3OYAA

Crystal structure of the prototype foamy virus (pfv) intasome in complex with magnesium and raltegravir at 2.65 resolution
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
LDAELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSHQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Molecular mechanisms of retroviral integrase inhibition and the evolution of viral resistance.
pubmed doi rcsb
molecule tags Recombination,viral protein/dna
source organism Human spumaretrovirus
molecule keywords PFV integrase
total genus 106
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2010-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3oyaA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3oyaA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3oyaA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3oyaA03
4B9VA 4M3WA 4DTXA 4R5PA 2BIVA 4CFDA 3TAFA 4N4GA 2R58A 3OS2A 3HPOA 4W5NA 1BGXT 3OYMA 1EKEA 1D5AA 4CJQA 1R0AA 1C6VA 1HYVA 4B9TA 4JRPA 3C94A 3V9ZA 1WGSA 4A4HA 5CY4A 4Q0BA 3KK3A 3OYDA 3Q1JA 3DLEA 3MP8A 1JLFA 3ZSRA 2I5JA 3CFRA 2P5OA 2L8DA 2E6NA 3V9SA 3HM9A 4AH9A 2RJCA 4CJKA 3AO4A 4FXDA 3QETA 2OPQA 4DU4A 2QKKA 1SKSA 4ICLA 5IN1A 3LZJA 4FJJA 4CRIA 2W42A 1XC9A 4M42A 4AHUA 3QERA 4O0IA 1TL1A 4CJRA 2DTUA 1W9HA 2VG5A 2VWJA 3B6PA 3EYZA 2QQRA 3M8SA 3QEWA 2YHAA 4OPKA 3RTVA 4CJVA 4CEEA 5IAYA 1SL2A 3QEXA 1KRPA 1LV5A 3HYFA 5J26A 3DOLA 1SL1A 2RF2A 1QSLA 3KTQA 4J2AA 1EX4A 3E9GA 5DK5A 3CFPA 2P5GA 1HNVA 4CHPA 3K5LA 2X6SA 3P5JA 4KPYA 3O3FA 3TI0A 4IUUA 3KLIA 4HCCA 1S1WA 4IDKA 4CJ5A 3DLBA 4HTUA 3PV8A 4CGFA 3HJFA 3ISNC 2Q3SA 4DLEA 2EQMA 2LCCA 4KFBA 3LAMA 3MEAA 4IFYA 3IAYA 4N76A 2YNHA 3VQ8A 1WAFA 3TWHA 3VQPA 4CJ3A 4KTWA 4PA1A 1WJSA 2RI2A 5CIUA 4I2PA 4E7LA 1HNIA 5FDLA 4O44A 4FJ9A 2HNYA 1D8YA 3OYLA 3VQ4A 2YNFA 3VQCA 3TAQA 2KFNA 5KGWA 4GMJB 1ZYQA 4C8OA 4CF0A 4KRFA 2M1HA 1NK7A 5CYMA 4EZ9A 4OGEA 1NKBA 3OYAA 1CXUA 2O4IA 1U45A 2RHIA 4LD0A 4E1NA 2P51A 4ZHRA 1O1WA 4DTRA 4H4MA 1C1BA 2HHQA 2KQ2A 4LSLA 1L3VA 2RHYA 2NLUA 1RTIA 1BQMA 2YRVA 4Y1CA 1JLCA 4W5QA 5D6YA 4DTMA 5HBMA 3KLHA 4NCAA 3NHGA 3M8PA 3DMJA 4PUOA 3V9UA 4E7KA 