4AMCA

Crystal structure of lactobacillus reuteri 121 n-terminally truncated glucansucrase gtfa
Total Genus 272
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
272
sequence length
1019
structure length
1019
Chain Sequence
QYYIDPTTGQPRKNFLLQSGNNWIYFDSDTGVGTNALELQFAKGTVSSNEQYRNGNAAYSYDDKSIENVNGYLTADTWYRPKQILKDGTTWTDSKETDMRPILMVWWPNTLTQAYYLNYMKQHGNLLPSALPFFNADADPAELNHYSEIVQQNIEKRISETGNTDWLRTLMHDFVTNNPMWNKDSENVNFSGIQFQGGFLKYENSDLTPYANSDYRLLGRMPINIKDQTYRGQEFLLANDIDNSNPVVQAEQLNWLYYLLNFGTITANNDQANFDSVRVDAPDNIDADLMNIAQDYFNAAYGMDSDAVSNKHINILEDWNHADPEYFNKIGNPQLTMDDTIKNSLNHGLSDATNRWGLDAIVHQSLADRENNSTENVVIPNYSFVRAHDNNSQDQIQNAIRDVTGKDYHTFTFEDEQKGIDAYIQDQNSTVKKYNLYNIPASYAILLTNKDTIPRVYYGDLYTDGGQYMEHQTRYYDTLTNLLKSRVKYVAGGQSMQTMSVGGNNNILTSVRYGKGAMTATDTGTDETRTQGIGVVVSNTPNLKLGANDKVVLHMGAAHKNQQYRAAVLTTTDGVINYTSDQGAPVAMTDENGDLYLSSHNLVVNGKEEADTAVQGYANPDVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAPSTEKNSGNSAYRTNAAFDSNVIFEAFSNFVYTPTKESERANVRIAQNADFFASLGFTSFEMAPQYNSSKDRTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGMSEPNKYGTDEDLRNAIQALHKAGLQVMADWVPDQIYNLPGKEVATVTRVDDRGNVWKDAIINNNLYVVNTIGGGEYQKKYGGAFLDKLQKLYPEIFTKKQVSTGVAIDPSQKITEWSAKYFNGTNILHRGSGYVLKADGGQYYNLGTTTKQFLPIQLTGEKKQGNEGFVKGNDGNYYFYDLAGNMVKNTFIEDSVGNWYFFDQDGKMVENKHFVDVDSYGEKGTYFFLKNGVSFRGGLVQTDNGTYYFDNYGKMVRNQTINAGAMIYTLDENGKLIKASYNSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Alpha-1,6/Alpha-1,4-Specific Glucansucrase Gtfa from Lactobacillus Reuteri 121
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Lactobacillus reuteri
molecule keywords GLUCANSUCRASE
total genus 272
structure length 1019
sequence length 1019
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01473 CW_binding_1 Putative cell wall binding repeat
