4E7JA

Pfv integrase target capture complex, apo form (tcc-apo), at 3.15 a resolution
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 3'-Processing and strand transfer catalysed by retroviral integrase in crystallo.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Pro-Pol polyprotein
molecule tags Recombination/dna
source organism Human spumaretrovirus
total genus 98
structure length 365
sequence length 365
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2012-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 4e7jA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 4e7jA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4e7jA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4e7jA03
4N5SA 5FROA 2KFZA 5KRSA 3ZEHA 4DQIA 4LY7A 3KTQA 4KFBA 3H8ZA 3CEYA 4RW7A 2RHIA 2L89A 3QETA 4IUPA 1UA0A 4DSFA 1UWBA 3AA5X 2LRQA 4CHQA 1JLFA 3VQBA 3RWUA 4C5HA 4FVMA 3K5NA 1A5WA 3HPGA 5HRNA 4OPKA 1BI4A 1NK4A 4FLXA 4DTRA 4NCBA 4E7LA 4FZXC 4DWIA 2HHQA 4CK3A 3ZSQA 3KLIA 3NTKA 3TI0A 2QQSA 4DSKA 1RBRA 1JL2A 3EY1A 1NKBA 3OYLA 4FJGA 3AVGA 4JLHA 3SUQA 2O4IA 1BCOA 2WOMA 1HPZA 4CFDA 1OZ2A 3A2FA 4ELVA 1BQNA 4E7IA 4BACA 2LTOA 4QQ6A 2P1JA 4FM0A 1XWLA 2IAJA 3HM9A 1BL3A 3E9FA 2X4XA 3VQ4A 4M3YA 3LX7A 4CJKA 1LW2A 3WNFA 5J2NA 4DSIA 4OLAA 4FK4A 1T8EA 2A1RA 3MEWA 3DLHA 4KHNA 4HCBA 1JL1A 3OYDA 4OKKA 2IG0A 2JTFA 2EQKA 3O4QA 1NK6A 4IDKA 3V6DA 2HHXA 3ZT4A 3NBPA 2YNGA 3HYFA 3L3UA 3OVNA 3JSMA 5I3UA 3L2RA 3MP1A 3TANA 1VSIA 3SZ2A 2QKKA 2GBZA 3OQ5A 3VQDA 1IKWA 2KW4A 2B5JA 2HHUA 2FBYA 3P8DA 4DTPA 1U47A 4WE1A 2P0KA 4F2SA 3WNGA 4FZZA 3AA2A 1CXUA 5CYQA 5KTQA 3NTIA 2XY5A 3KUFA 3RMAA 1ZBFA 3MXIA 3VN5A 3QIOA 1RT7A 1ASUA 3OYNA 4J2BA 4Q5WA 4DFJA 1NK0A 4KHUA 3ZSXA 4B9NA 4KI4A 3MEUA 3M8RA 2NUBA 2G8HA 3DLEA 1JLCA 4PL6A 2RN2A 4HCZA 4B9TA 4FYDA 3ZSZA 3LPUA 4KHWA 2E6LA 3OB9A 3LP0A 4X34A 3MEGA 4NZGA 3PX6A 4A4HA 4LH4A 2FBVA 4FXDA 1KVBA 3V1OA 1WSFA 2JLEA 4XIUA 1DTTA 1B9DA 3LP3A 1WJSA 2Y1JA 4HHTA 4E7KA 4C8LA 3SUPA 3KJVA 3DOLA 4IG3A 2YNFA 4Z4EA 3QLHA 2YKMA 4OGEA 4RW6A 3JYTA 1L3UA 4DLGA 4RW8A 4FJLA 3D45A 3KKSA 3QBYA 1Y97A 3Q1JA 4Q5VA 5KE2A 4CEOA 3C95A 1S9EA 4PA1A 2R7YA 3ZT3A 3S3MA 3IG1A 3QIIA 3HSTB 2LCCA 4AILC 1X9MA 2O4GA 3P5JA 2XHBA 3CFOA 3QNNA 3OA6A 2F8TA 1XNIA 5D6YA 