The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
103
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sequence length |
315
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structure length |
304
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Chain Sequence |
KDGFDLDLTYVTDHVIAMSFPSSNPIGEVSRFFKTKHPDKFRIYNLCSERGYDETKFDNHVYRVMIDDHNVPTLVDLLKFIDDAKVWMTSDPDHVIAIHCKGGKGRTGTLVSSWLLEDGKFDTAKEALEYFGSRRTGDVFQGVETASQIRYVGYFEKIKKNYGGQLPPMKKLKVTGVTITAIQGVGRGNGSDLSMQIVSERQEVLLCKFAEGYNCALQYDATDDCVTCEVKNCPVLAGDIKVRFMSTSKSLPRGYDNCPFYFWFNTSLVEGDHVTLKREEIDNPHKKKTWKIYRDNFTVKLTFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Crystal structure of the cytoplasmic phosphatase and tensin homolog (PTEN)-like region of Ciona intestinalis voltage-sensing phosphatase provides insight into substrate specificity and redox regulation of the phosphoinositide phosphatase activity
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Hydrolase, membrane protein
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source organism |
Ciona intestinalis
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molecule keywords |
Voltage-sensor containing phosphatase
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total genus |
103
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structure length |
304
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sequence length |
315
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chains with identical sequence |
B, C
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ec nomenclature |
ec
3.1.3.-: |
pdb deposition date | 2011-03-19 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00782 | DSPc | Dual specificity phosphatase, catalytic domain |
A | PF10409 | PTEN_C2 | C2 domain of PTEN tumour-suppressor protein |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Sandwich | Immunoglobulin-like | Immunoglobulin-like | ||
Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A | Protein tyrosine phosphatase superfamily |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D42 A; 1Q6M A; 2I3U A; 2C46 A; 1LQF A; 1ZC0 A; 5GTJ A; 4NX8 A; 1PTU A; 2GWO A; 1GFY A; 1G1F A; 3F41 A; 1EEN A; 4OHH A; 2Y96 A; 1LYV A; 2PI7 A; 3CWE A; 4QAH A; 1L8G A; 2J43 A; 3QCF A; 1Q6J A; 5EHR A; 1I9S A; 1OEM X; 1PH0 A; 3D1Q A; 4NND A; 5KAA A; 2OC3 A; 4OHL A; 3S3F A; 1T48 A; 2QBQ A; 2F6Z A; 4DGP A; 5KA4 A; 4Y2E A; 1T4J A; 1G4W R; 4NWG A; 2HNQ A; 1C87 A; 1Q1M A; 3F81 A; 2I6O A; 2MBC A; 4RDD A; 4R30 A; 3NME A; 1NNY A; 3D44 A; 2F46 A; 2HC2 A; 2F6Y A; 3RZ2 A; 2OUD A; 1PTT A; 1YTW A; 3AWG A; 1A5Y A; 1ONZ A; 3V0J A; 2H04 A; 1BZC A; 4NYH A; 1FQ1 A; 4PYH A; 3QCN A; 2CM8 A; 4OHI A; 3AWE A; 1RPM A; 1XXV A; 2CNG A; 2QBP A; 1P15 A; 5BZZ A; 2NZ6 A; 3SME A; 3ZM1 A; 2GJT A; 2ESB A; 1OEU A; 1FPR A; 1C84 A; 3I36 A; 2I42 A; 4JMK A; 3OLR A; 4QUN A; 3EAX A; 3H2X A; 3V0I A; 1YFO A; 4GE6 A; 1NL9 A; 1WAX A; 4H1O A; 2HC1 A; 3F9B A; 4RH5 A; 2F6F A; 2QDM A; 2HNP A; 1M3G A; 1YZ4 A; 2J16 A; 3O4T A; 1BZH A; 2M3V A; 2C7S A; 2PQ5 A; 1NWE A; 1J4X A; 1KAK A; 3V0D A; 1G7G A; 2HXP A; 2F71 A; 4NWF A; 4BJO A; 3MOW A; 1C86 A; 1YTS A; 1G1G A; 1JF7 A; 1LAR A; 2CM3 A; 1Q6S A; 3QCK A; 3ZM2 A; 3QKQ A; 2FHF A; 1OEO X; 1U24 A; 2B07 A; 2QCJ A; 2HY3 A; 3S4E A; 2NTA A; 3F9A A; 1R6H A; 2J72 A; 5KA0 A; 3QCC A; 5KA8 A; 2J44 A; 1OET A; 1QXK A; 2NLK A; 2CNF A; 4OHD A; 2B4U A; 4HJP A; 4ZI4 A; 3QCD A; 3O4U A; 4TVV A; 1Q6P A; 4R0S A; 3I80 A; 2FHC A; 1XBO A; 1G7F A; 4KYQ A; 2I4G A; 4QBW A; 3EB1 A; 1NO6 A; 2DXP A; 2F6V A; 5IBS A; 3EZZ A; 1WCH A; 2PT0 A; 2J16 B; 1PTY A; 2I6I A; 4JMJ A; 5KAD A; 5EHP A; 3ZV2 A; 4WU3 A; 4R0T A; 3B7O A; 3PS5 A; 4JNB A; 3S3E A; 4GRZ A; 2CNI A; 2CFV A; 2VEU A; 1OHE A; 2FJN A; 2AHS A; 3QCI A; 3F99 A; 2VEX A; 1NZ7 A; 2H4K A; 2ZN7 A; 3QCG A; 1YGR A; 3EMU A; 2YA1 A; 2J17 A; 1G1H A; 1XRI A; 2A8B A; 1AAX A; 4WU2 A; 4QUM A; 3QCE A; 2B4O A; 2I4E A; 4B04 A; 2I4H A; 2CNH A; 1PTV A; 3QCH A; 5IBM A; 3MMJ A; 2BV5 A; 2F6T A; 3D1H A; 1GWZ A; 4BPC A; 4D3Q A; 2CM7 A; 4D3P A; 5K23 A; 5KA3 A; 3D9C A; 1U26 A; 1PYN A; 3V0E A; 3QCB A; 1ONY A; 3ZMP A; 1YPT A; 1JLN A; 2I6P A; 3N0A A; 4ERC A; 1PXH A; 4GE2 A; 