4AMCA

Crystal structure of lactobacillus reuteri 121 n-terminally truncated glucansucrase gtfa
Total Genus 272
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
272
sequence length
1019
structure length
1019
Chain Sequence
QYYIDPTTGQPRKNFLLQSGNNWIYFDSDTGVGTNALELQFAKGTVSSNEQYRNGNAAYSYDDKSIENVNGYLTADTWYRPKQILKDGTTWTDSKETDMRPILMVWWPNTLTQAYYLNYMKQHGNLLPSALPFFNADADPAELNHYSEIVQQNIEKRISETGNTDWLRTLMHDFVTNNPMWNKDSENVNFSGIQFQGGFLKYENSDLTPYANSDYRLLGRMPINIKDQTYRGQEFLLANDIDNSNPVVQAEQLNWLYYLLNFGTITANNDQANFDSVRVDAPDNIDADLMNIAQDYFNAAYGMDSDAVSNKHINILEDWNHADPEYFNKIGNPQLTMDDTIKNSLNHGLSDATNRWGLDAIVHQSLADRENNSTENVVIPNYSFVRAHDNNSQDQIQNAIRDVTGKDYHTFTFEDEQKGIDAYIQDQNSTVKKYNLYNIPASYAILLTNKDTIPRVYYGDLYTDGGQYMEHQTRYYDTLTNLLKSRVKYVAGGQSMQTMSVGGNNNILTSVRYGKGAMTATDTGTDETRTQGIGVVVSNTPNLKLGANDKVVLHMGAAHKNQQYRAAVLTTTDGVINYTSDQGAPVAMTDENGDLYLSSHNLVVNGKEEADTAVQGYANPDVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAPSTEKNSGNSAYRTNAAFDSNVIFEAFSNFVYTPTKESERANVRIAQNADFFASLGFTSFEMAPQYNSSKDRTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGMSEPNKYGTDEDLRNAIQALHKAGLQVMADWVPDQIYNLPGKEVATVTRVDDRGNVWKDAIINNNLYVVNTIGGGEYQKKYGGAFLDKLQKLYPEIFTKKQVSTGVAIDPSQKITEWSAKYFNGTNILHRGSGYVLKADGGQYYNLGTTTKQFLPIQLTGEKKQGNEGFVKGNDGNYYFYDLAGNMVKNTFIEDSVGNWYFFDQDGKMVENKHFVDVDSYGEKGTYFFLKNGVSFRGGLVQTDNGTYYFDNYGKMVRNQTINAGAMIYTLDENGKLIKASYNSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Alpha-1,6/Alpha-1,4-Specific Glucansucrase Gtfa from Lactobacillus Reuteri 121
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUCANSUCRASE
molecule tags Transferase
source organism Lactobacillus reuteri
total genus 272
structure length 1019
sequence length 1019
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01473 CW_binding_1 Putative cell wall binding repeat
