4AMCA

Crystal structure of lactobacillus reuteri 121 n-terminally truncated glucansucrase gtfa
Total Genus 272
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
272
sequence length
1019
structure length
1019
Chain Sequence
QYYIDPTTGQPRKNFLLQSGNNWIYFDSDTGVGTNALELQFAKGTVSSNEQYRNGNAAYSYDDKSIENVNGYLTADTWYRPKQILKDGTTWTDSKETDMRPILMVWWPNTLTQAYYLNYMKQHGNLLPSALPFFNADADPAELNHYSEIVQQNIEKRISETGNTDWLRTLMHDFVTNNPMWNKDSENVNFSGIQFQGGFLKYENSDLTPYANSDYRLLGRMPINIKDQTYRGQEFLLANDIDNSNPVVQAEQLNWLYYLLNFGTITANNDQANFDSVRVDAPDNIDADLMNIAQDYFNAAYGMDSDAVSNKHINILEDWNHADPEYFNKIGNPQLTMDDTIKNSLNHGLSDATNRWGLDAIVHQSLADRENNSTENVVIPNYSFVRAHDNNSQDQIQNAIRDVTGKDYHTFTFEDEQKGIDAYIQDQNSTVKKYNLYNIPASYAILLTNKDTIPRVYYGDLYTDGGQYMEHQTRYYDTLTNLLKSRVKYVAGGQSMQTMSVGGNNNILTSVRYGKGAMTATDTGTDETRTQGIGVVVSNTPNLKLGANDKVVLHMGAAHKNQQYRAAVLTTTDGVINYTSDQGAPVAMTDENGDLYLSSHNLVVNGKEEADTAVQGYANPDVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAPSTEKNSGNSAYRTNAAFDSNVIFEAFSNFVYTPTKESERANVRIAQNADFFASLGFTSFEMAPQYNSSKDRTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGMSEPNKYGTDEDLRNAIQALHKAGLQVMADWVPDQIYNLPGKEVATVTRVDDRGNVWKDAIINNNLYVVNTIGGGEYQKKYGGAFLDKLQKLYPEIFTKKQVSTGVAIDPSQKITEWSAKYFNGTNILHRGSGYVLKADGGQYYNLGTTTKQFLPIQLTGEKKQGNEGFVKGNDGNYYFYDLAGNMVKNTFIEDSVGNWYFFDQDGKMVENKHFVDVDSYGEKGTYFFLKNGVSFRGGLVQTDNGTYYFDNYGKMVRNQTINAGAMIYTLDENGKLIKASYNSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of the Alpha-1,6/Alpha-1,4-Specific Glucansucrase Gtfa from Lactobacillus Reuteri 121
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUCANSUCRASE
molecule tags Transferase
source organism Lactobacillus reuteri
total genus 272
structure length 1019
sequence length 1019
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01473 CW_binding_1 Putative cell wall binding repeat
