The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
90
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structure length |
84
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Chain Sequence |
SVALPVAQVFSVLLDVKHFSPEEIAVKVVGEHVEVHARHEERPDEHGFVAREFHRRYRLPPGVDPAAVTSALSPEGVLSIQAAP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Molecular structure and dynamics of the dimeric human small heat shock protein HSPB6
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Heat shock protein beta-6
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| total genus |
9
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| structure length |
84
|
| sequence length |
90
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-03-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00011 | HSP20 | Hsp20/alpha crystallin family |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Sandwich | Immunoglobulin-like | Immunoglobulin-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4I88 A; 4FEI A; 1RL1 A; 3QOR C; 3QOR D; 2Y22 A; 3VQM A; 4YLC A; 4PBD A; 3QOR A; 2N3J A; 2JKI S; 3VQL A; 3GUF A; 1SHS A; 2KMW A; 1X5M A; 5DS1 A; 5LUM A; 3EUD A; 4ZJ9 A; 3Q9Q A; 2BOL A; 2N0K A; 1EJF A; 2WJ5 A; 3AAB A; 4M5S A; 2K8Q A; 4PCK A; 2Y1Z A; 1WFI A; 3AAC A; 2MNW A; 2WJ7 A; 3L1F A; 4YE0 A; 3Q9P A; 4M5T A; 2KLR A; 5DS2 A; 1WH0 A; 2CR0 A; 2XCM C; 3GLA A; 3QOR B; 3GT6 A; 4YDZ A; 4RZK A; 2O30 A; 2Y1Y A; 4MJH A; 3L1E A; 1WGV A; 3J07 A; 3IGF A; 4JUT A; 4YLB A; 4ELD A; 4YL9 A; 4JUS A; 3L1G A; 1GME A; 3N3E A; 2RH0 A; 2CG9 X; 3W1Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JEL L; 2QZ5 A; 3MZG B; 4N2I A; 3QYN A; 3VXQ B; 1FO0 A; 2Z0B A; 3IFL L; 5AUM B; 1C1E H; 2I5Y L; 4HKZ B; 3QAQ A; 1RPQ A; 1TR7 A; 2YD5 A; 4UT7 L; 5BXF B; 1NFA A; 2FEJ A; 3C87 A; 1HXK A; 4UT6 A; 3NPZ B; 2MCM A; 3V9C A; 4RWY H; 4CU6 A; 2ADG B; 4AYS A; 4GG8 A; 1C7S A; 1GVI A; 5IQ7 H; 1TMQ A; 3IGA A; 5GHW L; 4M43 H; 2ED7 A; 1LIL A; 4WNS A; 4ZD3 L; 3K6O A; 5CF3 A; 1NC4 A; 2CCL A; 4FHJ A; 2CHN A; 4GB9 A; 1GTN A; 4WNQ B; 3FOL B; 1BD2 D; 4HD5 