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.20 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. Aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit, C-terminal domain 4amcA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4amcA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4amcA04
1OT1A 4J28A 3KEHA 3ZR5A 2D0FA 1GQIA 3J7HA 3VGBA 2W4XA 5CPTA 3VMPA 2NT0A 1WZLA 1EHNA 2DSKA 5DO8A 2F2HA 2ZX6A 1HKMA 1G1YA 2YL5A 2B31A 5GQBA 4MDPA 3MV11 4CU8A 1M03A 2VRJA 3SCUA 5LA0A 3BMWA 1E55A 3GZAA 4AY1A 7A3HA 3NDYA 1KQYA 3VGGA 4F66A 1E43A 1I1WA 3IJ7A 1QNOA 4PCTA 1QW8A 3G6LA 4JCLA 4V27A 1GPFA 3NSXA 3ZT6A 2YJQA 2WVTA 3GBDA 4GQQA 2DT0A 1YQ2A 1CYGA 4MNKA 4MJ2A 1ISYA 1VFUA 3RM9A 3SUTA 2O92A 3TTSA 6AT1B 4U2ZA 5A3HA 3FAXA 1TMQA 1E56A 2J25A 3WY1A 1NOWA 1B3ZA 1CGVA 4P8VA 4PTVA 2D0HA 4UFHA 5KZ6A 1TZ7A 3ECQA 1CWYA 3KL5A 4XUYA 2QMKA 3CHEA 4W84A 2J8GA 3ARQA 3BSGA 4QP0A 1WDRA 4PMQA 1W3KA 1CXHA 4UQDA 4W8BA 3SCVA 4IISA 1C8QA 4Z2LA 2BXZA 1V3LA 4J7RA 4KRUA 2VCCA 3W28A 1JYVA 1XYFA 2UY4A 4UOZA 2BXYA 8ATCB 4F9JA 2GDUA 2G3IA 1CXLA 1C90A 4FLSA 4MB1A 4OOZA 3PTKA 2WC4A 1ZJBA 4TUFA 2PF0A 1XH1A 3WDJA 2X0HA 5AYIA 2VQTA 2AIRB 2YBUA 1WPCA 4AISA 1JZ7A 2EJ1A 5E09A 2PWGA 1XSKA 4TXEA 1C91A 1BYCA 3L4UA 1AVAA 4PRWA 5E6ZA 1BG4A 1QHZA 3O2LA 1UUQA 1E15A 1E6XM 3W26A 3VUPA 1OB0A 1Q4NX 1JG9A 2J62A 3AIWA 2OYKA 1TR1A 6CGTA 3VGEA 4PMOA 2YIHA 2WC7A 2DT3A 1V02A 2G3NA 4JFSA 4N42A 3SCQA 1MXDA 2HISA 5BRQA 3OGSA 3NDZA 1NP0A 1QI4A 1R8LA 2DGAA 4R5EA 1PEZA 3PZGA 2YWWA 1EQCA 2GJPA 1EDTA 3FHAA 1MFUA 3T2PA 3MMWA 3WSUA 3OZOA 2YA0A 4UQBA 1V02E 1QNSA 4TTGA 3ZIZA 2VUYA 3UEQA 1J0JA 1EO5A 3WUEA 5BXSA 3ZT5A 1DWGM 4WKHA 1IZJA 2D3LA 3CUGA 3WELA 1NWTA 3SUSA 1TFVA 3MPUB 1UD8A 1JYNA 5A6SA 3CUFA 1UWSA 3NSNA 1ZBVA 4AD5A 5A2BA 1J9YA 2DPEA 4DWSC 4M8UA 1CTNA 3KL3A 1XSIA 4UQ9A 1WAWA 5I23A 1CGUA 5FCZA 1IT0A 4CVUA 2GJRA 2A3HA 1R0CB 2EEXA 1UKQA 3WD1A 1BTCA 2CXGA 1V3MA 1JGIA 3K4AA 4HZ7A 2PWEA 1UH4A 1BYBA 1HJVA 1KR1A 4JHZA 2NW0A 4JKKA 3UR8A 2EBNA 3ARWA 3MUIA 1UD4A 