4AMCA

Crystal structure of lactobacillus reuteri 121 n-terminally truncated glucansucrase gtfa
Total Genus 272
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
272
sequence length
1019
structure length
1019
Chain Sequence
QYYIDPTTGQPRKNFLLQSGNNWIYFDSDTGVGTNALELQFAKGTVSSNEQYRNGNAAYSYDDKSIENVNGYLTADTWYRPKQILKDGTTWTDSKETDMRPILMVWWPNTLTQAYYLNYMKQHGNLLPSALPFFNADADPAELNHYSEIVQQNIEKRISETGNTDWLRTLMHDFVTNNPMWNKDSENVNFSGIQFQGGFLKYENSDLTPYANSDYRLLGRMPINIKDQTYRGQEFLLANDIDNSNPVVQAEQLNWLYYLLNFGTITANNDQANFDSVRVDAPDNIDADLMNIAQDYFNAAYGMDSDAVSNKHINILEDWNHADPEYFNKIGNPQLTMDDTIKNSLNHGLSDATNRWGLDAIVHQSLADRENNSTENVVIPNYSFVRAHDNNSQDQIQNAIRDVTGKDYHTFTFEDEQKGIDAYIQDQNSTVKKYNLYNIPASYAILLTNKDTIPRVYYGDLYTDGGQYMEHQTRYYDTLTNLLKSRVKYVAGGQSMQTMSVGGNNNILTSVRYGKGAMTATDTGTDETRTQGIGVVVSNTPNLKLGANDKVVLHMGAAHKNQQYRAAVLTTTDGVINYTSDQGAPVAMTDENGDLYLSSHNLVVNGKEEADTAVQGYANPDVSGYLAVWVPVGASDNQDARTAPSTEKNSGNSAYRTNAAFDSNVIFEAFSNFVYTPTKESERANVRIAQNADFFASLGFTSFEMAPQYNSSKDRTFLDSTIDNGYAFTDRYDLGMSEPNKYGTDEDLRNAIQALHKAGLQVMADWVPDQIYNLPGKEVATVTRVDDRGNVWKDAIINNNLYVVNTIGGGEYQKKYGGAFLDKLQKLYPEIFTKKQVSTGVAIDPSQKITEWSAKYFNGTNILHRGSGYVLKADGGQYYNLGTTTKQFLPIQLTGEKKQGNEGFVKGNDGNYYFYDLAGNMVKNTFIEDSVGNWYFFDQDGKMVENKHFVDVDSYGEKGTYFFLKNGVSFRGGLVQTDNGTYYFDNYGKMVRNQTINAGAMIYTLDENGKLIKASYNSD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Alpha-1,6/Alpha-1,4-Specific Glucansucrase Gtfa from Lactobacillus Reuteri 121
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Lactobacillus reuteri
molecule keywords GLUCANSUCRASE
total genus 272
structure length 1019
sequence length 1019
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01473 CW_binding_1 Putative cell wall binding repeat
A PF02324 Glyco_hydro_70 Glycosyl hydrolase family 70
