4BACA

Prototype foamy virus strand transfer complexes on product dna
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
LDAELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSGSKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSHQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Assembly of Prototype Foamy Virus Strand Transfer Complexes on Product DNA Bypassing Catalysis of Integration.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INTEGRASE
molecule tags Transferase/dna
source organism Human spumaretrovirus
total genus 82
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2012-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 4bacA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 4bacA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4bacA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4bacA03
3ZEHA 3MXIA 2YNFA 1JL2A 2LCCA 2P5OA 2QXFA 2GUIA 5HBMA 3NNQA 1IKWA 3CM5A 3MECA 3IAYA 2X78A 2P0KA 2HHVA 3SI6A 3OS0A 3BDLA 1GOCA 1VRUA 1CXQA 2IAJA 1T8EA 2RKIA 3FLGA 4A4HA 4CEQA 3AA3A 1KVCA 3FFIA 4BE1A 4B9LA 4OLAA 1TAQA 2JZ2A 3PFSA 4Z4CA 3H8ZA 4C5IA 2YV0X 3FEOA 4ICLA 4PQUA 1WSJA 4FJ8A 4OKJA 2IC3A 5CZ1A 3SD4A 3T3FA 3ME9A 1TKZA 3SYZA 1TKXA 4KB1A 4FXDA 4J2BA 4FK2A 2O4GA 1S1WA 2IGIA 2GF7A 1TAUA 3ZT0A 3CFOA 4ID5A 3V9ZA 4RG2A 3NH0A 4AHSA 3NH2A 4NYNA 2ATQA 3M8SA 1CXUA 3L3VA 3NTKA 3DRPA 3LYIA 3OYMA 3QEVA 5KCHA 4G1QA 3DLEA 3ULDA 4UC4A 2EQJA 1CZBA 3KD1E 4FCYA 3QO9A 4OGCA 3KK1A 4B9XA 1S1VA 1WLJA 3EAEA 3NFAA 2A1RA 5J26A 2HNYA 4DFPA 3PX4A 2HHXA 1RDCA 2DFFA 3ZT2A 3QIOA 4ELVA 3S9HA 3WNGA 3RTVA 2YHBA 2HQXA 4F2RA 1QSSA 2IG0A 4ELUA 1D5AA 4PY5A 3RRGA 3TAGA 2X4XA 1WSIA 4KTQA 4H4MA 4KI4A 5KE2A 1C1AA 3H6ZA 5KGXA 1UA1A 4FU6A 1LAWA 4C8OA 3K5MA 1EP4A 1ASUA 1Q9YA 1SSFA 4W5NA 1C0UA 2GBZA 4PA1A 3L42A 3V1QA 4CJLA 4JRPA 3AO3A 3OYBA 4M3UA 3PO4A 3D45A 3TAPA 4M3WA 2OYQA 1LAVA 3LAKA 4LY7A 4PLIA 3KK2A 3RMDA 4Z4FA 1G5VA 4O44A 1N27A 4OPJA 3AVFA 4M3YA 2M16A 4ELTA 3M9QA 1D9FA 4E1NA 4FLZA 4AHTA 2OZSA 3PV8A 4IUQA 4RW4A 1WSEA 3TAFA 1BI4A 4DTMA 1Z26A 2MWOA 1YTUA 4CERA 2OA8A 3DLBA 3OYNA 3ISNC 3NTHA 4DQIA 2VG6A 2B5JA 1BGXT 4CIFA 3V6DA 3MEGA 2NLUA 4Q0BA 3SJJA 3QESA 4EZ6A 4KB0A 1D8YA 1HNVA 1HYSA 1VSJA 2IOCA 3OYLA 3T19A 5DK5A 2LTOA 3NF8A 4I7FA 2XY6A 2OPQA 5C25A 4BDYA 2ETJA 4BDPA 2ITGA 3BGRA 1S5JA 2G8WA 3KKSA 1LWCA 2D0AA 3HXMA 3VQCA 3HPOA 3HPGA 4RW9A 3V9UA 3SV3A 3FC3A 4FZXC 