3L2VA

Crystal structure of the prototype foamy virus (pfv) intasome in complex with manganese and mk0518 (raltegravir)
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Retroviral intasome assembly and inhibition of DNA strand transfer
pubmed doi rcsb
molecule keywords Integrase
molecule tags Recombination/dna
source organism Human spumaretrovirus
total genus 97
structure length 365
sequence length 365
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2009-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3l2vA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3l2vA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3l2vA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3l2vA03
3MEGA 3OS1A 3NF8A 4FL6A 4FM1A 4DU4A 1C0MA 1T7PA 1N6QA 3GOXA 1CXUA 1U45A 2YNGA 3V4IA 4PL6A 3AVAA 4M42A 3FLGA 2PZSA 3SUPA 5HRSA 2R5MA 5C42A 2VWJA 4DQIA 1WSHA 3C4SA 3DOKA 1KLNA 2F5KA 4KHQA 4H4MA 1C0TA 3NBPA 2ZE2A 4DTJA 3DLHA 1VRUA 1HPZA 4N56A 3HSTB 4FJGA 4CK3A 4FW2A 3AVKA 1RBRA 2JZ2A 1HNIA 2QKBA 3SPZA 3NH1A 4OKKA 3AO2A 1VSFA 1U04A 1NK7A 4CF9A 2BIVA 3U3YA 3QKJA 3K5OA 3OYBA 1JLAA 3LX7A 1Z26A 4OGCA 3V9UA 4C8KA 2BE2A 2X4XA 3OYEA 1NK0A 4DTXA 3DLBA 4N4HA 3OQ5A 4RW9A 4Y1CA 1U4BA 5J2PA 2FBYA 4KRFA 5M9OA 3FDRA 3O4QA 4DS5A 1VSMA 3OS2A 3L3UA 1UOCA 2BKDN 5CYMA 3FFIA 5C0MA 1Q9YA 4BWJA 4IG3A 4J2DA 1VK0A 1WSIA 2R5AA 3LP3A 4LH4A 1ZBFA 4H4OA 2D0CA 3AVGA 3QEWA 4CJQA 3CYMA 1QE1A 3OA6A 1NJYA 5CYQA 4FZZA 3IRXA 2RN2A 4Q5WA 4X34A 5CIUA 4B9LA 4B9XA 5HRPA 3CM5A 4CJLA 3MAQA 3H6ZA 3OYAA 1NK4A 1HYZA 5CZ2A 2EQJA 4OVLA 4C5HA 3DLKA 4DLEA 2GUIA 2EX3A 1TKDA 1TVRA 3ZSZA 4N5SA 2XY8A 1ZBUA 1XHZA 1L3TA 4DSJA 1WJQA 3K5NA 3KIOA 3ZSVA 2P51A 2K3YA 1WN7A 1VSKA 3ZT3A 1VSLA 4CGGA 3ZCMA 4TSXA 3K57A 1D9DA 5FRMA 4E0DA 3ULDA 1JLBA 4KV8A 3HL8A 2G8VA 3NGYA 3TAMA 4W5OA 3PX0A 3KD5E 4FXDA 4KTWA 4FJLA 3KKRA 