3OYAA

Crystal structure of the prototype foamy virus (pfv) intasome in complex with magnesium and raltegravir at 2.65 resolution
Total Genus 106

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
LDAELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSHQ
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (9-17)S3 (44-47)EMPTYTIV1 (21-24)TI1 (25-28)S1 (30-33)S2 (36-41)TIV2 (32-35)3H1 (51-53)AH2 (54-64)AH3 (69-79)TIV3 (82-85)AH4 (85-94)S12 (361-365)TIV10 (327-330)TI'2 (136-139)TII1 (120-123)3H3 (214-217)TIV6 (158-161)AH8 (218-235)S4 (124-130)TII2 (235-238)TIV4 (135-138)TIV5 (147-150)S5 (141-147)TIV7 (210-213)AH9 (245-255)TIV8 (241-244)S6 (153-158)TI3 (148-151)S7 (181-184)S8 (205-208)O1 (239-241)TI5 (258-261)TI6 (259-262)AH11 (288-301)AH10 (265-270)O2 (274-276)TII3 (276-279)TI7 (281-284)TIV9 (311-314)TII4 (318-321)TII5 (331-334)S11 (351-355)S10 (337-348)TIV12 (356-359)TI2 (41-44)AH5 (97-102)TVIII2 (179-182)3H2 (188-190)AH7 (193-201)TI8 (283-286)S9 (321-326)TIV11 (346-349)AH6 (163-175)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Recombination,viral protein/dna
source organism Human spumaretrovirus
publication title Molecular mechanisms of retroviral integrase inhibition and the evolution of viral resistance.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PFV integrase
total genus 106
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2010-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3oyaA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3oyaA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3oyaA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3oyaA03
2FBYA 3L8BA 3MEGA 1RNHA 3B6OA 3NF9A 2FHDA 3KJVA 4C5EA 4IUVA 3LPUA 4DSLA 5J39A 1VRUA 1MU2A 1SKSA 1U48A 2IC3A 4FJHA 3VN5A 2RF2A 3BGRA 3SPZA 3LX7A 5D6XA 3P8DA 4OVAA 3MXIA 3CFPA 4NS5A 1T7PA 3CM6A 2F8TA 1Y97A 4AHUA 5CY4A 4A4GA 1BI4B 1L3TA 1BCOA 3HYFA 1ZBLA 3IAYA 1BIUA 1L3SA 2IGIA 3I0SA 1J9AA 2DTUA 2HW3A 4MFBA 1RTJA 4CIFA 2B5JA 2YNGA 4CEZA 3V9WA 4FXDA 3MEEA 3LGFA 3AA3A 3RRHA 1TKTA 3T19A 3ZSOA 1X1PA 4FLWA 2DFHA 4CF8A 4IUUA 3K59A 3NF7A 3ZSWA 2BE2A 3NFAA 4TSXA 5C0MA 1A5VA 4WE1A 4B9VA 2XY5A 4F2RA 4IURA 3VQQA 3ZT1A 4CERA 2DIGA 1J54A 4CJWA 3UIQA 3ZEHA 2XY7A 3AVHA 3ZSYA 2HHVA 1UAXA 4B9SA 4DTSA 3DB4A 2QXFA 4RW6A 1CZ9A 4CEDA 1QS4A 3QESA 2O4GA 1K6YA 