2HOEA

Crystal structure of n-acetylglucosamine kinase (tm1224) from thermotoga maritima at 2.46 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
359
structure length
354
Chain Sequence
ISRILKRIMKSPVSRVELAEELGLTKTTVGEIAKIFLEKGIVVEEKDSPRPTKSLKISPNCAYVLGIEVTRDEIAACLIDASMNILAHEAHPLPSQSDREETLNVMYRIIDRAKDMMEKLGSKLSALTVAAPGPIDTERGIIIDPRNFPLSQIPLANLLKEKYGIEVWVENDADMGAVGEKWYTKRDDSFAWILTGKGIGAGIIIDGELYRGENGYAGEIGYTRVFNGNEYVFLEDVCNENVVLKHVLSMGFSLAEARDSGDVRVKEYFDDIARYFSIGLLNLIHLFGISKIVIGGFFKELGENFLKKIKIEVETHLLYKHSVDMSFSKVQEPVIAFGAAVHALENYLERVTTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
publication title Crystal structure of N-acetylglucosamine kinase (EC 2.7.1.59) (TM1224) from Thermotoga maritima at 2.46 A resolution
rcsb
molecule keywords N-acetylglucosamine kinase
total genus 91
structure length 354
sequence length 359
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2hoeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hoeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hoeA03
5KQDA 2H94A 1NGGA 4XRFA 4BVOA 5BN8A 2CGKA 2TDXA 3UKRA 3L00A 1IRGA 4IHTA 4M7XA 2YJEA 3HOSA 2V7YA 2GZWA 5TJJA 3J81Z 1WUAA 3H3UA 4LG0A 2KIFA 2NS0A 5AQXA 1MJAA 3GEZA 4RTFD 1D3YA 4BGAA 3RKWA 3EUHA 4R8HA 3BWGA 2RVCA 4ZYGA 4OIQF 4MO5A 2VXZA 3GG4A 5HS7A 3ZMSA 3WXJA 5HVQC 2XROA 3WT0A 1XSXA 2CH5A 1Z6RA 1NGHA 4EM2A 1ULYA 3QPTA 3WE3A 4EHTA 3J80Z 4BG8A 4M9SA 3QRFF 2A5YB 4G8XA 2E7WA 5L3DA 2E2OA 3WEEB 3SK3A 2RDPA 3I0TA 3WTTC 2DBBA 4I6MB 4LB5A 1OYYA 1T38A 1W7PA 2LKPA 4OIOF 2WV0A 5BPNA 4G6DA 3GF2A 4BRCA 2GA1A 3F3XA 2PFBA 2VC0A 3R6SA 2FE3A 1XMAA 2Q1NA 2PI0A 3QBWA 1J7KA 4A6EA 4YIIA 4JD2B 2FXUA 1R58A 2QYOA 3KEQA 1FP2A 3WXIA 3BROA 3GZ5A 2K86A 1W4MA 3VERA 2HKXA 3RYPA 1RI7A 1AWCA 1S22A 2QWLA 4ZH4F 5AQUA 3HTSB 4G6QA 4LJZF 2P9UB 3DXKA 4KYWA 4YG2F 4H0OA 3C0BA 1K78A 1GLBG 2ASMA 4CJ7A 3HSCA 3FMQA 2KKOA 3F9MA 4QWQA 1T6SA 3DXMA 1W5SA 