3OS1A

Pfv target capture complex (tcc) at 2.97 a resolution
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The mechanism of retroviral integration from X-ray structures of its key intermediates
pubmed doi rcsb
molecule tags Recombination/dna
source organism Human spumaretrovirus
molecule keywords Integrase
total genus 100
structure length 365
sequence length 365
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2010-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3os1A04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3os1A01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3os1A02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3os1A03
3VQAA 4Z4FA 1SKRA 1NK5A 4CGGA 1J54A 3HP9A 4M41A 2LRQA 3MEEA 3OS1A 1U4BA 2IOCA 4LD6A 4DSLA 1WSIA 3HPOA 4E1NA 4NCAA 1RTHA 4BE0A 1TKXA 3OYFA 1MHNA 2XDPA 4CIFA 4QQGA 3MEUA 2G8UA 3ZEHA 4I9LA 4B9UA 4F2SA 4DTJA 4CHOA 4C8NA 3MEAA 1HYSA 3AVAA 3LPUA 3ITHA 3P8HA 3KLHA 3S3OA 4IG3A 2Z1JA 2HVIA 1WNSA 4KHNA 4DF8A 2QK9A 1TKTA 3KD5E 2R58A 1DTTA 5CZ2A 1X9MA 1QSSA 4M3XA 3O4NA 3DOLA 3AVFA 4DS5A 4KHUA 4M3WA 2ATQA 2OPRA 1QS4A 3QKJA 4DQSA 5KI6A 3LZJA 3LZIA 3DRPA 4FM1A 4LH4A 4PQUA 3LPTA 3SV4A 4J2EA 3ZT0A 1X1PA 3BDPA 1ITGA 3THVA 2DFFA 3Q1JA 2HVHA 3BGRA 3NDKA 4PWDA 4W5QA 4OKJA 4A4EA 3LAKA 3QEVA 2X78A 1KVAA 3LWLA 4M3ZA 1S1TA 3OJUA 4CHPA 3AA3A 4KO0A 1SKSA 3LLRA 4IUTA 4ZHRA 2O4GA 2EQMA 2AJQA 2RI3A 3NH0A 4KB1A 3LP2A 5E41A 4FLVA 4QCLA 1NKCA 3C95A 3ZSOA 3KLGA 1WSEA 4FJLA 1CXQA 4E0DA 3OYLA 2YRVA 1TL3A 1U04A 4RW8A 3MP1A 2GF7A 1UOCA 5J2PA 3LAMA 3I0SA 3NFAA 1N5YA 4B9LA 2RHZA 1S1XA 3OYDA 1BIZA 2Z1IA 4CK2A 3SUNA 4O44A 5CZ1A 4RW6A 2ZQBA 4QQDA 1UA0A 3VQCA 3O3HA 1J5OA 1NJZA 3TR8A 4CF9A 4CFDA 1VSHA 2F8SA 1CLQA 1X9WA 4W5NA 4BD3A 4WE1A 3TAFA 3MP6A 3KLEA 4I2QA 4DG1A 3MAQA 2QKKA 1BQNA 5CYQA 4B9TA 3PNWC 1VSLA 4Q5VA 4O55A 2B6AA 1TV6A 4CJ3A 4H4MA 2B5JA 2GFAA 2P51A 4HUEA 2BANA 5KGWA 4AHUA 4CHZA 3FEOA 4FW2A 2X35A 4FK0A 4CK1A 1ZBFA 2DFEA 4L59A 4F3OA 