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.20 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. Aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit, C-terminal domain 4amcA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4amcA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4amcA04
4HP5A 1XV8A 1HL9A 3CZEA 3FHQA 2XJ7A 2D20A 3IK2A 4AZ6A 1WZAA 3AZSA 3LPOA 4DWSD 1BQCA 1GORA 1VRXA 4W5UA 1WDPA 4D72A 3VM7A 2UY2A 2QMKA 1CNVA 1E5NA 1GQJA 3WQ4A 1DWIM 1RAGB 1V0MA 4BQ5A 4ACZA 5A6JA 4AIOA 5HPCA 3MUY1 1E6ZA 4PMDA 1MQQA 1WPCA 2BVTA 1W9BM 3VIGA 2VI0A 4ATWA 1EQCA 4Z2LA 4KGLA 2CKRA 7A3HA 1QOXA 1QHOA 2AIRB 2W5FA 3VGHA 3BMWA 1PJ9A 1XC6A 3W82A 4FMVA 5ABEA 1PX4A 1BYBA 3GNOA 5ABGA 4HZ7A 1JNDA 4QAWA 1QNOA 1K9TA 3APGA 4ZXLA 2WCSA 3VIKA 1DTUA 3MUZ1 3L4XA 3GBDA 3GXDA 2ZE0A 1XHGA 5A8MA 5HOSA 2MANA 1VBRA 2G3MA 1JZ3A 2VX4A 1CGUA 5A2AA 1E3ZA 4F79A 1W9DM 2XWDA 1B0IA 3VIIA 1HKKA 1KXHA 3IJ7A 2NT1A 1XCXA 2CXGA 1EOKA 3BAJA 3PZOA 4JIEA 4H41A 2W4XA 4UFLA 5A6BD 1B9ZA 5D4YA 4D6FA 1JG9A 2PF0A 4HU8A 1C8YA 2J7FA 2WVVB 3WF2A 1DWGM 5CPQA 1E6QM 1CPUA 1TR1A 4UZUA 3O6AA 3WUGA 3TA9A 3A6OA 1E5JA 1KGXA 1SMDA 3AIBA 3L4TA 1WZLA 2JEQA 1G9HA 1OD8A 4CCDA 4FLOA 4GKLA 4Z2GA 1J9YA 1U33A 3UG3A 1JI1A 3NJ3A 4GINA 4HOXA 2XFYA 1G0CA 1TMQA 2GDUA 4W85A 2WC7A 3M7SA 5A3HA 4FYWB 4FYXB 1UG6A 1V6YA 1SKUB 1F4HA 1BGGA 3AMLA 1E0WA 3GBEA 3GH7A 4X0NA 3ARQA 1MQPA 3AXXA 1MFVA 2DSZA 1QNPA 5CPTA 2NT0A 3VGDA 1JFXA 1X1NA 1MWOA 1NOFA 1UZ1A 3T2PA 5AC5A 4AEFA 2A3BA 4BQ3A 2YOCA 2VX7A 3N1AA 1BLIA 3K4AA 1NWRA 4MB5A 1RPKA 1CXEA 2VL4A 4GPNA 1J0KA 1E55A 3WQ5A 2PB1A 2DH3A 2PWFA 4WLCA 4WSKA 3AIEA 1DWHM 1PX8A 5LA2A 1LWHA 1WCGA 2UWFA 3W28A 1Q4NX 5E0FA 1CIUA 1Q6EA 3A47A 2YJQA 1H49A 3AROA 2X1IA 4UR9A 1KWGA 4AXNA 2F8QA 1UHVA 2XVKA 4J3VA 2PWGA 1OIMA 3BLPX 1HJXA 1KQYA 4GI8A 4D6CA 4AD2A 3VDCA 1QNSA 1EOMA 1CYGA 4UOQA 1C3FA 1M04A 1TVPA 1FA2A 3TTYA 5AY7A 3WNKA 4KH2A 1CECA 4JZ5A 4UQBA 4X0VA 4H8UA 3CMJA 4U2YA 4UCFA 1TA3A 4J3SA 3IAQA 4JAWA 2D0HA 3TTOA 