3LGLA 1JLAA 3KLIA 4DWIA 1QTMA 3C94A 3DLRA 4KREA 4EZ9A 4CGHA 2RPIA 3SPZA 3AVLA 1W0HA 4UQGA 1RTDA 3QLHA 1JLQA 4C5EA 1S9GA 2VWKA 4DSEA 1TL3A 4IUVA 1HPZA 3F73A 1QSYA 1CZ9A 2LDMA 1N5YA 4FYDA 4N5SA 1NOZA 1S6QA 4CHYA 4CHPA 3U6FA 2PQWA 4CF1A 2F8SA 3L2WA 4DU4A 3VQ6A 1WSFA 3ZSOA 3P8DA 4A4GA 4E7LA 3QEWA 3MEVA 3OA6A 3QIIA 1X1PA 2JTFA 4IG3A 5KCOA 1BQNA 2Z1GA 5HP1A 3L8BA 3AA2A 3VQBA 2PY5A 3CFRA 4KAZA 1ZYQA 5FRNA 1C1CA 3QEPA 3S3NA 2RO0A 1TV6A 2WOMA 3DLMA 4E1MA 1VRTA 4HHTA 1WAJA 2HHQA 4FVMA 3OYFA 1OZ3A 1ITGA 3CM6A 1RT3A 3ZSVA 2RJCA 3AVCA 4CGJA 3OB9A 1VSIA 1SKRA 1IH7A 4PL6A 1REVA 3AVBA 4KI6A 3NBPA 1KLNA 1RDDA 2VYTA 3LP3A 1NJXA 1ASVA 3OMGA 4M42A 4CF8A 2RHIA 1OZ2A 1NK8A 3U3GA 4E7KA 1NKBA 3NGZA 3ZSWA 1BIZA 1BL3A 2RJFA 3META 3PMTA 3I0SA 4Q5WA 2QQRA 3LALA 2KZZA 4JLHA 2B6AA 4LSNA 3OYKA 2GFAA 4IURA 3E01A 2AJQA 3HPHA 1J9AA 4I2QA 3HVTA 3SPYA 4IUUA 3AO4A 2E6LA 1RTHA 5CYQA 5C24A 4IFVA 3C6UA 3RWUA 2BUDA 1BQMA 4B9MA 1RCHA 2F8TA 3F9KA 4KHWA 4DTOA 4DSLA 3LX7A 3VQ4A 3K59A 4HCBA 3KD5E 1NOYA 1RDBA 4LH4A 3MEUA 1F21A 1FKOA 3OMCA 2Z1HA 1NJZA 3MXMA 1MU2A 3ZCMA 5J1EA 1RT2A 2KTQA 1JLFA 2X6SA 1EKEA 4FM1A 1LWFA 1ZBHA 1BCOA 2FBXA 3LLRA 2RF2A 2BKDN 3NDKA 1L3VA 1LV5A 2W42A 1RT4A 4KHUA 3DOLA 4CJ4A 3OY9A 1NK4A 3DLHA 4CEDA 1EETA 2YNHA 2G8FA 4KFBA 2HHSA 4IKFA 4CFAA 3PX0A 2XHBA 5C6SA 4I9QA 2QKBA 2R5AA 4Y1CA 3SQ1A 4CF0A 3QJ6A 4GVMA 3TABA 1U48A 4QVZA 3CEYA 3AVKA 1RTJA 4QAGA 3QETA 4CFBA 4H8KA 4CGGA 3C6TA 3KKRA 2D5RA 3RMCA 3DYAA 1OYXA 5T7BA 1S1TA 4B9UA 4DTSA 2RHXA 4JRQA 3KIOA 1JLBA 4KHQA 4OVAA 3AV9A 3P83D 2HNZA 2E6NA 1HRHA 3HL8A 3LWMA 3K57A 3SUPA 4E3SA 1FK9A 4E19A 3NTIA 1TVRA 3PX6A 4W5OA 3MEWA 4DSIA 2GFUA 4FK4A 4IBNA 1GOAA 3H08A 3QIPA 4ZTFA 1HNIA 3Q1JA 2RHYA 1JLGA 4H4OA 2FBYA 1ASWA 4M45A 2R57A 4KPYA 1C6VA 1VSMA 3SQ0A 1NK5A 1T05A 1XHZA 3ZT1A 1NK6A 1RDAA 2XK0A 4WE1A 4FLWA 1JXEA 3P5JA 3AA5X 2FBTA 3LH0A 3ZSRA 4DFMA 2K3YA 3QEIA 2L8DA 4GW6A 2RI5A 2XY7A 4CESA 4NYFA 5D3GA 1XNIA 2KFNA 1KRPA 2HVHA 2M1HA 4NCAA 4B3OA 3JSMA 4CHNA 1HJRA 2PYJA 2O4IA 4M41A 1U49A 5J39A 2EHGA 3O3FA 1U04A 2DIGA 2RHZA 1S6PA 1ZBFA 3AO5A 1GOBA 3QEXA 2X74A 3SQ4A 3ZSZA 4GMJB 5KI6A 1L3SA 3TWHA 1NK7A 4N41A 3P1GA 4B9TA 4CEZA 4LSLA 1RBRA 4DS4A 4CF2A 1NK9A 1QE1A 5J2NA 3CG7A 3LANA 4FJGA 3OYIA 1BISA 1BHLA 4ID1A 2OPRA 4Q5VA 4CGDA 2M0OA 4AH9A 5JS2A 3LZIA 4FLUA 3BDPA 3OVNA 2X35A 3SV4A 2HQEA 3K58A 2G8HA 2X6NA 1X9MA 4QCLA 1VSKA 1MHNA 2G3RA 5CIUA 2WONA 1JLCA 1WGSA 