The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
148
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structure length |
146
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Chain Sequence |
PSFLTHTIVNITIGLGMKRSGYGQPIASTLSNITLPMQDNNTDVYCVRSDQFSVYVHSTCKSALWDNVFKRNCTDVLDATAVIKTGTCPFSFDKLYLTFNKFCLSLSPVGANCKFDVAARTRTNDQVVRSLYVIYEEGDSIVLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural bases of coronavirus attachment to host aminopeptidase N and its inhibition by neutralizing antibodies.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Aminopeptidase N
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| molecule tags |
Hydrolase/viral protein
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| source organism |
Sus scrofa
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| total genus |
23
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| structure length |
146
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| sequence length |
148
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| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Sandwich | Immunoglobulin-like | Immunoglobulin-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KBH E; 4F5C E; 4F2M E; #chains in the Genus database with same CATH topology 2X44 D; 3TA3 A; 2HRG A; 4HIJ A; 1P4U A; 4DN4 H; 5HHM B; 2X3C A; 3QFD B; 1D5B B; 2UWE E; 3OL2 A; 1F13 A; 1NGZ B; 4Z7V E; 3CLF H; 3EHB D; 5DD6 A; 1QUP A; 1EZV Y; 3NRF A; 5CSZ B; 1JTO A; 3GSV B; 4ZFF B; 3GML B; 4JKP H; 5BS0 A; 3ZKS D; 2H2S D; 6PAZ A; 3P4L A; 1RPK A; 1N3N B; 4ETY A; 5BQ7 A; 2BCK A; 3E7J A; 1W8E A; 4PJI E; 3GMQ B; 4G7V L; 4YZF E; 5J89 A; 1KF9 B; 2NR6 A; 3FHQ A; 4XCY A; 2VLJ D; 3TIE B; 4WI2 A; 4U0R B; 4XP9 L; 1AZV A; 1UOK A; 4BH7 A; 2NYY C; 1A47 A; 1IBF A; 3DEC A; 3MOQ A; 4HWZ B; 2WQX A; 1EDY A; 1MCP L; 2VDP H; 1F4W H; 5LXV A; 1T04 A; 4JNX A; 2XWE A; 1XB3 A; 2MKW A; 4PJ8 C; 2H0P A; 5ELI A; 3T2N H; 2OTU B; 1AY1 H; 1I8I B; 3DUH A; 3RNQ B; 1HHJ B; 4S1R H; 4LKX B; 3B3I B; 3CXD L; 2A6J B; 2Z7W A; 4O00 A; 3D69 A; 3VTT A; 1QEW B; 4DET A; 3QAZ B; 4HF5 L; 