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.20 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. Aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit, C-terminal domain 4amcA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4amcA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4amcA04
3CZ8A 4FLRA 1E56A 5A3HA 1R7OA 2XTKA 1VFOA 4GXPA 3BXWA 1W91A 2OWWA 2VVSA 1CLXA 3AMCA 2WC4A 3BMWA 1XH2A 3B9AA 2J7FA 5D9MA 4AD2A 5I3DA 2E8YA 1E40A 2YDQA 1HNYA 3AXHA 2NT0A 1BG9A 1UD8A 2WHLA 5A6KA 4CD8A 4DM2A 1WZLA 1JZ4A 1CNVA 2GUYA 3ECQA 1OINA 4TOQA 2DEPA 1LL4A 4NZCA 3FHQA 5I78A 1W9BM 2YBTA 3UG3A 2CEQA 2GVYA 4FK9A 5JBFA 1DTUA 3A6OA 4CKQA 2E4TA 1SYTA 1NOFA 2Y5EA 3AI0A 2J25A 3CUJA 2UWFA 1JD9A 4CCEA 2CPUA 2CBJA 2JF6A 4GI6A 2XPKA 5D9PA 2WC7A 2DQXA 4CU8A 4QFUA 1H41A 1J18A 1EOMA 4D6JA 2EPOA 1XH1A 2PWEA 2O9OA 1JD7A 2XG9A 5DT5A 1OIFA 4Z2JA 2J8FA 3T2OA 1R85A 4LQ1A 1O6IA 1UZ1A 4PBGA 3W25A 4ACYA 1FH9A 4X0VA 2WSPA 1CLVA 1WNOA 1ZBKA 2VRQA 4P7OA 1UQZA 5CPSA 1RAFB 4WLCA 4ZENA 4JFVA 1BF2A 1TVNA 1G0CA 4MADA 1E0VA 1KR1A 1JNDA 3WENA 5I5RA 2YA2A 4JL1A 4Z2HA 5ABHA 7CGTA 2D0HA 2PI6A 1HX0A 3U57A 4JCMA 2BNJA 4UQCA 2E8ZA 1CZ1A 2AAAA 5A8QA 2ZICA 4BQ2A 3WL1A 3BAYA 4OBRA 1UWIA 1UH4A 1OT1A 4CD7A 2OSYA 5BCAA 2DT2A 3W6LA 4AT1B 4OOZA 4R27A 3AXXA 2WSKA 2WKGA 3AYSA 1HJWA 1NOWA 1QW9A 1DWGM 5HNNA 1MVYA 2XVPA 3AMLA 1XSKA 1XYZA 4GZJA 3POCA 5ABFB 2G4FA 5EFDA 4MB5A 4U2YA 3TA9A 1UR2A 1E0WA 2V3DA 3VM7A 4KWUA 2GK1B 1UD3A 1EDTA 1VRXA 2BY2A 5D9OA 4S3JA 1JXJA 1J11A 4HA3A 1W2VA 2XVNA 3NJ3A 2VQUA 4EANA 2WMJA 1BYDA 2BY0A 3GH5A 5EMYA 4W5ZA 2WBGA 1BG4A 2EPKX 1B9ZA 1GORA 2X0HA 2UY5A 1XCWA 1OSEA 1CGYA 3W4RA 3PZNA 4GQQA 2FZCB 5A6BD 3ARWA 3PZIA 1WAWA 3WUFA 4HMDA 5CLWA 3CH9A 4ATWA 1DWJM 4RE3A 3FHAA 2CERA 1EDGA 3ARYA 1CECA 1GQJA 4DWSA 4EK7A 3AFBA 2FZKB 4NRSA 4PSPA 1MWOA 1I1XA 2D1ZA 3SIMA 4WKHA 4GQRA 3EMZA 2DGAA 5TD4A 4S3KA 1B0IA 1DEDA 2VUYA 1W9XA 3WDRA 3VU2A 3AXIA 4V2XA 2YBUA 2CETA 4Z2GA 1KR0A 2W5FA 3AHTA 1EGZA 1MFUA 3BAKA 3NIYA 2CYGA 