4UFHA 1HT6A 5A2BA 1UR8A 4PCSA 1JZ5A 3VMPA 4IISA 1VENA 2CPUA 1WE5A 3B9EA 4UOZA 2E3ZA 3K8LA 3ZJKA 3O2LA 1N82A 3VIOA 4BF7A 3KLLA 2EXOA 2JF6A 3PZUA 1ZJAA 1B3YA 1E1FA 3KZSA 4PYSA 3MSDA 4HZ6A 3T0BA 1E73M 4MTVA 4CD7A 4QCFA 2YL5A 1UD2A 3O9NA 2J75A 1ESWA 4GO8A 1NOWA 1V6VA 3VD9A 3ARUA 1I1XA 4S3JA 2VNCA 1E56A 4F8XA 2J79A 2V3FA 4CVUA 5D8WA 4B16A 4P7LA 4D71A 2OSYA 3QGVA 4UQDA 5C8BB 3ECQA 3SCWA 2WZHA 3OG2A 4Z2KA 2OYMA 2ZXQA 5KZ6A 1LG2A 2VR4A 1RABB 1D2KA 1UKSA 2VRQA 2UY5A 3A4XA 3W6LA 1O6IA 3WKZA 4OJYA 4V27A 1B3VA 1OSEA 2TAAA 4J3TA 1CGYA 2DIEA 1W1PA 3AJ7A 3ARZA 3DHPA 1UH3A 4ACYA 2VMFA 3RJYA 3N17A 4AD4A 2YDSA 4P7RA 4QFUA 2DQXA 5E9AA 2AMGA 4F9DA 5D8ZA 2WVSA 1GOQA 2FHFA 3F4VA 2FZGB 1ISWA 2WKLA 1K9FA 4UQ9A 1OD0A 2BFGA 2PWEA 3TP4A 4ZFMA 3CZLA 5CQ1A 4LX4A 2VQTA 1JZ8A 4PTVA 4MDPA 3EMZA 2GK1B 3SCUA 1ZBKA 3N04A 3WNMA 3AMCA 2VUYA 3W26A 3IAPA 1V6WA 2XFRA 3U5YA 1L8NA 2UY3A 2D0GA 2XSAA 5I78A 4NRRA 1UWSA 1XD1A 3KEHA 4MADA 2VQUA 1OGBA 2QGFB 1E9LA 3WSUA 1UWIA 3AT1B 2WC3A 3T0DA 4TTUA 1UKOA 4X9YA 2V3DA 2ZXDA 4D6JA 1JDAA 2YIHA 3WF1A 1CZ1A 1B3WA 1C90A 1E4LA 1I75A 1W3LA 4V2XA 5A94A 5BRPA 5LA0A 1M53A 5I79A 1J18A 1EHAA 4B9ZA 1IV8A 2JALA 3CIVA 4M8UA 3CHFA 5A8NA 1EDTA 5D9OA 1D7FA 1EO5A 4UQCA 3RM8A 2E9BA 2B31A 4KWUA 1JGIA 3CBWA 4HMDA 1HVXA 3BAKA 1JXKA 4RE2A 4IPNB 3AFBA 2VCCA 2WMGA 1AVAA 9ATCB 2BNJA 3WY1A 4AZ5A 3AHVA 3VGGA 1J11A 3RM9A 2EO7A 1PPIA 3HJEA 3WL1A 1RH9A 1UKPA 5BXPA 4MNMA 1QPKA 4EANA 1WAWA 1NBEB 1BPLB 4FYYB 3GNRA 1EA9C 4ZE5A 4AYGA 1BTCA 2XFFA 4FYVB 1UKQA 1QHPA 2W62A 5A1AA 2W67A 2GJXB 3N9KA 2DSWA 3ZSSA 4KGVB 4ML4A 4A4AA 2V3EA 4UFKA 2D3LA 1JZ4A 3MSGA 1UD4A 3MANA 4GQQA 1UR1A 4N0RA 5I3DA 3SCPA 2QMJA 3VTRA 1DEDA 1KBKA 2ZUWA 4A3YA 1W9PA 6CGTA 1NH6A 1R8LA 1ISZA 2VVNA 2J7CA 4F04B 1HP4A 5AT1B 3S2CA 3OLEA 1W1TA 3ARYA 2WLZA 3WDHA 1KB3A 1XGZA 3WD2A 4AYSA 1JD9A 4XZWA 1UWQA 3VD4A 1EQPA 3BSHA 1UZ4A 4TUFA 2UY4A 1EO7A 3WMSA 2XIIA 2XUCA 1V3MA 