4GCVA 1KU3A 4EHUA 1PP7U 2ADUA 1TQIA 5BR9A 4KA4A 1FLIA 4EQQA 4CZIA 1MGTA 3JW4A 4NQWA 2QWRA 4B1UB 1S7AA 4BAYA 2IA2A 1B4AA 2LNBA 3L6QA 4Z2YA 1TTYA 3ENOA 4BR2A 4IWVA 3FM5A 1RDWX 1YXQA 1NLVA 4EAHD 1S6LA 3E5UA 2R7DA 1KAXA 3ROUA 5LBQA 1GLJO 2VC1A 4GXOA 4HX4A 2BEOA 2QQAA 1SZ2A 2QWPA 4BYYA 4FL9A 2EA2A 2FXAA 2RQPA 3ZEUB 2RGVA 3ML6A 4UVCA 2F5EA 4MLHA 2GIVA 5BREA 4A6DA 5ED4A 2MH2A 2VBXA 3CTAA 4HF2A 5FB2A 4FWKA 1DPUA 3I54A 4WQ5C 2JPBA 5BN9A 1OPCA 3GFJA 4CBXA 3KLOA 4CXFA 4CZZA 3KZBA 1P4AA 3GUDA 1YW8A 4ZZLA 3D2EA 2GEMA 3HI0A 3WTSC 5BMZA 4L18B 2M8EA 3EYIA 3BDDA 2XKOA 2ISYA 2W85A 2VN2A 1YUWA 3EZWA 2QBYB 3H45C 1F1ZA 2FBKA 4ENMA 3GX4X 1NGDA 2D1KA 4H5VA 3O4WA 4RS8A 1GLCG 1K8KA 4Y17A 1BA0A 3S2WA 1TLHB 3BY6A 1G3SA 4GYGA 4BR9A 4C23A 4KIFA 2VYPA 3HTVA 5HDGA 3SZPA 4A2BA 3O1WA 4D0PA 2M30A 3VESA 1DPRA 2QW9A 4LB6B 5EY4A 1KU2A 2XAQA 4AM6A 5E17F 1G4DA 3V8LA 4OU0A 1ZC6A 3FXRA 5LHIA 3DF8A 3FGUA 2ZBKA 4PKHA 4GNIA 4BC2A 1U2VA 2EV0A 4FPAA 4FWSA 2QLZA 4BHCA 5AQYA 4IRHA 2OZ6A 2OZUA 4H0YB 1IUYA 3TDUC 5EOYA 3ZETB 1E4FT 4FWPA 2ELHA 1V4SA 5EEGA 4BRPA 2A40A 3JSOA 3FZVA 3U9GA 3EYYA 5DCFA 5D5XB 3ZMZA 2V9VA 1V4RA 1BI2A 2Y75A 4AIHA 2L4AA 1QQNA 2Q2EA 3L2CA 3IC7A 2F5CA 2STWA 2E2QA 4PKIA 5AQSA 3CO6C 2G7HA 4OIPF 1J2XA 4CZLA 1UFMA 2CFXA 2V1UA 4QS7A 3O08A 1GLLO 5BPMA 3WODF 4JBAA 3WU1B 3H46O 2V1DA 1NM1A 2FSKA 5ICGA 3F8FA 3CUQC 4KT5C 4A0XA 1IG8A 2HMPA 2A42A 3KE2A 1BOTO 1FY7A 3FWEA 5HLGA 3JS6A 4K41A 4YDUA 1XGOA 3H6EA 4BRKA 4L3QA 1W7PD 1Z7UA 2IIRA 3WGIA 3W6KB 2Z9OA 1ZARA 5FFZA 1E2XA 1TQPA 3S41A 5BRHA 2FF4A 2NNYA 3MN5A 2QM3A 1RGIA 3I71A 2WTEA 3I59A 2Z5UA 2FLOA 5BS6A 4ON0A 4BREA 3CERA 3KP3A 2MBFA 4NB4A 1BIBA 2XASA 1R36A 1SD6A 4CZEA 1ESVA 5KPRA 4O8KA 1V3FA 1KU7A 3EO3A 3HSEA 2J5PA 2ISZA 2E1NA 3COAC 1R00A 2KJCA 3WE2A 4EJWA 1MZBA 3O6WA 2Y48A 3SZTA 1O57A 3I64A 3K1NA 1RUOA 2NRHA 4EM0B 2FBHA 2R7FA 3F6VA 5B8HA 4RAZA 4WX9A 4HA8A 4O6JA 1FP1D 2STTA 1OYWA 1LEBA 4Q48A 