4M8UA 5A6AA 5IFTA 2PWGA 2G3JA 1GOKA 4UFMA 1UD6A 1NWUA 1CXEA 3EDEA 5EFFA 1TE1A 1HJXA 1VFMA 5E6ZA 3ARRA 3GBDA 5DFAA 5JUVA 3CZJA 4U5IA 2WVVB 4W89A 3AMGA 4H8HA 4D6GA 4GIAA 4DWSD 1J9YA 4OBSA 3WD3A 3F4VA 4AD0A 4AZ6A 3SCQA 3PZTA 3VILA 3AIWA 2YL5A 1B90A 1C8QA 2ZUWA 1ITXA 4GZEA 2VVNA 4PCSA 1S46A 1FOBA 3VD5A 4JFUA 1HT6A 2WVVA 5DEZA 2EPLX 2OYMA 2VCAA 2GJRA 1V0MA 1UA7A 2V3GA 3PZMA 4F04B 4PTXA 5E70A 4D1JA 3U5YA 3TTYA 4P7QA 4JFSA 5ABEA 3VDBA 1R0BG 1RAGB 3RM9A 4KGXB 4PMDA 2VCBA 3WDJA 1IZKA 3N17A 1TMQA 4HA1A 2GDVA 3BAXA 4H41A 3WUEA 1PX3A 2ZUUA 3SCRA 2XWDA 1E73M 2EXOA 3GYCA 2JF7A 4WKAA 1H2JA 4MJ2A 3L4UA 3M07A 1JI2A 5JIWA 4U2ZA 2V38A 3VGFA 2E3ZA 1OGBA 1VF8A 4PSRA 4JZ5A 4W93A 1KWKA 1Q95G 1EDQA 1ZL1A 3B8SA 3WEMA 3BC9A 3G6LA 4PMYA 1NP0A 1JYWA 1L0PA 1RAHB 1GOQA 3SCVA 3ARVA 5D9NA 5A94A 3UG4A 4NSBA 1CPUA 4TTUA 1W9VA 1CTNA 3WF2A 4E2OA 2WCGA 3EDJA 2G3NA 3AZRA 1XD1A 5E9AA 3SUSA 3WH7A 2PWFA 4P7RA 3L2MA 4M80A 2GFTA 3TP4A 1A3HA 4B3LA 3MMUA 4W7UA 3W82A 2XGIA 3L4YA 4KH0B 4MNKA 1HF6A 2YKKA 1TU0B 1QHZA 1MW2A 3DYPA 4M81A 4X0NA 1EQPA 2FHFA 1KXQA 3ZSSA 1EA9C 1YHTA 5IXEA 1NP2A 2WXDM 4LPCA 1CXFA 5LA2A 1GPFA 3CUGA 3TOPA 2E40A 3I3DA 5BWFA 2OLHA 4D71A 3AYRA 4PTVA 3KL0A 3W24A 1GHRA 1HKJA 1UH3A 3AQUA 3W81A 3VDHA 3BAWA 2W62A 2D24A 2WANA 3J7HA 5CJ5A 1EZZB 2MANA 3MMWA 4ACZB 3ARQA 3VIFA 3AMDA 5A8NA 4PMZA 3F5JA 3DYMA 3PZQA 2JIWA 5I79A 5AC5A 1EXPA 3ZMRA 1WKYA 3ARPA 4MDPA 4CCCA 4P8XA 4E4PA 5BXPA 3G6MA 2BY1A 3VOCA 2NW0A 2Y4SA 5BXTA 5IHSA 2VTFA 2V3EA 3CHDA 3PZOA 5A2CA 3IJ9A 4IPNB 1GOMA 1LL7A 1QVBA 3AIVA 1CDGA 1DWAM 4CD5A 4L4PA 3T2PA 4TTGA 2CBUA 3PHAA 1W3JA 1PZ3A 3VNYA 1GUVA 5ABGA 3WD2A 4HOWA 1H11A 3VIHA 4A3YA 2PBGA 1JZ6A 1EH9A 1NARA 2VT0A 1EO5A 3WH8A 1JIBA 1VEMA 4B16A 3VDAA 2F61A 3W0KA 1XV8A 3VUPA 2A0FB 1E6SM 2YA1A 7AT1B 1C8YA 1ZA1B 1BPLB 1H09A 3KLKA 1LQ0A 4WTOB 1PIFA 2VRJA 4V27A 4W87A 2WLZA 2JIEA 4DWSC 2XVGA 1JAEA 4HZ7A 1XSIA 1RP8A 3M6DA 1G5AA 