2FHB A; 2G59 A; 3D1O A; 3BLU A; 2RF6 A; 2R0B A; 2QDP A; 4HJQ A; 5HDE A; 2CJZ A; 4Z6B A; 1X24 A; 3S4O A; 3OMH A; 1XXP A; 5AWX A; 2HVL A; 2B3O A; 1C83 A; 5K9W A; 1KAV A; 2FJM A; 1ZCL A; 3O4S A; 1EEO A; 1Q6T A; 2VEW A; 3GXG A; 3S3K A; 2I75 A; 4GS0 A; 2I3R A; 5KA9 A; 2NV5 A; 1VHR A; 3V0H A; 4ZN5 A; 5KAB A; 2P4D A; 4YAA A; 2NT2 A; 2B4P A; 3M4U A; 1OHC A; 1G4U S; 1PA9 A; 4PVG A; 2QBR A; 4QBE A; 4J51 A; 1YGU A; 4D3R A; 3BLT A; 2I6M A; 1FPZ A; 2Q47 A; 2J73 A; 4QAP A; 3AWF A; 2BGD A; 4H34 A; 3LJ8 A; 4IKC A; 4AZ1 A; 3ZM3 A; 1I57 A; 5KA1 A; 2CNE A; 4ZRT A; 4MBB A; 2F6W A; 2QDC A; 2BZL A; 2I1Y A; 5I6V A; 5K24 A; 2G6Z A; 4RI5 A; 1C88 A; 2YDU A; 2P6X A; 3MOZ A; 3O3L A; 5BX1 A; 2Q05 A; 2E0T A; 2B49 A; 2YOC A; 2H03 A; 3V0F A; 3QKP A; 2J71 A; 2OZ5 A; 2H4G A; 4YR8 B; 2CMA A; 2AZR A; 4WOH A; 2BGE A; 2QEP A; 5KA7 A; 1C85 A; 1ZCK A; 4Y14 A; 1PA1 A; 2NT7 A; 4RI4 A; 2H4V A; 3ZMQ A; 4DGX A; 5KAC A; 2IMG A; 3RO1 A; 4S0G A; 3QCL A; 4OHE A; 1NWL A; 5BUG A; 2CMC A; 2QCT A; 3ZM0 A; 1QZ0 A; 1WRM A; 1U25 A; 2HCM A; 3QCM A; 4GFU A; 2WGP A; 1RXD A; 1YTN A; 2QBS A; 2B4S A; 4KI9 A; 4WTY A; 5K9V A; 2I6J A; 3O5X A; 3QCJ A; 4RKK A; 2PBN A; 2VEV A; 4ICZ A; 1V3A A; 1OHD A; 5MMZ B; 2PSZ A; 5K25 A; 2PA5 A; 3BM8 A; 1BZJ A; 1T49 A; 3V0G A; 3GXH A; 4HRF A; 5K22 A; 2I5X A; 3EU0 A; 2H02 A; 1OEV A; 2HB1 A; 1OES A; 2CMB A; 4GWF A; 3RGQ A; 3BRH A; 1YN9 A; 1Q6N A; 5J8R A; 1ZZW A; 3U96 A; 1MKP A; 2SHP A; 4GRY A; 4KYR A; 1YWF A; 3A5K A; 1D5R A; 4RH9 A; 5BZX A; 1I9T A; 2OOQ A; 2F70 A; 2BIJ A; 3I7Z A; 3S3H A; 5KA2 A; 2ZMM A; 4JBC A; 4GFV A; 2Y2F A; 2JJD A; 3A5J A; 5M43 A; 2FH7 A; 1SUG A; 5LXQ B; 3RGO A; 2CM2 A; 2A3K A; 3CM3 A; 4I8N A; 1L8K A; 2VEY A; 1XM2 A; 3SR9 A; 1ECV A; 2GP0 A; 4GE5 A; 4RHG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2D3V A; 1RU9 L; 4FHJ A; 2J1Y A; 1FN4 B; 3L08 A; 2Q7N A; 3GIZ H; 4F2M E; 5GS1 A; 1DVF A; 2WVS A; 4Y1T A; 4X6B A; 2ICW J; 3CVH A; 4TVP E; 3EO0 A; 2J2Z A; 3MRM A; 3O3E B; 2P7T A; 3NYK A; 1KGI A; 2BSR B; 3ILP B; 5I0D A; 4PJ5 A; 3CLF H; 1ILS A; 2J1K A; 3FL7 A; 4FTV E; 4M3J A; 5EEZ A; 2G30 A; 4WWO A; 3T0D