2HOEA

Crystal structure of n-acetylglucosamine kinase (tm1224) from thermotoga maritima at 2.46 a resolution
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
359
structure length
354
Chain Sequence
ISRILKRIMKSPVSRVELAEELGLTKTTVGEIAKIFLEKGIVVEEKDSPRPTKSLKISPNCAYVLGIEVTRDEIAACLIDASMNILAHEAHPLPSQSDREETLNVMYRIIDRAKDMMEKLGSKLSALTVAAPGPIDTERGIIIDPRNFPLSQIPLANLLKEKYGIEVWVENDADMGAVGEKWYTKRDDSFAWILTGKGIGAGIIIDGELYRGENGYAGEIGYTRVFNGNEYVFLEDVCNENVVLKHVLSMGFSLAEARDSGDVRVKEYFDDIARYFSIGLLNLIHLFGISKIVIGGFFKELGENFLKKIKIEVETHLLYKHSVDMSFSKVQEPVIAFGAAVHALENYLERVTTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of N-acetylglucosamine kinase (EC 2.7.1.59) (TM1224) from Thermotoga maritima at 2.46 A resolution
rcsb
molecule keywords N-acetylglucosamine kinase
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
total genus 91
structure length 354
sequence length 359
ec nomenclature ec 2.7.1.59: N-acetylglucosamine kinase.
pdb deposition date 2006-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 2hoeA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hoeA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2hoeA03
4UUVA 5L3FA 4IJNA 1QZ6A 3IHUA 3CO7C 1ATRA 3P9CA 1YTYA 3HTUA 5H20A 4N9HA 3E5UA 3KP3A 2DPUA 5AIPA 2Q1NA 3M8EA 4RB1A 1ZG5A 3UE5A 3GOIA 3VESA 2L01A 3QDKA 4WXHA 3DXMB 3C0BA 1DEJA 1FOKA 1USSA 3TO7A 4A12A 1WOQA 4DCHA 4WWCA 2QZ8A 4CI6A 1ZRDA 2F9TA 4ZYHA 3CJ9A 1RUOA 3JTGA 5AIQA 3QMLA 2F5CA 1W7PA 4L9TA 3V4GA 4A5MA 3ZEUB 2XASA 4CBWA 2ZBKA 4FWRA 3V7CA 4L9NA 2B0LA 3QRFF 4BRHA 3CDHA 1TW3A 4KBOA 4BRPA 1R22A 1ZG1A 2EA4A 2GWRA 5DV5A 4EV0A 1J6ZA 2XRNA 1JGSA 4Z2YA 1OKJA 1RDWX 2YJEA 3DF8A 1FYMA 2CSOA 2XGXA 5LJWA 3L0QA 4CZGA 2J5PA 2XHKA 4BC3A 2VE8A 2Y75A 4LG0B 2PJPA 1XCVA 2O61A 2EV5A 1LEBA 3WTWC 4EJVA 2PBDA 3WXJA 