5FROA 3MEGA 1IKXA 4FJJA 2XY7A 2F8TA 3TWHA 3TAEA 1KSPA 4FXDA 2YHAA 3DLMA 3WNHA 1VSEA 2D0AA 3AV9A 1TKZA 2RJDA 1LAWA 2Y1IA 4CJQA 1XI1A 3MXJA 3ZSVA 3L8BA 3OYHA 1WJRA 2BE2A 3F73A 4CEBA 4I9QA 3AVBA 1BISA 5HRSA 5DK5A 4RW9A 2FBYA 4II1A 1TAQA 3L2QA 4KHQA 2HQXA 2OZSA 2F96A 3NTKA 4PLIA 3AVIA 2RPIA 2WOMA 1KFSA 3S3NA 1NKEA 4CJ5A 3FLGA 3C6UA 1O1WA 2X4XA 1VSKA 2P5GA 4M3TA 3WNGA 4ID1A 4MFBA 3NF8A 4Z4CA 1ASVA 1HRHA 3V4IA 4CJUA 1A5XA 4FM2A 3KLFA 1JLEA 1VSDA 5KCHA 2D5RA 3TABA 1TKDA 1ASWA 3ZT4A 4M3UA 4Y1CA 2XO7A 2O4XA 4DFJA 3BDLA 1RI0A 3KK3A 4CFCA 3RMBA 1IG9A 1L3SA 4RG8A 1BCOA 1YTAA 4CEZA 2FBVA 4AHSA 2OPQA 1L3TA 2PQWA 4CF8A 4IKFA 2HHUA 2W42A 4RW4A 3PO5A 2E4LA 4OGEA 1NJYA 2DY4A 5DMRA 4FZZA 1WSHA 3H6ZA 2DIQA 4CF1A 2L3RA 4CJ4A 4LSNA 3HP6A 3K5LA 5HP1A 3M8RA 1KLNA 2HHXA 3OYMA 3TAQA 3EYZA 3ZT3A 2YV0X 4BWMA 2B4JA 4CRIA 1Z26A 4O5BA 5C25A 3L2VA 4RG2A 4FJHA 2M1HA 4G1QA 2WONA 1G5VA 3CFOA 1WGSA 5C0MA 4NYNA 3O3FA 4Z4EA 3IRXA 4KI4A 1RNHA 2RO0A 1XNIA 1ZBHA 1KCFA 5J1EA 4CJVA 5M9OA 3TAGA 1QTMA 4PUOA 4CEOA 4Z4HA 1Z25A 1KFDA 4DLGA 3OS0A 3DLBA 2G8FA 1IH7A 1U47A 1DTQA 4OKKA 2IG0A 4N76A 1OZ2A 3EAEA 1T8EA 1VSIA 1JXEA 1QSYA 1ZYQA 4AHTA 3K59A 4E19A 1HNVA 1NK9A 3P1GA 3I8DA 1BQMA 4IDKA 3VQ5A 3V9WA 3SJJA 1TAUA 4E1MA 1RT4A 1JLBA 1VRTA 4E7KA 3ULDA 3RR8A 4C5GA 4CHNA 4B8AB 4FLUA 4F2RA 3PMTA 5KH6A 1RT2A 1X9SA 3OQ5A 4DQQA 3DB4A 1SV5A 1WJSA 1D5AA 1B9FA 3MECA 3KK1A 2G8HA 5C24A 1S9GA 1VSJA 5T7BA 4ELUA 3ISNC 4BDPA 3DI6A 4GMJB 3VQ4A 4FLYA 4DWIA 3DRRA 4CEQA 4F4KA 3NF7A 3LH0A 4CHYA 3K57A 5J2MA 3L2WA 4AH9A 3AVLA 1CZBA 3SPYA 4J2DA 2DFHA 2HNZA 3NF6A 3DYAA 2VWKA 1S1VA 1IO2A 5FRNA 3PV8A 4KPYA 3A2FA 4KV8A 2E5QA 3PX0A 3NAEA 3OYAA 4N5SA 3NTIA 2EFIA 1SL0A 4J2AA 1RTDA 2PYLA 4HCCA 3MO8A 2NLUA 1SUQA 1L3VA 3AA4A 4FJNA 2LTOA 4IUUA 5HRRA 1JLQA 1OI1A 1NK0A 4DTNA 5KTQA 4R5PA 3QEPA 2RHIA 3T1AA 2R7YA 4FW1A 1C1AA 5CIUA 5J2NA 3H8ZA 3K58A 1OYXA 2EX3A 4QAGA 1A5WA 2D0BA 4JS4A 2XHBA 4CEFA 2XY6A 3OYNA 1B92A 3QO9A 4C8MA 2OYQA 2P0KA 1VK0A 3CM5A 