A; 2F74 B; 4LK4 A; 3D50 A; 4JRE B; 2XN9 A; 3SOB L; 3CWE A; 3K3Q A; 4JN1 L; 5JYL A; 1DJY A; 2J43 A; 1PCS A; 1WZ1 L; 2ID5 A; 3B7R L; 3OKY A; 3FH8 A; 4MCZ A; 3WSQ L; 4PS8 A; 1A9E B; 3MLS L; 4DEP C; 1TYE B; 2ED9 A; 3UPC A; 3P3R A; 1SEQ L; 1YEJ H; 1NOL A; 1NDM B; 2WCS A; 3MCL L; 4GP8 B; 3RGB A; 4C56 D; 5JIK A; 4EAE A; 4ZTO L; 2E8Z A; 1ZT7 B; 5HYJ A; 1QWH A; 1S9W B; 4NI3 A; 5D1X D; 5DO2 C; 2DWT A; 1B88 A; 3UAJ A; 5I6K A; 2J7L A; 2AQR A; 4NWG A; 2ICE S; 4XMT A; 1HK6 A; 1DQI A; 2QSQ A; 2BSB A; 4TQP A; 4X4X A; 4W9H C; 4PP2 A; 3H1Z A; 1UC6 A; 3L1F A; 4LVO B; 4S1D D; 5CLY A; 1WPC A; 3BDB A; 2BLF A; 3EOB A; 2GAZ B; 4HCG A; 4ZXB B; 2J6E L; 2B59 A; 4JN2 A; 3BI9 X; 1I1Y A; 4LDL B; 4JQX A; 4QY8 A; 5TF0 A; 3VI4 B; 1EHL L; 3WII L; 1MIE L; 4IIQ C; 4DFH A; 1XH2 A; 5EII A; 1D6V H; 4ODT L; 2EO1 A; 3NRS A; 1DDH A; 5L88 H; 2KZW A; 4WWP A; 4Z18 A; 5KG9 A; 4LHU G; 3GGW A; 4LCW A; 3H9Y A; 4AYF B; 3U0P A; 3AXH A; 4LQF L; 5K9O B; 4FFZ A; 4NP9 A; 4X98 B; 4AUY A; 4KRO B; 3ZXA C; 1EAP B; 5IHU L; 1HEH C; 2ICW A; 1NJ9 B; 1DSF H; 2NSM A; 4QRT A; 3LQM A; 1BZC A; 4XI5 D; 4LVO C; 2A4C A; 4P2R E; 1UB6 B; 4H4N A; 4WUU E; 2AXG B; 3SDC D; 2NY6 D; 4BFI B; 1IC0 A; 4KWU A; 3SPV B; 2KHA A; 5F21 B; 4BGL A; 2EUV A; 4WSG A; 3QUH A; 3O6M H; 4X7F C; 4YHN B; 4Z7Q E; 5LGH L; 2QBP A; 1FE8 H; 5DI8 B; 1HWW A; 1U2H A; 3H6J A; 1IBG L; 2LTQ C; 1EJO L; 3FZU C; 1HCF X; 1UCB H; 2KZB A; 4WI9 A; 5TE6 H; 3T65 A; 4WWN A; 3KMD A; 2VC2 H; 1CCZ A; 4HWN A; 4FLO A; 1QLR A; 4ZS7 H; 4WSJ A; 1R33 A; 2I42 A; 2APB A; 4KRO C; 5CJO H; 3OLR A; 1F90 L; 4I9W E; 3H2X A; 1RPU A; 2FGZ A; 4L3F A; 1K5W A; 3FTV A; 3D39 E; 3VRL E; 1BA9 A; 4J3O H; 4KRP B; 4M1C D; 1KB3 A; 3E8U L; 3E3Q E; 1AD0 B; 3LIZ L; 3KED A; 1G7H A; 2CK0 H; 4L1H A; 4A7V A; 2Z31 B; 1A7R L; 2TAA A; 5GJS L; 1YZ4 A; 2BIP A; 3QCF A; 2H1L M; 4CGT A; 2B3I A; 4HUK B; 1CE1 H; 4LLW A; 4NZT H; 2C7S A; 2OMV B; 2AXF B; 3NRQ A; 1NGZ A; 3PPE A; 3GSO A; 4ACT A; 3GSN L; 3SYA A; 4GUP A; 5KN5 A; 5ICU A; 5F9W C; 3IT8 D; 3DBX A; 5A2F A; 5IFA H; 2LFE A; 5BV7 H; 1MNU L; 4JCM A; 3EGD A; 1XGQ A; 4UV7 L; 4AQE B; 2AQT A; 3FT3 A; 