3D7EO 1LDKB 1J0RA 5KPZA 1B1BA 2PG4A 3M7GA 4I6MB 5E26A 2VBYA 2VT3A 2M30A 3AY9A 3KP6A 3ENHA 2JZYA 3DXKB 3HOTA 4G6DA 1U2VA 4CZJA 1BJAA 3KLOA 3RPQA 5JLHA 1OPCA 4RWTA 2OA4A 5L3EA 4BG9A 1KXPA 2CYYA 5KPTA 3SMSA 3FWEA 4EM0B 1SFEA 3OV8A 3GFMA 2M5WA 3IWZA 2ASMA 3O6WA 4HLXA 4MTEA 1B9NA 4KDPA 2P6TA 3F21A 3WGGA 4LC9B 2DU9A 1FBSA 1V4SA 2DBBA 4M7XA 2ZNYA 4JNEA 3SMPA 1MJBA 2G9WA 2ZWHA 2NLXA 3O08A 3LM2A 3F3XA 4QS9A 1QQIA 1OYYA 3MMVA 4IPAA 4RAZA 1BI1A 2A5XA 3KVGA 2QLZA 1H1VA 1T6SA 1Y0UA 3U9DA 4N9IA 4BR2A 2DK5A 3REOA 1ZLJA 2IVMA 5D6EA 4Q5SF 4KUMA 1GXQA 5E8GA 3GZ5A 4HDUA 2ZMEB 4RGRA 4K41A 1FBUA 2KIMA 3MWMA 2EWNA 3H45C 5KK1A 1IN5A 1IN7A 1T0FA 3QPHA 2P9PB 2UXXA 3TPQA 1C0GA 3T5XA 1FC3A 3N4MA 1MDMB 3I64A 3HSFA 1XDUA 2IVPA 3RSEA 2EA2A 1FNNA 4Q47A 5BR9A 2ZO4A 4FWLA 1P6RA 5H6RA 2LSOA 2E2OA 4CZKA 3IRRA 5FD5A 3ULQB 3IMXA 3O80A 1FSEA 3W3DA 1XUPO 3EN9A 5CJ9A 3U1DA 4JQFA 3K1PA 3V8LA 2STWA 3HRUA 5K5OA 2L4MA 1C0WA 1FY7A 1IRFA 3VEPA 1SD4A 3W6JB 3GDQA 3QP5A 3IKTA 4M74A 1BN5A 3EETA 4HV5A 1K78B 2QM3A 5BN8A 5F1XA 4ZYEA 2YI1A 1B59A 2EFWA 2V9VA 2Q0RA 4L9JA 2MLGA 3C3WA 4CZLA 2EJRA 3FZHA 2ZNZA 3MCZA 2CWEA 3VENA 4JN4A 2GA2A 1REPC 4GGGA 1YO5C 1GLJO 1HSTA 3LFKA 1RIOH 4P96A 3F6VA 1P8ZA 2EWSA 4CBUA 5HS8A 2L4AA 1RZ4A 1HQCA 2OU2A 1Z1DA 3WUHA 3ULEA 1O7FA 3F23A 3GZ6A 2UXNA 4XSXF 1JXSA 3HSEA 4KYWA 2FE3A 4CICA 3PQKA 4ISEA 1XN7A 3GFJA 2F2EA 2PQ8A 1O3SA 2IA1A 3W6KB 1YW7A 2GAUA 4XBFA 5LGNA 1G3WA 4KMUX 2H6BA 1FYLA 3ZN1A 2EFQA 1ZN2A 5DUKA 3R0JA 3FR0A 4PL7A 3BF1A 1KAYA 1DGKN 2P4WA 2R7DA 1S6LA 3WXKA 2OD5A 1T6CA 2ITMA 3WODF 1QZYA 2YX4A 5ICFA 3L2CA 1YS7A 1ZH5A 1QHAA 1BI2A 4IRIA 1J5YA 1TUYA 3MN5A 1BOAA 2OQGA 4R8HA 4CZHA 3RYRA 2IW5A 2F5FA 2JPBA 2FNPA 5FB2A 6PAXA 3GXOA 4B1VA 1U5TB 2ASOA 2XAGA 2DPNA 3RKWA 3SFZA 4RB2C 1IF1A 2HEOA 4MQVA 3GLXA 4WXCA 3E6BA 4BREA 3DWLA 5D5WB 