1LWFA 3QLHA 4JLHA 1WAJA 2WONA 4R5PA 5HLFA 4DTRA 4N4GA 2EQKA 4MQ3A 1ZBHA 4C8OA 1RDCA 4CF0A 3OYCA 2OPSA 3LP0A 1RTDA 3M8RA 1RDBA 1JLEA 4L8RB 5SWMA 3CFRA 1LAWA 3SJJA 2PQWA 1BCMA 4FYDA 4E7IA 3SUOA 1X9WA 4OLAA 1EETA 1C6VA 2BANA 2OPPA 1ASWA 4E89A 3P1GA 4LSNA 1NKBA 1U47A 4HTUA 1I39A 5SZTA 5C25A 5J39A 4M3XA 3ZT1A 4ZTJA 1F21A 2XHBA 4N41A 4F8RA 4LSLA 4DU1A 3KLHA 4ICLA 4Z4EA 3CG7A 1SL0A 1DLOA 4FK4A 4B9TA 1U48A 3S3MA 1IKYA 4M45A 2R7YA 2G8WA 1QSSA 4FK0A 3M8QA 4CHZA 3AVHA 2F8TA 4YNQA 2HHSA 2W42A 4GMJB 2MWPA 4KTZA 3PX4A 4FJMA 2P5OA 3A2FA 4MFBA 2X4YA 4CEOA 1QTMA 3KD1E 3M8PA 1X1PA 4KB1A 2FBXA 3MECA 4A4HA 1K6YA 2IAJA 1RBUA 4DTNA 3F70A 4I9LA 4Z02A 2VG5A 3LGFA 3TAEA 2D5RA 3V1QA 4KFBA 4DSIA 1SL1A 1KFSA 4DTMA 3OYLA 3OYGA 2VYTA 2PYLA 1NJXA 4E7LA 3DB4A 2EQUA 3HP9A 4N76A 1RT7A 1RT6A 1VSHA 3L2VA 3C6TA 4NZGA 3HM9A 4L59A 4OPJA 4DWIA 4C5IA 4DTUA 4CFCA 1ZBLA 2HVIA 4CFDA 3QEXA 1VRTA 3WNFA 3LANA 2E6NA 5C6SA 4Z4GA 3AV9A 1FKPA 3SQ4A 1C1AA 1NK6A 4FCYA 4CJRA 3O3HA 1CZ9A 4CHNA 1O1WA 2EFIA 1NK5A 3LH0A 3V9SA 2XY7A 3SUQA 1TAQA 3QETA 1IH7A 5JS1A 4CJ5A 2G8IA 4DTOA 2LRQA 1NK8A 3QEPA 2WACA 3AO5A 1RT1A 4B9SA 4ID1A 3DYAA 3VQ7A 1NKCA 1GOBA 4ELVA 3MXMA 3SV4A 3SUNA 4DMNA 3RMCA 2OPQA 4IUPA 2ATQA 1L5UA 2QXFA 4CFBA 4E7JA 1B9DA 3NTKA 4GW6A 2FBTA 2RHYA 3T19A 4CEAA 3KTQA 3MP8A 3SYZA 3K5MA 2EQMA 2O4XA 1XHXA 1X9SA 3QIPA 2D9TA 3O8VA 3ZT0A 5CY4A 4CF1A 3TAFA 1KTQA 4J2AA 4M3ZA 4M3RA 2XDPA 1VSEA 4BDZA 3ALYA 2QK9A 3DB3A 4CERA 1BIUA 2G8KA 1J5OA 4DQRA 3OYNA 1QSLA 5E41A 4RW7A 4KHUA 4B08A 2Z1IA 3WNGA 3PY8A 1BL3A 4BDYA 2GFUA 5DMRA 3VQDA 1KVBA 4BWMA 5IN1A 2L89A 3I0RA 2VG7A 5KTQA 1G5VA 1RILA 2ZQBA 1T8EA 4E7HA 3OB9A 1TL1A 1JKHA 2E6LA 4HCZA 2QKKA 3RWUA 4FM0A 2VWKA 3LPUA 1SKSA 4KPYA 5J26A 4C8NA 1LAVA 1A5XA 4FJXA 2Q3SA 3LP2A 2X4WA 2A1SA 4CHQA 3OYJA 5D6YA 3C94A 4DF4A 3LAKA 3MEVA 1HRHA 3KLGA 3DLGA 2ETJA 1Z25A 4DQSA 1WAFA 