I;  3FMR A;  2XAH A;  3TGN A;  1NJI O;  1LVA A;  4CXF A;  3CO6 C;  1GLC G;  5JVH L;  4BY9 C;  4ISG A;  2HFH A;  1NGE A;  2HF3 A;  4A59 A;  2E1Y A;  3RTR A;  4P9U A;  2QVO A;  3ENO A;  1O7F A;  2PEX A;  3ZPL A;  4OU0 A;  3O9Q A;  2OAZ A;  3O9S A;  4ENN A;  3SLC A;  5BMZ A;  3WXJ A;  3G6E N;  2E7W A;  1NGJ A;  2RE2 A;  4OIO F;  4CBU A;  2P7V B;  3CC4 N;  2DQL A;  5EOY A;  3H45 C;  2HTJ A;  3V8J A;  2ZF5 O;  3LAP A;  3C0B A;  3GOI A;  1NLV A;  4NHJ A;  4BR5 A;  3JW4 A;  1VQ6 N;  4HF0 A;  3A5L C;  3F5T A;  3U9Z A;  1J75 A;  4CGZ A;  2EFQ A;  3HUG A;  1TQM A;  4AM7 A;  1U2V A;  4MGR A;  1IN4 A;  4S04 A;  2BBY A;  1NGG A;  4CZI A;  3I0T A;  2IRF G;  3DV8 A;  4K41 A;  1YJ9 N;  4R8H A;  3CO7 C;  1YW7 A;  5M1Q A;  3QFP A;  3UKU B;  2KIF A;  1HX1 A;  3E6M A;  3HTS B;  3OBY A;  2KIM A;  2CO5 A;  2W57 A;  3ZX3 A;  1KD1 O;  3U9G A; 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