1X1PA 1BQNA 3QEPA 3TAPA 4M41A 4J2DA 4H8KA 2Z1IA 3RMAA 4Z0UA 3SQ2A 1MHNA 4B9UA 1I3AA 3KUFA 1D9FA 4E3SA 1L3TA 4II1A 4FL6A 1A5VA 2ZQBA 2E4LA 2LVMA 1SL0A 4QQ6A 4FZXC 3DLKA 2RI5A 3L42A 4DSJA 5FRNA 1SKWA 2ZE2A 3SQ1A 4DU1A 1KFSA 5KRSA 1HRHA 1C0UA 3BGRA 2HHVA 3V4IA 4JS5A 2OPSA 1K6YA 4CJUA 4CE9A 4K8ZA 2XY6A 5CZ1A 4NS5A 1MU2A 4OPJA 1B9FA 3S3MA 1LAWA 3QLHA 4KTQA 2IC3A 1RTDA 5J2MA 2RKIA 2DFFA 1SKRA 1VRUA 1C0TA 3AA5X 4ZTJA 1U04A 2G8IA 2KW4A 3NTHA 4HVJA 4M3ZA 4C5EA 1NK8A 4FZZA 1HYSA 3QESA 3CG7A 4ID5A 3O4NA 1NK0A 3P8HA 3CFOA 1RI0A 2GF7A 4CIFA 1XHXA 2GUIA 2F8SA 2RJDA 1SUQA 2O4XA 3VN5A 4O0JA 3NTKA 5KE3A 3IRXA 2XDPA 4FYDA 2RN2A 3SCXA 1DLOA 2FBXA 3ZT1A 4HCBA 4CGIA 4DQRA 3LZIA 5KGXA 3UIQA 3VQAA 1Q9YA 1S6QA 2PYLA 4Z02A 2L89A 5KH6A 3AVAA 4C5IA 1RT3A 3QJ6A 3ME9A 4CGHA 2RHXA 3FFIA 4FLZA 1S1UA 2FC0A 5DMRA 3M8RA 3ZSOA 2HHWA 1BIZA 2PQWA 3RR8A 3AVIA 5HLFA 4LH5A 4OVLA 4KTZA 3OB9A 4QAGA 3FC3A 1U48A 3L2QA 4BDPA 3K59A 1KFDA 1TL3A 1TK8A 4FJLA 2G8FA 3NE6A 3ITHA 3OYCA 1LWCA 3MEWA 3M9QA 1YVUA 1HPZA 1WAJA 1WNSA 3T3FA 4AHTA 3UT1A 4W5OA 4B9NA 4LH4A 4KB1A 3ZSXA 5SZTA 4FJHA 3HVTA 4EZ6A 1KTQA 5C25A 4L59A 2RJEA 4DFPA 1VSFA 4FJIA 3K5MA 2M16A 4F8RA 3RR7A 5D6WA 4EP4A 2VYTA 1RTHA 4CEDA 3S3NA 3LP1A 2O4XB 4E19A 1S6PA 1Q9XA 5FROA 4A4EA 4CEFA 4M3XA 3SD4A 1T8EA 4OKJA 1TAUA 4RW8A 2YKNA 3SNNA 4DFMA 3NH0A 3DLGA 2P0KA 3MEUA 3P8DA 2G8UA 4DQPA 2K3XA 2R5AA 4UC4A 2CKKA 2M0OA 3MXIA 1VK0A 1XWLA 4B3OA 5I42A 2B8AA 4DTJA 3PX0A 1BIUA 4QVZA 1TAQA 1RCHA 4N56A 2XK0A 4CJWA 4CF2A 4TSXA 3ZSWA 4M3TA 4CF8A 1RT6A 1H3ZA 4M45A 3MXJA 3TAEA 3SQ4A 4JRQA 3AVJA 4W5TA 1L5UA 5C42A 1Z26A 5KRTA 4DSIA 3DOKA 3NF7A 3AVMA 3HL8A 1ZBUA 4YFUA 4M3YA 5HRPA 1NOZA 1RT5A 3PMIA 3AVLA 4FJ8A 4RG8A 3RRHA 1YTAA 2BDPA 4IUPA 4RW7A 3ZT2A 3ZCMA 1NK6A 3CYMA 4FK0A 3DLHA 1B92A 1C0MA 4IG0A 4CHZA 2OPRA 3A2FA 3VQQA 4HCZA 2P1JA 3U6FA 4DTUA 2X74A 2HW3A 2G8WA 1VRTA 1IKXA 4G1QA 4I2QA 1GOCA 4Z4EA 3SYZA 1CLQA 3TANA 3F70A 3AO2A 3SJJA 1C1AA 4BE0A 4DSKA 5KE2A 1JXEA 1NJYA 4FLYA 1J54A 1IKWA 3VA0A 4KI4A 4FJGA 3LP0A 1JLGA 3QEVA 2EHGA 3VQ6A 3F9KA 2MWOA 1JLAA 2HB5A 1ASVA 1OYXA 1YTUA 4CJLA 4FZYA 3OYFA 4AHRA 4DSEA 3V1OA 4NCGA 