5IFH L; 3O8X C; 5TJW K; 4GG6 F; 4G7Y L; 4OV5 A; 4K3J H; 2L04 A; 3NFP A; 5DMJ B; 3CK0 L; 3V7M A; 4FFY L; 4FUL A; 1HXK A; 3P69 A; 3H6J A; 4FKK A; 1M7U A; 3FU3 A; 3DDF A; 4A2H A; 4G8G E; 3S35 L; 5DEF B; 4WI3 A; 1E65 A; 1ED3 B; 3ARD A; 3VB9 A; 2I26 N; 3WEN A; 4XPG H; 1DAN U; 3BZ4 B; 4L1L A; 1FL3 A; 3KWT A; 3FRP B; 3KW7 A; 3QRG H; 2RH0 A; 5BUP A; 5A2K H; 3S88 H; 3KPR B; 5TE6 L; 1I7U A; 2BSR A; 1WC7 A; 3WFC H; 3PDG A; 3S2C A; 3QJF A; 1GA2 A; 4RFN C; 5MEN A; 1QR1 A; 3VTA A; 4UNT A; 5FOB B; 2QVT A; 3PL6 A; 3QUX D; 3SE9 H; 5DWU H; 4DEW A; 5GRX G; 2F8V A; 4DP0 X; 2BNR D; 3R7R A; 2D8K A; 2P49 B; 4R90 H; 1WWA X; 2MHA A; 4GKL A; 4LDL B; 5CZX C; 2YLH A; 4L1T A; 4YHZ L; 4W4N A; 5D4H A; 1IIK A; 4MJI B; 3BGM B; 3QUM L; 3BRF A; 2W8C A; 3NG5 A; 4BFE A; 1TVB A; 1ES0 A; 1EMT L; 3MCK A; 3RKP A; 1FGN H; 1Q9L A; 2VM3 A; 4G7R B; 1U8Q B; 3HE7 A; 4HT1 H; 4P05 A; 4DO6 A; 1TUP A; 3FTS A; 2H47 C; 2X7L A; 3DNK A; 4MSW B; 5D6D A; 1PLG L; 3F5W B; 1BFO A; 1RK0 B; 5DUP L; 2VT0 A; 5ESV A; 3DYP A; 2JQZ A; 1MI5 D; 4CIL A; 3QFJ B; 1U33 A; 3BVX A; 1GGY A; 4CAD B; 1YEC H; 4B53 A; 4AQE B; 2DTM H; 4ODB D; 2VSC A; 1UB6 B; 5D96 B; 1T1W B; 2ZKH H; 2CWR A; 4LOF A; 5IHU H; 2OP4 H; 3PYC A; 5GJT H; 3E1F 1; 5JW4 Q; 1UAD C; 2F53 D; 2Y6S D; 3GJF K; 4JDZ B; 1DBJ L; 5EZO L; 4HLZ H; 1TYJ A; 2WWM C; 3VQ2 C; 1MHP L; 4V2C B; 3B37 A; 1EFQ A; 3L3O B; 4AY0 A; 2DWE B; 2WTP A; 4LL9 A; 1KFG A; 1E9O B; 2YEV B; 4ZS7 L; 4ZUV A; 3ZSS A; 3DSF H; 5TE4 H; 3BKY H; 1N0L A; 2COQ A; 3Q2C A; 4PGE A; 2WD0 A; 1AD9 A; 2XZQ H; 1E4X L; 3AML A; 1K8D A; 1KIR B; 5LGJ A; 1CQK A; 5E6I B; 4H4N A; 3DJZ A; 2J5W A; 4I1N B; 2AQT A; 3EYS L; 1NEZ G; 3SDC D; 5JZ7 D; 1QRN B; 4IHB A; 4HHA B; 3QNY A; 1EVU A; 3KD4 A; 2WPG A; 1YEW A; 4ORG B; 1JK9 B; 4KQ3 L; 5BVP H; 5MI0 B; 1Q0X H; 3TBB A; 5F7D A; 4L4J A; 1RHH A; 1RUR H; 2XWT A; 3HMX H; 4KQ4 H; 2QLY A; 4UUJ A; 1Y18 B; 5F9J A; 4LEB A; 1RZK H; 4IKL A; 3TPK A; 5ADO L; 1X5I A; 4HII A; 1ZE3 H; 1FPT L; 1G4M A; 1Y1D A; 2XJK A; 3BPO C; 4Z7W F; 4X6E B; 1DBB H; 3DJT A; 4H0I A; 1A66 A; 1FZJ A; 2Z1K A; 3SEP A; 2YMO A; 5I8O H; 1CBV L; 2OX5 A; 3HG1 B; 3SJV D; 3WE6 B; 