4LSNA 1JLEA 2HHXA 4RG2A 4C8LA 1I3AA 3SQ2A 3V81A 4CFBA 1RDCA 1VSEA 2EHGA 2F8SA 2G8IA 3BDLA 3NAEA 1LV5A 3OYDA 3DMJA 5I3UA 4OLBA 2XHBA 3LZIA 4DWIA 3F73A 3QEPA 4FJ8A 1SKWA 1IKWA 4HUEA 2RKIA 1D9FA 3HSTB 3PMIA 3OYMA 2IAJA 4Y1DA 1BISA 1WAFA 2KFZA 3FFIA 1J53A 2L3RA 4HCCA 4KREA 1KLNA 2XDPA 2RI2A 3DYAA 5KRTA 3LGLA 1IG9A 4DFKA 3LWMA 3SQ4A 1LWFA 4KTQA 1JLFA 2KW4A 1WJRA 1ASVA 3WNHA 4QCLA 5KE3A 1R0AA 3ASKA 4N4HA 4QOZB 3CM5A 4Z4CA 3PO5A 2X4YA 4JRPA 1HNVA 1TGOA 4CEFA 3VQ7A 5KRSA 4HCBA 1L3UA 3O3GA 4A4EA 1U04A 4DF4A 4FW2A 1SKRA 3TWHA 1QE1A 3JSMA 4FW1A 4KFBA 1TK8A 3OYAA 4Y1CA 4CJFA 3K5NA 2B4JA 4M3XA 3LH0A 3SNNA 3O3FA 3VQ9A 2GV9A 4CEQA 1HYSA 4W5TA 3RMAA 4GMJB 1RILA 3RMBA 4PWDA 3CFOA 4X34A 3QJ6A 3HVTA 3OYIA 3LWLA 2X78A 1TKXA 3AO5A 3CQ8A 5DK5A 4HVJA 3LANA 2DAQA 4PL6A 2LVMA 1ASUA 4F4KA 3OYJA 3VQ6A 4NYFA 3KUFA 3HT3A 1VSHA 2HNZA 4DTXA 3L2RA 4FK4A 2R57A 1DLOA 3PNWC 4FJJA 4CIEA 4DTRA 4NCBA 1LWEA 4DTUA 1RT3A 1U47A 1XNIA 4K8ZA 1NK9A 5EU7A 5D6YA 1D5AA 1RT6A 4AH9A 1U4BA 2KZMA 2G8KA 1C1CA 5FRMA 3P1GA 4FJMA 1NK0A 4Z02A 1KVAA 5KH6A 1EX4A 3AO3A 2VG6A 3AVGA 2JGUA 4QAGA 2DFEA 1U49A 3E01A 1XI1A 4M3YA 1UA0A 1S6PA 4CRIA 1XC9A 4DU4A 1C0MA 3L2QA 4CF0A 1SV5A 2ETJA 1NJYA 4FLTA 3KLHA 1HYVA 3EAEA 4CEAA 2A1RA 3DLBA 3HK2A 1RDBA 3MEAA 3MO8A 4CIGA 4H8KA 2RN2A 1VSDA 1KHCA 4F8RA 3KD1E 3LP3A 4L8RB 1VSKA 3LDSA 3KK3A 4N47A 3AVIA 4CCHA 1TK0A 1C0UA 2VG7A 4CF2A 1QSSA 2HHQA 1JLQA 1BL3A 3DRRA 4JLHA 1BIZA 4DG1A 3DLMA 2RJCA 3WNEA 3OY9A 5J2QA 2E6NA 4CK3A 3KLEA 2Q3SA 1TL1A 3IRXA 4CFDA 5KCHA 1F21A 3PX4A 4ZTFA 5C24A 3HP6A 3QIOA 3P5JA 3OYEA 4CGIA 2Z1HA 2GFAA 3TAMA 1TKDA 3CEYA 3AVLA 3SJJA 2HQXA 4CEOA 4OPJA 1GOCA 3V6DA 4KHUA 3HXMA 3FEOA 4FJLA 4CESA 2XRIA 3NH2A 3ZSZA 4A4HA 3KLGA 4B9WA 3MEVA 3SYZA 1ASWA 4DQSA 1S9GA 2Y1JA 1S5JA 4C8KA 4NYNA 1X9SA 3MP1A 2ITGA 1X9WA 2MWOA 1WSEA 3NTKA 3OMGA 3VQ5A 4G1QA 4F3TA 4KHWA 2ZE2A 1S1WA 3ZT2A 4JS4A 4CJLA 3SUQA 1SSFA 3JYTA 1Q9YA 2VYTA 1KTQA 3LP1A 3OQ5A 3OYGA 4YNQA 3ALYA 4CJSA 4KHYA 3NHGA 4DTMA 4CGGA 3IG1A 1KRPA 2XY8A 3SUPA 2GUIA 1WSHA 4O55A 1LAVA 3HP9A 4AHRA 5CYQA 2ZD1A 4JRQA 1IH7A 2X35A 3PUFA 2D0CA 2X6SA 4DF8A 4CJ5A 4FJNA 2WACA 3MXJA 2VWJA 2D9TA 1YTUA 5SZTA 3S6WA 3I0RA 1SUQA 4EP5A 1SL1A 2YNFA 3OA6A 3VQPA 2IS3A 4N4GA 2OZMA 1Q8IA 3OYFA 4J2BA 1WJQA 1NKEA 4I2PA 4ELTA 2P51A 3TAQA 5HRRA 1C0TA 2RHYA 1JLCA 3ASMA 4CGDA 3H8ZA 4C5HA 1Z25A 5C6SA 4CJ3A 3KLIA 4BDPA 3P8HA 