3U3GA 1WAJA 1RTJA 4Z4CA 3THVA 1N6QA 2M1HA 1ASWA 4FJ9A 2E5QA 3NHGA 1G15A 4KV8A 4FJHA 4NS5A 1RDAA 3CG7A 4B9MA 4Z4HA 3L2QA 4FJXA 4FU6A 4CJ4A 4C8OA 3AVCA 5JS2A 4CK2A 1NKEA 4C8KA 4FLWA 4KAZA 2PY5A 4CIFA 4E1MA 3DLGA 1YT3A 2X6SA 3RMCA 4AHVA 1Q9XA 4I9QA 2HW3A 3SQ0A 1KSPA 3QESA 3OYKA 1IKYA 1WSJA 5K14A 2HQEA 4DQPA 4CGJA 4Z4IA 1YTAA 3KIOA 3MEDA 4AHSA 3OS1A 4YFUA 2Q3SA 4PQUA 1L3TA 4KTZA 2YNIA 1KFSA 4CIGA 2PYLA 4IURA 1NJZA 3PX4A 2DAQA 4IKFA 2B6AA 2Z1JA 1X1PA 5HRRA 1RT6A 1UAXA 1TK8A 1ZBIA 1OYXA 3L2WA 3LP2A 3OYMA 4QOZB 5HLFA 3TWHA 3KLGA 1NK7A 1VSHA 1NK9A 3O3FA 2BDPA 3VQ5A 5T7BA 4KI6A 2R57A 4F3OA 3V4IA 4Y1CA 1C1AA 4DS5A 3O8VA 1KVCA 3DRPA 3M8SA 4FLUA 3DI6A 4E0DA 4FJ5A 4PWDA 2HVIA 4DS4A 4EDUA 4ELUA 5FDLA 4E19A 4DSEA 1J5OA 2LSNA 4KB0A 3DLMA 1VSMA 1N5YA 1TAQA 4FM2A 3OS0A 4FZYA 4OGCA 4E89A 4Z4GA 2F96A 4CJTA 1SKRA 5D3GA 5KE3A 2XK0A 5EU7A 1C1BA 4N56A 1ZBHA 2RJFA 3EYZA 3NGIA 3H6ZA 1ASVA 1XHXA 2L3RA 3CQ8A 4OLBA 3I0SA 3E9GA 2M0OA 3TARA 3PV8A 1LV5A 3TR8A 5KGWA 1VSJA 3PMIA 1J54A 3SD4A 3NGZA 3LWLA 2E6MA 2ZQBA 4E7HA 3F73A 2EHGA 2XO7A 4CJ5A 4LSNA 2Z1GA 2D0CA 4ICLA 2DY4A 2K3XA 2AJQA 3QJ6A 4CRIA 1EKEA 2YHBA 4HCCA 3V9XA 4I9LA 3NFAA 1RTHA 4FLZA 3ZSWA 3KK1A 2RI3A 5HP1A 1W0HA 5CYMA 3SJJA 4DTMA 4E1NA 4HUEA 3L8BA 3IS9A 2OPQA 4Z4FA 3SCXA 2VG6A 1W9HA 3AO1A 2YRVA 3NTHA 4AHTA 4FJNA 3VQQA 1U49A 3UT1A 3LAKA 2KQ2A 3AO4A 4KRFA 1C0MA 1Q8IA 3LP1A 1T7PA 3HXMA 3HVTA 1CZBA 4N4IA 4F3TA 4OVLA 4AHRA 2IDOA 1S5JA 4CJFA 4FLTA 4TSXA 3OS2A 1IKXA 4B3OA 4H4MA 4G1QA 2NLUA 1SUQA 1MU2A 1VSFA 4ID5A 3TAMA 1CZ9A 2RJCA 2RKIA 2JZ2A 3AVNA 3NH1A 3SUOA 3U3YA 2RHZA 1HYVA 3MXJA 3OYGA 3V9WA 4FLYA 4F2RA 2RHYA 4CECA 1OI1A 3LWMA 3SV4A 1HNIA 4DSJA 3QEIA 3CFRA 3AO5A 2KZZA 4FK0A 3L3VA 3ZT0A 1X9SA 1U45A 4FCYA 3DRRA 3PNWC 4CJRA 4E3SA 4K8XA 1B9FA 1QQCA 3TAQA 4L59A 3FEOA 5JS1A 2WONA 3AVMA 5CIUA 2RO0A 4JS5A 5C0MA 1RTDA 2EQMA 4EZ6A 1XI1A 1U04A 1K6YA 2CKKA 3I0RA 3QERA 2BGGA 3VQ9A 3LGFA 4B9WA 3KLEA 1JKHA 3TAPA 4KHSA 2EQJA 4CHNA 1GOBA 4FJMA 4LH5A 1H3ZA 1D5AA 3KD1E 3MO8A 1WAFA 3CM5A 5DMRA 1WSEA 3DLBA 1XC9A 1FKOA 2DIGA 2KFNA 4A4EA 1NKCA 5J39A 2A1SA 1RDBA 3K59A 2G3RA 1C6VA 1HQEA 1KFDA 4FLVA 3ME9A 4DU1A 2OPSA 3QINA 1S6QA 1Z25A 1UOCA 4NCAA 1U4BA 1XHZA 3VA3A 4M3RA 1S1VA 3C94A 4CGFA 2GV9A 2OZMA 1KRPA 3OJSA 