4CJQA 5HRRA 4C8NA 4NS5A 2YNIA 1IKVA 4IDKA 3EY1A 2VG7A 4F3OA 3VQDA 1L3UA 3TAQA 4CHOA 4AHVA 3TAMA 3A2FA 1Q9XA 2P1JA 2KZMA 3LPTA 1XWLA 2KQ2A 1XC9A 4OKKA 3NE6A 2OPSA 4CFDA 1J5OA 3O3GA 3IRXA 1IO2A 1ZBIA 4O0IA 5FDLA 3L2UA 2QQSA 2EQMA 1WJRA 1WNSA 1EXQA 1HYVA 2X4WA 3O8VA 3OJUA 2RI2A 4CRIA 4E7IA 3GOXA 3E9GA 1I3AA 3VN5A 4W5QA 4DQSA 2HMIA 4QQ6A 3VQEA 3LP0A 2O4XB 3UIQA 4Z4HA 3CQ8A 1QS4A 3OYJA 4FM0A 1SUQA 3SUOA 3THVA 2HHUA 1EX4A 2OZMA 4E7JA 3DB4A 2L89A 3LPUA 3LZJA 4FLYA 2YKMA 5HROA 3HP6A 4DFJA 5E41A 3RRHA 4IG0A 4FJMA 1SKSA 4DF4A 4FK0A 1HQUA 4I9LA 3CYMA 4L59A 2YRVA 1RILA 4BDZA 2HB5A 3DRSA 1SKWA 3RMAA 2E5QA 2Z1IA 3U3YA 4DF8A 3SUQA 2FC0A 4O55A 3VQAA 4IUTA 4EP4A 3O3HA 2XY5A 4LD0A 3B6PA 3D0PA 4TSXA 1X9WA 4DSJA 5EU7A 3DMJA 3LP1A 4CJ5A 5KE3A 4E89A 4MQ3A 2FBVA 1OI1A 2BIVA 2XDPA 4FJLA 3KTQA 3V81A 3MEAA 3AVIA 1B9FA 1LW0A 5I42A 3MXJA 1TK0A 3DOKA 3NF9A 1RBUA 3HYFA 4L8RB 4HUFA 3NF6A 5KTQA 3WNEA 3K5OA 3V4IA 1RBSA 4FW2A 2EQUA 3NH1A 3VQ7A 4AHCA 4M3XA 1U4BA 4PUOA 2G8KA 1SL0A 1TK5A 4Z02A 3M8RA 4DSFA 4FJJA 4DQPA 5CY4A 4A4EA 3HP9A 3QERA 4CIEA 2KW4A 5JS1A 1DTQA 3AVHA 1T03A 1TKTA 2RJEA 3E9FA 4FL6A 3C4SA 3PNWC 1VK0A 1ZBLA 3LGFA 1NKEA 1RI0A 1KLMA 2YKNA 3RMBA 1TL1A 4CJPA 4DU3A 4QOZB 3ASKA 3OYGA 3WNFA 3V9XA 2L3RA 3PUFA 3VQPA 5SZTA 4B9NA 1DTTA 1G15A 1JL1A 1Z25A 1WSHA 4LD6A 3S6WA 2B4JA 2DTUA 4DTNA 1DLOA 1CLQA 4HCCA 2HNDA 4DG1A 1WJQA 3JYTA 3HVRA 3NGIA 4CJVA 1BI4B 4J2DA 3ZT3A 4FJ5A 2DAQA 5M9OA 1C1BA 3HK2A 4BWMA 2EKOA 4IUPA 2BE2A 4II1A 3VA3A 4MFBA 4KO0A 2NUBA 3VQ8A 3MP6A 4CEAA 4CEFA 2LSNA 4BE0A 3KLHA 1NJYA 2VWJA 3QNOA 4RG8A 4B9VA 2BDPA 2GV9A 4CEOA 4GY5A 3ZSQA 4FJ9A 3OYDA 1BIUA 1Q8IA 2FHDA 4FJKA 4CGIA 5J2PA 1J54A 3ALYA 4HUEA 4CGFA 4FLTA 2JGUA 4NCBA 4B8CA 3IG1A 3K5LA 1K6YA 3MAQA 1KVAA 4A4FA 4BE2A 1LWEA 4DQRA 3NHGA 2G8UA 3IS9A 4EDUA 2F96A 1X9SA 5C0MA 4C8LA 4KHYA 4F2SA 1KVBA 4CJEA 4C8MA 1SL1A 4F4KA 4QQDA 3EYZA 4O5BA 2HW3A 4CK3A 4CJWA 4OLBA 4FLVA 5SWMA 1QQCA 1YVUA 4Y1DA 4IFYA 4AHRA 4I2PA 1A5WA 3KJVA 4B8AB 2RN2A 1H3ZA 4J2EA 1RBTA 4C8KA 3OS1A 3MP1A 3QINA 4CEBA 3AA4A 3F70A 5HRNA 4QW2A 3AVGA 4OPKA 4CHQA 2R7YA 2D0CA 4DLEA 4AHUA 2RJDA 3NAEA 2I5JA 2P5GA 1C0TA 2OPPA 3DLGA 4YNQA 5HRSA 1TK8A 4W5RA 1UOCA 3MEDA 1YTAA 4M3ZA 3OYCA 3FDRA 1KFSA 2F5KA 3LAMA 1JLEA 1IG9A 5IAYA 3NCIA 2DIQA 4RW8A 4CE9A 4W5TA 3CFPA 5KRSA 4KHSA 4FZYA 3TR8A 1S1XA 3K5NA 3HO1A 1J53A 1VSHA 3C95A 3OYEA 2DFHA 5KRTA 4CK1A 4BACA 2X4YA 3DB3A 1A5VA 