4DFMA 3H08A 4UQGA 2YRVA 1RT2A 3TAPA 2EX3A 4A4FA 1VSJA 1U45A 2RHZA 4RW7A 1TV6A 3F70A 2HHWA 3LALA 4W5QA 4LH4A 4I2QA 3O8VA 3NGIA 4I9QA 2IG0A 1GOAA 2YNHA 1VSMA 4CECA 3S3NA 4HCZA 4FLZA 4M3UA 1C1AA 1NKBA 2LTOA 3QEIA 4H4MA 4J2EA 4KKOA 4RG8A 3RMCA 4FYDA 4AILC 2HB5A 3NDKA 1RT5A 3SUOA 3MP6A 2Z1IA 5M9OA 3GOXA 3KD5E 3ZSRA 2Y1IA 3V9XA 3DLRA 4B9XA 1NK7A 1KLMA 4FJXA 4B9TA 1W9HA 2NUBA 2E6LA 3TABA 2O4XB 1O1WA 1S1VA 4OGCA 5DMRA 2G8HA 2B6AA 1HQUA 2ZQBA 4YFUA 1BI4A 4CK1A 2XK0A 3VQAA 3V1RA 3DB3A 1WSGA 1ITGA 3V1OA 2GF7A 3VA0A 2M0OA 3P83D 4KTWA 3AVCA 1EP4A 2LRQA 4BDYA 3L42A 3OJSA 4I7FA 4DSFA 2BDPA 5C25A 3OS0A 5CIUA 3FC3A 1NK8A 4CJEA 1WAJA 1OZ3A 3QEVA 4AHTA 2HMIA 3MP8A 4DU3A 1OZ2A 1KCFA 1WSJA 3QNNA 3V9ZA 3OYKA 2FBTA 3LZJA 1GOBA 2OYQA 1KFSA 3NF6A 2HNYA 3K58A 4KV8A 3OYLA 1BHLA 4O0JA 4FK2A 3L2VA 1WSFA 4CF9A 1N27A 5HRSA 3QINA 3QERA 1UA1A 1NJWA 3U6FA 2FBXA 4W5NA 3TI0A 4EZ9A 1NK4A 3QETA 4W5OA 1TL3A 3C4SA 3V9SA 3M8QA 5IN1A 1TAUA 3THVA 3U3GA 4OKJA 3DI6A 2GFUA 1RCHA 4R5PA 3AVBA 4DTNA 3C95A 2X6NA 4FZZA 4CHYA 4QQGA 3HPOA 3T3FA 4B9LA 4BE2A 2LCCA 5D6WA 1A5WA 4B3OA 1IO2A 2I5JA 4CK2A 2DIQA 4DU1A 3V1QA 3KKRA 3SQ1A 3O4QA 3FDRA 1YVUA 4Z4IA 4E3SA 3QKJA 2OPRA 4KI6A 1HYZA 3K2PA 4FLYA 1RDDA 3HO1A 3HL8A 5JS2A 4DS5A 4FJGA 1DTTA 3DLKA 2Z1JA 4DSEA 4B08A 4DS4A 2AJQA 2L8DA 1EXQA 4DTPA 3G0ZA 4LH5A 3MXMA 3SQ0A 4C8MA 4AHVA 3AVMA 4IFVA 1C1BA 2WOMA 4BE1A 3SUNA 1L3VA 3AV9A 3AA5X 5J26A 3EZ5A 3NH1A 5HRPA 1S1UA 3OS2A 2YHAA 2KFNA 3MECA 4DFPA 1B9DA 1W0HA 2G8UA 4FJIA 3ME9A 2RI3A 4E7LA 3PO4A 1YTAA 1ZBIA 2ATQA 1G5VA 3UWNA 1XWLA 4HUGA 4OKKA 3NBPA 4KB1A 3KK1A 3V9UA 4II1A 4N4IA 1Z26A 5HBMA 3NTIA 1RBSA 3SV4A 1I39A 1HJRA 3OS1A 4IG3A 3NNQA 3LLRA 3AO4A 2A1SA 2OA8A 4CJPA 3DLEA 3VQCA 1NOZA 3OYCA 4M3ZA 4CEBA 4ELVA 2IOCA 3L3VA 3C94A 2BANA 3TAGA 3NCIA 1NJXA 4OJRA 4IUQA 3Q1JA 3L2UA 3CFRA 4CJVA 4PA1A 2RHXA 3QLHA 3HJFA 4N56A 1CZBA 2HVHA 2OPSA 4E19A 3SI6A 1S1XA 2VWKA 3S9HA 4CGFA 2YKMA 1JXBA 3QIPA 5C42A 3AVKA 4FJ5A 4CGJA 1RT1A 3TR8A 2X4WA 5KTQA 1OI1A 3ZSXA 5SWMA 4HUFA 1S1TA 3V4IA 4E7JA 1G15A 3VQ8A 3DOKA 3AVJA 2L89A 1JL1A 3AVFA 3D0PA 3T1AA 3KIOA 3DLGA 3NGZA 2R58A 3VQ4A 4IUPA 5JS1A 1XHXA 3B6PA 2XO7A 2HVIA 4BDZA 4C8NA 2HHSA 1X9MA 2O4IA 3TARA 3ZSVA 4OVLA 1EETA 4IG0A 3IS9A 4ID5A 4Z4HA 2KQ2A 3UT1A 4IFYA 2G3RA 3OYNA 2RJDA 3QNOA 1IKYA 2EFIA 2BKDN 4O44A 4OKEA 2G8WA 4E7KA 2LSNA 2K3YA 2F96A 1QSYA 4CJKA 5K14A 4AHSA 