3QINA 3TWHA 1QQCA 2ITGA 2RJCA 4CJVA 1JL1A 4G1QA 4KO0A 1RBSA 1FXXA 1A5VA 1XWLA 3G10A 2FHDA 3V9WA 1TK8A 4M41A 3VQBA 3MXIA 4AHVA 3HPGA 3TAGA 4HCCA 4HUGA 1UAXA 1LWCA 2YRVA 4Z4IA 1SV5A 3K59A 4HVJA 3E9GA 3M9QA 4FLZA 1I3AA 4O0IA 4QAGA 1OYXA 5KGWA 1DTTA 1CZBA 5J2QA 3MEEA 4ID5A 1TKTA 3TAQA 3RR8A 4KTQA 4DFPA 3SD4A 3QJ6A 2GFAA 4W5NA 4IG0A 4F3TA 1WLJA 3D45A 3RMDA 1G15A 1RNHA 4CJKA 1J54A 1L3UA 2LVMA 4CGDA 4PWDA 2DFEA 4Z4FA 4NCGA 4W5RA 4II1A 1FKOA 1HQUA 2HHUA 2I5JA 4FM2A 1KHCA 3IS9A 4C8LA 2HNYA 5EU7A 2KZMA 1GOAA 4AHCA 3AVJA 4FK2A 4Z4CA 4NCBA 4QCLA 1LW2A 3H8ZA 4QQGA 4J2BA 4DF8A 2RF2A 1BI4A 4I9QA 4CIEA 1LV5A 4DLGA 4E3SA 4CEZA 5D6XA 1D9FA 3PMIA 3HJFA 2X6SA 3UT1A 2CKKA 3T3FA 2HNZA 4B3OA 4CRIA 3LWMA 4O0JA 3LALA 1UWBA 4EZ6A 5CZ1A 3AVCA 2JLEA 2F8SA 4B8CA 2YNFA 3NTIA 3LZJA 1IKWA 3OJSA 2KTQA 2RI5A 4FU6A 2JGUA 3QEIA 4M3UA 3RTVA 1SSFA 2OZSA 3ZSRA 5KRTA 1REVA 1NKEA 4UQGA 3HPOA 3LZIA 4J2EA 3NCIA 1S1UA 3HK2A 1KVAA 3QNNA 4KREA 3QO9A 1ZYQA 4E19A 3OY9A 4FVMA 3DOLA 4A4FA 4E1NA 4ZHRA 2IGIA 4RW8A 2EKOA 5J2NA 3SQ0A 3BGRA 3TARA 4QQDA 1YTUA 4XIUA 3OYMA 3I0SA 3DLMA 3VQCA 1B9FA 2GF7A 4B9VA 2DY4A 4O4GA 1TV6A 5I3UA 1SKRA 1S6QA 1S1WA 4PLLA 5KCOA 5KI6A 3PO4A 3ZEHA 3HPHA 2LSNA 3S3OA 5K14A 3SZ2A 2RHUA 1KRPA 4HCBA 1S9GA 2DAQA 3E9FA 4OKJA 1Y97A 1TK5A 4JRPA 1WJRA 4N47A 2HHTA 1VSJA 1W0HA 3NDKA 1TAUA 3C6UA 3H08A 4CF2A 2OPRA 3SNNA 4CJEA 3KUFA 4IFYA 3O3GA 3LAMA 4FJNA 2M16A 4CGJA 4FJ7A 2LDMA 4NS5A 3P8HA 3OYHA 4CEBA 3WNHA 3SPYA 3LLRA 3I8DA 3SCXA 3V1OA 1KSPA 4N4IA 2XY6A 4OJRA 2L3RA 2YKNA 4JS4A 2E5QA 1KLMA 5KH6A 2A1RA 3HP6A 3JYTA 3C95A 4E7KA 4FLTA 2YNIA 3VQ9A 3P83D 4I2PA 1RT4A 2E6MA 3DI6A 5FDLA 4O5BA 4EP4A 1ITGA 2Z1HA 3KJVA 1JL2A 1BQNA 2NUBA 4JRQA 5J1EA 1NJWA 3QEVA 3S9HA 1VSDA 3UIQA 3DRRA 3NF9A 4Y1DA 2YV0X 1H3ZA 4PQUA 3AVBA 3ISNC 1U49A 4I7FA 4DS4A 4DQQA 1JXEA 2RPIA 3L3VA 3P8DA 3ASMA 1WNSA 2DIQA 