3IDN A; 4LU5 L; 4MJ5 B; 1AG6 A; 1QX1 A; 3O4L B; 5F21 B; 1SZN A; 4WV1 C; 4YHI A; 4MD0 B; 2X1W L; 2YR3 A; 1NBZ B; 1FL6 A; 4MAY B; 4OF3 A; 3ZU8 A; 2E0P A; 3U0P A; 4P9H C; 1GS8 A; 4K7P L; 4U6V H; 2FT7 A; 2AXJ A; 3GSW B; 4OZI E; 1K9T A; 4JRE C; 3KXF B; 3LVE A; 5CN3 A; 2OPC A; 2Q86 A; 1AQ8 A; 1NDM A; 1DBK L; 1HCY A; 1Q1J H; 4V1D E; 5JXE C; 3Q2V A; 4GH7 B; 1ZGL A; 3QC5 X; 5FKP B; 1COB A; 4RGM B; 4B50 A; 4WWI D; 1QFW H; 3BQU D; 1M71 A; 4JM2 A; 4TNG A; 1INE H; 3V0W L; 2NLJ B; 4PG2 A; 1AZR A; 3SDX B; 3V0V A; 1MRD L; 3NAA L; 5IQL A; 3CFB B; 5F1I B; 2ZPK L; 3UP6 A; 1NZR A; 4NS0 A; 4AYF B; 1J1X L; 4Y16 A; 3JWN E; 2NT0 A; 3DGC R; 5CIN H; 5L7X L; 2B77 A; 1GCY A; 4O02 L; 2WOB A; 4JPI A; 1J5D A; 1F4H A; 3PDO B; 4G6J L; 4PJ9 A; 3UTT D; 5I6M A; 3T4Y B; 4NHU B; 1G84 A; 4FA8 A; 3U4E B; 5T3Z H; 4BKS C; 4BWW A; 4EJ1 C; 2PTU A; 1RP9 A; 4IOI A; 5ILT L; 3CDZ A; 3ARG B; 1CDU A; 1OAU H; 4U1G C; 4MBO A; 2G3Z A; 3ZL4 L; 5DD1 L; 1H0D B; 4OLU L; 1HSB B; 3S34 H; 3TCL B; 3ZQW A; 1IAI H; 4X9H A; 4HWB H; 4M8V A; 5T3X E; 1G6R B; 5AOJ A; 2EYT A; 4ES9 A; 3TS8 A; 5B1J C; 3AXL A; 4CU6 A; 3NSD A; 3EO1 B; 3L9Y A; 2ZUW A; 1LDP L; 2ADF H; 2FGZ A; 2UX7 A; 1FNF A; 1V7M H; 3GMO A; 3Q9Q A; 2Z31 B; 1YN6 B; 3HB3 C; 4ZYK B; 3MRQ B; 4U3C A; 4HKJ A; 4TMP A; 4XTR D; 3N44 F; 5DJZ B; 5T33 L; 4S1S L; 5D1Q D; 1EK3 A; 1JHL H; 4OGY H; 1C9S A; 3AQD A; 2BRR L; 2BK8 A; 3N1F C; 4RFE B; 1JGL L; 1EEZ B; 2K8M A; 3IYL W; 4NN6 C; 5I0X A; 1GL4 B; 3DPB B; 4NX0 A; 5E9D D; 1IJ9 A; 1U3H A; 2AKR B; 4FE9 A; 3ZYJ A; 4F9L A; 4M43 H; 3RGH A; 5JR1 H; 5HD8 C; 4ZMP A; 4G5Z H; 4FNP A; 4QRU B; 3RUG F; 4PTT B; 4HKZ B; 3IN0 A; 3FN0 L; 2FQG A; 3W37 A; 3WNN A; 1X9R A; 1BLN A; 3ARE C; 3Q1E A; 2X88 A; 5EF1 A; 1KJV B; 2CDG A; 2YD2 A; 5F7U A; 2VDL H; 3GRW H; 1QTY T; 1LQS R; 4DZ8 B; 3BPN C; 1DQM L; 3SD5 A; 4M7Z B; 4A7Q A; 1T6W A; 4WHT B; 1DBA L; 4RAV B; 3ZUC A; 3QRF M; 4X42 A; 1OSY A; 1VAD B; 1MHH A; 1AP2 B; 5F6H I; 3WTT A; 4D7P A; 3MAC H; 5HHQ B; 1N64 H; 1S9X B; 3A21 A; 3ZMR A; 5LQB H; 2FO4 A; 3CZF B; 1Q4N X; 3KH4 A; 3A67 L; 4KXD A; 5BJT A; 5DFV D; 1I8L C; 2QL1 A; 4ELM B; 4EOW L; 2A4C A; 5L2K