2M16A 2X6NA 1YTUA 4JS5A 3AVJA 4CFAA 3CYMA 3SUPA 3KTQA 2IGIA 3HK2A 3SV3A 4DU4A 1HPZA 1BI4B 3SQ1A 5C6SA 1LWEA 2FC0A 4B9SA 4IUVA 1BL3A 4FYDA 2IAJA 2DAQA 4H4OA 3VQEA 2GUIA 2BUDA 3V9UA 1FK9A 3LALA 4IFYA 2GV9A 2KZMA 3SQ4A 3AVHA 1NJXA 4LY7A 4CERA 1KVBA 3O4QA 4JRQA 4PL6A 3VQ7A 3PO4A 2A1SA 1ZBLA 2YKNA 3CM6A 3L3VA 4O0IA 4FLXA 2HNYA 3HXMA 3K2PA 4Q0BA 4FU6A 1H3ZA 4CE9A 5SWMA 3K5OA 4O4GA 3B6PA 4KHWA 4UQGA 3HM9A 3V9SA 3JSMA 5HLFA 2IC3A 3S9HA 4C8LA 2R57A 1NK6A 2OZMA 3TI0A 2JTFA 3V9ZA 2RJCA 4PY5A 4N56A 2L89A 1MU2A 3VQPA 2I5JA 1BGXT 3HJFA 2HB5A 3OB9A 4FZXC 3U3GA 2LVMA 2IS3A 1LW2A 4BWJA 2JLEA 3TANA 1WSFA 4CFBA 4EDUA 2ETJA 4DTRA 4JLHA 3QBYA 4KTWA 2X6SA 2YNHA 1FKOA 3SQ0A 3UIQA 4W5TA 3SD4A 2PZSA 3SI6A 2DIGA 4DF4A 4MQ3A 4DU3A 4F3TA 3DB3A 1C1CA 3ZSZA 4C8KA 1L5UA 3NGYA 3CFPA 5EU7A 4BE1A 5HBMA 4FJ7A 4FJ8A 1VSFA 3D45A 2HHVA 4N4GA 4IFVA 3RMDA 5K14A 4CF2A 2FHDA 3HYFA 3MEVA 1RTJA 3E9FA 3C6TA 4AILC 1A5VA 3LANA 1UWBA 1C0MA 3VQ8A 4YFUA 3LGLA 1XHXA 3V1RA 4O0JA 3ASKA 1RCHA 5JS1A 1C1BA 3QETA 4QW2A 2BDPA 1LWFA 4B8CA 3JYTA 4DSFA 1WJQA 4Y1DA 1XWLA 1FXXA 2K3YA 2EQKA 2HW3A 4CGHA 3PX4A 3VN5A 4EZ6A 2Y1JA 4CJTA 1U45A 4DTPA 2ZE2A 4B08A 3CEYA 4KKOA 1VRUA 4N47A 3LWMA 4NS5A 3AO4A 4CGDA 4B9VA 2P1JA 3CG7A 2RHXA 3QIIA 3SNNA 3K5MA 3VA0A 5D3GA 3RTVA 2E6LA 3HVTA 1RBUA 1SL1A 3IG1A 1HYZA 1S6PA 1WAJA 1RDDA 4FVMA 3ALYA 3VQ6A 3UWNA 4A4FA 3TAPA 1RT1A 4HTUA 4GY5A 1JL1A 4Z02A 5J2QA 1GOCA 2G3RA 1C6VA 4CF0A 3C94A 4IUPA 2VYTA 1WLJA 5D6WA 1WN7A 4HUFA 2HHQA 1BIUA 4IBNA 5IN1A 3MEWA 1R0AA 4NCBA 4CJKA 4ZTJA 2EQUA 4DTXA 3I0RA 3AVMA 1YT3A 4B9WA 2O4IA 2P5OA 2RHYA 3VQ9A 4CHQA 3RMAA 3HVRA 4B9XA 2MWPA 3NE6A 3VA3A 2EHGA 4DU1A 3AA5X 5HROA 4E7IA 1S6QA 3PMIA 1WSGA 4TSXA 3B6OA 3ZT2A 4PA1A 5CY4A 1D8YA 4FZYA 3WNFA 3QESA 2KFZA 3NGZA 3OYJA 2M0OA 2LDMA 3KKSA 3DLEA 2DTUA 1JL2A 4CJRA 2QXFA 4CIGA 4OLBA 2Z1GA 4CGJA 5CYMA 3L2UA 1J9AA 3P5JA 5HRPA 1EXQA 4I7FA 1TK8A 2VG6A 1NKBA 4Z0UA 3M8PA 4B3OA 3ZSRA 2HMIA 4DSIA 3PUFA 3ZCMA 3SPZA 2G8KA 3QEIA 