4ML4A 3VIJA 3WQ4A 2WMHA 5AT1B 5ABEA 2O9RA 5M17A 4J27A 1C3FA 2WPGA 1JF6A 2E9MA 3WQ8A 1UWQA 3UG4A 2V3EA 1JD7A 3AROA 5CPQA 3PZUA 4E8CA 3IAQA 4XZWA 2GK1B 3GXFA 4H8HA 1K9EA 1BYDA 3PBGA 1QI5A 2OYMA 3VNZA 1BYAA 3CLWA 1E6QM 2YKKA 3AS3A 1LJYA 2WBKA 4PEEA 4PMXA 1BGAA 1L8NA 1LWJA 2XWEA 4EE9A 1HX0A 3WH5A 1XD1A 3OB8A 1KGWA 3WQ5A 3WH7A 4IPLA 3CMGA 4WK9A 3VINA 4DM1A 1KXVA 4BQ4A 2EPMX 2ZE0A 3VKKA 1V0LA 2V3GA 4AIOA 2CHOA 4PUEA 4DUWA 5E0CA 1HJSA 3MU7A 1UD5A 4CCDA 4DM2A 1MW3A 2XGIA 4UQAA 1O6IA 3BAWA 2E40A 1J0HA 3MUAA 2WBGA 3F4VA 2OSWA 1C92A 4PMVA 2HVMA 1QI0A 2V5DA 5LYRA 3B9EA 3TONA 2OLHA 1VAHA 4UOJA 2WVSA 4UFJA 4N0RA 3SCTA 5D8ZA 3VDBA 1H09A 2DSWA 3UR7A 2E9LA 1WCGA 2XFYA 1QOXA 3WNNA 2WKLA 1NH6A 2YL6A 1JFXA 3RCNA 1MW0A 3WMSA 2VNCA 3RJXA 1ZA2B 4P7LA 2DSUA 3E1F1 2OSXA 2XPKA 1UR4A 3RO8A 1GNXA 1CGWA 4FYXB 1E4MM 1NWSA 3PZVA 1KWKA 1Z32X 3AI0A 1A3HA 2DSVA 3T0DA 1VIWA 3WNLA 1W1YA 1E1FA 3BGAA 1JDDA 4GI6A 4IM4A 1BPLB 3ARUA 3LPFA 4W5ZA 1TCMA 4S3KA 4AZ7A 3VTRA 1IV8A 3M07A 3ARPA 4KGXB 2PC8A 3GXMA 4CN4A 3EDKA 2J74A 2OYLA 2BE9B 1QHOA 4KGLA 1ISVA 2WWCA 2XSBA 3O9NA 1US3A 2IXUA 3BMVA 1SMDA 1UWUA 2Y5EA 2EPLX 3FNDA 1H5VA 4PMZA 2FZGB 2XWDA 1V0KA 1DWJM 3QOMA 4KH1B 3BLKA 2GJXA 1NOFA 2WK2A 8AT1B 3AYSA 4Z2JA 3RDKA 1BQCA 2CHNA 1L0PA 4M29A 2AT1B 3W25A 1S46A 1JF5A 4X9YA 4C7GA 5HOSA 4PMYA 3TTQA 3K1DA 4M1RA 4KH0B 1DEDA 4DUXA 3VPLA 5CSYA 1WKYA 4JAWA 4W89A 4W88A 1F4HA 2GSJA 3CZGA 4GXPA 2CITA 3T2OA 1GOKA 1MW1A 4GZJA 1ZU8A 2RGMA 1HJUA 1NP2A 5DMYA 3POHA 3DHUA 3K8LA 2PWDA 1X1NA 3PZOA 2XYLA 3WBEA 4GI8A 1XSJA 2VMFA 1UG6A 5I3DA 5AC5A 2EPNA 4J3VA 3THDA 2A0FB 2WMIA 1RP8A 4XV0A 4D6DA 1OINA 3DC0A 3GH5A 1HKKA 4P7QA 1FP8A 1VEPA 1TTHB 3OLDA 1NWRA 3RPMA 2PBOA 3HMCA 2VZOA 4M80A 4BQ5A 3AISA 2JEQA 5E9AA 1UR1A 1B3WA 3AMGA 4M56A 3EDJA 1QI3A 1DHKA 2DQXA 1UR9A 1E70M 1E4LA 1PIGA 1QNRA 3ZOAA 1B9ZA 3SCWA 3FY1A 3VX0A 4V28A 1B2YA 1W3JA 3OG2A 4AT1B 3EMQA 3VGDA 4LQ1A 