1EKEA 2R5MA 2YHBA 1RBUA 2YNIA 3VQEA 3MAQA 1C6VA 3K57A 1B9FA 4FM2A 4FZXC 1RBTA 3G10A 2PY5A 4EP4A 3NGYA 5CYMA 1RBVA 1TKZA 3KTQA 1S9EA 3RTVA 4Z4FA 2RI5A 5CZ2A 2G8FA 1KVBA 4O4GA 4CHOA 4CF1A 4LSLA 1A5XA 4CJUA 1ZBFA 4FK0A 1N5YA 4N76A 1VSIA 4CHQA 4DQPA 1LW2A 1BGXT 1JLGA 3QEWA 3AA4A 3NTHA 4E1NA 3ZT0A 4Q5VA 5KGXA 3PY8A 5KE2A 4KI4A 3ZSQA 3M8PA 4DQQA 4RW9A 3HM9A 3ULDA 2OPPA 4HTUA 4MQ3A 4DSKA 2MWPA 2P5OA 1QHTA 1NK5A 4NCGA 4FJ9A 2VG5A 4I9LA 1FKOA 4ID1A 4PUOA 1REVA 2BUDA 1T03A 3A2FA 2CKKA 3TAEA 4B9NA 3O3HA 1BQMA 2X74A 2KZZA 3LAMA 3PFSA 1NK6A 4OLAA 2W42A 1JLBA 4IUTA 4M42A 1JLAA 2D0BA 3LP2A 3OB9A 1BQNA 2OPQA 3WNFA 4QW2A 3QBYA 1J5OA 1RI0A 4Q5WA 2FC0A 4DTOA 4CGHA 4UC4A 1CLQA 5HLFA 4ZTJA 4M45A 4RW4A 3HPGA 3D45A 4H4OA 4Z4EA 2R5AA 1QTMA 4IBNA 1OYXA 1JL2A 4FLUA 3HPHA 4E7IA 4GVMA 4ELUA 3E9GA 1VSFA 1LW0A 3VA3A 4OPKA 5T7BA 2RHIA 3CG7A 4ZHRA 5FDLA 4E89A 4FU6A 5HROA 4B9MA 3L3UA 4FCYA 4QQ6A 1L5UA 3PMTA 3RWUA 3LAKA 2R7YA 3PV8A 2BIVA 4FLXA 1QQCA 4GW6A 4C8OA 4FZYA 2LDMA 3EY1A 4Z0UA 1S6QA 4CE9A 4E7HA 2YKNA 2XY6A 4FLVA 3AA2A 4DFJA 3DM2A 5J1EA 3K5MA 3AVAA 3LPTA 2M16A 4DLGA 1B92A 2HHUA 4C5GA 2RPIA 4CFAA 4DLEA 2QKBA 4O0IA 2D0AA 4M3RA 2JTFA 1RTIA 4K8XA 1ZBUA 4LY7A 3C6UA 1NOYA 4F2SA 5D3GA 1MHNA 3M8RA 4B8AB 3QEXA 4EZ6A 4KHNA 4IKFA 3LYIA 2O4XA 1D9DA 3OYBA 2FBVA 2M1HA 4GY5A 4PY5A 4RW8A 4M3WA 4AHCA 3TAFA 4J2AA 1LWCA 2GBZA 4BWMA 1UOCA 4BE0A 3QO9A 2QKKA 5KI6A 3ZT4A 3OYHA 4DQIA 5FRNA 4OGEA 1XHZA 1VRTA 2DY4A 2RJFA 4DSJA 3PX0A 3ZCMA 3OMCA 4FL6A 3QIIA 4W5RA 5J2NA 2RJEA 3K5OA 4Z4GA 3EYZA 4L59A 3M8SA 3OVNA 1KFDA 3DLHA 1RDAA 2HQEA 1N6QA 1TK5A 4XIUA 2JZ2A 4QQDA 3SZ2A 4PLIA 2Z1GA 2OZSA 4DSIA 3MEWA 4DQRA 3KKSA 3F9KA 3KLFA 3TANA 2PZSA 2EQKA 1NJZA 1VK0A 1DTQA 4KRFA 3SPYA 2E5QA 2WONA 3K5LA 4CJ4A 3M9QA 2HNDA 4KO0A 3S3OA 3ISNC 5FROA 1WSIA 1ZBHA 3RRGA 3VQDA 4NZGA 1LAWA 2EQJA 2G8VA 4KAZA 4KPYA 1CXQA 2YV0X 1TAQA 5HRNA 1HQEA 1HNIA 5J2PA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2OZS A;  4DSI A;  3MEW A;  4DQR A;  3KKS A;  3F9K A;  3KLF A;  3TAN A;  2PZS A;  2EQK A;  1NJZ A;  1VK0 A;  1DTQ A;  4KRF A;  3SPY A;  2E5Q A;  2WON A;  3K5L A;  4CJ4 A;  3M9Q A;  2HND A;  4KO0 A;  3S3O A;  3ISN C;  5FRO A;  1WSI A;  1ZBH A;  3RRG A;  3VQD A;  4NZG A;  1LAW A;  2EQJ A;  2G8V A;  4KAZ A;  4KPY A;  1CXQ A;  2YV0 X;  1TAQ A;  5HRN A;  1HQE A;  1HNI A;  5J2P A;  2EKO A;  1HMV A;  1RT7 A;  