3IAYA 1QQCA 3KIOA 3VQDA 3QINA 2YNFA 2XY8A 4KI6A 2KFNA 3L42A 5KE2A 5IAYA 3L3UA 4FLZA 1RDCA 3SYZA 3E9GA 3AVCA 3VQBA 3AVKA 4KREA 1RBRA 2OPPA 3F70A 4YNQA 4M3YA 1JLGA 1DLOA 4W5OA 3TARA 3AO5A 3NF9A 2PY5A 2F5KA 1K6YA 4JRPA 1TVRA 4DTUA 3O3GA 1IKVA 2HNDA 3NCIA 3QERA 4F8RA 1HJRA 3NH2A 4DLEA 1U48A 4LSLA 3FC3A 3NH1A 1D9DA 4E7JA 2XK0A 3NGIA 4FK2A 3ME9A 4K8XA 2A1RA 1HNIA 2RJFA 3V6DA 1VSMA 1S1UA 5SZTA 1N27A 1KTQA 4KTQA 2QQRA 4OPKA 3QIOA 2D0CA 2E6NA 3OMGA 2HHWA 1WAFA 4CEEA 3OY9A 5JS2A 1IKYA 1QSLA 1NJWA 4HCZA 1XHZA 3QIPA 3EZ5A 2RJEA 4A4GA 3HL8A 3L2RA 3IS9A 1REVA 1GOAA 4EP5A 3OMCA 2RN2A 3KKRA 1KVCA 4IG0A 3OYEA 1T05A 5KCOA 1B9DA 3DOKA 3D0PA 5I3UA 4ELTA 1JKHA 3QLHA 3KD1E 4LH5A 3M8SA 4M3RA 3M9QA 4CGIA 3LDSA 4ELVA 4DQPA 4GVMA 5KE3A 3PX6A 1U49A 5C42A 4CJFA 2G8WA 4CK3A 1RDAA 3GOXA 3NBPA 1SL2A 3T3FA 4AHVA 2X4YA 4FJGA 4EP4A 3AO1A 1JXBA 3QJ6A 4XIUA 2G8IA 3MP8A 4E3SA 4LD0A 3LX7A 4KRFA 1JLCA 4M42A 4CIEA 1KHCA 1RT5A 1S1WA 2B8AA 1EETA 4DSKA 3P83D 4CJWA 3M8QA 4HVJA 3SUOA 3PY8A 3G10A 2KTQA 4CJPA 2QQSA 4BDYA 1L3UA 1F21A 3AO2A 1RDBA 3OYBA 4IURA 4RW7A 1S9EA 4EZ9A 2L8DA 3LP1A 4CGFA 1QE1A 4N41A 2LCCA 1RTIA 4J2BA 3MXIA 4BACA 3HPHA 4KB0A 2YNGA 4ICLA 3LP0A 3TAMA 3HO1A 3OJSA 1TL1A 3DLHA 4E89A 4FM0A 2GFUA 2BIVA 3RWUA 3NNQA 4CEAA 2MWOA 3V1OA 3NHGA 1HQUA 4NZGA 3PFSA 2HHTA 1BI4A 4FLWA 4FJ5A 3OYIA 1BHLA 3U3YA 2RKIA 4I2PA 1RILA 3DLRA 1Q9YA 4HHTA 2QKBA 1I39A 1UA1A 4KHSA 1J53A 4PLLA 4L8RB 1CZ9A 4DSJA 4DMNA 1GOBA 1HYVA 3ZSXA 1UAXA 4DFPA 1RT7A 4KTZA 5FDLA 2OA8A 4M45A 3DLGA 4QQ6A 4OVAA 3LP3A 1ZBUA 3CFRA 5KRTA 4FLTA 1LAVA 3FDRA 5HRNA 3MXMA 4QOZB 1HMVA 2HHSA 4KAZA 2IDOA 3SQ2A 4OPJA 4BE2A 3DMJA 2EQJA 1EX4A 2Z1HA 1HQEA 3SCXA 1IKWA 2X74A 1OZ3A 4A4HA 3QEXA 3ZT1A 5I42A 2G8VA 1NK8A 1FKPA 1RT6A 3V1QA 4DTMA 5J39A 4CESA 1C0UA 4CJSA 4B9NA 2FBXA 3SZ2A 4E7LA 1JLAA 3O8VA 3CQ8A 2XRIA 3HSTB 3WNEA 1CXUA 4DTOA 2RF2A 1RBSA 3G0ZA 3FFIA 4C5EA 4DTSA 1RBTA 4W5RA 3RR7A 4NYFA 3RRHA 3U6FA 2O4XB 1NK7A 3LGFA 1KRPA 5D6YA 2GBZA 4FJXA 3S6WA 