3OS0A

Pfv strand transfer complex (stc) at 2.81 a resolution
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The mechanism of retroviral integration from X-ray structures of its key intermediates
pubmed doi rcsb
molecule keywords Integrase
molecule tags Recombination/dna
source organism Human spumaretrovirus
total genus 103
structure length 365
sequence length 365
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2010-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3os0A04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3os0A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3os0A02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3os0A03
1LAVA 4QQGA 3V6DA 3MXIA 2G3RA 4CJTA 4CFBA 3T19A 2EQUA 2B4JA 4JLHA 2RHIA 2G8HA 2HHSA 3DMJA 1VSIA 3H8ZA 2M1HA 4PLIA 1NJZA 3LP2A 1BIZA 5I42A 4HUGA 2KZMA 4CK3A 3MP6A 1LWCA 4QQ6A 2O4IA 3AVMA 1NK9A 3ZSVA 1L5UA 1L3SA 2QXFA 1W9HA 1SSFA 2FBXA 2GV9A 4I9LA 2RJDA 4F3OA 4UC4A 4FW2A 3LP1A 2BIVA 4ELUA 2QK9A 2RHUA 3TAGA 1RDAA 3T1AA 4CEAA 4NCBA 4L59A 3I8DA 3F73A 4NCAA 2X4WA 1BGXT 4CFAA 3M8PA 3VQDA 3AVLA 1JLFA 3AVIA 3NTKA 3KLGA 4I2PA 4BWMA 2B8AA 3TAQA 3B6OA 2P1JA 4Z4CA 1LWFA 3P8HA 2L3RA 1IKXA 4KHYA 1TV6A 4FJNA 3O3GA 4PA1A 1YTAA 3IG1A 3O3FA 4IUVA 1RT7A 2B6AA 2M0OA 3HPGA 3MEDA 4FJGA 3LZJA 1GOBA 4M3TA 1EETA 3VQEA 3ITHA 2D9TA 4M3YA 1I3AA 4DU4A 3C4SA 1TKTA 2Y1JA 2HNDA 3AVBA 4AHRA 4DQRA 4B9UA 3IRXA 4PLLA 1ZYQA 1Z26A 5HRRA 4M42A 4KHSA 1RBUA 2HNYA 5HBMA 2XRIA 3L2RA 1U45A 1C0TA 1WJQA 1KHCA 4E89A 1S1VA 1RT4A 3KK3A 3OYMA 4OPKA 5KCOA 1RBSA 3TAMA 4O44A 3C94A 1FKOA 4F2SA 3KJVA 1WSFA 3L3UA 4KAZA 4FJ9A 4E1NA 2OZSA 4FCYA 1NK7A 3PFSA 3QKJA 1WSIA 2EQKA 4O4GA 4DS5A 3LH0A 1JLGA 3V9WA 4XIUA 4HTUA 2I5JA 3META 4LD0A 4CGJA 1WSGA 4JRQA 1B92A 1QSYA 5C6SA 4E7HA 3AA3A 4W5OA 1IKVA 4CHYA 1QQCA 5HRNA 4BE0A 2WONA 4RW8A 5M9OA 4Z4GA 2F5KA 4M3ZA 1BL3A 1TL3A 3KLEA 4DQSA 3OYEA 3SUNA 3I0RA 5FDLA 2FC0A 3OMCA 4CGGA 2FBVA 4DSIA 4N47A 3UT1A 4FLYA 3KTQA 3VQPA 2HQXA 3ZSXA 3NDKA 3QEIA 3HM9A 3THVA 3AV9A 3OYHA 4IUUA 1JXEA 1SKWA 1Z25A 2FHDA 2D5RA 4YNQA 4A4GA 3S3MA 2NLUA 4MQ3A 3HPHA 5D3GA 