3AA4A 4M3WA 3T3FA 1SSFA 3OYCA 1C1CA 4N76A 3MAQA 5I42A 1GOCA 3CYMA 4QQDA 1S1TA 1RILA 4DU3A 2EX3A 3VA0A 4KKOA 4A4GA 1BISA 4W5RA 4CK1A 1I39A 3QEVA 4KHQA 2QQRA 3MP6A 5KCOA 3K57A 2EQUA 4PLLA 1WNSA 5C6SA 4O5BA 1WGSA 4EP4A 1RT5A 4I2PA 4BDZA 1RTIA 5D6WA 3AVLA 4CFBA 2DFEA 5J26A 3RRHA 1RBVA 3OMGA 1HRHA 3DB4A 3HJFA 2BANA 3QNOA 1RDCA 3K58A 3V9ZA 3S9HA 1BHLA 1R0AA 2X4WA 3MP8A 3BDLA 4J2AA 2FHDA 5HRPA 4O55A 4DLEA 4DF4A 5J2PA 1JXBA 4AHUA 4KREA 1TL1A 2FC0A 4KPYA 3V9UA 1WN7A 1BCMA 3OY9A 1QTMA 1FXXA 3AVIA 3VQ7A 4FJJA 2DIQA 4BWJA 2D0AA 4OPJA 4L8RB 3AV9A 2X35A 4JS4A 5SZTA 1U48A 1NK5A 3AO3A 1UA1A 2G8KA 2ETJA 5HROA 4CJUA 3AVBA 1WSHA 3OYJA 3FLGA 4AH9A 1RBUA 3ZSOA 5J2QA 4AHCA 4QCLA 3UIQA 1JLAA 4JRQA 3AA3A 4B9LA 3F9KA 4Y1DA 3OYEA 5J2MA 1J53A 1B92A 1TL3A 3DOKA 4ZTJA 4C5EA 3WNHA 2XY8A 4M42A 3NNQA 4NYFA 1S1WA 3V1RA 4PY5A 1WSGA 3LDSA 2YV0X 4OKJA 2GF7A 2RHUA 4KHYA 1LWCA 2WACA 2XDPA 4OVAA 4IUQA 1CLQA 4CF0A 2FBXA 2ZD1A 3DLRA 2HNDA 3SV3A 1NJWA 1X9WA 2DFFA 1KLMA 1RI0A 1TGOA 1EETA 4F4KA 2HQXA 4C8MA 1D9FA 3K5OA 4II1A 4BWMA 1QSLA 3B6OA 4CGDA 1MHNA 2YNHA 3AO2A 1TAUA 3HT3A 1TKDA 4CF9A 1QE1A 4I7FA 3K5MA 2ITGA 4CHPA 1KCFA 4J2EA 1TVRA 3TAEA 4QQGA 1NOZA 3LANA 4CF2A 4RW9A 3QEPA 1TKXA 5IAYA 4MFBA 4W5QA 4W5NA 1N27A 1SV5A 5KH6A 2LVMA 2HVHA 2JGUA 1C0UA 1I3AA 1LWFA 2GFUA 4IUVA 2B8AA 1SL1A 5IN1A 3OYHA 4RG2A 2IS3A 4GW6A 5CY4A 2HHVA 4C5IA 3DB3A 4M45A 1IH7A 4DQRA 4M3TA 2OPPA 1SL0A 3PO4A 3ZSVA 3MEVA 3E01A 1VSEA 2RHXA 3M9QA 1IG9A 4CFAA 1RT4A 4B08A 1WJQA 3VQAA 2XY7A 3KKRA 4I2QA 4H4OA 3ALYA 4EP5A 3QEWA 2XY6A 3P8HA 1L5UA 3T1AA 4CJEA 2O4XB 4YNQA 4UQGA 2LDMA 3ZCMA 4QAGA 3NF7A 4LSLA 5D6XA 4CE9A 3KK3A 3VQ6A 3SPZA 3ASMA 3M8PA 3BGRA 3GOXA 3P1GA 1VRTA 2PYJA 2P5GA 1YTUA 2YKNA 1RT2A 4B8AB 3L42A 3V1QA 4FJKA 2HNZA 2Z1IA 4BE0A 3DYAA 1NJYA 2ATQA 3LYIA 2K3YA 4CJSA 3H08A 1BIZA 1RBTA 3PMTA 1D8YA 2OA8A 3K5LA 1NK8A 1J9AA 5J1EA 4GMJB 4DTUA 2Z1HA 4HVJA 4CJQA 2R5AA 4FL6A 1S1UA 4CGIA 3SI6A 3NE6A 5CZ2A 4UC4A 4PUOA 1A5VA 3VQ8A 1VSLA 2OZSA 1TK0A 1HYSA 1BQMA 2GUIA 1SKWA 2OPRA 3MECA 4CEZA 2IOCA 4B9SA 3S3NA 2D0BA 2I5JA 3U6FA 3RTVA 4NYNA 3SQ4A 1EXQA 3B6PA 4CJPA 4FM1A 5FRMA 4ZTFA 3KLHA 4GY5A 1KHCA 4Z0UA 3AVAA 4DQQA 1LW0A 3S3OA 1S9GA 5M9OA 5C42A 2VYTA 2HMIA 4FW1A 4B9UA 3MXMA 2RF2A 3NGYA 2HNYA 4BE1A 4H8KA 