3OLGA 3T0AA 3RJXA 2J7HA 1CGXA 1VIWA 2DT0A 1K9TA 2VI0A 3B9EA 2GSJA 2PWHA 4UFIA 2Y2WA 4OIFA 1E4IA 2YOCA 1QW8A 3GNPA 3GXFA 1JYXA 1W3HA 3PZGA 4D6IA 1CWYA 3ALFA 1JFHA 1ISZA 4OZOA 1M7XA 2Y24A 4AZGA 1GW1A 1E4MM 4KH2A 1TCMA 5BXSA 5I24A 1K9EA 8AT1B 2ZOXA 1Y7VA 1BHGA 4XX6A 1QHOA 1NWTA 1PX8A 4JCLA 2C8NA 2E0PA 1V6WA 4PMVA 4UOZA 2BE7D 1AQ0A 1KQZA 1LF1A 2XYLA 1EOKA 5M17A 4KRTA 1BVNP 4MJ4A 1XGZA 3BMVA 2XHYA 2WMGA 3BCFA 3DHPA 3OA5A 4QLJA 4D6CA 1BTCA 3CPUA 3RPMA 1ZB5A 1JF6A 1LL6A 1PG5B 4PMUA 4AZBA 5D8WA 8CGTA 2VZVA 4AYSA 3SCOA 1WCGA 1DWHM 2O92A 4CN4A 3VD3A 3O6AA 1V6VA 3EDFA 1HIZA 2WAGA 3D7SB 3OG2A 2DH3A 1JDCA 3VD7A 3VX0A 3UR8A 3WSUA 5BRPA 1C93A 3NSNA 3T09A 3WDIA 1O7AA 3IJ7A 1NQ6A 4M56A 1QNOA 2HVMA 3VINA 2FGZA 7A3HA 5HOSA 4YPJA 4AXNA 1KBBA 5JBDA 1JG9A 3MSGA 4JKLA 2PBOA 4JKMA 3KEHA 2XFRA 1G01A 3WF4A 1RPKA 3WD4A 4HU8A 2VJXA 1JNEA 4U3AA 4JFTA 4WSJA 2CITA 3W26A 2CNCA 2J75A 1DP0A 2DSKA 3F5KA 1XHGA 4PMRA 2OYLA 3VIJA 5A6LA 1TUGB 3T2QA 3PZUA 4E8CA 2BXYA 1EHNA 1PEZA 1QBBA 2CHNA 3QR3A 5A8OA 2V3FA 4MNJA 2ZUSA 4BCEA 1EO7A 3ZT6A 3ZM8A 1ODZA 4HZ6A 1B3YA 1FH7A 2IXUA 1BLIA 1E5JA 3RO8A 3W37A 1V02E 1FHLA 1AT1B 3VVGA 3PTQA 4KH1B 1PX4A 3MANA 3WFZA 1E15A 3WF3A 4Q22A 1W1VA 1WZKA 1EQCA 5CLTA 3WDQA 3WBEA 2VZUA 1NOUA 1X6NA 1V0NA 3GBEA 1BFNA 3VKKA 2DPEA 5KEZA 3TTOA 1TVPA 5HPOA 2GDUA 3SCTA 4M1RA 1FHDA 1E3ZA 1TA3B 2CCRA 4MNLA 2AMGA 2DSVA 2NT1A 1UHVA 1H5VA 2D2OA 1I5OB 2DDXA 4PN2A 6TAAA 5A6JA 3ZQ9A 3W27A 1CIUA 1KCKA 1UR0A 2WZEA 1FFRA 3VDCA 4MDOA 4F9JA 2C0HA 8A3HA 5GPRA 2YLLA 3ZIZA 1SR0A 1B1YA 3K46A 3OIHA 1BQCA 3LPFA 4LYQA 4CN1A 2EO7A 1WPCA 2X8RA 1QI4A 1UKSA 3ALGA 4AD5A 2DH2A 5A6BA 1XYFA 4J7RA 1E6XM 3DHUA 3N11A 4BQ4A 2D3LA 1J10A 5HBFA 1R7AA 3EMQA 4FF5A 1UKQA 3S2CA 2BFGA 3VX1A 1KXHA 3VGEA 4PTWA 3VD4A 2ZX9A 5DF0A 3A4AA 3ZO9A 1JI1A 2FZGB 2WMIB 3AS0A 2HISA 1GVIA 4GO8A 3VIPA 2DIJA 2EBNA 1ZU8A 1V3LA 1WP6A 5BYWA 1SFSA 1MW0A 4PYSA 4TVDA 4F66A 1B2YA 