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.20 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. Aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit, C-terminal domain 4amcA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4amcA03
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 4amcA04
2A3AA 3AXHA 4HU0A 3GXIA 3AXXA 5A1AA 1SYTA 4UQAA 2BY1A 1RD6A 1PIFA 2X0HA 3VMOA 3WBAA 1XSKA 1UG6A 2ZX5A 1JZ5A 2WVUA 2WWDA 4PMQA 1FFQA 3PTQA 1XH1A 3AMGA 5I78A 2DSZA 1JZ8A 3CTTA 5BRPA 1XCXA 2DIEA 5JBFA 4CU7A 2YBTA 1ITXA 2FZKB 3QHNA 4KGXB 1YQ2A 4AZIA 1MW1A 1W1PA 4J3UA 2OWXA 3OLEA 3BSHA 4IM4A 1UR2A 3B9DA 4KGVB 3WKZA 1VFFA 4UOZA 4CD7A 3FXYA 1NBEB 2XG9A 4PTMA 4IPNB 3W53A 1K9TA 5DT7A 1VJZA 1K9DA 4DWSC 1ZL1A 1D09B 3FY1A 3ARVA 3WMBA 4X0VA 5ABGA 4MJ4A 1J0ZA 4ML4A 3HMCA 1BSIA 2ATCB 4UQEA 1AMYA 2ZUSA 1R7OA 2XUCA 1DEDA 5GNZA 4D6JA 4FYVB 4U2ZA 4OZOA 3A3HA 1QHPA 2ZUMA 2CPUA 2J62A 3SCPA 2XSAA 4M81A 4GIAA 3BLPX 6A3HA 1CENA 3B8SA 1VBUA 5A8MA 1C91A 3RDKA 1ZBVA 4D6DA 4DUXA 2DGAA 3VUPA 2WC7A 3MS8A 3MMWA 4MNKA 2YLAA 1W1TA 1VFMA 4AC1X 4W8AA 2J8GA 4GI6A 2W62A 1E1FA 4UFKA 1XRVA 1OGGA 2WVTA 4UZSA 2V3EA 1W2PA 2CHNA 1PX4A 3MMUA 5BXPA 1VFUA 2V5CA 2ZUUA 4K68A 1B3WA 1QW8A 2VQUA 4V28A 2ESCA 1SMDA 4YN5A 3WH5A 1HJWA 1VEMA 2FDMA 1J0YA 1K9EA 1VENA 3WD0A 5I0DA 3JUGA 1NH6A 1CEOA 1G94A 4AT1B 4R5EA 2D0FA 3WNOA 1E70M 3CHEA 1UKQA 2UY4A 1KBBA 3W6LA 2G3IA 3SUUA 1NWRA 1WZKA 3GBEA 4HOXA 4J28A 3W28A 3BCFA 5ECUA 1KXTA 4IISA 4PCTA 2D0HA 2C7FA 2FHCA 2EJ1A 4W89A 1XJWB 1IZJA 1J10A 3OGRA 4UQ9A 1UR0A 4J3WA 4F8XA 5TD4A 4ZFMA 4L4PA 3NCOA 1N82A 4NZCA 1XH2A 4MNLA 4QLLA 3VNZA 3VMPA 2OSXA 3SUTA 3D3AA 1HP4A 4MB5A 3VKKA 2VCBA 3RM4A 1GQJA 1M04A 2BVYA 3U57A 1HJQA 5CGTA 2VR5A 4ZENA 4LYQA 4CCEA 2D0GA 4PCSA 1JYXA 3AIVA 3WN6A 3VDBA 4Y7EA 3FW6A 5I2UA 2FHBA 4OOZA 4WIWA 1C90A 3M7SA 3QHOA 2J7HA 1E73M 5M03A 1TTHB 3RMEA 3CUFA 2WMHA 2OSYA 1BQCA 5A69A 1E6SM 3F4VA 2VCCA 4MJ2A 1AQMA 1FHLA 2ZWYA 2A3HA 3WD2A 3A4AA 2IPOB 5GQBA 2G4FA 2O9RA 5I5RA 3OLGA 2J25A 1NWSA 2WMKA 2FHFA 