1BGXT 4O0IA 3T19A 3HPHA 3ISNC 2B4JA 3C6TA 3TAGA 4Z02A 2QXFA 1HJRA 4N4GA 3RMDA 1SL2A 2RJEA 4CF8A 1GOAA 1VSDA 3C4SA 1L3SA 3SQ2A 1Z26A 1ZBUA 1VRUA 4CHZA 3QO9A 5DK5A 1CXQA 4PLIA 2DTUA 3ASKA 4W5OA 5E41A 1WLJA 3KD5E 2R58A 2RJDA 3MEAA 4BDYA 4CJ3A 4E7JA 5KGXA 1LAWA 4CIEA 3MEEA 4M3ZA 4OJRA 4CHOA 1QSSA 2F5KA 3ULDA 1C0TA 2R5MA 4DFMA 1EP4A 4CJVA 4CESA 1KVAA 4C5GA 2RPIA 4CF1A 2EKOA 1S6PA 1BI4B 3ZT2A 4CJLA 1TV6A 4BE2A 2HB5A 4DMNA 3HK2A 3FDRA 3KK2A 3HVRA 4RG8A 4BDPA 3KLFA 4CGGA 3DM2A 4KB1A 4DTJA 2P5OA 3SPYA 3O4NA 1WJRA 3LH0A 3CM6A 3C6UA 4FJ7A 4DFPA 3QIPA 2D9TA 3O3GA 4KTWA 1D9DA 3TABA 3NCIA 3SQ1A 3FFIA 4M41A 2FBTA 2VWJA 1RT3A 4RW4A 3AVFA 2BUDA 3NH0A 2RI2A 2KTQA 3O3HA 4DG1A 4GVMA 1QHTA 3LZJA 2VG7A 3PO5A 3NH2A 3DRSA 3HPOA 4K8ZA 3IAYA 4B8CA 1LWEA 3LLRA 3OYAA 4O0JA 3SNNA 4BD3A 3SYZA 3LAMA 1RCHA 3V9SA 3SUNA 1RNHA 4IUTA 3HO1A 2QK9A 4F8RA 1T03A 3OMCA 3RRGA 1YVUA 3LGLA 4IBNA 4OKEA 2PQWA 3AVKA 2X78A 4CEFA 4CEEA 5KRTA 4DTSA 2BIVA 2M16A 1RT1A 4C8NA 3NDKA 2HHSA 3ITHA 2PZSA 3G10A 1VSKA 3PX0A 2X6NA 1TKTA 1QS4A 3HP6A 2HHWA 4O4GA 2G8FA 1S1XA 4HUGA 4M3UA 4R5PA 1KLNA 2BKDN 4ZHRA 1SKSA 4Q0BA 3F70A 1IKVA 1TK5A 4DTXA 3OYFA 4DFKA 3DLKA 4CERA 3M8QA 3RR7A 2GFAA 2F8SA 4J2DA 3S6WA 1JLGA 3TAFA 3OYIA 2VWKA 1NJXA 4QVZA 1REVA 3AVJA 3RMBA 3NF8A 1DTQA 4DTOA 3FC3A 3ZSRA 2X74A 4CGHA 2X4YA 3L2UA 2HHTA 5KCHA 2G8IA 3LALA 2O4XA 3NF9A 4DSLA 1F21A 3AVHA 1JLBA 4HTUA 1L3VA 3HP9A 2E4LA 2ZE2A 2QKBA 3EZ5A 4CEQA 4FJIA 3OJUA 4DQSA 5C25A 2OYQA 1KTQA 3LPTA 5FRNA 3V81A 1JXEA 4CEBA 4IUUA 1RDDA 4N41A 3HL8A 2W42A 4N4HA 3BDPA 1TKZA 1HQUA 2D5RA 3VQEA 4CHYA 3VQCA 3CFPA 4NCGA 4ID1A 2L8DA 4LD0A 5SWMA 4LD6A 1Q9YA 3IRXA 1QSYA 4IFVA 5HBMA 3I8DA 2RI5A 3P83D 3LZIA 1IO2A 2E6NA 2MWPA 4O44A 1ZYQA 4W5TA 4FK2A 1ZBLA 1O1WA 3META 2DFHA 3QEXA 3UWNA 3EAEA 3G0ZA 4QW2A 1JLQA 2Y1IA 1BIUA 1NOYA 3WNEA 4M3XA 5HRSA 4B9VA 3OYBA 4CEAA 2XRIA 1HNVA 4CEDA 2G8VA 2VG5A 4KO0A 2KZMA 5C24A 3ZSYA 4CFCA 3L2VA 3K2PA 4N47A 4MQ3A 4KTQA 1VK0A 1ITGA 3NAEA 4DU4A 3PFSA 4CJWA 4IG0A 2EFIA 4JRPA 4IFYA 3VQPA 2IGIA 4FJ8A 4B9XA 3NF6A 1FK9A 3ZT1A 1HYZA 1WSIA 1HMVA 1FKPA 3PY8A 1T05A 3DMJA 2P51A 1RBSA 4DTNA 5KI6A 1OZ3A 2BE2A 3D0PA 4HUFA 4ELTA 1LAVA 2YHAA 3QKJA 3PUFA 4EZ9A 1JLEA 1A5XA 4DF8A 2MWOA 5CZ1A 2IC3A 4A4FA 1DLOA 4FW2A 1G5VA 2G8UA 