3U3YA 3HXMA 2PY5A 2HQEA 3ZSZA 4DSFA 1JLBA 3AVCA 4ELVA 4FJKA 2G3RA 1NK4A 1HYZA 2B6AA 3IG1A 2XY5A 1UAXA 1ZBHA 3OJSA 1IO2A 3NH1A 1HJRA 4Y1DA 1CXQA 3NF6A 3LGLA 1L3UA 2KZZA 3NAEA 2WOMA 4FLXA 1L3SA 3PNWC 4O5BA 4FK4A 5J1EA 2EQUA 1EXQA 2BE2A 3ZT4A 5M9OA 3MEDA 4X34A 3MECA 2G8HA 3AO5A 4NYNA 3OYJA 1LW0A 3CEYA 1GOAA 3L2UA 3OMCA 3KD5E 3K5OA 4F3OA 4KREA 2EKOA 1JL2A 4IURA 3I0RA 3NTIA 4HUFA 3LDSA 3SPYA 5CZ2A 1S9EA 4C8MA 1TKZA 3C95A 3O3HA 4KHSA 2PYJA 2HVIA 1RBTA 4C8NA 3SV3A 1IKYA 1KVCA 1IG9A 3PY8A 2G8VA 4KHQA 3RMBA 2DFEA 1GOBA 2D5RA 3V81A 4DTOA 4E7JA 2X78A 4IKFA 3AVNA 3O3GA 1OZ3A 3OYBA 3EZ5A 5HP1A 1XI1A 3WNHA 2HVHA 2JGUA 5D6XA 2IGIA 3I8DA 4GY5A 1RBSA 3NGYA 3EY1A 4J2BA 4KAZA 2RI3A 4Z4CA 4B9SA 4XIUA 1BCOA 2GFUA 2YKMA 4FM2A 1FK9A 4YNQA 2ATQA 4Q5WA 5KI6A 1I39A 4FJ7A 5HRNA 3DRSA 2O4GA 4FM0A 4OKKA 3C4SA 1RDAA 4CIEA 2R7YA 1BHLA 3VQEA 4CGGA 4FLVA 3KK1A 4CHYA 2HNZA 5HROA 3FDRA 3MEVA 2XY7A 4DTSA 1QE1A 4CK3A 1REVA 3OYIA 5I3UA 3P1GA 3RWUA 4CK2A 2QQSA 3T19A 4KO0A 5J39A 2D0CA 3T1AA 1F21A 4CCHA 1VSIA 4AHVA 4O55A 1ZBIA 1UWBA 2OYQA 4JLHA 4KV8A 1QSYA 1U4BA 4RW9A 1RILA 2FBYA 3OJUA 3AVBA 3TARA 4IFVA 3OYKA 2GFAA 1YT3A 1NOYA 4DS4A 4C5HA 2FBVA 3QIPA 2F8TA 3RRGA 2JLEA 4CEAA 1VSMA 4F2RA 1CZ9A 3MEEA 3VA3A 4FJXA 4CHOA 4CEOA 3HO1A 4DSLA 4J2EA 1JKHA 5KCOA 3NGIA 1HQEA 4A4GA 1BISA 3IS9A 4E0DA 2RHUA 3H6ZA 4DWIA 3K5NA 1RDDA 4F2SA 1RT1A 3KLFA 2D9TA 3LGFA 4FK2A 3DLMA 3VQ9A 3LALA 2OPPA 1VSDA 1B9DA 3NFAA 3SUNA 2XY8A 2KFZA 2E6LA 4DF4A 3AV9A 3S6WA 3S3OA 3OA6A 2ITGA 1RT4A 5K14A 3MP1A 3OS1A 4QQGA 4N47A 1KLNA 1U47A 1TKTA 3VQDA 2WONA 3NF8A 3PX4A 1OI1A 1KSPA 2QXFA 3B6OA 1JL1A 2JTFA 3AA4A 4BACA 3MO8A 3D45A 1RBRA 3HPHA 3SUQA 2LRQA 4QW2A 1QQCA 1LWFA 1S5JA 4IG3A 2QK9A 3V9XA 4CFCA 1BL3A 1BCMA 3QNOA 3AO1A 4GW6A 3H8ZA 1RT7A 3LP3A 1KVAA 2RPIA 3LYIA 2OZSA 3KLEA 1D9DA 3AVHA 3OYHA 4DS5A 4MQ3A 2YV0X 2GBZA 3NDKA 4A4FA 4PY5A 1ZBLA 3DB4A 3OY9A 1UA0A 4DTNA 3ZEHA 2DY4A 2A1RA 4HUGA 3LPTA 2LDMA 3HPGA 4KHYA 2DIQA 5JS2A 3FLGA 4ELTA 4HUEA 4CESA 1WSFA 3CM5A 3HT3A 4BWJA 2HMIA 4I7FA 1WSIA 1J9AA 2MWPA 2RJFA 2EX3A 1SSFA 4HHTA 1JXBA 3HP6A 3SPZA 3MAQA 3SZ2A 3TR8A 2DFHA 1ITGA 4CJTA 3K57A 