3VU2A 3GDBA 1RD6A 3SUVA 4PUEA 1UWRA 5AYIA 2F2HA 1PIGA 1XSIA 2YDRA 3A4WA 3NDZA 1BFNA 1ACMB 1L0PA 3QHOA 5A2CA 4KGXB 4AZBA 2D22A 2G3JA 1H0GA 3WQVA 4ACZB 1VB9A 6TAAA 1FOBA 3CMGA 5CGMA 4F66A 3RCNA 6A3HA 1TFVA 1KBBA 2YA2A 1JAKA 3DYPA 1OGGA 3UETA 5HPOA 4PCTA 1GOOA 4W7VA 2WW5A 1ZBWA 1KFWA 1QHZA 3WBEA 4YN5A 1NOUA 2DEPA 4EKJA 1C8QA 2QLYA 4Z2HA 1TG7A 1XSJA 3RPMA 2QHAA 3WF4A 2GVYA 2WWDA 1W32A 2DGAA 3MU7A 4LYRA 4PMVA 1ODZA 2GJXA 1W1YA 2D2OA 1J0HA 3SCRA 2Q8XA 3L2LA 3QHMA 4GIAA 1FFQA 1W3HA 4PMNA 1HJUA 3M46A 1VFMA 2WBKA 3VPLA 2CBJA 1YHTA 3VM5A 2FHBA 1XYFA 1WDRA 4KH1B 4UZSA 4ZENA 1MVYA 3ZQ9A 4PRWA 1UA7A 2J8FA 2WCAA 4QLKA 4L4PA 1KXTA 4DUVA 3L4VA 2WANA 1PEZA 2BE9B 4J3WA 2ESCA 3F5LA 3U57A 4PMRA 4PSPA 1H1NA 4M24A 5D9MA 1J0ZA 4PTMA 2VZUA 1J12A 4HA3A 1EIBA 3WDPP 1XYZA 5BXSA 4WJXA 3W81A 1HKIA 4XZBA 3BCDA 4MPKA 4ZXOA 2QPUA 2XVLA 5TD4A 4ZE4A 5ABFA 3MMUA 2OLHA 4TVCA 2VCBA 3VDHA 3FW6A 3UG5A 1HKJA 5JIPA 2JIEA 3OB8A 1RACB 1NWSA 3VIFA 4JL1A 1RP9A 1EXPA 1CDGA 4QDMA 1VFUA 4AW7A 3SUTA 1G1YA 3WNPA 2CHOA 1V0LA 1ISVA 4WF7A 2CETA 2ZUSA 1QNRA 2Z1KA 4E2OA 4W84A 2WZIA 2AT1B 3WNNA 4PTWA 4PMOA 3BH4A 4QCEA 5M03A 3WELA 1MYRA 2WVUA 3NDYA 5HDRA 1GUVA 4C7FA 5CG0A 2VOTA 3N15A 2JE8A 3WH6A 1B90A 3AXIA 3W53A 5E6YA 2E9MA 1XSKA 1Q95G 2ZUUA 1GQLA 2WSPA 4JKKA 3SUWA 4U33A 5E70A 2YL9A 2D3NA 3CZKA 2DIJA 3AS3A 2W91A 4PMUA 1V6XA 1W9XA 4DUWA 2J77A 7TAAA 3JUGA 4CD5A 1JYNA 2CBVA 2VRJA 1P6WA 2WHMA 3CHCA 3MUIA 3WFLA 1C7TA 1DWAM 4YHEA 7AT1B 1A47A 4D1IA 3WD3A 5CZKA 3EDEA 4AWEA 4TTGA 4CU8A 2OWCA 2FGZA 1QNQA 3WFZA 3OLGA 4D6HA 2ZWYA 1TA3B 4MAVA 2J74A 1W3JA 2IXVA 3FNDA 3GH4A 5E6ZA 3GXMA 1UH4A 3UCQA 4DWSA 4AIUA 3BSGA 3SCVA 3CH9A 5A95A 1EDQA 4XB3A 3WEOA 3K8MA 3CUFA 2A3EA 4MB1A 1JFHA 4OBRA 3CGTA 4GI9A 4MNKA 1NARA 1A3HA 3SCTA 2AAAA 3W27A 1GZJA 3SEPA 3OA5A 1R87A 1BAGA 2CESA 2YDQA 1HX0A 1UR0A 2VX5A 1GVYA 2NW0A 3WL0A 3EDDA 4PN2A 3SUUA 1R86A 1HJSA 2VT0A 1QI5A 1C7SA 2Y5EA 2D1ZA 