4AMCA

Crystal structure of lactobacillus reuteri 121 n-terminally truncated glucansucrase gtfa
Total Genus 272
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
272
sequence length
1019
structure length
1019
Chain Sequence
QYYIDPTTGQPRKNFLLQSGNNWIYFDSDTGVGTNALELQFAKGTVSSNEQYRNGNAAYSYDDKSIENVNGYLTADTWYRPKQILKDGTTWTDSKETDMRPILMVWWPNTLTQAYYLNYMKQHGNLLPSALPFFNADADPAELNHYSEIVQQNIEKRISETGNTDWLRTLMHDFVTNNPMWNKDSENVNFSGIQFQGGFLKYENSDLTPYANSDYRLLGRMPINIKDQTYRGQEFLLANDIDNSNPVVQAEQLNWLYYLLNFGTITANNDQANFDSVRVDAPDNIDADLMNIAQDYFNAAYGMDSDAVSNKHINILEDWNHADPEYFNKIGNPQLTMDDTIKNSLNHGLSDATNRWGLDAIVHQSLADRENNSTENVVIPNYSFVRAHDNNSQDQIQNAIRDVTGKDYHTFTFEDEQKGIDAYIQDQNSTVKKYNLYNIPASYAILLTNKDTIPRVYYGDLYTDGGQYMEHQTRYYDTLTNLLKSRVKYVAGGQSMQTMSVGGNNNILTSVRYGKGAMTATDTGTDETRTQGIGVVVSNTPNLKLGANDKVVLHMGAAHKNQQYRAAVLTTTDGVINYTSDQGAPVAMTDENGDLYLSSHNLVVNGKEEADTAVQGYANPDVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAPSTEKNSGNSAYRTNAAFDSNVIFEAFSNFVYTPTKESERANVRIAQNADFFASLGFTSFEMAPQYNSSKDRTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGMSEPNKYGTDEDLRNAIQALHKAGLQVMADWVPDQIYNLPGKEVATVTRVDDRGNVWKDAIINNNLYVVNTIGGGEYQKKYGGAFLDKLQKLYPEIFTKKQVSTGVAIDPSQKITEWSAKYFNGTNILHRGSGYVLKADGGQYYNLGTTTKQFLPIQLTGEKKQGNEGFVKGNDGNYYFYDLAGNMVKNTFIEDSVGNWYFFDQDGKMVENKHFVDVDSYGEKGTYFFLKNGVSFRGGLVQTDNGTYYFDNYGKMVRNQTINAGAMIYTLDENGKLIKASYNSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Alpha-1,6/Alpha-1,4-Specific Glucansucrase Gtfa from Lactobacillus Reuteri 121
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUCANSUCRASE
molecule tags Transferase
source organism Lactobacillus reuteri
total genus 272
structure length 1019
sequence length 1019
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01473 CW_binding_1 Putative cell wall binding repeat