4KHWA 4N4IA 1WLJA 2Z1GA 5D3GA 2G8KA 3C6TA 4AILC 1RBUA 1RT2A 2R57A 4CECA 2Y1JA 4Z4HA 4IUQA 1NK9A 4CIGA 4PLIA 1S9GA 4RW6A 4QCLA 1N5YA 3ULDA 1T05A 3NGZA 4C8KA 4AHCA 3LPUA 3UWNA 3O8VA 1KCFA 3HVRA 1XNIA 1Y97A 2EFIA 3PUFA 3LP2A 3HSTB 1CZBA 4BWMA 1EP4A 4FJ5A 4I9LA 4MFBA 2B5JA 1KHCA 5EU7A 3QKJA 1TK5A 4ELUA 3TAGA 1G5VA 3AA3A 2AJQA 1BI4A 4Q5VA 3K2PA 3O4QA 2DIGA 3CQ8A 3QEIA 2Y1IA 3DYAA 1LAVA 1TK0A 4CJFA 4CJEA 3OS0A 4CHNA 4LD6A 4E1MA 1VSEA 5E41A 4FLWA 2BGGA 3LH0A 4NZGA 2IG0A 4DF8A 1NJZA 3P83D 4ZTFA 2F96A 1RDCA 1WSHA 1VSJA 2F5KA 2LTOA 1EETA 4B8CA 3L2WA 3LAKA 3QNNA 1ZBFA 3LX7A 1Q8IA 4B9LA 1T7PA 4KKOA 1N6QA 1WSJA 2BUDA 1SV5A 3QO9A 3E9FA 2IOCA 3THVA 3QINA 1HQUA 3L3UA 2JZ2A 1KVBA 4CGDA 2X4YA 3META 3RMCA 3VQ5A 3I0SA 3E01A 3ZT0A 2XRIA 4FLUA 4FJMA 3V9WA 4RW4A 2NUBA 4CF1A 4GVMA 3D0PA 2VWKA 3LLRA 4WE1A 4FW1A 4LY7A 2ZD1A 1TKDA 5SWMA 3OYEA 4O4GA 4L8RB 1TVRA 4IUTA 3DRPA 3VQ7A 4DLGA 3LWMA 3L2RA 1Z25A 4CGJA 3LANA 4K8XA 3HK2A 1QS4A 1BI4B 4FU6A 2YNGA 3ZT3A 1KLMA 1XHZA 3KKRA 1X9WA 2OZMA 4DQSA 4KHNA 3KK2A 1NKEA 1W0HA 1WJRA 4FVMA 2HHSA 1A5WA 3MP6A 2L3RA 2OA8A 5C0MA 3QIOA 3TABA 3OQ5A 5KTQA 3EAEA 2E6MA 3PO5A 3ASMA 4Z4GA 3KLGA 3RMDA 1FKPA 3G10A 5J2QA 3L8BA 1ASUA 4IBNA 3FEOA 1NJWA 4BE2A 3HP9A 3MXMA 4PLLA 2K3YA 1J5OA 4N5SA 2BANA 2FHDA 1VSKA 3SQ0A 2R5MA 1G15A 4EP5A 3KD1E 2KTQA 1DTQA 3PMTA 4OKEA 2HNDA 3NNQA 1IH7A 5T7BA 1OZ2A 4KI6A 1S1TA 2LSNA 4OLAA 4JS4A 4LSNA 4QQDA 4B9MA 3NH2A 2Z1HA 5J2NA 2WACA 1N27A 3BDPA 3CM6A 1A5XA 4PQUA 3BDLA 3WNFA 1HMVA 4FW2A 2HHTA 4BE1A 2YNIA 3V1RA 4CEQA 4E7HA 4ID1A 3V1QA 1C1CA 4DG1A 4CK1A 4Z4IA 2IDOA 4NCBA 4DMNA 4CFBA 4N41A 1NJXA 1VSHA 3ZSQA 3KKSA 3OYGA 4E7IA 2RHZA 3AVGA 1X9MA 1NKCA 3KJVA 1J53A 3F73A 2B4JA 3ZSYA 1TGOA 5HRSA 2BKDN 2HQXA 2ETJA 2HHXA 4PL6A 3QBYA 2A1SA 3DLRA 2X35A 3MEGA 5CYQA 1ASWA 3KIOA 1RDBA 4CJPA 3M8QA 3V6DA 1TKXA 4F4KA 4DU3A 3DB3A 4QOZB 4UQGA 4N4HA 1U49A 2GV9A 2VG7A 3SUPA 1NK5A 1WJQA 4NYFA 1JLQA 5C6SA 4E89A 3C6UA 3H08A 2IAJA 3AVFA 4BDYA 4FJNA 4CJSA 5HRRA 3PX6A 1QSSA 2RO0A 3PFSA 4DFKA 4DQIA 4IUVA 1UOCA 4M3RA 4CF9A 4FLTA 4BD3A 4CERA 4CFAA 1QTMA 2XHBA 3OVNA 1DTTA 2Z1JA 3LWLA 2QKBA 3ZSVA 2X4WA 1S1XA 