A; 1FH5 H; 3GI9 L; 3IJ7 A; 5F3F A; 5A16 A; 1UEM A; 4Y19 A; 1KAC B; 2OL3 B; 4PWF A; 5I1A B; 3BFW A; 2X4P B; 5BNX D; 4MJ2 A; 2HPT A; 1AGC B; 3RQ3 A; 3WDH A; 3GB7 A; 5HDR A; 3IEA A; 5T5N G; 2L04 A; 5FW6 A; 4QRS A; 3F7V B; 4P4K D; 3RTL A; 1ASP A; 3VFN A; 2ADJ A; 2DZE A; 2HFG H; 4PD4 K; 5D6D A; 2QEJ A; 4JN2 A; 3CBR A; 4XWG L; 1BLN A; 3DHJ A; 2K7Q A; 4KJQ C; 3LXC A; 1N64 L; 1BIH A; 1QA9 B; 4HVB A; 1AZV A; 3FUH A; 4TL5 A; 3RUG A; 4K71 C; 4YFD B; 1TVH A; 3RHW F; 4ODH L; 2WLM A; 3EJU A; 5E51 A; 1HNF A; 1VEP A; 1YNL H; 4HFW A; 2ZT9 C; 1SEB A; 3D7P A; 1MG2 C; 2PCF B; 3MRF A; 2PPF A; 3VD0 A; 3R4R A; 4R90 L; 1L3W A; 1D5B A; 2XIB A; 5C07 E; 1ORQ B; 3ZKX C; 2NY6 D; 2R1W B; 4ILD A; 4PJ8 A; 2AQT A; 4JZN B; 4XNU L; 4S10 A; 4GUO A; 3UAJ C; 5MER B; 5T3X H; 1SOX A; 2DQG H; 5C07 B; 3RVT D; 4R7N A; 5FO9 A; 2ZKM X; 4HGM A; 4XAW L; 1U3H A; 1PY4 A; 5EPM B; 2DTS A; 4WW1 B; 4HKJ B; 1DQJ A; 3PV6 B; 1KCV L; 3OGC A; 2FL5 A; 4XO5 A; 2G5B B; 2WLI B; 2OW7 A; 3MA9 L; 4GH7 B; 1BII A; 4ZFO A; 3DTX B; 4AKP A; 4GJT B; 4AIT A; 3JWO H; 4KTE H; 5JPN B; 4OLW L; 3NFS L; 5J56 B; 1KJM A; 4B9F A; 3P2D A; 1QBM L; 2VXV H; 1N19 A; 4FMF A; 2XXF A; 1IFH H; 3WLB B; 3BKY H; 4LSQ L; 4Z7N B; 1NKO A; 4DOH E; 4NBZ B; 1L7I L; 1DVU A; 3KL5 A; 5CWS A; 5HGA B; 3VFM A; 4UDU B; 5D1Z A; 1FAI L; 3PJS A; 5DJZ A; 3DRQ A; 3IRZ A; 4OM1 L; 1UM4 L; 4JFF A; 3L3H A; 2VL4 A; 5D5M A; 4HZA A; 4AQA B; 1OAQ H; 1UEY A; 1EX0 A; 4GKZ A; 4JZO A; 1IGT A; 4M00 A; 2UYL B; 3ZDZ F; 4NZ8 A; 4U2Z A; 4XCC H; 1CE6 A; 2VDO H; 5I6K A; 2VDK L; 1AHK A; 4IDJ L; 4AJ0 A; 4DAG L; 2EDK A; 5DVN A; 1DL7 L; 1N7M H; 2PPD A; 3G5V A; 3BUQ A; 4JRY D; 1MVY A; 1OL0 A; 3CHX A; 3M7O A; 2ZTB A; 4KVN H; 3STL B; 2YA2 A; 1JTP A; 3QUL A; 1BQL H; 2PYE E; 2ZID A; 3VVW A; 3TWC L; 4AVH A; 3QO0 A; 1U2H A; 1E6J H; 4WFF D; 4HDI A; 3Q8B A; 4M48 H; 1U8L B; 5DMK A; 2C3V A; 1LO2 L; 2PYE B; 4FTV D; 4TQH A; 4YSP A; 3O11 B; 2HH0 H; 1NFI A; 1WIT A; 2DQE L; 3RB7 A; 4EIG B; 1NCO A; 5JYL A; 3D69 A; 5JHL H; 2DM4 A; 5F88 B; 3B83 A; 1ZHB B; 3MN8 A; 4CDG C; 2N7B A; 3QEH B; 1SXZ A; 2YEV B; 4GP4 B; 2UZX A; 2YGV