3RR8A 1EX4A 2G8WA 4CCHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OOUA 4HWIA 2DK8A 3T69A 3AL0B 1P9QC 2MK5A 2L3SA 1WHJA 4OO1J 2CSQA 2GIZA 1MUYA 5JFRA 2E19A 1WFWA 1J3TA 2RHIA 2XB0X 2L89A 3QETA 1JRIA 4JJBA 4DSFA 1KG7A 2KRSA 1JJ2S 4M7DE 2VKNA 1UWBA 3DQVC 1NMDA 1GL5A 4NB5A 3SK3A 1GVDA 1JLFA 2CRGA 2GA1A 3M0PA 3QSUA 4B24A 3HPGA 5HRNA 2PLYA 2XUBA 3HOVJ 5GAOn 4OPKA 4KYWA 3JSCA 1M2OA 4FLXA 2CGLA 3SMPA 2LVSA 1MD0A 3CCQI 2Z16A 4E7LA 4DWIA 2HHQA 2ENMA 6PAXA 3FDYA 4M75F 4CK3A 1SVMA 3KLIA 4AUXA 3CCLT 2HQRA 4RKUE 1T38A 4M78G 1B8IB 1VQ4Q 1X3UA 2PVDB 3OSVA 1M3CA 2O4IA 4EQQA 1N9SA 1N8RO 3VEPA 2E1ZA 1ZUUA 3A2FA 2WC2A 5LJ5j 4ELVA 4LMYA 1BQNA 3TQNA 5E18F 4XQ3A 1ZREA 2E1YA 3L1PA 4FM0A 2UXNA 1XWLA 4IOXA 1SFXA 2PFBA 2EQRA 3KZIC 3E9FA 2UUBK 3EG0A 5L3EA 1N3CA 4JJNK 4CZCA 4X9CA 1K8KB 3K9KA 1M1KC 2CS3A 5J2NA 3VERA 4DSIA 3MZ8A 4HNUA 4BC4A 4BGBA 2ZF5O 1WKMA 1VA7A 4F7UB 3REAB 2WV0A 1KD1U 3KBGA 2NOZA 3A0IX 2F2WA 2DMUA 3O4QA 5AQRA 3RDVA 4CZKA 4B47A 1WXBA 2RAEA 1NGGA 1JB0E 2KE9A 3L3UA 3OVNA 5I3UA 3HOSA 3TANA 2K7LA 4CD3A 3TSUA 2FB7A 5FPMA 2R7VA 3SZ2A 3CCMQ 2HKOA 4AFQC 1MGQA 3OQ5A 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 4DTU A;  2Z1H A;  4HVJ A;  4CJQ A;  2R5A A;  4FL6 A;  1S1U A;  4CGI A;  3SI6 A;  3NE6 A;  5CZ2 A;  4UC4 A;  4PUO A;  1A5V A;  3VQ8 A;  1VSL A;  2OZS A;  1TK0 A;  1HYS A;  1BQM A;  2GUI A;  1SKW A;  2OPR A;  3MEC A;  4CEZ A;  2IOC A;  4B9S A;  3S3N A;  2D0B A;  2I5J A;  3U6F A;  3RTV A;  4NYN A;  3SQ4 A;  1EXQ A;  3B6P A;  4CJP A;  4FM1 A;  5FRM A;  4ZTF A;  3KLH A;  4GY5 A;  1KHC A;  4Z0U A;  3AVA A;  4DQQ A;  1LW0 A;  3S3O A;  1S9G A;  5M9O A;  5C42 A;  2VYT A;  2HMI A;  4FW1 A;  4B9U A;  3MXM A;  2RF2 A;  3NGY A;  2HNY A;  4BE1 A;  4H8K A;  1BGX T;  4O0I A;  3T19 A;  3HPH A;  3ISN C;  2B4J A;  3C6T A;  3TAG A;  4Z02 A;  2QXF A;  1HJR A;  4N4G A;  3RMD A;  1SL2 A;  2RJE A;  4CF8 A;  1GOA A;  1VSD A;  3C4S A;  1L3S A;  3SQ2 A;  1Z26 A;  1ZBU A;  1VRU A;  4CHZ A;  3QO9 A;  5DK5 A;  1CXQ A;  4PLI A;  2DTU A;  3ASK A;  4W5O A;  5E41 A;  1WLJ A;  3KD5 E;  2R58 A;  2RJD A;  3MEA A;  4BDY A;  4CJ3 A;  4E7J A;  5KGX A;  1LAW A;  4CIE A;  3MEE A;  4M3Z A;  4OJR A;  4CHO A;  1QSS A;  2F5K A;  3ULD A; 