5FRMA 4RG2A 3L2VA 4CEBA 3DI6A 4DTPA 1T03A 2E5QA 4M3UA 2X4XA 3SUOA 2D0BA 2YHBA 4I9QA 3QIIA 4KB0A 3OMGA 1IKVA 2FBTA 4OGCA 4DFJA 5JS1A 4OVAA 4CHQA 4AHSA 1X9SA 3OYNA 2D0AA 3PO4A 3WNGA 3WNEA 1WSGA 4B8AB 3DM2A 1WN7A 1RNHA 5C24A 4FCYA 4B9XA 3JYTA 4Z4FA 3ASKA 4B9WA 4KHUA 3TAMA 1RBVA 4CJ4A 4F3TA 3ALYA 2DAQA 1FKOA 5J2PA 2IS3A 3NBPA 4W5RA 2EQJA 1UA1A 1JLEA 2KZMA 4B08A 3NCIA 4EDUA 3SI6A 4FM1A 4OLBA 4C5GA 3S9HA 4H4OA 2HHUA 1WSEA 3VQBA 1S1VA 3AO3A 5KCHA 4PWDA 2EQKA 2VG6A 2X6NA 3AVKA 3NF9A 1FXXA 3JSMA 2XO7A 4DQQA 1LWEA 3K58A 4C8LA 3G0ZA 4BDZA 1RTJA 1QHTA 2PZSA 3U3GA 4CEZA 1VSLA 3L3VA 3DRRA 4OJRA 3SV4A 1LW2A 1TV6A 3AA2A 3GOXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DQVC 1JI8A 4LIUA 3OOPA 2L9NA 1K73U 3MMVA 1ZBSA 3TCJA 4ZGJB 4CZGA 1VQON 4LF8K 1ZLMA 4NLBA 3JREA 5KYNA 2DK8A 4BRHA 5KAIC 1IZ6A 4B1WB 1WZOA 5AFUA 3VYHB 5FPMA 1VQ9N 1KQ9A 3OS2A 2VKVA 3HPOA 2A7YA 2LP5A 1EKEA 3HRMA 1P4WA 2P6SA 3WTTC 2Q2RA 2DEUA 2LC2A 1VQNA 3OOUA 1O75A 2YDLA 2O8KA 3ERMA 4H4KC 2ECZA 4YHHK 1HYVA 2EW3A 4B9TA 3CCJQ 4XONA 1W36D 2FZKB 1S7OA 3G1LA 2M8EA 2NOGA 3A8YA 2Y31A 4PJOD 3FBIB 3P31A 1UGVA 2DQRA 4K11A 2QEXQ 3G3ZA 3CIPA 1HXDA 3CERA 1IRZA 2I5JA 3CO6C 3P38A 1C0WA 1MUYA 3CC4A 2VOOA 2E6NA 1XJWB 3JCMh 4LD5A 3LNQA 3CHWA 5GMKe 5TISC 4CJKA 3AO4A 1RDWX 4A5BA 1ZH5A 4IHXA 1RNLA 2RNJA 4N9IA 1SKSA 1TTHB 4ICLA 4FJJA 3N4PA 1K1ZA 4CI6A 3QERA 5HODA 1HX1A 1TL1A 2OTJA 3THWB 1UHMA 2Z3YA 1Q7YC 4XOPA 1VTNC 2XRNA 1ZR2A 2YHAA 1WHKA 4CEEA 3JAMZ 1SL2A 3SJMA 1FOWA 2HSTA 2VKHA 2RF2A 3GF2A 3MX2A 1TWFJ 3SEZA 2E70A 1KA8A 3BZCA 1M3CA 3WG7H 1OV3A 3TO9A 5AQGA 2X6SA 4KPYA 3TQNA 1JXMA 3ENOA 2EQIA 1MJBA 4RTVA 4RM2A 2CH5A 4Z89A 1XDSA 1TTYA 1MIJA 1TSFA 1GLDG 1W97L 1S1WA 3HBTA 2PX9A 4HTUA 5EF6A 1R5ID 3VF4A 1Q86C 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3V1R A;  4CEQ A;  4E7H A;  4ID1 A;  3V1Q A;  1C1C A;  4DG1 A;  4CK1 A;  4Z4I A;  2IDO A;  4NCB A;  4DMN A;  4CFB A;  4N41 A;  1NJX A;  1VSH A;  3ZSQ A;  3KKS A;  3OYG A;  4E7I A;  2RHZ A;  3AVG A;  1X9M A;  1NKC A;  3KJV A;  1J53 A;  3F73 A;  2B4J A;  3ZSY A;  1TGO A;  5HRS A;  2BKD N;  2HQX A;  2ETJ A;  2HHX A;  4PL6 