4KTWA 2CKKA 3V9WA 4FJ7A 2BGGA 3S3OA 3O4NA 2Q3SA 3G10A 4HUGA 4CCHA 4KV8A 3SNNA 1KCFA 4FJIA 2LRQA 5KH6A 4Z4IA 2XRIA 5HLFA 3S3MA 4F8RA 1U47A 4Z4GA 2P51A 4O4GA 2IDOA 3M8QA 3V9SA 1XI1A 4DTUA 3QBYA 4B9SA 3V1OA 5C42A 4CIGA 3L2VA 3NF7A 2ZE2A 1VSDA 4CJRA 2QK9A 1HMVA 4HCZA 4OJRA 4DTPA 2ZD1A 2IS3A 3SQ2A 1WAFA 2D9TA 3AO2A 3AVAA 3SCXA 4E0DA 2EX3A 3I0RA 4C5GA 1T7PA 2QKKA 1NJWA 2R5MA 3KLFA 4K8XA 2G8VA 1FKPA 1L3TA 3T1AA 2WACA 3QKJA 1RTIA 3RR7A 3UT1A 3PY8A 1HYZA 1WSGA 1YT3A 4E7HA 2R58A 4Z4EA 4YFUA 4C5HA 2VG5A 1IKYA 4N76A 4N56A 4DTRA 1FXXA 4DSKA 3LWLA 1HQEA 4FJNA 3V1RA 1W9HA 1KTQA 2BANA 4AILC 3TARA 4CEEA 2ZQBA 4M3RA 1VSLA 4ZHRA 2PYLA 1L5UA 4CJ3A 2EQKA 4FW1A 4O0JA 3OJSA 3HM9A 5FRMA 3AO1A 4XIUA 5D6XA 1U45A 4BWJA 4K8ZA 3NGYA 4M3TA 2A1SA 1A5XA 3EZ5A 3SZ2A 2Y1IA 2D0BA 4BD3A 2G8IA 3AVMA 4JS5A 3ZSYA 3TANA 4F3TA 4LH5A 2YNGA 3QNNA 3AVJA 3DRRA 2XY8A 4B9WA 1RBVA 3TI0A 2RHUA 1I39A 4PWDA 4JS4A 1NKCA 4N4GA 1RNHA 3AVNA 4OKEA 3VQ9A 3OS2A 1Y97A 4ZTJA 1TKDA 4FLXA 2YHAA 3UWNA 3K2PA 3VQ5A 4NCGA 4CECA 2B8AA 1C0MA 4DFKA 3KLGA 1JKHA 4NZGA 3MEEA 4CJTA 1KFDA 4CHZA 4HVJA 3ASMA 5FROA 1N6QA 5D6YA 4DMNA 2HVIA 1S1UA 5CZ2A 4DLGA 1S9EA 2K3XA 2RI3A 3OYAA 1VSFA 1B92A 3HJFA 4R5PA 4N4HA 2XO7A 4N47A 3KUFA 2DY4A 1IKXA 4DTJA 4CFCA 1ZBUA 4KKOA 3VA0A 2PZSA 1RT5A 4N4IA 2EFIA 1KSPA 1WN7A 3DI6A 4Z0UA 4KRFA 1SV5A 3MP8A 5DMRA 3P8HA 1QHTA 4DQQA 4OVLA 5CYMA 3PMIA 2Y1JA 5HRPA 2E6MA 5J2MA 1RT7A 2Z1JA 4CJSA 1JXBA 3WNHA 2KFZA 2LVMA 3OQ5A 1SL2A 3L2RA 4KHNA 3LP2A 4DTXA 1UA0A 3MO8A 5KGWA 4CJUA 3HSTB 1B9DA 1O1WA 3L3UA 3I8DA 4RW6A 3L2QA 4FM2A 5I3UA 4DS5A 4RW7A 3KLEA 4HTUA 3DM2A 4CJKA 2E4LA 1RT6A 3M8PA 4CF9A 1VSEA 3RR8A 3ZT4A 1LW2A 4CK2A 1WJSA 4QQGA 1KHCA 3KK3A 1UAXA 4OGEA 5K14A 4FJHA 4FJXA 4KTZA 3G0ZA 4X34A 3PO5A 1TGOA 2HHTA 3VQQA 3ITHA 5D6WA 2HHWA 1QSLA 1D9DA 4EP5A 2MWPA 4DU1A 3DLKA 3SUNA 4J2AA 3HT3A 4FZZA 1XHXA 3OYHA 2JLEA 5IN1A 4B08A 3B6OA 5J2QA 1NK0A 3ZSXA 1R0AA 3TAEA 1RT1A 3O4QA 4CJFA 2DFEA 1BCMA 1UWBA 4PLLA 3LDSA 2O4XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YNFA 3J80E 2L3PA 2LCCA 2QXFA 1LEBA 5IP9J 3NNQA 3AARA 3P39A 2DO7A 1YITT 3G6EA 3OS0A 4PSWA 1K0SA 5D5VB 1ULYA 2GA2A 3A03A 1VRUA 2EYYA 4G7ZF 1N5ZA 4RB2C 1T8EA 3FLGA 1T08B 1YI2I 4A4HA 3FXUA 1N33K 4M7DF 1BA0A 3EGDB 2FYKA 4J5YA 5E79C 3T8TA 3CTAA 2EA4A 4NHJA 1LE8B 1KVCA 3J81Z 1ZRCA 2HKXA 4C3HJ 2KSSA 2YJFA 3G1JA 1KYZA 3CBMA 1HLUA 1LOTB 1P8ZA 1TAQA 1NJIR 1Z7LA 1BOTO 