3OZPA 4D1JA 3IAQA 1FP9A 4PMYA 1W9BM 2CIPA 4M82A 4KGLA 1BGGA 1ESWA 4NRSA 2J7BA 1SKUB 5BROA 4ZXLA 1QI2A 2DIJA 4FLRA 1HN1A 1C3FA 1CGYA 3RO8A 1Q95G 4CN1A 5C70A 5A8PA 2BV9A 5BXRA 9ATCB 5AC5A 4EE9A 1UWSA 1HXJA 1UH2A 3ZJ8A 3OLIA 4AD2A 2QF8A 4D6CA 4V27A 3CBWA 3UERA 5E09A 2BE7D 1CZ1A 4NI3A 3AIUA 3CO4A 3WDPP 4AY1A 3VIIA 2WHJA 2VRQA 3NDZA 1HKIA 4HOWA 7CGTA 3WEZA 1M01A 3EMZA 2VX5A 2EXOA 2YDRA 3T0DA 4JKKA 2XSBA 2Y24A 4DWSD 1JAEA 3T0AA 1KQZA 3AHVA 1TR1A 2O92A 1RH9A 3WDHA 4B16A 5I77A 3ARXA 1JI2A 2WHLA 3PTKA 1B2YA 2O9OA 3U5YA 1H11A 3BAIA 3KEHA 3L2LA 4ATDA 3IAPA 1JDAA 4FYXB 2ZUNA 4PTXA 4AD4A 2CXGA 4P8VA 1WNOA 2ZXBA 1MQRA 1PX3A 1RAIB 1JAKA 3SCRA 5AYBA 4W85A 4F04B 1W2VA 2PWFA 3PTMA 4N0RA 4CN6A 4R27A 2CERA 1UQYA 1MFVA 2PI6A 4JL1A 2VURA 1NARA 4JKMA 3DHUA 4D6FA 2WKLA 1J0JA 1OIMA 4E2FB 5KEZA 3PZNA 3UR8A 1MQPA 3EDEA 4H8VA 2X8RA 4M56A 1H0IA 3W24A 4TX8A 2TAAA 1KB3A 1HJUA 2DQXA 3ZR5A 3F5LA 4DWSB 2VQTA 2GJXB 1W3JA 3AZSA 4J3VA 3DECA 1OD0A 2BY2A 4AISA 2ZUTA 1V02E 5E6YA 3TA9A 3VIMA 3W29A 4C7FA 4XV0A 4E8DA 4LXFA 2PWGA 4P8XA 4D6IA 3IK2A 3WQ4A 4HA1A 1JG9A 1PEZA 1HKJA 3MUY1 1EA9C 1NOUA 1UD8A 3BSGA 3GXDA 4AD5A 4H04A 1UA7A 6AT1B 1OT1A 4MB1A 4E4PA 5JIWA 1SMAA 4PMRA 1KGWA 4MDPA 2C0HA 2ZOXA 5D8ZA 5DO8A 4S3JA 5IFPA 2WMIB 1B3VA 4F9JA 1DWJM 4MDOA 3WQ6A 1JYNA 5I6SA 1EO7A 4FK9A 3VU2A 3LMYA 1W9PA 1GJWA 2NSXA 3ZM8A 2GK1B 1GPFA 3WUGA 4TUFA 4FMVA 4QP0A 5CSYA 1KFWA 5CGMA 5IHRA 1WZAA 4ACYA 4W8BA 2VNCA 3CZGA 4JHOA 1CGUA 2ZXAA 3WL0A 1ACMB 4BF7A 1E55A 2OWCA 1V6UA 2WZHA 1KXQA 4PUDA 5ABHA 2W91A 2Z1SA 3WNKA 5M5DA 2J4GA 3WF2A 1GZJA 1OD8A 5FKYA 3ALFA 4RE3A 3VX1A 3WF3A 2VZSA 1OBAA 4ZXOA 3AS1A 3FHQA 4BCEA 1UD4A 3VGEA 3QOKA 5E70A 1JGIA 1RPKA 1J0IA 2WYSA 3WH6A 1WAWA 3AXIA 2MANA 1CLVA 1BAGA 4PN2A 3VTRA 4GQRA 4JL2A 5M17A 1RAAB 3MSGA 1W9UA 1WDPA 3SCVA 5A6SA 4JFTA 5IXEA 3RM9A 3GXMA 1PBGA 1B31A 2GFTA 4E2OA 3AJ7A 1XYZA 2CBUA 1EZZB 3AROA 3VD7A 1JZ2A 4JAWA 