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.20 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. Aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit, C-terminal domain 4amcA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4amcA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4amcA04
3WMSA 3W53A 3PN8A 2VQTA 1ISVA 2BHZA 3CMGA 2UWFA 1FH9A 3QOMA 2OWWA 1XCXA 1R8LA 3WF0A 2B31A 1B3XA 5IFPA 3OGSA 1E72M 1CEOA 1HVXA 4XV0A 1X1NA 1BG4A 3AIWA 3SCNA 1ISXA 2XWEA 3MSGA 4UCFA 1J11A 3TTSA 5E9AA 1UYQA 1XYFA 3OIHA 2QPSA 4HMDA 3VD9A 3VO0A 1W3LA 6AT1B 1B3ZA 5AY7A 2E3ZA 4TTUA 2EXOA 3B9DA 4W86A 4D1IA 2WWDA 3MPUB 3GYCA 4GZIA 2UY5A 2WXDM 2WVVB 3NJ3A 3WFLA 2DSZA 3HN3A 1FH7A 4QP0A 4YHGA 4BS0A 1R87A 3VMOA 1KGXA 4W8BA 1GHRA 1R85A 2Y5EA 5M17A 3ARQA 1ZJAA 5I0DA 2BV9A 2CHNA 1E40A 1UR8A 5AYIA 5FKYA 1ZBCA 3EDDA 2FGLA 5M5DA 3J7HA 1BVZA 2CBVA 1QHPA 1CGWA 3WN6A 2XVLA 3WQ5A 1TVNA 3RM9A 4AZHA 2CKRA 1XH0A 2XM2A 1KCLA 3PZGA 4GPNA 4UZUA 3F4VA 1ZA2B 3NYDA 2V38A 2X1IA 3B9AA 1V08A 3PTMA 4HTYA 2JF6A 4Z2IA 5AC5A 2XFRA 3K8LA 1ZB5A 2W5FA 2VT0A 2PF0A 1UWQA 2WC7A 5DT5A 3O6AA 1HNYA 4U5IA 1AT1B 1QNSA 1W3HA 2WSKA 3CTTA 1PZ3A 1JAKA 4E8CA 3AFBA 4J28A 4Z2HA 5CG0A 4JZ5A 3AS3A 2WNWA 4AYSA 2V3EA 2WVTA 2WZEA 4GXPA 1XV8A 2PWHA 4D6EA 2DIJA 3A6OA 1Z32X 2XSAA 3EDEA 3AHXA 4ZXOA 2IUZA 2IXUA 1E6XM 1E0VA 2Y8KA 4OJYA 1GVYA 1OINA 1JZ5A 4OUEA 3WENA 4J3TA 2YDQA 2HVMA 2F61A 2VR4A 1ISWA 4AD3A 1WDQA 1BYDA 3L4WA 3UERA 4QDMA 3MMWA 4GI6A 3SCQA 4MNLA 4CN4A 3GXDA 4IM4A 3VMPA 1UQYA 4EKJA 4M29A 1HJXA 1QI3A 1HKIA 1V3JA 2A3CA 1ISYA 3GH5A 1KWKA 1FP8A 2GVYA 3SCUA 3VNYA 3UESA 5FOOA 5EBAA 2Y4SA 1GOIA 1CENA 5A2AA 1JD7A 4TXEA 4HOWA 2VL4A 4TX8A 3RJYA 1E1EA 4LYQA 1ZBWA 1E4LA 1KXVA 1M04A 1E43A 1Q6GA 5IHSA 2VURA 1JG9A 3AZRA 3W29A 2AOSA 5A2CA 3GH4A 3MMUA 2V5DA 3AMKA 2EQDA 4DM2A 1OGBA 3DHUA 3WUBA 1NOFA 1B3YA 2HSEB 1OIMA 3WBEA 1ESWA 3CHEA 3O2LA 4UOJA 1W1VA 4MDOA 3WF4A 2J62A 1UKPA 2XHYA 4S3JA 1GOMA 3QHOA 3ZO9A 1HP4A 3M7SA 1OGSA 4CD6A 4GINA 1E0WA 4AZCB 