A; 3VD5 A; 3VGB A; 3V6F A; 4GW5 B; 9CGT A; 5KS9 A; 5IT2 H; 4FNQ A; 1BG9 A; 2WII A; 3D0L A; 4J5V A; 1ZS8 B; 4NT6 B; 2UVF A; 1E4H A; 1KBB A; 4PTU A; 3CLE L; 4LEX L; 3QYM A; 2CJU H; 4PS3 A; 2JTY A; 1MRD L; 2CDF A; 5IB3 A; 3OZ9 H; 4NZD A; 5GGT H; 1SMA A; 1ZE3 C; 2CRY A; 3LQA H; 4MJ6 B; 5E8D H; 1QBB A; 1SQ2 N; 2Z31 A; 5IHU L; 5EU3 B; 1NMA L; 5FDW A; 4J8R B; 3KPS A; 2DV6 A; 3LIZ H; 1QAS A; 1F8T L; 3MRK A; 3FRU A; 1EEU A; 3RGV B; 3DVI A; 43CA B; 3GRW L; 3SPC A; 5IW6 B; 3HTL X; 2A83 B; 2MMX A; 2AQS A; 1CGS H; 1N12 A; 5C6T H; 2L4O A; 1S7V A; 4W9G C; 5JHM A; 4PRB B; 2HN7 A; 2AI0 H; 2OZ4 L; 4AE1 A; 4AV4 A; 3Q6G L; 5I18 L; 4U1L B; 4YSD A; 3SKO A; 4D0D B; 1O6T A; 4NWU H; 3CBJ B; 3THM H; 2MQ3 A; 2DJM A; 4QHN B; 3G08 A; 3GXD A; 4CJ0 A; 3K6S A; 3ZDX F; 4WUK H; 1S7W B; 5JQI B; 5DVK A; 2I60 H; 4D9L H; 3VH8 G; 1AZZ C; 2IH3 A; 4WO4 C; 5IND A; 1JV5 B; 2B16 A; 1MJU H; 3CCH B; 3GDC A; 5FYL E; 3UJT L; 3FXI C; 3GUF A; 4OZG E; 2N4I A; 2PPA A; 2W92 A; 4FFY H; 1B0R A; 1UA6 H; 4DO4 A; 1WUZ A; 3ATD A; 3I9I A; 4KTD H; 1UA7 A; 5H2B B; 4K5O A; 1YMH B; 3VAE A; 1V7N H; 4XHJ C; 1CQK A; 1RIU H; 4G9F B; 1K3I A; 4GP5 B; 1JPE A; 4OZG B; 5CEX A; 5JLZ A; 2D3V A; 4BWT A; 8PAZ A; 3QXD B; 5DHX B; 1V5J A; 2ZOT A; 3LRS A; 2NY3 C; 1WK0 A; 4JFH E; 4NPY A; 3SDD B; 1HI6 B; 2EDQ A; 2OJE B; 5I26 A; 3VNZ A; 3K71 A; 4PCT A; 1BHG A; 1KY7 A; 4Y4K C; 1A3L H; 2CPU A; 1FJ1 A; 4ZFZ B; 1WFO A; 2VR3 A; 4NQE A; 1IGI L; 3RWE A; 1BX2 A; 3DJ9 A; 4FLS A; 3ELQ A; 1A6A B; 1XL4 A; 2DEY X; 4ODX A; 4L4T A; 5ECG A; 4P5M A; 5F7A A; 3T1F B; 4IBV A; 1A6Z A; 1QSF A; 5AOI A; 1AS8 A; 1GA2 A; 2FIK A; 1AO7 D; 3DSF L; 5HHO E; 2MCG 1; 5HXM A; 3RL1 A; 3VW3 L; 2KLR A; 2VXS L; 4PJB E; 3L4X A; 3MOQ A; 4UTB L; 3LS5 H; 2LU5 A; 4FQX C; 4HPY L; 4NQU A; 1DFX A; 1YEW A; 2A6K A; 4AMK L; 2AK1 H; 4HWB L; 3PWV B; 4I85 A; 3QJU B; 4DW2 H; 1JI2 A; 1I7R B; 3T3P B; 4B0M M; 4FG2 A; 5HHO B; 4XVO A; 4PJB B; 2HFE B; 5DJA A; 3S3D B; 4XPT H; 1AXS B; 3H56 A; 2WNW A; 4CL7 A; 1IBG H; 2XN2 A; 2Z7Y A; 4IGB D; 4EI5 B; 1L6Z A; 2NR6 A; 4BQB A; 2J56 A; 2SEB B; 5INC A; 5EO1 A; 3PXJ A; 