1ASUA 2RJFA 1JLFA 4FLUA 3L2QA 4F2RA 1CLQA 2M1HA 5JS2A 1R0AA 3RMAA 5KGXA 1S1VA 4O55A 4BDPA 3AA5X 4C5GA 5HRNA 5IAYA 2X78A 1SL2A 4NCAA 2PY5A 2RKIA 4CF8A 3F9KA 4IFVA 2DIGA 2RHZA 5KE3A 5KRSA 4AHSA 2AJQA 1WSEA 4DTPA 5I42A 5T7BA 3QERA 1NOZA 2B5JA 4QOZB 4Q5VA 3K5LA 4FLVA 3PMTA 4BD3A 4FZYA 3MEDA 1N27A 3K2PA 4RW4A 1RTJA 2YNHA 4AHTA 4CJWA 3O3FA 3QBYA 2XY5A 5FROA 4KHYA 3SV3A 4W5TA 1WSFA 3ME9A 3RRGA 2MWOA 3VQ8A 3KLIA 4CGIA 3AO4A 2G8UA 3S6WA 4AHUA 3OS0A 3KK1A 3VQ5A 3L8BA 4CJFA 3G0ZA 4ZTFA 2XRIA 3E01A 5HBMA 4KKOA 4WE1A 1SUQA 2LTOA 2RJDA 3NF6A 1UA1A 1KFDA 2G3RA 2RO0A 3NH2A 2Y1IA 4HUEA 2RI2A 1TKXA 1A5WA 3L2WA 2KZZA 2RI3A 2X74A 1RTIA 2HQXA 1JLQA 4DU3A 1EXQA 1S1TA 2BGGA 2O4GA 4CK2A 4DTSA 3KLEA 3HXMA 3MO8A 3V9ZA 2XO7A 3F73A 5HP1A 3M8SA 5J2MA 4CIFA 1NOYA 4Q0BA 4O44A 1N5YA 2R58A 2P1JA 1HNVA 4A4GA 3O4NA 2IOCA 1TGOA 3TI0A 3MEWA 3MP1A 4CFAA 4DSLA 4CEEA 4EDUA 4CJUA 3U3GA 4BE0A 2HHXA 4IUVA 3KK2A 4NYFA 4KHSA 4ELTA 3FC3A 3PUFA 4F2SA 3ITHA 1RTHA 3DLRA 1SKWA 1X9MA 2HNDA 4DSFA 2PYJA 2IDOA 1XC9A 4OLBA 1OZ2A 3D0PA 4CECA 4CJ3A 2QQSA 3META 3VQ4A 2HW3A 4B8AB 1RBVA 3TANA 3NNQA 4CJSA 3SQ2A 1C1CA 3RR7A 3ZSXA 1HYVA 4H8KA 4DG1A 3SI6A 3AA4A 1JLGA 4C8MA 1WSJA 4CE9A 2FC0A 4FJ8A 3L2UA 3OYFA 3NHGA 3CFPA 2L8DA 2D0AA 1ZBIA 3OYIA 1RCHA 3DLEA 3AA2A 1XI1A 2B8AA 3QESA 5KCHA 2XK0A 3BDLA 4PUOA 3NTHA 4LY7A 4DQPA 4FZXC 3PO5A 3LYIA 2BDPA 2OYQA 2RHXA 2X6NA 4CJ4A 2E4LA 2HHVA 3IAYA 2FBVA 1BQMA 1W9HA 1BIZA 1YTAA 4FLXA 2HHWA 3OVNA 1S6PA 3AO3A 3NH0A 3ZT4A 3U6FA 3HVTA 1QSYA 3HT3A 2DFFA 2R57A 1HJRA 1WSGA 3QIIA 4EP5A 3SQ1A 4CESA 1Q9XA 4PLIA 5C24A 2QQRA 4LH5A 2DFHA 1EP4A 3BDPA 3NE6A 3OYKA 3VQQA 1EKEA 1IKXA 2K3XA 4FLWA 3DRSA 1WGSA 1NK9A 4GVMA 3CFOA 4NYNA 2M0OA 2GV9A 4FJ5A 1L3SA 2HQEA 4BACA 4IKFA 4A4EA 3MEAA 4CEQA 4W5QA 1HQEA 3QIOA 1ASVA 2YHBA 2GBZA 4PA1A 1XNIA 1KCFA 5KE2A 3DRPA 4LD0A 2O4XB 3NGIA 3MP6A 3EYZA 3V6DA 