5AYBA 3NYDA 4NSBA 2WCGA 1KGUA 2J8GA 1CENA 1EH9A 2WNWA 2GUYA 3ZR5A 5IFTA 1C93A 2X0HA 3WD4A 2ZXAA 2EPLX 1UWUA 3AMDA 1GVIA 2DSKA 4EE9A 1IZKA 3VGFA 1CGWA 1US3A 3KL3A 4WTOB 4WKHA 1ZJBA 2WZEA 3CZGA 2VCAA 1BYDA 4UNIA 3AHZA 3AICA 1BSIA 1BHGA 3UR7A 4NF7A 1OBAA 3OGRA 4Q7NA 3F5KA 3U5UA 2EQDA 3WF3A 1HJQA 2IXUA 5A6BA 1NP2A 5I5RA 4FF5A 3LPGA 5C71A 4U3CA 2FH6A 4H2CA 1ZBCA 2VR5A 5DT5A 3AQUA 2XPKA 4E4PA 3DC0A 1PIFA 4TX8A 1TVNA 2XVPA 4CU7A 3UG4A 2BS9A 1Y7VA 4AMCA 1SYTA 1MQRA 2WWCA 3VMNA 3SCQA 3FAWA 3W24A 4JL2A 2YL8A 4W8BA 5A6AA 1CGVA 4DWSC 4TVUA 3EDJA 2BV9A 4P7NA 5HBFA 1C91A 3B8SA 1UD5A 4HPGA 3QOKA 1EZZB 2JF7A 2EEXA 3BAIA 1GOIA 2WMKA 4CD8A 1J0JA 1V3LA 5DF0A 1X6LA 2A0FB 4CN1A 2GFTA 3K8KA 1VF8A 2ZX9A 4DM1A 1H4PA 3AOFA 1OT1A 1GJUA 3AIQA 3N13A 4IM4A 2G4FA 2JEPA 2D24A 3FY1A 1BYCA 1V02A 3K4DA 4YHGA 1HF6A 2DSUA 1FP9A 3ALFA 1JZ2A 4P8WA 2WBGA 1F4AA 2WHLA 2X8RA 3D3AA 3ZM8A 4JCMA 1LWJA 1GHSA 3AHYA 4J27A 2YWWA 4P7QA 5EFDA 4D6GA 2RGLA 5HNNA 5GNZA 2V5DA 1W9VA 2OWXA 3W0KA 1QI4A 4CGTA 1ZBVA 5DMYA 3NUKA 4U2ZA 3WNLA 5D9PA 1BG9A 1GOWA 1OT2A 3TOPA 5E0CA 5BXTA 4E2FB 3PTQA 4W8LA 3T2QA 1LL7A 1KCKA 3ZT7A 1ZA1B 1OB0A 5I0DA 3VGEA 2BY1A 1J10A 1M01A 2OYKA 3EYPA 1XH2A 3AS2A 1ODUA 3WMBA 1E71M 2V38A 1HJVA 3I3EA 3VIJA 3W38A 6AT1B 5A6LA 1Q6FA 3AS1A 2CYGA 5CLTA 1DHKA 3PHAA 2CIPA 3GXFA 3ZJ6A 1LJYA 2YLLA 4TXEA 2WHKA 3RO8A 3MO4A 4QLJA 5CSYA 1H41A 8ATCB 2GJPA 1VIWA 4TOQA 2D0FA 1BYAA 4H04A 4D6IA 3ZT5A 2GDVA 1QBAA 3II1A 2DH2A 1E6XM 2J7GA 3GYCA 4CD6A 1KCLA 4M1RA 4C7DA 3SCSA 4QLLA 1XCWA 4JCLA 1ITXA 4AZIA 1KWKA 3CO4A 5LYRA 3WD0A 3HMCA 4AZ7A 1CXLA 3ZOAA 5BROA 5A6SA 1D3CA 3I3DA 3ZIZA 1E15A 3AMKA 1PX3A 1NWUA 1DP0A 4KRUA 3N11A 1B3XA 3WH5A 2FHCA 4C7GA 5FD0A 3WEZA 1LLOA 5CJ5A 2XWEA 4UFMA 1UR9A 3WF0A 3W25A 1I5OB 1HN1A 3POCA 1B1YA 3RMEA 3HN3A 2E4TA 4BA0A 4HMCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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