1B2W L; 3NK3 A; 3U0W H; 3B9K A; 3MV7 B; 3ZDY F; 1LAR A; 5KSA B; 1LO0 H; 3BGF B; 4LBE B; 1EHX A; 4J3X A; 1XCW A; 3BRF A; 1F11 B; 4BE6 A; 3AB0 B; 1S9Y B; 2VMF A; 2DQG H; 2Z31 C; 3VQM A; 1QUN A; 4QDG A; 1J0Y A; 3R4R A; 4N0F B; 2YC1 B; 1DZB A; 2XTJ B; 4L1T A; 4LVH B; 1RER A; 4F9P A; 3QUY B; 4NO3 B; 3F9A A; 3NAB L; 4I0P C; 2CA4 A; 2IMN A; 1HH9 A; 2DY2 A; 2J5W A; 4QHL A; 4EI6 A; 2IH3 B; 4FXK B; 4AIZ B; 2GB2 A; 4CN6 A; 4O5L H; 1JZ6 A; 4EDX B; 3CNK A; 5KSA C; 5E5M B; 2LLG A; 3BGF C; 5CR8 A; 4PGD A; 4MAY B; 3V4V L; 5DA4 A; 1PZA A; 3IFN L; 4XPB L; 5B38 B; 5IML B; 5HHV H; 3AB0 C; 2E6P A; 2VN7 A; 5CLX A; 5JZ7 D; 3AU1 B; 2E7M A; 4L5F H; 4FNU A; 4LVH C; 4YH6 A; 3V4P H; 1XCQ A; 3VXS A; 4B3E A; 1VAD B; 3ZDX E; 3QCD A; 2KZK A; 4K23 L; 4X7T A; 1XO8 A; 4U3H A; 2Q5B A; 2FL5 A; 3EOT L; 3UAC A; 4MYW B; 4YFE A; 3HE6 A; 2V2T B; 5CCG E; 2Y7N A; 2V33 A; 3H4F A; 4A7G F; 3EZZ A; 1S46 A; 3QXA A; 1P5V B; 1TQB B; 3QDG D; 3LOW A; 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3C09 C; 1S7X A; 1ZDQ A; 3R8B B; 3WO4 C; 2BY2 A; 3LYR A; 4XXC C; 4GBX D; 1HWG B; 2R0B A; 4XND A; 3ROO A; 4XCE B; 5F8R C; 1HDM B; 4NNP L; 1CI3 M; 5D96 B; 2IQ9 H; 4MJ5 B; 2V7N A; 4RGN E; 2FEJ A; 1SY6 A; 4PJC E; 2FK9 A; 1AXS A; 35C8 L; 2X1O A; 1WCB B; 2PR4 L; 3BWA A; 2VZO A; 4IU3 B; 4U1I A; 3SKO B; 5LB1 A; 2F1B A; 3TBW A; 1GG4 A; 2GSM B; 5DJX A; 3UH8 A; 2I9L A; 5I74 C; 2FZ3 A; 1NIA A; 2CO6 B; 5F6I C; 5D9S A; 4E9Y A; 4OFY A; 4GUQ A; 3L5I A; 5GIR A; 3QEQ E; 5DEF A; 2DQF B; 3G04 B; 3N04 A; 3RUG E; 2EDK A; 2ADJ A; 4FAD A; 1INE L; 1ZPL A; 3GIN A; 5D96 C; 1B90 A; 1A14 L; 2VDQ L; 1S5I L; 4W93 A; 3O0R L; 3OHX B; 3LEV L; 2FVN A; 2E27 L; 3QEU A; 1JCV A; 4K94 H; 4P2O D; 3HI5 H; 3QS2 A; 5E95 B; 4WO4 A; 1M6O B; 4U1N B; 1H5B A; 4EDW L; 2UUD K; 5I66 A; 3HMX H; 3ARD C; 3HCV A; 4LL9 A; 3RWE A; 5GGV L; 3HNV L; 4FFY L; 4LKX A; 4NO0 B; 3GHB H; 4HU2 A; 3NP4 A; 1PD1 A; 3TT1 L; 3H8N A; 2CUA A; 4KRL B; 5DUJ A; 4OLV L; 1AE6 L; 4EN3 B; 4AJY V; 3MRC A; 4H26 A; 3DVN B; 5IB4 B; 4PJH A; 1IC1 A; 1R3L A; 4NKO B; 5CMA A; 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