1RACB 2E3ZA 2QMJA 1QVBA 2A3CA 1CBGA 3J7HA 1H41A 1RAHB 4QCEA 1Q6EA 5FCZA 4Q22A 4AMCA 4DWSA 4YHEA 2JFEX 3KL3A 1UR1A 3ZMRA 4AEFA 2VRKA 4W8LA 2G3NA 4ZE4A 1HJSA 1W9XA 1PG5B 5DF0A 3BMVA 1TVPA 2J79A 2QG9B 3AIRA 4UR9A 5LA0A 3KLLA 5I23A 3GYCA 3N1AA 1WP6A 3CHDA 1E71M 4YHGA 3E1F1 4AXNA 2G8ZA 1B30A 1ODUA 3MUZ1 3B9AA 5EFFA 4D72A 4PMNA 3BXWA 1FH8A 1J11A 2WC4A 2Y8KA 2VJXA 5C71A 2QMKA 3MPUB 1W3HA 1W9DM 3GNPA 1V6XA 1I5OB 3PBGA 2XFFA 1XSIA 4U31A 1H3GA 1Q6FA 1M03A 1UKSA 2G41A 2GK1A 4H8UA 1LL7A 1QNQA 3OLDA 1WZMA 2DSUA 4P7RA 2YL5A 1E56A 1E72M 1G5AA 1XYFA 2XPKA 3RJYA 3L4XA 1CXLA 1RABB 1UR9A 3PZQA 4JKLA 2BS9A 3HZ3A 3SCQA 1UWIA 4NSBA 1V0KA 3WD1A 2VZUA 3CUIA 3K8MA 4MAZA 4M1RA 1MXDA 2GDVA 4AZCA 9CGTA 4H8HA 1B3XA 2EO7A 4GI8A 3WQ5A 4HP5A 1B3YA 1M53A 2D22A 4Z2KA 4CKQA 2YKKA 4QDMA 2XVPA 3PN8A 4KWUA 4U2YA 1BF2A 1TU0B 2W92A 1GOWA 2W67A 3VD4A 1AVAA 1S46A 1E6QM 1V3KA 1UD3A 4HMCA 1CXIA 3PZMA 1JNDA 2DSWA 1SR0A 1KBKA 3WF4A 1VB9A 4AIEA 3UCQA 4W84A 4JFUA 5BRQA 2VI0A 5D9MA 5I24A 2VOTA 2BXYA 3ZT7A 1MVYA 4MAVA 4XUYA 2J78A 4LYRA 1UUQA 4L4OA 1J0HA 2WC3A 2XGBA 3SIMA 3FHAA 2YDQA 1UD6A 4CU6A 1C7TA 1F4AA 1EQCA 3AFBA 3ZSSA 4UOJA 3FAXA 3SCOA 4FLSA 2AMGA 1CGVA 3ARZA 4HMEA 3CZEA 2DT2A 2ZWZA 1EQPA 1JZ3A 3PZUA 2DSKA 4UTFA 2V38A 1J01A 1NOFA 2CBVA 1US2A 4CVUA 1CECA 1BFNA 4HZ8A 3U5UA 2C8NA 4Z2JA 5BCAA 5A6AA 4GQQA 1HKMA 1VIWA 2XWEA 3O9NA 1RP8A 4OUEA 3OG2A 3CUGA 1B9ZA 3CZKA 2OYMA 2QPSA 2VMFA 1JF6A 5JUVA 2VVNA 3OBAA 2X09A 3WUFA 1UH4A 2FGZA 8ATCB 1E9LA 5HBFA 2DT0A 3VNYA 1GOKA 1VJSA 2BVDA 4UFMA 4PRWA 3RCNA 1TG7A 2V5DA 1V08A 1YHTA 2WK2A 4GZEA 3WUEA 2QHAA 5CJ5A 1OM0A 4D6EA 2WVVB 1LLOA 3I3DA 1ZU8A 3AHTA 3HU7A 1OGSA 1D2KA 3ZOAA 2CBJA 3ZT6A 1ZB5A 4UNIA 3F5KA 1P6WA 1TCMA 2G3MA 2W61A 3S2CA 3D7SB 2XVKA 1JFHA 2WPGA 4GPNA 4OBSA 1JD7A 5AY7A 4MB3A 3KLKA 3AOFA 5A6LA 2XVLA 4DUWA 1XGZA 3AMLA 4F79A 4DM2A 1ZA2B 7AT1B 4M80A 2HSEB 1MW0A 2V3DA 1JNEA 1NM9A 2F8QA 4H2CA 