A;  3QBY A;  2A1S A;  3DLR A;  2X35 A;  3MEG A;  5CYQ A;  1ASW A;  3KIO A;  1RDB A;  4CJP A;  3M8Q A;  3V6D A;  1TKX A;  4F4K A;  4DU3 A;  3DB3 A;  4QOZ B;  4UQG A;  4N4H A;  1U49 A;  2GV9 A;  2VG7 A;  3SUP A;  1NK5 A;  1WJQ A;  4NYF A;  1JLQ A;  5C6S A;  4E89 A;  3C6U A;  3H08 A;  2IAJ A;  3AVF A;  4BDY A;  4FJN A;  4CJS A;  5HRR A;  3PX6 A;  1QSS A;  2RO0 A;  3PFS A;  4DFK A;  4DQI A;  4IUV A;  1UOC A;  4M3R A;  4CF9 A;  4FLT A;  4BD3 A;  4CER A;  4CFA A;  1QTM A;  2XHB A;  3OVN A;  1DTT A;  2Z1J A;  3LWL A;  2QKB A;  3ZSV A;  2X4W A;  1S1X A;  5FRM A;  4RG2 A;  3L2V A;  4CEB A;  3DI6 A;  4DTP A;  1T03 A;  2E5Q A;  4M3U A;  2X4X A;  3SUO A;  2D0B A;  2YHB A;  4I9Q A;  3QII A;  4KB0 A;  3OMG A;  1IKV A;  2FBT A;  4OGC A;  4DFJ A;  5JS1 A;  4OVA A;  4CHQ A;  4AHS A;  1X9S A;  3OYN A;  2D0A A;  3PO4 A;  3WNG A;  3WNE A;  1WSG A;  4B8A B;  3DM2 A;  1WN7 A;  1RNH A;  5C24 A;  4FCY A;  4B9X A;  3JYT A;  4Z4F A;  3ASK A;  4B9W A;  4KHU A;  3TAM A;  1RBV A;  4CJ4 A;  4F3T A;  3ALY A;  2DAQ A;  1FKO A;  5J2P A;  2IS3 A;  3NBP A;  4W5R A;  2EQJ A;  1UA1 A;  1JLE A;  2KZM A;  4B08 A;  3NCI A;  4EDU A;  3SI6 A;  4FM1 A;  4OLB A;  4C5G A;  3S9H A;  4H4O A;  2HHU A;  1WSE A;  3VQB A;  1S1V A;  3AO3 A;  5KCH A;  4PWD A;  2EQK A;  2VG6 A;  2X6N A;  3AVK A;  3NF9 A;  1FXX A;  3JSM A;  2XO7 A;  4DQQ A;  1LWE A;  3K58 A;  4C8L A;  3G0Z A;  4BDZ A;  1RTJ A;  1QHT A;  2PZS A;  3U3G A;  4CEZ A;  1VSL A;  3L3V A;  3DRR A;  4OJR A;  3SV4 A;  1LW2 A;  1TV6 A;  3AA2 A;  3GOX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1UHM A;  2Z3Y A;  1Q7Y C;  4XOP A;  1VTN C;  2XRN A;  1ZR2 A;  2YHA A;  1WHK A;  4CEE A;  3JAM Z;  1SL2 A;  3SJM A;  1FOW A;  2HST A;  2VKH A;  2RF2 A;  3GF2 A;  3MX2 A;  1TWF J;  3SEZ A;  2E70 A;  1KA8 A;  3BZC A;  1M3C A;  3WG7 H;  1OV3 A;  3TO9 A;  5AQG A;  2X6S A;  4KPY A;  3TQN A;  1JXM A;  3ENO A;  2EQI A;  1MJB A;  4RTV A;  4RM2 A;  2CH5 A;  4Z89 A;  1XDS A;  1TTY A;  1MIJ A;  1TSF A;  1GLD G;  1W97 L;  1S1W A;  3HBT A;  2PX9 A;  4HTU A;  5EF6 A;  1R5I D;  3VF4 A;  1Q86 C;  3LDO A;  2M1B A;  