2XRNA 1FYMA 2PAVA 3DWLA 5D5VB 5BQTA 2HGCA 1S29A 1U6ZA 4EGYA 1BC8C 5BRDA 3R6MA 3FLCO 1PDNC 3V7CA 3CJ7A 4A62A 4CO8A 2ZFWA 4JNEA 4BRAA 3FFKB 3V4GA 4LK1F 4M74A 2K7LA 5FPMA 2O61A 1KYWA 3BJ6A 1ZN2A 1R1TA 1YS7A 5KQ8A 1TUUA 1T44A 3H92A 4Y15A 4LC9B 5EEHA 3QMLA 2R3SA 3MCZA 1ZG3A 3FX3A 4CBUA 1BI0A 4YFKF 4U0YA 3FZFA 4RGRA 4BHBA 3R61A 1I6XA 4ZZDA 4BRMA 1MDMA 3QPHA 3MDQA 3EKSA 2PQ8A 6PAXA 3F23A 1FYKA 3VGKA 3LDOA 2M5WA 2MA3A 4LLLA 2XGXA 3QP5A 3D7EO 3WXKA 1QHAA 1O7FA 2FMLA 3C7JA 3HRTA 4DNCA 5AQJA 4HDUA 3QU3A 2QM1A 4G7HF 3HHHA 4U0VA 2DU9A 4FX0A 4IXCA 2GWRA 2MC3A 2HF4A 2YR2A 2E1ZA 3BJOA 2HDCA 3IL2A 1SD7A 1R59O 1R5HA 5TKYA 4Q5SF 1J59A 4CDGA 4BROA 1KAYA 3DXKB 4OMYA 4H5TA 2HZTA 3OOPA 5F64A 2P9SA 1SQKA 1K78B 3U8XA 4HAMA 4P5OA 5E1XA 1XD7A 2P5VA 1PP8F 4U0WA 1XGSA 3NQOA 1DEJA 4FSVA 3Q9VA 2VT2A 3O3KA 2GELA 2DW4A 1ZLKA 4PCQA 4H0EA 3M8FA 4DB3A 4PL7A 4A5MA 2DPUA 4KN4X 4S04A 3VEWA 1XMKA 4F9OA 4B1XB 3WTZA 3GWZA 2OD5A 1QNTA 3GLXA 4CD1A 2A61A 1MDUB 4L0YB 2IT0A 5ADXH 3AY9A 3D2FA 2FSJA 4G94A 2J5OA 3N97A 5FPNA 3HIFA 2Y0MA 3BPXA 2RV8A 5BPLA 5CVVA 4WCGA 5BPIA 1ZG5A 3A5OC 2QVOA 1IZ1A 1T0FA 1C0GA 4BH9A 2E8AA 1O3RA 4I0BA 3KP7A 1IN8A 3LAPA 2M1BA 3RKYA 1P2FA 4N0BA 1F4KA 4B09A 4MHGA 1H9TA 5E1ZB 3ZMDA 3WTXC 2AP1A 1WSUA 4BQLA 2Q0OA 2P9IA 4RB2C 1BBYA 4CZJA 4L9VA 3R0AA 4AIKA 3PFIA 2PBDA 3V7SA 5DCMA 4WQ4C 2FNPA 1BWFO 4EJVA 3MN7A 1J9IA 2JZYA 2ETHA 4JAXA 3CJBA 3I33A 3D2EB 4EVIA 1GLAG 4A5NA 4EV0A 3T8TA 2P9PB 1YO5C 3WTWC 2BE5F 1NBWA 2A5XA 3ZMUA 3P4IA 2IA0A 2FQ3A 3TO6A 1YFHA 5L3BA 3FZLA 1WKMA 3DV8A 3QOPA 2P6TA 3G25A 4IVNA 3ULEA 1W5TA 5LGNA 3KP6A 4CZHA 5LJWA 1FZPB 1T6CA 1K8KB 4EJOA 4AWXB 3RPUA 2F9WA 2V79A 5AZJB 2FNAA 3LDLA 1Y64A 1BU6O 3T5XA 4MGRA 1YS6A 2F5FA 4AM7A 1NMDA 2DQLA 3GE1A 1YAGA 3U4LA 1Q18A 3WXLA 5CVIA 1MKMA 1E4GT 3K69A 1P4XA 5JICA 1FT9A 2VONA 3MCPA 2X4HA 2HF3A 5J8CA 3ZPLA 3DXJF 2IPQX 3T0YA 3O1BA 3GL1A 1U2VB 1JCGA 3DEUA 3O5BA 4JHDA 4O3MA 2VODA 