2DH3A 2JIWA 1UD2A 4ATLA 2XM1A 3TTOA 1W2VA 1MW2A 5FOOA 2WB5A 3A4WA 4JZ5A 4F9DA 4BA0A 3VDCA 4LXFA 4FLQA 5IXEA 2WXDM 5BWFA 1OD8A 1WB0A 4HOZA 2XVNA 1Y7VA 2YBTA 2NSXA 2WKGA 4EK7A 3AZRA 4EAMA 1TA3A 2BNJA 3L4WA 3VIPA 2WMGA 3AHTA 4GO8A 1HN1A 4J3XA 1A47A 4XZBA 3WEZA 3AHXA 2WMIB 3ALGA 3ARSA 4CU7A 3II1A 4KGJA 1W1TA 1CXKA 4CN1A 3L2MA 1B0IA 1KBKA 4JFWA 4GIAA 3UG5A 2D24A 2PBGA 1EOKA 1E72M 4ZFMA 2WYSA 1JZ8A 4UZSA 3EDDA 3WIJA 2J7FA 1OGGA 3GNOA 3MKKA 1EHAA 1XCXA 4HOXA 3O6AA 1PX4A 1KGUA 2GUYA 4GZEA 5I6SA 1CNVA 2YDQA 1G9HA 5GNZA 4FK9A 3MS8A 4UZUA 5CXPA 5HNNA 3W24A 4QLLA 2FH6A 3MUY1 1W3HA 3DECA 2G3JA 4RE3A 1X6NA 5E6YA 3T0AA 3WUFA 1GHRA 1GUVA 3AFBA 1ECEA 3GDBA 4TX6A 2EXOA 4D6HA 5BXPA 3VIIA 1AQHA 1WDPA 3A6OA 2C7FA 4AMCA 1VBRA 4U5IA 3VO0A 2X8RA 3VOCA 4D6FA 3OA5A 2X05A 1AQMA 3UCQA 3ZJ8A 1KBBA 1W1PA 1XH2A 4HA4A 1KXQA 1FFRA 1J12A 3NSMA 1D7FA 1B3XA 1UR2A 4PTMA 4MNLA 1BFNA 5EFDA 3N18A 2WVVA 1UYQA 5JIPA 1EXPA 5AC4A 3AHYA 4BQ2A 4TOQA 4B9YA 3VNYA 4D6CA 4DWSA 4DWSD 1XYZA 3SCSA 1KGXA 3L4ZA 2ZWYA 3CUJA 1MVYA 2YLAA 4W7UA 2DT1A 3KLLA 4U2YA 1FH8A 4MB3A 4QLJA 4UNIA 1V6UA 1RAHB 1E71M 2VRKA 1DWIM 2V38A 2ZUVA 1EQPA 2YLLA 2XVPA 3SCRA 2Y2WA 1OIFA 1BSIA 2DEPA 4MDOA 2J75A 3FW6A 4W8AA 2XG9A 1E73M 1JXJA 1QNQA 2V3DA 4W85A 1E9LA 2V5CA 5TD4A 2VX7A 2CIPA 3PTMA 3VU2A 5D9MA 1E6SM 2WANA 4ZXOA 4UQEA 4CD8A 3L4YA 2EQDA 3AS0A 4MJ4A 3MMDA 1C93A 1MFVA 1PZ2A 2VL4A 4AD2A 3BAJA 5GNYA 1GONA 1UZ1A 1J11A 1D2KA 2IUZA 2Y8KA 3EDEA 4W5UA 3SCOA 3VIFA 2XGBA 2WC3A 4AYGA 2VTFA 3AT1B 4Z2IA 4CD4A 4KGZB 1TG7A 3GTNA 3WF2A 1UKOA 2QHAA 4DWSB 1RP9A 3THCA 1C7TA 3A3HA 4M82A 1JNEA 9CGTA 4P7NA 1CXIA 4RE4A 2WZEA 5M03A 5HPOA 3L4XA 1KXTA 4PYSA 1XD0A 3WDHA 5IFTA 2VO5A 4IPNB 5BCAA 4MNJA 1J0KA 4JFTA 2XSAA 2VI0A 3VIKA 2JF6A 4PBGA 3QHOA 2XIBA 3WH6A 4E4PA 5BXTA 3ARXA 1OWQA 2VZUA 2DSZA 1V6XA 4EANA 4H8UA 1HJWA 1LL7A 2WCAA 3MMUA 4D72A 1Q6DA 4ZE4A 1UWTA 1U2YA 1CLXA 4CUCA 4AD4A 2VURA 4WF7A 