B; 4PRD B; 4PJX E; 3Q3G A; 2WXR A; 3EGX A; 3C12 A; 3JTS B; 3S5L A; 3O81 A; 1UH4 A; 3H3P L; 1GYA A; 4G1M B; 4ICX A; 2G60 L; 3SN6 N; 4KXA A; 3X3G L; 3KHO A; 3T0E A; 2XWC A; 1M7I A; 1UD8 A; 1KYF A; 2B4C L; 4JN1 L; 4KJW C; 2EDF A; 4H88 H; 4WUK H; 4AYS A; 5BXF A; 5IBU G; 2NCE A; 4DNL A; 2LHA A; 3EYF B; 5E5M A; 3QQD B; 2VJX A; 3DUS B; 4QHK I; 1U8M B; 4I89 A; 4Z7W B; 5I16 A; 3NA9 L; 4P06 A; 2HRL A; 4CVX B; 2EIM B; 4HYT B; 2BY3 A; 2Q8B H; 3HZM A; 2AF2 A; 1I8K B; 1A1N A; 1NCN A; 1ETZ B; 4DGI L; 4AIZ B; 1TSH A; 2XN9 B; 3OGO E; 4ZXB C; 4X9Y A; 5K5Y A; 5JHB A; 4BK5 A; 1UA6 H; 3QNX A; 3U79 A; 2NZ9 C; 1G0X A; 3ULU H; 4PRI A; 8FAB B; 5F7N C; 1IKN C; 1UZ6 E; 1RUQ L; 1Y6N R; 5TFS H; 1Z5Y D; 3HI5 H; 2RBL A; 4OUU A; 5E70 A; 2GFB A; 4W9J C; 2QHR H; 3POC A; 2X9Z A; 3HUJ F; 4PJ8 B; 2R4R H; 3KM1 A; 2ZJS H; 4G83 A; 2X4T B; 3F58 L; 4K3E L; 3WIH H; 1JYN A; 4PWG A; 5FW8 A; 2GK0 A; 1GYC A; 2B9B A; 1JDD A; 1RV6 X; 2V7N B; 4KRO D; 5LJY H; 1ONQ B; 5D7L D; 3TL5 A; 5AD0 A; 5GZO D; 1O6T A; 4J23 A; 1T5W A; 3O8X B; 5E8E B; 4GY4 A; 4XO5 A; 3TID B; 5AVX B; 4F7C A; 2EE6 A; 4TPR L; 3MBX H; 4F7M A; 3VFP B; 3PV6 A; 2OL3 B; 1FVE B; 5H2B A; 4AL8 L; 4XVS H; 1HE8 A; 2CR6 A; 1GGB L; 4FG6 C; 4U6T A; 1R0A L; 3WL9 B; 2VTF A; 4PIR F; 5IHW A; 3CHO A; 1KAC B; 4ECN A; 4J3O F; 3RVU C; 3O6F D; 2OXH B; 1E42 A; 3NH7 H; 4JFV A; 4FQH A; 4LB8 A; 4X8J B; 5B1A B; 1A22 B; 4K8R D; 1HTY A; 3HTL X; 3PWP B; 5AAP A; 2IC2 A; 3VFN A; 5ETU A; 2GAZ A; 2YD9 A; 1CLZ H; 3NIG F; 1C7S A; 5A2C A; 2Q7Y A; 2AJX L; 4C4U A; 4KU1 A; 1WRF A; 4RFN B; 3A6B H; 5CJQ H; 4NUJ B; 5HHX L; 4KRP D; 2ENY A; 1YEK H; 4W6Y B; 1UWG L; 3GO1 H; 4MZR A; 4AGL A; 3IE9 A; 2WNW A; 5DQ9 B; 4E36 A; 3VGA C; 1ECY A; 3ZLQ C; 5CJX A; 1WWW X; 4NI6 A; 4CVW A; 1LE9 A; 4YR6 B; 3OAU H; 3BQV A; 4J1U B; 4IRZ A; 4DWH A; 1URZ A; 4NKM B; 1WE5 A; 5JPM C; 2PYE A; 2DQJ H; 3BZE A; 2AEW A; 1U92 B; 3GHE L; 3ZOA A; 5ACL A; 2LW3 A; 4CBZ A; 1JD9 A; 1X5G A; 3NEX A; 3KW8 A; 4L4V A; 5FYK E; 1M1X B; 4PJD F; 1PKQ E; 3QO0 B; 4P5K B; 1W2K T; 1KXT A; 3I02 A; 5DF0 A; 5C08 D; 1E8Z A; 1RK1 B; 4F8T A; 2Z0U A; 1IX2 A; 3QR2 A; 4X4Y B; 4NQE E; 5D55 