1Z6TA 2P9LB 3VEWA 2P9UB 3HHGA 3RJPA 2H6CA 2V51B 4ISFA 1SD7A 2KJBA 5HOOA 2A40A 5AQWA 4MTDA 1U2WA 4BXUA 3NEUA 1IN6A 3GUDA 2LKPA 2FXAA 2QQBA 3DPTA 3QFUA 5CVRA 3O5BA 1F9NA 2W40A 3GL1A 4IVNA 4CD3A 2QYOA 1BC7C 1U5TC 2A6EF 2Q97A 4NB4A 5EOYA 4BRKA 4BG8A 1HW1A 3IKVA 4BQZA 1YXQA 3IL2A 5BREA 1YW9A 5DD8A 2HQNA 4JHDA 2PBIA 4GYGA 2Z99A 5K1YA 1T39A 1RUNA 3JSOA 1BA1A 1C0FA 3H1VX 2GXGA 4YFKF 3L9FA 1BC8C 4EIAA 1O57A 4BRMA 2RDPA 4FWQA 4WX9A 4U0WA 1FBQA 3L00A 4HOBA 3J80Z 2PEXA 3LQRA 4KIBA 4HZFA 4B8XA 3K1NA 2KKOA 3ROUA 2Z3YA 4HAMA 4NB5A 4O3MA 5TJJA 4JD2B 2QWOA 3HTSB 3KHYA 2ZFWA 4BAYA 3BZ6A 3LM9A 5AQGA 3ECHA 3WU1B 5FLXZ 4FX4A 3KLNA 4RS8A 5FLXK 2FF3B 5H6QA 5EX5A 4HYEA 3V7RA 1GLAG 2HKOA 3H3UA 3LAPA 2E1CA 1K8KA 4H5NA 3WXIA 3LDLA 3CUQB 3OHRA 3FX3A 2RKHA 5DD4A 4IZ9A 5D4RA 3FM5A 4NHJA 5HLGA 1IW7F 4K25A 1HKGA 3CHWA 3VERA 2NAZA 1YQAA 5BRDA 2D4WA 1WI9A 3BEXA 3EL2A 2HWVA 1V4TA 4D0PA 4H0PA 1TYQA 5FPEA 2VE9A 2FBHA 3KETA 2H3GX 3BOQA 2FSNA 2QWNA 1P4AA 4P9UA 3CUQC 3G3ZA 1OKRA 4HQEA 1K79A 3TOBA 3WEEB 4MEYF 3SZTA 3VEVA 4A2AA 4G7ZF 3EZWA 2ZGYA 2NRAC 5B8HA 4L18B 4ENJA 1ZC6A 2J4RA 3FMSA 2BUPA 4LGWA 1ZLKA 4UXNA 1FZPB 3MFKA 3O6BB 3J8AA 1MA9B 5JICA 5DCMB 2IVNA 4UHTA 3UKUA 3J81Z 4RB0A 4OU0A 3J81K 2QBYB 5IT9Z 3VGLA 2W84A 4LK0F 1KAZA 3GF2A 3HI0A 5IT9K 4PL8A 1D8KA 5TRDA 1E4GT 3JS6A 5ILVA 5A2QZ 1R00A 4LLNA 3ID8A 5A2QK 2Q0OA 1QZ5A 3BDDA 4PGHA 3TDZC 4A2BA 4KN7X 2KIUA 1G99A 4IHSA 4BRDA 1FT9A 2Y0MA 2Z9OA 2W41A 1YAGA 4WF2A 1F4KA 4FL9A 2E20A 1B4AA 2P5VA 3VEZA 5FPDA 3HUGA 3BF3A 5AONA 3DXMA 1HX1A 1X3UA 4XLNF 5D8LB 1O3TA 4BGAA 4BR9A 5BOXA 1XGOA 1SQKA 2DO7A 3CLOA 4I98B 2EFOA 4DQ8A 4ESBA 3FE1A 3QU6A 3L09A 4FHTA 5E1ZB 4CHUA 3LSTA 2XKPA 1PP8F 4M9SA 1HBXG 2XKOA 3ZQ7A 3S41A 3D2EB 2FLOA 1QNTA 1NGCA 4BC2A 4Q48A 1O3QA 2TDXA 3VODA 2ISYA 2JTVA 2P9SB 1FWZA 2XVCA 3I59A 