1GHSA 1C91A 2OWXA 3W4RA 2CETA 3VIIA 4ZFMA 4W5UA 1UD8A 1TE1A 2DSKA 2X09A 2W4XA 4CU6A 4KGLA 1CTNA 3VPLA 2XJ7A 3N1AA 1JZ8A 4U3AA 2WCSA 2GDVA 3VDHA 2D3LA 2EPLX 3SEPA 1H0GA 1UUQA 5FCZA 2CXGA 4NI3A 4KH2A 4DM1A 4FLRA 4JFWA 1UG6A 4AD4A 3SCOA 1W9VA 4V27A 1PX4A 1OD0A 1PAMA 1SMAA 2D24A 5HDRA 3RMEA 4LX4A 2AAAA 3CMJA 1VEMA 4JIEA 5EFFA 3VIJA 2XPKA 4N42A 1Q95G 4HOZA 1HN1A 1GJWA 2FZKB 4ACYA 5JBFA 1HJSA 5IXEA 2YA2A 3A4AA 1VIWA 1E6QM 1LG2A 4AT1B 4JHOA 1TZ7A 4EK7A 3UR7A 3SCRA 2IXVA 1E0XA 1RAEB 4UOZA 4P7OA 3ZIZA 1ACMB 2CEQA 5I79A 2YL8A 3PZ9A 4D6CA 2EPKX 1CXFA 5GPRA 4QCEA 3AHZA 1EH9A 1FA2A 4NRRA 1CXEA 3VD3A 1NOUA 5A95A 1P6WA 4MB4A 3CHCA 4CCEA 1JDCA 1GOQA 3TOPA 1QI4A 3UG5A 1F1BB 3A47A 2OYKA 4FLSA 2PWFA 1WDSA 4AD5A 1FHDA 1QI2A 1OCQA 2FHBA 3DC0A 4UFHA 3BH4A 1ODUA 1YQ2A 1PIGA 1E6SM 4QAWA 4AZIA 2FZCB 4B15A 1KBKA 5JIPA 1WPCA 1LJYA 1AQ0A 8AT1B 1D7FA 1Q6CA 3N11A 1XC6A 2VO5A 2BE7D 1TUGB 3N15A 1ITCA 3FAWA 3MV01 2XVKA 4J27A 4F66A 3B9EA 2BY3A 4JFSA 2A0FB 3TTQA 2VNCA 3BCDA 5E0CA 4M82A 3QR3A 1BQCA 5KZ6A 2CBJA 1K9EA 2DH2A 2CNCA 5BROA 4K68A 1BYBA 2C8NA 3RM4A 3WQ6A 3MO4A 5JUVA 2WMFA 4MNJA 4X9YA 3AI0A 1MW3A 1FOBA 3DYOA 3BSHA 4NSBA 4PMDA 3T09A 3CO4A 4KRTA 2ZUUA 4UOQA 1EO7A 3ZSSA 3VOCA 1H11A 3GH7A 3MKKA 4CD4A 1CIUA 2E8YA 2J47A 4TUFA 1A3HA 5D9PA 2J77A 1U2YA 1DP0A 2YBUA 2V3FA 2VI0A 2X8RA 2W62A 4IUGA 4L4OA 4U31A 4LYPA 4BQ3A 1LWHA 1WP6A 2PWGA 3WH8A 3AXIA 3BLPX 1V0MA 4X0VA 2GDUA 3OLGA 4CUCA 2VVNA 4ATDA 1JYVA 2FDMA 3S2CA 7CGTA 1BYCA 5GNZA 3L2MA 4Y7EA 8A3HA 4WIWA 3SCTA 3W0KA 4H04A 5E70A 4UQDA 2OSWA 1AMYA 1JXJA 5IDIA 1OWQA 3OZOA 4PCSA 4UFLA 3VGHA 2VZSA 3T2OA 3ZJ6A 5A6BA 4R5EA 2ZX7A 5E0FA 4TTGA 5HPCA 2AT1B 2XUCA 3SUSA 2CPUA 1JDDA 2YA1A 3WD3A 4V2XA 1PX3A 4QCFA 1CGVA 2D23A 2WHLA 4AIUA 5A6LA 1HJQA 1UOKA 1HVQA 4DUWA 1GORA 5M3WA 2CHOA 4PYSA 6A3HA 1V6UA 3U5YA 2JF7A 3GZAA 5BRQA 4Z2GA 3RM8A 7AT1B 1PIFA 4D1JA 1C93A 5D9NA 3WL0A 5I3DA 1BG9A 2D3NA 4AD0A 