1IN6A 3TU5A 2Q8KA 3F22A 4WXDA 3UE5A 3IKTA 5HOOA 3ATVA 4ISFA 1SD5A 2HTSA 3KP4A 1JXSA 3P7NA 2NYXA 1NGIA 3FZMA 5BPDA 4KDPA 1H1VA 2FEZA 2D4WA 4RGUA 2D0PA 2JSCA 4BG9A 2A68F 3CQYA 2L4MA 3UKUB 2CGLA 4M9XA 1P92A 2A41A 4RB3C 5J6XA 3RSEB 2P9NB 3MN6A 5HLHA 2RC4A 1ZBSA 5F0XA 3K2ZA 1CZAN 3TGNA 1TW2A 5JVTA 4HLXA 3ZMVA 2EFWA 4EJUA 1XCVA 3DP7A 2J4RA 3HRUA 4PKGA 5LRSA 4O5VA 4FOEA 4FX4A 1ZREA 5ILVA 3L09A 2K27A 3MZYA 4XH1A 5DUKA 5D5WB 4CZGA 1QQOA 2P9KA 5J8FA 2DI3A 2VOOA 3HHGA 4MNUA 5AQLA 3P9IA 2LSOA 3I59B 4TV7A 2H09A 1UB9A 5FO5A 3RJPA 3REOA 3VENA 1XGMA 4UVBA 2W25A 1DKGD 2H27A 3QAHA 2HOEA 4K43A 4YDUC 3A8YA 1H9GA 3E6BA 1BI3A 5DUIA 3ZX3A 1REPC 3R0JA 2H6CA 4XH4A 2F5DA 2FRHA 4J8FA 4UV8A 1B9NA 3H3OB 1TBXA 2NAZA 5E8IA 2E7XA 1CF7B 4BHPA 1RZ4A 3GXOA 3QDKA 3IRRA 1D8JA 2FSNA 3GO5A 4UXNA 4DQ2A 3F8NA 3KHYA 5KK1A 3KZZA 1T2KA 2C6YA 2Q0UA 4CHUA 1KU9A 3CO7C 3H3ZA 3A5NC 4WXHA 1XN7A 2GXGA 4IJNA 5LGTA 4WQ4A 2P7CB 4ESBA 2VBZA 4E70A 2V52B 1JHHA 2KJBA 2CQKA 3DPLC 1XDSA 4M71A 1YYVA 2I7PA 3WTYC 3GOIA 3WQUA 3W6JB 2XAJA 4EFHA 3NRVA 3E5XA 1I1SA 3VF2A 4HYEA 5LHHA 3ENHA 1OKJA 4XLPF 3CJ9A 3JTHA 3HBTA 4IHSA 3C3WA 1MDMB 2CG4A 2KIMA 3L9FA 1BM9A 1E17A 3CI5A 4HQMA 1XCBA 2VBYA 4QS9A 5BOXA 2L01A 1ZAOA 4G7ZF 4IPAA 3LSTA 1FBQA 1QQIA 3UB5A 3R9PA 3HSRA 1KGSA 5L3CA 4K25A 4ENJA 3RIRA 5CVJA 1TYQA 2P9SB 5E84A 4BVPA 3E6CC 1HJOA 1HBXG 2W41A 5AR0A 2D1HA 2YHXA 4I01A 1Y0UA 4KICA 5FLXZ 4LFUA 3MFKA 5IT9K 5AQPA 2FF6A 4XBFA 1EH8A 4BR4A 3TO9A 4GY2B 4O5FA 3VETA 4H5RA 1LOTB 4HF0A 2JRTA 1WRJA 3PQKA 4A12A 3GYHX 3D2FB 3CUQB 1I1GA 4PGGA 3VFZA 2EV5A 4XLNF 3BZ6A 2OANA 3K0LA 2P4WA 4BRNA 4EGZA 4HV5A 2ZNYA 4KMUX 1QZYA 1U78A 4P96A 2ZMEB 4ASNA 1K79A 1U5TC 3ISPA 5HS8A 1ZH5A 3ZX2A 2CYYA 4N9IA 1NGFA 2ACJA 2D1VA 5AZIA 3CJNA 3KVGA 3ABTA 1X3UA 5DYMA 4A0YA 3CDHA 4FWLA 2RNJA 2V1XA 1JCEA 3LL3A 2OA4A 3EQLF 2LF7A 1JGSA 2XIGA 4CZKA 3T1BA 3K9TA 1NGAA 3KP5A 2XHKA 4HBLA 4NHJA 2BV6A 1ZGJA 3P9CA 4MO4A 