3E7LA 1MJ9A 3CCQT 4PK4A 2YV0X 2LDUA 3VEZA 1K9MO 3MZYA 4Z89A 4RTFD 4XK8E 4A5BA 3EGXA 4FJ8A 4EW0A 3CCLA 5CZ1A 3GTMJ 3SYZA 4CCOA 2R7QA 4M78E 4FXDA 3TKYA 2PUOB 4FK2A 1KU9A 4HOBA 2W40A 1B72A 1S1WA 4BUGA 4YPHA 2ZSHB 3H0FA 3TMOA 1ABQA 3I5UA 1R22A 5TKWA 4E47A 2P9NB 3D5LA 1GHCA 1GUUA 3WGGA 1FYKA 4RG2A 2UU9K 4F14A 1K8AO 4M7DG 2DYRH 2AS5F 4NYNA 2WC9A 2ATQA 1MD0A 2COWA 3QJYA 1O7FA 3LYIA 3QEVA 2OTLT 3J8AA 4PJOD 4DEYA 5F08A 2EQJA 2DA5A 3CCSN 5E8IA 3KK1A 2DJQA 3T8RA 1S1VA 4OB0B 2LQNA 1WLJA 4UNOA 1WXTA 3ZQQA 4PNOA 2HNYA 4IO9L 3DLLA 2P81A 1XQOA 1Y64A 2DFFA 5HNHA 4IHWA 4ELVA 2RNAA 3R2XC 2YHBA 2E65A 2IIMA 4EJWA 1D5AA 4BBRJ 2C06A 4ZH4F 3U9GA 3E9LA 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 5D6X A;  1U45 A;  4BWJ A;  4K8Z A;  3NGY A;  4M3T A;  2A1S A;  1A5X A;  3EZ5 A;  3SZ2 A;  2Y1I A;  2D0B A;  4BD3 A;  2G8I A;  3AVM A;  4JS5 A;  3ZSY A;  3TAN A;  4F3T A;  4LH5 A;  2YNG A;  3QNN A;  3AVJ A;  3DRR A;  2XY8 A;  4B9W A;  1RBV A;  3TI0 A;  2RHU A;  1I39 A;  4PWD A;  4JS4 A;  1NKC A;  4N4G A;  1RNH A;  3AVN A;  4OKE A;  3VQ9 A;  3OS2 A;  1Y97 A;  4ZTJ A;  1TKD A;  4FLX A;  2YHA A;  3UWN A;  3K2P A;  3VQ5 A;  4NCG A;  4CEC A;  2B8A A;  1C0M A;  4DFK A;  3KLG A;  1JKH A;  4NZG A;  3MEE A;  4CJT A;  1KFD A;  4CHZ A;  4HVJ A;  3ASM A;  5FRO A;  1N6Q A;  5D6Y A;  4DMN A;  2HVI A;  1S1U A;  5CZ2 A;  4DLG A;  1S9E A;  2K3X A;  2RI3 A;  3OYA A;  1VSF A;  1B92 A;  3HJF A;  4R5P A;  4N4H A;  2XO7 A;  4N47 A;  3KUF A;  2DY4 A;  1IKX A;  4DTJ A;  4CFC A;  1ZBU A;  4KKO A;  3VA0 A;  2PZS A;  1RT5 A;  4N4I A;  2EFI A;  1KSP A;  1WN7 A;  3DI6 A;  4Z0U A;  4KRF A;  1SV5 A;  3MP8 A;  5DMR A;  3P8H A;  1QHT A;  4DQQ A;  4OVL A;  5CYM A;  3PMI A;  2Y1J A;  5HRP A;  2E6M A;  5J2M A;  1RT7 A;  2Z1J A;  4CJS A;  1JXB A;  3WNH A;  2KFZ A;  2LVM A;  3OQ5 A;  1SL2 A;  3L2R A;  4KHN A;  3LP2 A;  4DTX A;  1UA0 A;  3MO8 A;  5KGW A;  4CJU A;  3HST B;  1B9D A;  1O1W A;  3L3U A;  3I8D A;  4RW6 A;  3L2Q A;  4FM2 A;  5I3U A;  4DS5 A;  4RW7 A;  3KLE A;  4HTU A;  3DM2 A;  4CJK A;  2E4L A;  1RT6 A;  3M8P A;  4CF9 A;  1VSE A;  3RR8 A;  3ZT4 A;  1LW2 A;  4CK2 A;  1WJS A;  4QQG A;  1KHC A;  3KK3 A;  1UAX A;  4OGE A;  5K14 A;  4FJH A;  4FJX A;  4KTZ A;  3G0Z A;  4X34 A;  3PO5 A;  1TGO A;  2HHT A;  3VQQ A;  3ITH A;  5D6W A;  2HHW A;  1QSL A;  1D9D A;  4EP5 A;  2MWP A;  4DU1 A;  3DLK A;  3SUN A;  4J2A A;  3HT3 