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 2X6N A;  1TKT A;  1QS4 A;  3HP6 A;  2HHW A;  4O4G A;  2G8F A;  1S1X A;  4HUG A;  4M3U A;  4R5P A;  1KLN A;  2BKD N;  4ZHR A;  1SKS A;  4Q0B A;  3F70 A;  1IKV A;  1TK5 A;  4DTX A;  3OYF A;  4DFK A;  3DLK A;  4CER A;  3M8Q A;  3RR7 A;  2GFA A;  2F8S A;  4J2D A;  3S6W A;  1JLG A;  3TAF A;  3OYI A;  2VWK A;  1NJX A;  4QVZ A;  1REV A;  3AVJ A;  3RMB A;  3NF8 A;  1DTQ A;  4DTO A;  3FC3 A;  3ZSR A;  2X74 A;  4CGH A;  2X4Y A;  3L2U A;  2HHT A;  5KCH A;  2G8I A;  3LAL A;  2O4X A;  3NF9 A;  4DSL A;  1F21 A;  3AVH A;  1JLB A;  4HTU A;  1L3V A;  3HP9 A;  2E4L A;  2ZE2 A;  2QKB A;  3EZ5 A;  4CEQ A;  4FJI A;  3OJU A;  4DQS A;  5C25 A;  2OYQ A;  1KTQ A;  3LPT A;  5FRN A;  3V81 A;  1JXE A;  4CEB A;  4IUU A;  1RDD A;  4N41 A;  3HL8 A;  2W42 A;  4N4H A;  3BDP A;  1TKZ A;  1HQU A;  2D5R A;  3VQE A;  4CHY A;  3VQC A;  3CFP A;  4NCG A;  4ID1 A;  2L8D A;  4LD0 A;  5SWM A;  4LD6 A;  1Q9Y A;  3IRX A;  1QSY A;  4IFV A;  5HBM A;  3I8D A;  2RI5 A;  3P83 D;  3LZI A;  1IO2 A;  2E6N A;  2MWP A;  4O44 A;  1ZYQ A;  4W5T A;  4FK2 A;  1ZBL A;  1O1W A;  3MET A;  2DFH A;  3QEX A;  3UWN A;  3EAE A;  3G0Z A;  4QW2 A;  1JLQ A;  2Y1I A;  1BIU A;  1NOY A;  3WNE A;  4M3X A;  5HRS A;  4B9V A;  3OYB A;  4CEA A;  2XRI A;  1HNV A;  4CED A;  2G8V A;  2VG5 A;  4KO0 A;  2KZM A;  5C24 A;  3ZSY A;  4CFC A;  3L2V A;  3K2P A;  4N47 A;  4MQ3 A;  4KTQ A;  1VK0 A;  1ITG A;  3NAE A;  4DU4 A;  3PFS A;  4CJW A;  4IG0 A;  2EFI A;  4JRP A;  4IFY A;  3VQP A;  2IGI A;  4FJ8 A;  4B9X A;  3NF6 A;  1FK9 A;  3ZT1 A;  1HYZ A;  1WSI A;  1HMV A;  1FKP A;  3PY8 A;  1T05 A;  3DMJ A;  2P51 A;  1RBS A;  4DTN A;  5KI6 A;  1OZ3 A;  2BE2 A;  3D0P A;  4HUF A;  4ELT A;  1LAV A;  2YHA A;  3QKJ A;  3PUF A;  4EZ9 A;  1JLE A;  1A5X A;  4DF8 A;  2MWO A;  5CZ1 A;  2IC3 A;  4A4F A;  1DLO A;  4FW2 A;  1G5V A;  2G8U A;  3RR8 A;  1EX4 A;  2G8W A;  4CCH A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1N3C A;  4JJN K;  4CZC A;  4X9C A;  1K8K B;  3K9K A;  1M1K C;  2CS3 A;  5J2N A;  3VER A;  4DSI A;  3MZ8 A;  4HNU A;  4BC4 A;  4BGB A;  2ZF5 O;  1WKM A;  1VA7 A;  4F7U B;  3REA B;  2WV0 A;  1KD1 U;  3KBG A;  2NOZ A;  3A0I X;  2F2W A;  2DMU A;  3O4Q A;  5AQR A;  3RDV A;  