1CDGA 1J12A 3AIUA 2G3JA 2VOTA 1BTCA 1LLOA 3MUZ1 2CYGA 4HMCA 3D5HA 3VX0A 5I6SA 3U7VA 3OB8A 5CLTA 4XZWA 1W91A 1FHLA 3WD1A 1JL8A 5KEZA 1EOMA 4DWSD 3T2QA 4Z2LA 2FZGB 2WVUA 4WLCA 2PI6A 3ARWA 3GM8A 1UH2A 3CUHA 5E6YA 1NWUA 3AHYA 1MFUA 1ODZA 4GO9A 2BNJA 5D9OA 1CBGA 2W66A 4HMEA 2ZX8A 3WDHA 1KQYA 4HPGA 4W8LA 1RPKA 3WKZA 1EQCA 3L4TA 1VJSA 3AMCA 1BVNP 1GW1A 4V28A 1UHVA 4MPKA 3U57A 3VDAA 2NSXA 4JKKA 2XIIA 3ZT5A 1J0YA 2WBGA 1MW0A 1U33A 1SYTA 1X6LA 1RH9A 1QNRA 4BQ2A 1E70M 2GJRA 1JI2A 1XD0A 4NRSA 1HJVA 4XB3A 2ZUMA 1NARA 3CBWA 2VQUA 1JF6A 3CH9A 6TAAA 3KE0A 1HXJA 4DWSC 4DUXA 1HJWA 4KH0B 2WVSA 1G5AA 3L4VA 3VILA 4NZCA 3RJXA 5A3HA 4BA0A 3ARSA 4UTFA 4W93A 4W7UA 3I3BA 1RP9A 3K8MA 3RPMA 3RCNA 5BRPA 5IHRA 1ZBKA 4U5KA 2G41A 4PMNA 1R0CB 1W1PA 3NDYA 5IFTA 4GZEA 2JE8A 2FH8A 4FYYB 1EIBA 4AZCA 5CPSA 2CBIA 5ECUA 2WANA 2AIRB 3MUY1 5F7UA 4CD7A 4JL1A 1CLVA 2WSPA 3L4XA 1YHTA 2CITA 2WHMA 1UWIA 2CESA 2YDSA 4PCTA 3M46A 1UKQA 5A6MA 1QNQA 2EJ1A 1RAIB 2YJQA 3BMWA 3WMBA 1SR0A 2YOCA 2ESCA 3BGAA 1GVIA 4PMYA 1MXDA 2PBOA 3ALFA 4WJXA 1J0ZA 4KGJA 3QOKA 4WK9A 5A1AA 2BXYA 2J78A 4WTOB 4HA4A 2J25A 1H41A 4WKAA 1H1NA 2WLZA 3ZSTA 2MANA 2YWWA 3CZJA 3IJ8A 3L2LA 3CLWA 1CGYA 3ARZA 3EDKA 4HU8A 2NW0A 1K9DA 3MSDA 2E4TA 1RAFB 1KBBA 3CIVA 2GFTA 5FL1A 1LL4A 1OT2A 1X6NA 2WHJA 5A6KA 1J10A 1UD3A 1Q4NX 1QBBA 3FHAA 4H2CA 1JDAA 4KGZB 1UWRA 1E3ZA 1HIZA 1W9BM 3ALGA 3NSMA 5HXMA 5CGTA 1B2YA 3AMGA 3D7SB 3OGVA 3ZR5A 2YL9A 1XH1A 9ATCB 3POHA 2PC8A 3W24A 4W87A 3N17A 4HZ7A 5FIPA 3WH5A 1BYAA 3M07A 4F04B 1JNEA 1HL9A 3FAXA 1R0BG 3AQUA 4LQ1A 1MQPA 2J75A 1E6RA 1VBRA 2ZXAA 3FNDA 4N0RA 8CGTA 3VD4A 3AIVA 2EO7A 2J8GA 3PTKA 4TVDA 3K1DA 2V5CA 1RADB 4PMVA 1WE5A 4ATLA 4JFVA 3RIKA 1J18A 3WIJA 3EBVA 1R86A 2V3DA 4P8UA 3WQ4A 3GXIA 4WSJA 3ZMRA 4UFKA 4W85A 4KH1B 3IAPA 3VIFA 2WAGA 4ZENA 2G4FA 1I1WA 3AS1A 4UFIA 1JZ2A 3WD0A 3W38A 2VRJA 4H8UA 2CBUA 3PZQA 1NWTA 4PMOA 1QVBA 2YA0A 3WF2A 2BVDA 1LG1A 