4FJ7 A;  2RO0 A;  2D5R A;  3PX6 A;  5I42 A;  1WLJ A;  3SD4 A;  3L2W A;  2EQM A;  4KHS A;  5J2M A;  2E4L A;  1FK9 A;  1TVR A;  3ZT3 A;  1KVC A;  1RTD A;  4FVM A;  2B8A A;  4CHZ A;  4J2D A;  3O4N A;  2P5G A;  4Q0B A;  4B8C A;  4CFC A;  3CYM A;  1WGS A;  4DMN A;  4FM0 A;  1HPZ A;  1WN7 A;  3AVN A;  3HVR A;  1IKV A;  2K3X A;  4M41 A;  3H6Z A;  1FXX A;  3RR8 A;  4CHP A;  4KTZ A;  4BWJ A;  4PLL A;  1RT4 A;  3DRP A;  4N41 A;  4CEE A;  4NCA A;  2JLE A;  3MED A;  4O5B A;  1YT3 A;  1T8E A;  3LP0 A;  5IAY A;  1UWB A;  4F3O A;  3VQB A;  4E1M A;  2HHT A;  4CHN A;  4CJT A;  1KSP A;  2DFF A;  2PYJ A;  4FM1 A;  2RHU A;  1SL0 A;  2KTQ A;  2QK9 A;  3RR7 A;  4IDK A;  2P0K A;  4LD0 A;  4JS5 A;  3E9F A;  1ZYQ A;  4N5S A;  3C6T A;  5KCO A;  4QVZ A;  4B9U A;  3WNG A;  1RTH A;  2PYL A;  1JKH A;  4PQU A;  3I8D A;  5KGW A;  1IKX A;  2NLU A;  1SL2 A;  1H3Z A;  1JXE A;  3SV3 A;  3NF8 A;  4DTJ A;  1Q9X A;  1VSL A;  1BCM A;  4M3T A;  1FKP A;  2QQR A;  1D8Y A;  4HHT A;  3SCX A;  2F5K A;  3AO2 A;  3NH0 A;  2PQW A;  1NKC A;  1WJS A;  4KB0 A;  1WNS A;  4E0D A;  3ITH A;  3S3M A;  1T05 A;  2QQS A;  4BAC A;  4LD6 A;  2EQU A;  4BD3 A;  3OJU A;  4KHQ A;  1HRH A;  2X4X A;  5CZ1 A;  3FLG A;  3NE6 A;  1QSL A;  4C5I A;  3U3Y A;  2E6M A;  3MEU A;  3KK2 A;  1RBR A;  3BDP A;  2P1J A;  3DRS A;  4CJQ A;  3RMD A;  3DOL A;  4ICL A;  3MET A;  4EDU A;  5HP1 A;  4CJR A;  5E41 A;  1CXU A;  2BGG A;  2IDO A;  3AO1 A;  4FJK A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FBY A;  3L8B A;  2K3P A;  1RNH A;  2FHD A;  1WZ2 A;  3A03 A;  4FWR A;  4IUV A;  5CQY A;  3DLL L;  4YY3 K;  2FUG 2;  2A69 F;  1VQ4 I;  3FSP A;  1MU2 A;  3A0I X;  4JJC A;  4C0Z A;  5HK3 A;  4F55 A;  2EV6 A;  3GG4 A;  2A08 A;  1D5V A;  1OQK A;  3BGR A;  2HQR A;  3LX7 A;  2I0N A;  4U7B A;  2EIK H;  3CCJ Q;  3CFP A;  4BR9 A;  1T7P A;  5K7F A;  1Y97 A;  1FYM A;  4AHU A;  4LLG F;  1Y1W J;  1BI4 B;  3EHQ A;  4YOR A;  5D5W B;  1L3T A;  3ULQ B;  1XGO A;  1Y8Q B;  4LUD A;  1XQO A;  1ZBL A;  4NLC A;  3HPW A;  3DXM B;  5TRD A;  2RPN A;  3F9M A;  4UVC A;  1TS9 A;  2MC4 A;  3GYH X;  4NUB A;  5I2S A;  2DTU A;  1R5I D;  2Y4X A;  3MX2 A;  3CO7 C;  4XU0 A;  1RTJ A;  1VQ8 A;  2YCH A;  2PFU A;  1IXR C;  3AKZ A;  3M0P A;  1ATN A;  2B5J A;  3CJR B;  4Y7N J;  5KN8 A;  3LFU A;  1X27 A;  3DU5 A;  1KU7 A;  3A5Z B;  3RZO J;  3CBO