4NS5A 3SJJA 4BDYA 1XNIA 1H3ZA 1TK5A 4CJKA 2ITGA 1CZBA 1HRHA 2YV0X 1K6YA 1CLQA 1C1BA 1IH7A 3QLHA 3OYGA 4DU3A 3DYAA 1XC9A 1HYSA 4OLAA 3LAMA 2JLEA 1VK0A 3P83D 4OGEA 3NGZA 3QBYA 3HVTA 3PX4A 4W5RA 3IS9A 5KE2A 3OYDA 3EY1A 1S9EA 4CJQA 2P51A 1CXQA 3RTVA 2W42A 1Q9XA 5J2NA 1L3TA 4L8RB 3AA2A 2CKKA 4M3UA 2G8IA 4CHNA 4FJ5A 1UAXA 4CEDA 4CEQA 4HCCA 2HW3A 4PY5A 3MP8A 1D9FA 4CJ3A 4CJLA 4AILC 2VG6A 3F70A 3OQ5A 1KTQA 3NGIA 1NKEA 4BDPA 4BWJA 1RBTA 1S9GA 1TK0A 1KVAA 4E1MA 1WN7A 1RDBA 3NCIA 1U49A 4M3WA 1HNIA 3T3FA 2E4LA 3L2UA 3VA0A 4N4IA 3D45A 4EZ6A 1ASVA 1RBVA 1VSFA 2Z1IA 3C95A 2XDPA 1MU2A 3CFPA 3AVJA 2RN2A 1JLBA 3CYMA 1X9WA 3NE6A 1IO2A 4KREA 2KTQA 4N56A 1TGOA 5IN1A 3UWNA 4OGCA 3FDRA 4FM2A 1XHZA 1NK5A 4FZYA 3QEVA 3RMDA 2Q3SA 1IG9A 4A4EA 2G8UA 2DFEA 2YNHA 2WOMA 1KFDA 1JL1A 3VQ5A 2KZZA 1UOCA 1I39A 2HNZA 1HPZA 4FLTA 1ASWA 4OVAA 1GOAA 2XY7A 4NYNA 3DLHA 4IUPA 3WNHA 3KLFA 2D0CA 3O3HA 3QIOA 4I7FA 2Y1IA 3OY9A 2EQMA 2GUIA 3ALYA 4PQUA 1KSPA 4E7JA 2JTFA 4M41A 3QINA 4KRFA 3DOKA 2RHYA 2IOCA 3VQQA 4FZXC 3SV3A 1YVUA 1WNSA 3DLMA 3ZT4A 3K5LA 1XWLA 4CERA 4KB0A 2DTUA 2E6MA 4FM0A 2P5GA 2PQWA 4CEFA 3PMTA 2K3XA 4B9XA 5FRMA 3A2FA 3MP1A 1HQUA 4IUTA 4IKFA 4F8RA 3NTIA 1HYZA 3UIQA 1QHTA 1U04A 4QQDA 2A1RA 3M8QA 3TWHA 3SZ2A 3L42A 2X6SA 4CFCA 4LSNA 1ZBHA 1BISA 2HQEA 4E0DA 3HSTB 2X35A 2ZD1A 1SV5A 3V81A 3HVRA 4QAGA 4CF0A 4E7IA 4QOZB 1RDCA 4OKEA 3VQ9A 2OPRA 3DLEA 3OYAA 4DFMA 1LAWA 4AHTA 1YTUA 2VG7A 2LRQA 2FBYA 4CHZA 1WSEA 3SUPA 4OJRA 2RJCA 4AH9A 1SL0A 2AJQA 4CIGA 4J2BA 1BI4B 3E9FA 2Z1HA 3QIPA 2IAJA 3VQ8A 3NHGA 3OJUA 4RW6A 3AO4A 1Q9YA 3U3YA 3ZEHA 3NF8A 3H08A 5KGWA 3KUFA 4KHUA 3BDPA 5C24A 2ATQA 4DQPA 1A5XA 1QS4A 2LDMA 3AVGA 1L3UA 4KI6A 3OA6A 4FJMA 3CEYA 2EFIA 4DTJA 4FJXA 1N27A 4E7KA 4FVMA 3MEEA 4CGHA 3TAPA 3SPYA 1N6QA 1WGSA 3ZT2A 4IG3A 4PUOA 3NF6A 5JS2A 3NF9A 1NJWA 4KV8A 1C0UA 3VQ4A 2DFFA 2K3YA 4FLWA 4I2QA 2G8FA 3V9XA 4DTUA 3M9QA 3ZT3A 1A5VA 4YFUA 1EX4A 3KLIA 1RTDA 3PO5A 4KHWA 1W0HA 2O4XB 5DMRA 1HNVA 2NUBA 1DTTA 2HVHA 1LW2A 3IAYA 1JLCA 1RBRA 4UQGA 1WLJA 4DLGA 2QQSA 3OS1A 3TANA 1SL1A 4C8NA 3OVNA 4PWDA 4DSFA 2X4YA 1IKYA 1KLMA 3DI6A 4CJEA 