4JVU A; 4RIS H; 4WI5 A; 2VM9 A; 4Z3E A; 4I1P A; 2AJ3 A; 5L0Q C; 1LK2 B; 5E8O B; 3V6O C; 2P52 A; 1A7P L; 4WFF E; 3QJO A; 2WB7 A; 2FSD A; 2FWU A; 3SPI A; 2Y0S A; 3KJ4 B; 2IFF H; 5LDS A; 3GYR A; 3ABL B; 4K7F A; 2ZCZ A; 4OU3 A; 3ULV D; 4K3G A; 3S2C A; 4NKO A; 5FYK H; 2HTL C; 2IAD B; 3WY4 A; 1BF2 A; 4HXA H; 3DRO B; 4GQQ A; 3C6L C; 1F42 A; 5LUM A; 5EZO L; 1U8K B; 3DO3 A; 2B15 A; 3R1G H; 4AEE A; 3ZL4 L; 2YC1 B; 2YPK B; 5T3Z E; 3FO0 H; 3PDD A; 1GC1 H; 2WJ7 A; 3SE3 C; 1I4F A; 2CA4 A; 4I0C C; 3WV0 A; 4V11 A; 2BZ7 A; 3RAJ H; 3LIU A; 5LLI C; 3ABG A; 2ZCH H; 5H35 B; 2EKS B; 3NCW A; 5IB2 A; 3JWD C; 1RUP L; 5MEQ B; 2HJL B; 1X5I A; 3Q2V A; 4YXH L; 5C0C E; 1JFH A; 5GSR A; 3OLI A; 2PWH A; 4MA7 L; 2AJY H; 4BWW A; 2O61 A; 2Y6S D; 4MMX C; 2IO5 A; 5B8C C; 3GMN B; 3FRP B; 3ARX A; 5IF0 B; 5C0C B; 3VFP A; 3S48 A; 1UZ6 F; 1UVQ A; 3VGE A; 3FFD A; 1P4U A; 3DTD A; 2JF1 A; 4ORG A; 2G3M A; 1I7U A; 3GT6 A; 4KKR A; 3FB8 A; 2ZKW A; 4OZH E; 2YPL D; 2MKL C; 5D4I A; 5KN5 A; 3PE9 A; 1A1M B; 2VZO A; 4E9Y A; 1A1N A; 2AXG B; 2XXC B; 4XN7 A; 1GYC A; 2JJS A; 1B0I A; 3MRO A; 1ETZ A; 1LTX A; 3AY2 A; 3CFJ B; 3SKN A; 4OZH B; 3ZKM D; 1QPP A; 1GGU A; 2H26 B; 1K3Z A; 1KYU A; 4LVO B; 2M83 A; 4F58 L; 1SLV A; 1WFM A; 2BSS A; 3LH9 A; 4FGM A; 5HVF B; 4XNX H; 1Q0Y L; 3STZ B; 1IAO A; 5HGB A; 3V4L A; 2OX5 A; 3B2U C; 2ALA A; 5B39 B; 1CVS C; 4ZMA T; 3BDY H; 3NZS A; 1TQC B; 2YMX H; 4UQB A; 4RMS A; 1DJG A; 5ENW A; 2VXQ H; 1HEZ B; 3HVN A; 3QIU C; 1C5B H; 4X9G A; 3O3B A; 4DGV H; 2Y2Y A; 3KYK L; 1IC5 L; 3Q2N A; 3BKM H; 5E99 H; 1IGM H; 2ZYR A; 4BBW A; 1KWG A; 4O4Y H; 5ALB L; 4PM1 A; 4MQX D; 1TZI B; 3NCJ H; 1PKQ E; 2H2P D; 2BY3 A; 3OX8 A; 3SZ6 A; 1OV8 A; 2W0P A; 3LNE A; 3MV7 E; 4JJO A; 4M93 B; 4Y1A E; 1GSM A; 4TSC L; 4DGI H; 4KVC L; 3BPC B; 1EAP B; 3QUH A; 2VDR B; 1FCC A; 2G75 A; 1U2C A; 1CXH A; 1PKQ B; 1YNT F; 3PDO A; 4WDI A; 5I15 L; 3MV7 B; 5DHV A; 2ZWZ A; 4ZJ9 A; 3T65 B; 3N0A A; 1PQZ B; 1SYS A; 1OAX L; 2FJH A; 2WYZ A; 4F7K A; 3FT0 A; 4M03 A; 4JK0 D; 2IBB A; 1AYO A; 2CHD A; 4BZ2 A; 1ZVS A; 4UUJ A; 1MCP H; 5MI0 B; 1I8M A; 3OB8 A; 4J6R L; 