4Z4GA 3E01A 4AHRA 3OYGA 3P8DA 4CECA 4HCBA 1T7PA 3VQQA 2RI2A 4FCYA 4C5IA 4OVLA 3SUQA 4DFMA 3MEDA 2D9TA 4NCGA 1TGOA 3F9KA 4FJMA 3V9XA 2PYJA 1JLFA 4FK4A 3ZSQA 2KQ2A 3ASMA 4DSEA 4C5HA 2Q3SA 1ASUA 4OJRA 4KHYA 1D9FA 4K8ZA 3ZSYA 4BDZA 2X4WA 4DS4A 2EKOA 1XC9A 1G15A 2BGGA 1YVUA 3AO3A 1RBVA 4AHCA 4E7HA 3RMCA 1W9HA 4X34A 1C0TA 1NOZA 3KK2A 2BKDN 1EP4A 2VWJA 3OYKA 5J26A 1S5JA 4Q5WA 3AVGA 1LW0A 4FL6A 1LV5A 3T19A 1NK4A 2KZZA 3RRGA 3OS2A 3KJVA 1Q9XA 4FJIA 4UC4A 1EKEA 1BCMA 4CJLA 4C8OA 4CJEA 2YNIA 2E6MA 1QHTA 4DQRA 2ZD1A 3OYCA 2XY5A 1W0HA 4N4IA 2YHBA 1KLMA 2NUBA 1SSFA 2CKKA 1NOYA 3QNNA 4N4HA 2JGUA 3DLKA 4DQIA 4CEDA 1Y97A 3V81A 4FJ9A 3META 3QEWA 2YKMA 3KLIA 4ZTFA 1TK0A 2FBTA 3C4SA 2K3XA 3ZSWA 3HT3A 2OPSA 1T03A 5KRSA 3LYIA 2KW4A 4DFKA 4Z4IA 3UT1A 4FJKA 2HQEA 1Q8IA 2RI5A 2VG7A 4QVZA 2R5AA 3HPGA 3EY1A 2ITGA 4HUGA 3NTHA 3KUFA 3AVNA 4GW6A 4IUQA 2RHUA 2JZ2A 2R5MA 4B9MA 1WSJA 4OGCA 3OA6A 4CCHA 5FRMA 1SKWA 3S3MA 2LSNA 5KGXA 3K5NA 3QNOA 3H08A 5D6XA 4OLAA 3DRSA 2WACA 1ZBIA 3AA2A 1TK5A 3OVNA 4KFBA 4ID5A 1LWCA 3DM2A 2VG5A 1N6QA 4H8KA 1RT3A 4OKEA 1I3AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HNWK 4CI6A 4OO1J 3KTUA 4CGGA 4KUMA 3CCET 2M7BA 5KYXA 3DP7A 2GNCA 2KZVA 4RTUA 3RKQA 1U4BA 5IOYA 3OH6A 1QKXA 3OSGA 4HW0A 2M34A 4EA4A 4DSLA 5FKMA 4A3BJ 2ELKA 4HAMA 1BB9A 3VPRA 2BVMA 3HRTA 1MHNA 5IT9O 4M3GA 2K4JA 3CQTA 1OX8A 5GAOl 3ZEUB 1WQWA 3CP8A 4OMQA 3CCRQ 2L4MA 1NGEA 3Q0VA 4AFQC 4XRFA 5GAN3 3JAMK 4DNCA 2O8FA 2QDLA 3EH1A 1M1KU 1V4SA 3C7NA 5KCMA 1KQ8A 2DODA 2MPXC 4IG3A 2J6OA 3VEZA 2HVIA 2QWWA 3WTUC 4HT8A 3FZHA 1VQOI 1GLJO 1LNXA 2MD0A 4HNTA 3LAPA 1L0OC 2ZZDA 2ZJQL 2QK9A 3J80K 1S22A 4JKBA 1DTTA 2DI3A 3G73A 3JCMV 2AK5A 3MDQA 4BRCA 4BRDA 2E2NA 1CF7A 1LFUP 4FM4B 2JS0A 3C3WA 2FZGB 3AVFA 4XK8E 2OPRA 2FSKA 5F1RA 5CLSA 2CZ7B 2QEXI 4ZDLA 1U1SA 1K73R 2UUBK 2FU4A 1IRXA 2DMTA 3DKYA 1ITGA 3TOBA 2FYKA 1M2VA 2DFFA 4DIQA 5F27A 3JCMQ 4HX4A 4JNEA 4PWDA 3I5UA 4RTFD 3URGA 4A3JJ 2QLZA 3S1MJ 1N25A 4HG2A 2DVEA 