4KHQA 2DY4A 3Q1JA 3V1QA 4Y1CA 2A1SA 2IGIA 3PNWC 3KKRA 3U3GA 4C5HA 2VYTA 4CJSA 4B9SA 5SWMA 3BDLA 2DFHA 4E3SA 4RW4A 5E41A 3KD5E 1TK8A 4FXDA 3I0SA 4GW6A 3K59A 4Q5VA 2HVIA 3G10A 4DTMA 3PX0A 4CJUA 3VN5A 3QESA 4DQQA 3JSMA 4DTRA 3RMAA 3PY8A 3DRRA 2IDOA 1B9FA 4EZ9A 3LDSA 3EAEA 3QNOA 4CF1A 3LWMA 4CJRA 2GFUA 3PMIA 2LSNA 2PZSA 3SCXA 3BGRA 2YNGA 3G0ZA 4DS4A 2F8SA 4DSEA 1WAJA 1BHLA 2DAQA 2MWPA 2R58A 1YT3A 1TVRA 4CIEA 2YKMA 2Z1JA 4C8OA 4FL6A 3S3OA 4H8KA 5CZ2A 2LCCA 2X4XA 2XY8A 3DLKA 3PV8A 3QEWA 2Z1GA 1C6VA 1Q8IA 3V4IA 5HROA 3SI6A 5HP1A 2G8KA 1A5WA 1HMVA 3OYBA 2D0BA 1XI1A 1BQMA 3ZSYA 1S1XA 2EX3A 3OYIA 3VQCA 1TKZA 1QE1A 4RG8A 4DWIA 4CEBA 4FLXA 3OYNA 4Q5WA 3WNGA 3NAEA 4Z4HA 1VSKA 1S1TA 1OZ3A 4CF9A 3PO4A 3FLGA 1X9SA 3V9ZA 3EYZA 4G1QA 4FJ8A 3TABA 4FU6A 1VSLA 4ID1A 5FRNA 4QW2A 4FM1A 1L3VA 2P0KA 4R5PA 2P5OA 1JL2A 4OPJA 3FEOA 1QSLA 4FJLA 3NH2A 3MAQA 3K58A 5IAYA 1OZ2A 1RDDA 4Z0UA 1KRPA 4FK0A 2EKOA 2XY5A 3LGLA 1D9DA 4BACA 2X74A 1FKPA 1NKCA 4IFVA 3ZT0A 2YNFA 2RO0A 4FLUA 1J5OA 2QKBA 3KD1E 1RILA 4LSLA 3TAEA 4LH5A 3MEUA 4AHUA 3NH0A 1CXUA 4HUFA 4CGDA 3P8DA 3M8RA 4NCGA 2EHGA 1N5YA 3QJ6A 1QTMA 2HHXA 1RNHA 3KK1A 4CECA 4HCZA 2BDPA 2RPIA 4HCBA 4AHSA 4ZTFA 4B8CA 1JLQA 3K2PA 1DLOA 2YHAA 3WNFA 4K8XA 5KE3A 3LP0A 1VSMA 1KLNA 4CF8A 2JGUA 3AVCA 3AA5X 4PL6A 3AO3A 1T8EA 2HHVA 4ZTJA 2ZE2A 1J9AA 1VSJA 3LX7A 2EQJA 1RTHA 3SQ4A 4Z4FA 4WE1A 3QO9A 2OA8A 3OS0A 3NBPA 4II1A 3AVAA 1NKBA 4HUEA 4CIFA 3JYTA 1RI0A 2E6LA 2OPPA 4E19A 1SL2A 4A4FA 2PY5A 3CG7A 4J2EA 1VRUA 3HP9A 2IG0A 4B3OA 4E7LA 1OI1A 2VWKA 4CHPA 4LH4A 2IC3A 1C1AA 2OPSA 4I9QA 3RWUA 2DIQA 4KB1A 3LWLA 4Q0BA 3PX6A 3D0PA 4CGIA 2OZMA 1ZBLA 4KTWA 1T03A 2RI2A 4CESA 4X34A 1ZBFA 2GBZA 5CYMA 1REVA 3AO2A 3RRGA 5J1EA 4DFPA 1J53A 4CJWA 4C8MA 4CJPA 4JS5A 3OMGA 1EXQA 2LVMA 1FXXA 1KVBA 2D0AA 4O5BA 4ICLA 4OKKA 4FLVA 3VQ7A 4B9NA 1ZBIA 1WJRA 4B9VA 5KCHA 4FK4A 3CQ8A 3KLHA 4BE2A 3S3NA 2F8TA 5KRSA 2XY6A 1RCHA 2OPQA 3L8BA 3OYCA 4DG1A 1RT5A 3ZSOA 4AHVA 3RMCA 5KTQA 2M16A 1KCFA 1F21A 3P5JA 3C6UA 4KO0A 1WAFA 3ZT1A 4C8LA 1TKDA 4CF2A 3LPUA 5C0MA 3MEGA 3QERA 3AVFA 5DK5A 5D6XA 2HB5A 4KKOA 2VWJA 3H6ZA 