A; 2VNC A; 4LK4 A; 4UTB A; 2N7B A; 2ZYI A; 3KLQ A; 4W9F C; 2IG2 H; 2K1M A; 4KPH L; 4MA7 L; 3RWE B; 4QXV A; 4TUJ B; 4Y1A A; 4YSA A; 2VRA A; 2CLV A; 1DVF D; 3U2S B; 2ENQ A; 3BZF B; 5D7I A; 2WY3 B; 5CFA A; 1A4K B; 1AAC A; 1UT9 A; 4XVU D; 4BKL B; 3P9L B; 2E27 H; 4JZJ A; 1E6O H; 1XGY H; 4AGM A; 3EBI A; 3Q06 A; 1OWR M; 1C1E L; 3C75 A; 5I6X C; 3N1G C; 1WUN T; 2RTT A; 3U46 B; 4JY6 A; 1LNU B; 3L1G A; 2WP3 O; 4KKL D; 5J7C C; 5FYJ D; 4E9W A; 3L13 A; 3PGF H; 2CZN A; 1Z9L A; 4FHK A; 3ZHK A; 1JDA A; 3BAJ A; 3NQI A; 4RIS L; 1LD9 B; 1N7M L; 2WNX A; 4K23 H; 4WNS A; 3D39 E; 3V4U H; 3P4O B; 2VW7 A; 4BWT A; 5HXM A; 4TVP L; 3SYC A; 4Z5R A; 1SNR A; 3HMW L; 4P9M H; 4UM9 D; 5AW6 B; 3CN2 A; 3VWJ A; 1U8H A; 3OPU A; 3UDW A; 5I5R A; 2DQF B; 4HZA A; 3BPO B; 2E4F A; 3OPZ H; 1BYP A; 3W39 A; 1ACZ A; 2I5Y L; 4JLR B; 4KNS A; 1OVZ A; 5KG9 B; 2BZ7 A; 3VYN A; 3FO9 B; 3R0N A; 5ITF B; 4L8S A; 4KK6 C; 4BEL D; 3VFU A; 1VGK B; 5FO7 B; 1UAC L; 5DRX B; 4GOS A; 2ZE0 A; 3HUJ B; 2LE9 A; 2ZD0 A; 5I73 C; 4OKD A; 4DW2 H; 1IEA A; 3V52 H; 1JZF A; 1XAU A; 2XRA L; 4MDI B; 5AOK A; 1E28 A; 2Y7Q B; 3FFC E; 3TN0 A; 2GJZ B; 1I7Z B; 4RZC B; 2EUX A; 4RDQ F; 2WNG A; 3BW9 A; 1I1Y B; 4JGJ A; 4IRS C; 2H9G A; 3LJ3 A; 3Q2L A; 1GAF H; 1ZLV H; 1ZRU A; 1EZU A; 5IUC A; 5GGS A; 3ATD A; 3G6D H; 3FCS B; 2WII B; 2E9J A; 4TV3 A; 1X4Y A; 3GK8 H; 2J5L C; 4IU2 B; 4E5X B; 5I26 A; 1QA9 A; 1ZLD A; 4FDW A; 4PW3 A; 2R69 A; 4AOF A; 4L8C B; 2AAA A; 3Q01 A; 5HHO B; 4L37 A; 3DV4 A; 1A4J A; 4GSD H; 4MNG E; 3H0T A; 3HHS B; 4MS6 A; 4U1G B; 3VO0 A; 3QNZ A; 3IF1 A; 4G8A C; 1CT8 A; 4D7B A; 1TTU A; 3ABL B; 2DI9 A; 5EZI L; 4ANV A; 5ICX A; 4JB9 H; 1G9N C; 4MCN A; 4EI5 D; 3IDJ A; 5T5F H; 4X7F C; 1L6Z A; 5IES H; 2QVF B; 5EUO F; 4H25 A; 3RFZ C; 1NSN L; 1AGB A; 2X2Y A; 4MDR A; 3PWV A; 1WS7 A; 2IJ0 C; 1ODU A; 3K2U H; 3OXR A; 1C16 B; 1BXX A; 4G72 B; 3FU8 A; 4L4T D; 4LFH D; 3RPI B; 1SDD B; 3D18 B; 3FRP G; 5CCG E; 1KIP B; 3BIA X; 1EIB A; 4LSQ L; 1U3N A; 4QTH B; 1A8Z A; 1RLB A; 3PLY A; 3MRF A; 4M7J L; 4QOK B; 2FCB A; 3V0J A; 4XMT A; 2P5E E; 3V4P A; 4HAG A; 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