1KVAA 5I2MA 1IXDA 3CF2A 1Y0MA 4X62K 5BNGA 4H0OA 3OJUA 4A3CJ 4EMKA 3VRZA 1K9MU 1YYVA 4JKCA 2V8JA 4YFXF 1JXMA 1VQ9Q 1O7LA 4HLYA 5GAOq 2H6CA 2E2OA 1SKUB 4KO0A 3U1KA 2KZGA 2EWSA 1SKSA 1KG4A 3QPTA 3LLRA 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 3OYC A;  2XY5 A;  1W0H A;  4N4I A;  2YHB A;  1KLM A;  2NUB A;  1SSF A;  2CKK A;  1NOY A;  3QNN A;  4N4H A;  2JGU A;  3DLK A;  4DQI A;  4CED A;  1Y97 A;  3V81 A;  4FJ9 A;  3MET A;  3QEW A;  2YKM A;  3KLI A;  4ZTF A;  1TK0 A;  2FBT A;  3C4S A;  2K3X A;  3ZSW A;  3HT3 A;  2OPS A;  1T03 A;  5KRS A;  3LYI A;  2KW4 A;  4DFK A;  4Z4I A;  3UT1 A;  4FJK A;  2HQE A;  1Q8I A;  2RI5 A;  2VG7 A;  4QVZ A;  2R5A A;  3HPG A;  3EY1 A;  2ITG A;  4HUG A;  3NTH A;  3KUF A;  3AVN A;  4GW6 A;  4IUQ A;  2RHU A;  2JZ2 A;  2R5M A;  4B9M A;  1WSJ A;  4OGC A;  3OA6 A;  4CCH A;  5FRM A;  1SKW A;  3S3M A;  2LSN A;  5KGX A;  3K5N A;  3QNO A;  3H08 A;  5D6X A;  4OLA A;  3DRS A;  2WAC A;  1ZBI A;  3AA2 A;  1TK5 A;  3OVN A;  4KFB A;  4ID5 A;  1LWC A;  3DM2 A;  2VG5 A;  1N6Q A;  4H8K A;  1RT3 A;  4OKE A;  1I3A A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3DKY A;  1ITG A;  3TOB A;  2FYK A;  1M2V A;  2DFF A;  4DIQ A;  5F27 A;  3JCM Q;  4HX4 A;  4JNE A;  4PWD A;  3I5U A;  4RTF D;  3URG A;  4A3J J;  2QLZ A;  3S1M J;  1N25 A;  4HG2 A;  2DVE A;  1KVA A;  5I2M A;  1IXD A;  3CF2 A;  1Y0M A;  4X62 K;  5BNG A;  4H0O A;  3OJU A;  4A3C J;  4EMK A;  3VRZ A;  1K9M U;  1YYV A;  4JKC A;  2V8J A;  4YFX F;  1JXM A;  1VQ9 Q;  1O7L A;  4HLY A;  5GAO q;  2H6C A;  2E2O A;  1SKU B;  4KO0 A;  3U1K A;  2KZG A;  2EWS A;  1SKS A;  1KG4 A;  3QPT A;  3LLR A;  3ATV A;  2WB1 A;  3VOE A;  1GV5 A;  2O4G A;  1M9S A;  3NH0 A;  2W1O A;  1EFN A;  4QCL A;  1Z77 A;  1VFC A;  5JVT A;  2CP0 A;  2YX4 A;  1WEF A;  1TU0 B;  3KLG A;  5D7U A;  2OTL Q;  1WSE A;  4FJL A;  1LJO A;  2QGG A;  4BG9 A;  3JS6 A;  2XV4 S;  1WJE A;  2FF3 B;  4FIS A;  2DT7 B;  1KD1 C;  4FO0 A;  5HVQ C;  4DHY