A;  4JDS A;  1Q7Y C;  4FLW A;  3TRE A;  2DFH A;  4A2U A;  4IUU A;  4LD5 A;  3K59 A;  2CRE A;  3SWN B;  3ZSW A;  4UNF A;  1DPU A;  4Y4R A;  4PUS A;  2BE2 A;  2JA8 J;  1YIT Q;  2J5P A;  2DOA A; 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 2KQ2 A;  1ZR2 A;  5DUI A;  2EFI A;  4O44 A;  3CMY A;  2GQV A;  4E7K A;  2LSN A;  4CYC B;  5M1O A;  3CME N;  5GMK m;  3QYB A;  3M8E A;  3K9J A;  4CJK A;  3K4L A;  3CJQ B;  1M1F A;  5K14 A;  3QWX X;  1OJL A;  3CQZ J;  2ME0 A;  2YNI A;  3CCE N;  4DGW B;  4FZX C;  1RBT A;  2PY5 A;  3LA7 A;  3BEX A;  2LC4 A;  1HW2 A;  3J81 Z;  3H9G A;  4KH1 B;  4N0A A;  4F17 A;  1H1V A;  2G8F A;  3OBY A;  3K4B A;  4WF2 A;  2QWP A;  1RNL A;  4CHO A;  1A5X A;  4EGZ A;  4GV6 A;  3TSQ A;  2O31 A;  2PVD B;  4JRK A;  1DU6 A;  1H89 C;  1QA6 A;  3RES A;  1YJ9 Q;  4B3M K;  1YFN A;  1YOV B;  1BGX T;  3WXI A;  3AA4 A;  1YQL A;  3CCQ N;  2DVJ A;  2NOB A;  4Q5V A;  4LE9 A;  4XN3 A;  2YUO A;  1E6G A;  1TUD A;  2NOG A;  4RW9 A;  2GWR A;  2XDD A;  1JXM A;  1KQ0 A;  4HTU A;  4ZZL A;  4XLP F;  1AU7 A;  2O9L A;  5TKY A;  5LHG A;  2P5O A;  2UXC K;  2IA1 A;  2LJ3 A;  2Y0S N;  1Y8R B;  2FO0 A;  2DD4 A;  1JKP C;  1UJY A;  1WX6 A;  3PO2 J;  1XC3 A;  4H0E A;  2E60 A;  3WGG A;  2C0I A;  3Q0U A;  2O8B B;  3M57 A;  1T03 A;  1S72 A;  4I0A A;  3K4M A;  3A2F A;  3M1E A;  4B9N A;  4E1J A;  3B8A X;  3OV8 A;  3AHU A;  1RR8 C;  2X74 A;  1D0X A;  3VW4 A;  1FP1 D;  1WRJ A;  1X19 A;  1Z7L A;  2SEM A;  3RKY A;  2W42 A;  3ISP A;  1JLB A;  3R8E A;  1VF9 A;  1YQK A;  4XNF A;  1JLA A;  2D0B A;  4WCI A;  5H20 A;  3T1Y K;  3HBL A;  1SG5 A;  3WNF A;  1KC8 C;  1P4A A;  3LA3 A;  2F4O B;  2WBN A;  2LOO A;  3A5L C;  4OFE A;  1MD0 A;  5HLF A;  2M9H A;  2W41 A;  3IDH A;  3BDU A;  3RVC A;  1S72 I;  1F36 A;  4HLX A;  4C2U A;  2VAS A;  1X2Q A;  2NWM A;  4H4O A;  4KUM A;  4Z4E A;  4ENM A;  4BHC A;  4XH1 A;  1I1J A;  5CQX A;  1OYX A;  1JL2 A;  1XG7 A;  4PNO A;  4QPO A;  5LJ3 e;  4E7I A;  1LW0 A;  3VA3 A;  4AG1 C;  1OOT A;  2MI6 A;  2XGC A;  5GAM h;  3VDX A;  1NH3 A;  3FZF A;  1YW8 A;  1ETO A;  5T7B A;  4C9Y A;  1K8A U;  3L2C A;  3DWL A;  5IP9 J;  2JMC A;  1WWX A;  1VQ8 Q;  2IPO B;  2NS7 A;  4YPR A;  2TCT A;  3L3U A;  3H35 A;  4Q5S F;  1KU3 A;  4FCY A;  4AF1 A;  3I0W A;  2OTJ N;  3E5X A;  3MN9 A;  4PJN A;  2GTO A;  4FLX A;  2KRS A;  1QVG P;  4GW6 A;  4Z0U A;  