4CJFA 3SQ1A 3DLBA 2HMIA 1EP4A 2ETJA 2O4GA 4FLZA 2KFNA 1NJYA 3NF7A 4GMJB 3LAKA 4Z4EA 1D8YA 3B6PA 5J26A 4Z02A 5KI6A 4B8AB 3LLRA 4ELTA 4NYFA 2R7YA 4OLBA 2RJEA 5KGXA 1BCMA 3NH1A 3TARA 3ZCMA 4FJJA 3M8SA 3QIIA 3ME9A 5FROA 4CEEA 4BD3A 5CIUA 3OYJA 1BI4A 5T7BA 4Y1DA 3LYIA 5CYQA 4CJ5A 1S1WA 3V1OA 4KHNA 1HQEA 3AA4A 2IS3A 2R5MA 4B9MA 4N76A 3OB9A 4F4KA 3HP6A 4CJ4A 1C1CA 2X78A 5SZTA 4CJVA 2F96A 1NK0A 2R57A 1ITGA 4W5NA 3ASKA 3LP3A 4NZGA 4KTQA 4IUQA 3LGFA 4IDKA 4FZZA 4LY7A 5D6YA 3OJSA 4H4MA 1WSJA 1T05A 3DB4A 4LD6A 1RT3A 2BKDN 5K14A 1T7PA 1X9MA 4M3XA 3LANA 1TAQA 2GFAA 3L2WA 1RT1A 3KKSA 1NK4A 3SD4A 1S5JA 4DTNA 5C25A 4C5GA 3QNNA 2BE2A 3MEAA 2BUDA 1UA0A 4M3RA 2KFZA 1KFSA 1BCOA 3DLRA 3GOXA 1R0AA 1HYVA 2O4XA 5C42A 1KVCA 3TR8A 3V1RA 3PUFA 3L2VA 4CHQA 4Z4IA 3L3VA 3VQBA 4B9LA 5CZ1A 3ZSQA 2HHUA 4N41A 3LALA 2YRVA 4OVLA 4KTZA 1WSHA 3E01A 4FJIA 4KFBA 4DSJA 2B5JA 3RRHA 3OS2A 1NJXA 4ZHRA 3DB3A 4CK2A 3MO8A 3K5MA 2PYJA 3FC3A 3NNQA 3HYFA 3ISNC 3L2QA 4AHCA 2HHTA 3DRSA 4DU1A 3AVNA 2YHBA 4JS4A 2RI5A 3S9HA 2BANA 2QQRA 2YNIA 4DFKA 3HK2A 3RR7A 2G8VA 2BGGA 4DSKA 1RTJA 4HVJA 1X1PA 1LV5A 3ASMA 3AO1A 1UWBA 1JXBA 4BE1A 3WNEA 3P1GA 5I3UA 1TKXA 1JLAA 2MWOA 4DLEA 1S6PA 3ZSWA 4QCLA 4BDZA 1S1UA 3OYKA 4DTSA 4O0JA 4J2AA 1CZ9A 1WJSA 1VRTA 4H4OA 3OYLA 5KRTA 3VA3A 1LW0A 1TL1A 2XK0A 4EDUA 1ZBUA 3MECA 2GF7A 1D5AA 4N4HA 1NK8A 4IURA 3VQ6A 4B08A 1NOYA 5EU7A 3OYFA 4QVZA 1HJRA 3K5NA 3NGYA 4CFDA 4EP4A 3S6WA 2XHBA 1UA1A 1SKSA 1MHNA 4IFYA 2RJFA 4FYDA 2KQ2A 4C5IA 1BIUA 1FK9A 4W5QA 4DTXA 3RR8A 3SQ2A 4FJHA 2L8DA 3O4QA 4CEZA 1RT2A 4DFJA 4C5EA 1SKRA 4FK2A 4CEOA 1RT6A 3CFRA 2RF2A 2ZQBA 2HHQA 3V9UA 2XO7A 1VSEA 2RKIA 1S6QA 1NOZA 4CE9A 4N4GA 1OYXA 3TAFA 1U48A 2OYQA 3CM5A 1IKWA 4CCHA 4IG0A 3SV4A 1J54A 3CM6A 1DTQA 2QKKA 3MXJA 5J2PA 3AVKA 4A4HA 3QETA 4MFBA 3LPTA 4CGFA 4B9TA 1VSHA 4F3TA 4DF8A 4DSLA 3SYZA 4ELVA 1JKHA 2DIGA 4HHTA 1U47A 3ULDA 2RHXA 1TAUA 1BQNA 3F9KA 2JZ2A 4M45A 2L89A 4DTPA 3VQAA 3TI0A 4CRIA 4CK1A 1SUQA 3DRPA 5J2MA 4K8ZA 4GY5A 1C0MA 4ID5A 3HXMA 2PYLA 3E9GA 2FBTA 2X6NA 3O4NA 1EKEA 4RW9A 4O0IA 1RTIA 2WACA 1U4BA 3SPZA 3LZIA 2RI3A 4IBNA 4F2RA 3EZ5A 