2DTRA 1JCEA 4UVCA 4OMYA 4GCVA 3O2PE 5DYMA 3IUCA 5HLIA 4RTFD 2R3SA 4XLPF 3ZETB 5L3DA 3UB5A 4ISGA 4BR4A 3WTUC 3TKYA 4BR7A 5F6FA 3T8RA 3WGHA 3KZZA 3AAFA 4EM2A 1NMDA 1TQMA 2PI0A 1ESVA 3WG9A 1A04A 1ZXOA 4I0AA 2P9IB 1FLIA 1QQMA 1ZYRF 4HQMA 1EH8A 1KQ0A 1J9IA 1I5ZA 1XMKA 4FPBA 5HVQC 1L3LA 2STTA 4B9QA 1MZBA 3QP6A 3MZHA 3H6EA 1CGPA 4I6MA 1BWFO 4FWKA 4XRFA 1NGFA 3DXKA 5DDGA 1XGNA 4HLYA 3ZX2A 2IIRA 3LQQA 1IG8A 1HPMA 1D4XA 4HV6A 4MHGA 1YS6A 2D1VA 1E2XA 5LGTA 4ZH4F 1BU6O 3P4IA 1R58A 4A0YA 4U7DA 3OOPA 3GE1A 1IN4A 5AZJB 4FT8A 2RNJA 5K5QA 1BBYA 1X9JA 2M8EA 1KAXA 1CF7A 1BUPA 3RKXA 2A6AA 3CJ7A 4L0ZB 3EYYA 5FD6A 4AWXB 1U6ZA 5ILSA 4YFXF 2CO5A 2QQ9A 4FWPA 1F5TA 4MO4A 4A0XA 2A41A 4ENMA 3LWFA 1BG3A 5JR3A 4CGZA 3KP4A 1XGMA 4B1ZA 4WYBA 5JI6A 2D1KA 1ZRCA 3MCPA 2QVOA 3T1BA 1L0OC 1NGHA 2GA1A 5FFZA 2E2QA 1JE8A 1IAWA 4BNCA 3DP7A 4FX0A 3D2FA 3ZMVA 4HA8A 2VCPA 1UHMA 4OIOF 1VTNC 1ZG3A 3PFIA 1I1GA 5D6FA 2VBXA 3LDPA 2JT1A 3E6MA 2E2PA 1LEAA 3MQ0A 3CO6C 3KE2A 5FFXA 3GX4X 2P9PA 1BOTO 1TNSA 2ETHA 4P5OA 2WUSA 3BPVA 4BGBA 3JAMZ 1SAZA 2NYXA 1MDMA 4IRGA 4DHYA 3JAMK 4U7BA 2BGCA 3V7SA 4G7OF 1R5HA 1RI7A 2ZJ2A 5LY3A 2P7CB 2ESNA 1DPUA 1FSHA 5FGMA 1HSJA 5AQZA 4PKIA 1JCGA 2V1XA 1BIAA 1R1UA 3ZMTA 2Q36A 2KIFA 1QGPA 3DV8A 3HRTA 3VPZA 3VGMA 4G6QA 3IDHA 4YFNF 1W7PB 5CYVA 2V1DA 1GLBG 5AQIA 2XUBA 4RGXA 2V7ZA 5D4SA 1K78A 2AXLA 4CYDA 5E17F 3U9ZA 5E18F 2QWLA 5EXWA 3KEQA 2QW9A 3SXYA 2X4HA 1B9MA 3K9TA 4ENNA 2MH2A 1QZZA 2MD5A 2YSRA 1BA0A 2M1BA 1SAXA 1JHFA 2D45A 4H0XB 2IT0A 1J2XA 2L54A 1LJ9A 1YW8A 3JXUA 3KP5A 2V79A 4CD1A 4BHPA 2Q0UA 4XH4A 3Q9SA 2GZWA 3FMRA 4BH9A 3FFKB 1KGSA 2FA5A 2QWRA 2YJFA 3RPUA 4OMZA 4Y13A 1P2FA 3FLCO 3VF6A 1YLFA 3F8CA 4ENKA 4KN4X 1XGSA 1GXPA 1YYVA 2EK5A 1U2VB 4H0TB 4UV9A 4PCQA 1T6DA 3JSPA 3FXQA 3ZPLA 4LB5A 3CIPA 2LF8A 1KA8A 2VWBA 4RCHA 5AZIA 