A;  4FZZ A;  1XHX A;  3OYH A;  2JLE A;  5IN1 A;  4B08 A;  3B6O A;  5J2Q A;  1NK0 A;  3ZSX A;  1R0A A;  3TAE A;  1RT1 A;  3O4Q A;  4CJF A;  2DFE A;  1BCM A;  1UWB A;  4PLL A;  3LDS A;  2O4X A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4M7D G;  2DYR H;  2AS5 F;  4NYN A;  2WC9 A;  2ATQ A;  1MD0 A;  2COW A;  3QJY A;  1O7F A;  3LYI A;  3QEV A;  2OTL T;  3J8A A;  4PJO D;  4DEY A;  5F08 A;  2EQJ A;  2DA5 A;  3CCS N;  5E8I A;  3KK1 A;  2DJQ A;  3T8R A;  1S1V A;  4OB0 B;  2LQN A;  1WLJ A;  4UNO A;  1WXT A;  3ZQQ A;  4PNO A;  2HNY A;  4IO9 L;  3DLL A;  2P81 A;  1XQO A;  1Y64 A;  2DFF A;  5HNH A;  4IHW A;  4ELV A;  2RNA A;  3R2X C;  2YHB A;  2E65 A;  2IIM A;  4EJW A;  1D5A A;  4BBR J;  2C06 A;  4ZH4 F;  3U9G A;  3E9L A;  3CC4 I;  2ESN A;  1WSI A;  3QPS A;  4F92 B;  1HCR A;  5GAM e;  4KI4 A;  1IZ1 A;  1C1A A;  2ZXJ A;  2MGQ A;  5FLX K;  1UG1 A;  3H6Z A;  5KGX A;  1UA1 A;  1TQI A;  2NS0 A;  1LAW A;  1AKH B;  4LB6 B;  3K5M A;  1EP4 A;  3GFL A;  2LX7 A;  5J40 A;  5J47 A;  4XKV A;  1W5C C;  1Q9Y A;  1VIE A;  1C0U A;  3ZRG A;  3L42 A;  1V1C A;  2UXB K;  3CCE N;  5IYD J;  2P9I A;  3PO4 A;  3CP2 A;  3TAP A;  1QCN A;  3G71 Q;  1NYF A;  2E2J J;  3CCS A;  1M1K O;  2XHK A;  2D1K A;  2V1R A;  3BG6 A;  4PJO C;  3LM9 A;  4Z4F A;  1YIJ Q;  2H56 A; 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 3WHC A;  3IH3 A;  4BL0 B;  3TTF A;  5L3G A;  2L02 A;  1GFC A;  4BRA A;  1VZ0 A;  3F3X A;  1DKG D;  4AI5 A;  2K57 A;  3NGZ A;  2WSE E;  1BI0 A;  1IC8 A;  4NO7 A;  1BIZ A;  1Q82 C;  4FX4 A;  2L3D A;  2E7W A;  3MET A;  3QG1 A;  4B1Z A;  3PMT A;  3W0L A;  4U88 A;  3I0S A;  2F4V K;  2QQR A;  3ABL H;  2KIU A;  5EEH A;  4J83 A;  2DTH A;  3C7N B;  1U3O A;  2GAU A;  2B6A A;  4YOW A;  3OYK A;  3EUK L;  5AJ3 K;  4IUR A;  3U9D A;  1VQL Q;  3HPH A;  4YFN F;  3CCU I;  1J9A A;  2MH2 A;  3NMU A;  1T0F A;  4JI0 K;  2E1Y A;  4XQF A;  2JSP A;  3CC7 I;  2E6L A;  1N9S A;  1WXB A;  4IFV A;  3RWU A;  3CDI A;  3CC4 A;  1WLP B;  2JW4 A;  2FJ1 A;  1KON A;  4M6V A;  2STT A;  3BCA A;  1CKA A;  4M78 B;  4Y13 A;  4JRI A;  3DWL A;  4DSL A;  2CZ7 B;  3M7G A;  3K9J A;  4JRK A;  2XB5 A;  3E0J B;  4B8X A;  3K59 A;  5L3D A;  4HCB A;  2QWQ A;  3KD5 E;  2OTJ T;  2F48 A;  3MEU A;  3G6E Q;  1FKO A;  4XLA A;  1SMT A;  3ML6 A;  3K4J A;  4OF1 A;  1UJY A;  5F0F A;  1KD1 R;  3CJA A;  3RR6 A;  1HNX K;  3D2E B;  4L6V 5;  