3RMBA 5HRPA 4CHOA 4JRPA 1LWEA 1QSSA 5JS1A 3SNNA 1GOCA 4DF4A 3KIOA 3CFOA 1ASUA 4EP5A 3V9SA 2YKNA 3ZSZA 2HHWA 1G5VA 3DLGA 4FW1A 3U6FA 4RW7A 4W5TA 3NFAA 2KW4A 3NTHA 3K57A 1NK6A 5HLFA 5D6WA 1XHXA 3KK2A 5CY4A 1Y97A 4TSXA 5KH6A 3SUOA 4FJKA 4KPYA 2G8WA 4RG2A 3SQ0A 1O1WA 3DOLA 3HL8A 1G15A 2R5AA 1B9DA 3HJFA 2E5QA 2VG5A 2E6NA 3DM2A 3FFIA 4J2DA 5J39A 3HO1A 4OKJA 3MXMA 4B9WA 3MEVA 3HT3A 4GVMA 3AO5A 4DMNA 3AVHA 5HRSA 3C6TA 1VSDA 3HPOA 4DTOA 4O55A 4C8KA 3ZSRA 4N5SA 2RHZA 3SUQA 3O8VA 3MEWA 1JLEA 2LTOA 4KI4A 4DQIA 4FJ7A 5J2QA 3K5OA 3QEXA 3QEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V8JA 5HDKA 2Q97A 4QQGA 3V6DA 2E2QA 1KG1A 3KYLA 2JM8A 2ICWG 2DXCA 3KFWX 3IV5A 3DQVC 2G3RA 3T19A 2B4JA 1Q86R 4OMLA 4F04B 3I0WA 2FBIA 2A3LA 1VSIA 5HS9A 3U9GA 4PLIA 2A61A 4LG3A 5CLSA 3DBLB 3N05A 1BIZA 1EWQA 1FW6A 1M4ZA 2GIVA 1XS9A 2PVGB 2JRMA 5HNFA 1LWCA 4DCHA 4ETSA 2L3SA 1L5UA 3QXEB 3FRNA 1JUPA 3CCVI 4JQFA 2NRZA 1W9HA 1SSFA 2NOZA 3R6NA 2DERA 4UC4A 3QQAA 4PIIA 2E2PA 5BRHA 2RHUA 4RB3C 2HMAA 4F7UB 2IS4A 3T1AA 1PDNC 5E17F 3CMAA 4NCBA 3DKWA 3F73A 2X4WA 1BGXT 2BYVE 3KEYA 1KD1U 3M8PA 4FYWB 1NHAA 1KD1C 4K42A 2NRVA 5J1UA 5AONA 1GCPA 3GLLA 4BBRJ 5E1WA 2NOGA 3R6MA 4JKFA 2JW4A 1JLFA 5KAFC 2WY8Q 4IHTA 4AYBN 4B47A 3IH4A 3LOCA 3AVIA 1JCFA 4O8KA 2XC7A 5HL7L 2LD5A 1M30A 3DJCA 1M3AA 2ELHA 2OZ6A 3AG3H 1WUAA 3SDBA 2OTJT 1W97L 2L3RA 1LE8B 2KDSA 4IX7A 3MQ0A 3ZQGA 4DIQA 3KZBA 4LOCA 1BN5A 3HFNA 4KHYA 5LRRA 1HJDA 2V7YA 3QPLA 2L01A 1IN8A 1YG2A 3O3GA 3IG1A 4HA8A 3K2AA 4LJZF 1YRNB 1STZA 2ZWHA 3GG4A 2AO9A 1GOBA 3DBHB 2K5IA 1I3AA 2G6FX 3UA7A 1H3HA 4G12A 4LF7K 2Y1JA 2HNDA 3I64A 4DQRA 3QRFF 3IRXA 3DLLA 2EAYA 4J9EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4CFD A;  4EP4 A;  3S6W A;  2XHB A;  1UA1 A;  1SKS A;  1MHN A;  4IFY A;  2RJF A;  4FYD A;  2KQ2 A;  4C5I A;  1BIU A;  1FK9 A;  4W5Q A;  4DTX A;  3RR8 A;  3SQ2 A;  4FJH A;  2L8D A;  3O4Q A;  4CEZ A;  1RT2 A;  4DFJ A;  4C5E A;  1SKR A;  4FK2 A;  4CEO A;  1RT6 A;  3CFR A;  2RF2 A;  2ZQB A;  2HHQ A;  3V9U A;  2XO7 A;  1VSE A;  2RKI A;  1S6Q A;  1NOZ A;  4CE9 A;  4N4G A;  1OYX A;  3TAF