A;  3FXQ A;  4IIM A;  3CCJ T;  2KDZ A;  1ARK A;  3CJC A;  1KYW A;  5A2Q K;  5HNF A;  2DL4 A;  2QQA A;  1W0T A;  1HSQ A;  3QYE A;  1ZGA A;  1I5Z A;  3H3N O;  4PFZ A;  3I0S A;  3G7Z A;  3E7L A;  4BRK A;  1MSE C; 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 3F72 A;  4Y7N J;  1L3L A;  3EZW A;  4W5R A;  2QA4 N;  2OJ2 A;  2O8B B;  1FZP B;  3K70 D;  4BRL A;  2Y69 H;  5I2S A;  3QFP A;  5A2Q E;  2K5C A;  2O4X B;  1MUY A;  4F9O A;  1RI7 A;  3M0U A;  3QYF A;  3ZRG A;  3UKU B;  1XSX A;  4XR6 A;  4LUD A;  2VB6 A;  2GIZ A;  3UF4 A;  5KQD A;  5LJV A;  1W7P A;  3KLN A;  3KP6 A;  3T8T A;  4OB2 B;  1WEI A;  2J06 A;  4OVL A;  3SUQ A;  4DFM A;  2K9S A;  3JCM g;  3IFR A;  1VQK I;  3GTG J;  1TH7 A;  1GFC A;  2OTJ N;  4I01 A;  3QYH B;  5KYY A;  2WUS A;  3MPU B;  2TDX A;  4ELZ C;  3ASM A;  3HGG A;  3R6O A;  3JCM e;  4M78 B;  2DM1 A;  1ASU A;  2UXX A;  1D9F A;  1Y07 A;  1KQ2 A;  2OTL A;  3BP8 A;  1K9M C;  2X4W A;  3D2E B;  1E0E A;  2XKP A;  4EVI A;  2A28 A;  3R8E A;  2XAF A;  1YVU A;  4AHC A;  2PI0 A;  1W9H A;  1K9M O;  2W10 A;  3CCQ N;  2Z0W A;  1C0T A;  1NOZ A;  3M9A A;  1EP4 A;  5KYW B;  3MWM A;  3QDR B;  1NE8 A;  5KN9 A;  1J7K A;  1YX5 A;  1S72 A;  4HQE A;  1LW0 A;  5F6F A;  1QPM A;  3TBI A;  4FL6 A;  3FRN A;  1O7F A;  4GYI A;  3BW1 A;  1GBQ A;  2KRH A;  4M7D F;  3OS2 A;  1HKC A;  2PFU A;  3THW B;  2E2P A;  3L09 A;  2DA5 A;  1U84 A;  3I3L A;  1IG8 A;  4ZN3 A;  1Q86 U;  2DD5 A;  2CWE A;  2EFQ A;  1WSU A;  1NGN A;  2P9I B;  3F8C A;  1I27 A;  5KAI C;  1BCM A;  3EDP A;  4CJE A;  2QWQ A;  3F0Z A;  3SWN A;  2E6M A;  3QDK A;  2PBI A;  3OYC A;  1W0H A;  2JJ9 A;  4R55 A;  2Q8K A;  4C92 A;  2NOI A;  4DUY K;  3PUB A;  1NOY A;  2I5W A;  4N4H A;  1U8R A;  4CED A;  4C3I J;  3CVS A;  1ZBS A;  3V81 A;  4ORZ A;  2A3L A;  2E6Z A;  1M3B A;  2VQF K;  4B3T K;  1YJN Q;  3VF2 A;  2KNB B;  1QLY A;  2HZY A;  3QEW A;  2BXZ A;  5CAI A;  4M73 A;  3KLI A;  5FFZ A;  2F4M B;  2EQR A;  4A3I J;  3C4S