3GTG J;  1VQ7 A;  5E3N A;  3CQT A;  2R7X A;  2LMJ A;  1QCF A;  1U2V B;  3WGI A;  2LCC A;  3LAM A;  4IFY A;  2ID3 A;  2L9S A;  2HGC A;  3IAY A;  3CJ9 A;  1FJG K;  1MMS A;  4A0X A;  2LF7 A;  5LJ5 h;  2NRW A;  1T98 A;  4OU0 A;  2VQG A;  2W03 A;  2WAD A;  5HS8 A;  2RI2 A;  4E7L A;  1HNI A;  2H8R A;  4M6V A;  3CBP A;  4R79 A;  4RB3 C;  1N78 A;  5GMK h;  2HBP A;  3CCR I;  4MO5 A;  4N0A C;  4HAM A;  4EA4 A;  1VQ4 I;  2YNF A;  3JCM b;  1BOT O;  3VQC A;  3CWS A;  1RAG B;  1M90 U;  5JVH L;  3ABU A;  2K4B A; 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 4M78 A;  5EG0 B;  8ATC B;  4ID1 A;  2WY7 Q;  1C1C A;  4O5V A;  1Y57 A;  3N5B B;  3CPW A;  1ZN2 A;  2YUN A;  4LDX A;  4LLG F;  2YXY A;  2E5N A;  2KSS A;  3CCU N;  2V6E A;  1GCQ A;  5IT9 Z;  3AVG A;  3CC7 A;  3QYF A;  4XSZ F;  2P0Q A;  1NGG A;  1IF1 A;  2Q97 A;  2CP0 A;  3MKL A;  1NGC A;  4MHG A;  2B4J A;  3ZSY A;  1QKW A;  2BKD N;  4HX4 A;  1WQ7 A;  3L2C A;  2G7H A;  4M7A E;  5J47 A;  2ZJ2 A;  3DLR A;  2GTD A;  4C0D B;  1YVN A;  3MEG A;  3CF2 A;  1ASW A;  5I2M A;  4CJP A;  3HEF A;  3QDR B;  3LDP A;  3CME N;  2H3G X;  5GAD J;  5AQL A;  3DB3 A;  4UQG A;  1U49 A;  2NRR A;  4DCH A;  2AQE A;  3SBG A;  2K3F A;  3Q7B A;  2RMO A;  2EH3 A;  3LA3 A;  2Y75 A;  3HOS A;  1IDZ A;  2V9K A;  4B1Z A;  1N3C A;  3H08 A;  3S1Q J;  4CJS A;  3TW7 A;  4MMK A;  2IVO A;  3MQ0 A;  4FLT A;  3EUA A;  1OH6 A;  3E6B A;  3SWN B;  4NC8 A;  2VJJ A;  3OVN A;  2RK2 A;  3IKM A;  2J4R A;  2QKB A;  3M1F A;  2P84 A;  3ZGK A;  1O57 A;  1S1X A;  4HDU A;  4M78 B;  3L2V A;  4IFE A;  3VJP A;  1VQ8 I;  5M1K A;  5CKB A;  3QO3 A;  4XQF A;  1JCF A;  1SPK A;  3GBQ A;  1O3R A;  2DAO A;  3J81 K;  3QII A;  3GFM A;  3CCL T;  4NLC A;  4KB0 A;  3UA6 A;  5JS1 A;  1X1A A;  3ER0 A;  4G94 A;  1IXR C;  3TSQ A;  2VAS A;  4DBQ A;  2D0A A;  3WNG A;  5D4R A;  1FMV A;  3D5R C;  4D9J A;  2CDT A;  1WSG A;  4CBU A;  2QTD A;  1ZQ1 A;  1B59 A;  3C1D A;  1H1V A;  4RMO A;  4G6D A;  4B8A B;  5HY6 A;  4C8Q C;  2Q0U A;  1I27 A;  2L4M A;  3UDC A;  1B4A A;  2VE9 A;  1YIJ I;  1NGI A;  2LK2 A;  1WJE A;  2E1M C;  4HV6 A;  1QNT A;  2V1N