5ABFA 4Z2LA 1NWSA 4OKDA 1KGUA 3U7VA 1NWRA 1AMYA 4R5EA 2J4GA 1OIMA 1GHSA 2BVTA 4D1IA 1C91A 4D72A 3CHCA 3OGSA 3APGA 3K8LA 2GK1A 3M7SA 4AWEA 3VNZA 1KFWA 4PMOA 5KZ6A 1FP9A 3W28A 1MFVA 2WWDA 5BRQA 1B30A 1JYVA 5M03A 1KGWA 4W85A 2ZWZA 3VM5A 3WQ4A 3I3EA 2XWEA 2CBIA 4F8XA 1ZJBA 1E6NA 2FHCA 1VBUA 1B31A 4V28A 4EAMA 4AZ5A 4GZIA 3LMYA 5HXMA 3GTNA 4TX8A 3ARUA 4IUGA 1SKUB 2BHUA 2D0GA 3RILA 4U3CA 1B3VA 1YQ2A 2PC8A 1E6PA 1J0YA 2D23A 1K9DA 4GO9A 4W86A 1CXIA 1OGGA 4TXEA 1PAMA 4FYYB 1F4HA 1BSIA 1NH6A 3HJEA 2BHYA 2J7EA 3VIIA 3PTMA 3AHYA 3AS3A 2CESA 1KXVA 1B3XA 2XVKA 1ISXA 5JBEA 2J78A 9ATCB 4HU0A 1UD5A 2DSZA 4CUCA 3RM4A 2X2YA 2G3MA 2Y8KA 1C3FA 3MUAA 3WDPP 3QHOA 5LA0A 4PMXA 1MW3A 4Y7EA 3VMOA 1MQQA 1ZS2A 4HOZA 3AIBA 3WEOA 2DT3A 2VRKA 2J47A 1H3GA 2WKLA 3AICA 5CG0A 4BS0A 5EBAA 3N9KA 2WLYA 1DHKA 3CHFA 1GONA 1KGXA 4J3VA 4TVCA 5GNYA 2A3AA 3MPUB 1W1YA 3HN3A 1GCYA 1TFVA 4AIEA 2OSWA 1BVZA 3F5LA 4PTMA 4H2CA 4PUEA 2QLYA 4PMQA 3ZJ7A 4F79A 3SUUA 3O9NA 3WNNA 1QI5A 3WNLA 5A2AA 1V02A 1E3XA 5BROA 2XUCA 2CKSA 4BQ3A 3IANA 3KL3A 3ZJKA 4QLLA 2WMFA 1GZJA 1UA3A 2YJQA 3ZJ6A 1QNQA 5FL0A 4CD4A 3O2LA 2XSBA 3VGHA 5A2BA 5I6SA 4QDMA 2QHAA 2DSUA 1D7FA 1UH2A 1LJYA 2VCCA 1WDRA 2C7FA 2QG9B 2ZX6A 3AHXA 1PBGA 4AEEA 2EJ1A 1AVAA 3FW6A 3MMDA 1UZ4A 2DSWA 5JIPA 3WFLA 2IXVA 1F1BB 1M01A 4KGZB 2BHZA 2ZE0A 1W1PA 2JALA 4PEEA 5FL1A 1FH8A 1L8NA 3WF0A 2XFFA 4TVUA 3WQWA 1IZJA 4W8AA 4AZCB 1GOIA 8ATCB 2NSXA 1M04A 4P7LA 1JYNA 1CXHA 5E6YA 3EDDA 3OLEA 4HOXA 1J0ZA 2FGLA 3LPOA 3VD9A 1CGTA 1JAKA 1VAHA 5CSYA 4TUFA 1UOKA 2ZWYA 2AIRB 3LPGA 1E4NA 3IJ8A 2YWWA 3WH9A 2E9MA 3WMSA 1G9HA 3L4ZA 4W88A 1Z32X 4HZ8A 1HL9A 3MUY1 3L4WA 4JFWA 1LG1A 2IPOB 3NCOA 5I0DA 3WKZA 1VEOA 1RD6A 1W9UA 2V5CA 4PCTA 1B3WA 1HJQA 1WDSA 3OZPA 1RAIB 1JL8A 1PZ2A 2VO5A 1QI3A 1QNRA 1CYGA 2DIEA 3SUVA 2W4XA 2D22A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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