A;  3ENB A;  1B7T A;  1SRL A;  2DXB A;  5E26 A;  3TVT A;  3V7C A;  1AEY A;  2OPS A;  1N75 A;  1ZAR A;  1GVJ A;  4RDU A;  4EJV A;  4OFA A;  1JT0 A;  2XHK A;  4BB7 A;  5KRS A;  4L9T A;  4XM3 A;  4ESR A;  4DFK A;  4Z4I A;  3FXK A;  1PYV A;  4FJK A;  1FMK A;  2F5F A;  2RI5 A;  1WXB A;  3JCM h;  2VG7 A;  1NG9 A;  2R5A A;  3HPG A;  4BC5 A;  2Y2Z A;  4Z8A A;  1YI2 I;  2DYB A;  3B6A A;  2ITG A;  4HUG A;  4XBF A;  2ZWH A;  1J9I A;  3OV8 A;  2DE0 X;  1RDW X;  1V29 B;  4BAY A;  1F9N A;  2VE9 A;  4OGC A;  3PL8 A;  2R4G A;  1SEM A;  2XHC A;  3CCL N;  2E5L K;  4NC7 A;  5J8F A;  4C92 D;  1OIS A;  1QVU A;  4FWN A;  3DRS A;  3QAH A;  1G3W A;  2D6F A;  1YQM A;  3AA2 A;  1TK5 A;  1IJJ A;  1KQS S;  1KG6 A;  2O7O A;  2VG5 A;  1YFN A;  5FPD A;  4IPA A;  1RT3 A;  4ATO A;  2BE5 F;  3C0B A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4HNT A;  3TCJ A;  2ZZD A;  2CGH A;  2QK9 A;  1TKT A;  3OR2 C;  3KD5 E;  2R58 A;  1DTT A;  3JCM V;  1D0Y A;  5CZ2 A;  2P4T A;  5FU7 C;  4M7A C;  2R7S A;  1X9M A;  1QSS A;  4FM4 B;  4M3X A;  2KLO A;  4ZGE B;  3O4N A;  5GAN g;  3DOL A;  3AVF A;  4DS5 A;  4XK8 E;  4KHU A;  4XLE A;  1P9Q C;  4M3W A;  2ATQ A;  2OPR A;  2CZ7 B;  1QS4 A;  4M7A G;  2M4G A;  3QKJ A;  5KHD A;  3V7S A;  1K73 U;  4DQS A;  5KI6 A;  4BEH A;  3LZJ A;  4ZDL A;  3LZI A;  3DRP A;  4FM1 A;  1U1S A;  4LH4 A;  1JB0 E;  4PQU A;  3LPT A;  5FU6 C;  5GAN e;  3SV4 A;  4J2E A;  3HL2 A;  1IRX A;  2XC7 A;  1Q7Y C;  3ZT0 A;  1X1P A;  1V5F A;  3DKY A;  3BDP A;  1ITG A;  4YEJ A;  3THV A;  2FYK A;  2DFF A;  4DIQ A;  3Q1J A;  2QI2 A;  4J6Y A;  3JCM Q;  3BGR A;  2HVH A;  3NDK A;  3OL3 A;  4PWD A;  1I4K 1;  2NOJ B;  4W5Q A;  1J09 A;  4OKJ A;  3URG A;  2RNG A;  5GAN j;  2HNH A;  2DZC A;  4A4E A;  1N8R U;  3LAK A;  3QEV A;  4QVC A;  2X78 A;  4HG2 A;  1Y7X A;  2DVE A;  1KVA A;  1U0J A;  5I2M A;  3LWL A;  4M3Z A;  3CF2 A;  1S1T A;  1QVP A;  3I9V 2; 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