2XSBA 1PZ2A 5EB8A 2F2HA 4W8AA 3AHVA 1UD4A 3HJEA 5CGMA 1E4IA 4MB3A 5I5RA 1EGZA 3WQWA 5BXPA 4GO8A 3IK2A 1XSJA 1G94A 3OZPA 1JI1A 1RAGB 1CYGA 2JIEA 1B3VA 1GQIA 4LPCA 2G3IA 2WZHA 3VTRA 1C90A 4OOZA 1AVAA 2WCAA 3OG2A 3T0AA 1EO5A 1Q6FA 1V6VA 1QBAA 1MXGA 2RGLA 3K4DA 1CPUA 1NP2A 5JBEA 1DEDA 4XX6A 1HF6A 2EBNA 1PG5B 2CCRA 2ZUVA 3DYMA 3OA5A 4MB5A 4R27A 4TVUA 4AW7A 3ZR6A 5C8BB 2CKSA 3NSXA 3CPUA 4J3SA 1EXPA 5CSUA 1E56A 4W84A 5AYBA 2XGBA 1EDTA 2ZUSA 1GQJA 2WC3A 4AD1A 1UR0A 2W61A 4Q7NA 3TTOA 4AZ7A 3G6LA 2EPNA 1JIBA 4CCDA 3ZT6A 1JNDA 1XHGA 3KWXA 5LYRA 4C7GA 2XVPA 3VDBA 5EFDA 2J7GA 1TA3A 3VINA 1SMDA 1MFVA 1GPFA 4PN2A 3WY1A 3CZ8A 2J7EA 3VKKA 5JBDA 3WF1A 2VMFA 1XD1A 4PMUA 1TG7A 1WDRA 3CHDA 3UR8A 2UY4A 3GBEA 4IPLA 1SKUB 3WDPP 1H4PA 1N82A 1KQZA 2EEXA 1I5OB 5A6SA 1J01A 4IPNB 5TD4A 3ZM8A 4FK9A 1GNXA 3AZSA 4UNIA 3VIPA 1CGTA 3N12A 1JZ6A 3BSGA 1E73M 1IT0A 2O9OA 1L0PA 4AC1X 3BMVA 2WMGA 1FFRA 1KXQA 2E0PA 2ZXQA 3NCOA 3SCWA 4Q22A 3PZVA 3BXWA 2QLYA 3D3AA 1RP8A 4YHEA 1UWTA 1CECA 1Y7VA 1F4AA 3ARRA 3KLKA 1LWJA 5HPOA 4AD2A 1RAAB 1DWJM 4OZOA 1E6PA 4KMQA 3PTQA 1J0IA 4W5ZA 4U2ZA 2J8FA 3PZOA 3VIOA 2BFGA 2VRKA 3AXXA 1V3IA 3CUIA 5DEZA 5GQBA 2ZXBA 3K4AA 1US2A 2J7DA 9CGTA 5DFAA 3L4YA 3SCPA 2GK1B 3II1A 1GQKA 2VX7A 1V02A 3MANA 1RABB 2J7HA 5CJ5A 1PX8A 2AMGA 1E15A 2ZIDA 3EDFA 3N9KA 1XH2A 1GZJA 2TAAA 2DSUA 4W88A 1OGGA 2BVTA 5ABFA 3BLKA 1BGGA 3ARYA 3IANA 4GI9A 4AIEA 1XJWB 3SCVA 4HU0A 3KEHA 4WSKA 4C7FA 1EOKA 1C7SA 1UZ1A 1VENA 5D8WA 3ARXA 3ZT7A 3VIHA 5HBFA 3BAXA 4GIAA 3WNLA 4ZE4A 2J74A 3KLLA 4PRWA 7A3HA 4P7QA 4H7VA 2J7CA 1QW8A 5A6JA 2E9LA 2VCBA 1DWGM 1WZKA 3WQ8A 2XYLA 4M56A 4P7LA 3I3DA 1E5JA 3RILA 4GQRA 2WMIA 4KRUA 1BGAA 1TCMA 3B8SA 2XWDA 1UD2A 1OIFA 2BS9A 2Z1SA 4B9YA 2RGMA 2DPEA 1KXHA 3AXHA 4UQBA 4KGVB 4MADA 1V0NA 4DWSA 4CU7A 1HT6A 4M80A 1H5VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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