4CZK A;  4B47 A;  1WXB A;  2RAE A;  1NGG A;  1JB0 E;  2KE9 A;  3L3U A;  3OVN A;  5I3U A;  3HOS A;  3TAN A;  2K7L A;  4CD3 A;  3TSU A;  2FB7 A;  5FPM A;  2R7V A;  3SZ2 A;  3CCM Q;  2HKO A;  4AFQ C;  1MGQ A;  3OQ5 A;  2HOA A;  2JSC A;  3VQD A;  1IKW A;  3G71 Q;  2HHU A;  2FBY A;  4DBR A;  4XTW A;  2DL7 A;  2V9K A;  1ZKG A;  1WNL A;  4BRG A;  1BKB A;  4BQZ A;  1CXU A;  3HZJ A;  2OQG A;  2M7B A;  1VQ5 Q;  4A62 A;  1XJW B;  4B21 A;  3NTI A;  1WH5 A;  1W0U A;  4FSX A;  3QPL A;  5GPC A;  1Q81 R;  3MXI A;  3CBP A;  3WG7 H;  4RB1 A;  3JCM X;  2ACJ A;  2RH2 A;  2CP6 A;  3VN5 A;  4BBS J;  1NU0 A;  4J2B A;  2IS4 A;  5HLH A;  4XU2 A;  1VQ8 N;  3OA9 A;  2AKL A;  2QWW A;  2KL4 A;  4PJO B;  2OV7 A;  1QVG M;  3MEU A;  1IXR C;  3V4G A;  3JCM h; 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 4HUG A;  3TDU C;  3UDC A;  4R5P A;  3GTP J;  1GXQ A;  2BKD N;  1YI2 T;  1SKS A;  3FK6 A;  1KGS A;  2E3H A;  1GLJ O;  2K57 A;  4BEH A;  2E2H J;  2CV0 A;  3M07 A;  4KMU X;  2CUD A;  1VYV A;  3S6W A;  5F08 A;  3OYI A;  1X6G A;  3TAF A;  4GV6 A;  2RN7 A;  4W1U A;  1QW1 A;  1NJX A;  9ANT A;  4I2O A;  4JRK A;  4W97 A;  1OX9 A;  3VYR B;  1Q82 C;  1E3O C;  3CC4 T;  3KEY A;  1W70 A;  4KN4 X;  3QDK A;  1IN7 A;  4EJZ A;  1UEB A;  2FSW A;  2UXC K;  1IG7 A;  4OB0 B;  2JWL A;  4DTO A;  2Z33 A;  4J9B A;  1Z67 A;  3QXE B;  3L2U A;  1IBM K;  4XKC A;  4YDU A;  2TRT A;  3NWS A;  3C12 A;  4ESF A;  2NAZ A;  3QOE A;  4DEY A;  3NMU A;  1FYN A;  1QQO A;  1N9R A;  1F21 A;  3AGR A;  4D7N A;  2Y69 H;  1PM3 A;  1I3Q J;  3CC7 N;  2ZE2 A;  4PJO E;  2VCP A;  4Z94 A;  4FJI A;  2MYS A;  4EMK B;  2QWO A;  1VQN A;  4L9N A;  4ZN1 A;  2KMT A;  2W10 A;  1SFO J;  4OB1 B;  3JRH A;  2J5P A;  4O8K A;  1ZGJ A;  1JXE A;  1PC0 A;  2XSJ C;  4AIK A;  4CEB A;  4C8Q C;  3L2C A;  4ENN A;  4JX5 A;  3HL8 A;  4N4H A;  2ZAE A;  3MDQ A;  2M8G X;  3DAW A;  3RNJ A;  2D5R A;  2FRW A;  1Q1V A;  2FZC B;  1MBK A;  3UB5 A;  3I55 T;  3EFR A;  5LJ3 e;  2PVG B;  4NUB A;  4LD0 A;  3TPQ A;  2HFH A;  5DM6 L;  1YIJ I;  4F93 B;  4QS8 A;  2FJ1 A;  2R5Z A;  1IGN A;  4EM0 B;  2ZPG B;  4IFV A;  2JWT A;  4BR2 A;  3I8D A;  3P83 D;  3LZI A;  2W40 A;  4ZGJ B;  1IO2 A;  1K9M O;  4O44 A;  2MWP A;  2ED0 A;  2DPN A;  