1SFXA 3DFGA 4M9XA 3D5LA 2HOEA 4BQLA 3ZP5A 3EUHA 3K2ZA 2NS0A 4LD5A 3KZYA 3CUOA 4M9ZA 4EMSA 1XD7A 1OYWA 3ZX3A 3M6GA 1BIBA 2ASPA 3SK3A 3CQXA 5AQLA 2DK8A 2P9LA 5LHHA 4UNOA 4MO5A 2VONA 3N97A 2P9UA 1I6XA 4FSVA 1WQ2A 2P5KA 5E20A 1NWKA 3E97A 2F9WA 3ECOA 3ELKA 2RQPA 1G3SA 3ZMZA 4PZJA 5LRRA 1SD6A 4WQ4A 1U6GA 5DCFA 1LQ1A 1W7PD 1IZ1A 3MK6A 3AAQA 2RGVA 4MNUA 4EHUA 1HXDA 5LHIA 2HDCA 2E7WA 4EAHD 1Z7UA 2OANA 2HYGD 2FF4A 4MLHA 4FOIA 3LA3A 5F0XA 2MBFA 1Q18A 3M9AA 3RSEB 4CZFA 1NGBA 4QLCU 4KNYA 2Q2EA 4I01A 1RGIA 2V6CA 1Z05A 4QS7A 2MLKA 4K2EA 3L6QA 2OAZA 4RGSA 3QU3A 4ETSA 5BN9A 4HX7A 1D3YA 3M1FA 4H0VB 4L0YB 5D8KB 3WT0A 4A6EA 3M1EA 3F22A 5AQOA 1KYZA 4BRFA 4KMFA 4MGRA 4JD2A 4BVPA 4H0YB 4F9OA 1XSXA 1OMIA 5LEKA 2FF6A 3O1WA 5AQPA 5BPIA 5AQNA 2XV4S 5AQSA 2VOOA 3GEZA 1NGJA 2VYPA 4WXDA 4IRHA 4JK1X 5D5XB 2EFPA 1UB9A 2W24A 2EFNA 3RTRA 4R1HA 4IHTA 1B6AA 4TV7A 2CH5A 4O5FA 5HDNA 3A8YA 2LDUA 4KFCA 3NQOA 4FWMA 3FF5A 2NRHA 3ULEB 4G94A 3GO5A 1ONVA 4B1UB 2VT2A 3C7NA 4K42A 1MDUB 3FHZA 1KU7A 2OQRA 5JVTA 1V3FA 4HWIA 3Q5FA 1GVJA 3ZMDA 2Y48A 4AIJA 3SQNA 3DXJF 3C1DA 2QENA 4PKHA 2PMUA 1OR7A 3AAPA 4HF0A 4BROA 2A61A 1E17A 5AQHA 4M6YA 5E8IA 1LOTB 1HKTA 1PDNC 2HYFA 1ZHFA 3C7JA 2QM1A 3L7WA 4YG2F 2GUPA 1PP7U 4PGGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UUV A;  5L3F A;  4IJN A;  1QZ6 A;  3IHU A;  3CO7 C;  1ATR A;  3P9C A;  1YTY A;  3HTU A;  5H20 A;  4N9H A;  3E5U A;  3KP3 A;  2DPU A;  5AIP A;  2Q1N A;  3M8E A;  4RB1 A;  1ZG5 A;  3UE5 A;  3GOI A;  3VES A;  2L01 A;  3QDK A;  4WXH A;  3DXM B;  3C0B A;  1DEJ A;  1FOK A;  1USS A;  3TO7 A;  4A12 A;  1WOQ A;  4DCH A;  4WWC A;  2QZ8 A;  4CI6 A;  1ZRD A;  2F9T A;  4ZYH A;  3CJ9 A;  1RUO A;  3JTG A;  5AIQ A;  3QML A;  2F5C A;  1W7P A;  4L9T A;  3V4G A;  4A5M A;  3ZEU B;  2XAS A;  4CBW A;  2ZBK A;  4FWR