4QS8A 1UHMA 1FWZA 3QP6A 2VE8A 2Z99A 2GTDA 1I5ZA 3VEOA 4G7OF 1ATNA 4BRHA 2UYTA 3IHUA 4PL8A 5F6FA 3WQTA 5AFUA 1DGKN 2O3FA 1XC3A 4JD2A 1P4WA 3E6DA 3M1FA 3Q9SA 3VOVA 5KPTA 2A3ZA 3B73A 5K1YA 4B1YB 3K1PA 3J8AA 3DFGA 1SFXA 3VEXA 5L3GA 1IN4A 3ECHA 2WC2A 4Q47A 1LEAA 3UKRB 4FWMA 4RB1A 4P55A 3GFLA 2V6CA 2O6GE 3J80K 4H5WA 4LG0B 4HX7A 1BA1A 3F72A 1FNNA 4M63C 1SFUA 3KETA 1O3QA 4UNOA 5FGMA 2HYGD 4MQ9F 2OAZA 4BRFA 1T98A 1U2WA 2VOPA 1HW5A 4YFXF 3SMPA 5JHUA 1EH7A 1FSHA 1D8KA 2P6SA 4UV9A 3IKVA 5LLQA 3ECOA 2WWYA 5KVRA 2ASOA 3CJAA 3G73A 3JXUA 4B1ZA 4FOIA 2QWWA 4JK1X 3RDIA 3QB0A 4LGWA 1DDNA 5AQMA 3HYIA 3C1DA 2Q31A 4RAYA 1ON2A 2V7ZA 4DCHA 1T6DA 2CGJA 1ZRDA 5EX5A 3ZP5A 4MEYF 3MEXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5KQD A;  2H94 A;  1NGG A;  4XRF A;  4BVO A;  5BN8 A;  2CGK A;  2TDX A;  3UKR A;  3L00 A;  1IRG A;  4IHT A;  4M7X A;  2YJE A;  3HOS A;  2V7Y A;  2GZW A;  5TJJ A;  3J81 Z;  1WUA A;  3H3U A;  4LG0 A;  2KIF A;  2NS0 A;  5AQX A;  1MJA A;  3GEZ A;  4RTF D;  1D3Y A;  4BGA A;  3RKW A;  3EUH A;  4R8H A;  3BWG A;  2RVC A;  4ZYG A;  4OIQ F;  4MO5 A;  2VXZ A;  3GG4 A;  5HS7 A;  3ZMS A;  3WXJ A;  5HVQ C;  2XRO A;  3WT0 A;  1XSX A;  2CH5 A;  1Z6R A;  1NGH A;  4EM2 A;  1ULY A;  3QPT A;  3WE3 A;  4EHT A;  3J80 Z;  4BG8 A;  4M9S A;  3QRF F;  2A5Y B;  4G8X A;  2E7W A;  5L3D A;  2E2O A;  3WEE B;  3SK3 A;  2RDP A;  3I0T A;  3WTT C;  2DBB A;  4I6M B;  4LB5 A;  1OYY A;  1T38 A;  1W7P A;  2LKP A;  4OIO F;  2WV0 A;  5BPN A;  4G6D A;  3GF2 A;  4BRC A;  2GA1 A;  3F3X A;  2PFB A;  2VC0 A;  3R6S A;  2FE3 A;  1XMA A;  2Q1N A;  2PI0 A;  3QBW A;  1J7K A;  4A6E A;  4YII A;  4JD2 B;  2FXU A;  1R58 A;  2QYO A;  3KEQ A;  1FP2 A;  3WXI A;  3BRO A;  3GZ5 A;  2K86 A;  1W4M A;  3VER A;  2HKX A;  3RYP A;  1RI7 A;  1AWC A;  1S22 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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