1ZYQ A;  1X43 A;  2NUZ A;  3J7Y P;  4FK2 A;  2VPL A;  1N3A A;  2D0P A;  4UVB A;  1WJA A;  3QEX A;  3UWN A;  3C18 A;  4QW2 A;  1JLQ A;  2Y1I A;  1WX6 A;  4CCK A;  2BY3 A;  3F8M A;  4Q48 A;  2PMZ N;  3EYI A;  4WX9 A;  1O4X A;  3EG1 A;  4U0Y A;  3LSH A;  3D1N I;  2XRI A;  3CCS T;  2D0N A;  3K9J A;  2H1L A;  2G8V A;  2L7F P;  4GBQ A;  2LMD A;  4KIG A;  3CXC P;  2VG5 A;  4KO0 A;  2GWJ A;  5C24 A;  3ZSY A;  4J6Y A;  3ABK H;  3BJ6 A;  5GAG J;  2FG0 A;  1WCM J;  4MQ3 A;  5ED4 A;  1VK0 A;  3GLX A;  4DU4 A;  1FX7 A;  3R4K A;  4IG0 A;  4DYC A;  2EFI A;  1LNW A;  1VQM I;  1T0F C;  3IRQ A;  5IT9 Z;  2K6D A;  1ZUY A;  4EW0 A;  3M1E A;  2R7X A;  4CZE A;  1KQS S;  1HUX A;  1HKB A;  2C6Y A;  3BG3 A;  1OCC H;  4AT1 B;  1ZQ1 A;  4EJT A;  1T05 A;  3FK7 A;  2KIF A;  1ONV A;  1UHM A;  1RBS A;  5B66 C;  5IYC J;  1OR7 C;  5KI6 A;  4KBM B;  2VBY A;  3TDZ C;  2KI7 A;  5BMZ A;  4LF8 K;  3S32 A;  1ZRD A;  1YW8 A;  2BGC A;  4B3S K;  1U6Z A;  5JR3 A;  4JQF A;  5GTI C;  4RB0 A;  3DLA A;  1PD0 A;  4FW2 A;  3RR8 A;  3C7J A;  2G8W A;  2CDT A;  4A0X A;  4CCH A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4FJG A;  3AVG A;  4JLH A;  2PVD B;  3OSV A;  3SUQ A;  3CC7 T;  4DOV A;  2O4I A;  2CZ6 B;  1BCO A;  2WOM A;  1N9S A;  2HPI A;  1HPZ A;  4BXF A;  2RB6 A;  3BLY A;  4CFD A;  3OR2 C;  1OZ2 A;  3A2F A;  5LJ5 j;  4ELV A;  1BQN A;  4E7I A;  4BAC A;  2LTO A;  4QQ6 A;  2RNG A;  4OB3 B;  4XQ3 A;  4BGD A;  2P1J A;  5HKC A;  4C92 B;  4FM0 A;  2UUZ A;  1Q7Y C;  1XWL A;  2IAJ A;  3HM9 A;  1BL3 A;  1WJB A;  3E9F A;  3JB9 I;  2X4X A;  2IVW A;  4M7D F;  3HRS A;  3VQ4 A;  4C2U A;  3RES A;  4JJN K;  1X75 C;  1V5F A;  1K8A U;  4CZC A;  4M3Y A;  3LX7 A;  4X9C A;  4CJK A;  3H35 A;  3U21 A;  1LW2 A;  3WNF A;  1M1K C;  2CS3 A;  4NC8 A;  5J2N A;  3JB9 H;  4DSI A;  4OLA A;  1QU3 A;  4FK4 A;  1T8E A;  1NJI C;  3MEW A;  2A1R A;  3DLH A;  4HNU A;  3I55 A;  3LL7 A;  4HCB A;  4KHN A;  2E1H A;  5FLX E;  2XG8 D;  4M78 E;  1JL1 A;  4F7U B;  2LQ8 A;  5GAN d;  3OYD A;  5LD2 C;  2F6C A;  4OKK A;  3OBY A;  1KD1 U;  1MW7 A;  1K73 C;  2IG0 A;  3KBG A;  1MMD A;  2JTF A;  2EQK A;  4MDX A;  3FBN B;  3O4Q A;  1M9S A;  1NK6 A;  4IDK A; 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