7AT1B 1PPIA 1DWHM 4NZCA 3WEOA 3NYDA 5AY7A 1AT1B 2XFFA 1W9BM 4J3WA 4PN2A 1CZ1A 1LQ0A 4PSPA 4QAWA 4CVWA 3M6DA 1VFMA 4AD1A 4PMUA 4ACYA 2UY5A 1R7AA 3CHCA 4GPNA 3VGFA 1CLVA 3AIQA 3WNPA 1E0WA 3ARZA 2CETA 3CZJA 4MB5A 5D9NA 1VEOA 2EO7A 3EYPA 3EMZA 1O7AA 1HIZA 1M04A 3AIUA 3L4VA 2A3EA 2BHUA 3AIEA 2JFEX 3CUHA 2Z1KA 2W91A 4OIFA 4CGTA 2VX6A 1QBBA 2ZX7A 5EB8A 4HA3A 8CGTA 1VJZA 3CZ8A 1WDSA 5A6AA 3CPUA 4AD3A 4C7FA 4AZGA 2JE8A 3SUWA 1WE5A 2VVSA 3I3BA 3FHQA 2ZUNA 1GOQA 2WLZA 1U33A 4AWEA 5M5DA 1GVIA 3AICA 1E6RA 1H49A 1H0GA 2VR4A 2F61A 4YHGA 5JBDA 4HP5A 4YN5A 1RAAB 1V3KA 3WFZA 1XV8A 1JZ3A 2VJXA 2CERA 3AIVA 4Y7EA 2X0YA 5A8MA 4LX4A 3W6LA 4P8WA 1ZB5A 3DHPA 5A6LA 3UETA 1UKTA 4CD5A 1W9VA 1DTUA 4NI3A 5BXRA 4H2CA 4S3JA 3MSDA 4LYRA 1GOOA 3AYRA 3F5KA 2QMJA 4TTUA 5C70A 1AQ0A 5A8NA 2FHBA 1ZA1B 1E0XA 1LG2A 3W38A 3BXWA 4OBRA 2VC9A 4P8UA 1KR0A 1G01A 2X1IA 4J3SA 1ODUA 3A4AA 2X2YA 2WW5A 5IHRA 1DWAM 4NSBA 2VZTA 4D6IA 3CBWA 1TUXA 2D2OA 4L4OA 1FA2A 3EDFA 1UHVA 2F8QA 2Q8XA 2YDSA 3AZSA 2WCSA 4F8XA 4X0VA 2D20A 2E0PA 4U33A 2E4TA 3AXXA 1LL4A 4FYYB 1CEOA 3M7SA 3OLGA 1SR0A 2CBIA 2D23A 3MUZ1 4BF7A 1PAMA 1ITCA 2VX5A 1PX3A 4NRSA 3GXDA 2BE7D 5DT5A 4AZIA 2JALA 3CIVA 5ABFA 1W32A 2AOSA 2JF7A 2ZXQA 3QHNA 4MADA 1GOMA 2YL9A 1JXKA 2BS9A 5CPSA 1BGGA 2CBVA 1SYTA 4JKLA 5I24A 2FGZA 3APGA 2UY3A 1LWHA 1U30A 4RE2A 5A8PA 4GZIA 1TE1A 2J77A 3T0BA 1JDCA 3NUKA 4AEEA 1FOBA 1XH0A 3S2CA 1XC6A 2WWDA 1CXEA 1EGZA 4UR9A 4DUVA 4FLRA 3GBEA 1ZBCA 3PZNA 1KB3A 3PHAA 1BAGA 3K8MA 2EPKX 1KCLA 4W8LA 1MQQA 2ZXDA 1RADB 5ECUA 1V6WA 1QI2A 2ZIDA 4D1IA 2W61A 4KRTA 2WZHA 2UY2A 2BV9A 5I5RA 4M24A 3SUVA 1EDGA 1EA9C 3VD9A 4UFIA 5A69A 4AIUA 1ISWA 3WDQA 2YL8A 2J7BA 1X6LA 2UWFA 3WDIA 3WD0A 2ZX8A 3GYCA 2WMKA 3CH9A 3DYMA 4LYPA 2VCBA 3ZJ7A 5LA1A 2GFTA 1E40A 4PUDA 4ATDA 1UZ4A 3T2QA 4P7RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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