1TL3A 3VN5A 3PNWC 1L3VA 4IUUA 3VQEA 1GOCA 4KB0A 3TR8A 2YHAA 2BUDA 3L2RA 3ZSOA 4FLYA 4DSKA 1JLCA 4KI4A 1OI1A 4CJTA 3OMCA 3V81A 4QW2A 4M3YA 4B9WA 4OPKA 2OA8A 3ZT2A 1FK9A 3KKSA 2EHGA 4CGHA 3THVA 3LPTA 1LW0A 4HUFA 3PX6A 2HHQA 5HRRA 4KHWA 2KFNA 4CEDA 4C5EA 3K58A 3OJUA 2Z1JA 3KK3A 2WOMA 4CGFA 1RT5A 1BISA 3VA3A 3MEUA 2JTFA 2YKMA 1RDAA 2HB5A 1IO2A 2RHIA 3JSMA 3TABA 5D3GA 5FRNA 4F3OA 2IG0A 4DFMA 1QS4A 4M3TA 4RG2A 4AILC 3HVRA 2ZD1A 4QVZA 1MHNA 3MXJA 4PY5A 4CIGA 4K8XA 5DK5A 2IS3A 4RW6A 3OYDA 3VQ6A 2HVHA 4Z0UA 1VSIA 1QHTA 4B9UA 2NLUA 5D6WA 3NFAA 1KVCA 4CHPA 4AHRA 3B6OA 1J53A 3LDSA 1TKZA 1BGXT 1RI0A 3LGLA 4FJHA 2O4IA 3AVIA 1CXQA 4IBNA 3VA0A 3NAEA 1OZ3A 3EY1A 1DTQA 4DSEA 4FJ9A 2Z1GA 2RJEA 1BHLA 1Q8IA 1S9EA 4OVAA 2F96A 3AVFA 4BE2A 1B92A 4B9NA 3VQAA 3V9XA 3ZSQA 3EZ5A 4OGEA 3WNEA 3VQPA 1UA0A 4IDKA 4CK1A 1S1XA 1S5JA 3B6PA 3CEYA 2D0BA 4HHTA 3ZSWA 1RT3A 3FEOA 3DM2A 1LWEA 3PV8A 1WJSA 2G8FA 4E1MA 4BE1A 3RMBA 4FJKA 1RT2A 4DFJA 2KFZA 4KI6A 3AVLA 2P0KA 4FW1A 2IC3A 5HROA 1NJZA 4FJJA 4IURA 1RDDA 3P5JA 3V1RA 4CEFA 3RRHA 4KHNA 4DFKA 4I2QA 3LWLA 2HMIA 4QQ6A 4GY5A 1YVUA 2LCCA 3UWNA 2B4JA 1YT3A 3L42A 1HMVA 3AA3A 3AO1A 1T03A 4EZ9A 4JS5A 3HYFA 2Y1JA 4KAZA 3DMJA 1C0UA 3Q1JA 3ZSYA 3NF7A 4CHYA 4K8ZA 3EAEA 3PFSA 3HO1A 1RBTA 4CHOA 2P5GA 1BI4B 1T05A 4RG8A 3TAPA 1MU2A 4Z4HA 2KW4A 4B9MA 2DTUA 3CM6A 2X35A 2G8HA 2OZMA 2KQ2A 4CCHA 3KLFA 4F4KA 3S3NA 4FJIA 3LP1A 4M3WA 1D8YA 3ASKA 1J9AA 1IG9A 3OMGA 4LD6A 3T1AA 1TK0A 4UC4A 1C1BA 4CJPA 2VG6A 2B6AA 4OKEA 4ELUA 4IUTA 1JXBA 4IUQA 3NGZA 3AVNA 1BCOA 4YFUA 4AH9A 3AVMA 1EX4A 1D5AA 3IG1A 1HYSA 1IKVA 3CQ8A 3QNOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OS1A 3NF8A 3CTAA 4DU4A 3AT1B 2SRCA 2JNGA 2IW5A 4XU1A 4PIIA 1U45A 4LC9B 4E1JA 5AQNA 2GLOA 4I6MA 4M42A 2DVEA 1YIJQ 5CQEA 4A2AA 1TUGB 1IBKK 3IKTA 2RMOA 3GZ5A 1XJWB 4Y33A 5AQFA 2DDBA 2XF6A 4DQIA 