A;  1U48 A;  2OYQ A;  3CM5 A;  1IKW A;  4CCH A;  4IG0 A;  3SV4 A;  1J54 A;  3CM6 A;  1DTQ A;  2QKK A;  3MXJ A;  5J2P A;  3AVK A;  4A4H A;  3QET A;  4MFB A;  3LPT A;  4CGF A;  4B9T A;  1VSH A;  4F3T A;  4DF8 A;  4DSL A;  3SYZ A;  4ELV A;  1JKH A;  2DIG A;  4HHT A;  1U47 A;  3ULD A;  2RHX A;  1TAU A;  1BQN A;  3F9K A;  2JZ2 A;  4M45 A;  2L89 A;  4DTP A;  3VQA A;  3TI0 A;  4CRI A;  4CK1 A;  1SUQ A;  3DRP A;  5J2M A;  4K8Z A;  4GY5 A;  1C0M A;  4ID5 A;  3HXM A;  2PYL A;  3E9G A;  2FBT A;  2X6N A;  3O4N A;  1EKE A;  4RW9 A;  4O0I A;  1RTI A;  2WAC A;  1U4B A;  3SPZ A;  3LZI A;  2RI3 A;  4IBN A;  4F2R A;  3EZ5 A;  3RMB A;  5HRP A;  4CHO A;  4JRP A;  1LWE A;  1QSS A;  5JS1 A;  3SNN A;  1GOC A;  4DF4 A;  3KIO A;  3CFO A;  1ASU A;  4EP5 A;  3V9S A;  2YKN A;  3ZSZ A;  2HHW A;  1G5V A;  3DLG A;  4FW1 A;  3U6F A;  4RW7 A;  4W5T A;  3NFA A;  2KW4 A;  3NTH A;  3K57 A;  1NK6 A;  5HLF A;  5D6W A;  1XHX A;  3KK2 A;  5CY4 A;  1Y97 A;  4TSX A;  5KH6 A;  3SUO A;  4FJK A;  4KPY A;  2G8W A;  4RG2 A;  3SQ0 A;  1O1W A;  3DOL A;  3HL8 A;  1G15 A;  2R5A A;  1B9D A;  3HJF A;  2E5Q A;  2VG5 A;  2E6N A;  3DM2 A;  3FFI A;  4J2D A;  5J39 A;  3HO1 A;  4OKJ A;  3MXM A;  4B9W A;  3MEV A;  3HT3 A;  4GVM A;  3AO5 A;  4DMN A;  3AVH A;  5HRS A;  3C6T A;  1VSD A;  3HPO A;  4DTO A;  4O55 A;  4C8K A;  3ZSR A;  4N5S A;  2RHZ A;  3SUQ A;  3O8V A;  3MEW A;  1JLE A;  2LTO A;  4KI4 A;  4DQI A;  4FJ7 A;  5J2Q A;  3K5O A;  3QEX A;  3QEP A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2ELH A;  2OZ6 A;  3AG3 H;  1WUA A;  3SDB A;  2OTJ T;  1W97 L;  2L3R A;  1LE8 B;  2KDS A;  4IX7 A;  3MQ0 A;  3ZQG A;  4DIQ A;  3KZB A;  4LOC A;  1BN5 A;  3HFN A;  4KHY A;  5LRR A;  1HJD A;  2V7Y A;  3QPL A;  2L01 A;  1IN8 A;  1YG2 A;  3O3G A;  3IG1 A;  4HA8 A;  3K2A A;  4LJZ F;  1YRN B;  1STZ A;  2ZWH A;  3GG4 A;  2AO9 A;  1GOB A;  3DBH B;  2K5I A;  1I3A A;  2G6F X;  3UA7 A;  1H3H A;  4G12 A;  4LF7 K;  2Y1J A;  2HND A;  3I64 A;  4DQR A;  3QRF F;  3IRX A;  3DLL A;  2EAY A;  4J9E A;  4PLL A;  1QVF P;  3UKR B;  1M2V B;  2CGK A;  4HDV A;  1F36 A;  