4QPQ A;  2MSY A; 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 2IGO A;  4BAC A;  1S7A A;  3K1N A;  2A68 F;  1G3W A;  2XU8 A;  3HEF A;  4ZN3 A;  2CSI A;  3CUQ B;  2VAS A;  2Q3S A;  4HKE A;  2LR8 A;  1B1B A;  1PU8 A;  4CCH A;  1ZSZ C;  2LY2 A;  2KRS A;  3W3C A;  3CC2 T;  3L7W A;  2JS2 A;  5H20 A;  4FJI A;  1NGE A;  1W2B A;  4RMO A;  4JNE A;  4HEA 2;  2BXY A;  2LRQ A;  2CH6 A;  2VCP A;  1XSD A;  1KQS S;  2XRI A;  3KP2 A;  1VQ5 Q;  1VQ6 Q;  2NOF A;  4PFP A;  2L9S A;  3CC2 I;  2XPU A;  2YJE A;  1GLJ O;  1U47 A;  4Z4G A;  2LQK A;  2V79 A;  1K78 B;  3V9S A;  2YUO A;  1XI1 A;  5AQZ A;  4DTU A;  2CUD A;  3B02 A;  3INZ A;  3NF7 A;  4GO1 A;  1OUL A;  4C92 B;  3VES A;  2LLK A;  4HCZ A;  4DTP A;  1YJ9 A;  4BHC A;  3EG1 A;  2IS3 A;  4HX4 A;  3AO2 A;  4IFE A;  3ROU A;  3AVA A;  2AP1 A;  3SCX A;  1T7P A;  4B21 A;  2PTK A;  4K8X A;  1MDM B;  1WZO A;  2DDB A;  1RFQ A;  1NU0 A;  2X6Y A;  5LD2 C;  2HQN A;  5IXF A;  3LSI A;  3ZXS A;  1J9I A;  4OX9 K;  1HYZ A;  1YT3 A;  1S72 N;  3HIF A;  2QXL A;  4Z4E A;  2NOG A;  5FLX O;  2FLO A;  4KA4 A;  4C5H A;  1QVF A;  1TUY A;  3KWI A;  4N56 A;  1JXM A;  2HHH K;  2EBI A;  2LCL A;  1JJ2 S;  2Y0M A;  3LWL A;  1KQ0 A;  1PKS A;  2MFZ A;  2W24 A;  2KDS A;  3I55 Q;  4FJN A;  1UMQ A;  3CWU A;  1W9H A;  1JXS A;  4B1V A;  1XQS C;  4BRF A;  3KEO A;  3TAR A;  4OB2 B;  1I6X A;  1VSL A;  2FOW A;  3M0U A;  2UUB K;  2HGC A;  4AG2 C;  4EPC A;  5TGT A;  2Y30 A;  2D8H A;  3WQU A;  4NQW B;  2QM1 A;  1XG7 A;  4ELY C;  3HUG B;  1JKP C;  4LDY A;  3AO1 A;  3O3K A;  5D6X A;  1JCG A;  2A1S A;  2DPP B;  3HRU A;  2VT3 A;  3FXJ A;  3PO2 J;  3EQL F;  4JS5 A;  2KXD A;  4LH5 A;  1M27 C;  1S72 A;  3AVJ A;  3RUX A;  1YE9 A;  1XMO K;  4B9W A;  3TI0 A;  3CD6 Q;  1I39 A;  4JS4 A;  1NKC A;  1MH3 A;  1UG0 A;  4N4G A;  4A3F J;  3VQ9 A;  1PC0 A;  3OS2 A;  2IVP A;  1ZGW A;  1Y97 A;  2YUQ A;  1IN7 A;  2CT4 A;  2YHA A;  3EN9 A;  3UWN A;  3K2P A;  5AR0 A;  2VQC A;  1YW8 A;  1YJW Q;  2XB0 X;  2BY3 A;  1RRS A;  1JKH A;  4EMG A;  2R7X A;  1N8R R;  3THW B;  5IHI A;  5C12 A;  3NRV A;  2DMN A;  3GUD A;  4KN7 X;  1S1U A;  5CZ2 A;  5CVV A;  2QQ9 A;  3SWN C;  2RI3 A;  1EBM A;  2DFI A;  3LQQ A;  2WV0 A;  4BRM A;  1EIF A;  4N47 A;  1V5F A;  4H0V B;  3P7N A;  1ZUY A;  4WCE L;  1VQO I;  4KKO A;  2V26 A;  2L01 A;  1GRI A;  4N4I A;  1WN7 A;  1S3J A;  2GIV A;  1SV5 A;  1TWF J;  2VJI A;  