1WSHA 2XAJA 3DXKA 3JCMP 5KK1A 1OQKA 4BGDA 3QYHB 3HSCA 3M1CA 4X9CA 1RRQA 1E3PA 2K5IA 4F7UA 1ZELA 3O6WA 1N6AA 1HW1A 2STWA 3NBPA 4DTJA 4JRIA 5CPRB 2CZ0B 2OFKA 1WCMJ 1BDGA 2QWNA 3AVKA 2V4JC 1KD1R 1HOMA 5JVHL 4A3JJ 1K9MO 5FO5A 1RBRA 3P38A 2KNBB 2Z16A 1HNIA 1M1EB 1AZEA 1T38A 2QKBA 1T0FA 1EWQA 1U04A 2VPLA 4ESFA 3AGKA 4KICA 4IHSA 4Y0WA 1ZRCA 1Z7LA 3U3YA 1WH7A 2DX1A 2F9WA 5LJ3e 2AXTC 3OYBA 1K0XA 3ZCOA 4BEHA 3V9UA 2BE2A 1XGOA 4J00A 2X4XA 4YHHK 1RKWA 3RBBB 2A40A 3DLBA 1X2NA 4RW9A 3HXLA 2GOMA 1NWKA 4Y1CA 1M9SA 4XMYA 3A02A 2QA4Q 3GTOJ 3GLLA 1D09B 5M9OA 1KO9A 1KD1C 2ROLA 2KRSA 4J9GA 3IKVA 2KRFA 1UOCA 2BKDN 3G7ZA 2PVDB 2O8KA 5GAN7 4O8UA 3CCJN 1QPIA 1Q9YA 4BWJA 2K9QA 4M7AD 4BUPA 4J2DA 4JKGA 1NM1A 1WSIA 4LH4A 1GLAG 2GQIA 1ZBFA 3T9NA 2VT2A 5LJ5h 3AVGA 3QEWA 1B59A 4Q5SF 1WJAA 2PLYA 3UNGC 3ECHA 4X34A 3S2WA 2QWQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3RRH A;  4KHN A;  4DFK A;  4I2Q A;  3LWL A;  2HMI A;  4QQ6 A;  4GY5 A;  1YVU A;  2LCC A;  3UWN A;  2B4J A;  1YT3 A;  3L42 A;  1HMV A;  3AA3 A;  3AO1 A;  1T03 A;  4EZ9 A;  4JS5 A;  3HYF A;  2Y1J A;  4KAZ A;  3DMJ A;  1C0U A;  3Q1J A;  3ZSY A;  3NF7 A;  4CHY A;  4K8Z A;  3EAE A;  3PFS A;  3HO1 A;  1RBT A;  4CHO A;  2P5G A;  1BI4 B;  1T05 A;  4RG8 A;  3TAP A;  1MU2 A;  4Z4H A;  2KW4 A;  4B9M A;  2DTU A;  3CM6 A;  2X35 A;  2G8H A;  2OZM A;  2KQ2 A;  4CCH A;  3KLF A;  4F4K A;  3S3N A;  4FJI A;  3LP1 A;  4M3W A;  1D8Y A;  3ASK A;  1J9A A;  1IG9 A;  3OMG A;  4LD6 A;  3T1A A;  1TK0 A;  4UC4 A;  1C1B A;  4CJP A;  2VG6 A;  2B6A A;  4OKE A;  4ELU A;  4IUT A;  1JXB A;  4IUQ A;  3NGZ A;  3AVN A;  1BCO A;  4YFU A;  4AH9 A;  3AVM A;  1EX4 A;  1D5A A;  3IG1 A;  1HYS A;  1IKV A;  3CQ8 A;  3QNO A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2GOM A;  1NWK A;  4Y1C A;  1M9S A;  4XMY A;  3A02 A;  2QA4 Q;  3GTO J;  