3SWN B;  1K4U S;  2XRI A;  4XU3 A;  4F17 A;  1SVL A;  1USS A;  2DQR A;  4Y33 A;  1TQI A;  2ASP A;  2CV1 A;  1H88 C;  1B34 B;  4UV8 A;  5FW9 A;  1HW5 A;  4JX6 A;  1OCC H;  3KP5 A;  5KCO A;  4O44 A;  2VUM J;  4AFQ C;  3G4S Q;  1RGI A;  2WV1 A;  3SAH A;  4AYB A;  2HOT A;  4FCY A;  1Z7L A;  1NK7 A;  4RB2 C;  3K70 C;  1XB4 A;  2O8E A;  2RF0 A;  4LDU A;  1MDU B;  3HSE A;  3VFZ A;  4DS5 A;  1JLG A;  1HKS A;  1OH8 A;  1TUY A;  2OBP A;  1WSG A;  1UGR B;  1QSY A; 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 3RR8 A;  4G6D A;  2DK3 A;  4BS9 A;  2CZ0 B;  1Q81 O;  5C12 A;  4M9X A;  4D6W A;  1YO5 C;  5C3E J;  1M3H A;  1JU5 C;  4EMK C;  1R8O B;  1I1G A;  3CXC P;  3J80 Z;  3CFR A;  1T2K A;  2E64 A;  5AZJ B;  3DLA A;  4M75 F;  3V9U A;  5IT9 O;  5JMV A;  3REO A;  3S15 J;  2RKI A;  4NHJ A;  2GUP A;  3RSE A;  2EFW A;  1NOZ A;  4CE9 A;  5BOX A;  3KNT A;  1F4K A;  1WBD A;  2V52 B;  3VUZ A;  5AQZ A;  4OIP F;  3MKL A;  1KAY A;  3P4I A;  5ERI A;  2OYQ A;  3RKQ A;  3CM5 A;  1TZL A;  3FMS A;  2O9L A;  2FL7 A;  1IKW A;  1VA7 A;  3SV4 A;  2DTI A;  4KUM A;  2BTF A;  1Y39 A;  2P5K A;  2ZXJ A;  5FLV A;  1P7J A;  2QQA A;  2JWT A;  4G8X A;  4HQM A;  1UHC A;  3ASO H;  4BEH A;  2HR3 A;  3RMS A;  4DYR A;  3G6E N;  1VSH A;  2W25 A;  5DCF A;  3SYZ A;  3BP8 A;  3QP5 A;  1JKH A;  3VYU B;  4HHT A;  1BKB A;  3ULD A;  2MD5 A;  2UV1 A;  1KFZ A;  4AD9 A;  3WEE B;  2GTD A;  4Q4Z F;  4NB4 A;  5LHG A;  1BQN A;  3F9K A;  4WCG A;  4EHU A;  4OIR F;  2L89 A;  1BC8 C;  4R8H A;  4DTP A;  1VYT A;  2UUZ A;  4LF8 K;  5GIN A;  3BE3 A;  1Z67 A;  1QQN A;  3CC7 A;  2E12 A;  3VQA A;  2AHQ A;  3QML A;  2E2J J;  4LGW A;  5J2M A;  1TWG J;  4Z89 A;  1YIT A;  2JM9 A;  4HT8 A;  1Q82 R;  2LYC A;  2Y2Z A;  1EKE A;  2O8C B;  3K4J A;  2NXN B;  1ZBJ A;  3PJR A;  3VSK A;  2QXL A;  1B7T A;  1U4B A;  3BPV A;  3SPZ A;  2CV0 A;  1HC8 A;  3LZI A;  2DO7 A;  4PJL A;  2RI3 A;  4F2R A;  3RMB A;  2HBK A;  2CQX A;  1YIJ I;  4EIK A;  5L3F A;  5FO5 A;  1GXP A;  1QSS A;  2A68 F;  3JCM Q;  4DF4 A;  3TPQ A;  5IHI A;  3SDZ A;  3V9S A;  2YKN A;  1T6D A;  1QGP