1M1K U;  3S15 J;  1VQ5 A;  2CW0 F;  1J2X A;  1W7P D;  2FXA A;  2G7H A;  4FLV A;  2ECZ A;  3GOI A;  1NJI O;  4L5J A;  2V6C A;  5KYW A;  5EEH A;  1M5Q 1;  4ZGD B;  2VIX A;  3R9P A;  5J1E A;  4L6V 5;  3WUH A;  2ACJ A;  4L5I A;  3A8M B;  5KPR A;  3LPT A;  4A3M J;  3P9I A;  4OMZ A;  2ZC2 A;  1B92 A;  2FOK A;  3X25 B;  4C5G A;  1MPG A;  1N6A A;  2RPI A;  3H92 A;  4DLE A;  2YDL A;  3I33 A;  2E1M B;  5FKM A;  2RQQ A;  5LJ5 e;  3C65 A;  3CME Q;  4Y15 A;  2A41 A;  1RTI A;  3QZ9 B;  3VER A;  1Y6I A;  2HFH A;  5H6Q A;  4LLL A;  5GAN e;  4G7H F;  3CCE Q;  4IKF A;  2PJP A;  1VQ5 I;  2PQ8 A;  4IHS A;  3OYB A;  5E8I A;  1ZSZ C;  4M75 B;  3CCL I;  4UOB A;  1K78 A;  2FBV A;  4IHY A;  4RW8 A;  4M3W A;  1BN5 A;  3W6V A;  4AHC A;  1XOV A;  1XGN A;  1RI7 A;  3JS6 A;  3D2F B;  4J2A A;  2EYY A;  3QYE A;  2ISY A;  3LWI A;  2R93 J;  3GP8 A;  2R7Q A;  4DR6 K;  1AOJ A;  2GA2 A;  2YS9 A;  2CP3 A;  4DV1 K;  2QCO A;  2O8F B;  3DTK A;  3CCQ Q;  3OYH A;  2M3A A;  3RKX A;  3M3Y J;  2LR8 A;  1XHZ A;  3PX0 A;  3LL7 A;  3OMC A;  2KNB B;  5KYY A;  5GAN f;  5GAO n;  2RMO A;  2HYJ A;  3I55 T;  4YOX A;  4II2 A;  3GZ6 A;  1HKS A;  5GAH J;  2XHC A;  5KQD A;  4Z4G A;  3FHG A;  4B3S K;  5AIQ A;  4IQJ A;  1RDA A;  1TK5 A;  2BW3 A;  1MWK A;  2COM A;  2JZ2 A;  4QQD A;  3I9V 2;  2CYY A;  1Z67 A;  5CE3 A;  1TT0 A;  3TCJ A;  3IH4 A;  1PC0 A;  1U0J A;  3W2V A;  3G6E T;  1N3A A;  2FZK B;  3HI0 A;  2LC2 A;  3NAR A;  3CCJ N;  3FMQ A;  3KKS A;  2DTZ A;  2JTM A;  1IHV A;  2PZS A;  1MIJ A;  1O3R A;  1MA9 B;  5HNH A;  2W25 A;  5E17 F;  4A5M A;  4BY1 J;  4MFD A;  2AS5 F;  4DR2 K;  3WTY C;  4CJ4 A;  3D2E A;  1X6B A;  2YX6 A;  1ENH A;  2L2O A;  2F48 A;  3O08 A;  1D3B B;  3I71 A;  4X9C A;  1F4K A;  2EZI A;  4JI0 K;  3VEN A;  2NOE A;  4YOV A;  2JNG A;  5HRN A;  5IH2 A;  1HQE A;  1GFD A;  1WFX A;  3KP3 A;  4EJU A;  3D6R A;  2EKO A;  1VQM T;  3H0I A;  4M6X A;  4A3E J;  2JMW A;  2DYS H;  3HRM A;  2RO0 A;  2KHO A;  2NRV A;  3TTC A;  3L2W A;  3WXJ A;  3Q0V A;  2CQQ A;  5KVR A;  1YIT N;  3ZT3 A;  1KVC A;  3JCM e;  3GNF B;  2EFP A;  1TYQ A;  2BE9 B;  4CHZ A;  5AQY A;  4J2D A;  2IGO A;  3O4N A;  4Q0B A;  4B8C A;  1IV6 A;  4X0G A;  3F6O A;  3CYM A;  1WGS A;  3L1A A;  4BGB A;  1WXU A;  4FM0 A;  2FQ3 A;  1V4R A;  3TBI A;  1IRZ A;  3EG9 A;  2CMP A;  1FXX A;  5DLQ E;  1RT4 A;  5BRD A;  2F5V A;  4CC3 