3GLL A;  1D09 B;  5M9O A;  1KO9 A;  1KD1 C;  2ROL A;  2KRS A;  4J9G A;  3IKV A;  2KRF A;  1UOC A;  2BKD N;  3G7Z A;  2PVD B;  2O8K A;  5GAN 7;  4O8U A;  3CCJ N;  1QPI A;  1Q9Y A;  4BWJ A;  2K9Q A;  4M7A D;  4BUP A;  4J2D A;  4JKG A;  1NM1 A;  1WSI A;  4LH4 A;  1GLA G;  2GQI A;  1ZBF A;  3T9N A;  2VT2 A;  5LJ5 h;  3AVG A;  3QEW A;  1B59 A;  4Q5S F;  1WJA A;  2PLY A;  3UNG C;  3ECH A;  4X34 A;  3S2W A;  2QWQ A;  3VGL A;  4B9L A;  2ELH A;  1T3L A;  3FRN A;  1RUO A;  1VQ7 Q;  3ROU A;  4CJL A;  1D3B B;  1G3W A;  3OYA A;  5F1R A;  2XHK A;  5DYM A;  1N5Z A;  2EQJ A;  2EFO A;  2LRD A;  3L9F A;  5FD6 A;  3DLK A;  1OKJ A;  4DLE A;  2VBW A;  3LST A;  3M57 A;  4B44 A;  2RK1 A;  1C0G A;  2L4A A;  2EX3 A;  1TKD A;  2OJ2 A;  4CZI A;  1HYO A;  1TVR A;  3LSH A;  3ZSZ A;  3PIP A;  4HG2 A;  3IL2 A;  3HHH A;  4FAS D;  4L5E A;  1RZ4 A;  4AFQ C;  5GAN e;  1YJN I;  5C4J J;  2DEU A;  4OAY A;  3CCE N;  3TU4 K;  2NUP B;  1UJ0 A;  1TUU A;  1IZ6 A; 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 5GAN d;  1FK9 A;  1STZ A;  3O9U A;  1TYQ B;  5EJC A;  3A8M B;  2C06 A;  4CC2 A;  2HHQ A;  4Y4R A;  1EBM A;  4L5J A;  3EQL F;  4X64 K;  1RT5 A;  1BIS A;  3VA3 A;  3LDL A;  2NWM A;  1JKP C;  2Y4X A;  2HB5 A;  4HXJ A;  1GDT A;  1UGV A;  3PE0 A;  4M7A F;  5D3G A;  4H5W A;  1Y1W J;  3PFI A;  2YCH A;  1IRX A;  1V3F A;  2V8K A;  1K8K A;  1WHH A;  3M55 A;  2IPQ X;  3HVR A;  3J7Z I;  2ZJR L;  3SMP A;  1MHN A;  3MXJ A;  2HZD A;  3OHR A;  1QVF A;  3ZQH A;  4CGZ A;  2IS3 A;  4RW6 A;  3VQ6 A;  5AFU A;  2CRE A;  2HVH A;  4Z0U A;  5HS7 A;  4XLN F;  2P0P A;  3GO5 A;  2BE5 F;  4CHP A;  2Y90 A;  3BDU A;  3CHW A;  3W6J B;  4FWK A;  2LBF A;  4U7D A;  1R36 A;  4FJH A;  2O4I A;  1XN7 A;  1HSQ A;  3DCF A;  4HVW A;  3K4N A;  2DAO A;  3JCM d;  2VI6 A;  5BR8 K;  3HOU J;  4B1W B;  4L6V 5;  1KQS P;  