A;  4CD1 A;  5I11 A;  4KBM B;  2GAU A;  2HHW A;  2L3P A;  4L9N A;  1X1C A;  2P9L B;  1GXI E;  5LJ5 g;  1ULY A;  1ZN2 A;  2DCE A;  1UFM A;  3M8F A;  2HOS A;  2KW4 A;  4W5T A;  4M7D E;  2AP1 A;  3FZF A;  1VQM N;  1MD0 A;  5HLH A;  5L8R E;  3NQO A;  3T1B A;  4JKG A;  1B59 A;  4LE9 A;  4TSX A;  1ACM B;  1P92 A;  1ON1 A;  1FOK A;  5C2F A;  5KH6 A;  5M1Q A;  3CBM A;  5KCM A;  1QHG A;  2XRO A;  2VCP A;  2DL7 A;  1XC3 A;  3LST A;  2Y31 A;  4RWT A;  5IHN A;  2RNJ A;  4M7Y A;  3CD6 Q;  2QA4 A;  2VQE K;  2VJJ A;  4J9C A;  4CZH A;  4J83 A;  4ESR A;  4J5Y A;  1ZRD A;  4HST A;  3MDQ A;  4ZNX A;  5J39 A;  3CMA N;  2EV0 A;  3MXM A;  1BIB A;  1XD7 A;  4A3M J;  1SHG A;  1IBM K;  3MEV A;  4GVM A;  4M7D F;  3AO5 A;  1D1C A;  3WTV C;  3LDL A;  1ZC6 A;  3C6T A;  3AT1 B;  4DTO A;  4O55 A;  1YQR A;  2RHZ A;  3JRA A;  3SUQ A;  1VQ4 Q;  1JLE A;  4KI4 A;  3N97 A;  4DQI A;  2XHI A;  1RUW A;  3QEX A;  2Q3S A;  1NLO C; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 1RDA A;  3CMA A;  3T1A A;  2WBM A;  4CEA A;  4NCB A;  4L59 A;  3I8D A;  3VKI A;  3F73 A;  2QKM B;  4NCA A;  2X4W A;  1BGX T;  3KEY A;  2LT4 A;  1KD1 U;  4CFA A;  3M8P A;  3VQD A;  3M59 A;  3AVL A;  1KD1 C;  3DPL C;  1JRI A;  2X85 A;  4XLH A;  2ZGW A;  3A1Y A;  4RMO A;  1JLF A;  2WY8 Q;  4P1W A;  4B47 A;  3FHN A;  2HD0 A;  3AVI A;  2XC7 A;  3NTK A;  2E10 A;  3KLG A;  4I2P A;  5LJ3 e;  4BWM A;  2B8A A;  3TAQ A;  3B6O A;  3SDB A;  2OTJ T;  2P1J A;  2R7W A;  1LWF A;  4Z4C A;  3P8H A;  2L3R A;  2KDS A;  4X9C A;  4IX7 A;  1IKX A;  4DIQ A;  4M78 D;  3HKS A;  3HFN A;  4KHY A;  3VYG A;  1OR7 C;  3W3C A;  2M7B A;  1TV6 A;  2JNG A;  3EFR A;  4FJN A;  1VIF A;  3KBG A;  1VQO A;  3O3G A;  4PA1 A;  1YTA A;  3IG1 A;  4HA8 A;  3O3F A;  4IUV A;  1RT7 A;  2B6A A;  1G3Y A;  2M0O A;  3HPG A;  1X19 A;  3MED A;  4FJG A;  2K57 A;  3LZJ A;  5GAN f;  4PJO D;  3ONQ A;  1GOB A;  4M3T A;  1EET A;  3VQE A;  2K5I A;  1YJW A;  3ITH A;  3UNG C;  2D9T A;  3I55 T;  1I3A A;  4M3Y A;  4DU4 A;  3C4S A;  4F7U A;  1TKT A;  1D0Y A; 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