3ZR8 X;  1J2X A;  2GQI A;  5LJ3 h;  1T0H A;  4JOM A;  5DMR A;  1SC7 A;  1QHT A;  1Z77 A;  4WQ5 C;  2OCC H;  4BVO A;  2ACJ A;  2Y1J A;  5EEG A;  1DPU A;  1KC8 U;  5AQO A;  4EM0 B;  2E6M A;  5J2M A;  1VQL N;  4FOI A;  4U0W A;  4FOE A;  3GTL J;  2YHT A;  2CZ6 B;  1JJ8 C;  3JCM V;  3HHG A;  2FD5 A;  3OQ5 A;  1FYN A;  3D1N I;  5GAN 3;  4DTX A;  3FK6 A;  2DTO A;  2EYZ A;  5EXW A;  1B9D A;  2HL5 C;  2BUP A;  4RW6 A;  3BWG A;  1Q86 O;  3FK7 A;  4DS5 A;  2G0E A;  1R5G A;  4KGX B;  4XAX B;  3T69 A;  4PJL A;  5J3L A;  1RT6 A;  4CF9 A;  3KX2 A;  3RR8 A;  4P9F A;  4CK2 A;  1ZC6 A;  3HRS A;  1WJS A;  3G6E N;  4QQG A;  2Y4X A;  3KK3 A;  3RKX A;  4XTU A;  2R5Z B;  1FMW A;  2ZPB B;  3ULR B;  3G0Z A;  4X65 K;  2DYB A;  4DW6 A;  4X34 A;  4FWP A;  2HPM A;  3VUB A;  1ZG1 A;  2KT1 A;  4OWR B;  3W6V A;  1W1W E;  1D9D A;  5A2Q Z;  1ITY A;  5CQX A;  3MMY B;  4OMF B;  4EP5 A;  2DMQ A;  1VQL A;  5AQP A;  3O8G A;  1XMX A;  2EZL A;  4J2A A;  1UST A;  4PUS A;  4LDV A;  1NHA A;  2JLE A;  5IN1 A;  2FZC B;  1K8K A;  4Q4Z F;  4E7S A;  5J2Q A;  2QYO A;  3CCL N;  3ZOB A;  3EEQ A;  4IPA A;  1NK0 A;  3QOD A;  2K3P A;  5FU7 C;  3O4Q A;  3TU5 A;  1BCM A;  1PSF A;  1UWB A;  4OMQ A;  4PLL A;  3VPZ A;  2LQ8 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4FK2 A;  3VYR B;  2CMP A;  2O4G A;  3AL0 C;  3TBI A;  1S1W A;  2IGI A;  4BUG A;  3OSV A;  2ZSH B;  1HA8 A;  2D0Q B;  2GF7 A;  3BFM A;  3TMO A;  1TAU A;  2FL7 A;  3ZT0 A;  3CFO A;  4E47 A;  3M56 A;  3JB9 H;  3D5L A;  2E10 A;  4ID5 A;  3V9Z A;  1QP3 A;  1D3B B;  3HL2 A;  4RG2 A;  3NH0 A;  4AHS A;  2RM4 A;  3NH2 A;  4M7D G;  4NYN A;  3A1Y A;  2ATQ A;  3M8S A;  1LNX A;  5GAN g;  1CXU A;  3L3V A;  4MML A;  4L5G A;  3NTK A;  3QJY A;  3DRP A;  3LYI A;  3OYM A;  4LIT A;  1MMD A;  2EWN A;  4CZC A;  3QEV A;  2OTL T;  3VYH B;  5KCH A;  2XAU A;  5CQY A;  3CCV T;  4G1Q A;  3DLE A;  4PJO D;  1T95 A;  3IAS 2;  3ULD A;  4KBM B;  3HFN A;  4UC4 A;  2EQJ A;  5HLT A;  4II2 A;  1CZB A;  3KD1 E;  4FCY A;  3QO9 A;  4OGC A;  3KK1 A;  4B9X A;  3EUH C;  1S1V A;  1KQ1 A;  4OB0 B;  2A1R A;  1WLJ A;  2VIX A;  3EAE A;  3NFA A;  2BVM A;  3A8H B;  3ZQQ A;  4PNO A;  5J26 A;  2HNY A;  1Y56 A;  3QZ9 B;  3DLL A;  5GMK j;  4DFP A;  3PX4 A;  1QHH D;  2HHX A;  2KL4 A;  1JI8 A;  1RDC A;  2DFF A;  1WJB A;  5HNH A;  3H5A A;  3QIO A; 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