2XIC A;  1NG9 A;  2OCE A;  2Z1G A;  2COZ A;  1Y0N A;  2L9V A;  1Q8I A;  4OVA A;  2F96 A;  4J9H A;  3AVF A;  1ZX6 A;  2A42 A;  4BE2 A;  2F5D A;  2DL8 A;  1YJW I;  1MV0 B;  3VQA A;  3I4N J;  3V9X A;  1V76 A;  3HTV A;  1Z6R A; 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 1UJY A;  4K0K K;  2R5Y A;  1YQK A;  4MDB A;  1VQ5 Q;  3ZEU B;  1ESV A;  4C8Q D;  2DFI A;  1HSJ A;  3CMA I;  1ZG5 A;  2B6A A;  4OKE A;  3DWL A;  4YOY A;  4RCB A;  1K0S A;  4DV3 K;  3KVG A;  4IUQ A;  4KT6 A;  5GMK h;  5BPL A;  4DBR A;  2EPD A;  4YFU A;  3NMZ C;  4RCC A;  4AH9 A;  4RKU E;  2WSF E;  3IG1 A;  5FKN A;  2ID3 A;  4BRA A;  4AIK A;  4IZZ A;  1SD5 A;  1JI8 A;  1R5I D;  3QYE A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4OKK A;  3AO2 A;  1VSF A;  1U04 A;  1NK7 A;  3SB2 A;  2VPL A;  4CF9 A;  3OW2 S;  2BIV A;  2ZCF B;  3TEE A;  3OIQ A;  3TRE A;  1Z7L A;  3U3Y A;  2O5R A;  3HOS A;  3QKJ A;  5LJ3 e;  3K5O A;  3OYB A;  1JLA A;  5CAI A;  3LX7 A;  4ZN3 A;  3ZCO A;  4BEH A;  4C0Z A;  4OGC A;  1Z26 A;  3V9U A;  4XQ3 A;  2BE2 A;  4C8K A;  4J00 A;  2X4X A;  3OYE A;  2R7R A;  1NK0 A;  4DTX A;  3DLB A;  4N4H A;  3OQ5 A;  4RW9 A;  3HXL A;  2GOM A;  4Y1C A;  5J2P A;  1U4B A;  2FBY A;  1M9S A;  4XMY A;  3ZQQ A;  4ATO A;  4KRF A;  2QQA A;  3E1S A;  5M9O A;  3DPT A;  4EMK C;  1KD1 C;  3FDR A;  4XLF A;  3O4Q A;  4DS5 A;  1U1S A;  3J81 E;  1UEB A;  2AQF A;  4LDX A;  1VSM A;  2LNV A;  1YHQ T;  3OS2 A;  3ZBD A;  3L3U A;  1FWZ A;  4JLG A;  1UOC A;  2BKD N;  3G7Z A;  5CYM A;  1WJF A;  3FFI A;  2PVD B;  5C0M A;  3CPW S;  5GAN 7;  4LDY A;  1Y96 A;  2OTJ T;  3LL7 A;  1Q9Y A;  4BWJ A;  3JB9 F;  4IG3 A;  4M7A D;  4BUP A;  4QPO A;  4J2D A;  3BCB A;  4C0D C;  1VK0 A;  3CCJ A;  2R5A A;  1WSI A;  3LP3 A;  4LH4 A;  1ZBF A;  3T9N A;  4H4O A; 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