A;  2E4H A;  4FPB A;  1Z1D A;  4BI3 A;  1T8E A;  1LDK B;  1I5Z A;  2OTJ Q;  4DR1 K;  3IH7 A;  4YFK F;  2HHT A;  2OZU A;  3CCY A;  3SFI A;  1TUY A;  4H5N A;  4FM1 A;  3BY5 A;  3TTF A;  3EGX B;  3UB5 A;  4Y17 A;  2EVR A;  2R7R A;  4IDK A;  4JS5 A;  1WQ7 A;  4S04 A;  4EW0 A;  5FKO A;  2LH9 A;  2ABL A;  1VQO N;  4EPC A;  3JRD A;  1TQM A;  2E5Z A;  4B9U A;  4MNU A;  1WUA A;  3SQN A;  1JKH A;  4PQU A;  2KRM A;  2RGV A;  1IKX A;  1H3Z A;  3DLL F;  3NF8 A;  2F4I A;  4OIR F;  3I56 T;  1Q9X A;  1LUJ B;  4I6M B;  5CQE A;  3C0C A;  2K5L A;  1YJ9 A;  5JVG F;  1W0T A;  3SCX A;  3DPT A;  2F5K A;  2F7T A;  5EEG A;  2PQW A;  4IZ9 A;  1NKC A;  2VWF A;  2ZME C;  4HWI A;  4WXC A;  4E0D A;  2HVQ A;  3S3M A;  3WOD F;  4B21 A;  5FLX K;  1FYL A;  3PIP A;  2NYX A;  2H94 A;  1GLC G;  3L9F A;  4BNC A;  2V8J A;  2HQ5 A;  5M3M J;  1ZSZ A;  3LQR A;  4F04 B;  2X4X A;  2M51 A;  5LBQ A;  3LDO A;  1D1A A;  1T6S A;  3J7Y P;  3FLG A;  1QSL A;  2JUF A;  5F1J A;  3PVQ A;  4C5I A;  5LL6 Z;  3U3Y A;  2VQC A;  4V19 S;  1CSK A;  2RKH A;  1O3T A;  2P1J A;  3F8M A;  4FM4 B;  1G4D A;  3RMD A;  2O8D B;  5K7H A;  1SVL A;  1CXU A;  1VQL N;  1AWO A;  2IDO A;  3CXC P;  3JCM J; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 2YNG A;  1WJB A;  1LVK A;  2DXI A;  3CJR B;  4CEZ A;  3V9W A;  5FU6 C;  5LD2 C;  3LFU A;  3DU5 A;  4FXD A;  1YJ9 T;  3LGF A;  3A5Z B;  3AA3 A;  3MEE A;  3RRH A;  1BOB A;  4QPQ A;  1TKT A;  3T19 A;  3ZSO A;  3CBO A;  4KJZ A;  2CV2 A;  3CCS A;  4JDS A;  5EG2 A;  1Q7Y C;  1X1P A;  1N77 A;  4FLW A;  2DPP B;  3TRE A;  2DFH A;  4L5G A;  4CF8 A;  4IUU A;  3K59 A;  3SWN B;  3NF7 A;  3ZSW A;  1O9S A;  4E47 A;  2R4G A;  4Y4R A;  4PUS A;  2BE2 A;  3V7C A;  3NFA A;  2DOA A;  1AHJ B;  2OAU A;  4TSX A;  5C0M A;  1A5V A;  1YX5 A;  3K4J A;  4J7I A;  4CCL A;  4F7U G;  2FYK A;  4WE1 A;  4B9V A;  2L7K A;  1V5F A;  2XY5 A;  2CGH A;  3M59 A;  1M90 C;  2PUK B;  4F2R A;  4IUR A;  1BIA A;  1JBM A;  3VQQ A;  4ITV A;  2JUG A;  3ZT1 A;  4MZM A;  3AL0 C;  4M7D B;  4CER A;  2ELJ A;  1NG7 A;  2DIG A;  1J54 A;  4CJW A;  4E7S A;  3OOU A;  2DXU A;  4M75 C;  1LJO A;  3X26 B;  1WJ5 A;  3ZEH A;  4PJM A;  3UIQ A;  2XY7 A;  3AVH A;  3ZSY A;  1SAU A;  2HHV A;  3X24 B;  1UAX A;  4B9S A;  4DTS A;  3DB4 A;  2QXF A;  4PK4 A;  1VQK A; 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