A;  1T3S A;  2AK5 A;  4DZP A;  2YCH A;  5B3S H;  4AVZ A;  1HNW K;  4GYI A;  4B9W A;  4KHU A;  3TAM A;  1RBV A;  1PD0 A;  3JCM W;  3ALY A;  2DAQ A;  3OA9 A;  1SG5 A;  2DER A;  5BN8 A;  3OIQ A;  4A54 A;  2A5Y B;  3VEW A;  5IWA K;  2DPD A;  4W5R A;  3Q0W A;  3R2X C;  1PKT A;  2R7W A;  1UA1 A;  2HI3 A;  1JLE A;  3CWA A;  1M1K R;  3NCI A;  1HLU A;  1K0X A;  4DOW A;  1T6D A;  4A93 J;  4B3R K;  4H4O A;  2HBL A;  1MPG A;  2DYR H;  1IAW A;  2H56 A;  1QPM A;  3NVM A;  3JCM e;  1BIA A;  2L5Q A;  2OJ2 A;  3OMY A;  2AKL A;  1U2W A;  2X6N A;  4LE9 A;  5AQR A;  5KNL A;  1FXX A;  3WU0 A;  1VQ6 Q;  2CGK A;  3JSM A;  1KC8 C;  4CCK A;  3A0I X;  3DBR B;  4F7U F;  4DQQ A;  4BR9 A;  4C8L A;  2XHC A;  3THW A;  4BDZ A;  1AHD P;  1N8R O;  4JRK A;  2QTV A;  2CH4 W;  3U3G A;  2C0O A;  4F7U G;  1VSL A;  3L3V A;  4ZGE B;  4WFN L;  3CCQ I;  3SV4 A;  4J9G A;  1SVM A;  1ABO A;  2R7V A;  4JAX A;  2EPF A;  2E1H A;  3AG3 H;  3HGG A;  3GOX A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 3U21 A;  4FXD A;  3QET A;  4ZDP A;  2OPQ A;  4CUG A;  4DU4 A;  2QKK A;  1SKS A;  4ICL A;  5IN1 A;  3LZJ A;  4FJJ A;  4CRI A;  2K4Y A;  2W42 A;  1XC9 A;  4M42 A;  4AHU A;  3QER A;  4O0I A;  1TL1 A;  4CJR A;  2DTU A;  1W9H A;  2VG5 A;  1O9S A;  2VWJ A;  2OTJ A;  1S72 T;  3B6P A;  1Q7Y C;  2CV1 A;  4XOP A;  3EYZ A;  2QQR A;  3M8S A;  2VJ5 A;  1R8O B;  4OPK A;  2YHA A;  3RTV A;  5GAN 2;  3QEW A;  1Q82 U;  4CJV A;  4CEE A;  3OW2 A;  1W2B A;  5IAY A;  1SL2 A;  3QEX A;  1KRP A;  1LV5 A;  3HYF A;  3C12 A;  5J26 A;  3DOL A;  1SL1 A;  2VKH A;  3JSC A;  1Q81 U;  2RF2 A;  1QSL A;  3BDU A;  3KTQ A;  4J2A A;  1EX4 A;  3GIB A;  3SEZ A;  2E70 A;  3CCJ A;  3E9G A;  4RKU E;  5DK5 A;  3CFP A;  2P5G A;  3V8J A;  1HNV A;  2L7K A;  4CHP A;  3K5L A;  2QEX A;  1D1B A;  2X6S A;  3P5J A;  4KPY A;  3O3F A;  3I55 A;  4RM2 A;  3TI0 A;  3JB9 F;  3R6O A;  4IUU A;  4HCC A;  3KLI A;  3OR2 C;  1S1W A;  4IDK A;  4CJ5 A;  3DLB A;  4HTU A;  3SEQ A;  1Q86 C;  3PV8 A;  3JB9 G;  5DLO A;  4HNT A;  4CGF A;  1VQ7 A;  3HJF A;  2R7X A; 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