4DGY L; 3LNF A; 4R7V A; 2Y5E A; 1Y18 A; 4R96 A; 1CFS A; 4RFE A; 2AAN A; 1AIF B; 5FHB H; 3RU8 H; 4OD3 H; 5AWN L; 5F9O L; 1YMM D; 5GGS A; 1DE4 A; 4O58 L; 4MDI A; 1RJL A; 4H25 B; 1AP2 B; 4HIJ B; 5J1A A; 4N8C H; 3OF6 D; 2FUQ A; 1MOE A; 5GGQ H; 5ETU A; 2IQA A; 2AQ2 A; 3MTX A; 1JZJ A; 1QSE D; 3T6Q C; 1CDY A; 2Y9R T; 3LPG A; 3ZX1 A; 3KM2 A; 3O8X B; 1OCW L; 3P9M A; 3BUY A; 3BXN B; 3TC9 A; 1KB5 B; 4MWF A; 4NKM B; 4GRL B; 5GS0 C; 4MVB D; 3OPZ L; 1TO5 A; 4LEO A; 3RVW D; 4LSU L; 4XPB L; 2WIM A; 4FLH A; 3SSG A; 4HH8 A; 4Y4F B; 2FYV A; 4MSW B; 3H9Y A; 5FYJ H; 3ARB D; 2XJL A; 2HVJ A; 1MFD L; 2A6J A; 1YEC L; 2I32 A; 4KY2 A; 4X6C F; 5FB8 B; 4LAS H; 4UB0 L; 1TCR B; 1CGT A; 5K59 F; 4DN3 L; 5ID1 A; 5DXW A; 2BMK A; 4PR5 B; 3V8O A; 4PJI B; 3EXJ A; 3TX4 A; 1T83 A; 3ULS B; 3ZZL A; 1VZI A; 4JKM A; 5EOR H; 1CIC B; 4PS7 A; 3KGR A; 3ASW A; 3W0W D; 1MI5 D; 3H0T A; 5D7E A; 2LLN A; 4WEE A; 1JZI A; 2GJ6 B; 5C0J B; 2IH1 B; 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1MWO A; 2HB0 A; 2WN2 A; 4AIO A; 3OPU A; 1RD6 A; 1Q94 A; 4BFI B; 3L13 A; 4M5T A; 1AI1 L; 1LQS R; 1P84 J; 1TOX A; 3U7Y L; 4P46 C; 1QI5 A; 5K9Q I; 2VDR L; 5L4J A; 2YD1 A; 3MLT B; 4WI3 A; 4FQL L; 2VE6 A; 5CZX C; 4H8U A; 4NHC L; 2CO6 A; 5L8L B; 1UD5 A; 1TNN A; 4XMW A; 4KI5 D; 1JZ4 A; 3FSA A; 2GJZ A; 5IWL C; 1XR9 B; 5IR1 A; 1FNG B; 3DV6 A; 2UZI L; 1JFQ L; 2WXM A; 2WXR A; 3N1P C; 32C2 B; 4TPR L; 1EH9 A; 1B2W L; 1IND H; 2GUO B; 3K8M A; 3LQA C; 3P4M B; 3PL6 B; 1ADQ L; 3UO8 B; 4Q6I B; 6CGT A; 3H9S B; 3EBA A; 3NCF B; 1WAA A; 4WAF A; 4EVN B; 3ES6 B; 4PV8 B; 5HGG S; 5IBT L; 1WIU A; 3WGU B; 3IJS B; 1NCN A; 4HUX B; 2F0C A; 3LDB C; 1YEE H; 4UI2 A; 3AWE A; 1CTM A; 2QSV A; 4JLR A; 2ZUT A; 3LHP H; 2GJR A; 3POC A; 4M56 A; 4O2E B; 5TQ0 H; 3PWN A; 4APQ C; 4N2N A; 3PU7 A; 4RMV A; 1KJ2 A; 1JDA A; 1JHT A; 4R2G D; 4X8G A; 2JB6 B; 2V7N A; 4B53 A; 3QXW A; 5BUP A; 3TJH C; 1GS6 X; 3CSF A; 4PVN A; 3EFF B; 4YX2 H; 2APW A; 3RVU D; 1EA9 C; 4MA8 L; 4WK2 B; 2XVB A; 3LS4 L; 1RZ8 B; 3Q1E A; 2XZC L; 2XZA L; 1PZU B; 3K2U L; 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