A;  3V7C A;  4L9N A;  2B0L A;  3QRF F;  4BRH A;  3CDH A;  1TW3 A;  4KBO A;  4BRP A;  1R22 A;  1ZG1 A;  2EA4 A;  2GWR A;  5DV5 A;  4EV0 A;  1J6Z A;  2XRN A;  1JGS A;  4Z2Y A;  1OKJ A;  1RDW X;  2YJE A;  3DF8 A;  1FYM A;  2CSO A;  2XGX A;  5LJW A;  3L0Q A;  4CZG A;  2J5P A;  2XHK A;  4BC3 A;  2VE8 A;  2Y75 A;  4LG0 B;  2PJP A;  1XCV A;  2O61 A;  2EV5 A;  1LEB A;  3WTW C;  4EJV A;  2PBD A;  3WXJ A;  3D7E O;  1LDK B;  1J0R A;  5KPZ A;  1B1B A;  2PG4 A;  3M7G A;  4I6M B;  5E26 A;  2VBY A;  2VT3 A;  2M30 A;  3AY9 A;  3KP6 A;  3ENH A;  2JZY A;  3DXK B;  3HOT A;  4G6D A;  1U2V A;  4CZJ A;  1BJA A;  3KLO A;  3RPQ A;  5JLH A;  1OPC A;  4RWT A;  2OA4 A;  5L3E A;  4BG9 A;  1KXP A;  2CYY A;  5KPT A;  3SMS A;  3FWE A;  4EM0 B;  1SFE A;  3OV8 A;  3GFM A;  2M5W A;  3IWZ A;  2ASM A;  3O6W A;  4HLX A;  4MTE A;  1B9N A;  4KDP A;  2P6T A;  3F21 A;  3WGG A;  4LC9 B;  2DU9 A;  1FBS A;  1V4S A;  2DBB A;  4M7X A;  2ZNY A;  4JNE A;  3SMP A;  1MJB A;  2G9W A;  2ZWH A;  2NLX A;  3O08 A;  3LM2 A;  3F3X A;  4QS9 A;  1QQI A;  1OYY A;  3MMV A;  4IPA A;  4RAZ A;  1BI1 A;  2A5X A;  3KVG A;  2QLZ A;  1H1V A;  1T6S A;  1Y0U A;  3U9D A;  4N9I A;  4BR2 A;  2DK5 A;  3REO A;  1ZLJ A;  2IVM A;  5D6E A;  4Q5S F;  4KUM A;  1GXQ A;  5E8G A;  3GZ5 A;  4HDU A;  2ZME B;  4RGR A;  4K41 A;  1FBU A;  2KIM A;  3MWM A;  2EWN A;  3H45 C;  5KK1 A;  1IN5 A;  1IN7 A;  1T0F A;  3QPH A;  2P9P B;  2UXX A;  3TPQ A;  1C0G A;  3T5X A;  1FC3 A;  3N4M A;  1MDM B;  3I64 A;  3HSF A;  1XDU A;  2IVP A;  3RSE A;  2EA2 A;  1FNN A;  4Q47 A;  5BR9 A;  2ZO4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5LL6 Z;  2VOP A;  2M9H A;  4H03 B;  2ID3 A;  1F21 A;  2ZD1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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