2DH2A 2J7GA 1Q6DA 2CKSA 5A8OA 3APGA 3ECQA 2WLYA 2WLZA 1W3KA 1NWTA 2UY2A 1QOXA 2YJQA 1EO5A 3EMQA 1OSEA 3WBEA 1J9YA 2ZX9A 3MV01 1FFRA 1UZ1A 3OZOA 4WKHA 1LL4A 4J3XA 2J77A 2WCAA 1GCYA 1ZJAA 3II1A 3NSMA 1C8YA 2FH6A 1GOIA 5D9OA 2J47A 2WNWA 3WIJA 1DWIM 3WMCA 4TVCA 4KMQA 3AHYA 1PAMA 5C8BB 3KWXA 3W82A 4H41A 1H09A 1EDGA 4GZJA 3UG5A 2WM0A 1HVXA 2BY0A 2JEQA 1R86A 3WNPA 3RJXA 1KWGA 4EK7A 2WCSA 2WWCA 1ISVA 3QOMA 1NWUA 3W37A 2E8YA 3GTNA 2WMFA 5E0CA 2J7CA 5ABEA 4B3KA 3IJ8A 3W6MA 1FA2A 2J7FA 3EDKA 1BYAA 3FN9A 2PF0A 4JCMA 1GOQA 5D8WA 1JXJA 1RAEB 1JF5A 4KH2A 1HP5A 1JYWA 1DWFM 3BAWA 4BQ5A 2VTFA 4PMUA 5BXTA 2WMGA 4CD8A 2JIWA 2CITA 1CXFA 4P8WA 2QPUA 1JYVA 4U3CA 1GQKA 1FHDA 3DYMA 3OGSA 3GM8A 3VGBA 2XIIA 1F1BB 1GNXA 2HISA 4CUCA 2CETA 2OLHA 4PUEA 1OINA 4PTVA 1UKOA 1QNPA 3M07A 1GOOA 3WDRA 4AD3A 1OWQA 1CTNA 1HJVA 3WY1A 2IUZA 3WENA 1IV8A 3RPMA 4DM1A 1M7XA 1DTUA 2NW0A 4AYGA 1NOWA 1JZ6A 1O6IA 3W81A 1CPUA 1PZ3A 4P7NA 5EMYA 4PEEA 2Y2WA 1BTCA 2WVVA 2OYKA 4ATWA 4URIA 4GI9A 1QHZA 1CXKA 1LF1A 2PWDA 3SUWA 4PSPA 1B1YA 2CESA 3TONA 1XV8A 3CHCA 1PPIA 2YIHA 3VD3A 8CGTA 3RM8A 3NSXA 4WLCA 3ZSTA 1FP8A 1UH3A 3WH8A 4HOZA 1EOKA 3ZO9A 4P7QA 2A0FB 1Y7VA 4W88A 4AEEA 2ZIDA 1SFSA 2XFRA 5EBAA 2J74A 5I79A 2DSVA 3AI0A 3O6AA 4U33A 3POCA 1A47A 1UR8A 4LYPA 4HPHA 3VIFA 4EANA 4C7DA 3WUBA 1V3IA 3AIQA 3POHA 3UG4A 2AOSA 4UQBA 4JFVA 2A3EA 2GJRA 3VM7A 3N17A 2FGLA 1V3HA 6TAAA 1UWUA 1KR0A 5A6MA 2Y5EA 2VX4A 4CCCA 4OJYA 3L4VA 3WDIA 1HVQA 3N15A 4F9DA 5DEZA 4IUGA 5JIPA 1UYQA 2VO5A 1LJYA 3BAYA 3GH4A 1AQHA 3AZTA 7A3HA 4WKFA 4CD6A 1JI1A 4LGXA 2YBUA 4W93A 4WKAA 3WDJA 4M29A 1XC6A 4HA3A 1BYBA 4XZWA 1NP0A 2BXZA 4W7UA 4AZHA 4AIOA 1B0IA 1JZ4A 3EBVA 5EFDA 4BQ3A 3SURA 2EPOA 1GJUA 1KR1A 5BWFA 5FIPA 3N13A 4TTUA 1WE5A 4F66A 4W7WA 3VIKA 3WNMA 5CLTA 4OBRA 1E15A 3W25A 4QCFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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